单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 9861 - 9880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9861 | 2024-08-08 |
A novel model combining genes associated with disulfidptosis and glycolysis to predict breast cancer prognosis, molecular subtypes, and treatment response
2024-Sep, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24329
PMID:38747344
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研究论文 | 本文开发了一种新型模型，结合与二硫化物死亡和糖酵解相关的基因，用于预测乳腺癌的预后、分子亚型和治疗反应 | 首次探讨了二硫化物死亡和糖酵解相关基因在乳腺癌中的作用机制及其预后价值 | NA | 开发一种能够准确预测乳腺癌预后、肿瘤微环境及药物治疗反应的模型 | 乳腺癌及其相关基因 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 涉及正常和乳腺癌组织中的差异表达基因 |
| 9862 | 2024-08-08 |
Neutrophil Heterogeneity Is Modified during Acute Lung Inflammation in Apoa1-/- Mice
2024-Aug-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300459
PMID:38912868
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研究论文 | 本研究评估了载脂蛋白A-I是否通过改变中性粒细胞异质性来减轻急性气道炎症的机制 | 通过单细胞RNA测序揭示了Apoa1-/-小鼠在LPS+HDM诱导的急性肺炎症中中性粒细胞和巨噬细胞群的特定增加以及共同促炎基因表达的增强 | NA | 探讨载脂蛋白A-I在急性气道炎症中对中性粒细胞异质性的影响 | Apoa1-/-和Apoa1+/+小鼠在LPS+HDM诱导的急性肺炎症中的中性粒细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | Apoa1-/-和Apoa1+/+小鼠的支气管肺泡灌洗液中的细胞 |
| 9863 | 2024-08-08 |
Somatic epigenetic drift during shoot branching: a cell lineage-based model
2024-Aug-07, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyae091
PMID:38809088
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研究论文 | 本文通过建立一个基于细胞谱系的模型，研究了植物分枝过程中体细胞表观遗传漂移的现象 | 提出了一个特殊的分离分生组织模型，其中前体细胞从茎顶端分生组织（SAM）外围随机采样，以最大化细胞谱系独立性 | NA | 研究植物分枝过程中体细胞表观遗传漂移及其对DNA甲基化异质性的影响 | 植物分枝过程中的体细胞表观遗传漂移 | 数字病理学 | NA | NA | 细胞谱系模型 | NA | NA |
| 9864 | 2024-08-08 |
Immunotherapy drives mesenchymal tumor cell state shift and TME immune response in glioblastoma patients
2024-Aug-05, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae085
PMID:38695342
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研究论文 | 研究探讨了免疫疗法在胶质母细胞瘤患者中诱导间质肿瘤细胞状态转变及肿瘤微环境免疫反应的机制 | 首次通过单细胞分辨率的表型和转录组动态分析，揭示了免疫检查点抑制剂治疗后肿瘤细胞和肿瘤微环境的特定侵袭性表型特征 | 研究样本量有限，且仅限于临床试验中的患者，可能影响结果的普遍性 | 旨在识别免疫疗法抵抗机制，以设计新的治疗策略 | 胶质母细胞瘤患者在接受免疫检查点抑制剂治疗后的肿瘤细胞和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 76个肿瘤样本，以及298个外部胶质母细胞瘤数据集 |
| 9865 | 2024-08-08 |
Insights of immune cell heterogeneity, tumor-initiated subtype transformation, drug resistance, treatment and detecting technologies in glioma microenvironment
2024-Aug-05, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.07.033
PMID:39097088
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综述 | 本文综述了胶质瘤微环境中四种主要免疫细胞（中性粒细胞、巨噬细胞、淋巴细胞、髓源性抑制细胞等）的亚型标记、胶质瘤诱导的免疫细胞亚型转化、各亚型影响化疗抵抗的机制、靶向免疫细胞的治疗方法以及免疫细胞相关的单细胞测序技术 | 详细分析了化疗抵抗的机制，并发现了有前景的免疫治疗靶点，探索了结合放疗、化疗和手术的新型免疫治疗策略 | NA | 全面总结胶质瘤诱导免疫细胞亚型转化的确切机制，并探讨单细胞测序在探索胶质瘤中免疫细胞亚型进展的应用 | 胶质瘤微环境中的免疫细胞及其亚型 | NA | 脑瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 9866 | 2024-08-08 |
Histone deacetylases facilitate Th17-cell differentiation and pathogenicity in autoimmune uveitis via CDK6/ID2 axis
2024-Aug-05, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.07.029
PMID:39107200
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和实验性自身免疫性葡萄膜炎模型，探讨了组蛋白去乙酰化酶（HDACs）及其下游分子机制在自身免疫性葡萄膜炎（AU）中的作用。 | 首次揭示了HDACs通过CDK6/ID2轴促进Th17细胞分化和致病性在AU中的作用，并提出了一种有前景的治疗策略。 | NA | 揭示自身免疫性葡萄膜炎的发病机制并开发更有效的治疗方法。 | 自身免疫性葡萄膜炎患者的外周血单个核细胞和实验性自身免疫性葡萄膜炎模型。 | NA | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），流式细胞术，siRNA，特定抑制剂，过继转移实验 | NA | 细胞 | 来自AU患者的PBMCs和实验性自身免疫性葡萄膜炎模型的免疫细胞 |
| 9867 | 2024-08-08 |
scTab: Scaling cross-tissue single-cell annotation models
2024-Aug-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51059-5
PMID:39098889
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研究论文 | 本文提出了一种名为scTab的自动化细胞类型预测模型，专门针对表格数据，并使用一种新颖的数据增强方案在大量单细胞RNA-seq数据集上进行训练 | scTab模型能够处理大规模数据集，并在跨组织细胞注释中表现出良好的泛化能力，同时数据增强方案提高了模型的泛化性能 | NA | 开发一种能够在大规模单细胞RNA-seq数据集上进行跨组织细胞类型预测的自动化模型 | 单细胞RNA-seq数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 表格数据 | 2220万细胞 |
| 9868 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptome reveals the region-specific genes and pathways regulated by Satb2 in neocortical development
2024-Aug-02, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10672-w
PMID:39095712
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学和免疫染色技术，系统研究了Satb2基因在不同新皮质区域发育中的区域特异性基因调控。 | 首次全面描绘了Satb2基因在新皮质发育中的空间调控途径，并揭示了其在不同区域的具体调控基因和通路。 | 研究主要集中在胚胎阶段的Satb2+/+和Satb2-/-小鼠，未涉及成年阶段或其他相关基因的影响。 | 探究Satb2基因在新皮质发育中的区域特异性基因调控及其相关通路。 | Satb2+/+和Satb2-/-小鼠的新皮质区域，包括室管膜区（VZ）、室下区（SVZ）、中间区（IZ）和皮质板（CP）。 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 空间转录组学，免疫染色 | NA | 转录组数据 | Satb2+/+和Satb2-/-小鼠的胚胎阶段样本 |
| 9869 | 2024-08-08 |
Genome-wide CRISPR screening identifies tyrosylprotein sulfotransferase-2 as a target for augmenting anti-PD1 efficacy
2024-Aug-02, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02068-x
PMID:39095793
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研究论文 | 本文通过全基因组CRISPR筛选，发现酪氨酰蛋白磺基转移酶-2（TPST2）是增强抗PD1疗效的潜在靶点 | 首次揭示了TPST2在癌症免疫中的抑制作用，并提出其作为免疫检查点疗法治疗靶点的可能性 | NA | 探索影响抗PD1反应性的肿瘤细胞内在因素，并评估TPST2在癌症免疫中的具体作用 | TPST2在癌症免疫中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | NA | NA | CRISPR筛选，共免疫沉淀，质谱分析，RNA测序 | NA | 基因组数据，蛋白质数据，RNA数据 | 在人源化小鼠中进行实验，使用同基因小鼠肿瘤模型进行验证 |
| 9870 | 2024-08-08 |
Bioengineered human colon organoids with in vivo-like cellular complexity and function
2024-Aug-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.05.007
PMID:38876106
|
研究论文 | 本文介绍了一种新型的人类结肠类器官模型——“迷你结肠”，通过结合类器官和芯片上的器官技术，实现了与体内组织高度相似的细胞复杂性和功能 | 采用非对称刺激与生长因子结合的方法，显著增强了组织寿命，并模拟了体内细胞类型的多样性和排列 | NA | 开发一种能够精确模拟人体肠道生理和病理的先进类器官模型 | 人类结肠类器官及其在肠道生理和病理研究中的应用 | 生物工程 | NA | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 细胞 | NA |
| 9871 | 2024-08-08 |
Lipid Deficiency Contributes to Impaired Alveolar Progenitor Cell Function in Aging and Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2024-Aug, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0290OC
PMID:38657143
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研究论文 | 本研究评估了脂质代谢在特发性肺纤维化（IPF）患者和健康捐赠者肺泡II型细胞（AEC2s）中的作用，并探讨了脂质补充和PPARγ激活对AEC2s干细胞更新能力的影响。 | 首次揭示了IPF和老年小鼠肺泡II型细胞中脂质代谢的缺陷，并证明了脂质补充和PPARγ激活可以促进AEC2s的干细胞更新能力。 | 研究主要集中在细胞和动物模型上，尚未在临床试验中验证脂质补充和PPARγ激活的治疗效果。 | 探讨脂质代谢在特发性肺纤维化和衰老中的作用，并寻找可能的治疗策略。 | 特发性肺纤维化患者和健康捐赠者的肺泡II型细胞，以及老年和年轻小鼠的肺泡II型细胞。 | NA | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色，流式细胞术 | NA | 基因表达数据，细胞脂质含量数据 | 包括IPF患者和健康捐赠者的肺泡II型细胞，以及老年和年轻小鼠的肺泡II型细胞。 |
| 9872 | 2024-08-08 |
scHD4E: Novel ensemble learning-based differential expression analysis method for single-cell RNA-sequencing data
2024-Aug, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108769
PMID:38897145
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研究论文 | 本文提出了一种基于集成学习的单细胞RNA测序数据差异表达分析方法scHD4E | scHD4E方法通过选择表现最佳的四种独立分析方法进行集成，相较于单一方法和现有的scDEA方法，在准确性和稳定性上表现更优 | NA | 旨在提出一种新的基于集成学习的差异表达分析方法scHD4E | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | 集成学习 | 数据集 | 使用了五个实验数据集和一个模拟数据集进行评估 |
| 9873 | 2024-08-08 |
Integrating single-cell transcriptomics and machine learning to predict breast cancer prognosis: A study based on natural killer cell-related genes
2024-Aug, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18549
PMID:39098994
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组数据与机器学习方法，利用自然杀伤细胞相关基因（NKRGs）建立了一个预测乳腺癌预后的模型 | 本研究首次利用NKRGs结合机器学习算法，开发了一种新的乳腺癌风险评估和个性化治疗模型 | NA | 建立一个基于自然杀伤细胞相关基因的预测乳腺癌预后的模型 | 自然杀伤细胞相关基因在乳腺癌预后中的作用 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞转录组 | Lasso + RSF | 转录组数据 | 44个显著表达的NKRGs，9个关键NKRGs |
| 9874 | 2024-08-07 |
Lung Single-Cell Transcriptomics in Alpha-1 Antitrypsin Deficiency
2024-Aug, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0064LE
PMID:39087828
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9875 | 2024-08-08 |
Identifying MSMO1, ELOVL6, AACS, and CERS2 related to lipid metabolism as biomarkers of Parkinson's disease
2024-07-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-68585-3
PMID:39080336
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研究论文 | 本研究通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）和机器学习方法，识别与脂质代谢相关的帕金森病生物标志物。 | 首次将MSMO1, ELOVL6, AACS, 和CERS2作为与脂质代谢相关的帕金森病生物标志物进行研究。 | NA | 旨在识别与脂质代谢相关的帕金森病生物标志物。 | 帕金森病患者中的脂质代谢相关基因。 | 生物信息学 | 帕金森病 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）, 单细胞RNA测序（scRNA-seq）, qRT-PCR | 反向传播神经网络 | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 9876 | 2024-08-08 |
Sustained generation of neurons destined for neocortex with oxidative metabolic upregulation upon filamin abrogation
2024-Jul-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110199
PMID:38989458
|
研究论文 | 本文研究了在小鼠模型中通过抑制Flna和Flnb基因，成年V-SVZ区域是否能持续产生类似上层大脑皮层神经元的神经元 | 首次展示了成年V-SVZ区域通过上调氧化磷酸化、线粒体生物合成和血管丰富度，能够持续产生类似上层大脑皮层神经元的神经元 | NA | 探讨成年V-SVZ区域是否具有产生大脑皮层神经元的能力 | 小鼠模型中的V-SVZ区域 | 神经科学 | NA | 空间转录组学分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 9877 | 2024-08-08 |
Mechanical stress during confined migration causes aberrant mitoses and c-MYC amplification
2024-Jul-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2404551121
PMID:38990945
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研究论文 | 研究机械应力在限制性迁移过程中对肿瘤细胞基因组完整性的影响 | 发现机械应力在转移性迁移过程中通过c-MYC位点扩增促进基因毒性和致癌事件，并绕过检查点控制 | NA | 探究转移性间质迁移产生的机械应力是否导致肿瘤细胞染色体不稳定性的增强 | 转移性肿瘤细胞在限制性迁移过程中的行为 | 数字病理学 | 肿瘤 | scRNA-seq | NA | 图像 | NA |
| 9878 | 2024-08-08 |
Historic obstacles and emerging opportunities in the field of developmental metabolism - lessons from Heidelberg
2024-Jun-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202937
PMID:38912552
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研究论文 | 本文总结了2023年EMBO研讨会'发育代谢：能量、物质和信息的流动'中的关键讨论，强调了现代发育生物学的挑战与机遇 | 文章介绍了代谢组学、小分子传感器、单细胞RNA测序和计算模型等技术的进步，为探索细胞特异性和组织特异性代谢网络、器官间代谢交流以及基因与代谢物在时间和空间上的相互作用提供了新机会 | NA | 探讨发育代谢领域的新技术革命及其对生物学研究的影响 | 细胞特异性和组织特异性代谢网络、器官间代谢交流、基因与代谢物的相互作用 | 发育生物学 | NA | 代谢组学、小分子传感器、单细胞RNA测序、计算模型 | NA | NA | NA |
| 9879 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Illuminates Thymic Development: An Updated Framework for Understanding Thymic Epithelial Tumors
2024-Jun-03, The oncologist
DOI:10.1093/oncolo/oyae046
PMID:38520743
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综述 | 本文综述了通过单细胞测序技术对胸腺上皮肿瘤（TETs）的研究进展，探讨了胸腺发育和肿瘤形成的分子机制 | 利用单细胞分子 profiling 技术深入分析肿瘤细胞的分子特征，为胸腺上皮肿瘤的研究提供了新的视角 | 胸腺上皮肿瘤的罕见性限制了对肿瘤发生机制的深入研究和合理治疗方案的开发 | 探讨胸腺上皮肿瘤的生物学特性，加速开发针对这些罕见肿瘤的改进治疗策略 | 胸腺上皮肿瘤及其在胸腺发育和老化过程中的细胞多样性 | NA | 胸腺上皮肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 9880 | 2024-08-08 |
Identification of cell surface markers for acute myeloid leukemia prognosis based on multi-model analysis
2024-May-25, Journal of biomedical research
IF:2.2Q3
DOI:10.7555/JBR.38.20240065
PMID:38807380
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研究论文 | 本研究通过多模型分析构建了一个9个细胞表面标记物的预后模型，用于急性髓系白血病患者的危险分层 | 本研究首次利用多模型分析方法构建了一个包含9个细胞表面标记物的预后模型，并验证了其在独立数据集中的预测价值 | NA | 识别急性髓系白血病的预后生物标志物，并指导治疗 | 急性髓系白血病患者及其细胞表面标记物 | 生物信息学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归, 弹性网络, 自适应LASSO回归 | 基因表达数据 | 涉及三个独立数据集的急性髓系白血病患者 |