单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 9781 - 9800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9781 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptome reveals the region-specific genes and pathways regulated by Satb2 in neocortical development
2024-Aug-02, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10672-w
PMID:39095712
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和免疫染色技术，系统研究了Satb2基因在不同新皮质区域发育中的区域特异性基因调控。 | 首次全面描绘了Satb2基因在新皮质发育中的空间调控途径，并揭示了其在不同区域的具体调控基因和通路。 | 研究主要集中在胚胎阶段的Satb2+/+和Satb2-/-小鼠，未涉及成年阶段或其他相关基因的影响。 | 探究Satb2基因在新皮质发育中的区域特异性基因调控及其相关通路。 | Satb2+/+和Satb2-/-小鼠的新皮质区域，包括室管膜区（VZ）、室下区（SVZ）、中间区（IZ）和皮质板（CP）。 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 空间转录组学，免疫染色 | NA | 转录组数据 | Satb2+/+和Satb2-/-小鼠的胚胎阶段样本 |
| 9782 | 2024-08-08 |
Genome-wide CRISPR screening identifies tyrosylprotein sulfotransferase-2 as a target for augmenting anti-PD1 efficacy
2024-Aug-02, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02068-x
PMID:39095793
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研究论文 | 本文通过全基因组CRISPR筛选，发现酪氨酰蛋白磺基转移酶-2（TPST2）是增强抗PD1疗效的潜在靶点 | 首次揭示了TPST2在癌症免疫中的抑制作用，并提出其作为免疫检查点疗法治疗靶点的可能性 | NA | 探索影响抗PD1反应性的肿瘤细胞内在因素，并评估TPST2在癌症免疫中的具体作用 | TPST2在癌症免疫中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | NA | NA | CRISPR筛选，共免疫沉淀，质谱分析，RNA测序 | NA | 基因组数据，蛋白质数据，RNA数据 | 在人源化小鼠中进行实验，使用同基因小鼠肿瘤模型进行验证 |
| 9783 | 2024-08-08 |
Bioengineered human colon organoids with in vivo-like cellular complexity and function
2024-Aug-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.05.007
PMID:38876106
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研究论文 | 本文介绍了一种新型的人类结肠类器官模型——“迷你结肠”，通过结合类器官和芯片上的器官技术，实现了与体内组织高度相似的细胞复杂性和功能 | 采用非对称刺激与生长因子结合的方法，显著增强了组织寿命，并模拟了体内细胞类型的多样性和排列 | NA | 开发一种能够精确模拟人体肠道生理和病理的先进类器官模型 | 人类结肠类器官及其在肠道生理和病理研究中的应用 | 生物工程 | NA | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 细胞 | NA |
| 9784 | 2024-08-08 |
Lipid Deficiency Contributes to Impaired Alveolar Progenitor Cell Function in Aging and Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2024-Aug, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0290OC
PMID:38657143
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研究论文 | 本研究评估了脂质代谢在特发性肺纤维化（IPF）患者和健康捐赠者肺泡II型细胞（AEC2s）中的作用，并探讨了脂质补充和PPARγ激活对AEC2s干细胞更新能力的影响。 | 首次揭示了IPF和老年小鼠肺泡II型细胞中脂质代谢的缺陷，并证明了脂质补充和PPARγ激活可以促进AEC2s的干细胞更新能力。 | 研究主要集中在细胞和动物模型上，尚未在临床试验中验证脂质补充和PPARγ激活的治疗效果。 | 探讨脂质代谢在特发性肺纤维化和衰老中的作用，并寻找可能的治疗策略。 | 特发性肺纤维化患者和健康捐赠者的肺泡II型细胞，以及老年和年轻小鼠的肺泡II型细胞。 | NA | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色，流式细胞术 | NA | 基因表达数据，细胞脂质含量数据 | 包括IPF患者和健康捐赠者的肺泡II型细胞，以及老年和年轻小鼠的肺泡II型细胞。 |
| 9785 | 2024-08-08 |
scHD4E: Novel ensemble learning-based differential expression analysis method for single-cell RNA-sequencing data
2024-Aug, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108769
PMID:38897145
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研究论文 | 本文提出了一种基于集成学习的单细胞RNA测序数据差异表达分析方法scHD4E | scHD4E方法通过选择表现最佳的四种独立分析方法进行集成，相较于单一方法和现有的scDEA方法，在准确性和稳定性上表现更优 | NA | 旨在提出一种新的基于集成学习的差异表达分析方法scHD4E | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | 集成学习 | 数据集 | 使用了五个实验数据集和一个模拟数据集进行评估 |
| 9786 | 2024-08-08 |
Integrating single-cell transcriptomics and machine learning to predict breast cancer prognosis: A study based on natural killer cell-related genes
2024-Aug, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18549
PMID:39098994
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组数据与机器学习方法，利用自然杀伤细胞相关基因（NKRGs）建立了一个预测乳腺癌预后的模型 | 本研究首次利用NKRGs结合机器学习算法，开发了一种新的乳腺癌风险评估和个性化治疗模型 | NA | 建立一个基于自然杀伤细胞相关基因的预测乳腺癌预后的模型 | 自然杀伤细胞相关基因在乳腺癌预后中的作用 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞转录组 | Lasso + RSF | 转录组数据 | 44个显著表达的NKRGs，9个关键NKRGs |
| 9787 | 2024-08-07 |
Lung Single-Cell Transcriptomics in Alpha-1 Antitrypsin Deficiency
2024-Aug, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0064LE
PMID:39087828
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9788 | 2024-08-08 |
Identifying MSMO1, ELOVL6, AACS, and CERS2 related to lipid metabolism as biomarkers of Parkinson's disease
2024-07-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-68585-3
PMID:39080336
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研究论文 | 本研究通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）和机器学习方法，识别与脂质代谢相关的帕金森病生物标志物。 | 首次将MSMO1, ELOVL6, AACS, 和CERS2作为与脂质代谢相关的帕金森病生物标志物进行研究。 | NA | 旨在识别与脂质代谢相关的帕金森病生物标志物。 | 帕金森病患者中的脂质代谢相关基因。 | 生物信息学 | 帕金森病 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）, 单细胞RNA测序（scRNA-seq）, qRT-PCR | 反向传播神经网络 | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 9789 | 2024-08-08 |
Sustained generation of neurons destined for neocortex with oxidative metabolic upregulation upon filamin abrogation
2024-Jul-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110199
PMID:38989458
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研究论文 | 本文研究了在小鼠模型中通过抑制Flna和Flnb基因，成年V-SVZ区域是否能持续产生类似上层大脑皮层神经元的神经元 | 首次展示了成年V-SVZ区域通过上调氧化磷酸化、线粒体生物合成和血管丰富度，能够持续产生类似上层大脑皮层神经元的神经元 | NA | 探讨成年V-SVZ区域是否具有产生大脑皮层神经元的能力 | 小鼠模型中的V-SVZ区域 | 神经科学 | NA | 空间转录组学分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 9790 | 2024-08-08 |
Mechanical stress during confined migration causes aberrant mitoses and c-MYC amplification
2024-Jul-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2404551121
PMID:38990945
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研究论文 | 研究机械应力在限制性迁移过程中对肿瘤细胞基因组完整性的影响 | 发现机械应力在转移性迁移过程中通过c-MYC位点扩增促进基因毒性和致癌事件，并绕过检查点控制 | NA | 探究转移性间质迁移产生的机械应力是否导致肿瘤细胞染色体不稳定性的增强 | 转移性肿瘤细胞在限制性迁移过程中的行为 | 数字病理学 | 肿瘤 | scRNA-seq | NA | 图像 | NA |
| 9791 | 2024-08-08 |
Historic obstacles and emerging opportunities in the field of developmental metabolism - lessons from Heidelberg
2024-Jun-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202937
PMID:38912552
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研究论文 | 本文总结了2023年EMBO研讨会'发育代谢：能量、物质和信息的流动'中的关键讨论，强调了现代发育生物学的挑战与机遇 | 文章介绍了代谢组学、小分子传感器、单细胞RNA测序和计算模型等技术的进步，为探索细胞特异性和组织特异性代谢网络、器官间代谢交流以及基因与代谢物在时间和空间上的相互作用提供了新机会 | NA | 探讨发育代谢领域的新技术革命及其对生物学研究的影响 | 细胞特异性和组织特异性代谢网络、器官间代谢交流、基因与代谢物的相互作用 | 发育生物学 | NA | 代谢组学、小分子传感器、单细胞RNA测序、计算模型 | NA | NA | NA |
| 9792 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Illuminates Thymic Development: An Updated Framework for Understanding Thymic Epithelial Tumors
2024-Jun-03, The oncologist
DOI:10.1093/oncolo/oyae046
PMID:38520743
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综述 | 本文综述了通过单细胞测序技术对胸腺上皮肿瘤（TETs）的研究进展，探讨了胸腺发育和肿瘤形成的分子机制 | 利用单细胞分子 profiling 技术深入分析肿瘤细胞的分子特征，为胸腺上皮肿瘤的研究提供了新的视角 | 胸腺上皮肿瘤的罕见性限制了对肿瘤发生机制的深入研究和合理治疗方案的开发 | 探讨胸腺上皮肿瘤的生物学特性，加速开发针对这些罕见肿瘤的改进治疗策略 | 胸腺上皮肿瘤及其在胸腺发育和老化过程中的细胞多样性 | NA | 胸腺上皮肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 9793 | 2024-08-08 |
Identification of cell surface markers for acute myeloid leukemia prognosis based on multi-model analysis
2024-May-25, Journal of biomedical research
IF:2.2Q3
DOI:10.7555/JBR.38.20240065
PMID:38807380
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研究论文 | 本研究通过多模型分析构建了一个9个细胞表面标记物的预后模型，用于急性髓系白血病患者的危险分层 | 本研究首次利用多模型分析方法构建了一个包含9个细胞表面标记物的预后模型，并验证了其在独立数据集中的预测价值 | NA | 识别急性髓系白血病的预后生物标志物，并指导治疗 | 急性髓系白血病患者及其细胞表面标记物 | 生物信息学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归, 弹性网络, 自适应LASSO回归 | 基因表达数据 | 涉及三个独立数据集的急性髓系白血病患者 |
| 9794 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Shows T-Cell Exhaustion Landscape in the Peripheral Blood of Patients with Hepatitis B Virus-Associated Acute-on-Chronic Liver Failure
2024-05-15, Gut and liver
IF:3.4Q2
DOI:10.5009/gnl220449
PMID:37317515
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了乙型肝炎病毒相关急性慢性肝衰竭患者外周血中T细胞亚群的异质性和耗竭T淋巴细胞的特征 | 本研究首次通过单细胞RNA测序揭示了乙型肝炎病毒相关急性慢性肝衰竭患者外周血中T细胞的耗竭景观，并分析了耗竭T细胞的基因表达谱和发展轨迹 | 研究样本仅包括乙型肝炎病毒相关急性慢性肝衰竭患者和健康对照，未涉及其他疾病状态的患者 | 探索乙型肝炎病毒相关急性慢性肝衰竭患者外周血T细胞亚群的异质性和耗竭T淋巴细胞的特征，以识别免疫功能障碍的潜在治疗靶点 | 乙型肝炎病毒相关急性慢性肝衰竭患者和健康对照的外周血T细胞 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 83,577个T细胞 |
| 9795 | 2024-08-08 |
Spatial and single-cell colocalisation analysis reveals MDK-mediated immunosuppressive environment with regulatory T cells in colorectal carcinogenesis
2024-May, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105102
PMID:38614865
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞共定位分析，揭示了中肾因子（MDK）介导的免疫抑制环境与调节性T细胞（Tregs）在结直肠癌发生中的作用 | 首次在结直肠癌早期阶段通过空间分布的单细胞分析，识别出MDK作为肿瘤上皮细胞向Tregs发送的主要信号分子，并发现MDK与SDC4的相互作用与Treg共定位相关 | 研究样本量较小，仅包括五个早期结直肠癌病例和一个晚期病例 | 探究促进腺瘤向散发性结直肠癌进展的细胞间相互作用因子，并评估其在结直肠癌患者中的临床意义 | 结直肠癌的肿瘤微环境中的细胞间相互作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学，单细胞转录组 | 深度生成模型 | 单细胞数据 | 五个早期结直肠癌病例和一个晚期病例 |
| 9796 | 2024-08-08 |
Intratumoral CD38+CD19+B cells associate with poor clinical outcomes and immunosuppression in patients with pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-May, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105098
PMID:38608514
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探讨胰腺导管腺癌（PDAC）中B细胞的异质性，并发现CD38+ B细胞的存在与不良临床结果和免疫抑制相关。 | 首次揭示了PDAC中CD38+ B细胞的免疫调节功能及其作为独立预后因子的潜力。 | 研究样本量有限，且未涉及所有可能的B细胞亚型及其在不同肿瘤微环境中的作用。 | 旨在识别PDAC中B细胞的异质性，并探索其作为治疗策略的新靶点。 | 胰腺导管腺癌（PDAC）中的B细胞及其与临床结果的关系。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | FUSCC队列147例，TCGA队列176例 |
| 9797 | 2024-08-08 |
Single-cell clonal tracing of glandular and circulating T cells identifies a population of CD9+ CD8+ T cells in primary Sjogren's syndrome
2024-04-29, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiad071
PMID:37395700
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学和免疫组库测序，研究了原发性干燥综合征（pSS）患者的外分泌腺和外周血中的免疫细胞，发现了一群具有组织定居特性的CD8+ CD9+细胞。 | 本文首次详细描述了pSS患者受损外分泌腺的免疫细胞景观，并鉴定出一群新的CD8+ CD9+细胞，这些细胞在pSS患者的唾液腺中高度富集，并可能与皮肤血管炎病变中的组织定居记忆细胞有关。 | 本文仅提供了pSS患者外分泌腺和外周血中免疫细胞的初步图景，未涉及更广泛的系统性研究。 | 研究pSS患者外分泌腺和外周血中的免疫细胞，以了解其适应性免疫反应。 | 原发性干燥综合征患者的外分泌腺和外周血中的免疫细胞。 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 单细胞转录组学，免疫组库测序 | NA | 基因表达数据 | 外周血样本和唾液腺活检样本 |
| 9798 | 2024-08-08 |
Enhancing the efficacy of vaccinia-based oncolytic virotherapy by inhibiting CXCR2-mediated MDSC trafficking
2024-03-29, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiad150
PMID:38066571
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研究论文 | 研究通过抑制CXCR2介导的MDSC迁移，增强基于牛痘的溶瘤病毒疗法的疗效 | 首次证实CXCR2作为治疗靶点，通过特异性小分子抑制剂阻断PMN-MDSC迁移，增强溶瘤病毒疗法的抗肿瘤效果 | NA | 探索通过抑制CXCR2介导的MDSC迁移，提高溶瘤病毒疗法的抗肿瘤效果 | 牛痘病毒疗法在恶性间皮瘤模型中的应用及MDSC在肿瘤微环境中的作用 | NA | 恶性间皮瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 3个同基因癌症模型 |
| 9799 | 2024-08-08 |
Tumor-infiltrating γδ T cells as targets of immune checkpoint blockade in melanoma
2024-03-29, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae023
PMID:38324004
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研究论文 | 本研究分析了黑色素瘤中肿瘤浸润性γδ T细胞与免疫检查点受体之间的关联，旨在开发创新的联合免疫治疗策略。 | 研究揭示了γδ T细胞在黑色素瘤免疫反应中的潜在作用，并发现ICI治疗对不同γδ T细胞亚群的影响存在差异。 | NA | 探索γδ T细胞与免疫检查点受体在黑色素瘤中的相互作用，以开发新的治疗策略。 | γδ T细胞、免疫检查点受体、黑色素瘤。 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及黑色素瘤患者的临床样本 |
| 9800 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals recruitment of the M2-like CCL8high macrophages in Lewis lung carcinoma-bearing mice following hypofractionated radiotherapy
2024-03-25, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05118-6
PMID:38528587
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了在小鼠Lewis肺癌模型中，经过低分割放疗后，M2样CCL8高表达巨噬细胞的招募情况 | 首次揭示了低分割放疗通过上调免疫抑制基因，促进CCL8高表达巨噬细胞的浸润和重编程，从而形成免疫抑制的肿瘤微环境 | NA | 探究肿瘤相关巨噬细胞在放疗后的重编程机制及其对肿瘤微环境的影响 | 小鼠Lewis肺癌模型中的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |