单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 9881 - 9900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9881 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Shows T-Cell Exhaustion Landscape in the Peripheral Blood of Patients with Hepatitis B Virus-Associated Acute-on-Chronic Liver Failure
2024-05-15, Gut and liver
IF:3.4Q2
DOI:10.5009/gnl220449
PMID:37317515
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了乙型肝炎病毒相关急性慢性肝衰竭患者外周血中T细胞亚群的异质性和耗竭T淋巴细胞的特征 | 本研究首次通过单细胞RNA测序揭示了乙型肝炎病毒相关急性慢性肝衰竭患者外周血中T细胞的耗竭景观，并分析了耗竭T细胞的基因表达谱和发展轨迹 | 研究样本仅包括乙型肝炎病毒相关急性慢性肝衰竭患者和健康对照，未涉及其他疾病状态的患者 | 探索乙型肝炎病毒相关急性慢性肝衰竭患者外周血T细胞亚群的异质性和耗竭T淋巴细胞的特征，以识别免疫功能障碍的潜在治疗靶点 | 乙型肝炎病毒相关急性慢性肝衰竭患者和健康对照的外周血T细胞 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 83,577个T细胞 |
| 9882 | 2024-08-08 |
Spatial and single-cell colocalisation analysis reveals MDK-mediated immunosuppressive environment with regulatory T cells in colorectal carcinogenesis
2024-May, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105102
PMID:38614865
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞共定位分析，揭示了中肾因子（MDK）介导的免疫抑制环境与调节性T细胞（Tregs）在结直肠癌发生中的作用 | 首次在结直肠癌早期阶段通过空间分布的单细胞分析，识别出MDK作为肿瘤上皮细胞向Tregs发送的主要信号分子，并发现MDK与SDC4的相互作用与Treg共定位相关 | 研究样本量较小，仅包括五个早期结直肠癌病例和一个晚期病例 | 探究促进腺瘤向散发性结直肠癌进展的细胞间相互作用因子，并评估其在结直肠癌患者中的临床意义 | 结直肠癌的肿瘤微环境中的细胞间相互作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学，单细胞转录组 | 深度生成模型 | 单细胞数据 | 五个早期结直肠癌病例和一个晚期病例 |
| 9883 | 2024-08-08 |
Intratumoral CD38+CD19+B cells associate with poor clinical outcomes and immunosuppression in patients with pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-May, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105098
PMID:38608514
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探讨胰腺导管腺癌（PDAC）中B细胞的异质性，并发现CD38+ B细胞的存在与不良临床结果和免疫抑制相关。 | 首次揭示了PDAC中CD38+ B细胞的免疫调节功能及其作为独立预后因子的潜力。 | 研究样本量有限，且未涉及所有可能的B细胞亚型及其在不同肿瘤微环境中的作用。 | 旨在识别PDAC中B细胞的异质性，并探索其作为治疗策略的新靶点。 | 胰腺导管腺癌（PDAC）中的B细胞及其与临床结果的关系。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | FUSCC队列147例，TCGA队列176例 |
| 9884 | 2024-08-08 |
Single-cell clonal tracing of glandular and circulating T cells identifies a population of CD9+ CD8+ T cells in primary Sjogren's syndrome
2024-04-29, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiad071
PMID:37395700
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学和免疫组库测序，研究了原发性干燥综合征（pSS）患者的外分泌腺和外周血中的免疫细胞，发现了一群具有组织定居特性的CD8+ CD9+细胞。 | 本文首次详细描述了pSS患者受损外分泌腺的免疫细胞景观，并鉴定出一群新的CD8+ CD9+细胞，这些细胞在pSS患者的唾液腺中高度富集，并可能与皮肤血管炎病变中的组织定居记忆细胞有关。 | 本文仅提供了pSS患者外分泌腺和外周血中免疫细胞的初步图景，未涉及更广泛的系统性研究。 | 研究pSS患者外分泌腺和外周血中的免疫细胞，以了解其适应性免疫反应。 | 原发性干燥综合征患者的外分泌腺和外周血中的免疫细胞。 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 单细胞转录组学，免疫组库测序 | NA | 基因表达数据 | 外周血样本和唾液腺活检样本 |
| 9885 | 2024-08-08 |
Enhancing the efficacy of vaccinia-based oncolytic virotherapy by inhibiting CXCR2-mediated MDSC trafficking
2024-03-29, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiad150
PMID:38066571
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研究论文 | 研究通过抑制CXCR2介导的MDSC迁移，增强基于牛痘的溶瘤病毒疗法的疗效 | 首次证实CXCR2作为治疗靶点，通过特异性小分子抑制剂阻断PMN-MDSC迁移，增强溶瘤病毒疗法的抗肿瘤效果 | NA | 探索通过抑制CXCR2介导的MDSC迁移，提高溶瘤病毒疗法的抗肿瘤效果 | 牛痘病毒疗法在恶性间皮瘤模型中的应用及MDSC在肿瘤微环境中的作用 | NA | 恶性间皮瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 3个同基因癌症模型 |
| 9886 | 2024-08-08 |
Tumor-infiltrating γδ T cells as targets of immune checkpoint blockade in melanoma
2024-03-29, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae023
PMID:38324004
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研究论文 | 本研究分析了黑色素瘤中肿瘤浸润性γδ T细胞与免疫检查点受体之间的关联，旨在开发创新的联合免疫治疗策略。 | 研究揭示了γδ T细胞在黑色素瘤免疫反应中的潜在作用，并发现ICI治疗对不同γδ T细胞亚群的影响存在差异。 | NA | 探索γδ T细胞与免疫检查点受体在黑色素瘤中的相互作用，以开发新的治疗策略。 | γδ T细胞、免疫检查点受体、黑色素瘤。 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及黑色素瘤患者的临床样本 |
| 9887 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals recruitment of the M2-like CCL8high macrophages in Lewis lung carcinoma-bearing mice following hypofractionated radiotherapy
2024-03-25, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05118-6
PMID:38528587
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了在小鼠Lewis肺癌模型中，经过低分割放疗后，M2样CCL8高表达巨噬细胞的招募情况 | 首次揭示了低分割放疗通过上调免疫抑制基因，促进CCL8高表达巨噬细胞的浸润和重编程，从而形成免疫抑制的肿瘤微环境 | NA | 探究肿瘤相关巨噬细胞在放疗后的重编程机制及其对肿瘤微环境的影响 | 小鼠Lewis肺癌模型中的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 9888 | 2024-08-08 |
Immunological profile of lactylation-related genes in Crohn's disease: a comprehensive analysis based on bulk and single-cell RNA sequencing data
2024-03-23, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05092-z
PMID:38521905
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研究论文 | 本研究通过综合分析批量和单细胞RNA测序数据，探讨了乳酸化相关基因在克罗恩病中的免疫学特征 | 首次系统分析了乳酸化相关基因在克罗恩病发病机制中的作用，并利用单细胞测序数据揭示了不同免疫细胞中乳酸化水平的差异 | 研究仅基于公开数据库中的数据，未涉及临床样本的直接验证 | 探讨乳酸化相关基因在克罗恩病中的免疫学特征及其在疾病发病机制中的作用 | 克罗恩病患者肠道中的乳酸化相关基因及其在免疫细胞中的表达 | 数字病理学 | 克罗恩病 | RNA测序 | NA | RNA | 使用了三个克罗恩病相关的数据集（GSE16879, GSE75214, 和 GSE112366） |
| 9889 | 2024-08-08 |
Potential anti-tumor effects of regulatory T cells in the tumor microenvironment: a review
2024-03-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05104-y
PMID:38509593
|
综述 | 本文综述了调节性T细胞（Tregs）在肿瘤微环境中的潜在抗肿瘤作用 | Tregs在肿瘤微环境中展现出显著的可塑性和功能多样性，不仅支持肿瘤进展，还表现出抗肿瘤活性 | NA | 总结Tregs的潜在抗肿瘤作用，并强调其在肿瘤治疗策略中的重要性 | 调节性T细胞（Tregs）及其在肿瘤微环境中的功能 | NA | 恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序（ScRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 9890 | 2024-08-08 |
Investigation of the acute pathogenesis of spondyloarthritis/HLA-B27-associated anterior uveitis based on genome-wide association analysis and single-cell transcriptomics
2024-03-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05077-y
PMID:38475831
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研究论文 | 本研究通过全基因组关联分析和单细胞转录组学探讨了脊柱关节病/HLA-B27相关急性前葡萄膜炎的急性发病机制 | 本研究首次揭示了AIF1在脊柱关节病/HLA-B27相关急性前葡萄膜炎发病机制中的关键作用，并发现髓样细胞向DC分化及AIF1水平下降在此过程中的重要性 | NA | 探讨脊柱关节病/HLA-B27相关急性前葡萄膜炎的急性发病机制，以期为有效预防和治疗提供进一步的理解 | 脊柱关节病/HLA-B27相关急性前葡萄膜炎的发病机制 | 数字病理学 | 脊柱关节病 | 孟德尔随机化分析、单细胞转录组分析 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus (GEO)数据库的前葡萄膜炎数据集 |
| 9891 | 2024-08-08 |
nf-core/airrflow: an adaptive immune receptor repertoire analysis workflow employing the Immcantation framework
2024-Jan-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.18.576147
PMID:38293151
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研究论文 | 本文介绍了nf-core/airrflow，一个集成Immcantation框架的适应性免疫受体谱分析工作流程，用于处理批量和单细胞的AIRR-seq数据 | nf-core/airrflow提供了跨样本的并行化、可扩展性和对高性能计算基础设施的便携性，这是现有工具所不具备的 | NA | 开发一个端到端的工作流程，用于处理和分析AIRR-seq数据，以研究免疫状态 | B细胞和T细胞受体序列的重建以及克隆关系的推断 | 生物信息学 | 传染病 | AIRR-seq | NA | 序列数据 | 分析了97名COVID-19感染者和99名健康对照者的数据 |
| 9892 | 2024-08-08 |
Advancing bladder cancer management: development of a prognostic model and personalized therapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1430792
PMID:39104534
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研究论文 | 本研究旨在通过单细胞和批量RNA测序数据，开发和验证一种基于基底鳞状亚型相关基因的膀胱癌预后模型，并探索个性化治疗策略。 | 本研究首次基于基底鳞状亚型相关基因开发了一种新的膀胱癌预后模型，并验证了其在不同临床环境中的预测性能。 | NA | 提高对膀胱癌分子异质性的理解，并开发有效的预后模型和个性化治疗策略。 | 膀胱癌的分子亚型、预后模型和个性化治疗策略。 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序 | LASSO和Cox回归分析 | RNA测序数据 | 使用了来自多个来源的单细胞和批量RNA测序数据，包括GSE135337、GSE13507、GSE31684、GSE32894、GSE69795和TCGA-BLCA。 |
| 9893 | 2024-08-08 |
Multiplexed spatial transcriptomics methods and the application of expansion microscopy
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1378875
PMID:39105173
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综述 | 本文综述了空间转录组学方法，特别是序列（ISS）方法、杂交（ISH）技术以及基于下一代测序（NGS）的区域捕获测序技术，并探讨了扩展显微镜（ExM）在这些技术中的应用 | 扩展显微镜（ExM）通过控制生物样本的放大，实现了超分辨率成像，克服了传统显微镜的衍射极限，使得在空间转录组学方法中精确观察RNA成为可能 | 空间转录组学实验的一个挑战是细胞内RNA检测的光学拥挤限制 | 探讨空间转录组学方法及其在生物学和医学中的应用 | 空间转录组学技术及其与扩展显微镜（ExM）的结合 | NA | NA | 扩展显微镜（ExM） | NA | 转录组数据 | NA |
| 9894 | 2024-08-08 |
Transcriptomic profiling of SARS-CoV-2 infected human cell lines identifies HSP90 as target for COVID-19 therapy
2021-Mar-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102151
PMID:33585804
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研究论文 | 研究报道了SARS-CoV-2感染的人类细胞系的基因表达谱，并识别出HSP90作为COVID-19治疗的目标 | 首次揭示了SARS-CoV-2在人类上皮细胞系Calu-3中引发的大约两倍于SARS-CoV的固有免疫反应刺激，并通过单细胞RNA测序分析了病毒感染细胞的基因表达模式 | NA | 深入了解SARS-CoV-2感染的分子生物学机制，包括病毒复制、宿主反应和疾病进展 | SARS-CoV和SARS-CoV-2感染的人类细胞系，以及HSP90在感染中的作用 | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三个SARS-CoV和SARS-CoV-2感染的人类细胞系 |
| 9895 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptional changes associated with drug tolerance and response to combination therapies in cancer
2021-03-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21884-z
PMID:33712615
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，研究了癌症细胞在药物耐受和联合治疗反应中的转录变化 | 首次展示了癌症细胞系、异种移植瘤和患者肿瘤中存在的多种癌症细胞亚群，并揭示了这些亚群的表观遗传变化和治疗敏感性的差异 | NA | 研究癌症细胞在药物耐受和联合治疗反应中的转录变化 | 癌症细胞的亚群及其对药物的耐受性和敏感性 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及细胞系、异种移植瘤和患者肿瘤中的多种癌症细胞亚群 |
| 9896 | 2024-08-08 |
Urinary Single-Cell Profiling Captures the Cellular Diversity of the Kidney
2021-03, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020050757
PMID:33531352
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析技术，对17份尿液样本中的23,082个细胞进行了分析，揭示了尿液中细胞的多样性及其与肾脏和膀胱细胞的相似性和差异性 | 首次通过单细胞转录组分析技术全面地描述了尿液中细胞的类型和特征 | NA | 生成人类尿液中细胞的参考数据集，并探索尿液中细胞与肾脏和膀胱细胞的关系 | 尿液中的单细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 细胞 | 17份尿液样本，来自5名受试者在不同时间的收集 |
| 9897 | 2024-08-08 |
Single-cell lineage mapping of a diverse virus-specific naive CD4 T cell repertoire
2021-03-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20200650
PMID:33201171
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研究论文 | 本文利用单细胞测序技术追踪了病毒特异性CD4 T细胞在淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒（LCMV）感染下的克隆扩增、分化轨迹和谱系选择 | 首次实现了对自然TCR库中单个初始T细胞克隆扩增、分化和谱系选择的追踪 | NA | 研究病毒特异性CD4 T细胞在感染过程中的克隆扩增、分化和谱系选择 | 病毒特异性CD4 T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 序列数据 | NA |
| 9898 | 2024-08-08 |
A Single-Cell RNA Expression Map of Human Coronavirus Entry Factors
2020-09-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108175
PMID:32946807
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学方法，分析了28种SARS-CoV-2及相关冠状病毒受体和因子（SCARFs）在健康人体组织中的表达，以预测冠状病毒的趋向性 | 首次全面分析了SCARFs在多种健康人体组织中的表达，并预测了非经典的病毒感染路径和特定性别易感性 | NA | 预测人类冠状病毒的趋向性及其在人体组织中的表达模式 | SARS-CoV-2及相关冠状病毒的受体和因子（SCARFs） | 数字病理学 | 冠状病毒病 | 单细胞转录组学 | NA | RNA表达数据 | 多种健康人体组织 |
| 9899 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of RORα tracer mouse lung reveals ILC progenitors and effector ILC2 subsets
2020-03-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20182293
PMID:31816636
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研究论文 | 本研究通过生成RORα谱系示踪小鼠并进行单细胞RNA测序、流式细胞术和功能分析，揭示了肺部ILC2的发育路径 | 发现了不同于传统IL-18Rα-ST2+ ILC2s的IL-18Rα+ST2-群体，并识别出新生儿肺部中的三种ILC群体 | NA | 阐明肺部ILC2的发育路径 | 肺部ILC2及其前体细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 成年和新生儿小鼠肺部样本 |
| 9900 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals that an imbalance in monocyte subsets rather than changes in gene expression patterns is a feature of postmenopausal osteoporosis
2024-Aug-05, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/jbmr/zjae065
PMID:38652170
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了绝经后骨质疏松症患者骨髓单核细胞的基因表达模式和亚群比例变化 | 首次揭示了绝经后骨质疏松症中单核细胞亚群比例失衡而非基因表达模式变化是其特征 | 研究样本量较小，需要进一步验证和扩大样本以增强结论的普遍性 | 探究绝经后骨质疏松症中单核细胞重编程的机制 | 绝经后骨质疏松症患者的骨髓单核细胞 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 6名参与者（3名正常骨密度和3名绝经后骨质疏松症患者） |