单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 9901 - 9920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9901 | 2024-08-07 |
Accurate estimation of pathway activity in single cells for clustering and differential analysis
2024-Jul-23, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278431.123
PMID:38981682
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研究论文 | 本文介绍了SiPSiC方法，用于在单细胞水平上推断通路活性，以进行更敏感的差异分析和细胞聚类 | SiPSiC方法能够在单细胞水平上更敏感地进行差异分析，并利用通路评分进行细胞聚类和计算UMAP等投影 | NA | 开发一种新方法来推断单细胞中的通路活性，以改进细胞聚类和差异分析 | COVID-19、肺腺癌和胶质瘤数据集 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因集 | NA |
| 9902 | 2024-08-07 |
Chemokine-mediated cell migration into the central nervous system in progressive multifocal leukoencephalopathy
2024-Jul-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101622
PMID:38917802
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研究论文 | 本研究分析了进行性多灶性白质脑病（PML）患者脑脊液（CSF）中的趋化因子信号和吸引的免疫细胞，以定义与PML免疫反应相关的免疫细胞亚群 | 首次通过单细胞转录组学分析PML患者CSF细胞，揭示了特定CD4和CD8 T细胞亚群及其表达的趋化因子受体和PML风险基因 | NA | 研究PML中趋化因子介导的免疫细胞迁移及其在疾病发展中的作用 | 进行性多灶性白质脑病（PML）患者的脑脊液中的趋化因子和免疫细胞 | NA | 进行性多灶性白质脑病 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | NA |
| 9903 | 2024-08-07 |
Monitoring melanoma patients on treatment reveals a distinct macrophage population driving targeted therapy resistance
2024-Jul-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101611
PMID:38942020
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了接受BRAFi/MEKi治疗的黑色素瘤患者中耐药和响应肿瘤的细针抽吸物，揭示了与靶向治疗耐药相关的特定巨噬细胞群体。 | 发现了与靶向治疗耐药相关的POSTN基因及其信号传导的巨噬细胞群体，并证明了这些巨噬细胞通过CD44受体直接保护黑色素瘤细胞免受MEKi诱导的杀伤。 | NA | 揭示黑色素瘤靶向治疗耐药的机制 | 黑色素瘤患者的耐药和响应肿瘤 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 接受BRAFi/MEKi治疗的黑色素瘤患者的耐药和响应肿瘤样本 |
| 9904 | 2024-08-07 |
Deciphering the role of ferroptosis in rheumatoid arthritis: Synovial transcriptome analysis and immune infiltration correlation
2024-Jul-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33648
PMID:39091931
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研究论文 | 本研究通过转录组分析和免疫浸润相关性探讨铁死亡在类风湿性关节炎中的作用 | 首次揭示了铁死亡相关基因在类风湿性关节炎中的表达及其与免疫细胞浸润的关系，并验证了TIMP1作为潜在的生物标志物和治疗靶点 | NA | 探讨铁死亡在类风湿性关节炎发病机制中的作用 | 类风湿性关节炎患者的滑膜组织 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 转录组差异基因分析、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、受试者工作特征（ROC）曲线分析、单细胞测序 | NA | 转录组数据、单细胞测序数据 | 来自类风湿性关节炎患者的滑膜组织样本 |
| 9905 | 2024-08-07 |
Synthetic DNA barcodes identify singlets in scRNA-seq datasets and evaluate doublet algorithms
2024-Jul-10, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100592
PMID:38925122
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研究论文 | 本文利用合成DNA条形码数据集来识别单细胞RNA测序（scRNA-seq）中的单细胞（singlets），并评估双细胞（doublets）检测算法 | 提出了一种新的框架“singletCode”，用于评估现有的双细胞检测方法，并利用真实单细胞数据训练机器学习分类器，该分类器在双细胞检测算法中表现更优 | NA | 开发一种新的方法来识别和评估scRNA-seq数据中的单细胞和双细胞 | 单细胞RNA测序数据中的单细胞和双细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 机器学习分类器 | RNA序列 | NA |
| 9906 | 2024-08-07 |
DeepIMAGER: Deeply Analyzing Gene Regulatory Networks from scRNA-seq Data
2024-Jun-27, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14070766
PMID:39062480
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DeepIMAGER的高级计算工具，用于通过深度学习和数据集成推断细胞特异性基因调控网络（GRNs） | DeepIMAGER通过将基因对的共表达模式转换为图像样表示，并利用转录因子（TF）结合信息进行模型训练，提高了GRN推断的准确性和鲁棒性 | NA | 研究目的是开发一种新的计算工具，以提高从单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中推断基因调控网络的准确性 | 研究对象包括多种细胞类型的基因调控网络和转录因子 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤 | scRNA-seq, ChIP-seq | 深度学习模型 | 图像, 基因表达数据 | 涉及六种细胞系的scRNA-seq和ChIP-seq数据 |
| 9907 | 2024-08-07 |
Single-cell landscape of immunological responses in elderly patients with sepsis
2024-Jun-22, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-024-00446-z
PMID:38909272
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了年轻和老年脓毒症患者的外周血样本，探讨了免疫细胞的转录组特征及其在老年脓毒症患者中的变化 | 首次揭示了老年脓毒症患者中免疫细胞的表型转变、表达异质性及细胞间通讯，并发现了HLA-KIR的新型相互作用 | NA | 探究老年脓毒症患者免疫反应的病理机制 | 老年脓毒症患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 年轻和老年脓毒症患者的外周血样本 |
| 9908 | 2024-08-07 |
Integrative multi-omics profiling in human decedents receiving pig heart xenografts
2024-May, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-024-02972-1
PMID:38760586
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研究论文 | 本文通过多组学分析方法，研究了接受猪心脏异种移植的人类受者的分子和免疫反应 | 首次详细描述了心脏异种移植后早期分子和免疫反应的差异，并揭示了新的见解 | 研究仅基于两名受者的样本，可能限制了结果的普遍性 | 深入理解异种移植后的详细分子景观，并探索改善移植结果的靶向治疗方法 | 接受猪心脏异种移植的人类受者的血液和组织样本 | 数字病理学 | NA | 转录组学、脂质组学、蛋白质组学和代谢组学 | NA | 血液样本和组织样本 | 两名受者 |
| 9909 | 2024-08-07 |
Establishment and Evaluation of Exosomes-Related Gene Risk Model in Hepatocellular Carcinoma
2024-Apr, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-023-10441-6
PMID:37405532
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研究论文 | 本研究通过分析肝细胞癌患者血液样本中外泌体mRNA表达水平，建立并评估了一个基于外泌体相关基因的风险预测模型，用于肝癌的诊断和预后评估 | 首次证实了与肝癌发生发展相关的六个基因存在于血液外泌体中，可用于肝癌患者的液体活检，避免了穿刺诊断的需要 | NA | 建立一个基于外泌体mRNA表达水平的风险预测模型，用于肝癌的诊断和预后评估 | 肝细胞癌患者血液样本中的外泌体mRNA表达水平 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 液体活检 | Lasso Cox分析 | mRNA数据 | 肝细胞癌患者和正常对照的mRNA数据来自TCGA和exoRBase 2.0数据库 |
| 9910 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Pro-angiogenic Macrophage Profiles Reveal Novel Prognostic Biomarkers and Therapeutic Targets for Osteosarcoma
2024-Apr, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-023-10483-w
PMID:37603193
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了与骨肉瘤预后相关的促血管生成巨噬细胞亚型，并发现了新的预后生物标志物和治疗靶点 | 首次报道了促血管生成巨噬细胞在骨肉瘤预后中的作用，并开发了一个基于LASSO算法的预后模型 | NA | 探索骨肉瘤的预后生物标志物和治疗靶点 | 骨肉瘤患者的促血管生成巨噬细胞亚型及其相关基因 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | LASSO算法 | 基因表达数据 | NA |
| 9911 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals RAC1 Involvement in Macrophages Efferocytosis in Diabetic Kidney Disease
