单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27897 篇文献，本页显示第 9821 - 9840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9821 | 2024-08-31 |
Multimodal Single-Cell Analyses Outline the Immune Microenvironment and Therapeutic Effectors of Interstitial Cystitis/Bladder Pain Syndrome
2022-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202106063
PMID:35470584
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和图像质谱细胞仪技术，系统地描述了间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征患者的膀胱微环境，并揭示了其治疗效应器 | 首次通过多模态单细胞分析技术，详细阐述了间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征患者的膀胱微环境特征，并识别了关键的炎症介质 | NA | 揭示间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征的病理发生机制及其治疗效应器 | 间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征患者的膀胱微环境 | 数字病理学 | 泌尿系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和图像质谱细胞仪（IMC） | NA | 生物样本 | 来自间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征患者的膀胱活检样本，共识别出42个不同的细胞集群 |
| 9822 | 2024-08-31 |
Universal Surface Biotinylation: a simple, versatile and cost-effective sample multiplexing method for single-cell RNA-seq analysis
2022-May-27, DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes
IF:3.9Q1
DOI:10.1093/dnares/dsac017
PMID:35652718
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Universal Surface Biotinylation (USB)的新型通用标记技术，用于单细胞RNA测序分析中的样本多重化 | USB技术不依赖于特定的细胞表面蛋白，通过引入生物素到任何细胞表面蛋白的氨基团中，实现了对多种细胞类型的良好标记 | NA | 开发一种新的样本多重化技术，以降低实验成本并提高实验准确性 | 多种细胞类型的单细胞RNA测序分析 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 数千至数万个细胞 |
| 9823 | 2024-08-31 |
Oo-site: A dashboard to visualize gene expression during Drosophila oogenesis suggests meiotic entry is regulated post-transcriptionally
2022-05-15, Biology open
IF:1.8Q3
DOI:10.1242/bio.059286
PMID:35579517
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研究论文 | 开发了一个名为Oo-site的工具，用于可视化果蝇卵巢中不同阶段生殖细胞分化的批量RNA测序、单细胞RNA测序和翻译效率数据 | Oo-site工具使得非生物信息学专家也能访问和理解这些数据，并发现了一些有丝分裂基因的翻译调控 | NA | 探索干细胞分化控制的机制，并开发工具以更好地可视化和理解相关数据 | 果蝇卵巢中的生殖细胞和体细胞干细胞及其分化后代 | 生物信息学 | NA | RNA测序, 单细胞RNA测序, 翻译效率测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 9824 | 2024-08-31 |
The biology of time: dynamic responses of cell types to developmental, circadian and environmental cues
2022-02, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.15589
PMID:34797944
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综述 | 本文综述了植物细胞类型对发育、昼夜和环境信号的动态响应，并探讨了单细胞测序和时间生物信息学算法在这些响应中的应用 | 利用单细胞测序和时间生物信息学算法揭示了植物细胞和组织中基于时间的响应动态 | NA | 探讨植物细胞类型对不同时间尺度信号的响应机制 | 植物细胞类型及其对发育、昼夜和环境信号的响应 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 9825 | 2024-08-31 |
Transcriptome Analysis and Single-Cell Sequencing Analysis Constructed the Ubiquitination-Related Signature in Glioma and Identified USP4 as a Novel Biomarker
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.915709
PMID:35774799
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研究论文 | 本研究通过转录组分析和单细胞测序分析构建了胶质瘤中的泛素化相关特征，并鉴定了USP4作为新的生物标志物。 | 首次构建了胶质瘤中的泛素化相关特征，并发现了USP4作为潜在的胶质瘤生物标志物。 | 研究主要基于TCGA数据库的数据，需要进一步的临床验证和实验支持。 | 探讨泛素化基因在胶质瘤中的作用，并寻找新的胶质瘤生物标志物。 | 胶质瘤患者的泛素化基因及其在肿瘤微环境中的作用。 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | TCGA数据库中的胶质瘤患者数据，分为训练组和验证组。 |
| 9826 | 2024-08-31 |
Somatic variant calling from single-cell DNA sequencing data
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.06.013
PMID:35782734
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综述 | 本文综述了单细胞DNA测序数据中体细胞变异识别的当前方法 | NA | NA | 帮助用户根据自身数据选择合适的工具 | 单细胞DNA测序数据中的体细胞变异识别方法 | 测序技术 | NA | 单细胞DNA测序 | NA | DNA测序数据 | NA |
| 9827 | 2024-08-31 |
Intestinal strictures in Crohn's disease: a 2021 update
2022, Therapeutic advances in gastroenterology
IF:3.9Q1
DOI:10.1177/17562848221104951
PMID:35757383
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综述 | 本文综述了2021年关于克罗恩病（CD）肠道狭窄的最新进展，重点讨论了纤维化机制、诊断和治疗的新技术 | 介绍了单细胞测序、多组学和人工智能等新技术在肠道狭窄研究中的应用 | 目前尚无特定的抗纤维化治疗方法，且肠道纤维化的评估方法不够可靠 | 旨在提供关于纤维化的及时信息，并为改善肠道狭窄的诊断、治疗和预后奠定基础 | 克罗恩病患者的肠道狭窄 | NA | 克罗恩病 | 单细胞测序、多组学、人工智能 | NA | NA | NA |
| 9828 | 2024-08-31 |
Emerging artificial intelligence applications in Spatial Transcriptomics analysis
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.05.056
PMID:35765645
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综述 | 本文综述了当前用于空间转录组学分析的人工智能方法 | 介绍了利用机器学习和深度学习技术处理空间转录组学数据分析的新型计算方法 | NA | 综述空间转录组学分析中的人工智能应用 | 空间转录组学数据分析 | 机器学习 | NA | 机器学习, 深度学习 | NA | 转录组数据 | NA |
| 9829 | 2024-08-31 |
Detection of infiltrating fibroblasts by single-cell transcriptomics in human kidney allografts
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0267704
PMID:35657798
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析人肾移植活检样本，以揭示不同的细胞类型和状态，并深入了解同种异体免疫损伤的复杂异质性 | 通过单细胞转录组学技术，首次揭示了肾移植后不同时间点纤维化与非纤维化组织中成纤维细胞的来源差异，以及这些细胞在移植后免疫反应中的作用 | 研究未涉及T细胞介导的排斥反应 | 探索单细胞RNA测序技术在人肾移植活检中的应用，以揭示细胞类型和状态，并为移植受者的个性化护理提供新机制见解 | 来自三个个体的肾皮质活检样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 7217个高质量的单细胞转录组 |
| 9830 | 2024-08-31 |
Computational methods for the integrative analysis of single-cell data
2021-01-18, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa042
PMID:32363378
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研究论文 | 本文描述了用于单细胞基因组数据整合分析的计算方法，重点在于单细胞RNA测序数据集的整合以及来自单个细胞的多模态信号的联合分析 | 本文介绍了处理单细胞基因组数据的新计算方法，这些方法能够解决数据在实验、技术和生物学上的内在异质性问题 | NA | 旨在解决生物系统的全面复杂性问题，通过整合来自不同分子层和多种细胞群体的基因组数据 | 单细胞基因组数据，特别是单细胞RNA测序数据和多模态信号 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 9831 | 2024-08-31 |
Doublet identification in single-cell sequencing data using scDblFinder
2021, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.73600.2
PMID:35814628
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research paper | 本文介绍了一种基于Bioconductor的快速、灵活且准确的单细胞测序数据双胞体检测方法scDblFinder | scDblFinder在复杂数据集中能准确识别大多数异型双胞体，并已被独立基准测试证明优于其他方法 | NA | 开发一种新的双胞体检测方法以避免单细胞测序数据中的伪发现 | 单细胞RNA和可及性测序数据中的双胞体 | digital pathology | NA | single-cell sequencing | NA | single-cell RNA and accessibility sequencing data | NA |
| 9832 | 2024-08-30 |
Exploring the molecular mechanisms of asthma across multiple datasets
2024-12, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2023.2258926
PMID:38489401
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研究论文 | 本研究通过分析212名个体的基因表达数据，包括哮喘患者和健康对照，识别出267个差异表达基因，并利用多种生物信息学工具探索这些基因在哮喘发病机制中的潜在作用。 | 本研究揭示了哮喘的新遗传方面，并强调了综合生物信息学在解码复杂疾病模式中的力量。 | 这些发现需要进一步验证，C1orf64和C7orf26在哮喘中的确切作用有待进一步研究以验证其治疗潜力。 | 探索哮喘的分子机制，发现新的分子靶点和全面理解其发病机制。 | 哮喘患者和健康对照的基因表达数据。 | NA | 哮喘 | 差异基因表达分析、通路富集、药物靶点预测和单细胞分析 | NA | 基因表达数据 | 212名个体 |
| 9833 | 2024-08-30 |
The Novel-B-Cell-Related Gene Signature Predicts the Prognosis and Immune Status of Patients with Esophageal Carcinoma
2024-Sep, Journal of gastrointestinal cancer
IF:1.6Q4
DOI:10.1007/s12029-024-01083-x
PMID:38963643
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组数据分析，开发了一种新的B细胞相关基因签名（BRGrisk），用于预测食管癌患者的预后和免疫状态 | 首次开发了B细胞相关基因签名（BRGrisk），用于食管癌患者的预后分层和个性化治疗策略的指导 | NA | 研究B细胞在食管癌中的预后意义及其在肿瘤微环境中的作用 | 食管癌患者的预后和免疫状态 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞转录组分析 | LASSO回归分析 | 基因数据 | 来自癌症基因组图谱队列的患者被分为训练队列和测试队列 |
| 9834 | 2024-08-30 |
l-Theanine Alleviates Ulcerative Colitis by Regulating Colon Immunity via the Gut Microbiota in an MHC-II-Dependent Manner
2024-Aug-28, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c04379
PMID:39197065
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研究论文 | 本研究探讨了l-茶氨酸通过调节肠道微生物群和肠道免疫来减轻溃疡性结肠炎的机制 | 首次揭示了l-茶氨酸通过调节肠道微生物群和MHC-II依赖的方式影响肠道免疫，从而减轻溃疡性结肠炎 | 研究仅在动物模型中进行，需要进一步的人体试验验证 | 探索l-茶氨酸减轻溃疡性结肠炎的机制 | 溃疡性结肠炎小鼠模型 | NA | 溃疡性结肠炎 | 单细胞测序, 流式细胞术 | NA | 微生物群数据 | 溃疡性结肠炎小鼠 |
| 9835 | 2024-08-30 |
Accurate long-read transcript discovery and quantification at single-cell, pseudo-bulk and bulk resolution with Isosceles
2024-Aug-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51584-3
PMID:39183289
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研究论文 | 介绍了一种名为Isosceles的计算工具包，用于在单细胞、伪批量和批量分辨率级别上提高mRNA异构体的检测灵敏度和定量准确性 | Isosceles在异构体检测灵敏度和定量准确性方面优于其他方法 | NA | 提高单细胞转录组在异构体水平的定量忠实度，并实现灵活的下游分析 | mRNA异构体的准确检测和定量 | 生物信息学 | NA | 纳米孔长读长测序 | NA | 测序数据 | 使用合成和生物学衍生的数据集进行验证 |
| 9836 | 2024-08-30 |
Biomarkers associated with immune-related adverse events induced by immune checkpoint inhibitors
2024-Aug-24, World journal of clinical oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.5306/wjco.v15.i8.1002
PMID:39193157
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综述 | 本文综述了与免疫检查点抑制剂引起的免疫相关不良事件相关的生物标志物 | 探讨了机器学习、单细胞RNA测序、多组学分析和肠道微生物组分析等创新方法在识别新型生物标志物中的应用 | NA | 旨在寻找能够准确预测或诊断免疫相关不良事件的可靠生物标志物 | 免疫检查点抑制剂引起的免疫相关不良事件的生物标志物 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序、多组学分析 | 机器学习 | NA | NA |
| 9837 | 2024-08-30 |
The neocortical infrastructure for language involves region-specific patterns of laminar gene expression
2024-Aug-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2401687121
PMID:39133845
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术分析了人死后皮质组织样本中语言网络核心区域的基因表达，发现特定区域的层特异性基因表达模式与语言网络有关 | 首次揭示了语言网络中特定区域的层特异性基因表达模式，并发现这些模式与个体间结构连接变异及特定脑相关疾病有关 | NA | 探讨人类大脑语言网络的分子和细胞特征 | 人类大脑皮质组织中语言网络核心区域的基因表达 | 神经科学 | 阅读障碍，精神分裂症 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 大量死后皮质组织样本 |
| 9838 | 2024-08-30 |
Airway epithelial cell response to RSV is mostly impaired in goblet and multiciliated cells in asthma
2024-Aug-19, Thorax
IF:9.0Q1
DOI:10.1136/thorax-2023-220230
PMID:38373824
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研究论文 | 研究哮喘患者气道上皮细胞对RSV感染的转录反应 | 首次详细探讨了哮喘患者气道上皮细胞中杯状细胞和多纤毛细胞对RSV感染的反应差异 | 样本量较小，且未涵盖所有可能的细胞类型 | 探讨哮喘患者气道上皮细胞对RSV感染的转录反应及其分子机制 | 哮喘患者和健康捐赠者的原代支气管上皮细胞 | NA | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 哮喘患者8例，健康捐赠者8例 |
| 9839 | 2024-08-30 |
Human enteric nervous system progenitor transplantation improves functional responses in Hirschsprung disease patient-derived tissue
2024-Aug-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-331532
PMID:38816188
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研究论文 | 本文研究了通过移植人源肠神经系统前体细胞来改善Hirschsprung病患者的肠道功能 | 首次展示了人多能干细胞衍生的肠神经系统前体细胞能够重新填充并增加Hirschsprung病患者结肠组织的功能反应 | NA | 探索Hirschsprung病的替代治疗方案 | 人源肠神经系统前体细胞在Hirschsprung病患者肠道组织中的功能影响 | NA | Hirschsprung病 | 单细胞RNA测序、蛋白质表达分析、钙成像 | NA | 组织样本 | NA |
| 9840 | 2024-08-30 |
Comprehensive single-cell analysis deciphered microenvironmental dynamics and immune regulator olfactomedin 4 in pathogenesis of gallbladder cancer
2024-Aug-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-331773
PMID:38719336
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了胆囊癌的微环境动态和免疫调节因子olfactomedin 4的作用 | 首次揭示了胆囊癌中免疫微环境的改变，并发现了olfactomedin 4在胆囊癌进展中的关键作用 | NA | 阐明胆囊癌及其良性疾病的复杂生态系统和分子特征，以促进癌症预防和优化治疗干预 | 胆囊癌、胆囊炎、胆囊息肉、胆囊腺瘤及邻近正常组织 | 数字病理学 | 胆囊癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 细胞 | 230,737个细胞来自15个胆囊癌样本、4个胆囊炎样本、3个胆囊息肉、5个胆囊腺瘤和16个邻近正常组织 |