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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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9801 | 2025-10-07 |
The Tabula Sapiens: A multiple-organ, single-cell transcriptomic atlas of humans
2022-05-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abl4896
PMID:35549404
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研究论文 | 构建了一个包含24种人类组织器官、近50万个细胞的单细胞转录组图谱 | 首次使用同一供体的多个组织器官创建单细胞转录组图谱,能够分析T细胞在不同组织间的克隆分布、B细胞的组织特异性突变率以及共享细胞类型在不同组织中的细胞周期状态 | NA | 创建人类多器官单细胞转录组参考图谱,研究细胞类型在不同组织中的分布和基因表达差异 | 人类24种不同组织和器官的细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 近500,000个细胞,来自24种不同组织器官,多数来自同一供体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9802 | 2025-10-07 |
Integrated bioinformatics analysis to develop diagnostic models for malignant transformation of chronic proliferative diseases
2025-Jun, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000226
PMID:40201199
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析开发慢性增殖性疾病恶性转化的诊断模型 | 首次识别PV和AML之间的共享基因并构建诊断列线图,为AML相关PV的诊断提供新途径 | 慢性疾病转化特性使纵向高通量测序研究复杂化 | 开发慢性增殖性疾病恶性转化的诊断模型,解决早期检测和干预的挑战 | 真性红细胞增多症(PV)和急性髓系白血病(AML)患者 | 生物信息学 | 血液系统恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序, 分子对接, 机器学习算法 | 机器学习, 列线图 | 基因表达数据, 临床样本 | 公共数据集和临床标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9803 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomics Identifies a Prominent Role for the MIF-CD74 Axis in Myasthenia Gravis Thymus
2025-May, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000200384
PMID:40117520
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示MIF-CD74轴在重症肌无力胸腺中的关键作用 | 首次构建EOMG患者胸腺淋巴细胞的单细胞转录谱,发现B细胞通过MIF-CD74轴获得生存信号的新机制 | 样本量较小(11例患者),仅针对未接受免疫治疗的患者 | 探究早发型AChR抗体阳性重症肌无力的胸腺增生机制 | 11例未接受免疫治疗的EOMG患者的胸腺组织 | 单细胞组学 | 重症肌无力 | 单细胞RNA测序, 多重组织染色, ELISA | NA | 单细胞转录组数据, 组织图像, 蛋白浓度数据 | 11例EOMG患者胸腺样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9804 | 2025-10-07 |
Regulatory T Cell Infiltration-Driven Single-Cell Transcriptomic Analysis Identifies SAP18 as a Prognostic Marker for Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2025-Apr-10, Journal of gastrointestinal cancer
IF:1.6Q4
DOI:10.1007/s12029-025-01174-3
PMID:40208395
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组数据构建预后模型,鉴定SAP18作为食管鳞状细胞癌的预后标志物 | 首次整合单细胞转录组数据构建Tregs相关预后模型,并发现SAP18在ESCC中的关键作用 | 研究样本量有限,需要更大规模临床验证 | 开发食管鳞状细胞癌的预后模型并识别关键生物标志物 | 食管鳞状细胞癌患者临床标本和细胞系 | 单细胞转录组学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, Western blot, 免疫组化, 体外功能实验 | 预后预测模型 | 转录组数据, 单细胞数据, 临床数据 | 临床标本和细胞系(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
9805 | 2025-10-07 |
Comprehensive bioinformatics analysis identified HMGB3 as a promising immunotherapy target for glioblastoma multiforme
2025-Apr-07, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02235-6
PMID:40192954
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研究论文 | 通过生物信息学分析鉴定HMGB3作为胶质母细胞瘤免疫治疗的潜在靶点 | 首次通过单细胞RNA测序和批量RNA-seq综合分析HMGB3在GBM中的异质性和免疫抑制作用 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证 | 探索GBM发展机制并寻找相关预后生物标志物 | 胶质母细胞瘤组织和肿瘤微环境 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA-seq, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA-seq | NA | NA |
9806 | 2025-10-07 |
Integrating multi-omics data reveals the antitumor role and clinical benefits of gamma-delta T cells in triple-negative breast cancer
2025-Apr-07, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14029-8
PMID:40197136
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据揭示了γδ T细胞在三阴性乳腺癌中的抗肿瘤作用及临床价值 | 首次系统整合单细胞测序、影像组学和基因组学数据,揭示γδ T细胞在三阴性乳腺癌中的特异性抗肿瘤机制和临床预后价值 | 研究结果主要基于三阴性乳腺癌,在其他乳腺癌亚型中的适用性有限 | 探究γδ T细胞在乳腺癌中的作用机制和临床意义 | 乳腺癌患者,特别是三阴性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 基因组分析, 免疫组化, 影像组学 | 影像组学模型 | 基因组数据, 转录组数据, 影像数据, 病理图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 基因组分析, 免疫组化, 影像组学 | NA | NA |
9807 | 2025-10-07 |
CXCL12/CXCR4 axis mediates CD8 + T cell overactivation in the progression of viral myocarditis
2025-Apr-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06394-6
PMID:40186195
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示CXCL12/CXCR4轴在病毒性心肌炎中驱动CD8+T细胞过度活化的新机制 | 首次发现CXCL12/CXCR4轴介导CD8+T细胞在暴发性心肌炎中的过度活化作用 | 研究主要聚焦于儿科患者和小鼠模型,需要在更广泛人群中验证 | 探究病毒性心肌炎中免疫细胞异常活化的分子机制 | 儿科暴发性心肌炎患者外周血单个核细胞和CVB3诱导的病毒性心肌炎小鼠模型 | 单细胞基因组学 | 心肌炎 | 单细胞RNA测序 | 小鼠疾病模型 | 单细胞转录组数据 | 儿科患者急性期和恢复期外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9808 | 2025-10-07 |
NAALAD2 mutations disrupt the fate of photoreceptor cells and retinal pigment epithelial cells during early retinal development
2025-Apr-02, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2025.107724
PMID:40185296
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研究论文 | 本研究通过发现NAALAD2基因新突变并利用点突变敲入小鼠模型,揭示了该突变通过影响光感受器细胞和视网膜色素上皮细胞的命运导致病理性近视的机制 | 首次报道人类NAALAD2基因突变与病理性近视的关联,并通过单细胞RNA测序揭示了该突变对视网膜细胞组成和转录谱的影响 | 研究基于单个中国家族的突变发现,样本规模有限,需要更大样本验证 | 探究NAALAD2突变在病理性近视发病机制中的作用 | NAALAD2点突变敲入小鼠模型,特别是视锥细胞、视杆细胞和视网膜色素上皮细胞 | 单细胞组学 | 病理性近视 | 单细胞RNA测序 | 点突变敲入小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 一个中国家族和对应的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9809 | 2025-10-07 |
S100A8/A9 innate immune signaling as a distinct mechanism driving progression of smoking-related breast cancers
2025-Apr, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03276-5
PMID:39856330
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研究论文 | 本研究揭示了吸烟通过S100A8/A9先天免疫信号通路促进乳腺癌进展的新机制 | 首次发现α7 nAChR-S100A8/A9-Syntaphilin免疫信号模块驱动尼古丁诱导的肿瘤进展,并识别出吸烟相关乳腺癌作为侵袭性乳腺癌的独特亚型 | NA | 探索吸烟促进乳腺癌进展的分子机制 | 乳腺癌细胞、吸烟相关的乳腺癌患者样本 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9810 | 2025-10-07 |
Macrophages protect against sensory axon loss in peripheral neuropathy
2025-Apr, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08535-1
PMID:39939762
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研究论文 | 本研究揭示肥胖前期小鼠中巨噬细胞通过galectin 3延缓外周神经病变中感觉轴突变性的保护机制 | 首次发现肥胖诱导的外周神经病变中浸润性巨噬细胞具有神经保护作用,而非传统认知的促炎损伤作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类患者中验证;观察时间窗口为6个月,长期效应未知 | 探究炎症反应在外周神经病变发病机制中的作用 | 高脂高果糖饮食诱导的肥胖前期小鼠模型 | 神经科学 | 糖尿病外周神经病变 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9811 | 2025-10-07 |
MiR-146a engineered extracellular vesicles derived from mesenchymal stromal cells more potently attenuate ischaemia-reperfusion injury in lung transplantation
2025-Apr, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70298
PMID:40195092
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研究论文 | 本研究探讨了通过雾化递送miR-146a工程化人脐带间充质干细胞胞外囊泡在大鼠肺移植模型中减轻缺血再灌注损伤的效果 | 首次将miR-146a工程化的hucMSC-EVs通过雾化方式递送至肺移植模型,并证明其通过IRAK1/TRAF6/NF-κB通路抑制NLRP3炎症小体激活的机制 | 研究仅使用大鼠模型,尚未在人体中进行验证 | 开发减轻肺移植中缺血再灌注损伤的新治疗策略 | 大鼠肺移植模型和细胞冷保存再灌注模型 | 生物医学工程 | 肺移植相关疾病 | bulk-RNA测序, 单细胞测序分析, 免疫荧光, Western blot | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
9812 | 2025-10-07 |
Propionate alleviates diabetes-induced cardiac fibrosis in mice via regulating Serpinf1
2025-Mar-25, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151641
PMID:40203653
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研究论文 | 本研究探讨丙酸盐通过调控Serpinf1基因改善糖尿病小鼠心脏纤维化的治疗效果及机制 | 首次发现丙酸盐通过上调Serpinf1基因抑制Wnt信号通路异常激活,从而改善糖尿病心脏纤维化 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类临床验证 | 研究丙酸盐对糖尿病心脏纤维化的治疗作用及分子机制 | 链脲佐菌素诱导的糖尿病小鼠模型和原代小鼠心脏成纤维细胞 | 心血管疾病研究 | 糖尿病心肌病 | 单细胞RNA测序,shRNA敲低实验,组织学分析,生化检测 | 动物疾病模型 | 基因表达数据,组织学图像,生化指标 | 糖尿病小鼠模型及原代细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9813 | 2025-10-07 |
Epigenomic subtypes of late-onset Alzheimer's disease reveal distinct microglial signatures
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.15.643144
PMID:40166175
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研究论文 | 通过分析死后脑组织DNA甲基化数据识别晚发性阿尔茨海默病的两种表观基因组亚型 | 首次在全基因组尺度识别晚发性阿尔茨海默病的表观遗传亚型,并揭示其与特定小胶质细胞状态的关联 | 研究基于死后脑组织样本,无法反映疾病早期阶段的表观遗传变化 | 探索晚发性阿尔茨海默病的表观遗传异质性及其分子机制 | 831例死后脑组织样本(来自三个独立队列) | 表观基因组学 | 阿尔茨海默病 | DNA甲基化分析,单细胞RNA测序,批量RNA测序 | 无监督聚类 | 表观基因组数据,转录组数据 | 831例死后脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq,DNA甲基化分析 | NA | NA |
9814 | 2025-10-07 |
Astrocyte heterogeneity reveals region-specific astrogenesis in the white matter
2025-Mar, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-01878-6
PMID:39994409
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学比较灰质和白质星形胶质细胞的异质性 | 揭示了白质星形胶质细胞具有区域特异性的分子特征,发现胼胝体白质中存在持续的星形胶质细胞生成 | 研究仅针对小鼠前脑和小脑,人类样本验证有限 | 探究白质和灰质星形胶质细胞的分子差异及区域特异性 | 小鼠前脑灰质、白质/胼胝体和小脑白质区域的星形胶质细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 小鼠前脑和小脑星形胶质细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
9815 | 2025-10-07 |
A Krüppel-like factor establishes cellular heterogeneity during schistosome tegumental maintenance
2025-Mar, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013002
PMID:40153400
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和RNA干扰技术揭示了KLF4转录因子在血吸虫皮层细胞异质性建立中的关键作用 | 首次发现KLF4转录因子对血吸虫皮层相关谱系(TRL)的维持至关重要,并证明其调控皮层细胞亚群的分子身份 | 研究仅聚焦于KLF4因子,其他可能参与皮层细胞特化的分子程序尚未完全阐明 | 探究血吸虫皮层细胞特化的分子调控机制 | 曼氏血吸虫及其皮层细胞 | 分子生物学 | 血吸虫病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, RNA干扰 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
9816 | 2025-10-07 |
Modulation of cell fate by shock wave therapy in ischaemic heart disease
2025-Mar, European heart journal open
DOI:10.1093/ehjopen/oeaf011
PMID:40201592
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研究论文 | 研究冲击波疗法通过激活TLR3受体促进心脏成纤维细胞向内皮细胞转分化,改善缺血性心肌病的心功能 | 首次揭示冲击波疗法通过机械刺激激活TLR3信号通路,诱导染色质重塑和成纤维细胞转分化为内皮细胞的机制 | 研究主要基于细胞和小鼠模型,尚未在大型动物或临床人群中验证 | 探索冲击波疗法改善缺血性心肌病心功能的分子机制 | 人心脏成纤维细胞和Fsp1-Cre/LacZ转基因小鼠模型 | 心血管疾病研究 | 缺血性心脏病 | 单细胞RNA测序,ATAC-seq,Western blot,谱系追踪 | NA | 基因表达数据,染色质可及性数据,蛋白质数据 | 人心脏成纤维细胞和转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,ATAC-seq | NA | NA |
9817 | 2025-10-07 |
Gene function revealed at the moment of stochastic gene silencing
2025-01-19, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07530-0
PMID:39828795
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研究论文 | 提出一种利用单细胞随机基因沉默方法推断基因功能的新技术 | 开发了scSGS方法,利用单细胞基因表达的自然变异性来推断基因功能,避免了传统基因敲除研究中的存活偏差 | NA | 开发一种新的基因功能预测方法 | 基因功能与调控关系 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9818 | 2025-10-07 |
The Role of Zuo Jin Wan in Modulating the Tumor Microenvironment of Colorectal Cancer
2025, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
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研究论文 | 研究左金丸通过调节结直肠癌肿瘤微环境中多种细胞类型发挥免疫调节作用 | 首次在单细胞水平揭示左金丸对结直肠癌肿瘤微环境的全面调节作用,发现其可下调TIMP1和MTDH基因表达 | 研究主要基于数据库分析和体外验证,缺乏体内实验和临床数据支持 | 探索左金丸在结直肠癌免疫调节中的作用机制 | 结直肠癌肿瘤微环境中的恶性细胞、免疫细胞和基质细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 通路富集分析 | NA | 基因表达数据 | 基于已发表研究的单细胞RNA测序数据(PMID: 32451460, 32103181, 32561858) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9819 | 2025-10-07 |
Novel insights into Cntnap4 in Alzheimer's disease: Intestinal flora interaction
2025-Jan, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.138508
PMID:39647729
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研究论文 | 本研究探讨Cntnap4基因在阿尔茨海默病中的作用及其与肠道菌群的相互作用 | 首次揭示Cntnap4缺陷通过影响肠道菌群组成加剧AD病理,并证明GABA补充可改善认知障碍 | 研究主要基于动物模型,人类临床相关性需进一步验证 | 阐明Cntnap4基因在阿尔茨海默病发病机制中的作用及其与肠道菌群的关联 | 阿尔茨海默病模型小鼠 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,高通量转录组测序,16s rRNA测序,动物实验 | 动物模型 | 基因表达数据,微生物组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq, 16s rRNA sequencing | NA | NA |
9820 | 2025-10-07 |
Glucocorticoid receptor inhibits Th2 immune responses by down-regulating Pparg and Gata3 in schistosomiasis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1518586
PMID:40196108
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研究论文 | 本研究探讨糖皮质激素受体通过下调Pparg和Gata3抑制血吸虫病中Th2免疫应答的机制 | 首次整合RNA测序和单细胞测序揭示GR激活通过下调关键转录因子Gata3和Pparg抑制Th2免疫应答 | 需要进一步研究靶向GR激活治疗血吸虫病的可行性和安全性 | 研究GR激活对血吸虫病中肝脏Th2免疫应答的影响 | 日本血吸虫感染小鼠和Th2细胞 | 免疫学 | 血吸虫病 | RNA测序,单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 血吸虫感染小鼠模型和体外Th2细胞 | NA | 单细胞测序,RNA测序 | NA | NA |