单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 9821 - 9840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9821 | 2024-08-10 |
Applications of brain organoids in neurodevelopment and neurological diseases
2021-Apr-22, Journal of biomedical science
IF:9.0Q1
DOI:10.1186/s12929-021-00728-4
PMID:33888112
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综述 | 本文综述了脑类器官在神经发育和神经系统疾病中的应用现状 | 介绍了脑类器官与免疫染色和单细胞测序技术的结合，以及其在模拟早期脑发育和建模人类脑部疾病中的应用 | 讨论了该技术的挑战和未来展望 | 介绍脑类器官分化策略的现状，总结其在医学领域的进展和应用 | 脑类器官及其在神经发育和神经系统疾病中的应用 | NA | 神经系统疾病 | 免疫染色技术，单细胞测序技术 | NA | 组织 | NA |
| 9822 | 2024-08-10 |
The long noncoding RNA lnc-HLX-2-7 is oncogenic in Group 3 medulloblastomas
2021-04-12, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaa235
PMID:33844835
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研究论文 | 本文报道了一种新的长链非编码RNA lnc-HLX-2-7，作为第三组髓母细胞瘤的潜在分子标记和治疗靶点 | 首次发现lnc-HLX-2-7在第三组髓母细胞瘤中高度上调，并证实其作为治疗靶点的潜力 | NA | 研究lnc-HLX-2-7在髓母细胞瘤中的作用及其作为治疗靶点的可能性 | lnc-HLX-2-7在第三组髓母细胞瘤中的表达和功能 | 数字病理学 | 儿童肿瘤 | RNA测序（RNA-seq） | CRISPR/Cas9 | RNA | 175名髓母细胞瘤患者 |
| 9823 | 2024-08-10 |
Colorectal Cancer Stem Cell States Uncovered by Simultaneous Single-Cell Analysis of Transcriptome and Telomeres
2021-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202004320
PMID:33898197
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研究论文 | 本文通过同时分析单细胞转录组和端粒长度，揭示了结直肠癌干细胞的状态 | 首次实现同时测量单细胞中的端粒长度和转录组，系统评估了结直肠癌干细胞 | NA | 揭示结直肠癌干细胞的特征及其与肿瘤进展和药物抵抗的关系 | 结直肠癌干细胞及其在肿瘤中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | SMART-seq2, 10 × Genomics | NA | 转录组数据 | NA |
| 9824 | 2024-08-10 |
A fish with no sex: gonadal and adrenal functions partition between zebrafish NR5A1 co-orthologs
2021-02-09, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyaa030
PMID:33724412
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研究论文 | 本研究通过敲除斑马鱼中的nr5a1a和nr5a1b基因，探讨NR5A1同源基因在性腺和肾上腺功能中的祖先角色。 | 首次揭示了斑马鱼中nr5a1a和nr5a1b基因在性腺和肾上腺功能中的分工，以及这种分工对性发育差异的影响。 | 研究主要集中在斑马鱼模型上，可能需要进一步在其他物种中验证这些发现。 | 探索NR5A1同源基因在性腺和肾上腺功能中的祖先角色及其对性发育的影响。 | 斑马鱼的nr5a1a和nr5a1b基因及其在性腺和肾上腺中的功能。 | 遗传学 | NA | 单细胞RNA测序，RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括1天和2天龄的斑马鱼胚胎以及成年斑马鱼。 |
| 9825 | 2024-08-10 |
Lung transplantation for patients with severe COVID-19
2020-12-16, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abe4282
PMID:33257409
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研究论文 | 本文报告了三名患有难治性COVID-19相关呼吸衰竭患者的肺移植结果，并使用单分子荧光原位杂交（smFISH）检测了SARS-CoV-2 RNA，进行了细胞外基质成像和单细胞RNA测序。 | 首次使用smFISH技术检测移植肺组织中的SARS-CoV-2 RNA，并通过机器学习比较了晚期COVID-19患者与肺纤维化患者的单细胞RNA测序数据。 | 研究样本量较小，仅包括三名患者，且未讨论长期移植后的生存率和并发症。 | 探讨肺移植作为难治性COVID-19相关呼吸衰竭患者的一种潜在救命治疗方法的可行性和效果。 | 患有难治性COVID-19相关呼吸衰竭的患者及其移植后的肺组织。 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单分子荧光原位杂交（smFISH） | 机器学习 | RNA测序数据 | 三名接受肺移植的患者和两名因COVID-19相关肺炎死亡的患者 |
| 9826 | 2024-08-10 |
Expression of the SARS-CoV-2 ACE2 Receptor in the Human Airway Epithelium
2020-07-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202003-0541OC
PMID:32432483
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研究论文 | 研究SARS-CoV-2病毒受体ACE2在人类气道上皮细胞中的表达情况 | 首次详细分析了ACE2在不同类型气道上皮细胞中的表达模式，并探讨了吸烟对ACE2表达的影响 | 研究样本仅限于非吸烟者和吸烟者，未涵盖所有可能的人群 | 探究SARS-CoV-2病毒受体ACE2在人类气道上皮细胞中的表达及其对病毒感染的影响 | 人类气道上皮细胞中的ACE2表达 | NA | COVID-19 | 微阵列分析，RNA测序，10x单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 包括非吸烟者和吸烟者的气管、大气道和小气道上皮细胞样本 |
| 9827 | 2024-08-09 |
Single-cell and spatial omics: exploring hypothalamic heterogeneity
2025-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00231
PMID:38993130
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综述 | 本文综述了单细胞和空间组学技术在探索下丘脑细胞类型复杂分子遗传多样性中的应用价值 | 单细胞和空间组学技术的发展克服了早期技术挑战，提供了理解下丘脑复杂时空转录多样性和细胞类型特征的机会 | 单细胞/单核RNA测序需要从组织中分离细胞/核，可能导致神经网络空间信息的丢失 | 阐明下丘脑中复杂的动态细胞组织，以理解其在协调基本身体功能中的作用 | 下丘脑的细胞类型和神经网络的复杂组织 | NA | NA | 单细胞和空间组学技术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 9828 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing in diabetic kidney disease: a literature review
2024-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2024.2387428
PMID:39099183
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在糖尿病肾病研究中的应用 | 探讨了scRNA-seq技术在揭示糖尿病肾病发病机制和分子机制方面的作用 | NA | 阐明糖尿病肾病的发病机制并识别新的治疗靶点 | 糖尿病肾病中的多种细胞类型和非肾脏因素 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA |
| 9829 | 2024-08-09 |
New insights gained from cellular landscape changes in myocarditis and inflammatory cardiomyopathy
2024-Sep, Heart failure reviews
IF:4.5Q1
DOI:10.1007/s10741-024-10406-w
PMID:38896377
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研究论文 | 本文综述了心肌炎和炎症性心肌病（ICM）的最新研究，特别是通过单细胞RNA测序揭示的细胞景观变化 | 利用多组学技术，特别是单细胞RNA测序，深入理解心肌炎/ICM过程中的细胞景观变化 | NA | 提供心肌炎/ICM最新研究的全面概述 | 心肌炎和炎症性心肌病 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 9830 | 2024-08-09 |
Identification of the CD8 + T-cell Related Signature for Predicting the Prognosis of Gastric Cancer Based on Integrated Analysis of Bulk and Single-cell RNA Sequencing Data
2024-Sep-01, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997)
DOI:10.1097/CJI.0000000000000528
PMID:38809517
|
研究论文 | 本研究通过整合批量和单细胞RNA测序数据，识别与胃癌预后相关的CD8+ T细胞相关特征 | 首次探索了CD8+ T细胞在胃癌中的作用，并构建了一个新的风险模型 | NA | 旨在识别与胃癌预后相关的CD8+ T细胞相关特征，并指导免疫治疗决策 | 胃癌患者的CD8+ T细胞相关基因特征 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序 | 风险模型 | 基因表达数据 | 896个CD8+ T细胞差异基因 |
| 9831 | 2024-08-09 |
Cancer-associated fibroblasts: a versatile mediator in tumor progression, metastasis, and targeted therapy
2024-Sep, Cancer metastasis reviews
DOI:10.1007/s10555-024-10186-7
PMID:38602594
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research paper | 本文探讨了肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）在肿瘤进展、转移和靶向治疗中的作用 | 本文通过单细胞RNA测序技术识别了CAFs的多种表型，包括已知的肌成纤维细胞CAFs（myCAFs）和炎症性CAFs（iCAFs）以及新发现的亚型如抗原呈递CAFs（apCAFs） | NA | 研究CAFs在肿瘤发生、癌症干细胞性、血管生成、免疫抑制、代谢和转移中的多重功能，并探讨针对肿瘤微环境的靶向治疗 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs）及其在肿瘤微环境中的作用 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 9832 | 2024-08-09 |
SIRV: spatial inference of RNA velocity at the single-cell resolution
2024-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae100
PMID:39108639
|
research paper | 本文介绍了一种名为SIRV的方法，通过结合空间转录组学数据和参考单细胞RNA测序数据中的剪接和未剪接mRNA表达，实现单细胞分辨率下的空间RNA速度推断 | SIRV方法能够揭示仅通过单细胞RNA测序数据无法识别的空间分化模式，并成功应用于小鼠器官发生数据和鸡心脏发育数据 | 空间RNA速度的估计受限于无法在高分辨率空间转录组学中空间捕获剪接和未剪接的mRNA分子 | 研究组织中细胞分化动力学的空间背景 | 小鼠大脑发育中的中脑-后脑边界细胞和皮质边缘及间脑细胞的分化轨迹 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组学数据 | 小鼠大脑、鸡心脏和人类骨肉瘤细胞的数据 |
| 9833 | 2024-08-09 |
Cisplatin resistance-related transcriptome and methylome integration identifies PCDHB4 as a novel prognostic biomarker in small cell lung cancer
2024-Aug-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110413
PMID:39108724
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研究论文 | 本研究通过整合小细胞肺癌的转录组和甲基化组数据，发现PCDHB4作为新的预后生物标志物与顺铂化疗耐药相关 | 首次发现PCDHB4在顺铂耐药的小细胞肺癌中的表达与患者生存率相关，并通过单细胞RNA测序进一步验证了其在肿瘤干细胞特性和上皮-间质转化中的作用 | NA | 探索小细胞肺癌中与顺铂化疗耐药相关的新的预后生物标志物 | 小细胞肺癌患者及顺铂化疗耐药机制 | 数字病理学 | 小细胞肺癌 | RNA测序, 甲基化测序 | Cox回归模型 | 转录组数据, 甲基化数据 | NA |
| 9834 | 2024-08-09 |
Sensitive Multiplexed MicroRNA Spatial Profiling and Data Classification Framework Applied to Murine Breast Tumors
2024-08-06, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c01773
PMID:39044395
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研究论文 | 本文介绍了一种高灵敏度的方法，用于同时定量和空间检测固定在石蜡中的组织切片上的七种微小RNA（miRNA），并展示了该方法在鼠乳腺癌中的应用。 | 本文采用滚动循环扩增（RCA）与双扫描方法结合，在纳升孔阵列中嵌入水凝胶柱，实现了对miRNA的高灵敏度空间检测，具有广泛的动态范围和低检测限。 | NA | 开发一种高灵敏度的方法，用于空间检测和定量miRNA，以提高从样本中获取的信息量。 | 微小RNA（miRNA）在鼠乳腺癌中的空间表达。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 滚动循环扩增（RCA） | NA | 图像 | 固定在石蜡中的组织切片 |
| 9835 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing in tuberculosis: Application and future perspectives
2024-Aug-06, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003095
PMID:39111829
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在结核病（TB）研究中的应用及其未来展望 | 强调了scRNA-seq在结核病临床生物标志物探索、宿主导向治疗和精准治疗研究中的潜力 | 讨论了scRNA-seq在结核病相关研究广泛应用中需要克服的瓶颈 | 探讨scRNA-seq在结核病研究中的应用及其未来发展方向 | 结核病及其免疫反应机制 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 大量单个细胞 |
| 9836 | 2024-08-09 |
scPriorGraph: constructing biosemantic cell-cell graphs with prior gene set selection for cell type identification from scRNA-seq data
2024-Aug-05, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03357-w
PMID:39103856
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scPriorGraph的双通道图神经网络，用于整合多层次基因生物语义，以提高单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的准确性 | scPriorGraph通过构建生物语义细胞-细胞图并结合先验基因集选择，有效利用了基因间的生物学意义关系，从而提高了细胞类型识别的准确性 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 图神经网络 | 基因表达数据 | NA |
| 9837 | 2024-08-09 |
Machine learning-based biomarker screening for acute myeloid leukemia prognosis and therapy from diverse cell-death patterns
2024-08-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-68755-3
PMID:39090256
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研究论文 | 本文利用13种程序性细胞死亡途径和73种机器学习组合，开发了一种预测急性髓系白血病（AML）临床结果和药物反应的6基因指数（PPCDI） | 开发了一种新的6基因指数（PPCDI），该指数通过综合分析多种程序性细胞死亡途径，显示出预测AML患者临床预后和药物敏感性表型的潜力 | NA | 开发一种新的生物标志物，用于预测急性髓系白血病的临床预后和药物反应 | 急性髓系白血病患者 | 机器学习 | 白血病 | RNA测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 使用了来自TCGA-AML、Tyner和GSE37642-GPL96队列的bulk RNA测序和单细胞RNA测序转录组数据以及匹配的临床病理信息 |
| 9838 | 2024-08-09 |
Metastasis-associated fibroblasts in peritoneal surface malignancies
2024-Aug, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02717-4
PMID:38783165
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研究论文 | 本文探讨了腹膜表面恶性肿瘤（PSMs）中与转移相关的成纤维细胞（MAFs）的作用及其异质性 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了免疫调节性癌相关成纤维细胞（iCAFs）在PSMs中的普遍性，并探讨了其他主要亚型如肌成纤维细胞样CAFs（myCAFs）和基质CAFs（mCAFs）的分布 | NA | 旨在理解腹膜MAFs与肿瘤细胞间的复杂相互作用，以开发针对性和局部治疗策略，改善PSMs患者的治疗效果 | 腹膜表面恶性肿瘤中的转移相关成纤维细胞及其亚型 | NA | 腹膜表面恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 9839 | 2024-08-09 |
Dynamic intrauterine crosstalk promotes porcine embryo implantation during early pregnancy
2024-Aug, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-023-2557-x
PMID:38748354
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研究论文 | 本文全面分析了猪胚胎植入期胚胎和相应母体子宫内膜的单细胞转录组，识别了胚胎中的四种不同谱系和子宫内膜中的13种细胞类型，并开发了一种新工具ExtraCellTalk来生成母胎交叉对话的动态图谱。 | 本文开发了新工具ExtraCellTalk，并识别了跨物种保守的RBP4/STRA6通路，为胚胎植入过程中的母胎交叉对话提供了新的见解。 | NA | 研究胚胎植入过程中胚胎与母体的动态交叉对话。 | 猪胚胎植入期胚胎和母体子宫内膜的细胞类型及其基因表达。 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 猪胚胎植入期胚胎和相应母体子宫内膜的细胞样本 |
| 9840 | 2024-08-09 |
Spock2 Functions as a Key Time-Series Gene of Endothelial Cells in Sepsis-Induced Cardiomyopathy
2024-Aug-01, Journal of cardiovascular pharmacology
IF:2.6Q2
DOI:10.1097/FJC.0000000000001577
PMID:39115722
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研究论文 | 本研究旨在探讨脓毒症诱导的心肌病的发病机制，通过分析不同时间点的转录组数据和单细胞测序数据，鉴定了与时间序列相关的差异表达基因，并验证了SPOCK2在脓毒症心肌病中的保护作用 | 通过加权基因共表达网络分析、时间序列分析和差异表达分析，结合单细胞测序数据，鉴定了特定于内皮细胞的差异表达基因 | NA | 探讨脓毒症诱导的心肌病的发病机制 | 内皮细胞在脓毒症诱导的心肌病中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 使用GSE171546数据分析了不同时间点的转录组数据，GSE207363数据用于单细胞测序分析 |