单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 961 - 980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 961 | 2025-04-15 |
Hydroxychloroquine cures autoimmune myocarditis by inhibiting the innate immune system via the C-X-C motif chemokine ligand 16 and C-X-C motif receptor 6 axis between macrophages and T cells
2025-Apr-13, British journal of pharmacology
IF:6.8Q1
DOI:10.1111/bph.70028
PMID:40222951
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研究论文 | 本研究评估了羟氯喹（HCQ）通过抑制CXCL16和CXCR6轴在巨噬细胞和T细胞之间的作用，治疗自身免疫性心肌炎的疗效 | 揭示了HCQ通过抑制YY1转录因子降低CXCL16表达，从而减少Th17和NKT细胞的趋化作用，改善心肌炎的新机制 | 研究仅基于小鼠模型，尚未进行人体临床试验 | 评估HCQ治疗心肌炎的疗效及其作用机制 | 实验性自身免疫性心肌炎（EAM）小鼠模型 | 免疫学 | 心肌炎 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、Western blotting | 小鼠EAM模型 | RNA测序数据、蛋白质表达数据、细胞流式数据 | 未明确说明小鼠数量 |
| 962 | 2025-04-15 |
The effect of TIGIT and PD1 expression on T cell function and prognosis in adult patients with acute myeloid leukemia at diagnosis
2025-Apr-11, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04024-0
PMID:40214805
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research paper | 研究TIGIT和PD1在急性髓系白血病（AML）患者T细胞中的表达对T细胞功能及预后的影响 | 首次探索了TIGIT在新诊断AML患者骨髓T细胞中的预后意义，并揭示了TIGIT+PD1+ CD8+ T细胞的高耗竭状态与不良预后的关联 | 样本量较小（71例AML患者和31例健康供者），且仅进行了体外T细胞活化实验 | 评估TIGIT和PD1在AML患者T细胞中的表达及其对T细胞功能和预后的影响 | 新诊断的成人AML患者和健康供者的骨髓T细胞 | 肿瘤免疫学 | 急性髓系白血病 | 流式细胞术、体外T细胞活化实验、scRNA-seq | NA | 流式细胞数据、scRNA-seq数据 | 71例AML患者和31例健康供者的骨髓样本，其中15例AML患者和6例健康供者进行了体外T细胞活化实验，3例AML患者进行了scRNA-seq |
| 963 | 2025-04-15 |
Identification of the disulfidptosis-related key gene CD2AP as a potential biomarker and new therapeutic target for LUAD patients by comprehensive multi-omics analysis
2025-Apr-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02308-6
PMID:40214854
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research paper | 该研究通过多组学分析探讨了CD2AP在肺腺癌（LUAD）中的功能及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 首次将CD2AP与新型细胞死亡机制disulfidptosis联系起来，并系统评估了其在LUAD中的临床意义及对肿瘤免疫微环境和药物敏感性的影响 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证和前瞻性临床研究数据 | 探索CD2AP在肺腺癌中的作用机制及其临床转化价值 | 肺腺癌患者样本及相关公共数据库数据 | digital pathology | lung cancer | 多组学分析（转录组学、甲基化分析、免疫浸润分析、空间转录组学） | NA | omics数据、临床数据 | TCGA、GEO等公共数据库中的LUAD患者样本 |
| 964 | 2025-04-15 |
Integrated single cell and bulk RNA sequencing analyses reveal the impact of tryptophan metabolism on prognosis and immunotherapy in colon cancer
2025-Apr-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-85893-4
PMID:40216815
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research paper | 该研究通过单细胞和批量RNA测序分析，揭示了色氨酸代谢对结肠癌预后和免疫治疗的影响 | 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据，构建色氨酸代谢风险评分模型，并评估其对免疫治疗反应的预测价值 | 研究结果需要进一步在更大规模的前瞻性队列中进行验证 | 分析色氨酸代谢特征对结肠癌预后和免疫治疗反应的影响 | 结肠癌患者 | digital pathology | colon cancer | RNA-seq, single-cell RNA sequencing | random forest | RNA sequencing data | 473个肿瘤样本和41个正常组织样本（TCGA训练队列），902名癌症患者（多个GEO数据集验证队列） |
| 965 | 2025-04-15 |
Spatiotemporal transcriptomics reveals key gene regulation for grain yield and quality in wheat
2025-Apr-11, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03569-8
PMID:40217326
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research paper | 该研究通过时空转录组学揭示了小麦籽粒发育和品质调控的关键基因 | 首次在小麦籽粒早期发育阶段进行空间转录组学研究，鉴定出192个标记基因和关键转录因子TaABI3-B1 | 研究仅覆盖了授粉后4至12天的早期发育阶段，未涵盖整个籽粒发育过程 | 解析小麦籽粒发育和品质形成的分子调控机制 | 小麦籽粒早期发育阶段的细胞类型和基因表达 | 植物分子生物学 | NA | 空间转录组学，WGCNA分析 | NA | 转录组数据 | 授粉后4至12天的小麦籽粒样本 |
| 966 | 2025-04-15 |
Snail1 as a key prognostic biomarker of cancer-associated fibroblasts in breast tumors
2025-Apr-11, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189316
PMID:40222423
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review | 本文综述了乳腺癌中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的异质性及其预后标志物Snail1的作用 | 揭示了Snail1在CAFs中的表达与恶性肿瘤的关联，并提出了一个未描述的与Snail1相关的基因特征 | 主要基于患者样本和小鼠模型的研究，可能不完全反映人类肿瘤的全部复杂性 | 探讨CAFs的异质性及其在乳腺癌预后中的作用 | 乳腺癌患者样本和小鼠模型中的CAFs | digital pathology | breast cancer | single-cell RNA sequencing | NA | gene expression data | NA |
| 967 | 2025-04-15 |
The crucial role of neutrophil extracellular traps and IL-17 signaling in indomethacin-induced gastric injury in mice
2025-Apr-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-95880-4
PMID:40204883
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研究论文 | 本研究探讨了中性粒细胞胞外诱捕网（NETs）和IL-17信号在吲哚美辛诱导的小鼠胃损伤中的关键作用 | 揭示了NETs形成在吲哚美辛诱导胃损伤中的关键作用，并发现IL-17信号可能是NETs形成的关键细胞内机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体验证 | 探究吲哚美辛诱导胃损伤的分子机制 | 小鼠胃黏膜损伤模型 | 病理学 | 胃溃疡 | 蛋白质组学分析、ELISA、免疫荧光、TEM、Western blot、实时PCR、scRNA-seq | 小鼠胃损伤模型 | 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 | 未明确说明小鼠数量，但涉及体外实验使用200µL、400µL和600µL吲哚美辛处理 |
| 968 | 2025-04-15 |
Development of a fully human glioblastoma-in-brain-spheroid model for accelerated translational research
2025-Apr-04, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.03.055
PMID:40188875
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研究论文 | 开发了一种全人源胶质母细胞瘤-脑球体模型hGliCS，用于加速转化研究 | 结合患者来源的GBM细胞和诱导多能干细胞来源的成熟人类皮质神经元，克服了现有模型系统的关键限制 | NA | 研究胶质母细胞瘤生物学和肿瘤-神经元相互作用 | 胶质母细胞瘤细胞和人类皮质神经元 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | hGliCS模型 | 基因表达数据 | NA |
| 969 | 2025-04-15 |
Identification of BHLHE40-Expressing CD4+ T Cells Producing GM-CSF in Rheumatoid Arthritis
2025-Apr, International journal of rheumatic diseases
IF:2.4Q2
DOI:10.1111/1756-185X.70219
PMID:40223427
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research paper | 该研究探讨了BHLHE40和CSF2在类风湿性关节炎(RA)患者CD4+ T细胞中的表达及其与疾病的关系 | 首次在IL-1富集的炎症部位研究了BHLHE40和CSF2在CD4+ T细胞中的表达，并发现这些基因在RA患者滑膜液中的表达显著增加 | 研究主要依赖于已有的公开数据库数据，缺乏实验验证 | 研究BHLHE40和CSF2基因在RA发病机制中的作用 | 类风湿性关节炎患者和健康对照者的外周血和滑膜液中的CD4+ T细胞 | 免疫学 | 类风湿性关节炎 | scRNA-seq, RNA-seq, 微阵列数据分析 | NA | 基因表达数据 | 来自RA患者和健康对照者的外周血和滑膜液样本 |
| 970 | 2025-04-15 |
Correlative analysis of metallomic gene expression and metal ion content within the mouse hippocampus
2025-Mar-28, Metallomics : integrated biometal science
IF:2.9Q3
DOI:10.1093/mtomcs/mfaf009
PMID:40175292
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研究论文 | 本研究通过多模态模板结合X射线荧光显微镜和空间转录组学，揭示了小鼠海马区金属离子含量与金属组基因表达的相关性 | 首次将元素映射与空间转录组学结合，揭示了海马区金属离子富集与特定转录本区域富集的分子基础 | 研究仅局限于小鼠海马区，未涉及其他脑区或物种 | 探究大脑金属稳态的分子机制及其对神经功能的影响 | 小鼠海马区及其亚区域的金属离子含量和基因表达 | 神经科学 | 神经发育障碍 | X射线荧光显微镜, 空间转录组学 | NA | 元素映射数据, 转录组数据 | 小鼠海马区样本 |
| 971 | 2025-04-15 |
Multi-Manifolds fusing hyperbolic graph network balanced by pareto optimization for identifying spatial domains of spatial transcriptomics
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf162
PMID:40220278
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research paper | 提出了一种基于多流形融合的双曲图网络方法MManiST，用于空间转录组学中的空间域识别 | 首次在空间转录组学中引入多流形融合和双曲神经网络，通过Pareto优化平衡多种重建损失 | 未明确说明方法在计算效率方面的表现 | 开发更有效的空间转录组学空间域识别方法 | 空间转录组学数据 | computational biology | NA | spatial transcriptomics | hyperbolic graph network, attention mechanism | spatial transcriptomics data | multiple benchmark datasets |
| 972 | 2025-04-15 |
Role of TGF-β/SMAD/YAP/TAZ signaling in skeletal muscle fibrosis
2025-Mar-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00541.2024
PMID:39925133
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研究论文 | 探讨TGF-β/SMAD/YAP/TAZ信号通路在骨骼肌纤维化中的作用 | 揭示了TGF-β通过YAP/TAZ调控FAPs向肌成纤维细胞分化的新机制，并提出YAP/TAZ作为肌肉纤维增殖性疾病的潜在治疗靶点 | 对FAPs分化为肌成纤维细胞的核调控因子理解尚处于初级阶段 | 研究TGF-β信号通路在骨骼肌纤维化中的作用机制 | 骨骼肌纤维化过程中的FAPs分化和YAP/TAZ活性 | 分子生物学 | 肌肉萎缩症 | 空间转录组学分析、原代培养 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 小鼠模型和原代培养的FAPs |
| 973 | 2025-04-15 |
Distinct single-cell transcriptional profile in CD4+ T-lymphocytes among obese children with asthma
2025-Mar-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00270.2024
PMID:39868576
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，比较了肥胖与正常体重哮喘儿童的CD4+ T细胞转录组差异 | 首次在单细胞水平揭示了肥胖哮喘儿童CD4+ T细胞的独特转录特征，发现了与IL-7受体和Rho转录信号通路相关的新机制 | 样本量较小（仅8名参与者），需要在更大规模队列中验证发现 | 探究肥胖哮喘儿童CD4+ T细胞的分子特征及其与疾病严重程度的关系 | 肥胖与正常体重哮喘儿童的CD4+ T细胞 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 8名匹配的哮喘儿童（肥胖与正常体重各半） |
| 974 | 2025-04-15 |
BRD4 inhibition rewires cardiac macrophages toward a protective phenotype marked by low MHC class II expression
2025-Feb-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00438.2024
PMID:39716819
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研究论文 | 本文研究了BRD4抑制如何通过改变心脏巨噬细胞的表型，从而在心力衰竭模型中发挥保护作用 | 揭示了BRD4抑制通过调控巨噬细胞的MHC-II表达和NF-κB信号通路，促进心脏修复的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类心脏疾病的适用性尚需进一步验证 | 探索BET抑制剂JQ1改善心脏结构和功能的细胞机制 | 心脏巨噬细胞和成纤维细胞 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 小鼠缺血/再灌注损伤模型 | 基因表达数据 | 小鼠心脏组织样本 |
| 975 | 2025-04-15 |
mTOR signaling regulates multiple metabolic pathways in human lung fibroblasts after TGF-β and in pulmonary fibrosis
2025-Feb-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00189.2024
PMID:39745695
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研究论文 | 研究mTOR信号在TGF-β处理后的人类肺成纤维细胞及肺纤维化中调节多种代谢途径的作用 | 揭示了mTOR和ATF4在肺成纤维细胞中调节氨基酸稳态、糖酵解酶和线粒体电子传递链亚基等新的代谢途径 | 研究主要基于体外实验和公开的单细胞RNA-seq数据集，未涉及动物模型验证 | 探讨mTOR和ATF4在肺成纤维细胞代谢重编程中的作用及其在肺纤维化中的潜在治疗靶点 | 人类肺成纤维细胞和肺纤维化患者的肺组织 | 代谢重编程 | 肺纤维化 | RNA测序、代谢组学分析、单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据、代谢组数据 | 人类肺成纤维细胞及公开的单细胞RNA-seq数据集中的患者肺组织样本 |
| 976 | 2025-04-15 |
Cohesin rad21 mutation dysregulates erythropoiesis and granulopoiesis output within the whole kidney marrow of adult zebrafish
2025-Jan-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00657.2024
PMID:39548947
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研究论文 | 研究cohesin复合体亚基rad21突变对成年斑马鱼肾脏骨髓中红细胞生成和粒细胞生成的影响 | 首次在成年斑马鱼模型中揭示了cohesin亚基rad21杂合突变对造血过程的转录调控紊乱和细胞输出改变 | 未观察到明显的造血细胞形态学异常，突变对造血系统的长期影响尚不明确 | 探究cohesin基因突变对造血系统发育和功能的影响 | 携带rad21杂合突变的成年斑马鱼肾脏骨髓造血系统 | 发育生物学 | 血液系统恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 斑马鱼遗传模型 | 转录组数据 | 未明确说明样本量的突变型和野生型斑马鱼 |
| 977 | 2025-04-15 |
Single-cell transcriptomics reveal distinctive patterns of fibroblast activation in heart failure with preserved ejection fraction
2024-12, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-024-01074-w
PMID:39311911
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research paper | 该研究通过单细胞转录组学揭示了保留射血分数心力衰竭（HFpEF）中成纤维细胞激活的独特模式 | 发现了HFpEF特有的成纤维细胞激活特征，包括代谢、缺氧和炎症转录因子及通路的诱导，以及Angiopoietin-like 4（Angptl4）的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究HFpEF中成纤维细胞激活的分子机制 | 小鼠和人类心肌组织中的间质细胞，特别是成纤维细胞和巨噬细胞 | digital pathology | cardiovascular disease | scRNAseq（单细胞RNA测序） | NA | RNA-seq数据 | 小鼠模型和人类心肌组织样本 |
| 978 | 2025-04-15 |
Single-cell transcriptome unveils unique transcriptomic signatures of human organ-specific endothelial cells
2024-12, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-024-01087-5
PMID:39508863
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research paper | 该研究通过构建一个包含超过21万个内皮细胞的图谱，揭示了人类不同组织中内皮细胞的转录组、表型、代谢和转录调控的显著差异 | 揭示了毛细血管内皮细胞比其他类型内皮细胞具有更高的异质性，并发现内皮细胞的衰老特性更多由体细胞位置而非组织类型决定 | NA | 探究人类不同组织中内皮细胞的异质性及其与特定疾病的关联 | 人类24个组织中38个区域的超过21万个内皮细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过21万个内皮细胞，来自24个人类组织的38个区域 |
| 979 | 2025-04-15 |
Evaluating cell type deconvolution in FFPE breast tissue: application to benign breast disease
2024-09, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae098
PMID:40162103
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研究论文 | 评估FFPE乳腺组织中细胞类型去卷积方法的应用，特别是在良性乳腺疾病中的效果 | 构建了乳腺组织的单细胞RNA-seq参考数据，测试了多种去卷积方法，并发现深度学习为基础的Scaden方法在FFPE伪影影响下表现最佳 | FFPE伪影显著影响了去卷积方法的性能，误差范围在0.04至0.17之间 | 优化从FFPE样本中定义单个细胞类型组成的策略 | 良性乳腺疾病的FFPE组织样本 | 数字病理学 | 乳腺疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 深度学习 (Scaden) | RNA-seq数据 | 62个良性乳腺疾病RNA-seq样本 |
| 980 | 2025-04-15 |
Integrative single-cell and bulk transcriptomes analyses reveals heterogeneity of serine-glycine-one-carbon metabolism with distinct prognoses and therapeutic vulnerabilities in HNSCC
2024-06-17, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-024-00310-2
PMID:38886346
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research paper | 该研究通过整合单细胞和批量转录组分析，揭示了头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中丝氨酸-甘氨酸-一碳代谢的异质性及其对预后和治疗脆弱性的影响 | 首次在HNSCC中系统分析了SGOC代谢的异质性，并构建了4-SGOC基因预后特征，同时提出IMPDH1作为潜在的治疗靶点 | 研究主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平和代谢组学的验证 | 阐明HNSCC中代谢异质性的生物学作用并推动精准肿瘤学发展 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）患者 | digital pathology | head and neck squamous cell carcinoma | scRNA-seq, bulk transcriptomes, LASSO-COX regression analysis | NA | RNA sequencing data | 未明确提及具体样本数量 |