单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 961 - 980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 961 | 2025-10-05 |
Identification and validation of mitochondrial ferroptosis and immune microenvironment-related hub biomarkers in liver cirrhosis by integrated bioinformatics analysis
2025 Jul-Sep, Science progress
IF:2.6Q2
DOI:10.1177/00368504251380638
PMID:40966021
|
研究论文 | 通过整合生物信息学分析鉴定并验证了与肝硬化中线粒体铁死亡和免疫微环境相关的关键生物标志物 | 首次将线粒体铁死亡与免疫微环境结合，通过多组学数据分析鉴定肝硬化关键生物标志物 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据，需要进一步实验验证 | 鉴定肝硬化诊断和治疗的可靠生物标志物 | 肝硬化患者转录组数据 | 生物信息学 | 肝硬化 | 转录组测序,单细胞测序,免疫组化,分子对接 | LASSO回归,随机森林,WGCNA,机器学习 | 基因表达数据,单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 962 | 2025-10-05 |
Heterogeneity of mature oligodendrocytes in the central nervous system
2025-May-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00055
PMID:38934385
|
综述 | 本文系统总结了成熟少突胶质细胞在中枢神经系统中的异质性特征 | 整合了从20世纪早期研究到现代单细胞技术的证据，首次全面梳理成熟少突胶质细胞的功能和分子多样性 | 细胞亚型分类存在简化风险，且现有研究受限于时间分辨率和技术手段 | 探讨成熟少突胶质细胞在中枢神经系统中的异质性特征 | 成熟少突胶质细胞 | 神经科学 | 多发性硬化症,阿尔茨海默病,精神疾病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学,单细胞蛋白质组学 | NA | 转录组数据,形态学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 963 | 2025-10-05 |
Distinct adipose progenitor cells emerging with age drive active adipogenesis
2025-Apr-25, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adj0430
PMID:40273250
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现中年小鼠内脏脂肪中出现独特的脂肪祖细胞亚群CP-A，揭示其驱动年龄依赖性脂肪重塑的机制 | 首次鉴定出年龄富集的定向前脂肪细胞亚群CP-A，并证明其通过白血病抑制因子受体信号通路驱动内脏脂肪扩张 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性尚需进一步验证 | 探究年龄依赖性脂肪组织重塑的细胞机制 | 小鼠脂肪祖细胞 | 单细胞生物学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序，谱系追踪，细胞移植，药理学和遗传学操作 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 964 | 2025-10-05 |
Multi-omics integration uncovers key transcriptional regulators in triple-negative breast cancer spatial heterogeneity
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1614254
PMID:40969325
|
研究论文 | 通过多组学整合方法构建三阴性乳腺癌空间细胞图谱，揭示关键转录调控因子 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学构建TNBC空间细胞图谱，识别细胞类型特异性转录调控网络 | 研究样本量有限，需要更大规模验证；空间分辨率的限制可能影响细胞互作分析的精确性 | 解析三阴性乳腺癌空间异质性及其调控机制 | 三阴性乳腺癌组织样本 | 空间转录组学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学验证 | 转录因子调控网络, 受体-配体相互作用分析 | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据, 组织图像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 965 | 2025-10-05 |
NADH supplementation improves human oocyte maturation and developmental competence of resulting embryos in controlled ovarian hyperstimulation cycles: a pilot study implicating the CDK2/GAS6 signaling pathway
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1627679
PMID:40969372
|
研究论文 | 本研究探讨NADH补充对人类卵母细胞成熟及胚胎发育能力的影响 | 首次研究NADH（NAD+还原形式）对人类卵母细胞成熟的直接影响，并揭示CDK2/GAS6信号通路在此过程中的作用机制 | 初步研究，样本量有限，需要更大规模研究验证 | 评估NADH对人类卵母细胞体外成熟和胚胎发育能力的影响 | 控制性卵巢刺激周期中废弃的GV/MⅠ期人类卵母细胞 | 生殖医学 | 卵巢功能减退 | 单细胞RNA测序，免疫荧光，线粒体表型分析 | NA | 基因表达数据，图像数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 966 | 2025-10-05 |
A Brief Introduction to Genomics and Single-cell Analysis for Psychiatric Disorders
2025, Juntendo medical journal
DOI:10.14789/ejmj.JMJ25-0003-R
PMID:40969821
|
综述 | 本文综述了基因组学和单细胞分析在精神疾病研究中的最新进展，特别关注双相情感障碍 | 整合临床基因组数据与细胞类型特异性表达谱，结合类器官或神经元模型的药物筛选 | 直接获取活体人脑组织存在重大限制，主要依赖死后脑组织研究 | 深入理解精神疾病的病理机制，开发创新诊断和治疗策略 | 精神疾病（特别是双相情感障碍和精神分裂症）的病理机制研究 | 基因组学 | 精神疾病 | 单细胞RNA测序，诱导多能干细胞技术 | NA | 基因组数据，基因表达谱 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 967 | 2025-10-05 |
Unlocking hematopoietic stem cell potential: integrative computational approaches for genomic and transcriptomic analysis
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1589823
PMID:40970097
|
综述 | 本文综述了计算生物学方法在造血干细胞基因组和转录组分析中的应用 | 整合单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀测序、网络推断算法和机器学习等多种计算工具解析造血干细胞异质性 | NA | 解析造血干细胞生物学特性并改善血液疾病治疗 | 造血干细胞 | 计算生物学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序, 网络推断算法, 机器学习 | 机器学习模型 | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 968 | 2025-10-05 |
CD44 as a novel therapeutic target in pulmonary arterial hypertension: Insights from multi-omics integration and molecular docking
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0332817
PMID:40971695
|
研究论文 | 本研究通过多组学整合和分子对接分析，探讨CD44在肺动脉高压炎症过程中的作用及治疗潜力 | 首次发现CD44在肺动脉平滑肌细胞中高表达并参与血管炎症和重塑，通过分子对接揭示孕酮与CD44的潜在相互作用 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证CD44与孕酮相互作用的生物学功能 | 探索CD44在肺动脉高压发病机制中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 特发性肺动脉高压患者和肺动脉细胞 | 生物信息学 | 肺动脉高压 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子对接 | NA | 基因表达数据 | 特发性肺动脉高压患者的RNA-seq数据和肺动脉细胞的单细胞RNA-seq数据 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 969 | 2025-10-05 |
Exploratory trajectory inference reveals convergent lineages for CD8 T cells in chronic LCMV infection
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0332406
PMID:40971956
|
研究论文 | 提出探索性轨迹推断方法，用于解析单细胞RNA测序数据中的复杂分化轨迹拓扑结构 | 开发了探索性轨迹推断方法，能够识别收敛性分化轨迹，解决了传统方法难以解析复杂分化拓扑的难题 | 方法主要针对单细胞RNA测序数据，在其他数据类型上的适用性需要进一步验证 | 开发新的轨迹推断方法以解析细胞分化过程中的复杂拓扑结构 | 慢性LCMV感染过程中的CD8 T细胞 | 单细胞基因组学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序，RNA速度分析，过继转移实验 | 探索性轨迹推断，基于模拟的轨迹推断 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 970 | 2025-10-05 |
Linking transcriptome and morphology in bone cells at cellular resolution with generative AI
2024-Dec-31, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/jbmr/zjae151
PMID:39303095
|
观点文章 | 探讨生成式AI在骨细胞转录组与形态学关联分析中的应用前景与挑战 | 首次系统提出将生成式AI应用于骨细胞多模态数据整合分析，实现细胞分辨率下的转录组与形态学关联研究 | 骨单细胞数据集存在技术偏差、重要骨细胞类型缺乏分析、空间信息不足等问题 | 推动生成式AI在骨细胞生物学研究中的应用，揭示细胞水平的复杂生物过程 | 骨细胞 | 计算机视觉,自然语言处理,机器学习 | 骨科疾病 | 单细胞测序,空间转录组学 | 生成式AI | 组织学图像,单细胞分子数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 971 | 2025-10-05 |
Substrate Stiffness Dictates Unique Doxorubicin-induced Senescence-associated Secretory Phenotypes and Transcriptomic Signatures in Human Pulmonary Fibroblasts
2024-Nov-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.18.623471
PMID:39605579
|
研究论文 | 研究机械张力通过基质刚度调控人肺成纤维细胞衰老相关分泌表型和转录组特征 | 首次揭示基质刚度特异性影响多柔比星诱导的细胞衰老和SASP表型，并发现高刚度驱动的胶原蛋白富集特征 | 研究主要基于体外细胞模型，体内验证相对有限 | 探究机械力刺激对细胞衰老和衰老相关分泌表型的影响机制 | 人原代肺成纤维细胞（IMR-90）和小鼠肺纤维化模型 | 细胞生物学 | 肺纤维化 | 质谱分析、转录组测序、单细胞RNA测序、计算元分析 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 人原代肺成纤维细胞在不同刚度基质上的培养模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 972 | 2025-10-05 |
Spatial analysis reveals targetable macrophage-mediated mechanisms of immune evasion in hepatocellular carcinoma minimal residual disease
2024-Oct, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00828-8
PMID:39304772
|
研究论文 | 通过空间分析揭示肝细胞癌微小残留病中巨噬细胞介导的免疫逃逸机制 | 首次通过单细胞高plex细胞成像和空间转录组学识别PD-L1+M2样巨噬细胞与干细胞样肿瘤细胞的空间互作机制 | 研究样本量相对有限（108例患者），且主要基于小鼠模型验证 | 探索肝细胞癌微小残留病的免疫逃逸机制及治疗靶点 | 肝细胞癌患者样本（108例，107万个细胞）和转基因小鼠模型 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞高plex细胞成像，空间转录组学 | 转基因小鼠模型，同源原位移植模型 | 空间成像数据，转录组数据 | 108例患者，107万个细胞 | NA | 单细胞成像，空间转录组学 | NA | NA |
| 973 | 2025-10-05 |
Spatial Transcriptomics Identifies Cellular and Molecular Characteristics of Scleroderma Skin Lesions: Pilot Study in Juvenile Scleroderma
2024-Aug-23, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25179182
PMID:39273131
|
研究论文 | 本研究首次利用空间转录组学技术分析幼年硬皮病患者皮肤病变的细胞和分子特征 | 首次将Visium CytAssist空间转录组学平台应用于幼年硬皮病皮肤病变研究，并结合单细胞RNA测序数据进行验证 | 初步研究，样本量有限 | 探索幼年硬皮病皮肤病变的细胞和分子机制 | 幼年硬皮病患者的皮肤病变组织 | 数字病理学 | 硬皮病 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 幼年硬皮病患者皮肤病变组织（具体数量未明确） | 10x Genomics | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | Visium CytAssist | Visium CytAssist空间转录组学平台 |
| 974 | 2025-10-05 |
Optimizing cryopreservation of nasal polyp tissue for cellular functional studies and single-cell RNA sequencing
2024-May, International forum of allergy & rhinology
IF:7.2Q1
DOI:10.1002/alr.23275
PMID:37742089
|
研究论文 | 比较不同冷冻保存方法对鼻息肉组织细胞功能和单细胞RNA测序的影响 | 首次系统评估鼻息肉组织不同冷冻保存方法对特定细胞类型功能和单细胞测序的影响 | 仅针对鼻息肉组织，研究结果可能不适用于其他组织类型 | 优化鼻息肉组织的冷冻保存方法以支持细胞功能研究和单细胞RNA测序 | 鼻息肉组织样本 | 单细胞测序 | 鼻息肉 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 975 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing analysis of mouse cochlea identifies a novel proinflammatory CD74+CD14+ macrophage subset in mice with age-related and noise-induced hearing loss
2025-Oct, Hearing research
IF:2.5Q1
DOI:10.1016/j.heares.2025.109376
PMID:40743638
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠耳蜗免疫细胞，发现与年龄相关和噪声性听力损失相关的促炎性CD74+CD14+巨噬细胞亚群 | 首次在年龄相关和噪声性听力损失中鉴定出CD74+CD14+巨噬细胞亚群，并揭示其与螺旋神经节神经元的增强细胞通讯 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究年龄相关和噪声性听力损失中耳蜗免疫微环境的变化 | 小鼠耳蜗免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 976 | 2025-10-05 |
Elucidating cellular origins and TME dynamic evolution in NSCLC through multi-omics technologies
2025-Oct, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189425
PMID:40840819
|
综述 | 通过多组学技术解析非小细胞肺癌的细胞起源及肿瘤微环境动态演化 | 整合单细胞/空间转录组学揭示AT2细胞起源、SOX2/WNT/YAP通路驱动的谱系可塑性，并识别CXCL13CD8T细胞、apCAFs等新型治疗靶点 | 时空异质性解析存在挑战，需AI驱动建模提升分辨率 | 阐明NSCLC细胞起源与肿瘤微环境动态演化机制 | 非小细胞肺癌（重点肺腺癌）及其肿瘤微环境组成细胞 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 多组学技术 | AI驱动建模 | 转录组数据, 空间分布数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 977 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals transcriptomic landscape and potential targets for large/giant congenital melanocytic nevi
2025-Sep-20, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf360
PMID:40974031
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了大/巨型先天性黑色素细胞痣的转录组景观和潜在治疗靶点 | 首次在L/GCMN研究中应用单细胞技术，发现TBX2作为黑色素细胞亚群的核心转录因子，并鉴定PTN-PTPRZ1和IGF1-IGF1R信号通路的异常激活 | 样本量有限，需要更大规模研究验证发现 | 阐明L/GCMN皮肤微环境中细胞的转录组特征，探索黑色素细胞病理变化的关键分子机制 | L/GCMN患者的病变和非病变皮肤样本，健康皮肤样本，原代痣黑色素细胞 | 单细胞转录组学 | 先天性黑色素细胞痣 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 蛋白质印迹, qRT-PCR, 免疫组织化学, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据, 蛋白质表达数据 | L/GCMN患者和健康对照的皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 978 | 2025-10-05 |
Single-cell profiling of peripheral and local immune compartments reveal unique genotype-independent prognostic immune signatures across IDH-stratified glioma
2025-Sep-20, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf206
PMID:40974256
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析IDH突变型和野生型胶质瘤的局部与外周免疫环境，揭示基因型独立的预后免疫特征 | 首次系统比较胶质瘤局部与外周免疫 compartments，发现独特的GZMH+ CD8+ T细胞群和具有补体交互特征的微胶质样细胞 | 样本量较小（18例患者），需要更大规模验证 | 表征IDH分层胶质瘤的免疫微环境特征及其预后价值 | IDH突变型和野生型胶质瘤患者 | 单细胞基因组学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18例胶质瘤患者（6例IDH突变型，12例IDH野生型） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 979 | 2025-10-05 |
HIF-1α-induced microglia-mediated neuroinflammation is involved in Alzheimer's disease: Evidence from single-cell transcriptomic analysis
2025-Sep-19, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.1177/13872877251378007
PMID:40971318
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了HIF-1α调控的小胶质细胞亚群在阿尔茨海默病神经炎症中的作用 | 首次识别出具有炎症-血管生成转录特征的微胶质细胞亚群microglia_2，并证实HIF-1α是其关键调控因子 | 研究主要基于5×FAD小鼠模型，在人类患者中的验证仍需进一步研究 | 探究阿尔茨海默病中小胶质细胞亚群的多样性及其致病活性的调控机制 | AD患者和5×FAD小鼠模型的微胶质细胞 | 单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, SCENIC分析, 伪时间轨迹分析 | NA | 基因表达数据 | AD患者和5×FAD小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 980 | 2025-10-05 |
Cancer-associated fibroblasts drive lung adenocarcinoma progression via THBS2-mediated epithelial-mesenchymal transition
2025-Sep-19, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03569-9
PMID:40973793
|
研究论文 | 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞通过THBS2介导的上皮-间质转化驱动肺腺癌进展的机制 | 首次发现高表达THBS2的基质CAF亚型在肺腺癌进展中的关键作用，并阐明THBS2-SDC4-EMT信号轴 | NA | 解析肺腺癌进展过程中肿瘤-基质相互作用的动态变化 | 人肺腺癌组织样本，包括原位腺癌、微浸润腺癌和浸润性腺癌 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫组化 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |