单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 9861 - 9880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9861 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals SPP1-CD44-mediated macrophage-tumor cell interactions drive chemoresistance in TNBC
2024-Jul, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18525
PMID:38982317
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了三阴性乳腺癌（TNBC）中化疗耐药的机制 | 首次揭示了SPP1-CD44介导的巨噬细胞与肿瘤细胞相互作用在TNBC化疗耐药中的作用 | 研究样本量较小，仅包括五个化疗敏感和五个耐药的TNBC患者 | 探究三阴性乳腺癌化疗耐药的分子机制 | 三阴性乳腺癌患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 10个TNBC患者样本（5个化疗敏感和5个耐药） |
| 9862 | 2024-08-07 |
Studying temporal dynamics of single cells: expression, lineage and regulatory networks
2024-Feb, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-023-01090-5
PMID:38495440
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，通过计算方法研究细胞分化和细胞命运决定的时空动态 | 总结了轨迹推断（TI）、谱系追踪（LT）和基因调控网络（GRN）推断等不同计算方法的优势和局限 | 讨论了不同方法的局限性 | 探讨多细胞器官从单细胞到不同细胞类型的发育过程 | 研究细胞分化和细胞命运决定 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 9863 | 2024-08-07 |
Renin Cell Development: Insights From Chromatin Accessibility and Single-Cell Transcriptomics
2023-08-04, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.322827
PMID:37395102
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9864 | 2024-08-07 |
Systematic comparison of high-throughput single-cell RNA-seq methods for immune cell profiling
2021-Jan-20, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-07358-4
PMID:33472597
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研究论文 | 本文系统比较了七种高通量单细胞RNA测序方法在免疫细胞分析中的应用 | 展示了10x Genomics 5' v1和3' v3方法在mRNA检测灵敏度上的优势，减少了dropout事件，有助于识别差异表达基因和提高单细胞与免疫bulk RNA-seq特征的一致性 | 单细胞方法在恢复完整转录组方面存在固有限制，由于细胞和转录dropout事件的普遍性，以及样本可用性和异质性先验知识的限制，可能导致数据解释的混淆 | 评估不同高通量单细胞RNA测序方法在免疫细胞分析中的性能 | 七种高通量单细胞RNA测序方法在模拟免疫细胞类型和细胞大小异质性的混合样本中的表现 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 21个库，包含两个人类和小鼠淋巴细胞细胞系的混合样本 |
| 9865 | 2024-08-07 |
STAB: a spatio-temporal cell atlas of the human brain
2021-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa762
PMID:32976581
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研究论文 | 本文介绍了一个名为STAB的时空细胞图谱数据库，该数据库包含人类大脑多个区域和发育时期的单细胞转录组数据 | STAB数据库提供了人类大脑在生命周期中动态细胞组成和分子特征的全面数据，填补了现有研究的空白 | NA | 旨在阐明大脑的细胞和转录组结构，以理解大脑功能和脑部疾病 | 人类大脑的细胞组成和转录组结构 | 数字病理学 | 神经精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包含42种细胞亚型，跨越20个大脑区域和11个发育时期 |
| 9866 | 2024-08-07 |
MYC Promotes Bone Marrow Stem Cell Dysfunction in Fanconi Anemia
2021-01-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.09.004
PMID:32997960
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了范可尼贫血患者的造血干细胞和祖细胞，发现MYC的高表达与骨髓衰竭相关，并探讨了MYC抑制剂对FA患者造血干细胞的影响 | 首次揭示了MYC在范可尼贫血骨髓衰竭中的作用，并通过实验验证了MYC抑制剂对FA患者造血干细胞的潜在治疗效果 | 研究主要集中在细胞和动物模型上，尚未进行临床试验验证MYC抑制剂的临床应用效果 | 探讨范可尼贫血患者骨髓衰竭的分子机制及潜在治疗策略 | 范可尼贫血患者的造血干细胞和祖细胞 | NA | 范可尼贫血 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 来自范可尼贫血患者的造血干细胞和祖细胞样本 |
| 9867 | 2024-08-07 |
Bi-FoRe: an efficient bidirectional knockin strategy to generate pairwise conditional alleles with fluorescent indicators
2021-01, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1007/s13238-020-00747-1
PMID:32681448
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Bi-FoRe的高效双向敲入策略，用于生成带有荧光指示器的成对条件性等位基因 | 首次报道了通过单一供体生成具有条件性和基因标记双重功能的成对双功能敲入等位基因 | NA | 开发一种新的策略，用于基因表达标记和基因功能的条件性调控 | zebrafish中的sox10和isl1基因座 | 基因工程 | NA | CRISPR/Cas系统 | NA | 基因组数据 | NA |
| 9868 | 2024-08-07 |
In vitro Targeting of Transcription Factors to Control the Cytokine Release Syndrome in COVID-19
2020-Dec-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2020.12.29.424728
PMID:33398281
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研究论文 | 本研究系统探索了COVID-19中细胞因子释放综合征（CRS）相关的炎症细胞因子的转录调节因子，以识别可用于治疗目标的候选转录因子（TFs）和已批准的药物 | 发现了581个显著相关的TF-细胞因子基因相互作用，并识别出19个可作为FDA批准药物靶点的TFs，以及10种药物和25种药物组合在体外抑制细胞因子产生的效果 | NA | 寻找治疗COVID-19患者细胞因子释放综合征（CRS）的潜在治疗方法 | COVID-19患者的细胞因子释放综合征（CRS）及其相关的转录因子 | 生物医学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液细胞 |
| 9869 | 2024-08-07 |
Structural Variability, Expression Profile, and Pharmacogenetic Properties of TMPRSS2 Gene as a Potential Target for COVID-19 Therapy
2020-12-25, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12010019
PMID:33375616
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研究论文 | 本文研究了TMPRSS2基因的结构变异性、表达谱和药物遗传学特性，探讨其作为COVID-19治疗潜在靶点的可能性 | 首次分析了TMPRSS2基因在76个人群中的结构变异性，并发现了与前列腺癌相关的错义突变在不同人群中的分布模式 | 未提及具体限制 | 探讨TMPRSS2基因作为COVID-19治疗潜在靶点的可能性 | TMPRSS2基因的结构变异性、表达谱和药物遗传学特性 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 76个人群 |
| 9870 | 2024-08-07 |
Short-Chain Fatty Acid-Producing Gut Microbiota Is Decreased in Parkinson's Disease but Not in Rapid-Eye-Movement Sleep Behavior Disorder
2020-Dec-08, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.00797-20
PMID:33293403
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研究论文 | 本研究通过16S rRNA测序分析了26名快速眼动睡眠行为障碍（iRBD）患者和137名对照组的肠道微生物群，并与223名帕金森病（PD）患者的肠道微生物群进行了比较，发现短链脂肪酸（SCFA）产生菌在PD患者中减少，而在iRBD患者中未见显著减少。 | 首次对iRBD患者的肠道微生物群进行了大规模分析，并与PD患者的肠道微生物群进行了比较，揭示了SCFA产生菌在两种疾病中的不同变化。 | 研究样本主要来自日本和德国，可能存在地域偏差；仅分析了肠道微生物群的组成，未探讨其功能。 | 探讨帕金森病和快速眼动睡眠行为障碍患者肠道微生物群的差异及其与疾病发展的关系。 | 帕金森病和快速眼动睡眠行为障碍患者的肠道微生物群。 | NA | 帕金森病 | 16S rRNA测序 | NA | 微生物群数据 | 26名iRBD患者，137名对照组，223名PD患者 |
| 9871 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-Seq reveals the transcriptional landscape and heterogeneity of skin macrophages in Vsir-/- murine psoriasis
2020, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.45614
PMID:32929361
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，揭示了Vsir-/-小鼠银屑病皮肤中巨噬细胞的转录组图谱和异质性 | 首次全面展示了Vsir psoriatic小鼠皮肤免疫细胞的单细胞景观，揭示了银屑病皮肤巨噬细胞的转录组图谱和表型异质性，并识别了其基因表达特征 | NA | 研究Vsir-/-小鼠银屑病皮肤炎症中涉及的免疫细胞亚群 | Vsir psoriatic小鼠的皮肤免疫细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 23,258个细胞 |
| 9872 | 2024-08-07 |
More than one antibody of individual B cells revealed by single-cell immune profiling
2019, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-019-0137-3
PMID:31839985
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研究论文 | 本研究通过单细胞免疫图谱技术，揭示了个体B细胞中存在多种抗体的可能性 | 发现了单个B细胞中存在多种Ig特异性的现象，挑战了传统的“一个细胞一个抗体”规则和CSR机制 | NA | 验证和定义单细胞转录组水平上的经典免疫学概念 | B细胞及其产生的抗体 | 免疫学 | NA | Chromium单细胞免疫图谱技术和Sanger测序 | NA | 转录组 | 数百至数千个单个B细胞 |
| 9873 | 2024-08-07 |
Revealing the crucial roles of suppressive immune microenvironment in cardiac myxoma progression
2024-Aug-02, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01912-2
PMID:39090109
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析了心脏粘液瘤组织中的75,641个细胞，揭示了粘液瘤细胞的异质性及其与免疫细胞的相互作用 | 首次通过单细胞测序技术详细描述了心脏粘液瘤细胞的组成及其与免疫细胞的相互作用 | NA | 探究心脏粘液瘤的细胞组成及其与免疫微环境的相互作用 | 心脏粘液瘤组织中的细胞 | 数字病理学 | 心脏疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 75,641个细胞 |
| 9874 | 2024-08-07 |
Advances in single-cell transcriptomics in animal research
2024-Aug-02, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-024-01063-y
PMID:39090689
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综述 | 本文介绍了单细胞转录组技术的发展，并回顾了其在动物研究中的过程、进展和应用 | 单细胞转录组技术为研究动物不同组织/器官的高通量单细胞基因表达提供了有效方法，能够识别细胞类型/亚型及其标记基因，推断细胞命运轨迹，并揭示细胞间的相互作用 | 讨论了单细胞转录组技术在当前阶段的局限性和展望 | 旨在通过单细胞转录组技术深入理解动物营养与健康、生殖性能、遗传学和不同畜种的疾病模型 | 动物研究中的不同组织/器官的单细胞 | 生物技术 | NA | 单细胞转录组技术 | NA | 转录组数据 | 基于大量案例积累的实践经验 |
| 9875 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-seq reveals novel interaction between muscle satellite cells and fibro-adipogenic progenitors mediated with FGF7 signalling
2024-Aug, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
DOI:10.1002/jcsm.13484
PMID:38751367
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肌肉卫星细胞与成纤维脂肪前体细胞之间通过FGF7信号传导的新型相互作用 | 首次揭示了FGF7在肌肉卫星细胞与成纤维脂肪前体细胞相互作用中的作用，并通过实验验证了FGF7对肌肉卫星细胞增殖的促进作用 | 研究主要集中在猪模型上，需要进一步在其他物种中验证结果 | 探索肌肉卫星细胞与微环境细胞的相互作用，特别是与成纤维脂肪前体细胞的相互作用 | 肌肉卫星细胞和成纤维脂肪前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 猪的长背肌和比目鱼肌样本 |
| 9876 | 2024-08-07 |
Generation of human vascularized and chambered cardiac organoids for cardiac disease modelling and drug evaluation
2024-Aug, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13631
PMID:38453465
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研究论文 | 本文介绍了一种新方法，通过结合人诱导多能干细胞（hiPSC）衍生的血管球和直接分化的hiPSC心肌细胞，生成具有血管化和心室样结构的人心脏类器官（vcCOs），并探讨了其在心脏损伤模型和药物评估中的应用。 | 本文创新性地开发了一种三步法，用于生成具有心室样结构和血管化的复杂vcCOs，这些vcCOs显示出高自发跳动比率和多细胞类型组成。 | 尽管vcCOs在心脏疾病模型和药物评估中显示出潜力，但其低重复性、有限血管化和心室形成困难等问题仍需进一步解决。 | 研究目的是开发一种新方法，用于生成具有血管化和心室样结构的人心脏类器官，并探索其在心脏疾病模型和药物筛选中的应用。 | 研究对象包括人诱导多能干细胞衍生的心脏类器官（vcCOs）及其在心脏损伤模型和药物评估中的应用。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | vcCOs中包含六种细胞类型，包括心肌细胞、心脏前体细胞、内皮细胞、成纤维细胞等 |
| 9877 | 2024-08-07 |
Interleukin-35 alleviates neuropathic pain and induces an anti-inflammatory shift in spinal microglia in nerve-injured male mice
2024-Aug-01, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2024.07.043
PMID:39097202
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研究论文 | 本研究探讨了白细胞介素-35（IL-35）对神经损伤雄性小鼠的疼痛行为、脊髓小胶质细胞表型的影响及其体外小胶质细胞培养中的作用。 | 研究发现IL-35能显著减轻雄性小鼠的机械性疼痛过敏，并诱导脊髓小胶质细胞向抗炎表型转变，表明IL-35可能成为针对性别特异性的神经痛免疫调节治疗新策略。 | 研究主要集中在雄性小鼠，对雌性小鼠的效果较弱，性别差异的影响需要进一步研究。 | 研究IL-35在神经痛中的作用及其对脊髓小胶质细胞的影响。 | 神经损伤的雄性小鼠及其脊髓小胶质细胞。 | NA | 神经痛 | NA | NA | 转录组数据 | 涉及雄性和雌性小鼠的实验样本。 |
| 9878 | 2024-08-07 |
Establishment of a CD8+ T cells-related prognostic risk model for acral melanoma based on single-cell and bulk RNA sequencing
2024-Aug, Skin research and technology : official journal of International Society for Bioengineering and the Skin (ISBS) [and] International Society for Digital Imaging of Skin (ISDIS) [and] International Society for Skin Imaging (ISSI)
IF:2.0Q3
DOI:10.1111/srt.13900
PMID:39093712
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研究论文 | 本研究基于单细胞和批量RNA测序数据，建立了与肢端黑色素瘤预后相关的CD8+ T细胞风险模型。 | 首次利用单细胞RNA测序技术探索肢端黑色素瘤中免疫细胞的组成差异，并构建了基于CD8+ T细胞差异表达基因的预后风险评分模型。 | 研究主要基于TCGA-SKCM队列，可能需要进一步的跨队列验证以增强模型的泛化能力。 | 旨在通过识别CD8+ T细胞相关基因的表达水平，建立肢端黑色素瘤患者的预后模型。 | 研究对象为肢端黑色素瘤中的CD8+ T细胞及其相关基因。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | Lasso-Cox方法 | RNA测序数据 | 使用了TCGA-SKCM队列的数据，具体样本数量未在摘要中明确。 |
| 9879 | 2024-08-07 |
Single-cell Atlas of Penile Cancer Reveals TP53 Mutations as a Driver of an Aggressive Phenotype, Irrespective of Human Papillomavirus Status, and Provides Clues for Treatment Personalization
2024-Aug, European urology
IF:25.3Q1
DOI:10.1016/j.eururo.2024.03.038
PMID:38670879
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了阴茎鳞状细胞癌（PSCC）中TP53失活突变与人类乳头瘤病毒（HPV）状态对肿瘤微环境转录组差异的影响 | 首次使用单细胞RNA测序技术构建了阴茎癌的细胞图谱，揭示了TP53突变与HPV状态对PSCC生物学特性的影响 | 单细胞RNA测序分析存在样本量较小的问题，需要在大规模PSCC队列中验证这些特征 | 描述基于TP53失活突变和HPV状态的PSCC微环境中的转录组差异 | 阴茎鳞状细胞癌（PSCC）及其微环境中的细胞亚型 | 数字病理学 | 阴茎癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 包括6个HPV+ TP53野生型（WT）、6个HPV- TP53WT和4个TP53失活（LOF）PSCC样本及6个对照样本，以及541名PSCC患者的生存数据 |
| 9880 | 2024-08-07 |
Tropism for ciliated cells is the dominant driver of influenza viral burst size in the human airway
2024-Jul-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2320303121
PMID:39008691
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研究论文 | 研究了不同上皮细胞类型对流感病毒在人呼吸道中的复制动力学和负担的影响 | 揭示了纤毛细胞在流感病毒爆发规模中的主导作用，并发现感染的分泌细胞与总体病毒输出减少相关 | NA | 探究不同上皮细胞类型对流感病毒复制动力学和负担的影响 | 人呼吸道中的不同上皮细胞类型 | NA | 流感 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个供体和30种独立分化条件下的原代人呼吸道培养物 |