单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 41493 篇文献，本页显示第 961 - 980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 961 | 2026-07-02 |
Ferroptosis in heart failure: from molecular insights to therapeutic implications
2026-Mar-26, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvag019
PMID:41616804
|
综述 | 本文综述了铁死亡在心力衰竭中的作用机制，从分子层面到治疗应用进行了全面分析 | 提出了'铁死亡中枢'概念框架，将铁动员、抗氧化崩溃、脂质启动和线粒体/钙放大器形成一个自我增强循环导致泵衰竭的新机制 | 铁死亡与心力衰竭之间的明确因果关系尚未建立，并且缺乏标准化的铁死亡特征和机制驱动的临床试验 | 探讨铁死亡在心力衰竭中的作用机制及潜在治疗策略 | 心力衰竭动物模型及人类心肌和心外膜脂肪组织 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 962 | 2026-07-02 |
Spatially-resolved single cell atlas of liposarcoma reveals lineage hierarchies, immune niches, and regulatory circuits
2026-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.23.713651
PMID:41929055
|
研究论文 | 利用单核多组学测序、表观基因组谱分析和空间转录组学技术，构建了脂肪肉瘤的空间分辨单细胞图谱，揭示了其谱系层次、免疫微环境和调控回路 | 首次在单细胞和空间分辨率下系统表征了高分化与去分化脂肪肉瘤的细胞和表观遗传异质性，发现了新的基因调控回路和中间亚型 | 未提供明确的局限性信息 | 阐明脂肪肉瘤不同亚型之间的细胞和表观遗传异质性 | 高分化脂肪肉瘤和去分化脂肪肉瘤的肿瘤及免疫细胞 | 机器学习和数字病理学 | 脂肪肉瘤 | 单核多组学测序、表观基因组谱分析、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、表观基因组数据、空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞多组学、空间转录组学 | 10x Chromium | 单核多组学测序和空间转录组学平台 |
| 963 | 2026-07-02 |
MAP4K2 suppresses antitumor immunity in a pancreatic cancer model by promoting Treg differentiation
2026-Mar-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI196379
PMID:41615953
|
研究论文 | 该研究揭示了MAP4K2通过促进Treg细胞分化抑制抗肿瘤免疫的机制 | 首次发现MAP4K2通过磷酸化DDX39B诱导其核转位，进而促进Foxp3 RNA剪接和Treg分化，并证明靶向MAP4K2可增强胰腺癌免疫治疗效果 | 研究主要基于小鼠模型，临床样本分析仅限于scRNA-seq数据，缺乏直接的人体干预验证 | 阐明MAP4K2在免疫调节中的体内功能及其在肿瘤免疫抑制中的作用机制 | T细胞特异性Map4k2条件敲除小鼠及胰腺癌患者 | 机器学习 | 胰腺癌 | scRNA-seq, 质谱分析, 基因敲除 | NA | 基因表达数据 | T细胞特异性Map4k2条件敲除小鼠及胰腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 964 | 2026-07-02 |
A protective role of ECSIT in chemotherapy-induced intestinal mucositis by maintaining Lgr5+ intestinal stem cells and gut homeostasis
2026-Mar-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2026.124236
PMID:41611204
|
research paper | 本研究揭示了ECSIT在化疗所致肠黏膜炎中通过维持Lgr5+肠道干细胞和肠道稳态发挥保护作用 | 首次阐明了ECSIT通过稳定β-catenin复合物并调控Wnt信号通路来维持肠道干细胞平衡和黏膜修复的双重作用机制 | 未提及具体局限性 | 阐明ECSIT在化疗所致肠黏膜炎中对肠道干细胞平衡和黏膜修复的作用，特别是Wnt/β-catenin通路 | Lgr5+肠道干细胞和肠道上皮细胞 | 数字病理学 | 化疗所致肠黏膜炎 | 多组学分析、基因编辑、单细胞测序 | NA | 多组学数据、单细胞测序数据 | 肠道上皮特异性敲除小鼠和Lgr5特异性诱导敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 965 | 2026-07-02 |
IL-33 promotes rheumatoid arthritis progression by enhancing pro-inflammatory macrophage development in the synovial microenvironment
2026-Mar-11, Clinical science (London, England : 1979)
DOI:10.1042/CS20258645
PMID:41615676
|
研究论文 | 研究IL-33在类风湿关节炎滑膜微环境中促进促炎性巨噬细胞分化，进而推动疾病进展的机制 | 首次揭示IL-33在RA滑膜液中与疾病活动度及自身免疫标志物的相关性比血清更强，并阐明IL-33/ST2信号通过MAPK/NF-κB通路促进单核细胞分化为促炎性巨噬细胞，形成炎症正反馈循环 | 未提及具体局限性，但样本量可能有限，且需进一步在更大队列中验证 | 探索IL-33在RA滑膜微环境中的作用，尤其是在促进促炎性巨噬细胞分化中的关键功能，为治疗抵抗患者提供新靶点 | 类风湿关节炎患者及滑膜微环境中的免疫细胞 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 多重免疫组化, 单细胞RNA测序, KEGG富集分析, 细胞实验 | NA | 血清和滑膜液样本, 单细胞转录组数据 | 匹配的RA患者血清和滑膜液样本（数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 966 | 2026-07-02 |
Mapping biology in space: from spatial transcriptomics platforms to analytical tools and databases
2026-Feb-28, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2026.01.034
PMID:41611568
|
综述 | 系统总结了截至2025年9月的77种空间转录组学技术和594种分析工具，涵盖完整分析流程、平台依赖性考量以及空间多组学整合，并构建了持续更新的SpatialToolDB数据库平台 | 首次对空间转录组学分析工具进行大规模系统梳理（594种工具），并开发了整合技术、方法和数据库的持续更新平台SpatialToolDB，为平台选择和工具比较提供数据驱动基础 | 未明确说明具体局限性，但文中提及技术选择、方法比较和数据解释仍面临挑战，且部分工具性能可能受空间分辨率和检测效率差异影响 | 系统综述空间转录组学技术平台和分析工具，为生物医学研究中的平台选择和策略制定提供指导 | 空间转录组学技术、分析工具及相关数据库 | 计算机视觉, 机器学习 | NA | 空间转录组学, 空间多组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间多组学 | NA | NA |
| 967 | 2026-07-02 |
A systems-level machine learning approach uncovers therapeutic targets in clear cell renal cell carcinoma
2026-Feb-09, npj drug discovery
DOI:10.1038/s44386-025-00036-z
PMID:42380275
|
研究论文 | 本文提出一种系统级机器学习方法，整合单细胞RNA测序、蛋白质相互作用网络和药物邻近性分析，识别透明细胞肾细胞癌的治疗靶点 | 创新性地利用机器学习管道整合多组学数据（单细胞转录组、蛋白质网络、CRISPR筛选），发现具有新机制的治疗靶点和潜在抗癌药物组合 | 仅基于临床前细胞系筛选，缺乏体内模型和临床试验验证 | 识别透明细胞肾细胞癌中未被探索的内在治疗靶点及候选药物 | 透明细胞肾细胞癌的肿瘤细胞及其微环境 | 机器学习 | 肾癌（透明细胞肾细胞癌） | 单细胞RNA测序, CRISPR筛选, 药物邻近性分析 | 机器学习管道（系统级） | 单细胞转录组数据、蛋白质相互作用网络数据、药物靶点数据 | NA（论文未具体说明样本数量） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 968 | 2026-07-02 |
Comprehensive tumour-immune profiling reveals TREM2+ tumour-associated macrophages facilitating lymph node metastasis in head and neck squamous cell carcinoma
2026-Feb, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70604
PMID:41612852
|
研究论文 | 全面肿瘤免疫分析揭示TREM2+肿瘤相关巨噬细胞促进头颈部鳞状细胞癌淋巴结转移的机制 | 首次通过整合688,866个单细胞转录组数据，系统揭示了TREM2+肿瘤相关巨噬细胞通过SPP1-CD44-BHLHE40轴促进CD8+ T细胞耗竭，进而导致淋巴结转移的免疫微环境机制 | NA（摘要未明确提及局限性） | 揭示头颈部鳞状细胞癌淋巴结转移相关的免疫微环境特征及TREM2+肿瘤相关巨噬细胞的功能机制 | 头颈部鳞状细胞癌患者样本中的肿瘤相关巨噬细胞和CD8+ T细胞 | 机器学习 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序， 微阵列， 多重免疫组化， 体外共培养 | 机器学习预后模型 | 单细胞转录组数据， 微阵列数据， 临床队列数据 | 212个头颈部鳞状细胞癌样本共计688,866个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 969 | 2026-07-02 |
Ligand-receptor hotspots in dendritic-T cell niches expose targets in autoimmunity
2026-Feb, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2026.01.006
PMID:41616848
|
研究论文 | 通过空间转录组数据整合单细胞RNA测序，解析树突细胞-T细胞相互作用的配体-受体网络，发现F11R等关键基因与自身免疫性皮肤炎症严重程度相关 | 首次建立空间框架识别树突细胞-T细胞通讯介质，发现F11R作为疾病严重程度相关的空间富集标志物 | 未在更大规模队列或不同疾病阶段验证F11R的临床相关性，缺乏功能实验验证其直接调控机制 | 识别与自身免疫性皮肤炎症相关的树突细胞-T细胞通讯新介质 | 特应性皮炎和银屑病皮肤样本中的树突细胞和T细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、CITE-seq | NA | 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据、CITE-seq数据 | 特应性皮炎和银屑病皮肤样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | 10x Visium、10x Chromium | 10x Visium空间转录组学和10x Chromium单细胞3'测序 |
| 970 | 2026-07-02 |
From inhibition to regulation: serpins in health and disease
2026-Feb, Biomedical journal
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.bj.2026.100950
PMID:41616576
|
评论 | 本期《生物医学杂志》聚焦从分子、细胞到系统水平调控衰老、疾病进展和生物复杂性的机制，特别强调纤溶酶原激活物抑制剂-1（PAI-1）作为多功能调节剂的作用，以及相关治疗方法的研究进展 | 介绍了PAI-1抑制剂的结构导向开发及其在多种疾病中的治疗潜力，以及表观转录组、铁死亡、外泌体通讯等新兴调控机制，并强调了可重复性单细胞测序分析、机器人辅助量化、可解释深度学习等新方法 | 作为期刊综述，未提供具体实验数据或系统验证，各研究的局限需参考原文 | 综述调控衰老、疾病和生物复杂性的多种分子、细胞和系统机制 | 纤溶酶原激活物抑制剂-1（PAI-1）、表观转录组修饰、铁死亡、外泌体介导的细胞间通讯、单细胞RNA测序分析、针刺力学量化、医学影像深度学习等 | 数字病理学, 机器学习, 自然语言处理 | 肺癌, 皮肤癌, 慢性髓系白血病, 系统性硬化症, 血栓性疾病, 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 锥束计算机断层扫描, 深度学习 | 深度学习, 分类与分割框架 | 图像, 文本, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 971 | 2026-07-02 |
Single-cell spatial transcriptomics uncovers niches that govern response to PD-1/PD-L1 blockade in cutaneous squamous cell carcinoma
2026-Jan-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014067
PMID:41617396
|
研究论文 | 利用单细胞空间转录组学揭示决定皮肤鳞状细胞癌对PD-1/PD-L1阻断治疗反应的微环境 | 首次通过单细胞空间转录组学在1.7mm组织芯中识别出六种空间微环境，其预测免疫治疗反应的能力优于PD-L1状态 | 样本量较小（27例患者），且未说明微环境标志物在独立队列中的验证情况 | 探究皮肤鳞状细胞癌对PD-1/PD-L1阻断治疗产生耐药性的机制并预测治疗反应 | 接受新辅助PD-1/PD-L1阻断治疗的晚期皮肤鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 27例患者，来自两个II期试验的三个队列 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 1.7mm组织芯微阵列的单细胞空间转录组分析 |
| 972 | 2026-07-02 |
Targeting PKMYT1 enhances antitumor immune responses to PD-L1 blockade in castration-resistant prostate cancer
2026-Jan-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013247
PMID:41617394
|
研究论文 | 该文章研究了靶向PKMYT1增强抗肿瘤免疫反应，克服去势抵抗性前列腺癌对PD-L1免疫疗法的耐药性 | 首次揭示PKMYT1在去势抵抗性前列腺癌中作为肿瘤进展和免疫逃逸的双重调控因子，提出靶向PKMYT1联合PD-L1阻断可重新编程肿瘤免疫微环境 | 未提及具体局限性，但基于临床前模型，需进一步验证在人类患者中的疗效和安全性 | 探究PKMYT1在前列腺癌免疫逃逸中的作用机制，并开发靶向策略以增强免疫检查点阻断疗法的效果 | 去势抵抗性前列腺癌细胞系、临床标本及小鼠模型 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组化 | NA | 基因组学数据, 转录组学数据 | 公共数据库数据集及临床队列前列腺癌标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 973 | 2026-07-02 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing unravels neutrophil heterogeneity and validates SPP1 as a prognostic biomarker in cervical cancer
2026-Jan-30, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-15636-9
PMID:41612311
|
research paper | 通过整合单细胞和批量RNA测序，揭示了宫颈癌中中性粒细胞的异质性，并验证了SPP1作为预后生物标志物 | 首次全面描绘宫颈癌微环境中中性粒细胞的异质性，并确定SPP1-CD44轴作为中性粒细胞与肿瘤细胞交互的关键介质，同时基于风险分层构建了稳健的预后模型 | 未明确提及，但可能包括样本量有限、仅依赖公开数据库数据，以及缺乏体内功能验证 | 研究宫颈癌中中性粒细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的作用，并识别新的预后生物标志物 | 宫颈癌组织样本的单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据 | machine learning, digital pathology | cervical cancer | RNA-seq, scRNA-seq, bulk RNA-seq | LASSO-Cox regression | gene expression data | GSE208653数据集包含5个宫颈癌组织的单细胞样本，TCGA-CESC和GTEx数据库的批量RNA-seq数据 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 974 | 2026-07-02 |
Deep neural network-based biostatistical analysis for disease marker screening
2026-Jan-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34115-y
PMID:41611762
|
研究论文 | 提出一种基于深度神经网络（DNN）的新型生物标志物筛选框架，并在乳腺癌数据集上验证其优于传统统计方法，同时结合注意力机制和SHAP值分析提升模型可解释性 | 将DNN与注意力机制及SHAP值分析相结合，设计可扩展的多组学数据整合框架，提升生物标志物筛选的准确性和可解释性，并具有跨疾病应用的潜力 | 未明确说明局限，但可推断为可能依赖特定数据集、计算资源需求高或可解释性仍有提升空间 | 开发一种优于传统统计方法的深度神经网络框架，用于生物标志物筛选，并提升模型的可解释性和实际应用潜力 | 乳腺癌疾病相关的生物标志物 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | 深度神经网络 | 单细胞测序数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 975 | 2026-07-02 |
Preventing surgery-induced natural killer cell suppression and metastases by inhibiting PI3K-gamma signaling in myeloid-derived suppressor cells
2026-Jan-29, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013304
PMID:41611243
|
研究论文 | 该研究揭示了术后髓系来源的抑制细胞通过PI3K-γ信号通路抑制自然杀伤细胞活性并促进癌症转移的机制 | 首次通过单细胞RNA测序和功能实验证明PI3K-γ信号在术后MDSC介导的免疫抑制中起关键作用，并筛选出PI3K-γ抑制剂作为潜在治疗策略 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型，临床转化仍需进一步验证；样本量有限且未涉及不同癌症类型的比较 | 阐明术后MDSC的表型及其对NK细胞的抑制作用，并探索针对性的治疗策略 | 55例接受手术的癌症患者的外周血样本及小鼠术后转移模型 | 数字病理学 | 癌症 | 多色流式细胞术、单细胞RNA测序、小分子化合物库筛选、小鼠模型分析 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据、动物模型数据 | 55例癌症患者的外周血样本及小鼠术后转移模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 976 | 2026-07-02 |
CD8a antibody-functionalized biomimetic red blood cell membrane ectosomes delivering C646 reverse CD8⁺ T Cell exhaustion via H3K18la histone delactylation in gastric cardia adenocarcinoma
2026-Jan-29, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03957-z
PMID:41612336
|
研究论文 | 开发了负载C646的CD8a抗体功能化仿生红细胞膜外泌体，通过H3K18la组蛋白去乳酸化逆转胃贲门腺癌中CD8⁺ T细胞耗竭 | 首次利用仿生纳米平台靶向递送p300抑制剂C646，通过逆转乳酸驱动的H3K18la表观遗传修饰来重编程肿瘤浸润CD8⁺ T细胞功能 | 主要基于体外和动物模型验证，人类临床试验数据尚未提供 | 开发一种纳米生物技术策略，通过表观遗传重编程逆转CD8⁺ T细胞耗竭，增强胃贲门腺癌免疫治疗效果 | 胃贲门腺癌肿瘤微环境中的CD8⁺ T细胞 | 数字病理学 | 胃贲门腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人胃贲门腺癌组织样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 977 | 2026-07-02 |
A tri-omics and machine learning framework identifies prognostic biomarkers and metabolic signatures in sepsis
2026-Jan-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-37342-z
PMID:41611834
|
研究论文 | 通过整合转录组、蛋白质组、代谢组和单细胞转录组数据，建立多组学整合分析框架，识别脓毒症相关的候选生物标志物TPR和ERN1，并构建基因-代谢物联合分类模型 | 首次构建结合转录组、蛋白质组、代谢组和单细胞转录组的多组学整合框架，通过LASSO回归和SVM-RFE等机器学习方法优先筛选出TPR和ERN1作为脓毒症关键候选生物标志物，并构建基因-代谢物联合分类模型，同时利用ITCM数据库进行中药活性单体计算筛选 | 基因-代谢物联合模型的区分能力仅在内部队列中得到验证，尚缺乏独立的多组学匹配队列进行外部验证 | 识别脓毒症相关的稳定生物标志物，阐明其免疫代谢通路重塑机制，并生成可验证假说以支持下游机制研究和转化研究 | 脓毒症患者队列的转录组、蛋白质组、代谢组数据以及开放获取的蛋白质组-表型组数据资源，单细胞转录组数据中单核-巨噬细胞和NK细胞等免疫亚群 | 机器学习 | 脓毒症 | 转录组测序、蛋白质组学、代谢组学、单细胞转录组测序、LASSO回归、SVM-RFE | 逻辑回归、支持向量机、随机森林 | 转录组数据、蛋白质组数据、代谢组数据、单细胞转录组数据 | 内部队列和GEO外部验证队列（具体样本量未在摘要中说明） | NA | NA | NA | NA |
| 978 | 2026-07-02 |
DUSP22 dephosphorylates LGALS1 to enhance T cell-driven antitumor immunity
2026-Jan-28, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013142
PMID:41611244
|
研究论文 | 本研究揭示DUSP22通过去磷酸化LGALS1增强T细胞驱动的抗肿瘤免疫，为克服乳腺癌免疫检查点阻断耐药提供了新策略 | 首次发现肿瘤细胞内在的DUSP22-LGALS1轴通过磷酸化依赖性机制重编程免疫抑制性肿瘤微环境 | 需要进一步验证DUSP22-LGALS1轴在人类肿瘤中的临床相关性和治疗可行性 | 鉴定肿瘤细胞内在的T细胞浸润调控因子并阐明其作用机制 | 小鼠乳腺癌模型和人类乳腺癌样本中的CD8+ T细胞浸润及肿瘤免疫微环境 | 免疫学与癌症生物学 | 乳腺癌 | 睡美人转座子诱变筛选、质谱分析、共免疫沉淀、RT-qPCR、Western blotting、流式细胞术、免疫组化、多重免疫组化、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、生物信息学分析、磷酸模拟突变体实验、T细胞跨内皮迁移实验、小鼠模型 | NA | 基因组序列、蛋白质组数据、转录组数据、图像数据 | 小鼠乳腺癌模型和人类乳腺癌样本（具体数量未详述） | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | 通过bulk和单细胞RNA测序分析T细胞浸润和功能 |
| 979 | 2026-07-02 |
Genetically supported mediators linking peripheral metabolism to cerebral ischemia: a multi-omics characterization of HMGCR, TLR4, and MMP9 in angina pectoris and stroke
2026-Jan-09, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elag004
PMID:42296234
|
研究论文 | 利用多组学整合分析揭示心绞痛与缺血性中风之间的遗传中介因子，鉴定HMGCR、TLR4和MMP9为关键分子 | 首次通过多组学整合（BWMR、转录组、scRNA-seq、分子对接）系统鉴定心绞痛到缺血性中风的遗传中介因子，并验证其免疫细胞特异性表达 | 未明确说明 | 阐明心绞痛与缺血性中风之间的分子连接机制及潜在治疗靶点 | 心绞痛和缺血性中风的遗传关联及分子中介因子 | 机器学习 | 心血管疾病 | GWAS、Mendelian randomization、scRNA-seq、 molecular docking | MLPC（多层感知器分类器） | 基因表达数据、基因组关联数据、单细胞转录组数据 | 大型GWAS元数据分析（n=628,000）及scRNA-seq样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 980 | 2026-07-02 |
PIK3R1 as a Gastric Cancer Biomarker Linked to CD73 + Treg-Mediated Immunosuppression
2026, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2025.069453
PMID:41613810
|
研究论文 | 该论文探讨了PIK3R1作为胃癌生物标志物的作用，并发现其与CD73+ Treg介导的免疫抑制相关 | 首次将PIK3R1表达与CD73+ T细胞浸润结合，构建了一个新的预后模型以区分胃癌患者风险等级 | 研究主要基于公开数据集和单中心队列，需要进一步在多中心队列中验证 | 研究PIK3R1在胃癌中的预后意义及其与肿瘤免疫微环境的关联 | 胃癌患者样本，包括TCGA和中山大学肿瘤防治中心队列的临床数据及肿瘤组织 | 数字病理学 | 胃癌 | 免疫组织化学, 单细胞RNA测序, 体外细胞实验 | 预后诺模图 | 基因表达数据, 临床病理数据, 免疫组化图像 | 两个队列：TCGA队列和中山大学肿瘤防治中心队列，具体样本数未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |