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当前共找到 33678 篇文献，本页显示第 961 - 980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 961 | 2025-11-26 |
SpaGene: A Deep Adversarial Framework for Spatial Gene Imputation
2025-Oct-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.03.680242
PMID:41278680
|
研究论文 | 提出一种名为SpaGene的深度学习框架，用于整合单细胞RNA测序和空间转录组数据以填补空间基因表达缺失 | 采用包含两个编码器-解码器对、两个翻译器和两个判别器的深度对抗框架，实现空间转录组数据中缺失基因表达的有效填补 | NA | 整合单细胞RNA测序和空间转录组数据，提升空间基因表达数据的完整性 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 空间转录组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 深度学习, 对抗生成网络 | 基因表达数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 962 | 2025-11-26 |
Single-cell RNA-seq using UltraMarathonRT expands the known transcriptome
2025-Oct-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.06.680646
PMID:41278799
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研究论文 | 本文首次将II型内含子逆转录酶UltraMarathonRT应用于单细胞RNA测序，扩展了已知转录组的覆盖范围 | 首次在单细胞RNA测序中使用II型内含子逆转录酶uMRT，相比传统鼠白血病病毒来源的逆转录酶能捕获更多基因和基因组特征 | NA | 开发新型逆转录酶工具以提升单细胞转录组测序的性能 | 单细胞mRNA分子 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序, 代谢RNA标记, 核苷转换 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 963 | 2025-11-26 |
Transcriptional and epigenetic repression of hematopoietic stem cells underlies bone marrow failure after spinal cord injury
2025-Oct-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.05.680535
PMID:41279599
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研究论文 | 本研究揭示了脊髓损伤通过转录和表观遗传抑制导致造血干细胞功能受损和骨髓衰竭的机制 | 首次发现脊髓损伤通过抑制造血干细胞的转录程序和染色质可塑性导致骨髓衰竭的系统性后果 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究脊髓损伤对造血干细胞功能和长期造血的影响机制 | 造血干细胞(HSCs) | 表观遗传学 | 脊髓损伤 | 单细胞转录组学,染色质可及性分析,体内移植实验 | NA | 基因表达数据,表观遗传数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq,ATAC-seq | NA | NA |
| 964 | 2025-11-26 |
Investigating the dynamic signaling pathways involved in the specialization and differentiation of epiblast cells in early human embryos
2025-Oct, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2025.05.014
PMID:40581241
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类胚胎早期发育过程中外胚层细胞特化的动态信号通路 | 首次系统揭示BMP、WNT、FGF、LIF和TGFβ等多条信号通路在人类胚胎外胚层发育中的动态作用模式 | 研究结果基于RNA表达模式推断，需要蛋白质水平和功能验证 | 探索人类胚胎外胚层细胞特化和分化过程中的细胞间通讯机制 | 人类早期胚胎发育过程中的外胚层细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 涵盖植入前、植入后、原肠胚形成前和早期原肠胚形成阶段的人类胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 965 | 2025-11-26 |
Treg activation during allograft tolerance induction requires mitochondrion-induced TGF-β1 in type 1 conventional dendritic cells
2025-Sep-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI178960
PMID:40644411
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研究论文 | 本研究揭示了1型常规树突状细胞通过线粒体代谢诱导TGF-β1表达，进而促进抗原特异性调节性T细胞生成和心脏移植物耐受的机制 | 首次发现cDC1细胞在移植物耐受诱导中的关键作用，并阐明线粒体代谢-TGF-β1信号轴调控抗原特异性Treg生成的新机制 | 研究基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证；cDC1特异性基因敲除模型可能存在脱靶效应 | 探究1型常规树突状细胞在实体器官移植物耐受诱导中的作用机制 | 小鼠心脏移植模型、1型常规树突状细胞、CD4+CD25+FoxP3+调节性T细胞 | 免疫学 | 器官移植排斥 | 单细胞RNA测序、代谢分析、基因敲除 | NA | 基因表达数据、代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 966 | 2025-11-26 |
Integrated multi-omics analysis identifies lipid metabolism biomarkers in ONFH and reveals therapeutic potential of retinoic acid
2025-Aug-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-13703-y
PMID:40841396
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研究论文 | 通过多组学分析识别股骨头坏死中脂质代谢生物标志物并揭示视黄酸的治疗潜力 | 首次整合多组学分析与机器学习技术识别ONFH脂质代谢生物标志物，并通过单细胞测序验证生物标志物与免疫细胞的关联 | 未明确说明样本量大小及数据来源的具体细节 | 识别股骨头坏死的潜在生物标志物并为疾病治疗提供参考 | 股骨头坏死相关基因和免疫细胞 | 生物信息学 | 股骨头坏死 | 多组学分析、机器学习、分子对接、单细胞测序 | 列线图模型、ROC曲线分析 | 基因组数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 967 | 2025-11-26 |
Subcellular spatial transcriptomics reveals immune-stromal crosstalk within the synovium of patients with juvenile idiopathic arthritis
2025-Aug-08, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.08.05.25332835
PMID:40894156
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研究论文 | 通过亚细胞分辨率空间转录组分析揭示幼年特发性关节炎患者滑膜组织中免疫细胞与基质细胞的空间互作网络 | 开发了新的空间共定位分析流程，首次在亚细胞分辨率揭示JIA滑膜中NOTCH信号介导的内皮-成纤维细胞互作、CXCL9-CXCR3信号轴等微解剖结构 | 研究样本仅来自活动期JIA患者，未涵盖疾病不同阶段；与类风湿关节炎的比较分析样本量有限 | 解析幼年特发性关节炎滑膜组织的空间分子结构 | 幼年特发性关节炎患者的滑膜组织样本 | 空间转录组学 | 幼年特发性关节炎 | 空间转录组测序 | 空间共定位分析流程 | 空间转录组数据 | 活动期JIA患者滑膜组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | 亚细胞分辨率空间转录组分析 |
| 968 | 2025-11-26 |
Cannabidiol exerts anti-inflammatory effects but maintains T effector memory cell differentiation: A Single-Cell Study in Humans
2025-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.30.667742
PMID:40766582
|
研究论文 | 通过单细胞研究探讨大麻二酚在人类中的抗炎作用及其对T效应记忆细胞分化的影响 | 首次在人体研究中结合单细胞RNA测序和流式细胞术分析大麻二酚对免疫细胞的调节作用 | 样本量较小（23名参与者），缺乏长期随访数据 | 评估大麻二酚对人类外周免疫细胞分布和功能的调节作用 | 23名接受口服大麻二酚治疗的人类参与者 | 免疫学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,细胞因子检测,串联质谱 | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞术数据,蛋白质浓度数据 | 23名人类参与者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 969 | 2025-11-26 |
Genital herpes shedding episodes associate with alterations in the spatial organization and activation of mucosal immune cells
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.24.661157
PMID:40667113
|
研究论文 | 本研究探讨了HSV-2感染期间生殖器疱疹脱落对阴道黏膜免疫细胞空间组织和活化的影响 | 首次结合空间转录组学和免疫荧光成像技术揭示活动性HSV-2脱落期间阴道黏膜免疫细胞的空间重分布和基因表达变化 | 研究样本量相对有限（232名参与者），且主要关注黏膜局部免疫反应 | 研究HSV-2对宫颈阴道道免疫系统的影响机制 | HSV-2血清阳性和血清阴性参与者的宫颈阴道组织和血液样本 | 免疫学 | 生殖器疱疹 | 流式细胞术,免疫荧光成像,可溶性免疫因子分析,空间转录组学 | NA | 组织样本,血液样本,图像数据,基因表达数据 | 232名HSV-2血清阳性和血清阴性参与者 | NA | 空间转录组学,流式细胞术,免疫荧光成像 | NA | NA |
| 970 | 2025-11-26 |
HPV integration in head and neck cancer: downstream splicing events and expression ratios linked with poor outcomes
2025-Jan-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.17.633627
PMID:39896613
|
研究论文 | 研究HPV整合在头颈癌中对下游剪接事件和基因表达比例的影响及其与不良预后的关联 | 首次基于RNA特征对HPV整合阳性患者进行分类，发现特定HPV-人类融合转录本和HPV基因转录比例与较差临床结局相关 | 主要基于RNA分析而非DNA分析，样本量相对有限 | 探索HPV整合在头颈鳞状细胞癌中的致癌机制及其与临床预后的关系 | 头颈鳞状细胞癌患者 | 生物信息学 | 头颈癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 261个HPV相关HNSCC样本（包括bulk和单细胞RNA-seq），其中102名HPV阳性患者的DNA整合事件 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 971 | 2025-11-26 |
Piscis: a novel loss estimator of the F1 score enables accurate spot detection in fluorescence microscopy images via deep learning
2025-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.31.578123
PMID:38352551
|
研究论文 | 提出了一种名为Piscis的深度学习算法，通过新颖的SmoothF1损失函数实现荧光显微镜图像中RNA转录本斑点的自动检测 | 开发了SmoothF1损失函数，可近似F1分数并直接惩罚假阳性和假阴性，同时保持可微性以用于深度学习训练 | NA | 开发无需手动参数调优的自动斑点检测算法，用于空间转录组学图像分析 | 荧光显微镜图像中的RNA转录本斑点 | 计算机视觉 | NA | RNA荧光原位杂交 | 深度学习 | 图像 | 358张手动标注的实验RNA FISH图像和240张合成图像 | NA | 空间转录组学, 单分子RNA荧光原位杂交 | NA | NA |
| 972 | 2025-11-26 |
Correction: Unveiling the NEFH+ malignant cell subtype: insights from single-cell RNA sequencing in prostate cancer progression and tumor microenvironment interactions
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1718125
PMID:41280907
|
correction | 对前列腺癌研究中关于NEFH+恶性细胞亚型的文章进行更正 | NA | NA | NA | NA | NA | prostate cancer | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 973 | 2025-11-26 |
Multimodal cortical neuronal cell type classification
2024-05, Pflugers Archiv : European journal of physiology
DOI:10.1007/s00424-024-02923-2
PMID:38376567
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综述 | 本文综述了大脑皮层神经元细胞类型分类方法的历史演变和当前基于单细胞转录组学的分类进展 | 整合了形态学、电生理和转录组学多模态特征，提出了皮层神经元的新型分类框架 | 承认转录组学定义的细胞类型是否对应真实功能类型仍需未来验证 | 建立可靠的大脑皮层神经元细胞类型分类系统 | 大脑皮层兴奋性和抑制性神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 974 | 2025-11-26 |
Systematic benchmarking of imaging spatial transcriptomics platforms in FFPE tissues
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.07.570603
PMID:38106230
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研究论文 | 对三种商业化成像空间转录组平台在FFPE组织中的性能进行系统性基准测试 | 首次在包含23种肿瘤和正常组织类型的组织芯片上对三种商业iST平台进行全面性能比较 | 研究基于组织芯片样本，可能无法完全代表完整组织切片的情况 | 评估成像空间转录组平台在FFPE组织中的技术和生物学性能 | 包含23种肿瘤和正常组织类型的组织芯片连续切片 | 空间转录组学 | 多种肿瘤类型 | 成像空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 包含23种组织类型的组织芯片 | 10x Genomics | 成像空间转录组学 | 10x Xenium | 三种商业化成像空间转录组平台（包括10x Xenium） |
| 975 | 2025-11-25 |
An integrated approach of experiment validation and single-cell RNA sequencing reveal dual-pathway inhibition of NLRP3/ferroptosis by flavonoids of Sanyeqing fibrous root in acute lung injury
2026-Feb-10, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120743
PMID:41115482
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研究论文 | 本研究通过实验验证和单细胞RNA测序揭示了三叶青纤维根黄酮类化合物通过双重通路抑制NLRP3/铁死亡缓解急性肺损伤的作用机制 | 首次发现三叶青纤维根黄酮类化合物能同时抑制NLRP3炎症小体激活和铁死亡通路，并通过单细胞RNA测序鉴定出双通路激活的巨噬细胞亚群 | 研究主要基于LPS诱导的急性肺损伤模型，临床转化价值需进一步验证 | 探究三叶青纤维根黄酮类化合物对急性肺损伤的保护作用及分子机制 | C57BL/6小鼠、BEAS-2B人支气管上皮细胞、人类支气管肺泡灌洗液样本 | 单细胞组学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序，UPLC-Q-TOF-MS/MS，HPLC | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质表达数据，病理学数据 | 动物模型和细胞系实验，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 976 | 2025-11-25 |
Müller cell glutamine metabolism links photoreceptor and endothelial injury in diabetic retinopathy
2026-Feb, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202503434
PMID:41266111
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研究论文 | 本研究通过分析糖尿病视网膜病变中Müller细胞谷氨酰胺代谢异常，揭示了其与光感受器和内皮细胞损伤的关联机制 | 首次发现Müller细胞谷氨酰胺代谢异常是连接光感受器和内皮细胞损伤的关键环节，并确定了这一代谢生态系统在糖尿病视网膜病变早期发病机制中的核心作用 | 研究主要基于动物模型和体外实验，人类组织验证相对有限 | 阐明糖尿病视网膜病变的分子功能障碍时间进程和发病机制 | 链脲佐菌素诱导的糖尿病小鼠视网膜、人视网膜组织、内皮细胞和视网膜细胞 | 生物医学研究 | 糖尿病视网膜病变 | RNA-Seq, scRNA-Seq, 免疫组织化学, 体外培养 | NA | 转录组数据, 图像数据 | 6个月糖尿病病程的小鼠视网膜样本，包含1、3、6个月时间点 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 977 | 2025-11-25 |
Ciao3 knockout causes acute lung injury through immune activation using single cell sequencing
2025-Dec-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.124063
PMID:41187899
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示Ciao3基因敲除通过免疫激活导致急性肺损伤的机制 | 首次在Ciao3条件性敲除小鼠模型中结合单细胞RNA测序技术系统阐明免疫细胞在急性肺损伤中的核心作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本数量有限 | 阐明Ciao3基因缺失导致急性肺损伤的分子机制 | Ciao3基因突变患者和内皮细胞特异性Ciao3敲除小鼠 | 单细胞生物学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 免疫组化 | NA | 单细胞RNA测序数据, bulk RNA测序数据 | 1名纯合子患者和Ciao3条件性敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 978 | 2025-11-25 |
Malignant cell-mediated Treg immune suppression via ICOSLG-ICOS axis in tumor microenvironment relates to nasopharyngeal carcinoma prognosis
2025-Dec-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115743
PMID:41151481
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示鼻咽癌肿瘤微环境中恶性细胞通过ICOSLG-ICOS轴激活Treg细胞介导免疫抑制的机制 | 首次在鼻咽癌中发现Mal (TUBB2B+)细胞通过ICOSLG-ICOS通路激活Treg (TNFRSF4+)细胞，进而抑制多种免疫细胞功能的免疫逃逸新机制 | 研究样本主要来自亚洲人群，结果在其他人群中的普适性需要进一步验证 | 阐明鼻咽癌肿瘤微环境中细胞间相互作用与患者预后的关系 | 鼻咽癌患者肿瘤组织和肿瘤微环境中的各类细胞 | 单细胞生物学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组, 多重免疫组化 | scissor, scAB, CellChat分析 | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据, 空间转录组数据, 免疫组化图像 | 82个样本共488,771个细胞（其中50个样本269,521个单细胞），183例鼻咽癌患者批量RNA数据 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 979 | 2025-11-25 |
Melatonin ameliorates bronchopulmonary dysplasia by modulating the NF-κB pathway via the gut microbiota-short-chain fatty acid axis
2025-Dec-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115730
PMID:41151484
|
研究论文 | 本研究揭示了褪黑素通过调节肠道微生物群-短链脂肪酸轴改善支气管肺发育不良的机制 | 首次发现褪黑素通过增加肠道Ligilactobacillus murinus丰度和短链脂肪酸产生，抑制NF-κB通路和细胞焦亡来改善BPD | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证仍需进一步研究 | 阐明褪黑素通过肠道微生物-短链脂肪酸轴改善支气管肺发育不良的作用机制 | 博来霉素诱导的BPD小鼠模型、人支气管上皮细胞(BEAS-2B)、婴儿肺组织单细胞RNA测序数据 | 生物医学研究 | 支气管肺发育不良 | 宏基因组学、16S rRNA测序、非靶向代谢组学、RNA转录组学、单细胞RNA测序 | 动物模型、细胞模型 | 基因组数据、转录组数据、代谢组数据、单细胞测序数据 | BPD小鼠模型、BEAS-2B细胞系、公共单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序,宏基因组学,代谢组学,转录组学 | NA | NA |
| 980 | 2025-11-25 |
Pirfenidone regulates obesity-related renal injury through the SIRT3 signaling pathway
2025-Dec-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115709
PMID:41151486
|
研究论文 | 本研究探讨了吡非尼酮通过SIRT3信号通路调节肥胖相关肾损伤的作用机制 | 首次揭示吡非尼酮通过SIRT3依赖方式改善肥胖相关肾损伤的新机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，尚未进行临床验证 | 探究吡非尼酮对肥胖相关肾损伤的治疗作用及其分子机制 | C57BL/6J雄性小鼠、人近端肾小管上皮细胞(HK-2)和人原代肾近端小管上皮细胞(PTECs) | 分子生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞测序分析、分子对接、免疫共沉淀 | 动物模型、细胞模型 | 分子生物学数据、细胞实验数据 | C57BL/6J雄性小鼠分组实验，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |