单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 9641 - 9660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9641 | 2024-08-13 |
A Low Expression of NRF2 Enhances Oxidative Stress and Autophagy in Myofibroblasts, Promoting Progression of Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2024-Aug-08, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究探讨了NRF2低表达如何通过增强氧化应激和自噬促进肌成纤维细胞在慢性阻塞性肺疾病（COPD）进展中的作用。 | 首次揭示了NRF2低表达在肌成纤维细胞中通过激活氧化应激和自噬途径促进COPD进展的机制。 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和小鼠模型，未来需在人类样本中验证这些发现。 | 探索慢性阻塞性肺疾病中炎症的潜在机制。 | 肌成纤维细胞在COPD进展中的作用及其与NRF2、氧化应激和自噬途径的关系。 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 使用GSE171541数据集中的肺组织单细胞RNA测序数据，并在小鼠模型中进行了实验验证。 |
| 9642 | 2024-08-13 |
Identifying polyamine related biomarkers in diagnosis and treatment of ulcerative colitis by integrating bulk and single-cell sequencing data
2024-08-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-69322-6
PMID:39103474
|
研究论文 | 本研究通过整合批量和单细胞测序数据，识别与溃疡性结肠炎诊断和治疗相关的聚胺相关生物标志物。 | 首次通过综合分析批量和单细胞测序数据，识别出与溃疡性结肠炎活动性和治疗反应相关的关键聚胺相关基因。 | 研究依赖于公开数据库的数据，可能存在样本选择偏倚；体外和体内实验验证的样本量有限。 | 旨在识别关键的聚胺相关基因，并探索这些基因与溃疡性结肠炎疾病状态和治疗反应之间的关系。 | 溃疡性结肠炎患者的聚胺代谢酶及其相关基因。 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | mRNA测序, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自GEO数据库的溃疡性结肠炎患者数据，具体样本数量未详细说明。 |
| 9643 | 2024-08-13 |
ST6GALNAC1-mediated sialylation in uterine endometrial epithelium facilitates the epithelium-embryo attachment
2024-Aug-05, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.07.021
PMID:39111624
|
研究论文 | 本文研究了ST6GALNAC1/sTn-Siglecs轴在胚胎植入中的作用 | 首次探讨了sTn-Siglecs轴在胚胎植入中的作用 | NA | 研究ST6GALNAC1/sTn-Siglecs轴在胚胎植入中的作用 | 人类和鼠类子宫内膜中的ST6GALNAC1和sTn | NA | NA | 免疫组织化学分析、体外植入模型、免疫沉淀结合质谱分析、单细胞RNA测序、免疫荧光染色 | NA | 蛋白质数据 | 人类和鼠类的子宫内膜细胞及胚胎 |
| 9644 | 2024-08-13 |
Intratumoral Cell Heterogeneity in Patient-Derived Glioblastoma Cell Lines Revealed by Single-Cell RNA-Sequencing
2024-Aug-02, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25158472
PMID:39126040
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究了来自不同患者的胶质母细胞瘤细胞系的肿瘤内细胞异质性 | 揭示了患者来源的胶质母细胞瘤细胞系在细胞组成和基因组变异方面的差异 | 研究仅限于六个患者来源的胶质母细胞瘤细胞系和一个肿瘤样本 | 探究胶质母细胞瘤细胞模型中是否保持了肿瘤内异质性 | 胶质母细胞瘤细胞系和肿瘤样本的细胞组成及基因组变异 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 六个患者来源的胶质母细胞瘤细胞系和一个肿瘤样本 |
| 9645 | 2024-08-13 |
Pleiotropy, a feature or a bug? Toward co-ordinating plant growth, development, and environmental responses through engineering plant hormone signaling
2024-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103151
PMID:38823314
|
综述 | 本文探讨了如何利用系统生物学和单细胞测序技术来识别协调植物生长和发育的候选基因 | 结合系统生物学和单细胞测序技术，以及合成生物学方法来测试假设和定义基因型-表型关系 | 由于复杂的基因网络和通路，识别候选基因仍然是一个挑战 | 探索如何通过工程植物激素信号来协调植物生长、发育和环境响应 | 植物生长和发育的候选基因及其在特定时间和组织背景下的功能 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因序列 | NA |
| 9646 | 2024-08-13 |
Definition of a Multi-Omics Signature for Esophageal Adenocarcinoma Prognosis Prediction
2024-Aug-01, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16152748
PMID:39123475
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和批量RNA测序技术，识别了与食管腺癌（EAC）抗肿瘤反应相关的特定免疫细胞类型和差异表达基因，并验证了这些转录特征在TCGA患者队列中的预测效能。 | 本研究首次系统地分析了食管腺癌的转录特征，并提出了新的免疫生物标志物，用于预测术后预后和个性化辅助治疗决策。 | NA | 研究旨在识别和验证食管腺癌的转录特征，以预测临床结果和术后预后。 | 食管腺癌（EAC）的转录特征和免疫细胞类型。 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | RNA序列 | TCGA患者队列 |
| 9647 | 2024-08-13 |
Single-cell transcriptomic analysis of B cells reveals new insights into atypical memory B cells in COVID-19
2024-Aug, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29851
PMID:39132689
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了康复期COVID-19患者中S1和受体结合域蛋白特异性B细胞，旨在评估非典型记忆B细胞（MBCs）在严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）感染中的作用和发展途径 | 揭示了与疾病严重程度相关的B细胞亚群中的促炎特征，并提出了非典型MBCs通过生发中心的发展途径 | NA | 评估非典型记忆B细胞在SARS-CoV-2感染中的作用和发展途径 | 康复期COVID-19患者的S1和受体结合域蛋白特异性B细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同临床表现的康复期COVID-19患者 |
| 9648 | 2024-08-13 |
Advancements in Research and Treatment Applications of Patient-Derived Tumor Organoids in Colorectal Cancer
2024-Jul-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16152671
PMID:39123399
|
综述 | 本文综述了患者来源的肿瘤类器官（PDTOs）在结直肠癌（CRC）治疗中的应用，作为一种新型的药物抗性筛选工具 | PDTOs能够重现肿瘤的结构、细胞异质性和基因组景观，是一种有价值的体外预测药物筛选工具 | NA | 探讨PDTOs在预测结直肠癌治疗反应、药物抗性和生物标志物识别方面的潜力 | 结直肠癌及其治疗中的药物抗性问题 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 类器官 | NA |
| 9649 | 2024-08-13 |
Decoding Clonal Hematopoiesis: Emerging Themes and Novel Mechanistic Insights
2024-Jul-24, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16152634
PMID:39123361
|
综述 | 本文综述了克隆性造血（CH）的细胞机制及其与炎症因子的关系 | 揭示了CH在老年人群中的普遍性及早期启动的可能性，并探讨了环境因素通过异常炎症促进克隆扩增和疾病进展的机制 | 克隆性造血现象的许多方面仍待阐明，精确机制、特定环境下的驱动因素及克隆扩增途径尚未完全建立 | 探讨克隆性造血的细胞机制及其与炎症因子的关系 | 克隆性造血及其相关疾病 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 9650 | 2024-08-13 |
VNN2-expressing circulating monocytes exhibit unique functional characteristics and are decreased in patients with primary Sjögren's syndrome
2024-Jul, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2024.103275
PMID:38936146
|
研究论文 | 本研究旨在阐明外周血单核细胞中VNN2表达的意义及其在原发性干燥综合征（pSS）中的临床相关性 | 研究首次发现VNN2在单核细胞中的高表达，并探讨了其在pSS中的潜在作用和诊断价值 | 研究主要基于单细胞RNA测序和流式细胞术，未涉及VNN2功能的具体机制研究 | 阐明VNN2在原发性干燥综合征中的临床意义 | 外周血单核细胞中的VNN2表达 | NA | 原发性干燥综合征 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），流式细胞术 | NA | 细胞 | 未具体说明样本数量 |
| 9651 | 2024-08-13 |
Characterizing Rare Dormant and Cycling Lineages Using the Watermelon System
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3882-8_12
PMID:39037657
|
研究论文 | 本文介绍了Watermelon系统，该系统能够在单细胞水平上同时追踪细胞谱系、转录状态和增殖状态 | Watermon系统通过使用基于条形码的谱系追踪方法，实现了从单细胞RNA测序转录数据中解卷积谱系身份 | NA | 开发一种能够在单细胞水平上同时追踪细胞谱系、转录状态和增殖状态的新系统 | 罕见的休眠和循环细胞谱系 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录数据 | NA |
| 9652 | 2024-08-13 |
Early transcriptomic signatures and biomarkers of renal damage due to prolonged exposure to embedded metal
2023-12, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-023-09806-9
PMID:37058270
|
研究论文 | 本文研究了长期暴露于嵌入金属导致的肾脏损伤的早期转录组特征和生物标志物 | 结合高通量转录组学和深度学习技术，有效识别受金属暴露影响的肾细胞，并发现miRNA-423作为早期系统性标志物 | NA | 研究长期暴露于有毒重金属导致的肾脏损伤的早期分子特征 | 肾脏组织和血清样本中的RNA | 数字病理学 | 肾脏损伤 | RNA测序 | 随机森林 | RNA | 使用大鼠模型进行实验 |
| 9653 | 2024-08-13 |
Hyperhomocysteinemia lowers serum testosterone concentration via impairing testosterone production in Leydig cells
2023-12, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-023-09819-4
PMID:37495868
|
研究论文 | 研究报告了高同型半胱氨酸血症（HHcy）通过影响睾丸间质细胞（LCs）中的睾酮生成，导致血清睾酮水平降低 | 首次揭示了HHcy通过下调关键转录因子Nr5a1及其相关基因，影响睾酮合成，并发现了新的细胞群——巨噬细胞样睾丸间质细胞（McLCs） | NA | 探讨高同型半胱氨酸血症对睾酮生成的影响及其机制 | 高同型半胱氨酸血症小鼠的睾丸间质细胞 | NA | 男性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 高同型半胱氨酸血症小鼠 |
| 9654 | 2024-08-13 |
Trps1 acts as a regulator of Sf-1 transcription and testosterone synthesis in mouse Leydig cells
2023-12, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-023-09823-8
PMID:37531013
|
研究论文 | 本研究探讨了Trps1基因在小鼠Leydig细胞中对睾酮合成的影响及其机制 | 首次揭示了Trps1通过调节Sf-1转录和组蛋白乙酰化影响睾酮合成 | NA | 探索睾酮生物合成中的关键因素，为疾病研究和临床治疗提供新视角 | 小鼠Leydig细胞中的Trps1基因及其对睾酮合成的影响 | NA | 男性不育 | 单细胞RNA测序分析 | NA | RNA | 小鼠Leydig细胞 |
| 9655 | 2024-08-13 |
Single-cell RNA sequencing reveals differences between force application and bearing in ankle cartilage
2023-12, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-023-09829-2
PMID:37783808
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了踝关节软骨在不同受力条件下的差异 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了踝关节软骨在受力和承力区域的分子差异 | 样本来自因致命事故死亡的捐赠者，可能影响结果的普遍性 | 深入了解软骨细胞在不同受力条件下的功能 | 踝关节软骨组织中的软骨细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 共分析了149,816个细胞，来自6名捐赠者的11个软骨组织样本 |
| 9656 | 2024-08-13 |
GapClust is a light-weight approach distinguishing rare cells from voluminous single cell expression profiles
2021-07-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24489-8
PMID:34234139
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为GapClust的轻量级算法，用于从超大规模的单细胞RNA测序数据集中检测稀有细胞类型 | GapClust算法在速度和内存效率上达到了最先进的水平，并且在多样本实验数据集上展示了优于其他近期方法的性能 | NA | 开发一种高效的算法来识别超大规模单细胞RNA测序数据集中的稀有细胞类型 | 稀有细胞类型 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 表达谱 | 包括肠和68k PBMC数据集 |
| 9657 | 2024-08-13 |
Compensatory hepatic adaptation accompanies permanent absence of intrahepatic biliary network due to YAP1 loss in liver progenitors
2021-07-06, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109310
PMID:34233187
|
研究论文 | 研究探讨了Yes相关蛋白1（YAP1）在肝脏发育中的作用及其对肝细胞适应性的影响 | 首次揭示了YAP1在肝脏发育中的关键作用，并展示了肝细胞在没有胆管网络情况下的深刻适应能力 | NA | 探究YAP1在肝脏发育中的作用及肝细胞的适应性 | YAP1在肝脏发育中的作用及肝细胞的适应性 | NA | NA | 单细胞RNA测序分析 | NA | RNA序列 | NA |
| 9658 | 2024-08-13 |
[Progress in Single-cell RNA Sequencing of Lung Adenocarcinoma]
2021-Jun-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在肺腺癌研究中的应用和进展 | 单细胞测序作为一种新型测序方法，能够在单细胞水平上对细胞群体进行特定分析，揭示每种细胞类型的独特变化，并提供对异质性基质细胞和癌细胞的准确评估 | 尽管单细胞测序技术有诸多优势，但其在临床应用中仍面临技术挑战和数据解读的复杂性 | 深入理解肺腺癌的发病机制、肿瘤微环境的异质性及药物耐药形成的机制，以发现新的治疗靶点 | 肺腺癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 9659 | 2024-08-13 |
Therapeutic Targeting of Transcription Factors to Control the Cytokine Release Syndrome in COVID-19
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.673485
PMID:34163359
|
研究论文 | 本文系统探索了COVID-19中细胞因子释放综合征（CRS）相关的炎症细胞因子的转录调控因子，以识别可用于治疗靶点的转录因子（TFs）及其已批准的药物 | 本文通过整合TF-细胞因子基因相互作用资源与单细胞RNA-seq表达数据，发现了与COVID-19患者中上调的16种细胞因子相关的95个TFs，并识别出19个可作为FDA批准药物靶点的TFs | 需要进一步研究这些候选药物的重新定位，以确定治疗COVID-19患者CRS的有效疗法 | 探索COVID-19中CRS的治疗方法 | COVID-19患者的细胞因子释放综合征 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA | 来自COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液细胞 |
| 9660 | 2024-08-13 |
A community-based transcriptomics classification and nomenclature of neocortical cell types
2020-12, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-020-0685-8
PMID:32839617
|
研究论文 | 本文提出了一种基于转录组学的哺乳动物新皮层细胞类型的分类和命名法，旨在通过社区合作和数据聚合模型来统一和标准化细胞类型的分类。 | 首次提出基于单细胞转录组学的高通量测量方法，并建议采用基于转录组的分类法和标准化命名法，以及社区合作的数据聚合模型。 | NA | 为了理解皮层电路的功能，需要对细胞多样性进行分类和命名，以实现对细胞类型的统一和标准化。 | 哺乳动物新皮层的细胞类型。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |