单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 41240 篇文献,本页显示第 961 - 980 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
961 2026-06-25
MYDGF promotes pathological and physiological retinal angiogenesis via the Gαi1/3-Gab1-Akt-mTOR signaling
2026-Jun-23, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 该研究确定了髓源性生长因子(MYDGF)作为视网膜血管动态的关键调节因子,并通过Gαi1/3-Gab1-Akt-mTOR信号轴促进病理性及生理性视网膜血管生成 首次发现MYDGF在视网膜血管生成中的关键作用,并阐明了其通过Gαi1/3-Gab1-Akt-mTOR信号轴的分子机制 主要基于小鼠模型及体外实验,尚需更多人体样本及临床验证 揭示视网膜血管生成的分子机制 视网膜内皮细胞、增殖性糖尿病视网膜病变患者样本、新生小鼠及成年雄性小鼠 数字病理学 视网膜血管病变(增殖性糖尿病视网膜病变) 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 人类患者样本和小鼠模型(具体数量未在摘要中说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于单细胞转录组分析
962 2026-06-25
Spatial transcriptomics reveals coordinated ventricular patterning and maturation in the developing human heart
2026-Jun-23, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过空间转录组学绘制人心脏发育过程中的时空转录图谱,揭示心室模式化和协调成熟的分子机制 首次在8-15孕周的人心脏样本中,通过30个切片的空间转录组数据,识别出乳头肌和房室平面等特殊亚群,并发现从心内膜到心外膜的连续转录梯度 样本仅涵盖8-15孕周,未覆盖更早或更晚发育阶段;空间分辨率可能受限于单个点代表多细胞单元,无法解析单细胞水平异质性 阐明人心脏发育过程中空间组织结构的建立以及区域程序如何协调发育 8-15孕周的人心脏组织切片 空间转录组学 心脏发育相关疾病 空间转录组学 NA 空间转录组图像和基因表达数据 30个组织切片,来自8-15孕周的人心脏样本 NA 空间转录组学 NA NA
963 2026-06-25
Clemastine alleviates cognitive dysfunction after SAH by targeting neuronal CNTN1 to regulate the ADA-adenosine pathway
2026-Jun-23, Acta pharmacologica Sinica IF:6.9Q1
研究论文 本研究揭示了下调神经元CNTN1通过ADA-腺苷途径加剧蛛网膜下腔出血后脱髓鞘,并发现氯马斯汀可作为潜在治疗药物 首次发现神经元特异性CNTN1下调通过ADA-腺苷信号轴调控SAH后脱髓鞘,并验证氯马斯汀的治疗作用 具体分子机制和临床转化仍需进一步研究,且未明确CNTN1在脑实质其他细胞类型中的作用 阐明蛛网膜下腔出血后认知障碍的分子机制并寻找潜在治疗靶点 蛛网膜下腔出血患者脑脊液和小鼠模型中的神经元细胞 数字病理学 老年疾病 单细胞RNA测序, 转录组测序 NA 基因表达数据 患者脑脊液样本和小鼠模型样本 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
964 2026-06-25
Prdm15 Deficiency Results in Impaired Hippocampal Neurogenesis and Autism-Like Behaviors
2026-Jun-23, Cellular and molecular neurobiology IF:3.6Q2
research paper 本研究通过小鼠模型发现PRDM15基因缺失导致海马神经发生受损和自闭症样行为,揭示了PRDM15在自闭症谱系障碍发病机制中的关键作用 首次鉴定PRDM15为自闭症谱系障碍的新型候选风险基因,并利用单细胞RNA测序技术阐明其通过调控海马神经干细胞分化影响神经发生和行为表型的分子机制 研究仅限于小鼠模型,人源PRDM15突变与自闭症表型的直接因果关系尚需进一步验证;条件性敲除仅部分复现表型,提示可能存在其他补偿机制 探究PRDM15基因缺陷对海马神经发生和行为发育的影响及其在自闭症谱系障碍发病中的作用 Prdm15基因缺陷小鼠模型(全身性敲除和神经干/祖细胞条件性敲除小鼠) NA 自闭症谱系障碍 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠海马组织(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
965 2026-06-25
Mapping and engineering the human cell-cell interactome
2026-Jun-23, Nature biotechnology IF:33.1Q1
评论 提出绘制和工程化人类细胞-细胞相互作用组的倡议,旨在系统理解细胞间如何协同调控组织功能 首次提出‘十亿细胞×细胞项目’,系统刻画不同细胞类型与条件下已定义细胞对的相互作用结果 未提及具体技术挑战或潜在局限性 构建人类细胞之间通信的功能图谱,并推动治疗学发现 人类主要细胞类型及其相互作用 NA NA NA NA NA 计划包含十亿个细胞对 NA 单细胞转录组学, 空间图谱技术 NA NA
966 2026-06-25
Benchmarking DNA barcode decoding strategies under high error rates
2026-Jun-23, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 比较了三种DNA条形码解码策略在高错误率条件下的性能表现 首次在高错误率光刻合成条形码场景下系统评估了Columba、QUIK和RandomBarcodes三种解码策略的性能,并提出34-36 nt条形码长度以实现超高准确率 未说明 在10-20%核苷酸错误率条件下,评估不同DNA条形码解码方法的准确性、速度和可扩展性 光刻合成的高密度条形码阵列数据(模拟和真实测序数据) 机器学习 NA DNA条形码解码 FM索引、GPU加速k-mer过滤、三体分选算法 序列数据 模拟数据集覆盖21,000-85,000条条形码;真实数据集来自42,000点亚阵列,条形码长度28-36 nt NA NA NA NA
967 2026-06-25
Gnao1 acts as a gatekeeper to alleviate neuropathic pain by silencing pro-nociceptive signaling cascades
2026-Jun-23, The journal of headache and pain IF:7.3Q1
research paper 本研究探讨了Gnao1基因编码的Gαo蛋白在神经病理性疼痛中的调控作用及其作为非阿片类镇痛靶点的潜力 首次揭示Gnao1通过沉默促伤害性信号级联充当神经病理性疼痛的守门人负调控因子,并提出其作为非阿片类镇痛靶点的新方向 未明确提及临床相关性与长期应用效果 阐明Gnao1在神经病理性疼痛中的作用机制及其作为治疗靶点的可能性 小鼠脊髓、背根神经节、BV2小胶质细胞和原代DRG神经元 machine learning neuropathic pain spatial transcriptomics, bulk RNA-seq, AAV介导过表达与敲降, 行为测试, 免疫组化, 蛋白印迹 NA spatial transcriptomics, bulk RNA-seq, 行为学数据 小鼠模型(具体数量未明确) 10x Genomics, Illumina spatial transcriptomics, bulk RNA-seq 10x Visium, Illumina NovaSeq 10x Visium用于空间转录组学文库构建,Illumina NovaSeq用于RNA测序
968 2026-06-25
H3K18 lactylation promotes allergic airway inflammation in asthma via a CSF1/CSF1R/MAPK autocrine axis
2026-Jun-23, Respiratory research IF:4.7Q1
研究论文 本研究揭示了哮喘中糖酵解诱导的组蛋白H3K18乳酸化修饰通过CSF1/CSF1R/MAPK自分泌轴促进过敏性气道炎症的机制 首次发现组蛋白H3K18乳酸化修饰在哮喘气道炎症中的功能角色,并阐明其通过CSF1/CSF1R/MAPK自分泌正反馈轴驱动上皮细胞代谢重编程与炎症持续激活的分子机制 未明确提及研究局限性 探究糖酵解来源的组蛋白乳酸化修饰在哮喘气道炎症中的分子机制及潜在治疗靶点 哮喘患者的气道上皮细胞标本及单细胞RNA测序数据 数字病理学 哮喘 scRNA-seq, ChIP-seq, RNA-seq NA 基因表达数据 临床标本(具体数量未报告) NA 单细胞RNA测序 NA NA
969 2026-06-25
A novel EGR1-driven GLUL/mTOR axis regulates macropinocytosis-mediated crosstalk in pancreatic stellate cell-cancer metastasis
2026-Jun-23, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 揭示EGR1驱动的GLUL/mTOR轴通过抑制胰腺星状细胞活化及癌细胞巨胞饮作用,调控胰腺癌肝转移的新机制 首次发现EGR1作为转录因子直接调控GLUL表达,并通过mTOR信号通路抑制胰腺星状细胞活化,进而减少癌细胞的巨胞饮营养摄取和肝转移 未提及具体局限性 探索胰腺星状细胞与癌细胞之间新型转录调控通路,特别是通过巨胞饮作用影响营养获取和肝转移的机制 胰腺星状细胞、胰腺癌细胞及肝转移相关的细胞间相互作用 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序、ChIP、EMSA、荧光素酶报告基因检测、免疫印迹 NA 单细胞转录组数据、分子生物学数据 人胰腺癌组织样本(数量未明确)及小鼠胰腺癌肝转移模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3'测序
970 2026-06-25
Multi-omics integration and clinical validation identify CKAP2 as a diagnostic biomarker for bladder cancer
2026-Jun-23, World journal of surgical oncology IF:2.5Q1
研究论文 通过多组学整合与临床验证,确定CKAP2为膀胱癌的诊断生物标志物 首次结合多组学分析、孟德尔随机化与独立的临床队列验证,系统性确定CKAP2在膀胱癌诊断中的价值及其在肿瘤微环境中的作用 未明确提及局限,但可能受限于样本量(127例组织样本)及缺乏更广泛的验证 鉴定并严格验证CKAP2作为膀胱癌的诊断生物标志物 膀胱癌组织和正常组织样本 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习 膀胱癌 RNA测序, 单细胞RNA测序, 多组学分析, 孟德尔随机化 逻辑回归, 机器学习特征选择 基因表达数据, 临床样本数据 127例组织样本(包括50对匹配肿瘤与癌旁组织、21例独立肿瘤组织和6例独立癌旁组织) NA 单细胞RNA测序 NA NA
971 2026-06-25
Self-supervised graph contrastive learning for scRNA-seq clustering
2026-Jun-23, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 提出一种自监督图对比学习框架SSGL,用于提升单细胞RNA测序数据聚类的准确性和稳定性 创新点在于联合利用双随机基因掩码的增强视图、内在细胞间关系以及伪标签引导的图精化策略,在图对比学习框架中实现鲁棒表示学习 文中未明确提及局限性,可能包括对超参数的敏感性或计算复杂度较高 开发一种自监督图对比学习框架,通过联合增强视图、内在细胞间关系和伪标签引导的图精化来提高scRNA-seq聚类鲁棒性和生物学可解释性 公共scRNA-seq基准数据集,涵盖不同组织和测序平台 计算机视觉 NA 单细胞RNA测序 图对比学习 基因表达矩阵 八个公共scRNA-seq数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
972 2026-06-25
Late-stage dedifferentiation and epigenetic memory of cancer stem cells in hepatocellular carcinoma
2026-Jun-23, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过单细胞测序和多组学分析,揭示了肝细胞癌中肿瘤干细胞通过晚期去分化产生,并存在表观遗传记忆现象 首次通过单细胞证据证明肝细胞癌中肿瘤干细胞是晚期去分化产物而非初始肿瘤起始细胞,并发现其表观遗传记忆维持干细胞特性 主要基于公开数据集和有限患者样本,未在独立大规模队列中验证核心印记风险评分 探究肝细胞癌中肿瘤干细胞起源:是肿瘤起始细胞还是晚期去分化产物 肝细胞癌患者样本、Huh7细胞系及组织芯片 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序、靶向亚硫酸盐测序、多重免疫荧光 NA 单细胞转录组数据、基因组变异数据、表观基因组数据 44名患者的109个样本共410,608个细胞,外加2名患者EpCAM富集样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
973 2026-06-25
Spatial architecture of the melanoma immune niche reveals CORO1A as a functional hub for T cell cytotoxicity and immunotherapy synergy
2026-Jun-23, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过单细胞和空间转录组学整合分析,揭示了黑色素瘤免疫微环境的空间结构,并确定CORO1A为T细胞细胞毒性和免疫治疗协同作用的功能枢纽 首次在空间水平上解析黑色素瘤免疫微环境的两大区域(免疫区和黑色素细胞区),并发现CORO1A作为免疫微环境中的关键调控因子,其敲低可与抗PD-1治疗协同抑制肿瘤生长 未明确提及具体局限性 明确黑色素瘤肿瘤微环境的空间结构,并识别决定抗肿瘤免疫和免疫检查点阻断反应的关键分子调控因子 黑色素瘤肿瘤微环境中的免疫细胞和黑色素细胞 数字病理学 黑色素瘤 单细胞转录组测序、空间转录组学 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium NA
974 2026-06-25
PD-L1-targeted OMV priming licenses myeloid co-stimulation and chemokine circuits to potentiate CAR-T therapy in advanced-stage solid tumors
2026-Jun-23, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 利用PD-L1靶向细菌外膜囊泡预处理来重塑肿瘤微环境,增强CAR-T疗法在晚期实体瘤中的疗效 首次将PD-L1靶向的细菌外膜囊泡(OMV)作为CAR-T预处理的模块化平台,通过重塑髓系细胞区室和增强肿瘤内共刺激信号,实现剂量递减CAR-T治疗的强大抗肿瘤效果 未提及相关局限性 探索通过OMV预处理重编程实体瘤免疫微环境以增强CAR-T疗法的策略 晚期实体瘤小鼠模型及其肿瘤微环境 数字病理学 实体瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 多个同源小鼠模型样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
975 2026-06-25
Laser-induced skin microenvironment remodeling via exosomal CEBPA-mediated crosstalk between keratinocyte and fibroblast
2026-Jun-23, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示激光治疗后角朊细胞与成纤维细胞间的外泌体CEBPA介导的微环境重塑机制 首次系统描绘激光治疗后早期皮肤微环境中的细胞特化与细胞间通讯机制,发现角朊细胞亚群通过富含CEBPA的外泌体调控成纤维细胞活性,并通过YAP/TAZ通路促进自身增殖 未明确提及限制,但可能包括样本量有限、仅关注早期阶段、体内验证不足等 阐明激光治疗诱导皮肤重塑早期阶段的细胞特化与细胞间通讯机制 激光处理与未处理的人类皮肤组织 数字病理学 皮肤老化 单细胞RNA测序 不适用 单细胞转录组数据 激光处理与未处理的皮肤样本(具体数量未提及) 不适用 单细胞RNA测序 不适用 不适用
976 2026-06-25
Tumor-derived progranulin promotes macrophage cholesterol efflux and associated immunosuppressive features in oral squamous cell carcinoma
2026-Jun-23, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
research paper 本研究通过单细胞RNA测序等手段揭示了口腔鳞状细胞癌中肿瘤来源的颗粒蛋白前体通过调控巨噬细胞胆固醇外流促进免疫抑制特征的作用机制 首次鉴定出口腔鳞状细胞癌中高表达PGRN的恶性上皮细胞亚群,并阐明其通过SORT1-PPARγ-LXRα-ABCA1/ABCG1信号轴调控巨噬细胞胆固醇外流及免疫抑制表型 临床样本量较小(3例OSCC原发肿瘤),且免疫抑制特征的临床相关性尚需进一步验证 阐明口腔鳞状细胞癌中肿瘤来源的PGRN调控巨噬细胞胆固醇外流及相关免疫抑制特征的分子机制 口腔鳞状细胞癌原发肿瘤样本及头颈部鳞状细胞癌相关公共数据集中的巨噬细胞 digital pathology oral squamous cell carcinoma scRNA-seq, genetic knockdown, pharmacologic inhibition, PPARγ signaling activation NA 单细胞转录组数据 3例OSCC原发肿瘤,77例HNSCC相关公共数据集样本 NA single-cell RNA-seq NA NA
977 2026-06-25
Single-cell transcriptomics unveils pyroptosis-related immune microenvironment dynamics and prognostic modeling in esophageal squamous cell carcinoma
2026-Jun-23, Journal of cardiothoracic surgery IF:1.5Q3
研究论文 通过单细胞转录组学揭示食管鳞状细胞癌中焦亡相关的免疫微环境动态及预后模型构建 首次利用单细胞RNA测序整合7例食管癌组织和1例正常对照,系统解析了焦亡相关基因在食管癌免疫微环境中的动态变化,并构建了基于GSDMB和CYCS的双基因焦亡相关预后模型 预后模型在外部验证集GSE53625中表现有限,该模型应视为探索性预后特征而非经临床验证的预测工具 表征食管癌中焦亡相关的免疫机制并构建临床预测模型以改进预后评估 食管鳞状细胞癌组织及正常对照组织中的免疫细胞亚群 机器学习和数字病理学 食管鳞状细胞癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 预后模型(基于GSDMB和CYCS的双基因模型) 单细胞转录组数据和批量转录组数据 7例食管癌组织及1例正常对照组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
978 2026-06-25
Single-Cell Transcriptomic Landscape of Smoking-Related Periodontitis
2026-Jun-23, Oral diseases IF:2.9Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序技术揭示吸烟相关牙周炎的细胞组成和分子微环境特征 首次在单细胞水平描绘吸烟相关牙周炎的细胞图谱,并发现CXCR6+调节性T细胞与衰老上皮细胞通过CXCL16-CXCR6轴及CD2-CD58相互作用的致病机制 样本数量较少(健康对照2例、牙周炎2例、吸烟相关牙周炎3例),后续需扩大样本量验证 阐明吸烟相关牙周炎的细胞组成和分子微环境特征 牙周组织样本(健康对照、牙周炎患者、吸烟相关牙周炎患者) 数字病理学 牙周炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 健康对照2例、牙周炎2例、吸烟相关牙周炎3例 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒
979 2026-06-25
Single-Cell Transcriptomics in Triple-Negative Breast Cancer: Implications for Radionuclide Therapy in Precision Oncology
2026-Jun-23, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
研究论文 利用单细胞转录组学解析三阴性乳腺癌的异质性,并识别与放射性核素治疗相关的潜在分子靶点 首次将单细胞转录组学与孟德尔随机化分析结合,系统鉴定三阴性乳腺癌中放射性核素治疗相关的风险基因和保护基因,为精准肿瘤学提供新策略 研究仅基于公开数据集GSE155109,样本量有限,且缺乏体内实验验证,结果需进一步临床验证 阐明三阴性乳腺癌的基因表达特征和细胞异质性,为放射性核素治疗提供分子靶点和理论依据 三阴性乳腺癌肿瘤微环境中的细胞群体,包括内皮细胞、基质细胞和恶性细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析、qRT-PCR UMAP、扩散伪时间分析 单细胞转录组数据 公开数据集GSE155109,样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA 基于GSE155109数据集的单细胞转录组分析,使用Scanpy进行质控和聚类
980 2026-06-25
Multi-omics analyses reveal BPA accelerates glioma progression via cell cycle dysregulation
2026-Jun-22, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
研究论文 通过多组学分析揭示双酚A通过细胞周期失调加速胶质瘤进展 首次整合多组学分析与实验验证,阐明环境内分泌干扰物BPA通过结合细胞周期相关蛋白促进胶质瘤恶性进展的新机制 未明确具体样本量及临床验证数据,部分靶点预测依赖计算模型 探究BPA对胶质瘤恶性进展的影响及其分子机制 BPA的潜在靶点、胶质瘤相关基因、单细胞RNA测序数据 计算机视觉 胶质瘤 单细胞RNA测序、分子对接、机器学习 机器学习模型 基因表达数据、单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部