单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 9901 - 9920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9901 | 2025-10-07 |
Single-Cell Profiling of Ebola Virus Disease In Vivo Reveals Viral and Host Dynamics
2020-11-25, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.10.002
PMID:33159858
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研究论文 | 本研究通过单细胞技术揭示了埃博拉病毒感染期间宿主免疫细胞和病毒在体内的动态变化 | 首次在体内使用单细胞转录组学和质谱流式细胞技术全面表征埃博拉病毒感染期间的免疫反应，并量化细胞内病毒RNA以确定病毒嗜性 | 实验在高度防护环境下进行，样本获取困难，研究仅使用恒河猴模型 | 表征埃博拉病毒感染期间的宿主-病毒相互作用动态 | 恒河猴外周免疫细胞 | 单细胞生物学 | 埃博拉病毒病 | 单细胞转录组学, CyTOF质谱流式细胞技术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 100,000个转录组和15,000,000个蛋白质谱 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 9902 | 2025-10-07 |
Recent advances in single-cell RNA sequencing of bacteria: Techniques, challenges, and applications
2025-May, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2025.01.008
PMID:39984340
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综述 | 本文综述了细菌单细胞RNA测序技术的最新进展、技术挑战及其在微生物学中的应用 | 系统比较了不同细菌scRNA-seq方法的优劣，并探讨了在微生物生理学、宿主-病原体相互作用等领域的潜在应用 | 细菌mRNA缺乏poly-A尾和单个细菌细胞RNA含量低等技术挑战尚未完全解决 | 总结细菌单细胞RNA测序技术的发展现状和未来方向 | 细菌单细胞转录组 | 微生物组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 板式方法、分裂-汇集条形码技术、液滴基技术 |
| 9903 | 2025-10-07 |
BASELINE: A CRISPR Base Editing Platform for Mammalian-Scale Single-Cell Lineage Tracing
2025-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.19.644238
PMID:40166145
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研究论文 | 开发了一种基于CRISPR碱基编辑的哺乳动物规模单细胞谱系追踪平台BASELINE | 使用Cas12a腺嘌呤碱基编辑器在50个合成靶位点生成高分辨率谱系树，信息记录量比现有技术提高50倍 | 在细胞工程使小型分布式系统具有挑战性的情况下应用可能受限 | 开发高分辨率单细胞谱系追踪技术 | 哺乳动物细胞谱系，胰腺癌模型 | 基因编辑技术 | 胰腺癌 | CRISPR碱基编辑，单细胞测序 | NA | 基因组编辑记录，单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞谱系追踪，碱基编辑 | BASELINE平台 | 使用Cas12a腺嘌呤碱基编辑器在50个合成基因组靶位点进行不可逆编辑 |
| 9904 | 2025-10-07 |
Machine Learning-based Gene Biomarker Identification for Improving Prognosis and Therapy in Hepatocellular Carcinoma
2025-Apr-03, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过机器学习方法识别肝细胞癌的基因生物标志物，开发预后相关指数HPRI并验证其临床价值 | 整合多种机器学习算法(101个统计模型)筛选关键基因，结合单细胞测序分析基因功能，开发HPRI预后指数并在多队列中验证 | 研究依赖公共数据库数据，需要进一步实验验证关键基因的生物学功能 | 识别肝细胞癌的分子生物标志物以改善预后预测和治疗指导 | 肝细胞癌患者 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞测序，差异表达分析，Cox回归分析 | 多种统计模型 | 基因表达数据，临床病理信息 | 多个队列的肝细胞癌患者数据(来自ICGC、GEO、TCGA数据库) | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 9905 | 2025-10-07 |
Recurrent Composite Markers of Cell Types and States
2025-Apr-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.17.549344
PMID:37503180
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研究论文 | 提出RECOMBINE算法，用于识别可定义层次细胞身份的复发性复合标记集 | 开发了首个能够识别复发性复合标记集以定义层次细胞身份的算法，相比现有方法具有更高准确性 | 算法在模拟和生物数据集上的验证仍需更多实际应用场景的测试 | 解码生物复杂性，识别可定义和区分层次细胞身份的可解释复合标记集 | 细胞类型和状态，包括小鼠视觉皮层细胞、CD8+ T细胞状态、肠道亚群和人类多种组织细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | RECOMBINE算法 | 单细胞数据，空间转录组数据 | 多个数据集，包括小鼠视觉皮层、Tabula Sapiens项目的人类多种组织数据 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 9906 | 2025-10-07 |
Uncovering gene and cellular signatures of immune checkpoint response via machine learning and single-cell RNA-seq
2025-Apr-02, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00883-z
PMID:40169777
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和机器学习方法预测免疫检查点抑制剂治疗反应 | 开发了可解释的机器学习模型，在保持单细胞分辨率的同时预测治疗反应，并识别出跨癌种通用的11基因标志物 | 研究主要基于黑色素瘤数据，在其他癌种中的验证仍需进一步研究 | 预测免疫检查点抑制剂治疗反应并识别关键生物标志物 | 黑色素瘤浸润免疫细胞 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | XGBoost, 强化学习 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9907 | 2025-10-07 |
Characterization of shell field populations in gastropods and their autonomous specification mechanism independent of inter-quartet interactions
2025-Apr-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204538
PMID:40105679
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研究论文 | 本研究重新探讨了帽贝壳场特化的诱导假说，发现壳场细胞群具有自主特化机制 | 首次在帽贝中证明壳场细胞群（源自第二四分体）的特化不依赖于与其他四分体细胞的相互作用 | 研究仅针对帽贝一种物种，结论在其他软体动物中的普适性有待验证 | 探究软体动物胚胎壳场特化的细胞自主性机制 | 帽贝胚胎和分离的第二四分体（2q）细胞 | 发育生物学 | NA | 双色原位杂交，单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据，转录组数据 | 16细胞期胚胎及分离的2q细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9908 | 2025-10-07 |
Deletion of hepcidin disrupts iron homeostasis and hematopoiesis in zebrafish embryogenesis
2025-Apr-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204307
PMID:40110772
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研究论文 | 本研究通过CRISPR/Cas9技术构建铁调素敲除斑马鱼模型，揭示其在胚胎期铁稳态和造血过程中的关键作用 | 首次在斑马鱼模型中证实铁调素缺失导致胚胎铁过载和造血异常，并发现特定血液祖细胞亚型出现铁死亡现象 | 研究局限于斑马鱼模型，需进一步验证在哺乳动物系统中的适用性 | 探究铁调素在斑马鱼胚胎造血过程中的调控机制 | 斑马鱼胚胎和血液祖细胞 | 发育生物学 | 血液疾病 | CRISPR/Cas9基因编辑，单细胞RNA测序 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | 斑马鱼胚胎模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9909 | 2025-10-07 |
Differentiation stage predicts radiosensitivity in mesenchymal-like pancreatic cancer
2025-Apr-01, International journal of radiation oncology, biology, physics
DOI:10.1016/j.ijrobp.2025.03.034
PMID:40180058
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据开发分化阶段分类器，用于预测间充质样胰腺癌的放射敏感性 | 首次发现胰腺癌细胞分化阶段与放射敏感性相关，并证明染色质压缩状态与分化阶段存在关联 | 研究主要基于细胞系数据，需要进一步临床验证 | 开发基因组分类器预测胰腺癌放射敏感性，实现基因组指导的放射治疗 | 胰腺癌细胞系和胰腺癌患者 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | 基因组分类器 | 基因表达数据 | 45个胰腺癌细胞系，TCGA胰腺癌患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9910 | 2025-10-07 |
An atlas of early human mandibular endochondral and osteogenic paracrine signaling regions of Meckel's cartilage
2025-Mar-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2420466122
PMID:40096606
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析构建了人类胎儿Meckel软骨的时空图谱，揭示其在下颌骨骨化中的关键作用 | 首次发现Meckel软骨的两个不同区域通过不同机制参与下颌骨骨化过程 | 研究仅涵盖7-15周孕期的胎儿样本，需要进一步验证机制 | 探究Meckel软骨在下颌骨骨化过程中的作用机制 | 人类胎儿Meckel软骨组织 | 空间转录组学 | 口腔颅面疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞空间转录组学分析, 体内谱系追踪 | 小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 7-15周孕期人类胎儿样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9911 | 2025-10-07 |
Construction of a Single-cell Atlas of Thyroid Cancer
2025-Mar-10, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术构建甲状腺癌的单细胞图谱，揭示肿瘤异质性并探索分子特征 | 首次构建甲状腺癌全景单细胞图谱，发现lncRNA XIST在未分化甲状腺癌中的高表达及其m6A修饰调控机制 | 样本量有限（20例患者），数据来源于公共数据库 | 探索甲状腺癌的肿瘤异质性及其分子特征，为临床分期和治疗策略提供新见解 | 甲状腺癌患者的肿瘤组织、癌旁组织、转移淋巴结和远处转移灶 | 单细胞测序分析 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 生物信息学分析 | 单细胞转录组数据 | 20例患者的27个组织样本（11个原发肿瘤、6个癌旁组织、8个转移淋巴结、2个远处转移） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9912 | 2025-10-07 |
Integrating Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Data Reveals the Prognostic Significance of HOXC9-Related Immune Gene Signatures in Hepatocellular Carcinoma
2025, OncoTargets and therapy
IF:2.7Q3
DOI:10.2147/OTT.S509625
PMID:40177614
|
研究论文 | 本研究整合了bulk和单细胞RNA测序数据，构建了基于HOXC9相关免疫基因的风险评分模型，并评估其在肝细胞癌中的预后价值 | 首次整合bulk和单细胞RNA测序数据构建HOXC9相关免疫基因风险评分模型，揭示了其在肝细胞癌预后评估和免疫治疗预测中的新作用 | 研究数据主要来自公共数据库TCGA和GEO，需要进一步实验验证 | 构建HOXC9相关免疫基因风险评分模型并评估其在肝细胞癌预后和免疫治疗中的价值 | 肝细胞癌患者样本和癌细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, LASSO-Cox回归分析, CIBERSORT, ESTIMATE算法, 细胞实验 | 风险评分模型, LASSO-Cox回归模型 | RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据, 临床信息 | TCGA和GEO数据库中的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 9913 | 2025-10-07 |
Unraveling the immunomodulatory impact of hydroxychloroquine on peripheral T cells using single-cell RNA sequencing
2024-12, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2024.103324
PMID:39405653
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示羟氯喹对外周T细胞的免疫调节作用机制 | 首次在单细胞水平系统阐明羟氯喹对T细胞亚群的差异化调控作用，特别是发现其对CD8+T细胞细胞毒性的增强作用 | 研究主要基于体外实验，需要更多体内实验验证；样本量有限 | 探究羟氯喹对T细胞的免疫调节机制 | 外周T细胞（CD4+T细胞和CD8+T细胞） | 单细胞组学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 狼疮患者样本（含羟氯喹治疗组和未治疗组） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9914 | 2025-10-07 |
Cellular communication network factor 3 contributes to the pathological process of rheumatoid arthritis through promoting cell senescence and osteoclastogenesis in the joint
2024-12, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2024.103334
PMID:39549484
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研究论文 | 本研究探讨细胞通讯网络因子3在类风湿关节炎病理过程中的作用机制及治疗潜力 | 首次揭示CCN3通过促进细胞衰老和破骨细胞分化参与类风湿关节炎病理过程，并验证其抗体治疗的潜在价值 | 研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探究CCN3在类风湿关节炎中的分子功能及治疗靶点潜力 | 类风湿关节炎患者的关节组织、滑膜细胞、单核细胞及实验小鼠模型 | 病理学研究 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序、体外细胞培养、动物模型实验 | 实验性关节炎动物模型 | 基因表达数据、细胞表型数据、组织病理数据 | 公共单细胞RNA测序数据集及实验动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9915 | 2025-10-07 |
EZH2 promotes B-cell autoimmunity in primary Sjogren's syndrome via METTL3-mediated m6A modification
2024-12, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2024.103341
PMID:39577129
|
研究论文 | 本研究揭示了EZH2通过METTL3介导的m6A修饰促进原发性干燥综合征中B细胞自身免疫反应的机制 | 首次阐明METTL3通过m6A修饰调控EZH2表达，进而影响B细胞功能的分子机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验，需要进一步临床验证 | 探索EZH2在原发性干燥综合征B细胞自身免疫反应中的作用及治疗潜力 | 原发性干燥综合征患者外周血B细胞、唾液腺组织及三种干燥综合征小鼠模型 | 生物医学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序,RNA测序,ChIP测序,ChIP-qPCR,流式细胞术,CFSE检测,RIP实验,放线菌素D实验,m6A-RIP-qPCR | NA | 基因表达数据,表观遗传数据,临床数据 | 原发性干燥综合征患者样本和三种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序,染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 9916 | 2025-10-07 |
PAGE-based transfer learning from single-cell to bulk sequencing enhances model generalization for sepsis diagnosis
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae661
PMID:39710434
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研究论文 | 提出基于单细胞转录组的迁移学习方法scPAGE2，通过整合单细胞和批量转录组数据构建脓毒症诊断模型 | 开发了改进的差异表达基因对分析方法，实现了从单细胞到批量转录组数据的知识迁移 | 模型在更广泛疾病类型和临床场景中的适用性需要进一步验证 | 提高脓毒症诊断模型的泛化能力 | 脓毒症患者和急性髓系白血病患者的转录组数据 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序，批量转录组测序，荧光激活细胞分选 | 迁移学习 | 转录组数据 | 来自三个转录组平台和FACS的七个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 9917 | 2025-10-07 |
Metabolic Labeling and Digital Microfluidic Single-Cell Sequencing for Single Bacterial Genotypic-Phenotypic Analysis
2024-11, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202402177
PMID:39077951
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研究论文 | 开发了一种基于数字微流控的单细菌基因型-表型分析方法，用于抗生素耐药性分析 | 首次将代谢标记与数字微流控单细胞测序相结合，实现单细菌水平的基因型和表型同步分析 | NA | 开发能够同时分析细菌基因型和表型特征的方法，以全面了解抗生素耐药性 | 抗生素耐药性细菌 | 单细胞测序 | 细菌感染 | 全基因组测序，代谢标记，数字微流控 | NA | 基因组数据，荧光图像数据 | NA | NA | 单细胞全基因组测序 | 数字微流控平台 | 数字微流控自动化检测系统，用于单细菌分离和测序 |
| 9918 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing analysis of chronic subdural hematoma cell subpopulations and their potential therapeutic mechanisms
2024-06-01, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
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研究论文 | 通过单细胞测序分析慢性硬膜下血肿患者外周血和血肿中的细胞亚群及其潜在治疗机制 | 首次通过单细胞测序对慢性硬膜下血肿手术切除血肿中的细胞进行全面分类，并发现cDC2和M2巨噬细胞在病灶部位的富集与脑损伤相关 | 样本量有限，需要更大规模研究验证细胞亚群比例与疾病复发的相关性 | 分析慢性硬膜下血肿细胞亚群组成及其与疾病发生发展的关系 | 慢性硬膜下血肿患者的外周血和手术切除的血肿组织 | 单细胞测序分析 | 慢性硬膜下血肿 | 单细胞测序 | UMAP降维聚类分析 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9919 | 2025-04-04 |
Integration of Flow Cytometry and Single-Cell RNA Sequencing Analysis to Explore the Fibroblast Subpopulations in Keloid that Correlate with Recurrence
2025-Apr-03, Advances in wound care
IF:5.8Q1
DOI:10.1089/wound.2024.0262
PMID:40177712
|
研究论文 | 本研究通过整合流式细胞术和单细胞RNA测序分析，探索了与瘢痕疙瘩复发相关的成纤维细胞亚群 | 首次鉴定了影响瘢痕疙瘩复发的关键致病性成纤维细胞亚群FB1，并发现CD26+/CD117+/CD34+表型可作为复发预测标志物 | 研究样本来源为公共数据库，缺乏独立验证队列 | 鉴定参与瘢痕疙瘩复发的关键致病性细胞亚群 | 瘢痕疙瘩组织中的成纤维细胞亚群 | 单细胞组学 | 皮肤纤维化疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术(FCM) | 逻辑回归分析 | 单细胞转录组数据、流式细胞数据 | 公共数据库中的瘢痕疙瘩组织样本（具体数量未说明） | NA | NA | NA | NA |
| 9920 | 2025-10-07 |
PKCδ Germline Variants and Genetic Deletion in Mice Augment Antitumor Immunity through Regulation of Myeloid Cells
2025-Apr-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0999
PMID:39808445
|
研究论文 | 本研究通过分析种系变异发现PKCδ是癌症免疫治疗的潜在靶点，并证实其缺失可通过调节髓系细胞增强抗肿瘤免疫 | 首次将PKCδ种系变异与肿瘤免疫特征关联，并证明其通过调控巨噬细胞M1/M2表型转换增强抗PD-1/PD-L1疗效 | 主要基于小鼠模型，临床样本验证仍需扩展 | 探索新型癌症免疫治疗靶点 | PKCδ基因变异、髓系细胞、肿瘤微环境 | 癌症免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序、基因敲除、条件性基因删除 | NA | 基因表达数据、临床样本数据 | 小鼠模型和临床样本（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |