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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 9881 - 9900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9881 | 2025-10-07 |
Gene interactions analysis of brain spatial transcriptome for Alzheimer's disease
2024-Nov, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2024.101337
PMID:39281834
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研究论文 | 本研究通过分析阿尔茨海默病脑空间转录组数据，揭示了淀粉样蛋白-β积累过程中基因相互作用的动态变化 | 首次基于空间转录组学识别淀粉样蛋白-β积累过程中的多种基因关联，从时空依赖的基因相互作用角度为AD病因研究提供新视角 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据验证相对有限 | 揭示阿尔茨海默病中基因相互作用的时空动态特征 | 小鼠和人类大脑组织 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组测序,单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据,单核RNA-seq数据 | 敲除AD和野生型小鼠模型，不同AD小鼠模型，人类单核RNA-seq数据 | NA | 空间转录组学,单核RNA-seq | NA | NA |
| 9882 | 2025-10-07 |
Esophageal epithelial Ikkβ deletion promotes eosinophilic esophagitis in experimental allergy mouse model
2024-Jul-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.05.602313
PMID:39026724
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研究论文 | 本研究通过构建食管上皮细胞Ikkβ条件性敲除小鼠模型，揭示了上皮IKKβ/NFκB信号通路在嗜酸性食管炎发病机制中的关键保护作用 | 首次在实验性过敏小鼠模型中证明食管上皮细胞特异性Ikkβ缺失会加剧嗜酸性食管炎病理特征，并利用单细胞RNA测序技术深入解析了上皮分化和屏障完整性的破坏机制 | 研究基于小鼠模型，其病理特征与人类疾病的完全对应性仍需进一步验证 | 探究上皮IKKβ/NFκB信号通路在嗜酸性食管炎发病机制中的作用 | 食管上皮细胞条件性Ikkβ敲除小鼠 | 单细胞测序分析 | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序，RNA测序，组织学分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据，组织学图像数据 | Ikkβ EEC-KO小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9883 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis identifies PLK1 as a driver of immunosuppressive tumor microenvironment in LUAD
2024-Jun, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011309
PMID:38885192
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析发现PLK1是肺腺癌免疫抑制肿瘤微环境的关键驱动因子 | 首次揭示PLK1通过调控CXCL2细胞因子分泌促进肿瘤相关巨噬细胞M2极化和抑制抗原呈递过程的新机制 | 研究主要基于基因工程小鼠模型，人类临床样本验证尚不充分 | 探究PLK1在肺腺癌免疫抑制肿瘤微环境形成中的作用机制 | 肺腺癌小鼠模型和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 单细胞分析 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | 基因工程小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9884 | 2025-10-07 |
Targeting mTOR in myeloid cells prevents infection-associated inflammation
2025-Apr-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112163
PMID:40177636
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现mTOR通路在COVID-19患者髓系细胞调控中的关键作用，并开发了靶向髓系细胞的mTOR抑制纳米生物制剂 | 首次开发靶向髓系细胞及其骨髓前体细胞的mTOR抑制纳米生物制剂，证明其能有效抑制感染相关炎症 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用效果需进一步验证 | 探索mTOR通路在感染相关炎症中的作用并开发相应治疗策略 | COVID-19患者循环免疫细胞、人原代免疫细胞、高炎症和急性呼吸窘迫综合征小鼠模型 | 单细胞测序 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, F-FDG摄取检测 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据, 代谢活性数据 | COVID-19患者循环免疫细胞、人原代免疫细胞和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9885 | 2025-10-07 |
AXL-Mediated Drug Resistance in ALK-Rearranged NSCLC Enhanced by GAS6 From Macrophages and MMP11 Positive Fibroblasts
2025-Apr, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70006
PMID:39904499
|
研究论文 | 本研究揭示了AXL介导的ALK重排非小细胞肺癌耐药机制，发现肿瘤微环境中巨噬细胞和MMP11阳性成纤维细胞分泌的GAS6增强耐药性 | 首次发现肿瘤微环境中特定CAFs和TAMs亚群是Gas6主要来源，并揭示MMP11上调与耐药性关联 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系实验，人类患者样本验证有限 | 探究ALK重排NSCLC对alectinib耐药的分子机制 | ALK重排非小细胞肺癌细胞系H3122、小鼠模型、患者样本 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 患者耐药样本、细胞系和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9886 | 2025-10-07 |
High-throughput single cell -omics using semi-permeable capsules
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.14.642805
PMID:40166174
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于半透性胶囊的高通量单细胞多组学技术 | 开发了半透性胶囊技术，克服了液滴微流控系统长期培养的限制，支持单细胞克隆扩增并提供优异的转录本捕获能力 | NA | 开发适用于多种高通量核酸分析的单细胞多组学技术 | 造血系统疾病患者的白细胞，特别是急性髓系白血病样本 | 单细胞多组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序，数字PCR，基因组测序，FACS分选 | NA | 单细胞转录组数据 | 造血系统疾病患者的白细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | CapSeq（胶囊测序） | 基于半透性胶囊的单细胞测序技术 |
| 9887 | 2025-10-07 |
Mouse-Geneformer: A deep learning model for mouse single-cell transcriptome and its cross-species utility
2025-Mar, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011420
PMID:40106407
|
研究论文 | 开发了针对小鼠单细胞转录组的深度学习模型mouse-Geneformer，并验证其跨物种应用潜力 | 构建了首个基于2100万小鼠单细胞转录组数据预训练的Geneformer模型，并首次系统评估了该模型在跨物种分析中的效用 | 在人类COVID-19模型中的预测结果与人类专用Geneformer仅部分一致，表明物种特异性模型对某些疾病机制捕获存在局限 | 开发适用于小鼠单细胞转录组分析的深度学习模型，并探索其跨物种应用能力 | 小鼠和人类的单细胞转录组数据 | 自然语言处理, 机器学习 | 心肌梗死, COVID-19 | 单细胞RNA测序 | Transformer Encoder | 单细胞转录组数据 | 2100万个小鼠单细胞转录组图谱 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9888 | 2025-10-07 |
Chemokine Ligands and Receptors Regulate Macrophage Polarization in Atherosclerosis: A Comprehensive Database Mining Study
2025-Mar, CJC open
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.cjco.2024.11.018
PMID:40182401
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研究论文 | 通过生物信息学方法研究趋化因子配体和受体在动脉粥样硬化中调控巨噬细胞极化的作用机制 | 首次通过公共数据库挖掘和单细胞RNA测序数据系统分析趋化因子在动脉粥样硬化中调控巨噬细胞极化的网络机制 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证 | 研究趋化因子在动脉粥样硬化发生发展中的作用机制 | 巨噬细胞极化过程及相关趋化因子 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 数据库挖掘, 信号通路富集分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9889 | 2025-10-07 |
Spatial profiling of the interplay between cell type- and vision-dependent transcriptomic programs in the visual cortex
2025-Feb-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2421022122
PMID:39946537
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组分析揭示了视觉经验对初级视觉皮层L2/3神经元细胞类型空间组织和转录程序的调控机制 | 首次结合空间转录组学和单核RNA-seq数据，应用多任务理论揭示L2/3细胞类型空间分区与基因表达连续性的关联，并识别出视觉剥夺诱导的两个独立转录程序 | 研究仅聚焦于L2/3细胞类型，分析基于500个基因的空间转录组数据，可能未涵盖所有相关基因 | 探究视觉经验在关键期内如何影响哺乳动物新皮层神经元细胞类型的空间组织和转录调控 | 初级视觉皮层(V1)的L2/3神经元细胞类型 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组分析, 单核RNA-seq | 多任务理论, 2D流形模型 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 正常饲养和暗饲养条件下的L2/3细胞 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9890 | 2025-10-07 |
A prognostic model based on autophagy-and senescence-related genes for gastric cancer: implications for immunotherapy and personalized treatment
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1509771
PMID:40182050
|
研究论文 | 基于自噬和衰老相关基因构建胃癌预后模型并评估其对免疫治疗和个性化治疗的指导价值 | 首次联合分析自噬和衰老相关基因构建胃癌预后特征，并系统评估其与肿瘤微环境、免疫治疗疗效的关系 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步的前瞻性临床验证 | 开发能够预测胃癌预后和免疫治疗反应的生物标志物模型 | 胃癌患者组织样本和细胞系 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞测序，基因表达谱分析，药物敏感性分析 | Cox回归，LASSO回归，共识聚类 | 基因表达数据，临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的胃癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9891 | 2025-10-07 |
Automatically Detecting Anchor Cells and Clustering for scRNA-Seq Data Using scTSNN
2024-11, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2024.3460761
PMID:39283774
|
研究论文 | 提出了一种名为scTSNN的张量共享最近邻锚点聚类方法，用于自动检测单细胞RNA测序数据中的锚点细胞并进行聚类 | 首次利用张量亲和力学习模块挖掘细胞间的局部-全局平衡拓扑结构，并设计基于密度的共享最近邻测量方法自动检测锚点细胞 | 在无监督场景下发现真实细胞类型仍然具有挑战性 | 开发自动检测锚点细胞和确定聚类数量的单细胞RNA测序数据分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | 张量共享最近邻聚类模型 | 单细胞RNA测序数据 | 合成数据集和真实scRNA-seq数据集，包括哺乳动物细胞和宫颈癌肿瘤细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9892 | 2025-10-07 |
Inferring Characteristics of the Tumor Immune Microenvironment of Patients with HNSCC from Single-Cell Transcriptomics of Peripheral Blood
2024-09-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0092
PMID:39113621
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研究论文 | 本研究探索从头颈鳞状细胞癌患者外周血单细胞转录组数据推断肿瘤免疫微环境特征的可能性 | 首次证明可从外周血单细胞RNA测序数据推断肿瘤免疫微环境中的免疫细胞比例和基因表达谱，并开发了TIMEP预测工具 | 研究样本量有限，需要在更大规模研究中验证 | 探索从外周血推断肿瘤免疫微环境特征的方法及其在癌症免疫治疗中的应用价值 | 头颈鳞状细胞癌患者 | 生物信息学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两个头颈鳞状细胞癌患者数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 外周血单个核细胞和肿瘤组织的单细胞RNA测序 |
| 9893 | 2025-10-07 |
STFormer: Learning to Explore Spot Relationships for Spatial Transcriptomics Prediction from Histology of Colorectal Cancer
2024-Jul, Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual International Conference
DOI:10.1109/EMBC53108.2024.10782295
PMID:40031511
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研究论文 | 提出STFormer深度学习模型，通过组织学图像预测结直肠癌空间转录组数据 | 引入Style-Aug模块增强特征泛化能力，采用Cross-WSI Transformer模块有效捕获跨WSI的spot关系 | 在有限WSI数据场景下的性能表现未充分验证 | 开发从组织学图像预测空间转录组数据的成本效益方法 | 结直肠癌组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学，深度学习 | Transformer | 图像，基因表达数据 | 内部和外部数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9894 | 2025-10-07 |
Autofluorescence is a biomarker of neural stem cell activation state
2024-Apr-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.02.011
PMID:38521057
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研究论文 | 本研究利用自发荧光成像技术识别神经干细胞静息和激活状态的生物标志物 | 首次发现静息神经干细胞在特定溶酶体亚群中富集自发荧光，可作为单细胞水平预测干细胞行为的梯度标志物 | 研究仅限于小鼠神经干细胞，技术应用范围需进一步验证 | 开发非破坏性活细胞成像方法追踪神经干细胞激活状态 | 小鼠神经干细胞 | 细胞生物学 | NA | 荧光寿命成像(FLIM), 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9895 | 2025-10-07 |
Progesterone attenuates Th17-cell pathogenicity in autoimmune uveitis via Id2/Pim1 axis
2023-Jun-21, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-023-02829-3
PMID:37344856
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了孕酮通过Id2/Pim1轴减轻Th17细胞致病性来治疗自身免疫性葡萄膜炎的机制 | 首次构建了孕酮治疗实验性自身免疫性葡萄膜炎的高维免疫图谱，揭示了孕酮通过调节Id2/Pim1轴和IL-23/Th17/GM-CSF信号通路改善Th17/Treg失衡的新机制 | 研究仅限于动物模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探究孕酮治疗自身免疫性葡萄膜炎的作用机制 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型 | 单细胞组学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9896 | 2025-10-07 |
Spatial epigenome-transcriptome co-profiling of mammalian tissues
2023-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-05795-1
PMID:36922587
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研究论文 | 开发两种空间表观基因组-转录组联合分析技术，实现在同一组织切片上同时检测染色质可及性与基因表达或组蛋白修饰与基因表达 | 首次实现空间分辨的全基因组表观基因组与转录组联合分析，突破现有单组学检测限制 | 技术分辨率接近单细胞水平但尚未完全达到单细胞精度 | 探索表观遗传机制在组织中控制转录表型和细胞动态的机制 | 胚胎和幼年小鼠大脑、成年人类大脑组织 | 空间多组学 | NA | 空间表观基因组学、空间转录组学、染色质可及性测序、组蛋白修饰检测 | NA | 空间组学数据、基因表达数据、表观遗传数据 | 小鼠胚胎和幼年大脑、成年人类大脑组织样本 | NA | 空间表观基因组学、空间转录组学、单细胞多组学 | NA | NA |
| 9897 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis identifies the interaction of altered renal tubules with basophils orchestrating kidney fibrosis
2022-06, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01200-7
PMID:35552540
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研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示了肾脏纤维化中改变肾小管与嗜碱性粒细胞的相互作用机制 | 首次发现促纤维化肾小管通过分泌CXCL1招募CXCR2阳性嗜碱性粒细胞，并证实这些细胞是IL-6和Th17细胞招募的重要来源 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据验证相对有限 | 探究肾脏纤维化过程中的免疫调控机制 | 小鼠肾脏纤维化模型和人类肾脏纤维化患者样本 | 单细胞生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞测序，免疫染色，基因表达分析 | NA | 单细胞基因表达数据，bulk RNA-seq数据，免疫组织化学数据 | 小鼠模型和人类患者样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9898 | 2025-10-07 |
Deep learning and alignment of spatially resolved single-cell transcriptomes with Tangram
2021-11, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01264-7
PMID:34711971
|
研究论文 | 提出Tangram方法，将单细胞转录组数据与空间数据对齐，构建全基因组单细胞分辨率空间图谱 | 开发了能够将多种单细胞RNA测序数据与不同形式空间数据（包括MERFISH、STARmap、smFISH、空间转录组学和组织学图像）对齐的首个通用方法 | NA | 解决单细胞测序技术丢失空间信息与空间转录组技术分辨率有限的问题 | 健康小鼠脑组织视觉和体感运动区域 | 空间转录组学 | NA | scRNA-seq, snRNA-seq, MERFISH, STARmap, smFISH, SHARE-seq | 深度学习 | 单细胞转录组数据，空间转录组数据，多模态数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | 10x Visium | 空间转录组学技术 |
| 9899 | 2025-10-07 |
A comprehensive survey of regulatory network inference methods using single cell RNA sequencing data
2021-05-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa190
PMID:34020546
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综述 | 本文系统回顾了15种利用单细胞RNA测序数据推断基因调控网络的计算方法 | 首次对单细胞RNA测序数据下的调控网络推断方法进行全面比较分析，包括模拟评估方法的性能、对dropout的敏感性和时间复杂性 | 仅涵盖15种方法，可能未包含该领域所有最新进展；基于模拟数据的评估可能与真实生物系统存在差异 | 帮助生命科学家选择适合其数据和分析目的的方法，并为计算科学家开发新方法提供参考 | 基因调控网络推断方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 9900 | 2025-10-07 |
The Nuclear Receptor ESRRA Protects from Kidney Disease by Coupling Metabolism and Differentiation
2021-02-02, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2020.11.011
PMID:33301705
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示肾脏疾病中细胞多样性变化，发现近端小管细胞是易感细胞类型，并阐明代谢与细胞分化通过核受体ESRRA和PPARA耦合的机制 | 首次在单细胞水平系统揭示肾脏疾病中细胞特异性变化轨迹，发现代谢与细胞分化的耦合机制及核受体ESRRA的保护作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证尚不充分 | 探究肾脏疾病的细胞分子机制及保护性因子 | 小鼠肾脏疾病模型和患者样本 | 单细胞生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 细胞轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 小鼠疾病模型和患者样本（具体数量未明确） | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |