单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 9841 - 9860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9841 | 2024-08-07 |
Dry eye disease in mice activates adaptive corneal epithelial regeneration distinct from constitutive renewal in homeostasis
2023-01-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2204134120
PMID:36595669
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了小鼠角膜上皮在稳态、老化、糖尿病和干眼病（DED）状态下的转录状态，揭示了DED中角膜上皮适应性再生的独特响应。 | 本研究首次提供了区分稳态更新与适应性再生的全局标记，并验证了SPARC作为适应性再生标记的表达，加速了角膜上皮细胞的伤口闭合。 | NA | 探索干眼病状态下角膜上皮的适应性再生机制，并为未来研究眼部表面干细胞在健康和疾病中的功能提供框架和图谱。 | 小鼠角膜上皮细胞在不同生理和病理状态下的转录状态。 | 数字病理学 | 干眼病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 9842 | 2024-08-07 |
Transcriptional and Immune Landscape of Cardiac Sarcoidosis
2022-09-30, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.121.320449
PMID:36111531
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和单核RNA测序技术，揭示了心脏肉瘤病中的细胞和转录组景观，并识别了其与其它炎症性心脏疾病的差异 | 本研究首次通过空间转录组学和单核RNA测序技术，揭示了心脏肉瘤病中免疫细胞的多样性和独特的分子特征 | NA | 阐明心脏肉瘤病中的细胞和转录组景观，并区分其与其它炎症性心脏疾病的差异 | 心脏肉瘤病中的免疫细胞类型及其转录组景观 | 数字病理学 | 心脏肉瘤病 | 空间转录组学（GeoMx数字空间分析仪）和单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 人类心脏肉瘤病样本 |
| 9843 | 2024-08-07 |
Brain cancer stem cells: resilience through adaptive plasticity and hierarchical heterogeneity
2022-09, Nature reviews. Cancer
DOI:10.1038/s41568-022-00486-x
PMID:35710946
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综述 | 本文综述了脑癌干细胞如何通过适应性可塑性和层次异质性在脑肿瘤生态系统中维持其动态特性，并探讨了单细胞测序等技术进步如何帮助我们更好地理解这些机制以用于治疗目的 | 利用单细胞测序等技术深入探讨脑癌干细胞的生物机制，并探索这些机制如何被用于治疗 | NA | 探讨脑癌干细胞的生物机制及其在治疗中的应用潜力 | 脑癌干细胞及其在脑肿瘤中的作用 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 9844 | 2024-08-07 |
The human myocardium harbors a population of naive B-cells with a distinctive gene expression signature conserved across species
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.973211
PMID:36248879
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研究论文 | 本文通过免疫组织化学染色和单细胞测序技术，研究了人类心肌中的B细胞数量、分布及其基因表达特征，并与小鼠数据进行了比较 | 首次详细描述了人类心肌中B细胞的分布和基因表达特征，并发现这些特征在不同物种间具有保守性 | 研究主要基于公开数据集和少量心脏辅助设备接受者的样本，可能需要更多临床样本以验证结果 | 探讨人类心肌中B细胞的生物学特性及其在心脏疾病治疗中的潜在应用 | 人类心肌中的B细胞及其基因表达特征 | 免疫学 | 心脏疾病 | 免疫组织化学染色，单细胞测序 | NA | 组织样本，基因表达数据 | 分析了健康人类心脏样本中的B细胞与T细胞比例，以及心脏辅助设备接受者的心脏和外周血样本 |
| 9845 | 2024-08-07 |
CD11c+CD88+CD317+ myeloid cells are critical mediators of persistent CNS autoimmunity
2021-04-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2014492118
PMID:33785592
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研究论文 | 研究通过选择性删除CD11c细胞中的α4-整合素，探讨其在中枢神经系统（CNS）自身免疫中的作用 | 首次展示了CD11c+CD88+CD317+髓系细胞在持续性CNS自身免疫中的关键作用，并通过单细胞RNA测序进行了详细分析 | 研究主要在实验小鼠模型中进行，可能与人类疾病存在差异 | 探讨CD11c+CD88+CD317+髓系细胞在多发性硬化症（MS）中的作用及机制 | CD11c.Cre小鼠和野生型（WT）小鼠 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及CD11c.Cre小鼠和WT小鼠，以及人类脑脊液样本 |
| 9846 | 2024-08-07 |
Identification and Characterization of Zebrafish Tlr4 Coreceptor Md-2
2021-03-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.1901288
PMID:33472906
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和功能实验，鉴定并表征了斑马鱼中的Tlr4共受体Md-2，揭示了其在先天免疫系统中的作用 | 首次在斑马鱼中发现并验证了Md-2的存在，并证明其与Tlr4形成复合体响应LPS，挑战了之前认为斑马鱼缺乏Md-2的观点 | 文章中提到的功能丧失突变对LPS毒性的保护作用有限，表明可能存在其他未知的免疫机制 | 探究斑马鱼中Tlr4共受体Md-2的鉴定与功能，以及其在先天免疫系统中的作用 | 斑马鱼中的Tlr4共受体Md-2及其在先天免疫系统中的作用 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及11种有颌脊椎动物的基因组分析 |
| 9847 | 2024-08-07 |
Entropy subspace separation-based clustering for noise reduction (ENCORE) of scRNA-seq data
2021-02-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa1157
PMID:33305325
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研究论文 | 本文提出了一种基于熵子空间分离的聚类算法ENCORE，用于减少单细胞RNA测序数据中的噪声 | ENCORE算法通过集成熵子空间分离策略和共识聚类方法，能够有效区分信息特征与噪声，提高细胞聚类的准确性和可视化分辨率 | NA | 研究旨在提高单细胞RNA测序数据分析的准确性和分辨率，以更好地研究细胞异质性和发现群体标记 | 单细胞RNA测序数据中的细胞聚类、标记识别和可视化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 共识聚类方法 | 单细胞RNA测序数据 | 12个标准数据集 |
| 9848 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing and lipidomics reveal cell and lipid dynamics of fat infiltration in skeletal muscle
2021-02, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
DOI:10.1002/jcsm.12643
PMID:33244879
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和脂质组学分析，揭示了骨骼肌中脂肪浸润的细胞和脂质动态变化 | 首次通过单细胞RNA测序和脂质组学技术，详细解析了骨骼肌脂肪浸润过程中的细胞起源和脂质及转录组变化 | 研究主要集中在短期内的细胞和脂质变化，长期影响及机制尚需进一步研究 | 探究骨骼肌中脂肪浸润的细胞起源和脂质及转录组变化 | 骨骼肌中的脂肪浸润现象 | 数字病理学 | 肌肉疾病 | 单细胞RNA测序, 脂质组学 | NA | RNA, 脂质 | GLY注射后的骨骼肌样本 |
| 9849 | 2024-08-07 |
Runx2-Twist1 interaction coordinates cranial neural crest guidance of soft palate myogenesis
2021-01-22, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.62387
PMID:33482080
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研究论文 | 本研究使用小鼠软腭作为模型，通过单细胞RNA测序分析探讨了颅神经嵴衍生物在颅面肌肉发育中的异质性和谱系承诺 | 揭示了Runx2和Twist1在调控颅神经嵴衍生物命运中的新作用，以及它们通过细胞间相互作用指导颅面肌肉发育的机制 | NA | 研究颅神经嵴细胞在颅面肌肉发育中的作用及其调控机制 | 颅神经嵴细胞及其在颅面肌肉发育中的衍生物 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠软腭样本 |
| 9850 | 2024-08-07 |
A High-Dimensional Window into the Micro-Environment of Triple Negative Breast Cancer
2021-Jan-16, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13020316
PMID:33467084
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综述 | 本文综述了三阴性乳腺癌（TNBC）微环境中淋巴细胞、髓系细胞和基质细胞的细胞表型和空间模式，并探讨了将这些特征映射到肿瘤细胞基因型的潜在价值 | 利用多种高维度技术（如单细胞RNA测序、空间转录组学、T细胞受体分析、高级流式细胞术、成像质谱细胞术及其整合）来定义细胞表型 | NA | 深入理解三阴性乳腺癌患者的肿瘤微环境组成，以提供有效的个性化免疫治疗 | 三阴性乳腺癌的肿瘤细胞和非肿瘤成分的异质性及其随时间的变化 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、T细胞受体分析、高级流式细胞术、成像质谱细胞术 | NA | 基因组数据 | NA |
| 9851 | 2024-08-07 |
Single-Cell Profiling of Coding and Noncoding Genes in Human Dopamine Neuron Differentiation
2021-01-12, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10010137
PMID:33445654
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术对人类多巴胺神经元分化过程中的编码和非编码基因进行了高吞吐量转录组分析 | 开发了一种生物信息学管道，提供了基于时间和细胞类型特异性的长非编码RNA全景图，有助于揭示多巴胺神经元分化中编码和非编码基因的复杂调控网络 | NA | 评估干细胞培养作为人类多巴胺神经发生体外模型系统的实用性，并揭示人类多巴胺神经元的发育、成熟和功能的分子步骤 | 人类多能干细胞衍生的多巴胺神经元及其分化过程中的编码和非编码基因 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约20,000个腹侧中脑模式化的干细胞 |
| 9852 | 2024-08-07 |
FLOW-MAP: a graph-based, force-directed layout algorithm for trajectory mapping in single-cell time course datasets
2020-02, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-019-0246-3
PMID:31932774
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研究论文 | 本文介绍了一种名为FLOW-MAP的图形用户界面（GUI）软件工具，该工具利用基于图布局分析和时间顺序的方法，用于可视化高维单细胞数据集中的细胞轨迹 | FLOW-MAP算法通过图形布局分析和时间顺序的方法，为单细胞时间序列数据集的分析提供了一种新的可视化工具 | NA | 开发一种新的工具来分析和可视化单细胞时间序列数据集中的细胞轨迹 | 单细胞时间序列数据集，特别是来自流式细胞术、质谱细胞术或单细胞RNA测序（scRNAseq）实验的数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | 图布局算法 | 高维单细胞数据 | 包括从小鼠胚胎干细胞分化的时间序列数据集和已发表的scRNAseq数据集 |
| 9853 | 2024-08-07 |
Integrated-omics profiling unveils the disparities of host defense to ECM scaffolds during wound healing in aged individuals
2024-Dec, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 本文通过综合分析单细胞RNA测序和空间转录组学，探讨了ECM支架在老年个体伤口愈合中的差异性表现及其机制 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了老年小鼠中ECM支架周围六种功能和空间上独特的巨噬细胞和淋巴细胞群 | NA | 探索年龄相关差异背后的机制，并为未来针对老年个体的精准生物材料开发提供依据 | ECM支架在老年个体伤口愈合中的表现及其机制 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 老年小鼠 |
| 9854 | 2024-08-07 |
FLT3+ DC inhibits immune rejection via interaction with Treg in liver transplantation
2024-Aug-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112289
PMID:38889505
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研究论文 | 研究探讨了FLT3+ DC在肝脏移植中通过与Treg相互作用抑制免疫排斥的作用 | 首次揭示了FLT3DCs与调节性T细胞（Tregs）在肝脏移植中的关系，并提出FLT3DCs可能成为减轻肝脏移植免疫排斥的新靶点 | NA | 研究FLT3DCs在肝脏移植中的免疫调节作用 | FLT3+ DCs和调节性T细胞（Tregs） | NA | 肝脏移植 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 包括肝脏移植患者的外周血样本和肝脏组织，以及肝脏移植小鼠模型 |
| 9855 | 2024-08-07 |
Akt is a mediator of artery specification during zebrafish development
2024-Aug-05, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202727
PMID:39101673
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研究论文 | 本文研究了蛋白激酶B（Akt）在斑马鱼发育过程中对背主动脉（DA）形成的作用 | 揭示了Akt激酶在动脉内皮细胞中作为Notch信号通路上游的作用，并参与正确胚胎动脉的形成 | NA | 探究Akt在斑马鱼胚胎心血管系统中对背主动脉形成的作用 | 斑马鱼胚胎的背主动脉形成过程 | NA | 先天性畸形 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 四重突变体（aktΔ/Δ）中的akt 1, 2, 3a, 和 3b基因表达和活性显著降低的斑马鱼胚胎 |
| 9856 | 2024-08-07 |
Huntington's disease cellular phenotypes are rescued non-cell autonomously by healthy cells in mosaic telencephalic organoids
2024-Aug-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50877-x
PMID:39095390
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研究论文 | 本研究通过生成含有健康细胞或亨廷顿病（HD）细胞的端脑类器官，探讨了细胞间的非细胞自主机制对HD细胞表型的影响 | 首次揭示了健康细胞在混合类器官中对HD细胞身份、发育轨迹、突触密度及通信途径的恢复作用 | NA | 探讨亨廷顿病中细胞间的非细胞自主机制及其对疾病进展和治疗的影响 | 亨廷顿病细胞与健康细胞在端脑类器官中的相互作用 | 数字病理学 | 亨廷顿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 9857 | 2024-08-07 |
Exploring prognostic DNA methylation genes in bladder cancer: a comprehensive analysis
2024-Aug-02, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01206-7
PMID:39095590
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研究论文 | 本研究旨在探讨膀胱癌中具有预后DNA甲基化位点的基因状态 | 利用多种机器学习算法筛选关键基因，并构建Nomogram模型进行预后评估和药物敏感性分析 | NA | 探索膀胱癌中预后DNA甲基化基因，为预后评估和药物选择提供参考 | 膀胱癌中的DNA甲基化基因 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 甲基化测序 | Nomogram | 基因组数据 | 来自公共数据库的膀胱癌bulk转录组测序数据、甲基化数据和单细胞测序数据 |
| 9858 | 2024-08-07 |
Single-cell tumor heterogeneity landscape of hepatocellular carcinoma: unraveling the pro-metastatic subtype and its interaction loop with fibroblasts
2024-Aug-02, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02062-3
PMID:39095854
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，揭示了肝细胞癌（HCC）恶性细胞的异质性景观，并识别了促进转移的亚型及其与成纤维细胞的相互作用 | 首次建立了HCC恶性细胞的异质性景观，并识别了三种不同的肿瘤细胞亚型，包括促进转移的亚型，以及该亚型与成纤维细胞之间的正反馈循环 | NA | 揭示肝细胞癌肿瘤细胞的异质性及其对肿瘤进展和转移的机制 | 肝细胞癌（HCC）的肿瘤细胞异质性 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | 52个单细胞RNA测序数据和5个空间转录组学数据 |
| 9859 | 2024-08-07 |
Infiltrating lipid-rich macrophage subpopulations identified as a regulator of increasing prostate size in human benign prostatic hyperplasia
2024-Aug-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.07.597992
PMID:38915654
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了良性前列腺增生（BPH）中CD45+过渡区的白细胞，发现脂质丰富的巨噬细胞亚群与前列腺体积增大相关 | 首次定义了BPH中的两种新型免疫亚群，即TREM2+和MARCO+巨噬细胞，并提出这些脂质丰富的巨噬细胞可能加剧大前列腺患者的下尿路症状 | 需要进一步研究评估针对这些细胞在BPH中的治疗益处 | 探讨巨噬细胞在良性前列腺增生中的激活状态及其对这种增生性疾病的影响 | 良性前列腺增生（BPH）中的巨噬细胞亚群及其与前列腺体积增大的关系 | 数字病理学 | 前列腺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 20个人类前列腺样本，包括10个大前列腺（>90克）和10个小前列腺（<40克） |
| 9860 | 2024-08-07 |
Refining the optimal CAF cluster marker for predicting TME-dependent survival expectancy and treatment benefits in NSCLC patients
2024-07-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-55375-0
PMID:39034310
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，系统筛选多个数据库，以确定在非小细胞肺癌中区分癌症相关成纤维细胞（CAFs）的最强标记，特别是用于早期诊断、分期和治疗反应评估 | 首次揭示了CAF标记簇在区分不同肿瘤微环境（TME）组中的独特作用，并确定COL1A1为最有效的CAF标记 | 研究主要集中在CAFs的异质性和不同成纤维细胞标记在各种样本分析中的使用，这可能导致临床应用中的混淆和障碍 | 旨在确定用于预测TME依赖性生存预期和治疗效益的最佳CAF集群标记 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 未具体说明样本数量 |