2024-Apr, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-023-01942-y
PMID:38064011
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了RAC1在糖尿病肾病中巨噬细胞吞噬作用中的作用 | 首次揭示了RAC1在糖尿病肾病中巨噬细胞吞噬作用中的关键作用，并通过实验验证了RAC1的表达变化对巨噬细胞功能的影响 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，未涉及体内实验验证 | 探讨糖尿病肾病中巨噬细胞吞噬作用相关的分子机制 | 糖尿病肾病中的巨噬细胞及其吞噬作用 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及多个数据集，包括GSE131882, GSE195460, GSE151302, GSE131685 |
| 9912 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals characteristic transcription factors in polydactyly
2024-Apr, European review for medical and pharmacological sciences
DOI:10.26355/eurrev_202404_36050
PMID:38708480
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了多指畸形中的特征性转录因子 | 本研究首次通过单细胞RNA测序数据分析了多指畸形样本中的转录因子及其调控网络，揭示了HOX家族成员和GLI2转录因子在多指畸形过程中的作用 | 研究仅基于四个多指畸形样本的单细胞RNA测序数据，样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 旨在为多指畸形的潜在生物标志物和治疗靶点的识别提供指导 | 多指畸形样本中的纤维细胞和角质细胞的转录因子及其调控网络 | 数字病理学 | 多指畸形 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 四个多指畸形样本，共11,806个单细胞 |
| 9913 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals cellular dynamics and therapeutic effects of astragaloside IV in slow transit constipation
2024-Jan-29, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2024.10187
PMID:38289380
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了黄芪甲苷IV在治疗慢传输型便秘中的细胞动态和治疗效果 | 首次揭示了黄芪甲苷IV对慢传输型便秘模型中肠道细胞比例和功能的调节作用，并通过网络药理学分析了其作用机制 | 研究仅限于动物模型，需要进一步的人体试验验证 | 确定慢传输型便秘模型中结肠组织细胞的动态变化，并研究黄芪甲苷IV治疗的效果 | 慢传输型便秘的小鼠模型和黄芪甲苷IV的治疗效果 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用洛哌丁胺诱导的慢传输型便秘小鼠模型 |
| 9914 | 2024-08-07 |
Dysregulation of endometrial stromal serotonin homeostasis leading to abnormal phosphatidylcholine metabolism impairs decidualization in patients with recurrent implantation failure
2024, Human reproduction open
IF:8.3Q1
DOI:10.1093/hropen/hoae042
PMID:39091587
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研究论文 | 本研究探讨了异常的血清素稳态是否导致反复植入失败（RIF）患者子宫内膜蜕膜化受损 | 发现RIF患者子宫内膜中血清素代谢稳态异常，伴随单胺氧化酶（MAO）表达减少，影响子宫内膜基质细胞的蜕膜化，导致胚胎植入失败 | 研究揭示了血清素代谢稳态受损和MAO表达异常降低是RIF的原因之一，但血清素在子宫内膜中的来源和其他潜在功能仍需进一步探索 | 探讨异常的血清素稳态是否导致反复植入失败（RIF）患者子宫内膜蜕膜化受损及其机制 | 反复植入失败（RIF）患者的子宫内膜样本和生育能力正常的患者子宫内膜样本 | NA | 生殖系统疾病 | ELISA、免疫荧光组织化学、单细胞测序、RNA测序（RNA-seq）、液相色谱-质谱（LC/MS） | NA | 细胞、基因表达数据 | 50个子宫内膜样本（25个RIF患者和25个生育能力正常的患者） |
| 9915 | 2024-08-07 |
Identifying potential therapeutic targets in lung adenocarcinoma: a multi-omics approach integrating bulk and single-cell RNA sequencing with Mendelian randomization
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1433147
PMID:39092217
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研究论文 | 本研究通过整合批量和单细胞RNA测序数据与孟德尔随机化方法，旨在识别肺腺癌的新治疗靶点 | 本研究采用多组学方法，结合批量和单细胞RNA测序数据，以及孟德尔随机化分析，揭示了肺腺癌的潜在治疗靶点 | NA | 识别肺腺癌的新治疗靶点 | 肺腺癌及其相关基因和细胞类型 | 数字病理学 | 肺腺癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 513个肺腺癌组织和59个非肿瘤组织 |
| 9916 | 2024-08-07 |
The role of metabolic memory in diabetic kidney disease: identification of key genes and therapeutic targets
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1379821
PMID:39092227
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研究论文 | 本研究探讨了代谢记忆在糖尿病肾病中的作用，并通过单细胞RNA测序数据识别关键基因和治疗靶点 | 本研究首次结合人类数据和动物模型，识别出与代谢记忆和纤维化相关的关键基因NDRG1，并验证了其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于数据库数据和动物模型，需要进一步的人体临床试验验证 | 探索代谢记忆在糖尿病肾病中的作用及潜在的治疗靶点 | 糖尿病肾病中的代谢记忆和纤维化相关基因 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及12种细胞类型，包括人类和动物模型 |
| 9917 | 2024-08-07 |
Single-cell and spatial transcriptomics of the infarcted heart define the dynamic onset of the border zone in response to mechanical destabilization
2022-Nov, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-022-00160-3
PMID:39086770
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研究论文 | 本文通过单细胞/核RNA测序、空间转录组学和多重RNA荧光原位杂交技术，重新定义了心肌梗死边界区（BZ）的细胞和分子机制。 | 首次通过单细胞和空间转录组学技术详细描述了心肌梗死边界区的动态变化，并提出了‘邻居丢失’假说来解释其转录反应的机制。 | NA | 深入理解心肌梗死边界区的细胞和分子机制。 | 心肌梗死边界区的细胞和分子机制。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞/核RNA测序、空间转录组学、多重RNA荧光原位杂交 | NA | 转录组数据 | NA |
| 9918 | 2024-08-07 |
Stem Cell Pluripotency Genes Klf4 and Oct4 Regulate Complex SMC Phenotypic Changes Critical in Late-Stage Atherosclerotic Lesion Pathogenesis
2020-11-24, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和染色质免疫沉淀测序等技术，探讨了Klf4和Oct4基因在晚期动脉粥样硬化病变中对平滑肌细胞表型变化的影响。 | 研究发现平滑肌细胞在晚期动脉粥样硬化病变中表现出比普遍认为的更大的表型可塑性，并且Klf4基因调控了多种表型的转变，包括可能对晚期动脉粥样硬化病变有害的Lgals3+成骨细胞。 | NA | 探讨晚期动脉粥样硬化病变中平滑肌细胞的来源、身份和功能，以及它们如何控制斑块稳定性。 | 晚期动脉粥样硬化病变中的平滑肌细胞和内皮细胞。 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序 | NA | RNA | 人类颈动脉内膜切除术样本和微切割的小鼠晚期动脉粥样硬化病变样本 |
| 9919 | 2024-08-07 |
Research and application of single-cell sequencing in tumor heterogeneity and drug resistance of circulating tumor cells
2020-Nov-10, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-020-00240-1
PMID:33292625
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研究论文 | 本文研究了单细胞测序技术在肿瘤异质性和循环肿瘤细胞药物抗性中的应用 | 利用单细胞测序技术研究循环肿瘤细胞，避免了肿瘤异质性的干扰，为理解肿瘤药物抗性提供了新视角 | NA | 探讨单细胞测序技术在解决肿瘤异质性和药物抗性问题中的应用 | 肿瘤异质性和循环肿瘤细胞的药物抗性 | 数字病理学 | 恶性肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 9920 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome conservation in a comparative analysis of fresh and cryopreserved human skin tissue: pilot in localized scleroderma
2020-11-09, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-020-02343-4
PMID:33168063
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研究论文 | 本研究评估了使用CryoStor® CS10与RPMI在局部硬皮病患者皮肤组织中细胞组成和细胞特异性基因表达的变异性 | 首次比较了新鲜和冷冻保存的人类皮肤组织在单细胞转录组水平上的保守性 | 研究样本量较小，仅包括3名局部硬皮病患者 | 评估不同保存方法对局部硬皮病患者皮肤组织细胞组成和基因表达的影响 | 局部硬皮病患者的皮肤组织 | 数字病理学 | 硬皮病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 3名局部硬皮病患者的皮肤活检样本 |