单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 9721 - 9740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9721 | 2024-08-10 |
Age-associated reduction of sinus macrophages in human mesenteric lymph nodes
2024-Jun-27, Journal of clinical and experimental hematopathology : JCEH
IF:0.9Q4
DOI:10.3960/jslrt.24001
PMID:38462485
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研究论文 | 本研究评估了结直肠癌手术中切除的肠系膜淋巴结中窦状巨噬细胞（SMs）的分布情况，发现老年患者尤其是80岁以上患者中SMs显著减少 | 首次揭示了老年患者淋巴结中窦状巨噬细胞减少的现象，并探讨了其可能的免疫功能影响 | 研究仅基于手术中移除的肠系膜淋巴结样本，可能存在样本选择偏倚 | 探讨老年患者淋巴结中窦状巨噬细胞的分布及其与免疫功能的关系 | 肠系膜淋巴结中的窦状巨噬细胞 | NA | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 9722 | 2024-08-10 |
Single-cell and Spatial Transcriptomics Reveals Ferroptosis as The Most Enriched Programmed Cell Death Process in Hemorrhage Stroke-induced Oligodendrocyte-mediated White Matter Injury
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.96262
PMID:39113700
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研究论文 | 研究使用单细胞转录组和空间转录组技术，探讨了脑出血后程序性细胞死亡相关基因表达趋势，发现铁死亡是主要程序性细胞死亡过程，主要影响成熟的少突胶质细胞 | 首次揭示了脑出血后铁死亡作为主要程序性细胞死亡过程，并阐明了微胶质细胞与少突胶质细胞之间的特定相互作用 | 研究仅在 rat 模型上进行，需要进一步在人类中验证 | 探讨脑出血后不同程序性细胞死亡模式的区别及其对白质损伤的影响 | 脑出血后的程序性细胞死亡过程及其对神经系统的影响 | 数字病理学 | 脑卒中 | 单细胞 RNA 测序，空间 RNA 测序 | NA | 转录组数据 | rat 脑组织样本 |
| 9723 | 2024-08-10 |
Aryl hydrocarbon receptor confers protection against macrophage pyroptosis and intestinal inflammation through regulating polyamine biosynthesis
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.95749
PMID:39113799
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研究论文 | 研究探讨了芳香烃受体（AhR）通过调节多胺生物合成在肠道炎症和巨噬细胞焦亡中的保护作用 | 首次揭示了AhR信号通过促进鸟氨酸脱羧酶1（ODC1）转录来抑制巨噬细胞焦亡，增强多胺生物合成，从而维持肠道稳态 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证AhR/ODC1/多胺轴的功能 | 探究AhR在调节肠道炎症和巨噬细胞功能中的作用机制 | 巨噬细胞、肠道炎症模型、多胺生物合成 | 生物医学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、酶联免疫吸附试验、免疫荧光染色 | NA | RNA | 小鼠模型及人类肠道黏膜活检样本 |
| 9724 | 2024-08-10 |
scRNA sequencing technology for PitNET studies
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1414223
PMID:39114291
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综述 | 本文综述了使用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）研究垂体神经内分泌肿瘤（PitNETs）的最新进展 | scRNA-seq技术因其单细胞水平的高分辨率而在研究中发挥重要作用 | NA | 理解调控这些高度异质性肿瘤的分子机制 | 垂体神经内分泌肿瘤（PitNETs） | 数字病理学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA数据 | NA |
| 9725 | 2024-08-10 |
Single-cell RNA sequencing in ovarian cancer: revealing new perspectives in the tumor microenvironment
2024, American journal of translational research
IF:1.7Q4
DOI:10.62347/SMSG9047
PMID:39114691
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在卵巢癌肿瘤微环境研究中的应用和进展 | 单细胞测序技术揭示了卵巢癌肿瘤微环境中细胞异质性和细胞间复杂交互作用的新视角 | NA | 探讨单细胞测序技术在卵巢癌肿瘤微环境研究中的应用，以改善诊断和治疗策略 | 卵巢癌肿瘤微环境中的细胞异质性和细胞间交互作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 9726 | 2024-08-10 |
scDiffCoAM: A complete framework to identify potential biomarkers for esophageal squamous cell carcinoma using scRNA-Seq data analysis
2024, Journal of biosciences
IF:2.1Q2
PMID:39119913
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研究论文 | 本文提出了一种完整的差异共表达分析框架scDiffCoAM，用于从scRNA-Seq数据中提取网络模块并识别关键基因，以发现食管鳞状细胞癌的潜在生物标志物 | 该方法在大多数情况下表现优于其他四种现有的关键基因发现方法，并能识别其他方法未检测到的独特潜在生物标志物 | NA | 旨在通过scRNA-Seq数据分析识别食管鳞状细胞癌的潜在生物标志物 | 食管鳞状细胞癌的scRNA-Seq数据 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | scRNA-Seq | 差异共表达分析 | 单细胞RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 9727 | 2024-08-10 |
Classic genetic and hormonal switches during fetal sex development and beyond
2023-Sep, Medizinische Genetik : Mitteilungsblatt des Berufsverbandes Medizinische Genetik e.V
IF:0.8Q4
DOI:10.1515/medgen-2023-2036
PMID:38840820
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研究论文 | 本文探讨了人类胎儿性别发育过程中的关键遗传和激素开关，以及这些开关如何决定性腺性别确定和后续的生殖和体细胞性别表型的分化 | 文章指出传统的性别发育模型是不充分的，并介绍了在特定突变情况下，这些开关可能表现出不同的功能，导致基因功能和剂量的连续变化，酶活性，性激素水平和敏感性的变化，从而产生广泛的生物性别发育差异（DSD）和潜在的生殖和体细胞性别表型的多样性 | NA | 探讨人类胎儿性别发育过程中的遗传和激素开关的作用 | 人类胎儿性别发育过程中的遗传和激素开关 | NA | NA | 单细胞和空间转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 9728 | 2024-08-10 |
Hypoxic niches attract and sequester tumor-associated macrophages and cytotoxic T cells and reprogram them for immunosuppression
2023-08-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2023.06.017
PMID:37451265
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研究论文 | 本文研究了胶质母细胞瘤（GBM）中肿瘤相关骨髓细胞（TAMs）和细胞毒性T淋巴细胞（CTLs）在低氧微环境中的分布及功能重编程 | 首次揭示了低氧微环境吸引并隔离TAMs和CTLs，并使其向免疫抑制状态重编程的机制 | NA | 探讨胶质母细胞瘤中免疫抑制的机制 | 肿瘤相关骨髓细胞（TAMs）和细胞毒性T淋巴细胞（CTLs） | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 9729 | 2024-08-10 |
Reference-free and cost-effective automated cell type annotation with GPT-4 in single-cell RNA-seq analysis
2023-May-02, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2824971/v1
PMID:37205379
|
研究论文 | 本文展示了GPT-4这一强大的大型语言模型在单细胞RNA测序分析中自动准确地进行细胞类型注释的能力 | GPT-4无需高质量参考数据集和额外开发流程，能利用标准单细胞RNA测序分析流程生成的标记基因信息自动注释细胞类型 | NA | 探索在单细胞RNA测序分析中自动进行细胞类型注释的新方法 | 单细胞RNA测序分析中的细胞类型注释 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | GPT-4 | 文本 | 数百种组织类型和细胞类型 |
| 9730 | 2024-08-10 |
A Comprehensive Survey of Statistical Approaches for Differential Expression Analysis in Single-Cell RNA Sequencing Studies
2021-12-02, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12121947
PMID:34946896
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序研究中差异表达分析的统计方法，并对19种常用方法在11个真实数据集上的表现进行了评估 | 本文首次全面评估了从批量RNA测序实践中改编的方法以及专门为单细胞RNA测序设计的方法，并提供了选择适当工具的指导 | 难以通过单一性能标准确定全局最佳表现的方法 | 为单细胞RNA测序中的差异表达分析选择合适的工具提供指导 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达分析方法 | RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 11个真实单细胞RNA测序数据集 |
| 9731 | 2024-08-10 |
Transfer learning between preclinical models and human tumors identifies a conserved NK cell activation signature in anti-CTLA-4 responsive tumors
2021-08-11, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-021-00944-5
PMID:34376232
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研究论文 | 本文通过计算转移学习方法projectR，在鼠和人的抗CTLA-4反应性肿瘤中识别出保守的NK细胞激活特征，并探讨了其在转移性黑色素瘤中的临床相关性 | 本文首次应用转移学习方法在临床前模型和人类肿瘤之间识别出保守的NK细胞激活特征，为癌症治疗提供了新的理解 | 目前的方法在临床前模型中识别的治疗机制未能完全转化为人类疾病，限制了转化研究的进展 | 通过转移学习方法识别肿瘤微环境中免疫细胞的保守转录变化，以提高免疫检查点抑制剂的疗效 | 研究对象包括鼠和人的抗CTLA-4反应性肿瘤，以及转移性黑色素瘤中的NK细胞激活特征 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 转移学习 | 单细胞RNA测序数据 | 涉及鼠和人的肿瘤样本，具体数量未在摘要中提及 |
| 9732 | 2024-08-10 |
Transcriptional profiling of mouse peripheral nerves to the single-cell level to build a sciatic nerve ATlas (SNAT)
2021-04-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.58591
PMID:33890853
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研究论文 | 本文通过单细胞水平的转录组分析，构建了小鼠坐骨神经的转录组图谱（SNAT） | 首次结合了发育中的坐骨神经的批量RNA测序和Schwann细胞的批量及单细胞RNA测序，以及全坐骨神经的单细胞转录组分析 | NA | 促进对外周神经基本理解的研究 | 小鼠坐骨神经中的各种细胞类型 | NA | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括发育中的坐骨神经和成年坐骨神经的多个样本 |
| 9733 | 2024-08-10 |
A single-cell genomics pipeline for environmental microbial eukaryotes
2021-Apr-23, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102290
PMID:33870123
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研究论文 | 本文描述了一种针对环境中低丰度未培养真核微生物的单细胞基因组学流程 | 该流程整合了先进的单细胞基因组学工具和优化协议，旨在提高低成本下基因组质量 | NA | 开发和评估一种针对环境中低丰度未培养真核微生物的单细胞基因组学流程 | 环境中低丰度未培养的真核微生物 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 环境样本和早期分化线菌及Chromista/SAR培养物 |
| 9734 | 2024-08-10 |
Applications of brain organoids in neurodevelopment and neurological diseases
2021-Apr-22, Journal of biomedical science
IF:9.0Q1
DOI:10.1186/s12929-021-00728-4
PMID:33888112
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综述 | 本文综述了脑类器官在神经发育和神经系统疾病中的应用现状 | 介绍了脑类器官与免疫染色和单细胞测序技术的结合，以及其在模拟早期脑发育和建模人类脑部疾病中的应用 | 讨论了该技术的挑战和未来展望 | 介绍脑类器官分化策略的现状，总结其在医学领域的进展和应用 | 脑类器官及其在神经发育和神经系统疾病中的应用 | NA | 神经系统疾病 | 免疫染色技术，单细胞测序技术 | NA | 组织 | NA |
| 9735 | 2024-08-10 |
The long noncoding RNA lnc-HLX-2-7 is oncogenic in Group 3 medulloblastomas
2021-04-12, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaa235
PMID:33844835
|
研究论文 | 本文报道了一种新的长链非编码RNA lnc-HLX-2-7，作为第三组髓母细胞瘤的潜在分子标记和治疗靶点 | 首次发现lnc-HLX-2-7在第三组髓母细胞瘤中高度上调，并证实其作为治疗靶点的潜力 | NA | 研究lnc-HLX-2-7在髓母细胞瘤中的作用及其作为治疗靶点的可能性 | lnc-HLX-2-7在第三组髓母细胞瘤中的表达和功能 | 数字病理学 | 儿童肿瘤 | RNA测序（RNA-seq） | CRISPR/Cas9 | RNA | 175名髓母细胞瘤患者 |
| 9736 | 2024-08-10 |
Colorectal Cancer Stem Cell States Uncovered by Simultaneous Single-Cell Analysis of Transcriptome and Telomeres
2021-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202004320
PMID:33898197
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研究论文 | 本文通过同时分析单细胞转录组和端粒长度，揭示了结直肠癌干细胞的状态 | 首次实现同时测量单细胞中的端粒长度和转录组，系统评估了结直肠癌干细胞 | NA | 揭示结直肠癌干细胞的特征及其与肿瘤进展和药物抵抗的关系 | 结直肠癌干细胞及其在肿瘤中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | SMART-seq2, 10 × Genomics | NA | 转录组数据 | NA |
| 9737 | 2024-08-10 |
A fish with no sex: gonadal and adrenal functions partition between zebrafish NR5A1 co-orthologs
2021-02-09, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyaa030
PMID:33724412
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研究论文 | 本研究通过敲除斑马鱼中的nr5a1a和nr5a1b基因，探讨NR5A1同源基因在性腺和肾上腺功能中的祖先角色。 | 首次揭示了斑马鱼中nr5a1a和nr5a1b基因在性腺和肾上腺功能中的分工，以及这种分工对性发育差异的影响。 | 研究主要集中在斑马鱼模型上，可能需要进一步在其他物种中验证这些发现。 | 探索NR5A1同源基因在性腺和肾上腺功能中的祖先角色及其对性发育的影响。 | 斑马鱼的nr5a1a和nr5a1b基因及其在性腺和肾上腺中的功能。 | 遗传学 | NA | 单细胞RNA测序，RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括1天和2天龄的斑马鱼胚胎以及成年斑马鱼。 |
| 9738 | 2024-08-10 |
Lung transplantation for patients with severe COVID-19
2020-12-16, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abe4282
PMID:33257409
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研究论文 | 本文报告了三名患有难治性COVID-19相关呼吸衰竭患者的肺移植结果，并使用单分子荧光原位杂交（smFISH）检测了SARS-CoV-2 RNA，进行了细胞外基质成像和单细胞RNA测序。 | 首次使用smFISH技术检测移植肺组织中的SARS-CoV-2 RNA，并通过机器学习比较了晚期COVID-19患者与肺纤维化患者的单细胞RNA测序数据。 | 研究样本量较小，仅包括三名患者，且未讨论长期移植后的生存率和并发症。 | 探讨肺移植作为难治性COVID-19相关呼吸衰竭患者的一种潜在救命治疗方法的可行性和效果。 | 患有难治性COVID-19相关呼吸衰竭的患者及其移植后的肺组织。 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单分子荧光原位杂交（smFISH） | 机器学习 | RNA测序数据 | 三名接受肺移植的患者和两名因COVID-19相关肺炎死亡的患者 |
| 9739 | 2024-08-10 |
Expression of the SARS-CoV-2 ACE2 Receptor in the Human Airway Epithelium
2020-07-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202003-0541OC
PMID:32432483
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研究论文 | 研究SARS-CoV-2病毒受体ACE2在人类气道上皮细胞中的表达情况 | 首次详细分析了ACE2在不同类型气道上皮细胞中的表达模式，并探讨了吸烟对ACE2表达的影响 | 研究样本仅限于非吸烟者和吸烟者，未涵盖所有可能的人群 | 探究SARS-CoV-2病毒受体ACE2在人类气道上皮细胞中的表达及其对病毒感染的影响 | 人类气道上皮细胞中的ACE2表达 | NA | COVID-19 | 微阵列分析，RNA测序，10x单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 包括非吸烟者和吸烟者的气管、大气道和小气道上皮细胞样本 |
| 9740 | 2024-08-09 |
Single-cell and spatial omics: exploring hypothalamic heterogeneity
2025-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00231
PMID:38993130
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综述 | 本文综述了单细胞和空间组学技术在探索下丘脑细胞类型复杂分子遗传多样性中的应用价值 | 单细胞和空间组学技术的发展克服了早期技术挑战，提供了理解下丘脑复杂时空转录多样性和细胞类型特征的机会 | 单细胞/单核RNA测序需要从组织中分离细胞/核，可能导致神经网络空间信息的丢失 | 阐明下丘脑中复杂的动态细胞组织，以理解其在协调基本身体功能中的作用 | 下丘脑的细胞类型和神经网络的复杂组织 | NA | NA | 单细胞和空间组学技术 | NA | 转录组数据 | NA |