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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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9741 | 2025-10-07 |
A single-cell atlas of bladder cancer unveils dynamic cellular composition and endothelial functional shifts during progression
2025-Apr-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02297-6
PMID:40205274
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析膀胱癌细胞组成,揭示内皮细胞在肿瘤进展中的功能转变 | 首次在膀胱癌中鉴定出阶段特异性内皮细胞亚群,特别是MIBC特异的ADAM10+内皮细胞亚群 | 基于公共数据集分析,样本量有限(47例患者),缺乏实验验证 | 阐明膀胱癌进展过程中内皮细胞的异质性和功能变化 | 47例膀胱癌患者的单细胞RNA测序数据 | 单细胞组学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | CellChat细胞通讯网络分析 | 单细胞转录组数据 | 47例膀胱癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9742 | 2025-10-07 |
Comprehensive analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq data via machine learning and bioinformatics reveals the role of lysine metabolism-related genes in gastric carcinogenesis
2025-Apr-09, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14051-w
PMID:40205350
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研究论文 | 通过机器学习和生物信息学方法综合分析单细胞和批量RNA测序数据,揭示赖氨酸代谢相关基因在胃癌发生中的作用 | 首次创新性地识别SLC7A7和VIM作为赖氨酸代谢相关基因参与胃癌发生,并建立了可靠的预后风险列线图 | NA | 研究赖氨酸代谢相关基因在胃癌发生中的作用机制 | 胃癌细胞、临床样本 | 机器学习 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 细胞增殖实验, 细胞迁移实验, 细胞侵袭实验, 细胞周期分析 | 机器学习模型 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
9743 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals prognosis-related stromal signatures that potentiate stratification of patients with extrahepatic cholangiocarcinoma
2025-Apr-09, BMC gastroenterology
IF:2.5Q2
DOI:10.1186/s12876-025-03829-8
PMID:40205358
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肝外胆管癌中与预后相关的基质特征,实现患者分层 | 首次在肝外胆管癌中通过单细胞RNA测序系统鉴定预后相关基质细胞亚群并建立患者分层系统 | 样本量有限(8例单细胞测序样本),需要更大规模验证 | 探索肝外胆管癌肿瘤微环境中基质细胞的组成及其与预后的关系 | 肝外胆管癌患者肿瘤组织和配对癌旁正常组织 | 数字病理 | 肝外胆管癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 基因集变异分析(GSVA) | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | 8例活检样本(5例肿瘤组织+3例癌旁组织)用于单细胞测序,43例肿瘤组织用于批量RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
9744 | 2025-10-07 |
Filtering cells with high mitochondrial content depletes viable metabolically altered malignant cell populations in cancer single-cell studies
2025-Apr-09, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03559-w
PMID:40205439
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研究论文 | 本研究挑战了单细胞RNA测序分析中基于线粒体含量过滤细胞的常规做法,揭示了高线粒体含量的恶性细胞具有独特的代谢特征和临床相关性 | 首次系统证明高线粒体含量的恶性细胞具有生物学功能意义,而非单纯的细胞死亡标志,挑战了现有质量控制标准 | 研究基于公共数据集,缺乏实验验证;样本来源和癌症类型有限 | 评估单细胞RNA测序中高线粒体含量恶性细胞的功能特征和生物学意义 | 来自134名患者的441,445个癌细胞和公共空间转录组数据 | 单细胞转录组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 转录组数据 | 441,445个细胞来自134名患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
9745 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the intra-tumoral heterogeneity and immune microenvironment of small cell carcinoma of the ovary, hypercalcemic type
2025-Apr-09, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-025-01649-8
PMID:40205496
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示卵巢高钙血症型小细胞癌的瘤内异质性和免疫微环境特征 | 首次在SCCOHT中应用单细胞RNA测序技术,发现癌细胞可分为7种亚型,并鉴定出复发灶中具有高干性特征的癌细胞亚群 | 样本量较小(仅15个样本),单细胞测序仅针对1个原发灶和1个复发灶 | 探索SCCOHT的基因组突变谱、瘤内异质性和免疫微环境 | 卵巢高钙血症型小细胞癌(SCCOHT)患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序, 基因panel检测, 多重免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 基因组数据, 图像数据 | 15个SCCOHT样本(包含1个原发灶及匹配正常组织,1个复发灶) | NA | 单细胞RNA-seq, 全外显子组测序 | NA | NA |
9746 | 2025-10-07 |
Single-cell and spatial transcriptomic analyses revealing tumor microenvironment remodeling after neoadjuvant chemoimmunotherapy in non-small cell lung cancer
2025-Apr-09, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02287-w
PMID:40205583
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组分析揭示非小细胞肺癌新辅助 chemoimmunotherapy 后肿瘤微环境重塑 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组技术系统分析NSCLC患者新辅助 chemoimmunotherapy 后肿瘤微环境的动态变化,发现SELENOP-巨噬细胞与抗原呈递CAFs在肿瘤边界的共定位及其在治疗应答中的协同作用 | 样本量较小(12例患者16个组织样本),需要更大规模研究验证发现 | 研究 chemoimmunotherapy 对NSCLC患者肿瘤微环境的影响,识别与治疗敏感性相关的关键分子、细胞亚群、通讯模式和空间分布 | 非小细胞肺癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 12例NSCLC患者的16个肺癌组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
9747 | 2025-10-07 |
Putative function and prognostic molecular marker of mast cells in colorectal cancer
2025-Apr-08, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-025-02117-4
PMID:40205370
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示肥大细胞在结直肠癌中的功能作用,并构建基于肥大细胞标志物的预后分类模型 | 首次系统解析肥大细胞与恶性细胞间的分子通讯机制,并建立基于6个肥大细胞标志物的预后分类模型 | 研究样本量有限,主要基于公共数据库数据,需要更多临床样本验证 | 探究肥大细胞在结直肠癌发展中的功能作用并构建预后分子标志物模型 | 结直肠癌患者单细胞转录组数据、P815和MC-9细胞系、MC38细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA-seq, qRT-PCR, 细胞共培养, 伤口愈合实验, Transwell实验 | LASSO回归, Cox回归 | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | GSE146771数据集中的10,186个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9748 | 2025-10-07 |
Methionine-driven YTHDF1 expression facilitates bladder cancer progression by attenuating RIG-I-modulated immune responses and enhancing the eIF5B-PD-L1 axis
2025-Apr, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-024-01434-y
PMID:39672819
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研究论文 | 本研究揭示了甲硫氨酸通过增强YTHDF1表达抑制膀胱癌免疫治疗的两种机制 | 首次发现甲硫氨酸通过YTHDF1同时调控RIG-I介导的干扰素通路和eIF5B-PD-L1轴的双重免疫抑制机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床验证样本有限 | 探究甲硫氨酸对膀胱癌免疫治疗的影响机制 | 膀胱癌细胞、MB49小鼠肿瘤模型、膀胱癌免疫治疗患者样本 | 肿瘤免疫学 | 膀胱癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、免疫沉淀、质谱分析、多重免疫荧光 | 小鼠肿瘤模型 | RNA测序数据、单细胞数据、质谱数据、免疫荧光图像 | MB49小鼠模型及膀胱癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9749 | 2025-10-07 |
Age-Dependent Bi-Phasic Dynamics of Ly49+CD8+ Regulatory T Cell Population
2025-Apr, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14461
PMID:39696807
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研究论文 | 本研究首次揭示了Ly49+CD8+调节性T细胞在衰老过程中的双相动态变化规律 | 首次在衰老背景下研究Foxp3-CD8调节性T细胞,发现其具有与CD4 Foxp3+Treg不同的年龄依赖性双相动态变化模式 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据仅来自公共单细胞RNA-seq数据集,需要进一步实验验证 | 探究CD8调节性T细胞在衰老过程中的动态变化规律及其免疫调节功能 | 小鼠和人类外周血单核细胞中的CD8调节性T细胞 | 免疫学 | 衰老相关免疫疾病 | 流式细胞术,转录组分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 小鼠生命周期各阶段样本和人类PBMC单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9750 | 2025-10-07 |
Nuclear respiratory factor-1 (NRF1) induction as a powerful strategy to deter mitochondrial dysfunction and senescence in mesenchymal stem cells
2025-Apr, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14446
PMID:39720856
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研究论文 | 本研究探讨了核呼吸因子-1(NRF1)过表达对间充质干细胞线粒体功能和衰老的调控作用 | 首次证明NRF1诱导可通过增强线粒体功能有效延缓间充质干细胞衰老 | 研究主要基于体外实验模型,尚未在体内验证其治疗效果 | 探索NRF1过表达对间充质干细胞衰老的抑制作用及其机制 | 间充质干细胞(MSCs) | 细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq),mRNA转染 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9751 | 2025-10-07 |
Therapeutic Black Phosphorus Nanosheets Elicit Neutrophil Response for Enhanced Tumor Suppression
2025-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202414779
PMID:39840467
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研究论文 | 本研究探讨聚乙二醇功能化黑磷纳米片通过调节肿瘤免疫微环境增强抗肿瘤免疫反应的机制 | 首次发现黑磷纳米片具有免疫调节功能,能通过募集和激活中性粒细胞增强抗肿瘤免疫反应 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证;具体分子机制仍需进一步阐明 | 探索黑磷纳米片在癌症治疗中的免疫调节作用 | 乳腺癌模型(4T1原位BALB/c小鼠和MMTV-PyMT转基因小鼠) | 纳米医学 | 乳腺癌 | 质谱流式细胞术,bulk RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 两种小鼠乳腺癌模型 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
9752 | 2025-10-07 |
Human Pituitary Organoids: Transcriptional Landscape Deciphered by scRNA-Seq and Stereo-Seq, with Insights into SOX3's Role in Pituitary Development
2025-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202414230
PMID:39951008
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研究论文 | 通过优化培养条件并应用单细胞RNA测序和空间转录组技术,首次系统解析了人类垂体类器官的转录组特征和空间结构 | 首次在垂体类器官中同时应用scRNA-seq和Stereo-seq技术,揭示了细胞组成、细胞间相互作用和空间分布特征,并发现SOX3基因在垂体发育中的关键作用 | 该技术仍处于早期发展阶段,类器官的细胞组成和空间结构特征仍需进一步验证 | 建立优化的人类垂体类器官培养体系并解析其转录组特征 | 人类诱导多能干细胞分化的垂体类器官 | 单细胞生物学 | 垂体疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | 类器官模型 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
9753 | 2025-10-07 |
Loss of mucin 2 and MHC II molecules causes rare resistance to murine RV infection
2025-Feb-25, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01507-24
PMID:39727412
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研究论文 | 本研究通过条件性敲除分泌细胞发现MUC2和MHC II分子在轮状病毒感染中的关键作用 | 首次揭示分泌细胞缺失通过下调MUC2和MHC II表达导致轮状病毒罕见耐药性 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探究肠道分泌细胞在轮状病毒感染中的作用机制 | Atoh1条件性敲除小鼠和MHC II缺陷小鼠 | 感染性疾病研究 | 肠道病毒感染 | 单细胞RNA测序,条件性基因敲除 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,感染表型数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9754 | 2025-10-07 |
Dynamic regulation of Rgs16 and its correlation with Neuregulin1 expression in acute and chronic nerve injury
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1540453
PMID:40213396
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研究论文 | 本研究探讨了Rgs16在急性和慢性神经损伤中的动态调控及其与Neuregulin1表达的相关性 | 首次揭示了Rgs16在周围神经系统损伤中的表达模式及其与Neuregulin1的潜在反馈调控机制 | RGS16的具体功能机制仍需进一步研究阐明 | 探究RGS蛋白在周围神经系统损伤中的作用机制 | 小鼠坐骨神经、大鼠正中神经、CMT1A疾病模型大鼠、原代雪旺细胞 | 神经科学 | 周围神经病变 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 细胞培养 | NA | 基因表达数据 | 多个时间点的神经组织样本和原代细胞培养 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
9755 | 2025-10-07 |
Pan-cancer analysis reveals MTTP as a prognostic and immunotherapeutic biomarker in human tumors
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1549965
PMID:40213543
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研究论文 | 通过泛癌分析揭示MTTP作为人类肿瘤预后和免疫治疗生物标志物的潜力 | 首次对MTTP进行系统性泛癌分析,发现其与肿瘤免疫微环境和铁死亡调控的关联 | 部分分析基于公共数据库,实验验证主要集中于胃癌 | 探索MTTP在多种癌症中的表达特征及其临床意义 | 人类多种肿瘤类型,重点关注胃癌细胞 | 生物信息学 | 多种癌症 | 单细胞测序, RNA-seq, 基因集富集分析, 体外实验, 体内实验 | NA | 基因表达数据, 临床数据, 单细胞数据 | 基于TCGA等公共数据库的多癌种样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
9756 | 2025-10-07 |
An anti-FAP-scFv-functionalized exosome-carrying hydrogel delivers SKI mRNA to fibrotic nucleus pulposus cells to alleviate intervertebral disc degeneration by regulating FOXO3
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.107776
PMID:40213661
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研究论文 | 本研究开发了一种靶向纤维化髓核细胞的功能化外泌体-水凝胶系统,用于递送SKI mRNA以缓解椎间盘退变 | 构建了抗FAP-scFv功能化的外泌体-水凝胶系统,实现pH响应性靶向递送SKI mRNA至纤维化髓核细胞 | 研究主要在大鼠模型中进行,尚未进行临床验证 | 探索TGF-β信号通路在髓核纤维化中的作用机制,并开发靶向治疗策略 | 纤维化髓核细胞、HEK-293T细胞、大鼠椎间盘退变模型 | 分子生物学与组织工程 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序、分子对接、免疫共沉淀、重组质粒转染 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9757 | 2025-10-07 |
Hepatic stellate cell-derived microfibrillar-associated protein 2 prevents liver fibrosis by regulating extracellular matrix and inflammation
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.109771
PMID:40213670
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研究论文 | 本研究揭示了肝星状细胞来源的微纤维相关蛋白2通过调控细胞外基质和炎症反应预防肝纤维化的作用机制 | 首次发现MFAP-2在肝纤维化中的保护作用,并阐明其通过调节肝星状细胞与巨噬细胞相互作用影响纤维化进程的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究MFAP-2在肝纤维化发生和消退过程中的作用及分子机制 | 人类组织芯片、小鼠肝纤维化模型(CCl4注射和胆管结扎) | 分子病理学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 组织学分析, 生化分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 组织图像 | 人类组织阵列和小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
9758 | 2025-10-07 |
A distinct subgroup with Schwann-like differentiation presents immune resistance and poor prognosis in plantar melanoma
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.99526
PMID:40213656
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了足底黑色素瘤中雪旺细胞样分化亚群的演化轨迹及其与免疫抵抗和不良预后的关联 | 首次发现足底黑色素瘤中存在向雪旺细胞样分化的独特演化轨迹,并揭示该过程受特定转录因子调控 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 | 解析足底黑色素瘤的肿瘤异质性、细胞亚群演化及其对免疫环境和预后的影响 | 足底黑色素瘤患者肿瘤组织和正常组织 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重免疫组化,单细胞多组学分析 | NA | 单细胞基因表达数据,空间转录组数据,染色质可及性数据,临床预后数据 | 20例足底黑色素瘤和6例正常样本的218,021个细胞,以及68例黑色素瘤患者的批量RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,单细胞多组学,批量RNA测序 | NA | NA |
9759 | 2025-10-07 |
O-GlcNAcylation of circadian clock protein Bmal1 impairs cognitive function in diabetic mice
2024-Nov, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00263-6
PMID:39375536
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研究论文 | 本研究揭示了高血糖通过O-GlcNAc糖基化修饰生物钟蛋白Bmal1导致糖尿病小鼠认知功能障碍的分子机制 | 首次发现Bmal1的O-GlcNAc糖基化修饰在糖尿病认知功能障碍中的关键作用,并开发了特异性阻断该修饰的短肽治疗方法 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 阐明糖尿病相关认知功能障碍的分子机制 | 糖尿病小鼠的海马神经元 | 分子生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
9760 | 2025-10-07 |
Accurate and Flexible Single Cell to Spatial Transcriptome Mapping with Celloc
2024-Oct, Small science
IF:11.1Q1
DOI:10.1002/smsc.202400139
PMID:40212250
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研究论文 | 开发了一种名为Celloc的新方法,用于实现单细胞RNA测序与空间转录组数据之间的精确映射 | 结合图注意力自编码器和综合损失函数,实现灵活的单细胞到空间位点映射,既能解析每个位点内的细胞组成,也能为scRNA-seq数据中的每个细胞分配空间位置 | NA | 解决单细胞RNA测序数据缺乏空间信息和空间转录组数据分辨率有限的问题 | 单细胞RNA测序数据和空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | 图注意力自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |