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当前共找到 37326 篇文献，本页显示第 961 - 980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 961 | 2026-03-02 |
Spatial Single-cell Transcriptome Atlas of Mouse Thymus Reveals the T Lymphocyte Dynamics During Development
2026-Mar-01, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzag020
PMID:41764407
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研究论文 | 本研究通过空间单细胞转录组图谱揭示了小鼠胸腺在发育过程中的T淋巴细胞动态变化 | 首次构建了小鼠胸腺在四个发育阶段的空间单细胞转录组图谱，揭示了胸腺细胞组成和转录谱的动态重塑，特别是DP-T细胞亚群的空间分布和DC-DP-2相互作用的MHC-II通路富集 | 研究仅基于小鼠模型，未涉及人类样本；样本量相对有限（四个时间点）；空间分析分辨率可能受技术限制 | 解析胸腺微环境中淋巴细胞发育的分子动力学和空间组织 | 小鼠胸腺组织在3、9、15和33周四个发育阶段的免疫细胞 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | 空间轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 四个发育阶段（3、9、15、33周）的小鼠胸腺样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 962 | 2026-03-02 |
Predicting Macrophage Spatial Localization from Single-Cell Transcriptomes to Uncover Disease Mechanisms
2026-Feb-28, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202410924
PMID:41762738
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研究论文 | 本研究开发了一种名为MERLIN的算法，用于从单细胞RNA测序数据中重建细胞在器官中的空间定位信息，以揭示疾病机制 | 开发了MERLIN算法，首次能够从单细胞转录组数据中准确预测具有区室化解剖结构器官（如肾脏和大脑）中特定免疫细胞（如巨噬细胞）的空间位置，准确率超过75%，并成功应用于疾病模型分析 | 该算法仅适用于具有明确解剖分区的器官；对于淋巴细胞等移动性较强的细胞，其空间位置无法准确预测；算法性能依赖于训练数据的质量和分区定义 | 开发一种从单细胞RNA测序数据中重建细胞空间位置信息的计算方法，以增强对疾病机制的理解 | 肾脏和大脑中的免疫细胞，特别是驻留巨噬细胞和小胶质细胞 | 机器学习 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 改进的多层感知机 | 单细胞转录组数据 | 来自三个肾脏分区的多个独立免疫细胞scRNA-seq数据集（包括小鼠和人类肾脏数据集），以及新月体肾小球肾炎、内毒素诱导和缺血/再灌注诱导的急性肾损伤模型和糖尿病肾病治疗模型的已发表数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 963 | 2026-03-02 |
Role of CTGF-LRP1 in impaired healing of cesarean section incisions
2026-Feb-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69747-9
PMID:41764198
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析剖宫产切口愈合不良的微环境，揭示了LRP1缺陷在成纤维细胞中的作用及其对细胞外基质合成的抑制机制 | 首次在剖宫产切口愈合不良（niche）组织中，通过单细胞RNA测序识别出成纤维细胞亚群中LRP1的缺陷，并阐明其通过抑制CTGF激活ERK和WNT信号通路，从而损害细胞功能 | 研究样本量相对有限（共135,793个细胞），且主要基于体外实验和动物模型，临床转化需进一步验证 | 探究剖宫产切口愈合不良（niche）的发病机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 剖宫产切口相邻子宫肌层组织、愈合良好的瘢痕组织以及niche组织中的细胞 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 135,793个单个细胞（来自48,587个相邻组织细胞、47,653个对照组细胞和39,553个niche组织细胞），以及60个组织样本（30个非愈合组 vs 30个愈合组） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 964 | 2026-03-02 |
RETN exacerbates sepsis by GBP5/NLRP3 signaling pathway-mediated pyroptosis of macrophage
2026-Feb-28, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-026-00387-1
PMID:41764353
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研究论文 | 本研究揭示了RETN通过GBP5/NLRP3信号通路调控巨噬细胞焦亡，从而加剧脓毒症的机制 | 首次证明RETN/GBP5/NLRP3信号轴在脓毒症中调控巨噬细胞焦亡的作用，为脓毒症治疗提供了新靶点 | 研究主要基于体外实验和动物模型，临床转化需进一步验证 | 探索脓毒症的致病机制并寻找潜在治疗靶点 | 巨噬细胞和脓毒症动物模型 | 生物信息学与分子生物学 | 脓毒症 | 单细胞测序、RNA-Seq、生物信息学分析 | NA | 基因表达数据 | 脓毒症患者和动物模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 965 | 2026-03-02 |
Sinusoidal cell-derived biomarker scores predict diagnosis and prognosis in chronic liver disease
2026-Feb-28, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04733-y
PMID:41764477
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研究论文 | 本研究开发了基于肝窦细胞特异性特征的生物标志物评分，用于慢性肝病的诊断和预后预测 | 首次整合肝窦内皮细胞毛细血管化、肝星状细胞活化和巨噬细胞极化的单细胞特征，创建了反映细胞去分化的肝窦评分系统 | 评分系统基于回顾性数据推导，需要前瞻性验证和临床实施 | 开发肝窦细胞特异性生物标志物，用于慢性肝病的诊断和预后评估 | 慢性肝病患者（包括内部队列和三个独立验证队列） | 数字病理学 | 慢性肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 内部队列108例患者，三个独立验证队列总计1008例患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 966 | 2026-03-02 |
Atherosclerotic Fibrous Plaques in Women Present ECM Remodeling Linked to TGF-β
2026-Feb-27, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.327624
PMID:41641539
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研究论文 | 本研究揭示了女性与男性在晚期动脉粥样硬化纤维斑块中具有不同的临床和分子特征，特别是女性纤维斑块以平滑肌细胞驱动的细胞外基质重塑和TGF-β反应为特征 | 首次系统性地结合组织学、临床特征及多组学数据（蛋白质、bulk RNA、单细胞RNA、DNA甲基化），揭示了性别差异在动脉粥样硬化纤维斑块分子机制中的作用，并利用空间转录组学定位了基因表达模式，实验验证了TGF-β/SMAD3通路在女性偏向性机制中的关键作用 | 研究样本来源于颈动脉内膜切除术患者，可能无法完全代表其他血管床的斑块特性；研究为观察性设计，因果关系需进一步实验验证 | 探究男性和女性在组织学确定的纤维斑块中的分子驱动因素差异，以理解斑块侵蚀的分子机制并为动脉粥样硬化治疗提供潜在靶点 | 人类晚期动脉粥样硬化斑块（来自颈动脉内膜切除术患者） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, DNA甲基化测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | RNA-seq数据, 甲基化数据, 蛋白质数据, 空间转录组数据 | 1889个动脉粥样硬化斑块（1309例男性，580例女性） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 967 | 2026-03-02 |
A beneficial environment promotes immune resilience through epigenetic regulation
2026-Feb-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ady7317
PMID:41758935
|
研究论文 | 本研究探讨了农场粉尘暴露如何通过表观遗传重编程增强免疫韧性，从而减轻过敏性肺部炎症 | 首次揭示了有益环境暴露通过PPARγ信号通路维持的组蛋白去乙酰化酶活性，对单核细胞来源的巨噬细胞进行表观遗传重编程的机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验，人类样本验证有限；长期效应和临床转化潜力需进一步研究 | 探究有益环境暴露对免疫系统的影响机制，寻找哮喘预防新策略 | 小鼠过敏性炎症模型、骨髓来源巨噬细胞、人类细胞 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序、ATAC-seq、RNA测序 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq、ATAC-seq | NA | NA |
| 968 | 2026-02-28 |
Correction: CiCLoDS: Joint cell clustering and gene selection for single-cell spatial transcriptomics
2026-Feb-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-42146-2
PMID:41748707
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 969 | 2026-03-02 |
Integrating histology and spatial transcriptomics via multimodal transformers and contrastive representation learning for accurate gene expression prediction
2026-Feb-26, Journal of biomedical informatics
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbi.2026.105003
PMID:41763376
|
研究论文 | 本文提出了一种统一的多模态学习框架，通过整合组织学图像和空间转录组学数据，利用多模态Transformer和对比表示学习来准确预测空间基因表达 | 该方法结合了ResNet50卷积主干和MobileViT Transformer架构，通过对比学习目标在共享潜在空间中对齐图像和转录组特征，显著提高了预测准确性 | NA | 开发一种计算工具，用于从组织学图像中高精度预测空间基因表达，以理解组织结构和分子表型 | 人类肝脏组织 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | CNN, Transformer | 图像, 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium数据集 |
| 970 | 2026-03-02 |
BST2 promotes esophageal squamous cell carcinoma progression by mediating the cell-cell interaction between cancer cells and cancer-associated fibroblasts
2026-Feb-26, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2026.01.012
PMID:41763536
|
研究论文 | 本研究探讨了BST2在食管鳞状细胞癌中通过介导癌细胞与癌症相关成纤维细胞之间的细胞间相互作用促进癌症进展的机制 | 首次建立了通过直接共培养骨髓间充质干细胞与食管鳞癌细胞生成CAF样细胞的方法，并利用此方法结合单细胞RNA测序数据揭示了BST2在癌细胞与CAFs相互作用中的关键作用 | 研究主要基于体外共培养模型和公共数据库分析，缺乏体内实验验证BST2在肿瘤微环境中的具体作用机制 | 探究BST2在食管鳞状细胞癌进展中的作用及其介导癌细胞与癌症相关成纤维细胞相互作用的机制 | 食管鳞状细胞癌细胞、骨髓来源的间充质干细胞、癌症相关成纤维细胞 | 肿瘤生物学 | 食管鳞状细胞癌 | cDNA微阵列分析、单细胞RNA测序、免疫组织化学 | 共培养模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、临床病理数据 | 未明确说明具体样本数量，但使用了公共单细胞RNA测序数据库和患者组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 971 | 2026-03-02 |
Spatial transcriptomics profiling of small intestine adenocarcinoma and adenoma in humans and a murine model with KRASG12D and loss of CDKN2a-p16
2026-Feb-26, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2026.01.013
PMID:41763535
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析人类和小鼠模型中的小肠腺癌和腺瘤，揭示了分化亚型、微环境及驱动通路 | 首次结合人类和小鼠模型的空间转录组学数据，识别小肠腺癌的分化特征和信号通路，并开发了模拟胃型和肠型腺瘤及腺癌的新型基因工程小鼠模型 | 研究未明确说明样本量大小或数据集的局限性，且空间转录组学技术可能受分辨率限制 | 确定人类和小鼠模型中小肠腺癌的分化亚型及驱动分子通路 | 人类和小鼠的小肠腺癌、腺瘤及其微环境 | 数字病理学 | 小肠腺癌 | 空间转录组学，免疫组织化学 | 基因工程小鼠模型（p16KOKrasG12D） | 空间转录组学数据，组织图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 972 | 2026-03-02 |
Functional validation gaps in single-cell RNA sequencing-defined neuronal subtypes
2026-Feb-26, Neuroscience
IF:2.9Q2
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 973 | 2026-03-02 |
Tertiary lymphoid structures correlate with reduced recurrence risk and enhanced antitumor immunity in esophageal squamous cell carcinoma with pathologic non-complete response to neoadjuvant chemoimmunotherapy
2026-Feb-25, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-026-00748-6
PMID:41736069
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研究论文 | 本研究探讨了三级淋巴结构（TLS）在食管鳞状细胞癌（ESCC）新辅助化疗免疫治疗后非病理完全缓解（non-pCR）患者中的预后价值和免疫特征 | 首次在non-pCR ESCC患者中系统评估TLS与术后复发风险及抗肿瘤免疫的关系，并利用单细胞测序和多色免疫组化揭示TLS内免疫细胞的空间定位和相互作用模式 | 研究为回顾性分析，样本量有限，且未涉及TLS形成的机制或干预策略 | 评估TLS在non-pCR ESCC中的预后意义和免疫调控作用 | 接受新辅助化疗免疫治疗的局部晚期食管鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞测序、批量RNA测序、多色免疫组化 | NA | 单细胞数据、批量RNA测序数据、免疫组化图像 | 未明确指定样本数量，但涉及临床病理特征、复发事件和生存结果分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 974 | 2026-03-02 |
Evaluation of statistical differential analysis methods for identification of senescent cells using single-cell transcriptomics
2026-Feb-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101264
PMID:41576958
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研究论文 | 本研究系统评估了Seurat包中10种差异基因表达分析方法在单细胞RNA测序数据中识别衰老细胞的性能 | 首次系统评估Seurat包中多种DGE方法在scRNA-seq数据中识别衰老细胞的性能，并推荐DESeq2为最佳方法 | 仅评估了Seurat包中的方法，未涵盖所有可用的DGE工具；基于模拟和真实数据集，但可能未覆盖所有生物学场景 | 评估单细胞转录组学中差异基因表达分析方法的性能，以优化衰老细胞的识别 | 单细胞RNA测序数据中的衰老细胞 | 生物信息学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 多种统计方法（Wilcox、DESeq2等） | 单细胞转录组数据 | 模拟和真实scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 975 | 2026-03-02 |
DMC-BrainMap is an open-source, end-to-end tool for multi-feature brain mapping in different species
2026-Feb-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101302
PMID:41666930
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研究论文 | 介绍了一个名为DMC-BrainMap的开源端到端工具，用于处理和分析不同物种的脑解剖数据 | 开发了一个用户友好的开源napari插件，无需编程即可完成从图像预处理到数据分析可视化的全流程脑图谱绘制 | NA | 为神经科学研究提供标准化的脑解剖数据处理和分析工具 | 小鼠、大鼠和斑马鱼等模式生物的脑组织数据 | 数字病理学 | NA | 组织学成像、空间转录组学 | NA | 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 976 | 2026-03-02 |
Predictive modeling of molecular activity underlying physical cell-cell interactions
2026-Feb-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101301
PMID:41672069
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Gloss的预测建模框架，用于系统性地将基因和通路活性与LIPSTIC测量的细胞间相互作用强度联系起来 | Gloss是一种创新的预测建模框架，优于基于相关性和标准回归方法，同时保持可解释性，适用于分析LIPSTIC+scRNA-seq数据 | NA | 系统性地链接基因和通路活性与细胞间物理相互作用强度，以优先驱动细胞通讯的基因和通路 | 小鼠肿瘤中的髓系-T细胞相互作用以及病毒感染期间不同T细胞亚群之间的相互作用 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | group lasso | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 977 | 2026-03-02 |
An integrative spatial multi-omic workflow for unified analysis of tumor tissue
2026-Feb-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101306
PMID:41687601
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研究论文 | 本研究提出了一种名为SMINT的空间多组学整合工作流，用于统一分析IDH突变型弥漫性胶质瘤组织，结合空间转录组学和空间代谢组学数据 | 开发了一个创新的空间多组学整合工作流，能够将空间转录组学和空间代谢组学数据在共同坐标框架下进行细胞分割和配准，并识别出肿瘤浸润边缘的独特细胞邻域 | 仅使用细胞核分割策略时仅包含40%的细胞转录本，且未考虑多核细胞的分割场景 | 开发并验证一个整合空间多组学数据的工作流，以深入理解IDH突变型胶质瘤的肿瘤微环境 | IDH突变型弥漫性胶质瘤组织 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | 空间多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 978 | 2026-03-02 |
Celastrol disrupts the inflammatory feedback loop driven by Tenascin-C⁺ fibroblast subtype in psoriasis: Insights from single-cell RNA sequencing and experimental validation
2026-Feb-21, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.157988
PMID:41763138
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序分析和实验验证，揭示了雷公藤红素通过破坏由TNC⁺成纤维细胞亚型驱动的炎症反馈环路来缓解银屑病的机制 | 首次在银屑病皮肤中鉴定出TNC⁺成纤维细胞亚型驱动的炎症反馈环路，并阐明了雷公藤红素通过多靶点调控破坏该环路的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，其结论在人体中的普适性有待进一步验证 | 探索雷公藤红素如何调控银屑病中的细胞间相互作用网络 | 小鼠银屑病样模型（IMQ诱导）及NIH-3T3成纤维细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、图像数据 | 三组小鼠（健康对照、IMQ诱导模型、雷公藤红素治疗组）的单细胞转录组数据，以及BALB/c小鼠模型和NIH-3T3细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 979 | 2026-03-02 |
Modified Shenlingbaizhu decoction suppresses colon cancer via enhancing memory-like Tfh differentiation and B cell responses
2026-Feb-21, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158001
PMID:41763139
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研究论文 | 本研究探讨了加味参苓白术散通过增强记忆样滤泡辅助性T细胞分化和B细胞反应来抑制结肠癌的机制 | 揭示了加味参苓白术散通过上调Tfh细胞中Jarid2表达，以CCL20依赖的方式促进肿瘤相关聚集体形成，从而增强Tfh/B细胞协作的新免疫治疗机制 | 研究基于小鼠结肠腺癌模型，其结论在人体中的适用性有待验证；未详细探讨MSD的具体活性成分如何调控Jarid2表达 | 探索加味参苓白术散是否调控肿瘤微环境中的抗肿瘤免疫反应 | 微卫星稳定型结肠癌小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序，流式细胞术分析，免疫荧光，酶联免疫吸附测定，高效液相色谱分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞术数据，免疫荧光图像，血清IgG浓度数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 980 | 2026-03-02 |
Poly-l-lactic acid electrospun membrane with specific morphology promotes bone regeneration through macrophage reprogramming
2026-Feb-19, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04182-y
PMID:41715106
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研究论文 | 本研究探讨了具有特定形态的聚左旋乳酸电纺膜通过巨噬细胞重编程促进骨再生的分子机制 | 通过单细胞RNA测序揭示了PLLA电纺膜通过调控巨噬细胞亚型转化（特别是M2极化）来促进骨再生的新机制，为骨免疫调节视角下的仿生材料设计提供了新见解 | 研究主要基于大鼠颅骨缺损模型，结果在人类或其他动物模型中的适用性有待验证；单细胞测序仅针对特定组别，可能未全面覆盖所有免疫微环境变化 | 探究不同形态PLLA电纺膜对骨再生的影响及其免疫调节机制 | 聚左旋乳酸电纺膜（不同排列方式和尺寸）、大鼠颅骨缺损模型、巨噬细胞和骨髓间充质干细胞 | 生物材料与组织工程 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序、电纺技术、细胞共培养 | NA | 单细胞RNA测序数据、组织学数据 | 大鼠颅骨缺损模型（具体数量未明确），涉及多个材料组别 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |