单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 9881 - 9900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9881 | 2024-08-07 |
Single-cell atlas of human gingiva unveils a NETs-related neutrophil subpopulation regulating periodontal immunity
2024-Jul-30, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.07.028
PMID:39084404
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析牙龈组织，揭示了与中性粒细胞外陷阱（NETs）相关的中性粒细胞亚群在牙周免疫调节中的作用 | 首次构建了牙周微环境的单细胞图谱，并识别出与NETs相关的中性粒细胞亚群（NrNeu），揭示了牙龈成纤维细胞通过MIF-CD74/CXCR4轴促进NETs生成的具体机制 | NA | 展示NETs在牙周免疫病理中的重要功能和特定机制 | 牙龈组织中的中性粒细胞及其在牙周炎中的作用 | 数字病理学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 健康个体和牙周炎患者的牙龈组织样本 |
| 9882 | 2024-08-07 |
Fatecode enables cell fate regulator prediction using classification-supervised autoencoder perturbation
2024-Jul-15, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100819
PMID:38986613
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研究论文 | 本文提出了一种名为Fatecode的计算方法，用于基于单细胞RNA测序数据预测细胞命运调控因子 | Fatecode利用深度学习分类监督自编码器学习单细胞RNA测序数据的潜在表示，并通过在潜在表示上进行模拟扰动实验来预测基因 | NA | 加速疾病或损伤后的恢复 | 细胞命运调控因子 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | 基因表达数据 | 不同生物的血液和大脑发育的单细胞RNA测序数据 |
| 9883 | 2024-08-07 |
Directly selecting cell-type marker genes for single-cell clustering analyses
2024-Jul-15, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100810
PMID:38981475
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Festem的统计方法，用于直接选择细胞类型标记基因进行单细胞聚类分析 | Festem方法能够区分具有异质性分布的标记基因，这些基因对细胞聚类具有信息性，且能高精度地选择标记基因 | NA | 开发一种新的统计方法，用于直接选择细胞类型标记基因，以提高单细胞RNA测序研究中的细胞类型识别准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型及其标记基因 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 一个大型的肝内胆管癌数据集 |
| 9884 | 2024-08-07 |
Comment on Hu et al. Single-Cell Transcriptomics Reveals Novel Role of Microglia in Fibrovascular Membrane of Proliferative Diabetic Retinopathy. Diabetes 2022;71:762-773
2024-Jul-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db24-0041
PMID:38900953
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9885 | 2024-08-07 |
An attenuated lymphocytic choriomeningitis virus vector enhances tumor control in mice partly via IFN-I
2024-Jun-11, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI178945
PMID:38861331
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研究论文 | 研究报道了一种基于减毒淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒（r3LCMV）的非裂解性病毒载体在多种肿瘤模型中显著增强肿瘤控制和提高生存率的效果 | 首次展示了r3LCMV病毒载体在免疫缺陷小鼠模型中的肿瘤控制效果，并揭示了宿主内在的IFN-I在其抗肿瘤功效中的关键作用 | 文章未明确提及具体的局限性 | 探索和验证新型病毒载体在癌症治疗中的应用效果 | 肿瘤模型中的小鼠 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个肿瘤模型中的小鼠 |
| 9886 | 2024-08-07 |
PIK3CA inhibition in models of proliferative glomerulonephritis and lupus nephritis
2024-Jun-06, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI176402
PMID:38842935
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研究论文 | 本文通过使用多种遗传工程小鼠模型、单细胞RNA测序和空间转录组学，展示了PIK3CA通路在增殖性肾小球肾炎发展中的关键作用，并证明了PI3Kα抑制剂alpelisib在不同小鼠模型中改善肾小球病变和肾功能的效果。 | 首次揭示了PI3Kα抑制剂在增殖性肾小球肾炎和狼疮性肾炎中的双重作用，不仅影响足细胞，还影响免疫系统。 | 研究主要基于小鼠模型和从活动性狼疮性肾炎患者中分离的人淋巴细胞，尚未在更广泛的人类患者群体中进行验证。 | 探讨PIK3CA抑制在增殖性肾小球肾炎和狼疮性肾炎中的作用及其机制。 | 增殖性肾小球肾炎和狼疮性肾炎的小鼠模型及活动性狼疮性肾炎患者的人淋巴细胞。 | NA | 肾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | RNA | 多种遗传工程小鼠模型及活动性狼疮性肾炎患者的人淋巴细胞 |
| 9887 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic analysis deciphers heterogenous cancer stem-like cells in colorectal cancer and their organ-specific metastasis
2024-02-23, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-330243
PMID:38050068
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和空间转录组分析，揭示了结直肠癌中异质性癌症干细胞样细胞及其器官特异性转移的机制 | 首次通过综合分析揭示了结直肠癌中具有高PTPRO和ASCL2表达的干细胞样细胞群是转移的关键，并展示了这些细胞群在肝脏和卵巢转移中的特异性 | NA | 揭示结直肠癌中异质性癌症细胞的类型及其器官特异性转移的机制 | 结直肠癌原发肿瘤及肝脏和卵巢转移中的单细胞转录组 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及结直肠癌原发肿瘤及肝脏和卵巢转移的样本 |
| 9888 | 2024-08-07 |
AGBL4 promotes malignant progression of glioblastoma via modulation of MMP-1 and inflammatory pathways
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1420182
PMID:39007144
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研究论文 | 本研究探讨了AGBL4在胶质母细胞瘤（GBM）恶性进展中的作用及其与炎症途径的关联 | 发现AGBL4通过调节MMP-1和炎症途径促进GBM的恶性进展，并建立了一个新的调控轴 | NA | 阐明GBM的分子机制，特别是AGBL4与炎症途径的关系，以发现可行的治疗靶点 | AGBL4在GBM中的表达及其对细胞增殖、迁移、侵袭和炎症反应的影响 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 9889 | 2024-08-07 |
NNMT enriches for AQP5+ cancer stem cells to drive malignant progression in early gastric cardia adenocarcinoma
2023-12-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2022-328408
PMID:36977555
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探索早期胃食管腺癌（EGCA）的细胞和分子异质性 | 本研究首次揭示了NNMT+/AQP5+细胞群在EGCA恶性进展中的作用，并提出了可能的早期诊断和治疗策略 | NA | 深入理解早期胃食管腺癌的异质性及其恶性进展机制 | 早期胃食管腺癌及其配对的非恶性活检样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 95,551个细胞 |
| 9890 | 2024-08-07 |
Tff2 defines transit-amplifying pancreatic acinar progenitors that lack regenerative potential and are protective against Kras-driven carcinogenesis
2023-08-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.07.002
PMID:37541213
|
研究论文 | 研究通过长期谱系追踪和单细胞RNA测序分析，揭示了表达Tff2的胰腺腺泡前体细胞在正常稳态中的作用及其在Kras驱动的癌变中的保护作用 | 首次定义了表达Tff2的胰腺腺泡过渡放大前体细胞（TAP），并揭示其在Kras驱动的癌变中的保护作用 | NA | 探讨胰腺腺泡前体细胞在正常稳态及癌变过程中的作用 | 表达Tff2的胰腺腺泡前体细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 9891 | 2024-08-07 |
A molecular atlas of the human postmenopausal fallopian tube and ovary from single-cell RNA and ATAC sequencing
2022-12-20, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111838
PMID:36543131
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和ATAC测序技术，构建了人类绝经后输卵管和卵巢的分子图谱 | 首次提供了绝经后输卵管和卵巢的单细胞转录组和染色质可及性图谱，揭示了不同细胞类型在基因表达和调控上的差异 | NA | 生成绝经后卵巢和输卵管的单细胞转录组和调控组学图谱，以增进对更年期妇科疾病的理解 | 绝经后的人类卵巢和输卵管 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | NA | 转录组和染色质可及性数据 | 86,708个细胞用于scRNA-seq，59,830个细胞用于scATAC-seq |
| 9892 | 2024-08-07 |
Transfer learning efficiently maps bone marrow cell types from mouse to human using single-cell RNA sequencing
2020-12-04, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-01463-6
PMID:33277618
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据和迁移学习技术，成功实现了从小鼠到人类骨髓细胞类型的有效映射 | 首次展示了迁移学习在跨物种骨髓生物学映射中的应用，并证明了简单机器学习模型在有限数据下重建复杂生物学的能力 | 某些人类细胞类型难以识别，表明物种间存在重要的生物学差异 | 探索迁移学习在跨物种生物学研究中的应用 | 小鼠和人类的骨髓细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 多类逻辑回归模型 | 数据 | 少于10个人类细胞类型 |
| 9893 | 2024-08-07 |
WWOX Loss of Function in Neurodevelopmental and Neurodegenerative Disorders
2020-Nov-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21238922
PMID:33255508
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研究论文 | 本文探讨了WWOX基因功能丧失在神经发育和神经退行性疾病中的作用 | 首次全面描述了WWOX基因在多种中枢神经系统疾病中的表达模式及其与疾病的相关性 | 尚未完全阐明WWOX功能丧失导致神经退行性疾病的具体分子机制 | 研究WWOX基因在神经发育和神经退行性疾病中的作用及其分子机制 | WWOX基因及其在中枢神经系统中的表达 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | RNA原位杂交, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及人类和小鼠的多个脑区及特定神经元亚型 |
| 9894 | 2024-08-07 |
TLR-9 agonist and CD40-targeting vaccination induces HIV-1 envelope-specific B cells with a diversified immunoglobulin repertoire in humanized mice
2020-11, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1009025
PMID:33253297
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研究论文 | 本研究探讨了在人源化小鼠中，通过CD40靶向疫苗与CpG-B佐剂联合使用，诱导针对HIV-1 Env蛋白的B细胞反应及其免疫球蛋白谱系多样性 | 本研究首次展示了CD40靶向疫苗与CpG-B佐剂联合使用能在人源化小鼠中有效促进人B细胞从IgM向IgG的转变和成熟，并诱导出针对HIV-1 Env蛋白的特异性IgG转换记忆B细胞 | 研究主要在人源化小鼠模型中进行，其结果在人类中的直接应用尚需进一步验证 | 开发针对HIV-1的疫苗，特别是在人源化小鼠模型中诱导人B细胞和T细胞的反应 | 人源化小鼠中的B细胞和T细胞反应 | 疫苗学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 9895 | 2024-08-07 |
Inference of mutability landscapes of tumors from single cell sequencing data
2020-11, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1008454
PMID:33253159
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MULAN的最大似然计算框架，用于从单细胞测序数据中推断肿瘤细胞的突变率，从而构建肿瘤的突变景观 | 提出了MULAN框架，利用癌症突变树提供的部分突变事件顺序信息，推断肿瘤的完整进化历史和突变景观 | NA | 开发一种新的计算框架，用于从单细胞测序数据中推断肿瘤的突变率和进化历史 | 肿瘤细胞的突变率和进化历史 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 最大似然法 | 单细胞测序数据 | NA |
| 9896 | 2024-08-07 |
Integrated Skin Transcriptomics and Serum Multiplex Assays Reveal Novel Mechanisms of Wound Healing in Diabetic Foot Ulcers
2020-10, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db20-0188
PMID:32763913
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研究论文 | 本研究通过综合分析糖尿病足溃疡（DFU）患者的皮肤转录组和血清多重检测，揭示了伤口愈合的新机制。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序分析了糖尿病足溃疡患者的皮肤纤维母细胞群和炎症情况，并识别了可能影响伤口愈合的关键基因和通路。 | NA | 探讨糖尿病足溃疡伤口愈合的新机制。 | 糖尿病足溃疡患者的皮肤和血清。 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 一组糖尿病足溃疡患者 |
| 9897 | 2024-08-07 |
Exploring Additional Valuable Information From Single-Cell RNA-Seq Data
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.593007
PMID:33335900
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review | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据在细胞间通信探索、RNA速度推断、大规模拷贝数变异和单核苷酸变化识别、染色质可及性预测等方面的应用 | 探讨了scRNA-seq数据在发现新基因/转录本、长非编码RNA和环状RNA的分析，以及单细胞和批量RNA-seq数据集整合的应用 | NA | 旨在探索scRNA-seq数据在基础科学和临床应用中的额外价值 | scRNA-seq数据中的细胞间通信、RNA速度、拷贝数变异、单核苷酸变化、染色质可及性、新基因/转录本、长非编码RNA和环状RNA | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | text | NA |
| 9898 | 2024-08-07 |
Anti-EGFR Antibody-Drug Conjugate Carrying an Inhibitor Targeting CDK Restricts Triple-Negative Breast Cancer Growth
2024-Aug-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-3110
PMID:38772416
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研究论文 | 本研究探讨了一种基于西妥昔单抗的抗体药物偶联物（ADC），该ADC携带CDK抑制剂SNS-032，用于靶向EGFR表达的细胞，以限制三阴性乳腺癌的生长 | 本研究创新性地结合了EGFR抗体和CDK抑制剂，通过ADC的形式实现对EGFR高表达肿瘤细胞的选择性杀伤，同时减少对免疫细胞的影响 | 尽管ADC在体外和体内实验中显示出良好的抗肿瘤效果，但其长期疗效和安全性仍需进一步的临床研究验证 | 旨在开发一种新的治疗策略，通过靶向EGFR和细胞周期调控，有效治疗三阴性乳腺癌 | 三阴性乳腺癌细胞及其在体内的生长情况 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 转录组分析、单细胞RNA测序、空间转录组分析 | NA | 转录组数据、单细胞RNA数据、空间转录组数据 | 6,173个原发性肿瘤样本，27个基线和匹配的化疗后残留肿瘤样本，150,290个细胞，27个未经治疗的肿瘤样本，43个肿瘤切片，22个三阴性乳腺癌样本 |
| 9899 | 2024-08-07 |
Metastasis and basement membrane-related signature enhances hepatocellular carcinoma prognosis and diagnosis by integrating single-cell RNA sequencing analysis and immune microenvironment assessment
2024-Jul-31, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05493-0
PMID:39085893
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序分析和免疫微环境评估，探讨了转移和基底膜相关标志物在肝细胞癌（HCC）预后和诊断中的作用。 | 本研究首次构建了基于转移和基底膜相关基因（MBRGs）的预后模型，并结合免疫相关算法分析了高风险和低风险组的免疫景观和活性。 | 研究样本主要来自TCGA和ICGC数据库，可能存在一定的选择偏倚；实验验证主要依赖于数据库分析，缺乏体内外实验的直接证据。 | 旨在通过研究转移和基底膜相关标志物，提高肝细胞癌患者的生存结果和治疗效果。 | 肝细胞癌（HCC）患者及其转移和基底膜相关基因（MBRGs）。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Cox回归分析 | 转录组数据 | 424名来自TCGA数据库的HCC患者和240名来自ICGC数据库的HCC患者 |
| 9900 | 2024-08-07 |
scLEGA: an attention-based deep clustering method with a tendency for low expression of genes on single-cell RNA-seq data
2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae371
PMID:39060167
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研究论文 | 本文提出了一种基于注意力机制的深度聚类方法scLEGA，用于单细胞RNA测序数据中低表达基因的细胞类型推断 | scLEGA采用了一种新的零膨胀负二项分布（ZINB）损失函数，结合了多头部注意力机制和两种不同的单细胞RNA测序聚类策略，优化了低表达基因的贡献 | NA | 开发一种新的细胞类型推断方法，以提高单细胞RNA测序数据中细胞聚类的准确性、可扩展性和稳定性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 注意力机制、图卷积网络（GCN） | 基因表达数据 | 15个单细胞RNA测序数据集 |