单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 9781 - 9800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9781 | 2025-10-07 |
A comprehensive transcriptional profiling of developing gonads reveals the role of TGFβ signaling in female gonadal asymmetry in chickens
2025-Apr, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.104932
PMID:40014972
|
研究论文 | 通过转录组分析揭示TGFβ信号通路在雌鸡不对称性腺发育中的作用 | 首次结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq系统分析雌鸡胚胎期左右性腺的转录组差异，发现TGFβ信号通路调控细胞增殖导致性腺不对称发育 | 研究仅聚焦于鸡胚胎特定发育阶段，机制验证实验不足 | 阐明鸡雌性胚胎不对称性腺发育的分子机制 | 鸡胚胎期雌性左右性腺组织 | 发育生物学 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | RNA测序数据 | E5(HH26)、E6.5(HH30)、E8(HH34)、E9.5(HH36)四个发育阶段的雌鸡性腺样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9782 | 2025-10-07 |
Multi-omics joint analysis and identification of candidate genes for the rate of right ovarian degeneration in geese
2025-Apr, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.104966
PMID:40056778
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序构建鹅右侧卵巢退化的细胞图谱，并鉴定与退化速率相关的候选基因 | 首次构建鹅右侧卵巢退化的单细胞图谱，发现LHX9和ARID5B基因可能调控退化速率 | 右侧卵巢退化分子机制尚未完全阐明 | 探究鸟类右侧卵巢退化的分子机制和遗传因素 | 鹅的右侧卵巢组织 | 生物信息学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序,基因组测序,转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据,基因组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 9783 | 2025-10-07 |
Recursive Clustering of Cellular Diversity in scRNA-Seq Data
2025-Apr, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2024.0625
PMID:40151847
|
研究论文 | 本文提出了一种递归聚类方法用于单细胞RNA测序数据分析，通过逐层特征提取和聚类提高细胞类型检测能力 | 开发了递归聚类方法，通过在已识别簇上递归执行特征提取和聚类，使用更特异性特征区分高分辨率亚群 | NA | 探索改进单细胞RNA测序数据分析中细胞聚类的方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体 | 生物信息学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | 递归聚类算法 | 基因表达数据 | 四个单细胞RNA测序数据集，包括来自三种临床表型的克罗恩病患者数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9784 | 2025-10-07 |
Single-Cell Profiling and Proteomics-Based Insights Into mTORC1-Mediated Angio+TAMs Polarization in Recurrent IDH-Mutant Gliomas
2025-Apr, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70371
PMID:40202138
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了mTORC1通路和血管+TAMs在IDH突变胶质瘤复发进展中的关键作用 | 首次结合蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学和多维转录组学，在单细胞水平识别了具有mTORC1激活和血管生成特征的TAMs新亚群 | 研究样本量有限，主要依赖小鼠模型和公共数据库验证 | 探究mTORC1通路和肿瘤相关巨噬细胞在IDH突变胶质瘤复发进展中的机制 | IDH突变胶质瘤患者样本和小鼠胶质瘤模型 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞测序, 空间转录组学, 蛋白质组学, 磷酸化蛋白质组学, 多维转录组学 | GSVA, 去卷积分析, 伪时间分析, AddmodelScore | 转录组数据, 蛋白质组数据, 磷酸化蛋白质组数据, 空间转录组数据 | 匹配的IDH突变胶质瘤复发进展队列，包含多个胶质瘤相关数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 9785 | 2025-10-07 |
Bioinformatics Combined With Biological Experiments to Identify the Pathogenetic Link of Type 2 Diabetes for Breast Cancer
2025-Apr, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70759
PMID:40202151
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研究论文 | 通过生物信息学分析和生物学实验鉴定2型糖尿病与乳腺癌发病机制关联的关键分子 | 首次通过整合WGCNA、差异表达基因分析、机器学习与单细胞测序技术，系统性识别CCNB2、XRCC2和CENPI作为T2DM促进乳腺癌进展的关键介导分子 | 研究样本量有限，机制验证主要在细胞水平进行，缺乏动物模型验证 | 阐明2型糖尿病增加乳腺癌风险的分子机制 | 2型糖尿病和乳腺癌患者基因表达数据及乳腺癌细胞系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, WGCNA, 差异表达基因分析, 机器学习, CCK-8, 集落形成, 伤口愈合, Transwell实验, 免疫组织化学, 免疫荧光 | 机器学习 | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 实验数据 | T2DM数据集GSE25724和GSE20966，TCGA乳腺癌队列 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9786 | 2025-10-07 |
Cell-Type-Specific mRNA N6-Methyladenosine Landscape and Regulatory Mechanisms Underlying Immune Dysregulation of Sleep-Deprived
2025-Apr, Journal of pineal research
IF:8.3Q1
DOI:10.1111/jpi.70046
PMID:40214141
|
研究论文 | 本研究通过RNA测序和单细胞转录组数据揭示了睡眠剥夺患者外周血中m6A修饰的细胞类型特异性景观及其在免疫失调中的调控机制 | 首次在单细胞水平揭示睡眠剥夺患者外周血中m6A调节因子的细胞类型特异性表达模式，发现ALKBH5在T细胞、B细胞和NK细胞中的特异性上调 | 样本量有限，机制研究主要基于细胞系实验，需要进一步在体验证 | 阐明睡眠剥夺导致免疫失调的表观遗传调控机制 | 睡眠剥夺患者的外周血单核细胞(PBMC)及SH-SY5Y、HT22细胞系 | 表观遗传学 | 睡眠障碍 | RNA测序, 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据, 单细胞数据 | 睡眠剥夺患者外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9787 | 2025-10-07 |
Prognostic and Immunotherapeutic Value of Regulatory T Cell Marker Gene Signature in Melanoma
2025-Mar-10, Iranian journal of allergy, asthma, and immunology
DOI:10.18502/ijaai.v24i2.18150
PMID:40211502
|
研究论文 | 本研究通过分析黑色素瘤中调节性T细胞相关基因特征，开发了一个预后模型并评估其在免疫治疗中的价值 | 首次构建了包含CHD3、FOSB、SEMA4D、PSME1、FYN、PRKACB和ARID5A的Treg相关基因特征(TRGS)，并证明其作为独立预后指标的价值 | 研究依赖于公共数据库数据，缺乏前瞻性临床验证 | 阐明调节性T细胞相关基因在黑色素瘤抗肿瘤免疫反应中的作用 | 黑色素瘤患者样本和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、Cox回归分析、LASSO回归 | 预后风险评分模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 从GEO和TCGA数据库获取的黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9788 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics of melanoma sentinel lymph nodes identifies immune cell signatures associated with metastasis
2025-Mar-06, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.183080
PMID:40048259
|
研究论文 | 通过单细胞转录组技术分析黑色素瘤前哨淋巴结中的免疫细胞特征及其与转移的关系 | 首次使用单细胞转录组测序技术系统描绘黑色素瘤前哨淋巴结中T细胞、B细胞和髓系细胞亚型的转录程序，并发现基于细胞类型比例的“高活化”特征评分可预测免疫治疗反应 | 研究样本量相对有限（97,777个细胞），且为观察性研究，需要进一步功能验证 | 解析黑色素瘤前哨淋巴结中免疫浸润的动态变化及其临床意义 | 黑色素瘤患者的前哨淋巴结组织细胞 | 单细胞组学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组测序，细胞索引转录组和表位测序技术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 97,777个细胞，来自I/II期和III期皮肤黑色素瘤患者的前哨淋巴结组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 细胞索引转录组和表位测序技术 |
| 9789 | 2025-10-07 |
Mechanosensitive ion channel-related genes in hepatocellular carcinoma: Unraveling prognostic genes and their roles in drug resistance and immune modulation
2025-Mar, Liver research (Beijing, China)
DOI:10.1016/j.livres.2025.01.002
PMID:40206431
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研究论文 | 本研究探讨机械敏感性离子通道相关基因在肝细胞癌中的预后价值及其在耐药性和免疫调节中的作用 | 首次系统分析机械敏感性离子通道相关基因在肝细胞癌中的表达特征，发现PIEZO1基因与索拉非尼耐药性相关 | 需要在更大患者队列中验证研究结果，并进一步在临床前模型中探索靶向PIEZO1的功能意义 | 研究机械敏感性离子通道相关基因在肝细胞癌中的预后价值及其在免疫调节和耐药性中的作用 | 肝细胞癌患者数据及肝癌细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 深度学习神经网络分析, 基因敲低实验, 细胞活力检测, 细胞凋亡检测 | 深度学习神经网络 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 癌症基因组图谱数据库中的肝细胞癌患者数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9790 | 2025-10-07 |
Spatial single-cell proteomics landscape decodes the tumor microenvironmental ecosystem of intrahepatic cholangiocarcinoma
2025-Feb-25, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001283
PMID:39999448
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研究论文 | 本研究通过空间多组学技术解析肝内胆管癌肿瘤微环境的生态系统特征 | 首次构建肝内胆管癌空间单细胞蛋白质组学图谱，开发空间肿瘤微环境深度学习系统进行预后预测 | 部分样本量较小（如空间转录组学仅4例），需进一步验证 | 解析肝内胆管癌空间肿瘤微环境特征及其与预后和免疫治疗的关系 | 肝内胆管癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 成像质谱流式,空间蛋白质组学,空间转录组学,多重免疫荧光,单细胞RNA测序,批量RNA测序,批量蛋白质组学 | 深度学习 | 空间多组学数据,图像,序列数据 | 总计超过106万个细胞，包括155例内部成像质谱流式/空间蛋白质组学样本，4例空间转录组学，20例多重免疫荧光，43例单细胞RNA测序（9内部+34公共），244例公共批量RNA测序，324例蛋白质组学（110内部+214公共） | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,空间蛋白质组学,批量RNA测序,批量蛋白质组学 | NA | NA |
| 9791 | 2025-10-07 |
Atypical memory B cells acquire Breg phenotypes in hepatocellular carcinoma
2025-Feb-25, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.187025
PMID:39998891
|
研究论文 | 本研究整合单细胞转录组和B细胞受体测序技术，揭示了肝细胞癌中非典型记忆B细胞获得调节性B细胞表型的新机制 | 首次发现肝细胞癌中非典型记忆B细胞获得调节性B细胞表型，并证实肿瘤细胞可赋予外周血B细胞免疫抑制功能 | 未明确说明样本数量和研究人群特征 | 探究肿瘤微环境对肿瘤浸润B淋巴细胞发育和功能的影响 | 肝细胞癌患者的肿瘤浸润B细胞和外周血B细胞 | 单细胞生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序, B细胞受体测序 | 轨迹分析, 基因调控网络分析 | 单细胞RNA测序数据, BCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, BCR测序 | NA | NA |
| 9792 | 2025-10-07 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Delineate the Microstructure and Immune Landscape of Intrahepatic Cholangiocarcinoma in the Leading-Edge Area
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202412740
PMID:39716897
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组技术揭示了肝内胆管癌前沿区域的微结构特征和免疫景观 | 首次系统描绘了肝内胆管癌前沿区域肿瘤细胞与免疫微环境的相互作用，发现了由MAIT细胞、SPP1+巨噬细胞、POSTN+ CAFs和内皮细胞组成的独特'三元结构' | 样本量较小（仅9例患者），需要更大规模研究验证发现 | 探究肝内胆管癌前沿区域的肿瘤细胞特征及其与免疫微环境的相互作用 | 9例肝内胆管癌患者的肿瘤核心区、癌旁组织和前沿区域组织 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 9例肝内胆管癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9793 | 2025-10-07 |
Detecting gene expression in Caenorhabditis elegans
2025-Jan-08, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyae167
PMID:39693264
|
综述 | 本文概述了线虫基因表达检测方法及其应用 | 系统整合了从原位检测到单细胞测序等多种基因表达技术在线虫研究中的应用 | NA | 为研究基因表达与细胞表型关联提供方法学指导 | 秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans) | NA | NA | 原位转录本检测、蛋白质检测、bulk RNA测序、单细胞RNA测序、高通量蛋白质组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 9794 | 2025-10-07 |
Integrating single-cell sequencing and clinical insights to explore malignant transformation in odontogenic keratocyst
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.03.027
PMID:40206344
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研究论文 | 通过单细胞测序和临床数据整合探索牙源性角化囊肿恶性转化的分子机制 | 首次在单细胞水平揭示COKC特异性上皮亚群及其干细胞特性和侵袭潜力，发现成纤维细胞和巨噬细胞表型转化在癌变中的作用 | 样本量较小（仅3例COKC样本），恶性转化病例罕见导致研究受限 | 探索牙源性角化囊肿恶性转化的细胞异质性和分子机制 | 牙源性角化囊肿（OKC）和癌变牙源性角化囊肿（COKC）患者组织样本 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例COKC样本+公共OKC数据集，共22,509个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9795 | 2025-10-07 |
Integrating multi-omics and machine learning methods reveals the metabolism of amino acids and derivatives-related signature in colorectal cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1565090
PMID:40206583
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法，揭示了氨基酸及其衍生物代谢在结直肠癌中的关键作用 | 首次整合批量转录组和单细胞转录组数据，结合多种机器学习方法构建MAAD相关预后模型，并实验验证LSM8基因的功能 | 研究样本量有限，需要更大规模的数据验证模型的普适性 | 探索氨基酸及其衍生物代谢在结直肠癌进展中的作用，识别潜在治疗靶点 | 结直肠癌患者数据和结直肠癌细胞系 | 机器学习 | 结直肠癌 | 转录组测序，单细胞转录组测序，基因敲低实验 | 机器学习预后模型 | 转录组数据，单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9796 | 2025-10-07 |
Identification of FDFT1 and PGRMC1 as New Biomarkers in Nonalcoholic Steatohepatitis (NASH)-Related Hepatocellular Carcinoma by Deep Learning
2025, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S505752
PMID:40206734
|
研究论文 | 本研究通过深度学习技术识别出FDFT1和PGRMC1作为非酒精性脂肪性肝炎相关肝细胞癌的新型生物标志物 | 首次结合深度学习、WGCNA和PPI网络分析筛选NASH相关HCC的特征基因，并发现FDFT1和PGRMC1在胆固醇代谢通路中的关键作用 | 研究主要基于生物信息学分析和动物模型验证，尚未进行大规模临床样本验证 | 探索NASH相关肝细胞癌的新型生物标志物 | 非酒精性脂肪性肝病小鼠模型和NASH相关肝细胞癌的基因表达数据 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 深度学习,实时定量PCR,单细胞测序分析,WGCNA,蛋白质相互作用网络分析 | 神经网络 | 基因组数据,基因表达数据 | NAFLD小鼠模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 9797 | 2025-10-07 |
Neutrophils in Rheumatoid Arthritis Synovium: Implications on Disease Activity and Inflammation State
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S503144
PMID:40206809
|
研究论文 | 通过分析类风湿关节炎患者滑膜组织中的中性粒细胞分布，探讨其与疾病活动度和炎症状态的关系 | 首次结合组织病理学和单细胞RNA测序技术，系统揭示滑膜中性粒细胞在特定RA亚型中的临床意义 | 回顾性研究设计，样本量有限（55例患者），缺乏外部验证队列 | 研究中性粒细胞在类风湿关节炎滑膜组织中的分布特征及其临床意义 | 55例类风湿关节炎患者的滑膜组织和临床数据 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | H&E染色, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 基因表达数据 | 55例RA患者滑膜组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9798 | 2025-10-07 |
Prognostic and immunotherapeutic potential of disulfidptosis-associated signature in pancreatic cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1568976
PMID:40207217
|
研究论文 | 本研究构建了一个基于二硫化物死亡相关基因的胰腺癌预后特征，并评估其在免疫治疗预测中的潜力 | 首次在胰腺导管腺癌中系统研究二硫化物死亡的作用，构建了8基因预后特征，并揭示了其与肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞的相互作用机制 | 研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证；样本量相对有限 | 阐明二硫化物死亡在胰腺导管腺癌中的临床意义和免疫治疗预测价值 | 胰腺导管腺癌患者 | 生物信息学 | 胰腺癌 | RNA测序，单细胞RNA测序，空间转录组，微阵列分析 | LASSO-Cox回归模型 | 转录组数据，单细胞数据，空间转录组数据 | 20对PDAC样本和癌旁正常组织，多个外部PDAC队列 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9799 | 2025-10-07 |
CD14+ monocytes: the immune communication hub in early vasculitis symptoms of Kawasaki disease
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1557231
PMID:40207219
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了川崎病血管炎早期免疫细胞通讯的动态变化，发现CD14+单核细胞在细胞间通讯中发挥核心作用 | 首次利用单细胞测序技术系统揭示川崎病病程中免疫细胞通讯网络，识别出CD14+单核细胞作为通讯枢纽的关键作用及SELPLG、ITK等重要信号基因 | 样本量较小（仅7例患儿），需要在更大队列中验证发现 | 研究川崎病病程中免疫细胞通讯的变化并识别潜在生物标志物 | 川崎病患儿外周血单个核细胞 | 单细胞生物学 | 川崎病 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 7例川崎病患儿 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9800 | 2025-10-07 |
Integrating machine learning and multi-omics analysis to reveal nucleotide metabolism-related immune genes and their functional validation in ischemic stroke
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1561544
PMID:40207230
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研究论文 | 本研究整合机器学习与多组学分析，揭示了与缺血性卒中相关的核苷酸代谢免疫基因及其功能验证 | 首次系统整合机器学习算法（LASSO回归、SVM-RFE、随机森林）与多组学数据（单细胞RNA测序、分子对接）来识别核苷酸代谢相关的免疫基因，并通过体内实验进行功能验证 | 研究依赖于公共数据库的基因表达数据，样本来源和数量可能存在限制；体内实验验证的规模有限 | 识别与缺血性卒中相关的核苷酸代谢基因，探索其在疾病机制中的作用，为诊断和治疗提供新策略 | 缺血性卒中患者基因表达数据和小鼠模型 | 机器学习 | 缺血性卒中 | 单细胞RNA测序，分子对接，差异表达分析，加权基因共表达网络分析 | LASSO回归，SVM-RFE，随机森林 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的缺血性卒中基因表达数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |