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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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9861 | 2025-10-07 |
Aspartame increases the risk of liver cancer through CASP1 protein: A comprehensive network analysis insights
2025-Apr-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118089
PMID:40139029
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研究论文 | 通过综合网络毒理学、孟德尔随机化、分子动力学和单细胞RNA测序分析,系统探索阿斯巴甜通过CASP1蛋白增加肝癌风险的机制 | 首次整合网络毒理学、孟德尔随机化、分子动力学和单细胞技术系统研究阿斯巴甜的致癌机制,发现CASP1是阿斯巴甜诱导肝癌的关键靶点 | 需要后续实验验证阿斯巴甜的致癌机制,研究结果主要基于计算和预测方法 | 系统探索阿斯巴甜的致癌潜力及其对肝脏的作用机制 | 阿斯巴甜及其与肝癌相关的分子靶点 | 计算生物学 | 肝癌 | 网络毒理学、孟德尔随机化、分子动力学模拟、单细胞RNA测序 | 分子对接模型、分子动力学模型 | 计算预测数据、分子对接数据、单细胞表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9862 | 2025-10-07 |
H1-0 is a specific mediator of the repressive ETV6::RUNX1 transcriptional landscape in preleukemia and B cell acute lymphoblastic leukemia
2025-Apr, HemaSphere
IF:7.6Q1
DOI:10.1002/hem3.70116
PMID:40177616
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研究论文 | 本研究通过hiPSC模型发现H1-0是ETV6::RUNX1融合基因诱导的转录抑制景观的关键调控因子 | 首次揭示连接组蛋白H1-0在ETV6::RUNX1阳性前白血病状态中的关键调控作用 | 研究主要基于hiPSC模型,需要进一步在体内验证 | 探索ETV6::RUNX1阳性前白血病细胞维持静息状态的分子机制 | ETV6::RUNX1阳性B细胞前体急性淋巴细胞白血病 | 分子生物学 | 急性淋巴细胞白血病 | CRISPR/Cas9基因编辑,单细胞测序,双荧光素酶报告基因检测 | hiPSC模型 | 转录组数据 | 1,727例白血病患者样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
9863 | 2025-10-07 |
In Situ Graphene-Seq: Spatial Transcriptomics and Chronic Electrophysiological Characterization of Tissue Microenvironments
2025-Mar-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.25.645278
PMID:40196689
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研究论文 | 开发了一种集成慢性电生理记录和空间分辨3D转录组学的原位石墨烯测序平台 | 首次将可拉伸网状纳米电子学与透明石墨烯电极结合,实现长期单细胞水平的多模态分析 | NA | 研究细胞功能与分子身份之间的复杂相互作用 | 人诱导多能干细胞衍生的心肌细胞和内皮细胞共培养体系 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 原位测序, 电生理记录, 光学成像 | NA | 电生理信号, 基因表达数据, 空间图像 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞电生理记录, 3D成像 | 原位石墨烯测序平台 | 集成可拉伸网状纳米电子学和透明石墨烯/PEDOT:PSS电极的多模态分析系统 |
9864 | 2025-10-07 |
Lignature: A Comprehensive Database of Ligand Signatures to Predict Cell-Cell Communication
2025-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.22.644770
PMID:40196598
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研究论文 | 开发了一个名为Lignature的配体特征数据库,用于预测细胞间通讯 | 构建了包含362种人类配体的细胞内转录组特征数据库,显著扩展了可用配体响应特征库,在基因和通路水平上优于现有方法 | NA | 预测配体-受体相互作用和细胞间通讯 | 人类配体及其诱导的转录组特征 | 生物信息学 | NA | 转录组分析,单细胞测序 | NA | 转录组数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9865 | 2025-10-07 |
Streptococcus lutetiensis inhibits CD8+ IL17A+ TRM cells and leads to gastric cancer progression and poor prognosis
2025-Feb-09, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00810-2
PMID:39924593
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研究论文 | 本研究通过微生物组和单细胞分析揭示路氏链球菌通过抑制CD8+ IL17A+ TRM细胞促进胃癌进展 | 首次发现路氏链球菌在胃癌组织中富集并通过激活Nrf2介导的氧化应激反应抑制CD8IL17A TRM细胞 | NA | 探究胃微生物组对胃癌进展和免疫调节的影响 | 胃癌患者组织样本和小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 16s rRNA测序, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 微生物组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9866 | 2025-10-07 |
Leveraging programmed cell death patterns to predict prognosis and therapeutic sensitivity in OSCC
2025-Feb, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.15139
PMID:39315471
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研究论文 | 本研究通过整合12种程序性细胞死亡模式构建细胞死亡指数(CDI),用于口腔鳞状细胞癌的预后预测和治疗敏感性评估 | 首次整合多种程序性细胞死亡模式构建CDI生物标志物,并利用单细胞RNA-seq数据验证关键基因在癌细胞分化中的作用 | 研究基于回顾性数据,需要前瞻性研究验证CDI的临床实用性 | 开发口腔鳞状细胞癌预后预测和治疗反应评估的新型生物标志物 | 口腔鳞状细胞癌患者 | 生物信息学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA-seq, Cox回归分析, LASSO分析, Kaplan-Meier生存分析 | 预后预测模型, 列线图 | 基因表达数据, 临床数据 | 多个独立患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9867 | 2025-10-07 |
Transcriptomics in the Study of Antiviral Innate Immunity
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4108-8_10
PMID:39192121
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综述 | 本章介绍多种转录组学技术在抗病毒天然免疫研究中的应用、意义和实验流程 | 重点介绍了单细胞测序和空间转录组学等新兴技术在该领域的应用前景 | NA | 探讨转录组学技术在抗病毒天然免疫研究中的应用 | 抗病毒天然免疫相关的RNA分子 | 自然语言处理 | NA | 微阵列, RNA测序, 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | RNA分子数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
9868 | 2025-10-07 |
Identification of Alzheimer's disease biomarkers and their immune function characterization
2025, Archives of medical science : AMS
IF:3.0Q1
DOI:10.5114/aoms/188721
PMID:40190307
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研究论文 | 本研究通过多组学方法识别阿尔茨海默病生物标志物并分析其免疫功能特征 | 结合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,首次发现RBM3、GOLGA8A和ALS2等生物标志物与AD中CD8 T细胞浸润的关联 | 研究依赖于公共数据库数据,缺乏实验验证 | 探究阿尔茨海默病的生物标志物及其免疫机制 | 阿尔茨海默病患者样本和正常对照样本 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 机器学习算法 | 机器学习诊断模型 | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE122063、GSE97760、GSM4996463、GSM4996462) | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
9869 | 2025-10-07 |
The single-cell transcriptional landscape of lung cells from PCV2d-infected mice
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1554961
PMID:40196036
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了PCV2d感染小鼠肺组织中10种细胞类型的转录组特征和免疫应答机制 | 首次系统绘制PCV2d感染小鼠肺组织的单细胞转录组图谱,鉴定出高病毒载量的单核巨噬细胞及其通过CD40-CD40L和CXCL14-CXCR4介导的细胞互作网络 | 研究仅使用BALB/c小鼠模型,未验证其他动物模型或临床样本 | 探究PCV2d亚型感染的生物学特性及其驱动的炎症性肺损伤机制 | PCV2d感染BALB/c小鼠的肺组织细胞 | 单细胞转录组学 | 病毒感染性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | PCV2d感染和未感染对照小鼠肺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9870 | 2025-10-07 |
Transcriptomic Analysis of Air-Liquid Interface Culture in Human Lung Organoids Reveals Regulators of Epithelial Differentiation
2024-12-02, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13231991
PMID:39682739
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析气液界面培养对人肺类器官上皮分化的影响 | 首次使用单细胞RNA测序全面分析ALI培养对肺上皮细胞分化的调控机制 | NA | 识别影响上皮细胞分化的关键因素 | 人肺类器官上皮细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9871 | 2025-10-07 |
Mucosal Single-Cell Profiling of Crohn's-Like Disease of the Pouch Reveals Unique Pathogenesis and Therapeutic Targets
2024-Dec, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.07.025
PMID:39084267
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研究论文 | 通过单细胞分析技术研究克罗恩样储袋病(CDP)的黏膜细胞特征,揭示其独特发病机制和潜在治疗靶点 | 首次在单细胞水平系统描绘CDP的细胞图谱,发现内质网应激在免疫和非免疫细胞中普遍增强的独特特征 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现 | 探究克罗恩样储袋病(CDP)的病理生理机制和潜在治疗靶点 | 接受回肠储袋肛管吻合术患者的黏膜组织样本 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术,免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 50例患者 | NA | 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术 | NA | NA |
9872 | 2025-10-07 |
The role of lactate metabolism in retinoblastoma tumorigenesis and ferroptosis resistance
2025-Apr-01, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2025.102893
PMID:40188688
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研究论文 | 本研究探讨乳酸代谢在视网膜母细胞瘤肿瘤发生和铁死亡抵抗中的关键作用 | 首次在单细胞水平揭示视网膜母细胞瘤中乳酸代谢特征,发现MCT1介导的乳酸转运促进肿瘤发生和铁死亡抵抗的新机制 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型,需要进一步临床验证 | 阐明乳酸代谢在视网膜母细胞瘤肿瘤发生和铁死亡抵抗中的作用机制 | 视网膜母细胞瘤患者组织样本、视网膜母细胞瘤细胞系和小鼠异种移植模型 | 数字病理学 | 视网膜母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 患者视网膜母细胞瘤组织和正常视网膜组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9873 | 2025-10-07 |
Thor: a platform for cell-level investigation of spatial transcriptomics and histology
2025-Mar-10, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4909620/v1
PMID:40162205
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研究论文 | 介绍Thor平台,一个用于空间转录组学和组织学图像多模态分析的计算平台 | 开发了抗收缩马尔可夫扩散方法从spot级数据推断单细胞空间转录组,实现细胞形态与空间转录组学的有效整合 | NA | 解决基因组分析与图像分析之间的整合空白,提供全面的细胞和分子分析工具 | 空间转录组学数据和组织学图像 | 空间转录组学 | 心力衰竭、乳腺癌、膀胱癌 | 空间转录组学、免疫荧光染色、ISH、MERFISH、Xenium、Stereo-seq | 抗收缩马尔可夫扩散方法 | 空间转录组数据、组织图像 | 内部心力衰竭患者样本、小鼠嗅球样本、乳腺癌样本、膀胱癌样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | 10x Visium HD空间转录组测序平台 |
9874 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing reveals the mechanisms of multiple myeloma progression: clarity or confusion?
2025-Feb, Annals of hematology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s00277-025-06241-0
PMID:39918600
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综述 | 本文综述单细胞测序技术在揭示多发性骨髓瘤进展机制中的新见解 | 系统总结单细胞测序技术在多发性骨髓瘤克隆进化、微环境转化和表观遗传改变研究中的突破性发现 | NA | 探讨单细胞测序技术对多发性骨髓瘤生物学机制和治疗策略研究的贡献 | 多发性骨髓瘤及其微环境 | 单细胞组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
9875 | 2025-10-07 |
Novel Perspective on Sevoflurane-Induced Cognitive Dysfunction: Implications of Neuronal SIRPα and Microglial Synaptic Remodeling
2024-12-18, ACS chemical neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.1021/acschemneuro.4c00485
PMID:39644326
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研究论文 | 本研究探讨神经元SIRPα和小胶质细胞突触重塑在七氟醚诱导新生小鼠认知功能障碍中的作用 | 首次揭示神经元SIRPα通过调控小胶质细胞功能改善七氟醚诱导的认知障碍,并发现IRF8与SIRPα表达的相关性 | 研究仅针对新生小鼠,未验证其他年龄阶段;转录组分析显示皮质小胶质细胞和神经元无显著变化 | 阐明七氟醚诱导认知功能障碍的分子机制 | 新生小鼠 | 神经科学 | 认知功能障碍 | 单细胞转录组测序, 慢病毒过表达, SCENIC分析 | NA | 基因表达数据, 行为学数据 | 新生小鼠皮质细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9876 | 2025-10-07 |
Emerging drug targets for triple-negative breast cancer: a guided tour of the preclinical landscape
2022-05, Expert opinion on therapeutic targets
IF:4.6Q1
DOI:10.1080/14728222.2022.2077188
PMID:35574694
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综述 | 本文系统综述了三阴性乳腺癌的潜在治疗靶点及其临床前研究进展 | 基于可药性、治疗效力、TNBC特异性及免疫治疗应用等标准,全面评估癌细胞膜分子、细胞内信号通路和肿瘤微环境等新兴靶点 | 靶点识别验证面临分子异质性、临床前到临床转化失败等挑战,缺乏统一评估标准 | 探索三阴性乳腺癌的新型有效靶向治疗策略 | 三阴性乳腺癌的分子靶点和肿瘤微环境 | 肿瘤学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 热稳定II型内含子逆转录酶测序, 人源化小鼠模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
9877 | 2025-10-07 |
Individualized patient tumor organoids faithfully preserve human brain tumor ecosystems and predict patient response to therapy
2025-Apr-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.01.002
PMID:39938519
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研究论文 | 开发了一种快速高效的个体化患者肿瘤类器官(IPTO)培养系统,能够准确模拟人脑肿瘤的细胞和分子病理特征 | 利用iPSC来源的脑类器官培养患者来源的肿瘤外植体,首次实现了包括成人、儿童和转移性脑癌在内的多种中枢神经系统肿瘤的体外培养 | 未明确说明样本规模和研究队列的具体细节 | 建立能够预测患者特异性治疗反应的临床前肿瘤模型 | 人脑肿瘤组织样本,包括成人、儿童和转移性脑癌 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 基因组学, 表观基因组学, 组织病理学分析 | IPTO(个体化患者肿瘤类器官)模型 | 基因组数据, 转录组数据, 表观基因组数据, 图像数据 | 前瞻性患者队列(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9878 | 2025-10-07 |
Interferon-responsive intestinal BEST4/CA7+ cells are targets of bacterial diarrheal toxins
2025-Apr-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.02.003
PMID:40010349
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研究论文 | 本研究通过人类肠道类器官模型揭示了BEST4/CA7+细胞在细菌感染引起的腹泻中的作用机制 | 首次建立人类肠道类器官中BEST4/CA7细胞的分化方法,发现其对细菌毒素的响应机制及去甲肾上腺素-ADRA2A轴的调控作用 | 缺乏小鼠模型验证,人类体外模型数量有限 | 探究肠道BEST4/CA7细胞在电解质平衡和免疫应答中的功能 | 人类肠道BEST4/CA7细胞 | 单细胞生物学 | 细菌性腹泻 | 单细胞RNA测序, 类器官培养 | 人类肠道类器官模型 | 基因表达数据, 功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9879 | 2025-10-07 |
Exploring Human Brain Metabolism via Genome-Scale Metabolic Modeling with Highlights on Multiple Sclerosis
2025-04-02, ACS chemical neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.1021/acschemneuro.5c00006
PMID:40091499
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA-seq数据和基因组规模代谢模型,构建了人脑细胞特异性代谢模型并应用于多发性硬化症研究 | 首次构建了包含神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞、少突胶质细胞和少突胶质前体细胞的脑细胞特异性GEMs,并创建了整合的iHumanBrain2690脑代谢网络模型 | 模型基于计算推断,需要实验验证;未考虑所有脑细胞类型和复杂的细胞间相互作用 | 探索人脑代谢机制,特别关注多发性硬化症中的代谢改变 | 人脑细胞(神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞、少突胶质细胞、少突胶质前体细胞) | 系统生物学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA-seq, 基因组规模代谢建模, tINIT算法 | 基因组规模代谢模型 | 基因表达数据, 代谢网络数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9880 | 2025-10-07 |
IL-25 Enhances B Cell Responses in Type 2 Inflammation Through IL-17RB Receptor
2025-Apr, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16472
PMID:39829150
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研究论文 | 本研究揭示了IL-25通过IL-17RB受体增强B细胞在2型炎症中的抗体应答机制 | 首次发现B细胞在IgE诱导条件下表达IL-17RB受体,并证实IL-25能增强其抗体产生能力 | 研究主要基于体外实验和有限的组织样本,需要更多体内实验验证 | 探究B细胞中IL-25受体(IL-17RB)的表达调控及其在2型炎症中的功能 | 外周血来源的B细胞和鼻息肉组织中的B细胞 | 免疫学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 流式细胞术, RT-PCR, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 外周血B细胞和鼻息肉组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |