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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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9741 | 2024-09-02 |
Theories, laws, and models in evo-devo
2022-01, Journal of experimental zoology. Part B, Molecular and developmental evolution
DOI:10.1002/jez.b.23096
PMID:34570438
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综述 | 本文回顾了进化发育生物学(evo-devo)中的一些理论、模型和定律,包括历史上的重演理论、原型理论以及新的框架移位理论、发育工具箱、ABC模型等 | 文章提出了对von Baer定律的重新审视以及对时钟模型修正的可能性,并探讨了利用高通量测序数据发展新理论和模型的前景 | 文章指出evo-devo中所谓的“定律”实际上只是特定谱系趋势的概括,且“体计划”作为一种原型,其科学意义常被忽视 | 探讨和总结进化发育生物学中的理论、模型和定律,并展望未来的发展方向 | 进化发育生物学中的理论、模型和定律 | NA | NA | 高通量测序,单细胞测序 | NA | NA | NA |
9742 | 2024-09-02 |
Mapping the genetic architecture of human traits to cell types in the kidney identifies mechanisms of disease and potential treatments
2021-09, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-021-00909-9
PMID:34385711
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研究论文 | 本研究通过生成659个微切割人肾样本的表达数量性状位点(eQTL)综合图谱,并利用分层连锁不平衡得分回归方法整合全基因组关联研究(GWAS)与单细胞RNA测序及单核测序数据,揭示了肾功能和高血压发病机制中的细胞类型特异性遗传变异。 | 本研究首次生成了人肾样本的细胞类型特异性eQTL图谱,并通过贝叶斯共定位分析提名了200多个与肾功能和高血压相关的基因,为药物再利用提供了新机会。 | NA | 旨在通过解析人类特征的遗传结构与肾细胞类型的关系,揭示疾病机制并探索潜在治疗方案。 | 人肾样本的遗传变异及其在肾功能和高血压发病机制中的作用。 | 遗传学 | 肾脏疾病 | 全基因组关联研究(GWAS)、单细胞RNA测序、单核测序 | 分层连锁不平衡得分回归 | 基因组数据 | 659个微切割人肾样本 |
9743 | 2024-09-02 |
The developmental hourglass model is applicable to the spinal cord based on single-cell transcriptomes and non-conserved cis-regulatory elements
2021-Sep, Development, growth & differentiation
DOI:10.1111/dgd.12750
PMID:34473348
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研究论文 | 本研究通过数据挖掘和实验验证,证明了发育沙漏模型适用于脊髓这一简化元素 | 首次通过单细胞转录组数据和非保守的顺式调控元件验证了脊髓发育的沙漏模型 | 仅限于脊髓的发育过程,未涉及其他器官或组织的发育 | 验证发育沙漏模型在脊髓发育中的适用性 | 脊髓的发育过程及其分子机制 | NA | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 小鼠和斑马鱼的单细胞转录组数据 |
9744 | 2024-09-01 |
Comprehensive analysis of single-cell transcriptomics and genetic factors reveals the mechanisms and preventive strategies for the progression from pulmonary fibrosis to lung cancer
2024-Oct-25, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112803
PMID:39094357
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研究论文 | 本文通过综合分析单细胞转录组学和遗传因素,揭示了从肺纤维化到肺癌进展的机制和预防策略。 | 本文首次使用孟德尔随机化方法确定肺纤维化诱发的肺癌初期属于小细胞肺癌,并通过伪时间序列分析识别出具有致癌潜力的肺神经内分泌细胞。 | NA | 研究从肺纤维化到肺癌的进展机制及其预防策略。 | 肺纤维化细胞、肺神经内分泌细胞及其相互作用,以及肺纤维化微环境中纤维母细胞对免疫细胞的影响。 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
9745 | 2024-09-01 |
Alterations in intratumoral and peripheral immune status in recurrent gliomas and their prognostic implications for patients underwent reoperation
2024-Oct-25, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112797
PMID:39083926
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研究论文 | 本文分析了复发性胶质瘤中肿瘤内和外周免疫状态的特征及其对患者再次手术后生存的预测意义 | 发现复发性胶质瘤中肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的浸润增加,并且TAMs在复发性胶质瘤中表现出显著的表型异质性和代谢重编程 | NA | 研究复发性胶质瘤中免疫状态的特征及其对患者再次手术后生存的预测意义 | 复发性胶质瘤患者的肿瘤内和外周免疫状态 | 数字病理学 | 脑瘤 | 免疫组织化学染色、血液学检查、批量和单细胞测序 | NA | 组织样本、血液样本、测序数据 | 使用自家的样本和公开来源的数据进行分析 |
9746 | 2024-09-01 |
Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptome reveal potential molecular mechanisms of lung cancer brain metastasis
2024-Oct-25, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112804
PMID:39079345
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了肺癌脑转移的潜在分子机制 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,识别并验证了早期转移上皮细胞集群(EMEC)及其在肺癌脑转移中的作用 | NA | 揭示肺癌脑转移的分子机制,为临床检测和治疗提供参考 | 肺癌脑转移的分子机制 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | 共获得55,763个单细胞,分为9种细胞类型 |
9747 | 2024-09-01 |
Enhancing insight into ferroptosis mechanisms in sepsis: A genomic and pharmacological approach integrating single-cell sequencing and Mendelian randomization
2024-Oct-25, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112910
PMID:39121604
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和孟德尔随机化方法,利用先进的基因组学和药理学手段,探讨了铁死亡与脓毒症之间的复杂关系 | 本研究首次结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,深入探讨了铁死亡相关基因在脓毒症中的作用,并通过计算分子对接预测了潜在的治疗化合物 | 研究主要基于UK Biobank的数据,可能存在样本选择偏倚;此外,分子对接预测的药物靶点需要进一步的实验验证 | 探讨铁死亡机制在脓毒症中的作用,并为脓毒症的治疗提供新的策略 | 铁死亡相关基因及其在脓毒症中的表达和作用 | 基因组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析、基因集富集分析(GSEA)、计算分子对接 | NA | 基因表达数据 | 10,154名脓毒症患者和452,764名对照组 |
9748 | 2024-09-01 |
Suppression of GATA3 promotes epithelial-mesenchymal transition and simultaneous cellular senescence in human extravillous trophoblasts
2024-Oct, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119768
PMID:38838858
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研究论文 | 本研究利用胎盘类器官模型和胎盘组织的单细胞RNA测序数据,探讨了GATA3在早期妊娠胎盘外绒毛滋养层细胞(EVT)成熟过程中的动态变化及其在妊娠障碍发生中的相关性 | 本研究首次揭示了GATA3在EVT分化和成熟过程中调控上皮-间质转化(EMT)和细胞衰老的双重作用 | 研究主要集中在体外细胞模型上,未来需要进一步的体内研究来验证这些发现 | 探讨GATA3在早期妊娠胎盘EVT分化和成熟过程中的调控机制及其与妊娠障碍的关系 | 早期妊娠胎盘的外绒毛滋养层细胞(EVT) | NA | 妊娠障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 胎盘类器官模型和胎盘组织的单细胞RNA测序数据 |
9749 | 2024-09-01 |
Combination of radiotherapy and PD-L1 blockade induces abscopal responses in EGFR-mutated lung cancer through activating CD8+ T cells
2024-Oct, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.102074
PMID:39106551
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研究论文 | 研究结合放疗和PD-L1阻断剂在EGFR突变型肺癌中通过激活CD8+ T细胞诱导远隔效应 | 首次探讨了放疗与免疫检查点抑制剂联合治疗EGFR突变型非小细胞肺癌的效果,并揭示了CD8+ T细胞在其中的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,需要进一步的人体临床试验验证 | 探讨放疗与PD-L1阻断剂联合治疗EGFR突变型肺癌的效果及其机制 | EGFR突变型非小细胞肺癌中的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 小鼠模型LLC-19del和LLC-EGFR |
9750 | 2024-09-01 |
Glycyrrhizic acid alleviates concanavalin A-induced acute liver injury by regulating monocyte-derived macrophages
2024-Oct, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2024.155586
PMID:39159503
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研究论文 | 本研究探讨了甘草中的活性成分甘草酸(GA)通过调节单核细胞衍生的巨噬细胞(MoMFs)减轻刀豆蛋白A(ConA)诱导的急性肝损伤的作用机制 | 本研究通过CyTOF和单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术,全面阐释了GA干预后ConA诱导的肝损伤的免疫景观,为GA的作用机制提供了深入理解 | 研究中的部分单细胞数据仍处于原始状态,需要进一步处理和注释 | 探究甘草酸在自身免疫性肝炎治疗中的免疫调节机制 | 甘草酸对刀豆蛋白A诱导的小鼠急性肝损伤的影响及其免疫调节作用 | NA | 自身免疫性肝炎 | CyTOF分析,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA数据 | 小鼠模型 |
9751 | 2024-09-01 |
Gene expression profile of human placental villous pericytes in the first trimester - An analysis by single-cell RNA sequencing
2024-Sep, Reproductive biology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.repbio.2024.100919
PMID:38941941
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了第一孕期人类胎盘绒毛周细胞的基因表达谱 | 首次揭示了胎盘绒毛周细胞在第一孕期的特定标记物和功能,并发现了其在整合素介导的信号通路和细胞外囊泡中的组织特异性功能 | NA | 探讨胎盘绒毛周细胞的标记物和功能,以增进对早期胎盘发育的理解并寻找治疗胎盘相关妊娠并发症的新靶点 | 人类胎盘绒毛周细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 第一孕期的胎盘绒毛样本 |
9752 | 2024-09-01 |
Integrative analysis reveals different feature of intrahepatic cholangiocarcinoma subtypes
2024-Sep, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.16015
PMID:38924592
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研究论文 | 本研究通过综合分析揭示了肝内胆管癌两种主要组织学亚型(大管型和小管型)在分子特征和免疫微环境方面的差异 | 发现了大管型肝内胆管癌中PPP1R1B的高表达及其在细胞增殖、迁移和侵袭中的作用,以及其作为潜在标记物和治疗靶点的可能性 | NA | 扩展对肝内胆管癌两种亚型分子特征和免疫微环境差异的理解 | 肝内胆管癌的两种主要组织学亚型 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 全外显子测序、批量RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 132名接受根治性手术的患者 |
9753 | 2024-09-01 |
Single-cell RNA sequencing of cystic fibrosis liver disease explants reveals endothelial complement activation
2024-Sep, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.15963
PMID:38847551
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了囊性纤维化相关肝病患者的肝组织,揭示了内皮细胞的补体激活特征 | 首次在单细胞水平上展示了囊性纤维化肝病患者的内皮细胞特征,特别是发现了一类上调补体级联反应和凝血相关基因的特殊内皮细胞群体 | 研究样本量较小,仅包括四例囊性纤维化相关肝病患者的肝组织 | 探究囊性纤维化相关肝病中内皮细胞的病理特征及其在疾病发展中的作用 | 囊性纤维化相关肝病患者的肝组织内皮细胞 | 数字病理学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四例囊性纤维化相关肝病患者的肝组织 |
9754 | 2024-09-01 |
Multi-omic analysis and validation reveal ZBP1 as a potential prognostic and immunotherapy-related biomarker in head and neck squamous cell carcinoma
2024-Sep, Journal of stomatology, oral and maxillofacial surgery
DOI:10.1016/j.jormas.2024.101901
PMID:38688403
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和验证,揭示了ZBP1作为头颈部鳞状细胞癌潜在的预后和免疫治疗相关生物标志物 | 首次全面揭示ZBP1在头颈部鳞状细胞癌中的潜在预后和免疫治疗相关作用 | NA | 旨在识别ZBP1在头颈部鳞状细胞癌中的可能功能 | ZBP1在头颈部鳞状细胞癌中的表达及其与临床预后和免疫特征的关系 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 多组学分析 | NA | 基因表达数据 | 66个肿瘤样本和37个对照样本 |
9755 | 2024-09-01 |
Lung Fibrosis Is Linked to Increased Endothelial Cell Activation and Dysfunctional Vascular Barrier Integrity
2024-Sep, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0046OC
PMID:38843440
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研究论文 | 本研究通过透射电子显微镜、免疫组织化学和单细胞RNA测序分析了肺纤维化患者与供体肺血管的差异,并研究了血管屏障阻力、内皮-免疫细胞粘附及对炎症环境的敏感性。 | 首次详细描述了肺纤维化中内皮细胞的异常激活和血管屏障功能障碍,并提出了恢复内皮细胞稳态和功能作为治疗肺纤维化的新策略。 | 研究主要基于体外实验和患者样本,需要进一步的临床试验验证其治疗策略的有效性。 | 探讨肺纤维化中内皮细胞的激活和血管屏障功能障碍的机制。 | 肺纤维化患者的肺血管和内皮细胞。 | NA | 肺纤维化 | 透射电子显微镜、免疫组织化学、单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因表达数据 | 多个肺纤维化患者和供体样本 |
9756 | 2024-09-01 |
Intramyocardial Sprouting Tip Cells Specify Coronary Arterialization
2024-Aug-30, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.324868
PMID:39092506
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学和组织学验证,研究了冠状动脉内皮细胞在血管重塑和动静脉分化中的作用 | 发现了冠状动脉起源于经历过特定尖端细胞表型的细胞,并识别了心肌内和心外膜下尖端细胞群体及其基因表达谱和调控途径 | NA | 理解冠状动脉内皮细胞如何协调血管重塑和动静脉分化,以开发恢复缺血心脏功能灌注的创新治疗策略 | 冠状动脉内皮细胞及其在血管重塑和动静脉分化中的作用 | 生物医学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠和人类胚胎的多个发育阶段和成年阶段样本 |
9757 | 2024-09-01 |
Sensory nerves drive migration of dental pulp stem cells via the CGRP-Ramp1 axis in pulp repair
2024-Aug-28, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05400-2
PMID:39196292
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研究论文 | 研究探讨了感觉神经通过CGRP-Ramp1轴促进牙髓干细胞迁移在牙髓修复中的作用 | 首次揭示了感觉神经通过CGRP-Ramp1轴直接作用于牙髓干细胞,促进其向损伤部位的集体迁移,从而促进牙髓修复 | NA | 探究感觉神经在牙髓损伤后对牙髓干细胞行为的影响及其机制 | 牙髓干细胞和感觉神经 | NA | NA | 单细胞RNA测序分析和免疫组织化学研究 | NA | 细胞 | NA |
9758 | 2024-09-01 |
Comprehensive pan-cancer analysis reveals EPHB2 is a novel predictive biomarker for prognosis and immunotherapy response
2024-Aug-28, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12843-0
PMID:39198775
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研究论文 | 本文通过多种数据库和生物信息学工具,全面分析了EPHB2在多种癌症中的预后和免疫治疗反应预测作用 | 首次全面探讨了EPHB2在不同癌症中的免疫学作用和预后意义,并验证了其与M2巨噬细胞浸润的相关性 | NA | 探索EPHB2作为预测多种癌症预后和免疫治疗反应的新型生物标志物的潜力 | EPHB2在多种癌症中的表达及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 数字病理学 | NA | 基因集富集分析(GSEA), 分子对接和动力学模拟 | NA | 转录组数据, 空间转录组学, 多荧光染色 | 涉及多种癌症类型,包括肺腺癌(LUAD)细胞系 |
9759 | 2024-09-01 |
Single-cell RNA-seq reveals the transcriptional program underlying tumor progression and metastasis in neuroblastoma
2024-Aug, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-024-1081-7
PMID:39014137
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了神经母细胞瘤从原发肿瘤到骨髓转移的转录组图谱,并识别出启动肿瘤发展和转移的共同'启动'亚群 | 首次通过时间分辨分析描绘了神经母细胞瘤细胞从原发肿瘤到转移的进化轨迹,并识别出启动肿瘤发展和转移的共同'启动'亚群 | NA | 探究神经母细胞瘤转移的分子机制 | 神经母细胞瘤细胞及其转移过程 | 数字病理学 | 儿童恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 15447个神经母细胞瘤细胞,来自8个样本,包括原发肿瘤和骨髓转移的配对样本 |
9760 | 2024-09-01 |
Protein phosphatases regulate the formation of Müller glia-derived progenitor cells in the chick retina
2024-Jun, Molecular and cellular neurosciences
DOI:10.1016/j.mcn.2024.103932
PMID:38679247
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,探讨了蛋白磷酸酶在正常和受损鸡视网膜中对穆勒胶质细胞向穆勒胶质源性前体细胞转化的调控作用 | 首次详细研究了蛋白磷酸酶在穆勒胶质细胞转化过程中的作用,并揭示了不同磷酸酶对前体细胞形成的不同影响 | 研究主要集中在鸡视网膜模型,可能需要进一步在其他物种中验证结果 | 探讨蛋白磷酸酶在视网膜中对穆勒胶质细胞向穆勒胶质源性前体细胞转化的调控作用 | 鸡视网膜中的穆勒胶质细胞及其前体细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个类型的视网膜神经元及穆勒胶质细胞和穆勒胶质源性前体细胞 |