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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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9841 | 2025-04-10 |
scRNA-Seq reveals age-dependent microglial evolution as a determinant of immune response following spinal cord injury
2024-12, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脊髓损伤后不同年龄组小胶质细胞的亚型及其功能差异 | 首次系统性地鉴定了脊髓损伤后年龄依赖性小胶质细胞亚型演化及其免疫功能差异 | 研究主要基于生物信息学分析,动物模型验证样本量有限 | 探究年龄因素如何通过小胶质细胞亚型影响脊髓损伤后的免疫反应 | 脊髓损伤后的小胶质细胞 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | scRNA-seq, 免疫荧光染色 | 伪时间轨迹分析, CellChat细胞通讯分析 | 基因表达数据 | 整合GEO数据库中多个数据集的小鼠模型样本 | NA | NA | NA | NA |
9842 | 2025-04-10 |
Investigating the mechanisms of inflammation and immune alterations in Parkinson's disease using spatial transcriptomics techniques
2024-10-15, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术探究帕金森病中炎症和免疫改变的机制 | 首次在MPTP诱导的帕金森病小鼠模型中应用空间转录组学技术,揭示了中脑黑质区域的病理变化与铁死亡之间的关联 | 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证 | 探究帕金森病中炎症和免疫改变的分子机制 | MPTP诱导的帕金森病小鼠模型 | 空间转录组学 | 帕金森病 | 空间转录组测序 | MPTP诱导的小鼠模型 | 转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
9843 | 2025-04-10 |
Deciphering brain cellular and behavioral mechanisms: Insights from single-cell and spatial RNA sequencing
2024 Jul-Aug, Wiley interdisciplinary reviews. RNA
DOI:10.1002/wrna.1865
PMID:38972934
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学在脑研究中的应用及其潜在问题和挑战 | 深入探讨了单细胞和空间RNA测序与神经科学多个方向的整合潜力,包括神经发育、新型脑微结构识别等 | 未具体说明数据处理中的具体技术限制或样本量限制 | 理解单个细胞或细胞类型在特定脑功能中的作用 | 脑细胞及其在脑功能中的作用 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
9844 | 2025-10-07 |
Hematopoietic stem and progenitor cells confer cross-protective trained immunity in mouse models
2023-Sep-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107596
PMID:37664586
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研究论文 | 本研究揭示了造血干细胞和祖细胞通过训练免疫机制在不同病原体间提供交叉保护作用 | 发现HSPCs对感染产生异质性反应,可诱导骨髓源性巨噬细胞功能增强并产生针对不同病原体的交叉保护 | 研究仅限于小鼠模型,特异性反应和负责细胞类型仍需进一步明确 | 探究造血干细胞和祖细胞在训练免疫中的作用机制和交叉保护效应 | 小鼠造血干细胞和祖细胞及衍生的巨噬细胞 | 免疫学 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9845 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity and interactions of immune cells and Müller glia during zebrafish retina regeneration
2025-Dec-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-23-02083
PMID:38934409
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示斑马鱼视网膜再生过程中免疫细胞与Müller胶质细胞的异质性及相互作用 | 首次在斑马鱼视网膜中发现两种静息态Müller胶质细胞亚型及其不同的再生路径,并揭示炎症通过Jak1-Stat3信号通路激活胶质细胞重编程 | 研究仅限于斑马鱼模型,对哺乳动物视网膜再生的直接指导意义尚需验证 | 探究视网膜再生过程中免疫细胞与Müller胶质细胞的细胞异质性和相互作用机制 | 斑马鱼视网膜中的Müller胶质细胞和免疫细胞(包括小胶质细胞) | 单细胞生物学 | 视网膜损伤 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9846 | 2025-10-07 |
Dynamic development of microglia and macrophages after spinal cord injury
2025-Dec-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00063
PMID:39101644
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了脊髓损伤后小胶质细胞和巨噬细胞的动态发育差异 | 首次系统揭示脊髓损伤后小胶质细胞和巨噬细胞的不同演化路径及其功能差异 | NA | 探究脊髓损伤后小胶质细胞和巨噬细胞的动态发育过程及其功能差异 | 脊髓损伤后的小胶质细胞和巨噬细胞 | 单细胞组学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 体内实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
9847 | 2025-10-07 |
Fasting-mimicking diet-enriched Bifidobacterium pseudolongum suppresses colorectal cancer by inducing memory CD8+ T cells
2025-Apr-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-333020
PMID:39870395
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研究论文 | 本研究揭示了模拟禁食饮食通过富集假长双歧杆菌及其代谢产物L-精氨酸促进CD8+组织驻留记忆T细胞分化,从而抑制结直肠癌的机制 | 首次发现假长双歧杆菌是模拟禁食饮食抗肿瘤作用的关键介质,并阐明其通过产生L-精氨酸诱导记忆性CD8+T细胞分化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证样本有限,机制研究尚未完全阐明所有信号通路 | 探究模拟禁食饮食通过肠道菌群调节抑制结直肠癌的免疫机制 | 结直肠癌小鼠模型和结直肠癌患者 | 免疫学与肿瘤学 | 结直肠癌 | 粪便宏基因组测序、单细胞RNA测序、多色流式细胞术、代谢组学分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、代谢组数据、流式细胞数据 | 结直肠癌小鼠模型和有限数量的结直肠癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 宏基因组测序, 代谢组学 | NA | NA |
9848 | 2025-10-07 |
Exploring and validating the marmoset as a primate model for chromosomal instability in early development
2025-Apr-07, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf012
PMID:40193493
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研究论文 | 本研究验证了狨猴作为研究灵长类早期发育中染色体不稳定性的合适模型 | 首次发现狨猴胚胎中存在异质性非整倍体,建立了naïve样狨猴多能干细胞系,揭示了非整倍体在囊胚发育中促进腔体形成的新作用 | 研究受限于动物模型系统,无法直接验证人类胚胎中的机制 | 探索灵长类早期发育中染色体不稳定性的调控机制 | 狨猴胚胎细胞和naïve样狨猴多能干细胞 | 发育生物学 | 胚胎发育异常 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9849 | 2025-10-07 |
Integrating microbial GWAS and single-cell transcriptomics reveals associations between host cell populations and the gut microbiome
2025-Apr-07, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-025-01978-w
PMID:40195537
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研究论文 | 开发计算框架scBPS整合微生物GWAS和单细胞转录组数据,揭示宿主细胞群体与肠道微生物组的关联 | 首次将微生物全基因组关联研究(GWAS)与单细胞RNA测序数据整合,开发scBPS计算方法系统解析宿主-微生物相互作用 | 研究主要基于计算预测和有限实验验证,需要更多功能实验确认机制 | 探索宿主遗传、肠道微生物组与特定细胞环境之间的关联机制 | 人类24个器官的单细胞RNA测序数据和207种微生物分类群 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,微生物GWAS,转录组分析 | 计算框架(scBPS) | 基因组数据,转录组数据 | 24个人类器官,207种微生物分类群,254种宿主细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq,单核RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
9850 | 2025-10-07 |
A replication study of novel fetal hemoglobin-associated genetic variants in sickle cell disease-only cohorts
2025-Apr-06, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaf015
PMID:39886999
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研究论文 | 本研究验证了镰状细胞病中五个新的胎儿血红蛋白相关遗传位点,并通过功能实验探索其调控机制 | 首次在独立镰状细胞病队列中验证了五个新的HbF相关遗传位点,并结合CRISPR抑制和单细胞转录组学揭示其功能机制 | 未能在1354名SCD患者中发现对HbF水平有较大影响的罕见遗传变异 | 验证镰状细胞病中新的胎儿血红蛋白相关遗传变异并探索其功能机制 | 镰状细胞病患者和HUDEP-2红细胞系 | 遗传学 | 镰状细胞病 | GWAS, CRISPR抑制, 单细胞转录组学, 全外显子组测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 最多3740名SCD患者用于验证研究,1354名SCD患者用于外显子分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 全外显子组测序 | NA | NA |
9851 | 2025-10-07 |
Multi-omics analysis identifies DLX4 as a novel biomarker for diagnosis, prognosis, and immune infiltration: from pan-cancer to renal cancer
2025-Apr-05, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02258-z
PMID:40186710
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨DLX4基因在泛癌及肾癌中的诊断、预后和免疫浸润价值 | 首次系统揭示DLX4在泛癌中的表达模式及其与免疫浸润的关联,特别是在肾透明细胞癌中的空间定位特征 | 研究主要基于数据库分析,实验验证部分相对有限 | 探索DLX4在癌症中的分子机制及其作为生物标志物的潜力 | 多种癌症类型,特别关注肾透明细胞癌(KIRC) | 生物信息学 | 肾癌 | 多组学分析, 空间转录组学, 实时PCR, 免疫组化 | NA | 基因表达数据, 突变数据, 甲基化数据, 免疫数据 | 26种癌症类型,具体样本数量未明确说明 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
9852 | 2025-10-07 |
Multi-omics insights into the roles of CCNB1, PLK1, and HPSE in breast cancer progression: implications for prognosis and immunotherapy
2025-Apr-05, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02282-z
PMID:40186712
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研究论文 | 通过多组学方法研究CCNB1、PLK1和HPSE在乳腺癌进展中的作用及其预后和免疫治疗意义 | 首次整合转录组学、蛋白质组学、DNA甲基化分析、免疫浸润分析和单细胞RNA测序等多组学方法系统研究这三个基因在乳腺癌中的协同作用 | 未明确说明样本来源和具体样本量,功能验证实验仅限于细胞增殖分析 | 探究CCNB1、PLK1和HPSE在乳腺癌进展中的具体作用机制 | 乳腺癌肿瘤组织和细胞系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 转录组学, 蛋白质组学, DNA甲基化分析, 免疫浸润分析, 单细胞RNA测序, siRNA敲低 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 甲基化数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | NA | NA |
9853 | 2025-10-07 |
Revealing NAPSA's role in ccRCC: Insights from single-cell RNA sequencing
2025-Apr-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149478
PMID:40194687
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示NAPSA基因在透明细胞肾细胞癌中的表达特征和潜在作用机制 | 首次在单细胞水平系统分析NAPSA在ccRCC中的表达模式,并发现其与EMT过程及肿瘤微环境中细胞通讯的关联 | 样本量较小(7个肿瘤和2个正常样本),需要更大规模研究验证;机制研究尚不完善 | 探究NAPSA基因在透明细胞肾细胞癌中的表达特征和功能作用 | 透明细胞肾细胞癌组织样本和细胞系(OS-RC-2和Caki-1) | 单细胞测序分析 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序,免疫荧光染色,siRNA转染 | Seurat分析流程 | 单细胞RNA测序数据,基因表达数据 | 7个肿瘤样本和2个正常样本(来自GEO数据库GSE210042),外加两个ccRCC细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9854 | 2025-10-07 |
Esophageal epithelial Ikkβ deletion promotes eosinophilic esophagitis in experimental allergy mouse model
2025-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.12.1070
PMID:39724973
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研究论文 | 本研究通过构建食管上皮细胞特异性Ikkβ敲除小鼠模型,揭示了上皮IKKβ/NF-κB信号通路在嗜酸细胞性食管炎发病机制中的关键保护作用 | 首次在实验性过敏小鼠模型中证明食管上皮细胞特异性Ikkβ缺失会加剧嗜酸细胞性食管炎病理特征 | 研究基于小鼠模型,与人类疾病存在物种差异;机制研究尚未完全阐明所有下游效应 | 探究上皮IKKβ/NF-κB信号通路在嗜酸细胞性食管炎发病机制中的作用 | 食管上皮细胞特异性Ikkβ敲除小鼠模型 | 病理学 | 嗜酸细胞性食管炎 | 单细胞RNA测序,组织学分析,转录组分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,组织图像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9855 | 2025-10-07 |
Origin and stepwise evolution of vertebrate lungs
2025-Apr, Nature ecology & evolution
IF:13.9Q1
DOI:10.1038/s41559-025-02642-6
PMID:39953253
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析脊椎动物肺器官的起源和逐步演化过程 | 首次在软骨鱼类中发现肺发育相关的遗传基础,识别哺乳动物特异性肺泡细胞类型和基因 | 研究主要基于基因表达数据,功能验证仅限于小鼠模型 | 探究脊椎动物肺器官的演化起源和分子机制 | 脊椎动物成年和发育期肺组织 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多种脊椎动物物种的肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9856 | 2025-10-07 |
Aspartame increases the risk of liver cancer through CASP1 protein: A comprehensive network analysis insights
2025-Apr-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118089
PMID:40139029
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研究论文 | 通过综合网络毒理学、孟德尔随机化、分子动力学和单细胞RNA测序分析,系统探索阿斯巴甜通过CASP1蛋白增加肝癌风险的机制 | 首次整合网络毒理学、孟德尔随机化、分子动力学和单细胞技术系统研究阿斯巴甜的致癌机制,发现CASP1是阿斯巴甜诱导肝癌的关键靶点 | 需要后续实验验证阿斯巴甜的致癌机制,研究结果主要基于计算和预测方法 | 系统探索阿斯巴甜的致癌潜力及其对肝脏的作用机制 | 阿斯巴甜及其与肝癌相关的分子靶点 | 计算生物学 | 肝癌 | 网络毒理学、孟德尔随机化、分子动力学模拟、单细胞RNA测序 | 分子对接模型、分子动力学模型 | 计算预测数据、分子对接数据、单细胞表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9857 | 2025-10-07 |
H1-0 is a specific mediator of the repressive ETV6::RUNX1 transcriptional landscape in preleukemia and B cell acute lymphoblastic leukemia
2025-Apr, HemaSphere
IF:7.6Q1
DOI:10.1002/hem3.70116
PMID:40177616
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研究论文 | 本研究通过hiPSC模型发现H1-0是ETV6::RUNX1融合基因诱导的转录抑制景观的关键调控因子 | 首次揭示连接组蛋白H1-0在ETV6::RUNX1阳性前白血病状态中的关键调控作用 | 研究主要基于hiPSC模型,需要进一步在体内验证 | 探索ETV6::RUNX1阳性前白血病细胞维持静息状态的分子机制 | ETV6::RUNX1阳性B细胞前体急性淋巴细胞白血病 | 分子生物学 | 急性淋巴细胞白血病 | CRISPR/Cas9基因编辑,单细胞测序,双荧光素酶报告基因检测 | hiPSC模型 | 转录组数据 | 1,727例白血病患者样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
9858 | 2025-10-07 |
In Situ Graphene-Seq: Spatial Transcriptomics and Chronic Electrophysiological Characterization of Tissue Microenvironments
2025-Mar-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.25.645278
PMID:40196689
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研究论文 | 开发了一种集成慢性电生理记录和空间分辨3D转录组学的原位石墨烯测序平台 | 首次将可拉伸网状纳米电子学与透明石墨烯电极结合,实现长期单细胞水平的多模态分析 | NA | 研究细胞功能与分子身份之间的复杂相互作用 | 人诱导多能干细胞衍生的心肌细胞和内皮细胞共培养体系 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 原位测序, 电生理记录, 光学成像 | NA | 电生理信号, 基因表达数据, 空间图像 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞电生理记录, 3D成像 | 原位石墨烯测序平台 | 集成可拉伸网状纳米电子学和透明石墨烯/PEDOT:PSS电极的多模态分析系统 |
9859 | 2025-10-07 |
Lignature: A Comprehensive Database of Ligand Signatures to Predict Cell-Cell Communication
2025-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.22.644770
PMID:40196598
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研究论文 | 开发了一个名为Lignature的配体特征数据库,用于预测细胞间通讯 | 构建了包含362种人类配体的细胞内转录组特征数据库,显著扩展了可用配体响应特征库,在基因和通路水平上优于现有方法 | NA | 预测配体-受体相互作用和细胞间通讯 | 人类配体及其诱导的转录组特征 | 生物信息学 | NA | 转录组分析,单细胞测序 | NA | 转录组数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9860 | 2025-10-07 |
Streptococcus lutetiensis inhibits CD8+ IL17A+ TRM cells and leads to gastric cancer progression and poor prognosis
2025-Feb-09, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00810-2
PMID:39924593
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研究论文 | 本研究通过微生物组和单细胞分析揭示路氏链球菌通过抑制CD8+ IL17A+ TRM细胞促进胃癌进展 | 首次发现路氏链球菌在胃癌组织中富集并通过激活Nrf2介导的氧化应激反应抑制CD8IL17A TRM细胞 | NA | 探究胃微生物组对胃癌进展和免疫调节的影响 | 胃癌患者组织样本和小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 16s rRNA测序, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 微生物组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |