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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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9821 | 2025-10-07 |
A tumor-infiltrating B lymphocytes -related index based on machine-learning predicts prognosis and immunotherapy response in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1524120
PMID:40196113
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研究论文 | 基于机器学习构建肿瘤浸润B淋巴细胞相关指数预测肺腺癌预后和免疫治疗反应 | 首次系统性地利用十种机器学习算法和101种算法组合构建TILB相关指数,全面分析其在肺腺癌中的作用 | 研究基于公共数据集,需要进一步实验验证 | 开发预测肺腺癌预后和免疫治疗反应的生物标志物 | 肺腺癌患者和肿瘤浸润B淋巴细胞 | 机器学习 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,机器学习 | 多种机器学习算法组合 | 基因表达数据,临床数据 | TCGA、GSE31210、GSE72094、GSE91061和GSE126044多个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9822 | 2025-10-07 |
Immune cells differentiation in osteoarthritic cartilage damage: friends or foes?
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1545284
PMID:40201177
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综述 | 本文综述了骨关节炎中免疫细胞分化的双重作用及其在疾病进展中的复杂网络 | 系统阐述骨关节炎中免疫细胞'亦敌亦友'的双重特性,并比较其与类风湿关节炎在免疫治疗方面的异同 | 主要基于现有文献综述,缺乏原始实验数据验证 | 阐明骨关节炎中免疫细胞的分化特征及其在疾病进展中的作用机制 | 骨关节炎患者的免疫细胞及其与关节组织的相互作用 | 免疫学 | 骨关节炎 | 单细胞测序, 免疫组学 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9823 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing advances in revealing the development and progression of MASH: the identifications and interactions of non-parenchymal cells
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1513993
PMID:40201243
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在揭示代谢相关脂肪性肝炎中非实质细胞发育和进展方面的应用 | 系统总结了单细胞转录组测序技术对MASH中非实质细胞异质性和细胞相互作用的最新发现 | 作为综述文章,主要基于已有研究进行总结,未提供原始实验数据 | 探讨单细胞RNA测序技术在MASH研究中的应用,理解非实质细胞在疾病中的作用机制 | 肝脏非实质细胞(包括Kupffer细胞、肝星状细胞和肝窦内皮细胞) | 数字病理学 | 代谢相关脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9824 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing and spatial transcriptomics reveal the evolution of glucose metabolism in hepatocellular carcinoma and identify G6PD as a potential therapeutic target
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1553722
PMID:40201344
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学揭示肝细胞癌中葡萄糖代谢的时空演化特征,并验证G6PD作为潜在治疗靶点 | 首次从时空维度解析肝细胞癌葡萄糖代谢演化规律,发现G6PD通过谷胱甘肽代谢和ROS产生调控肿瘤进展 | 样本量有限(7例单细胞测序样本,4例空间转录组样本),需更大规模验证 | 探索肝细胞癌中葡萄糖代谢的时空演化特征并寻找治疗靶点 | 肝细胞癌组织及癌旁组织 | 空间转录组学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序, 空间转录组学, 高通量测序, 伤口愈合实验, CCK-8实验, transwell实验 | 伪时间分析, Cox回归分析 | 单细胞测序数据, 空间转录组数据 | 7例HCC及癌旁组织(单细胞测序),4例HCC组织(空间转录组) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
9825 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing reveals the role of aggrephagy-related patterns in tumor microenvironment, prognosis and immunotherapy in endometrial cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1560625
PMID:40201347
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研究论文 | 通过单细胞测序技术研究聚集性自噬相关模式在子宫内膜癌肿瘤微环境、预后和免疫治疗中的作用 | 首次在子宫内膜癌中系统分析聚集性自噬相关基因在肿瘤微环境中的作用,并发现TUBA1A+巨噬细胞亚型与良好预后的关联 | 样本量相对有限(5个肿瘤样本),需要更大规模研究验证 | 阐明聚集性自噬在子宫内膜癌肿瘤微环境中的功能及其对预后和免疫治疗的影响 | 子宫内膜癌患者肿瘤样本中的单细胞 | 单细胞测序分析 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学染色 | 非负矩阵分解算法,CellChat分析 | 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据 | 5个子宫内膜癌肿瘤样本中的36,227个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
9826 | 2025-10-07 |
Comprehensive Analyses of Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Data From M2 Macrophages to Elucidate the Immune Prognostic Signature in Patients with Gastric Cancer Peritoneal Metastasis
2025, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S506143
PMID:40201390
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研究论文 | 基于单细胞和批量RNA测序数据构建M2巨噬细胞相关基因的预后风险模型,用于预测胃癌腹膜转移患者的预后和免疫治疗反应 | 首次结合单细胞RNA测序和加权基因共表达网络分析识别M2巨噬细胞相关基因,构建了针对胃癌腹膜转移的预后预测模型 | 模型验证主要依赖公共数据库数据,需要进一步的前瞻性临床验证 | 构建能够有效预测胃癌腹膜转移患者预后和免疫治疗反应的生物标志物模型 | 胃癌腹膜转移患者 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, WGCNA, LASSO分析 | 预后风险模型 | 基因表达数据 | TCGA、GSE62254和IMvigor210等多个队列数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
9827 | 2025-10-07 |
Transcriptomic and spatial dissection of human ex vivo right atrial tissue reveals proinflammatory microvascular changes in ischemic heart disease
2024-May-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101556
PMID:38776872
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研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学分析人类离体右心房组织,揭示缺血性心脏病中促炎性微血管变化 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术系统分析人类右心房组织在心血管疾病中的基因表达变化 | 研究样本为离体组织,可能无法完全反映体内真实情况;对照组为接受预防性手术的瓣膜病患者 | 揭示缺血性心脏病和心力衰竭中右心房组织的分子和细胞变化机制 | 人类离体右心房组织和心包液 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 未明确样本数量(使用瓣膜病患者作为对照组) | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
9828 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis revealed a potential role of T-cell exhaustion in colorectal cancer with liver metastasis
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18341
PMID:38647235
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研究论文 | 通过单细胞分析揭示T细胞耗竭在结直肠癌肝转移中的潜在作用 | 首次通过单细胞测序技术系统分析结直肠癌肝转移中T细胞耗竭的作用机制,发现CEACAM5和ADGRE5-CD55在Tex与Treg-上皮细胞相互作用中的关键角色 | 研究基于公共数据库数据,缺乏实验验证;样本来源和数量未明确说明 | 探究T细胞耗竭在结直肠癌肝转移过程中的作用机制 | 结直肠癌肝转移患者的单细胞测序数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | Seurat聚类分析,伪时间分析,ssGSEA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9829 | 2025-10-07 |
Integrated analysis highlights the significance role of ITGAL in lung adenocarcinoma
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18289
PMID:38613346
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研究论文 | 本研究通过整合分析揭示了ITGAL在肺腺癌中的预后价值和抑制肿瘤恶性进展的作用 | 首次系统阐明ITGAL在肺腺癌中的预后价值及其通过调控NK细胞因子影响肿瘤微环境的机制 | 研究主要基于TCGA数据库和体外实验,缺乏大规模临床样本验证 | 探究ITGAL在肺腺癌中的生物学功能和临床意义 | 肺腺癌患者和肿瘤细胞 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞测序,3D Matrigel培养,BrdU ELISA,伤口愈合迁移实验,细胞粘附实验 | NA | 基因表达数据,临床预后数据,单细胞测序数据 | TCGA数据库中的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9830 | 2025-10-07 |
Detecting early-warning biomarkers associated with heart-exosome genetic-signature for acute myocardial infarction: A source-tracking study of exosome
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18334
PMID:38661439
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研究论文 | 本研究通过溯源分析血浆外泌体,检测与心脏外泌体遗传特征相关的急性心肌梗死早期预警生物标志物 | 首次通过去卷积算法实现血浆外泌体溯源分析,识别出三个与心脏外泌体遗传特征相关的急性心肌梗死早期预警生物标志物 | 仅分析了血浆总外泌体中的心脏来源部分,未完全排除其他器官外泌体的干扰 | 检测与心脏外泌体遗传特征相关的急性心肌梗死早期预警生物标志物 | 急性心肌梗死患者的血浆外泌体 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞测序, 去卷积算法, 加权基因共表达网络, 机器学习 | 机器学习 | 基因表达数据 | 住院患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9831 | 2025-10-07 |
Identification of PPAR-related differentially expressed genes liver hepatocellular carcinoma and construction of a prognostic model based on data analysis and molecular docking
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18304
PMID:38652093
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肝细胞癌中PPAR相关基因表达,构建预后模型并筛选潜在治疗药物 | 首次在单细胞水平分析肝细胞癌中PPAR相关基因表达特征,构建基于8个PPAR相关基因的预后模型,并通过分子对接筛选潜在治疗药物 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限 | 探索肝细胞癌发展的分子机制并识别潜在治疗靶点 | 肝细胞癌组织样本和细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,分子对接,伤口愈合实验 | LASSO-Cox回归模型,ConsensusCluster分析 | 基因表达数据 | TCGA-LIHC、ICGC-LIRI和GSE14520数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9832 | 2025-10-07 |
Integrative analysis unveils ECM signatures and pathways driving hepatocellular carcinoma progression: A multi-omics approach and prognostic model development
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18230
PMID:38568083
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示细胞外基质在肝细胞癌进展中的特征和作用机制,并开发了基于ECM的预后模型 | 整合单细胞转录组分析和多组学数据,系统揭示ECM在LIHC免疫浸润和预后分层中的新作用,并构建了有效的ECM预后模型 | 样本量相对有限(10个LIHC样本),需要在更大队列中进一步验证 | 探索细胞外基质在肝细胞癌进展中的作用机制并开发预后预测模型 | 肝细胞癌患者样本、肝癌细胞系 | 生物信息学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, Western blotting, 侵袭实验, Transwell实验 | Lasso回归 | 单细胞转录组数据, 基因表达数据, 蛋白质数据 | 10个LIHC样本(单细胞数据), TCGA-LIHC队列, CheckMate研究独立队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9833 | 2025-10-07 |
Integration of single-cell and RNA-seq data to explore the role of focal adhesion-related genes in osteoporosis
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18271
PMID:38534087
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研究论文 | 通过整合单细胞和RNA测序数据探索黏着斑相关基因在骨质疏松症中的作用 | 首次通过整合单细胞RNA测序和RNA测序数据识别出与骨质疏松相关的两个关键基因FAM129A和RNF24 | 研究样本量有限,仅基于GSE56815和GSE56116两个队列数据 | 挖掘与黏着斑相关的枢纽基因并研究其在骨质疏松症中的作用 | 骨质疏松症患者样本、小鼠模型、人类血液样本 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个基因表达数据集(GSE56815和GSE56116) | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
9834 | 2025-10-07 |
Histone modification-linked prognostic model for ovarian cancer reveals LBX2 as a novel growth promoter
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18260
PMID:38520216
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研究论文 | 本研究构建了基于组蛋白修饰相关基因的卵巢癌预后模型,并发现LBX2作为新的生长促进因子 | 首次将组蛋白修饰相关基因与卵巢癌预后关联,并鉴定LBX2为新的卵巢癌增殖促进因子 | 研究基于回顾性数据,需要进一步实验验证 | 探索组蛋白修饰相关基因在卵巢癌预后预测中的作用 | 卵巢癌患者 | 生物信息学 | 卵巢癌 | RNA-Seq, 单细胞RNA测序 | Lasso回归 | 转录组数据 | 多个队列的卵巢癌患者数据 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
9835 | 2025-10-07 |
Prognostic and immunotherapeutic potential of regulatory T cell-associated signature in ovarian cancer
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18248
PMID:38520220
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别Treg相关生物标志物,开发了卵巢癌预后模型并评估其免疫治疗潜力 | 首次结合单细胞RNA测序和机器学习算法构建Treg相关特征评分,用于卵巢癌预后预测和免疫治疗反应评估 | 需要进一步的外部验证和临床转化研究 | 探索调节性T细胞相关基因在卵巢癌中的预后价值和免疫治疗潜力 | 卵巢癌患者 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 机器学习 | 随机生存森林(RSF), LASSO | 基因表达数据 | 未明确指定样本数量,但识别了365个Treg相关基因 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
9836 | 2025-10-07 |
Construction of a prognostic model with CAFs for predicting the prognosis and immunotherapeutic response of lung squamous cell carcinoma
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18262
PMID:38520221
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研究论文 | 本研究构建了基于癌症相关成纤维细胞(CAFs)的预后模型,用于预测肺鳞状细胞癌(LUSC)的预后和免疫治疗反应 | 首次在LUSC中系统分类CAFs亚型并构建包含9个CAF相关基因的预后特征模型 | CAFs在LUSC中的功能复杂且不确定,需要进一步验证 | 开发预测LUSC预后和免疫治疗反应的生物标志物模型 | 肺鳞状细胞癌患者和癌症相关成纤维细胞 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 单变量Cox分析, 多变量Cox分析, ssGSEA, Kaplan-Meier分析 | Cox比例风险模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9837 | 2025-10-07 |
Rapid microfluidic isolation of virally infected primary bronchial epithelial cells for single-cell RNA sequencing
2021-07-16, BioTechniques
IF:2.2Q4
DOI:10.2144/btn-2021-0020
PMID:34269076
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研究论文 | 介绍了一种使用微流控设备快速分离病毒感染的原代支气管上皮细胞用于单细胞RNA测序的优化方法 | 开发了可在生物安全柜内操作、使用常规实验室设备即可快速分离病毒感染细胞的微流控方法 | NA | 建立病毒感染支气管上皮细胞的高效分离方法以促进单细胞RNA测序研究 | 病毒感染的原代支气管上皮细胞和细胞系 | 单细胞测序技术 | 呼吸道病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9838 | 2025-04-10 |
FoxO1 mediates odontoblast differentiation of hDPSCs via B cell-derived ANGPTL1 in dental caries: A laboratory investigation
2025-May, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.14206
PMID:39904951
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research paper | 本研究探讨了B细胞及其分泌因子ANGPTL1在龋齿条件下促进人牙髓干细胞(hDPSCs)向成牙本质细胞分化的作用,重点关注FoxO1的激活 | 揭示了B细胞分泌的ANGPTL1通过上调FoxO1促进hDPSCs向成牙本质细胞分化的新机制 | 研究主要基于实验室数据,尚未进行临床验证 | 探索龋齿环境下牙髓修复和再生的分子机制 | 人牙髓干细胞(hDPSCs)和B细胞 | dental research | dental caries | scRNA-Seq, ELISA, 免疫荧光染色, 双荧光素酶报告基因检测, 染色质免疫沉淀 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
9839 | 2025-04-10 |
ROICellTrack: A deep learning framework for integrating cellular imaging modalities in subcellular spatial transcriptomic profiling of tumor tissues
2025-Apr-08, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf152
PMID:40199763
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研究论文 | 开发了一个名为ROICellTrack的深度学习框架,用于更好地整合细胞成像与空间转录组分析 | 提出了一种新的深度学习框架,将细胞成像与空间转录组分析相结合,以分析肿瘤异质性 | 研究样本量较小,仅分析了56个ROI | 提高对肿瘤异质性的理解,以支持个性化和靶向治疗 | 膀胱尿路上皮癌(UCB)和上尿路尿路上皮癌(UTUC)的肿瘤组织 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 空间转录组技术(如GeoMx Digital Spatial Profiler) | 深度学习 | 图像和转录组数据 | 56个ROI | NA | NA | NA | NA |
9840 | 2025-10-07 |
Synthetic control removes spurious discoveries from double dipping in single-cell and spatial transcriptomics data analyses
2024-Dec-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.21.550107
PMID:37546812
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研究论文 | 提出一种名为ClusterDE的统计方法,用于识别单细胞和空间转录组数据分析中可靠的细胞类型和空间域标记基因 | 通过生成合成零数据作为阴性对照,有效控制假发现率并消除因双重检验导致的虚假发现 | NA | 解决单细胞和空间转录组数据分析中的双重检验问题,识别可靠的差异表达基因 | 单细胞转录组数据和空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 统计方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |