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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 961 | 2025-12-19 |
WNT10A-SMOC2-LRP4 network affects permanent tooth development via potential tooth-bone interaction
2025-Dec-17, BMC oral health
IF:2.6Q1
DOI:10.1186/s12903-025-06451-y
PMID:41408627
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研究论文 | 本文报道了一例非综合征性牙齿缺失病例,通过遗传分析和单细胞RNA-seq数据重分析,揭示了WNT10A-SMOC2-LRP4网络通过潜在牙齿-骨骼相互作用影响恒牙发育的机制 | 首次在非综合征性牙齿缺失病例中同时发现WNT10A、SMOC2和LRP4基因变异,并揭示了LRP4阳性牙槽骨细胞通过FGF信号调控WNT10A和SMOC2阳性牙髓细胞的新机制 | 研究基于单一样本,样本量有限,需要更多病例验证;机制研究主要依赖数据重分析和免疫荧光染色,缺乏功能实验验证 | 探索下颌环境对非综合征性牙齿缺失的影响,特别是牙齿缺失相关基因与骨形成相关基因的相互作用网络 | 一名19岁非综合征性牙齿缺失患者及其遗传变异,以及人类磨牙及周围组织的单细胞RNA-seq数据集 | 数字病理学 | 牙齿缺失 | 全外显子组测序,Sanger测序,单细胞RNA-seq,免疫荧光染色,锥形束计算机断层扫描 | NA | 遗传数据,单细胞RNA-seq数据,影像数据 | 1名患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 962 | 2025-12-19 |
Injury-Activated ERMs Undergo EMT and May Contribute to Periodontal Repair
2025-Dec-17, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251397858
PMID:41408679
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研究论文 | 本研究探讨了损伤激活的上皮马氏残余(ERMs)在牙周修复中的作用,通过分析其在发育和损伤响应中的行为变化 | 揭示了损伤激活的ERMs经历上皮-间质转化(EMT),并可能通过表达Wnt通路成分和基质重塑参与牙周修复 | 研究主要基于小鼠模型和人类组织样本,可能未完全涵盖所有牙周损伤类型或临床变异性 | 探究ERMs在牙周损伤修复中的激活机制和功能贡献 | 小鼠和人类牙周组织中的上皮马氏残余(ERMs) | 数字病理学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学(IHC),Wnt谱系示踪 | NA | 基因表达数据,组织图像 | 涉及小鼠牙周损伤模型和人类组织样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 963 | 2025-12-19 |
cGAS-STING pathway reprograms macrophage polarization and is highly expressed in responding tumors after neoadjuvant immunotherapy in head and neck carcinoma
2025-Dec-17, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025209
PMID:41408831
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研究论文 | 本研究探讨了cGAS-STING通路在头颈鳞状细胞癌抗肿瘤免疫中的作用,并评估了STING激动剂的治疗潜力 | 首次系统性地结合临床数据分析、体外实验和单细胞RNA测序,揭示了STING激动剂MSA-2能够重编程肿瘤相关巨噬细胞向M1表型极化,并证实该通路在免疫治疗应答患者中高表达 | 研究主要基于体外细胞实验和回顾性临床数据分析,缺乏体内动物模型验证和前瞻性临床试验数据 | 评估cGAS-STING通路在头颈鳞状细胞癌抗肿瘤免疫中的功能作用及STING激动剂的治疗潜力 | 头颈鳞状细胞癌患者临床样本、TCGA-HNSC数据集、RAW 264.7巨噬细胞系 | 肿瘤免疫学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组化、细胞共培养 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、流式细胞数据、免疫组化图像 | TCGA-HNSC数据集、临床样本(数量未明确)、单细胞RNA测序数据来自接受新辅助免疫治疗的HNSCC患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 964 | 2025-12-19 |
Single-cell profiling of bone metastasis ecosystems reveals pivotal role of INSR+AEC in clear cell renal cell carcinoma
2025-Dec-16, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102650
PMID:41406889
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和大规模批量队列数据,揭示了透明细胞肾细胞癌骨转移生态系统中INSR+动脉内皮细胞的关键作用及其与肿瘤细胞通过COL4A1-SDC4轴进行的信号交流 | 首次在人类骨转移微环境中定义了以TCF4相关的INSR+动脉内皮细胞为中心的促转移血管生态位,并鉴定出连接内皮细胞与肿瘤细胞的COL4A1-SDC4信号轴,开发了基于INSR+动脉内皮细胞程序的新型预后特征 | 研究主要基于观察性数据和体外实验,体内功能验证和临床转化潜力有待进一步探索 | 阐明透明细胞肾细胞癌骨转移微环境的细胞和空间结构,识别可干预的治疗靶点 | 透明细胞肾细胞癌患者的骨转移组织样本 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | 多种计算流程整合分析 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量转录组数据 | 多个独立队列的患者样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 965 | 2025-12-19 |
Exploration of precise classification and therapeutic targets of breast cancer based on genes related to neuro-cancer crosstalk
2025-Dec-16, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102647
PMID:41406890
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研究论文 | 本研究基于神经-癌症串扰相关基因,探索乳腺癌的精确分类和治疗靶点 | 利用TCGA/GEO转录组和单细胞数据,开发了神经-癌症串扰预后特征,并揭示了由MIF和MDK信号通路主导的神经-免疫-肿瘤相互作用网络 | NA | 探索乳腺癌中神经-癌症串扰的调控机制,并建立预后模型以识别潜在治疗靶点 | 乳腺癌患者及其相关转录组和单细胞数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | LASSO-Cox回归风险评分模型 | 转录组数据,单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 966 | 2025-12-19 |
Physical activity decreases cancer burden by alleviating immunosenescence-related inflammation and improving overall immunity
2025-Dec-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102484
PMID:41406938
|
研究论文 | 本研究通过队列研究和实验分析,揭示了体育锻炼通过减轻免疫衰老相关炎症和增强整体免疫力来降低癌症负担的机制 | 首次系统性地将体育锻炼与癌症风险降低通过免疫衰老和炎症途径联系起来,并利用单细胞测序等多种技术验证了机制 | 研究主要基于观察性队列和动物模型,因果关系需进一步验证,且样本主要来自英美人群,可能限制普适性 | 探究体育锻炼与癌症发病率及死亡率之间的关联及其潜在机制 | 英国和美国的443,768名成年人,以及小鼠和仓鼠动物模型 | 生物医学研究 | 癌症 | 单细胞测序, RNA测序, 流式细胞术, 炎症阵列 | NA | 队列数据, 基因表达数据, 细胞计数数据 | 443,768名成年人,以及小鼠和仓鼠动物模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 967 | 2025-12-19 |
A mouse organoid platform for modeling cerebral cortex development and cis-regulatory evolution in vitro
2025-Dec-15, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.08.001
PMID:40876454
|
研究论文 | 本研究开发了一种从小鼠外胚层干细胞生成大脑皮层类器官的可重复方案,并利用该平台结合单细胞RNA测序技术,研究了不同小鼠亚种间皮层发育的顺式调控进化差异 | 首次建立了可重复的小鼠大脑皮层类器官生成方案,并利用F1杂交干细胞结合单细胞测序技术,系统绘制了发育过程中皮层细胞类型的顺式调控变异图谱 | 研究仅限于小鼠模型,且类器官系统可能无法完全模拟体内发育的复杂性 | 研究大脑皮层发育的基因调控网络及其在哺乳动物进化中的变异机制 | 小鼠大脑皮层类器官,来源于实验室小鼠(C57BL/6J)与四种野生近交系杂交的F1代外胚层干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 来源于5个小鼠品系(C57BL/6J及4个野生近交系)杂交的F1代外胚层干细胞生成的皮层类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 968 | 2025-12-19 |
Large-scale single-cell profiling of stem cells identifies redundant regulators of shoot development and yield trait variation
2025-Dec-15, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.07.024
PMID:40865519
|
研究论文 | 本研究通过大规模单细胞RNA测序分析玉米和拟南芥的茎尖分生组织,鉴定出保守的干细胞调控因子,并揭示了这些因子与谷物产量性状的关联 | 首次在植物中通过优化的单细胞测序技术捕获大量CLAVATA3和WUSCHEL表达的稀有干细胞,并跨物种比较鉴定出深度保守的调控因子 | 未明确说明样本处理的潜在批次效应或技术重复的统计验证细节 | 鉴定植物茎尖干细胞的关键调控因子及其与作物产量性状的关联 | 玉米和拟南芥的茎尖分生组织干细胞 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 数千个表达CLAVATA3和WUSCHEL的干细胞(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 969 | 2025-12-19 |
Single-cell transcriptomic analysis highlights specific cell types manipulated by Fusarium head blight fungus leading to wheat susceptibility
2025-Dec-15, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.07.022
PMID:40845857
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术,分析了小麦胚芽鞘对适应性和非适应性镰刀菌感染的细胞类型特异性响应 | 首次应用单细胞RNA测序于小麦-真菌互作研究,揭示了不同细胞类型在非宿主抗性和易感性中的差异化免疫响应 | 研究仅关注了接种后1-3天的早期响应,未涵盖整个疾病进程;样本量虽大但限于特定时间点 | 探究小麦在适应性和非适应性镰刀菌感染下的细胞类型特异性转录组响应机制 | 小麦胚芽鞘细胞 | 植物病理学与单细胞组学 | 小麦赤霉病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 超过90,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 970 | 2025-12-19 |
Divergence of immune cell types in chordate blood
2025-Dec-15, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2025.10.032
PMID:41237770
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序等技术,定义了海鞘Ciona robusta血细胞的身份,揭示了其分化层次和主要谱系,扩展了脊索动物免疫细胞的已知库 | 首次在无脊椎动物海鞘中通过单细胞RNA测序、原位杂交和活体报告系统全面定义血细胞状态,揭示了与脊椎动物免疫细胞的广泛分歧 | 研究主要基于海鞘这一特定物种,可能无法完全代表所有无脊椎动物或脊索动物的免疫细胞进化情况 | 研究脊索动物血细胞类型的进化分歧,特别是无脊椎动物与脊椎动物免疫细胞的同源性 | 海鞘Ciona robusta的循环血细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 原位杂交, 活体报告系统 | NA | 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | 未明确指定样本数量,但涉及Ciona robusta的循环血细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 971 | 2025-12-19 |
Mitochondrial complex II orchestrates divergent effects in CD4+ and CD8+ T cells
2025-Dec-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI194134
PMID:41392980
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研究论文 | 本研究揭示了线粒体复合物II在CD4+和CD8+T细胞中具有相反的调控作用,影响其代谢和功能 | 首次系统阐明了线粒体复合物II在CD4+和CD8+T细胞中的差异化调控机制,发现其在CD8+T细胞中缺失反而能增强抗肿瘤功能 | 研究主要基于小鼠模型,在人类T细胞中的适用性需要进一步验证;机制细节如代谢产物如何精确调控基因表达仍需深入探索 | 探究线粒体复合物II在不同T细胞亚群中的特异性作用机制 | CD4+和CD8+T细胞 | 免疫学 | 肿瘤免疫 | 单细胞RNA测序,代谢谱分析 | NA | 基因表达数据,代谢数据 | 使用SDHA缺陷型小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 972 | 2025-12-19 |
scRepli-RamDA-seq: a multi-omics technology enabling the analysis of gene expression dynamics during S-phase
2025-Dec-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64688-1
PMID:41397953
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scRepli-RamDA-seq(scRR-seq)的新型单细胞多组学技术,该技术能够在同一单细胞中以单倍型特异性方式分析DNA复制谱和全长总RNA测序 | 首次开发出能够同时监测S期进展过程中基因表达动态的单细胞多组学方法,并可根据DNA复制数据确定细胞的S期阶段 | 未在摘要中明确说明 | 开发一种能够分析S期基因表达动态的单细胞多组学技术 | 单细胞 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞DNA复制谱分析、全长总RNA测序 | NA | DNA复制数据、RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 973 | 2025-12-19 |
ER-phagy and proteostasis defects prime pancreatic epithelial state changes in KRAS-mediated oncogenesis
2025-Dec-15, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.07.016
PMID:40816286
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研究论文 | 本文揭示了KRAS介导的胰腺癌发生中,ER-phagy缺陷和蛋白稳态失调如何驱动胰腺腺泡细胞的化生状态转变 | 发现KRAS激活导致ER-phagy的零星失败,进而引发ER蛋白(如REG3B)的病理性聚集,这直接驱动了腺泡-导管化生(ADM)和癌变,揭示了蛋白聚集作为癌基因合作因子的新机制 | 研究主要基于基因工程小鼠模型,人类胰腺癌中的直接验证尚需进一步研究 | 探究KRAS介导的胰腺癌发生过程中,ER-phagy和蛋白稳态缺陷在细胞状态转变中的作用 | 胰腺腺泡细胞及其在KRAS激活下的化生转变 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 空间转录组学、蛋白质组学、高分辨率成像 | 基因工程小鼠模型 | 转录组数据、蛋白质数据、图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 974 | 2025-12-19 |
Molecular Signatures and Signaling Interactions of the Hair Follicle Stem Cell Niche
2025-Dec-15, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.11.021
PMID:41407191
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析,定义了毛囊干细胞及其微环境(包括真皮乳头、毛胚干细胞和隆起干细胞)的转录组特征,揭示了细胞间信号交互作用 | 首次通过流式分选和全转录组测量,以高灵敏度分类细胞类型特异性分子特征,并结合多年研究数据发现新的基因表达程序 | 研究仅基于小鼠背部皮肤样本,可能不适用于其他物种或身体部位,且单细胞技术仍存在检测灵敏度限制 | 研究毛囊干细胞微环境中的信号交互作用和分子特征,以理解毛囊生长调控机制 | 小鼠背部皮肤中的真皮乳头、毛胚干细胞、隆起干细胞、表皮细胞、毛囊细胞和真皮成纤维细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学、流式分选、全转录组测量、配体-受体映射、CellChat分析 | NA | 转录组数据 | 来自四个相邻小鼠背部皮肤区域的细胞群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 975 | 2025-12-19 |
Safety and efficacy of AAV8-aflibercept in treating choroidal neovascularization via single-cell RNA sequencing
2025-Dec-11, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2025.101625
PMID:41399432
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序评估了AAV8-aflibercept治疗小鼠脉络膜新生血管的安全性和有效性 | 利用单细胞RNA测序技术深入探究AAV8-aflibercept治疗对小鼠视网膜的细胞层面影响,并识别了12种不同的细胞类型 | 研究仅基于小鼠模型,且在高剂量(超过1×10 GC/眼)下观察到视网膜变薄和视网膜色素上皮细胞改变 | 评估AAV8-aflibercept治疗脉络膜新生血管的疗效和安全性 | 小鼠模型中的脉络膜新生血管 | 数字病理学 | 脉络膜新生血管 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 976 | 2025-12-19 |
PEGylated black-phosphorus nanosheet-alginate hydrogels enable local PRRX1 delivery to drive fibroblast reprogramming in intestinal fibrosis
2025-Dec-05, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03896-9
PMID:41350883
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定出克罗恩病肠道纤维化中的关键转录因子PRRX1,并开发了一种新型水凝胶递送系统用于局部PRRX1递送,以驱动成纤维细胞重编程 | 首次将PRRX1确定为肠道纤维化的核心调控因子,并创新性地开发了基于聚乙二醇化黑磷-海藻酸盐水凝胶的局部递送系统,用于在体内外验证其功能 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,在人体内的长期安全性和有效性仍需进一步验证 | 阐明肠道纤维化的核心调控机制并开发靶向治疗策略 | 克罗恩病患者的成纤维细胞、小鼠模型(Col1a2-Cre; Prrx1)、人类肠道成纤维细胞 | 单细胞组学与生物材料 | 克罗恩病(肠道纤维化) | 单细胞RNA测序、ChIP-seq、报告基因检测、蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质数据、基因组数据 | 来自克罗恩病患者的配对纤维化和非纤维化回肠组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 977 | 2025-12-19 |
Prehabilitation during neoadjuvant chemotherapy results in an enhanced immune response in esophageal adenocarcinoma tumors: A randomized controlled trial
2025-Dec, Journal of sport and health science
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.jshs.2025.101063
PMID:40499717
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研究论文 | 本研究通过一项随机对照试验,探讨了在新辅助化疗期间进行预康复运动训练对局部晚期食管腺癌患者肿瘤免疫反应的影响 | 首次通过随机对照试验证明,新辅助化疗期间的预康复运动训练能显著增加食管腺癌肿瘤中的CD8+淋巴细胞浸润、NK细胞比例以及三级淋巴结构的成熟度 | 样本量较小(n=22),且未观察到预康复组与对照组在生存率、治疗耐受性或肿瘤再分级等临床结局上的显著差异 | 确定预康复运动训练是否能增加肿瘤浸润淋巴细胞,并探讨其作为新辅助化疗期间免疫佐剂的潜力 | 局部晚期食管癌患者 | 数字病理学 | 食管癌 | 高分辨率多重光谱免疫组化,空间转录组学 | NA | 组织图像,基因表达数据 | 22名局部晚期食管癌患者(预康复组11人,对照组11人) | NanoString | 空间转录组学 | NA | NA |
| 978 | 2025-12-19 |
Transforming histologic assessment: artificial intelligence in cancer diagnosis and personalized treatment
2025-Dec, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03206-y
PMID:40993310
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综述 | 本文综述了人工智能在癌症组织学评估中的转型作用,从辅助诊断工具发展为临床决策的核心组成部分 | AI不仅复制并增强了病理学家的决策,还通过组织形态学表型聚类和空间转录组学等创新技术,实现了癌症分层和个性化治疗的精细化 | AI预测的验证仍面临挑战,特别是在预后应用方面,且资源有限环境中的可及性有待保障 | 探讨人工智能在癌症诊断和个性化治疗中如何变革组织学评估,并推动其临床整合 | 癌症患者的组织学图像(如全切片图像WSIs)及其相关的基因组和临床数据 | 数字病理学 | 癌症 | 深度学习 | NA | 图像、文本、临床数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 979 | 2025-12-19 |
αCGRP deficiency aggravates pulmonary fibrosis by promoting senescence in alveolar type 2 cells
2025-Dec, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00361-3
PMID:41023452
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研究论文 | 本研究探讨了αCGRP缺乏通过促进肺泡II型细胞衰老而加剧肺纤维化的机制 | 首次揭示了αCGRP缺乏通过扰乱AT2细胞脂质代谢和加速炎症性衰老来促进肺纤维化的新机制 | 样本量较小(n=15),且为回顾性分析;动物模型可能无法完全模拟人类疾病进程 | 探究αCGRP缺乏在肺纤维化发病机制中的作用 | 肺纤维化患者、Calca基因敲除大鼠、D-半乳糖诱导的衰老模型 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序、无标记蛋白质组学、免疫组织化学 | NA | 临床数据、组织样本、测序数据、蛋白质组数据 | 15例肺纤维化患者样本及基因敲除大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 980 | 2025-12-19 |
Non-cell-autonomous control of mouse gastruloid development by the ultra-conserved lncRNA T-UCstem1
2025-Dec, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00558-2
PMID:41174250
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研究论文 | 本研究探讨了超保守长链非编码RNA T-UCstem1在小鼠胃胚体发育中的非细胞自主调控作用 | 首次揭示了T-UCstem1通过调控DKK1依赖性WNT通路以非细胞自主方式影响胃胚体发育和前后轴延伸 | 研究基于干细胞模型,可能无法完全模拟体内胚胎发育的复杂性 | 探究超保守lncRNA在哺乳动物体轴形成中的功能 | 小鼠胃胚体 | 发育生物学 | NA | 形态学成像、免疫荧光分析、bulk转录组学、单细胞转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |