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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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9781 | 2025-10-07 |
Lipid metabolism analysis reveals that DGAT1 regulates Th17 survival by controlling lipid peroxidation in uveitis
2025-Apr-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.184072
PMID:40197365
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现DGAT1通过调控脂质过氧化过程影响Th17细胞存活,为葡萄膜炎治疗提供新靶点 | 首次揭示DGAT1在葡萄膜炎中通过调控脂肪酸代谢和脂质过氧化影响Th17细胞存活的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,临床验证样本有限 | 阐明脂质代谢在葡萄膜炎发病机制中的作用,特别是对Th17细胞存活的影响 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠的颈引流淋巴结细胞、VKH病患者CD4+ T细胞 | 单细胞生物学 | 葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | EAU小鼠模型和VKH病患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9782 | 2025-10-07 |
Unique and shared transcriptomic signatures underlying localized scleroderma pathogenesis identified using interpretable machine learning
2025-Apr-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.185758
PMID:40197368
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析和可解释机器学习方法,揭示局限性硬皮病的分子机制 | 首次在成人和儿童局限性硬皮病患者中应用可解释的潜在因子分析机器学习框架SLIDE,识别细胞类型特异性决定因素和共享信号机制 | NA | 探究局限性硬皮病的发病机制和炎症驱动的纤维化过程 | 成人和儿童局限性硬皮病患者及健康对照 | 机器学习 | 局限性硬皮病 | 单细胞RNA测序 | SLIDE(潜在因子回归框架) | 单细胞转录组数据 | 成人和儿童局限性硬皮病患者及健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9783 | 2025-10-07 |
Identification of DNA damage and repair gene-related markers in pancreatic ductal adenocarcinoma by single-cell and bulk RNA sequencing
2025-Apr-08, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02293-w
PMID:40198431
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研究论文 | 通过单细胞和批量RNA测序识别胰腺导管腺癌中DNA损伤修复相关基因标志物并构建预后风险模型 | 创新性地整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据构建DNA损伤修复相关预后模型 | NA | 研究DNA损伤反应在胰腺导管腺癌发展中的作用并开发预后评估工具 | 胰腺导管腺癌患者 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | LASSO回归,单变量Cox回归 | 基因表达数据 | 来自GEO、TCGA和GTEx数据库的样本 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
9784 | 2025-10-07 |
Acinar cells modulate the tumor microenvironment through the promotion of M1 macrophage polarization via macrophage endocytosis in pancreatic cancer
2025-Apr-08, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02244-5
PMID:40198509
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研究论文 | 本研究揭示了胰腺腺泡细胞通过促进巨噬细胞M1极化调节胰腺癌肿瘤微环境的新机制 | 首次发现PRSS1和CTRB1作为腺泡细胞标志基因,通过巨噬细胞内吞作用促进M1极化,从而抑制肿瘤恶性表型 | 研究主要基于生物信息学分析和细胞系实验,缺乏体内动物模型验证 | 探索胰腺癌中与M1巨噬细胞相关的关键基因及其调控机制 | 胰腺导管腺癌患者样本、肿瘤细胞系、免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞测序、免疫组化、细胞培养、生物信息学分析 | WGCNA、PPI网络分析、生存分析 | 基因表达数据、单细胞测序数据、临床数据 | TCGA-PAAD队列和ICGC-PACA队列患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
9785 | 2025-10-07 |
LRP8-dependent cholesterol metabolism modulates mTORC1 signaling and apoptotic pathways in multiple myeloma
2025-Apr-08, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07625-w
PMID:40199866
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研究论文 | 本研究揭示了LRP8通过调节多发性骨髓瘤细胞胆固醇代谢影响mTORC1信号通路和细胞凋亡的机制 | 首次发现LRP8作为多发性骨髓瘤胆固醇代谢的关键调控因子,并阐明其通过mTORC1通路和自噬影响细胞凋亡的新机制 | 研究主要基于临床数据分析和动物模型验证,缺乏更大规模的前瞻性临床研究验证 | 探究多发性骨髓瘤中胆固醇代谢异常的分子机制及其对疾病进展的影响 | 多发性骨髓瘤细胞和703例新诊断多发性骨髓瘤患者 | 肿瘤代谢研究 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,转录组分析,小鼠异种移植肿瘤模型 | 动物疾病模型 | 临床数据,转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 703例新诊断多发性骨髓瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9786 | 2025-10-07 |
Single-nucleus and spatial transcriptomics identify brain landscape of gene regulatory networks associated with behavioral maturation in honeybees
2025-Apr-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58614-8
PMID:40199930
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学技术,探索蜜蜂从护理到觅食行为成熟过程中大脑基因调控网络的细胞类型和空间异质性 | 首次整合单核RNA测序和空间转录组学数据,揭示了蜜蜂行为转变过程中特定基因调控网络(如stripe调节子)在特定脑细胞类型中的空间激活模式 | 研究主要聚焦于蜜蜂模型,结果在其他物种中的普适性需要进一步验证;人工控制年龄的群体设置可能无法完全反映自然状态下的行为转变 | 探索大脑基因调控网络与行为成熟之间的关联机制 | 蜜蜂大脑细胞,特别是与空间学习和导航相关的Keyon细胞 | 空间转录组学 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
9787 | 2025-10-07 |
α-Lipoic acid alleviate myocardial infarction by suppressing age-independent macrophage senescence
2025-Apr-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-92328-7
PMID:40199978
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研究论文 | 本研究探讨了α-硫辛酸通过抑制年龄无关的巨噬细胞衰老来缓解心肌梗死的机制 | 发现心肌梗死中存在年龄无关的巨噬细胞衰老倾向,并阐明α-硫辛酸通过调节SIRT1/Nrf2通路减轻巨噬细胞衰老的新机制 | NA | 研究α-硫辛酸对心肌梗死中巨噬细胞衰老的调控作用及机制 | 巨噬细胞、心肌细胞、动物模型 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,qPCR,western blot,免疫荧光,共培养实验 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,图像数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
9788 | 2025-10-07 |
Combining multi-omics analysis with machine learning to uncover novel molecular subtypes, prognostic markers, and insights into immunotherapy for melanoma
2025-Apr-07, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14012-3
PMID:40200221
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和机器学习技术识别黑色素瘤的分子亚型并开发预后预测模型 | 首次结合多组学分析和机器学习识别黑色素瘤三种分子亚型,开发基于标记基因的机器学习驱动特征(MLDS)用于预后预测,并验证关键基因AGPAT2的致癌作用 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库的回顾性数据,需要进一步的前瞻性临床验证 | 提高黑色素瘤预后诊断准确性并开发新的治疗策略 | 黑色素瘤患者和细胞系 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 多组学分析,机器学习,单细胞测序,siRNA敲低,细胞功能实验,皮下肿瘤形成实验 | 机器学习驱动特征(MLDS) | 转录组数据,RNA表达谱,甲基化微阵列数据,基因突变数据,临床信息 | TCGA-SKCM和GEO队列数据 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
9789 | 2025-10-07 |
Embracing diversity: macrophage complexity in cancer
2025-Apr, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2024.12.002
PMID:39753470
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综述 | 本文综述了肿瘤相关巨噬细胞(TAM)的多样性,整合单细胞表型和复杂生理信号探讨其在肿瘤中的复杂性 | 从单细胞表型和生理信号整合角度系统探讨TAM多样性,强调肿瘤微环境中巨噬细胞的复杂性 | 缺乏能够完全整合TAM复杂性的模型 | 探讨肿瘤相关巨噬细胞的多样性和功能特性 | 肿瘤相关巨噬细胞(TAM) | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
9790 | 2025-10-07 |
Clustering Mycobacterium tuberculosis-specific CD154+CD4+ T cells for distinguishing tuberculosis disease from infection based on single-cell RNA-seq analysis
2025-Apr, The Journal of infection
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.jinf.2025.106449
PMID:40010539
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析结核分枝杆菌特异性CD154+CD4+ T细胞的聚类特征,用于区分活动性结核病与潜伏性结核感染 | 首次在单细胞水平描绘MTB特异性CD154+CD4+ T细胞从潜伏感染到活动性疾病的发育轨迹和转录特征,并建立随机森林模型实现准确区分 | 患者异质性可能影响CD154区分疾病与感染的能力 | 开发区分活动性结核病与潜伏性结核感染的诊断方法 | 结核分枝杆菌特异性CD154+CD4+ T细胞 | 单细胞测序分析 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9791 | 2025-10-07 |
A comprehensive transcriptional profiling of developing gonads reveals the role of TGFβ signaling in female gonadal asymmetry in chickens
2025-Apr, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.104932
PMID:40014972
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研究论文 | 通过转录组分析揭示TGFβ信号通路在雌鸡不对称性腺发育中的作用 | 首次结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq系统分析雌鸡胚胎期左右性腺的转录组差异,发现TGFβ信号通路调控细胞增殖导致性腺不对称发育 | 研究仅聚焦于鸡胚胎特定发育阶段,机制验证实验不足 | 阐明鸡雌性胚胎不对称性腺发育的分子机制 | 鸡胚胎期雌性左右性腺组织 | 发育生物学 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | RNA测序数据 | E5(HH26)、E6.5(HH30)、E8(HH34)、E9.5(HH36)四个发育阶段的雌鸡性腺样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
9792 | 2025-10-07 |
Multi-omics joint analysis and identification of candidate genes for the rate of right ovarian degeneration in geese
2025-Apr, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.104966
PMID:40056778
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序构建鹅右侧卵巢退化的细胞图谱,并鉴定与退化速率相关的候选基因 | 首次构建鹅右侧卵巢退化的单细胞图谱,发现LHX9和ARID5B基因可能调控退化速率 | 右侧卵巢退化分子机制尚未完全阐明 | 探究鸟类右侧卵巢退化的分子机制和遗传因素 | 鹅的右侧卵巢组织 | 生物信息学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序,基因组测序,转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据,基因组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
9793 | 2025-10-07 |
Recursive Clustering of Cellular Diversity in scRNA-Seq Data
2025-Apr, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2024.0625
PMID:40151847
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研究论文 | 本文提出了一种递归聚类方法用于单细胞RNA测序数据分析,通过逐层特征提取和聚类提高细胞类型检测能力 | 开发了递归聚类方法,通过在已识别簇上递归执行特征提取和聚类,使用更特异性特征区分高分辨率亚群 | NA | 探索改进单细胞RNA测序数据分析中细胞聚类的方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体 | 生物信息学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | 递归聚类算法 | 基因表达数据 | 四个单细胞RNA测序数据集,包括来自三种临床表型的克罗恩病患者数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9794 | 2025-10-07 |
Single-Cell Profiling and Proteomics-Based Insights Into mTORC1-Mediated Angio+TAMs Polarization in Recurrent IDH-Mutant Gliomas
2025-Apr, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70371
PMID:40202138
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了mTORC1通路和血管+TAMs在IDH突变胶质瘤复发进展中的关键作用 | 首次结合蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学和多维转录组学,在单细胞水平识别了具有mTORC1激活和血管生成特征的TAMs新亚群 | 研究样本量有限,主要依赖小鼠模型和公共数据库验证 | 探究mTORC1通路和肿瘤相关巨噬细胞在IDH突变胶质瘤复发进展中的机制 | IDH突变胶质瘤患者样本和小鼠胶质瘤模型 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞测序, 空间转录组学, 蛋白质组学, 磷酸化蛋白质组学, 多维转录组学 | GSVA, 去卷积分析, 伪时间分析, AddmodelScore | 转录组数据, 蛋白质组数据, 磷酸化蛋白质组数据, 空间转录组数据 | 匹配的IDH突变胶质瘤复发进展队列,包含多个胶质瘤相关数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
9795 | 2025-10-07 |
Bioinformatics Combined With Biological Experiments to Identify the Pathogenetic Link of Type 2 Diabetes for Breast Cancer
2025-Apr, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70759
PMID:40202151
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研究论文 | 通过生物信息学分析和生物学实验鉴定2型糖尿病与乳腺癌发病机制关联的关键分子 | 首次通过整合WGCNA、差异表达基因分析、机器学习与单细胞测序技术,系统性识别CCNB2、XRCC2和CENPI作为T2DM促进乳腺癌进展的关键介导分子 | 研究样本量有限,机制验证主要在细胞水平进行,缺乏动物模型验证 | 阐明2型糖尿病增加乳腺癌风险的分子机制 | 2型糖尿病和乳腺癌患者基因表达数据及乳腺癌细胞系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, WGCNA, 差异表达基因分析, 机器学习, CCK-8, 集落形成, 伤口愈合, Transwell实验, 免疫组织化学, 免疫荧光 | 机器学习 | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 实验数据 | T2DM数据集GSE25724和GSE20966,TCGA乳腺癌队列 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
9796 | 2025-10-07 |
Cell-Type-Specific mRNA N6-Methyladenosine Landscape and Regulatory Mechanisms Underlying Immune Dysregulation of Sleep-Deprived
2025-Apr, Journal of pineal research
IF:8.3Q1
DOI:10.1111/jpi.70046
PMID:40214141
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研究论文 | 本研究通过RNA测序和单细胞转录组数据揭示了睡眠剥夺患者外周血中m6A修饰的细胞类型特异性景观及其在免疫失调中的调控机制 | 首次在单细胞水平揭示睡眠剥夺患者外周血中m6A调节因子的细胞类型特异性表达模式,发现ALKBH5在T细胞、B细胞和NK细胞中的特异性上调 | 样本量有限,机制研究主要基于细胞系实验,需要进一步在体验证 | 阐明睡眠剥夺导致免疫失调的表观遗传调控机制 | 睡眠剥夺患者的外周血单核细胞(PBMC)及SH-SY5Y、HT22细胞系 | 表观遗传学 | 睡眠障碍 | RNA测序, 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据, 单细胞数据 | 睡眠剥夺患者外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9797 | 2025-10-07 |
Prognostic and Immunotherapeutic Value of Regulatory T Cell Marker Gene Signature in Melanoma
2025-Mar-10, Iranian journal of allergy, asthma, and immunology
DOI:10.18502/ijaai.v24i2.18150
PMID:40211502
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研究论文 | 本研究通过分析黑色素瘤中调节性T细胞相关基因特征,开发了一个预后模型并评估其在免疫治疗中的价值 | 首次构建了包含CHD3、FOSB、SEMA4D、PSME1、FYN、PRKACB和ARID5A的Treg相关基因特征(TRGS),并证明其作为独立预后指标的价值 | 研究依赖于公共数据库数据,缺乏前瞻性临床验证 | 阐明调节性T细胞相关基因在黑色素瘤抗肿瘤免疫反应中的作用 | 黑色素瘤患者样本和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、Cox回归分析、LASSO回归 | 预后风险评分模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 从GEO和TCGA数据库获取的黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9798 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics of melanoma sentinel lymph nodes identifies immune cell signatures associated with metastasis
2025-Mar-06, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.183080
PMID:40048259
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研究论文 | 通过单细胞转录组技术分析黑色素瘤前哨淋巴结中的免疫细胞特征及其与转移的关系 | 首次使用单细胞转录组测序技术系统描绘黑色素瘤前哨淋巴结中T细胞、B细胞和髓系细胞亚型的转录程序,并发现基于细胞类型比例的“高活化”特征评分可预测免疫治疗反应 | 研究样本量相对有限(97,777个细胞),且为观察性研究,需要进一步功能验证 | 解析黑色素瘤前哨淋巴结中免疫浸润的动态变化及其临床意义 | 黑色素瘤患者的前哨淋巴结组织细胞 | 单细胞组学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组测序,细胞索引转录组和表位测序技术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 97,777个细胞,来自I/II期和III期皮肤黑色素瘤患者的前哨淋巴结组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 细胞索引转录组和表位测序技术 |
9799 | 2025-10-07 |
Mechanosensitive ion channel-related genes in hepatocellular carcinoma: Unraveling prognostic genes and their roles in drug resistance and immune modulation
2025-Mar, Liver research (Beijing, China)
DOI:10.1016/j.livres.2025.01.002
PMID:40206431
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研究论文 | 本研究探讨机械敏感性离子通道相关基因在肝细胞癌中的预后价值及其在耐药性和免疫调节中的作用 | 首次系统分析机械敏感性离子通道相关基因在肝细胞癌中的表达特征,发现PIEZO1基因与索拉非尼耐药性相关 | 需要在更大患者队列中验证研究结果,并进一步在临床前模型中探索靶向PIEZO1的功能意义 | 研究机械敏感性离子通道相关基因在肝细胞癌中的预后价值及其在免疫调节和耐药性中的作用 | 肝细胞癌患者数据及肝癌细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 深度学习神经网络分析, 基因敲低实验, 细胞活力检测, 细胞凋亡检测 | 深度学习神经网络 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 癌症基因组图谱数据库中的肝细胞癌患者数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9800 | 2025-10-07 |
Spatial single-cell proteomics landscape decodes the tumor microenvironmental ecosystem of intrahepatic cholangiocarcinoma
2025-Feb-25, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001283
PMID:39999448
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研究论文 | 本研究通过空间多组学技术解析肝内胆管癌肿瘤微环境的生态系统特征 | 首次构建肝内胆管癌空间单细胞蛋白质组学图谱,开发空间肿瘤微环境深度学习系统进行预后预测 | 部分样本量较小(如空间转录组学仅4例),需进一步验证 | 解析肝内胆管癌空间肿瘤微环境特征及其与预后和免疫治疗的关系 | 肝内胆管癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 成像质谱流式,空间蛋白质组学,空间转录组学,多重免疫荧光,单细胞RNA测序,批量RNA测序,批量蛋白质组学 | 深度学习 | 空间多组学数据,图像,序列数据 | 总计超过106万个细胞,包括155例内部成像质谱流式/空间蛋白质组学样本,4例空间转录组学,20例多重免疫荧光,43例单细胞RNA测序(9内部+34公共),244例公共批量RNA测序,324例蛋白质组学(110内部+214公共) | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,空间蛋白质组学,批量RNA测序,批量蛋白质组学 | NA | NA |