单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 9641 - 9660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9641 | 2025-10-07 |
Precise measurement of CRISPR genome editing outcomes through single-cell DNA sequencing
2025-Jun-12, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2025.101449
PMID:40225018
|
研究论文 | 本研究利用单细胞DNA测序技术精确测量CRISPR基因组编辑结果 | 首次采用单细胞测序技术在单细胞水平全面分析CRISPR编辑结果，包括编辑合子性、结构变异和细胞克隆性 | 未明确说明样本规模和实验验证的局限性 | 开发精确测量基因编辑结果的方法以确保基因治疗产品的安全性 | 经过三重编辑的细胞基因型 | 基因组编辑 | NA | 单细胞DNA测序 | NA | DNA序列数据 | NA | Mission Bio | 单细胞DNA测序 | Tapestri | Tapestri单细胞DNA测序平台 |
| 9642 | 2025-10-07 |
Proline mitigates antibiotic resistance evolution induced by ciprofloxacin at environmental concentrations
2025-Jun-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137561
PMID:39938368
|
研究论文 | 本研究通过实验发现脯氨酸能够有效缓解环境中环丙沙星诱导的抗生素耐药性进化 | 首次发现脯氨酸可通过调节细菌代谢状态来抑制抗生素耐药性进化，并揭示了其作用机制 | 研究主要针对土壤分离的大肠杆菌，对其他菌种和环境的应用效果需进一步验证 | 探索氨基酸在控制环境抗生素耐药性进化中的作用 | 土壤分离的大肠杆菌及其他细菌种群（如假单胞菌属和沙雷氏菌属） | 微生物学 | 细菌感染 | 转录组学，C代谢通量分析，单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据，代谢通量数据，单细胞RNA测序数据 | 18种氨基酸筛选，24天进化实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9643 | 2025-10-07 |
Reading of Human Acute Immune Dynamics in Omicron SARS-CoV-2 Breakthrough Infection
2025-Apr-15, Emerging microbes & infections
IF:8.4Q1
DOI:10.1080/22221751.2025.2494705
PMID:40231451
|
研究论文 | 本研究通过纵向追踪奥密克戎突破感染患者的免疫动态，揭示了其与初感染不同的免疫应答特征 | 首次系统描绘奥密克戎突破感染期间的人类急性免疫动态，发现单核细胞来源的S100A8/A9在轻症早期显著升高并持续存在 | 样本量较小（13名参与者），仅观察至症状出现后7天 | 解析SARS-CoV-2突破感染的免疫应答动态 | 奥密克戎突破感染患者 | 免疫学 | COVID-19 | 转录组测序,单细胞测序,TCR测序,BCR测序,Olink蛋白质组学,抗原-抗体结合实验 | NA | 血液样本,转录组数据,蛋白质组数据,免疫受体序列数据 | 13名参与者 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞多组学 | NA | NA |
| 9644 | 2024-12-21 |
Correction to: The pathogenesis of endometriosis and adenomyosis: insights from single-cell RNA sequencing
2025-Apr-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioae184
PMID:39701072
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9645 | 2025-10-07 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveals the key role of MCAM+ tip-like endothelial cells in osteosarcoma metastasis
2025-Apr-13, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00896-8
PMID:40221534
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示了MCAM+尖端样内皮细胞在骨肉瘤转移中的关键作用 | 首次系统构建骨肉瘤内皮细胞单细胞图谱，发现尖端样内皮细胞在转移灶中富集并鉴定MCAM为其关键功能基因 | 未明确MCAM促进血管生成和转移的具体分子机制 | 探究尖端样内皮细胞在骨肉瘤转移中的作用机制 | 骨肉瘤患者的内皮细胞，特别是尖端样内皮细胞 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, qRT-PCR, 管形成实验, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 实验验证数据 | 未明确具体样本数量，包括原发肿瘤、转移灶和正常淋巴结样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9646 | 2025-10-07 |
ITGB2 and ICAM3 predict increased survival of sepsis with decreased intercellular communication in cytotoxic CD8+ T cells
2025-Apr-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-93685-z
PMID:40221459
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序识别与脓毒症免疫相关的关键基因，发现ITGB2和ICAM3可预测脓毒症生存率增加 | 首次揭示细胞毒性CD8+T细胞中ITGB2、SELL和ICAM3低表达通过减少细胞间通讯不利于脓毒症生存 | 研究样本量有限，仅使用两个GEO数据集和小鼠模型验证 | 识别与脓毒症免疫相关的关键基因 | 脓毒症患者的CD8+T细胞 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, KEGG分析 | NA | 基因表达数据 | GSE167363和GSE54514数据集，加小鼠CLP模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9647 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing characterization of Holstein cattle blood and milk immune cells during a chronic Staphylococcus aureus mastitis infection
2025-Apr-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-96657-5
PMID:40221598
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析荷斯坦奶牛在慢性金黄色葡萄球菌乳腺炎感染期间血液和乳汁免疫细胞的特征 | 首次使用单细胞RNA测序技术同时分析乳腺炎感染期间血液和乳汁中的免疫细胞，揭示了乳腺局部特异性粒细胞簇及其基因特征 | 研究仅涉及三头中期泌乳荷斯坦奶牛，样本量较小 | 研究慢性金黄色葡萄球菌乳腺炎感染期间免疫反应的细胞和分子特征 | 荷斯坦奶牛的血液和乳汁免疫细胞 | 单细胞组学 | 乳腺炎 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 3头中期泌乳荷斯坦奶牛 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9648 | 2025-10-07 |
Single Molecule Fluorescence In Situ Hybridization Using RNAscope to Study Hematopoietic and Vascular Interactions in the Zebrafish Embryo and Larva
2025-Apr-05, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5269
PMID:40224667
|
研究论文 | 本文介绍了一种使用RNAscope技术优化单分子荧光原位杂交方案，用于研究斑马鱼胚胎和幼体阶段造血干细胞前体与血管的相互作用 | 优化了RNAscope技术在斑马鱼模型中的应用，提高了mRNA检测的灵敏度和空间分辨率，能够可视化深埋在内部器官中的造血生态位 | 主要局限在于技术方法专注于斑马鱼模型，可能在其他物种中的适用性需要进一步验证 | 研究造血干细胞前体如何从血管中出现并在发育生态位中定植的过程 | 斑马鱼胚胎和幼体阶段的造血干细胞前体及其血管生态位 | 空间转录组学 | NA | 单分子荧光原位杂交，RNAscope技术，荧光共聚焦显微镜 | NA | mRNA表达数据，荧光图像 | 斑马鱼胚胎和幼体 | Advanced Cell Diagnostics | 单分子荧光原位杂交，空间转录组学 | RNAscope | RNAscope技术结合高灵敏度mRNA检测和高分辨率荧光共聚焦成像 |
| 9649 | 2025-10-07 |
TET3 is expressed in prostate cancer tumor-associated macrophages and is associated with anti-androgen resistance
2025-Apr, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-024-03708-w
PMID:39240303
|
研究论文 | 本研究探讨TET3在前列腺癌肿瘤相关巨噬细胞中的表达及其对抗雄激素治疗疗效的影响 | 首次发现TET3在前列腺癌肿瘤相关巨噬细胞中特异性表达，并揭示其与抗雄激素治疗敏感性的关联 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证机制 | 研究TET3在前列腺癌中的表达特征及其对抗雄激素治疗疗效的影响 | 前列腺癌组织和肿瘤相关巨噬细胞 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, CIBERSORT算法, 伪时间分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 1965例前列腺癌病例, 493例正常前列腺组织, 21292个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9650 | 2025-10-07 |
ApoE ε4-dependent Alteration of CXCR3 + CD127+ CD4+ T cells associates with elevated plasma neurofilament light chain in Alzheimer's disease
2025-Apr, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.1177/13872877251320123
PMID:40112322
|
研究论文 | 本研究通过单细胞质谱流式技术揭示了阿尔茨海默病患者外周血中CXCR3+CD127+ Th1细胞与神经丝轻链蛋白的负相关性 | 首次发现CXCR3+CD127+ Th1细胞与神经丝轻链的关联具有ApoE ε4依赖性，并揭示了该细胞群在脑脊液与外周血中的差异分布 | 样本量有限，机制研究不够深入，需要进一步验证 | 表征阿尔茨海默病患者外周血适应性免疫细胞组成 | 阿尔茨海默病患者和健康对照的外周血单个核细胞及血浆样本 | 免疫学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞质谱流式技术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞蛋白质组数据, 单细胞转录组数据, 蛋白质浓度数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞质谱流式, 单细胞RNA测序 | CyTOF | 质谱流式细胞技术分析外周血单个核细胞 |
| 9651 | 2025-10-07 |
Large Peritoneal Macrophages Play No Role in the Pathogenesis of Postoperative Ileus Induced by Intestinal Manipulation
2025-Apr, Neurogastroenterology and motility
IF:3.5Q2
DOI:10.1111/nmo.14997
PMID:39777769
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和细胞迁移实验证明大腹膜巨噬细胞在术后肠梗阻发病机制中不起作用 | 首次通过单细胞测序和细胞特异性清除技术明确排除了大腹膜巨噬细胞在术后肠梗阻中的作用 | 研究仅关注早期POI阶段，未探讨长期效应或其他潜在机制 | 探究大腹膜巨噬细胞在术后肠梗阻发病机制中的作用 | 小鼠肠道操作模型中的免疫细胞 | 免疫学 | 术后肠梗阻 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, qPCR, 免疫荧光, 细胞过继转移 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9652 | 2025-10-07 |
Asthma-derived genetic signature predicts lung cancer prognosis: a multi-scale omics investigation
2025-Mar-31, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-24-1697
PMID:40223964
|
研究论文 | 通过多组学方法研究哮喘与肺癌的关联，并开发基于哮喘相关基因的肺癌预后模型 | 首次将哮喘相关基因特征应用于肺癌预后预测，结合流行病学、孟德尔随机化和单细胞测序进行多尺度验证 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探索哮喘与肺癌的关联并开发预后预测模型 | 哮喘和肺癌患者 | 生物信息学 | 肺癌 | 全基因组关联研究, 孟德尔随机化, RNA测序, 单细胞RNA测序 | 预后预测模型 | 基因组数据, 转录组数据, 流行病学数据 | 1990-2019年全球疾病负担数据及公共数据库样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9653 | 2025-10-07 |
An Efficient Method for Extracting Human Fallopian Tube Epithelia for Single-cell Analyses
2025-Mar-28, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67753
PMID:40228013
|
研究论文 | 本文介绍了一种从新鲜输卵管中高效分离上皮细胞用于单细胞分析的方法 | 开发了一种能够在4-6小时内从新鲜输卵管中分离上皮细胞的方法，具有最小的基质细胞污染 | NA | 建立输卵管上皮细胞的有效分离方法 | 人类输卵管上皮细胞 | 单细胞分析 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞悬浮液 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9654 | 2025-10-07 |
Disulfiram ameliorates bone loss in ovariectomized mice by suppressing osteoclastogenesis
2025-Mar, Journal of bone and mineral metabolism
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s00774-024-01555-x
PMID:39373772
|
研究论文 | 本研究探讨了双硫仑在卵巢切除小鼠模型中改善骨质疏松的作用机制 | 首次在体内证实双硫仑通过抑制破骨细胞生成早期阶段的Tnfrsf11a表达来改善骨丢失 | 研究仅使用小鼠模型，未涉及人类临床试验 | 研究双硫仑在骨质疏松小鼠模型中对破骨细胞生成的影响 | 卵巢切除小鼠模型和原代破骨细胞培养 | 骨代谢研究 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，微计算机断层扫描，骨形态计量分析 | NA | 基因表达数据，影像数据，细胞计数数据 | 卵巢切除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9655 | 2025-10-07 |
Single-Cell Profiling of Tubular Epithelial Cells in Adaptive State in the Urine Sediment of Patients With Early and Advanced Diabetic Kidney Disease
2025-Mar, Kidney international reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.ekir.2024.11.002
PMID:40225386
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析糖尿病肾病患者尿沉渣中的适应性状态肾小管上皮细胞 | 首次在糖尿病肾病患者尿液中鉴定出适应性状态肾小管上皮细胞，并发现其不同状态比例具有诊断价值 | 样本量有限，仅针对糖尿病肾病患者进行研究 | 探究糖尿病肾病患者尿液中适应性状态肾小管上皮细胞的存在及其临床意义 | 糖尿病肾病患者的尿液样本 | 单细胞组学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 轨迹推断分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 9656 | 2025-10-07 |
Unraveling tumoral heterogeneity and angiogenesis-associated mechanisms of PD-1 and LAG-3 dual inhibition in lung cancers by single-cell RNA sequencing
2025-Mar, Chinese medical journal pulmonary and critical care medicine
DOI:10.1016/j.pccm.2025.02.004
PMID:40226601
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示PD-1和LAG-3双重抑制在肺癌中的抗肿瘤机制 | 首次在肺鳞癌PDX模型中证实PD-1和LAG-3双重抑制的协同抗肿瘤效果，并发现其与肿瘤异质性评分低、MHC I类通路上调和肿瘤血管正常化相关 | 研究仅使用PDX模型，未涉及人体临床试验；对腺癌和小细胞肺癌模型无效 | 阐明PD-1和LAG-3双重抑制在肺癌中的协同抗肿瘤机制 | 肺癌患者来源异种移植模型 | 单细胞测序分析 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析、差异表达基因分析 | 单细胞转录组数据 | 8127个细胞（2699个基底细胞、4109个恶性细胞、1319个上皮细胞） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9657 | 2025-10-07 |
Integrating bulk and single-cell RNA sequencing data: unveiling RNA methylation and autophagy-related signatures in chronic obstructive pulmonary disease patients
2025-02-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-87437-2
PMID:39893187
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA测序和单细胞RNA测序数据，揭示了慢性阻塞性肺疾病中RNA甲基化和自噬相关特征 | 首次系统整合bulk RNA-seq和scRNA-seq数据研究COPD中RNA甲基化与自噬的关联，发现FTO和IGF2BP2作为关键RNA甲基化调控因子在巨噬细胞中表达下调 | 研究主要基于公共数据库数据，部分发现需要通过动物模型验证，样本来源和数量有限 | 研究RNA甲基化调控因子及其与自噬在COPD发病机制中的作用 | COPD患者和非COPD患者的肺组织样本，COPD小鼠模型 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 流式细胞术 | 逻辑回归, WGCNA, 基因集富集分析 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的COPD和非COPD患者样本，具体数量未明确说明 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9658 | 2025-10-07 |
Comprehensive analysis reveals the tumor suppressor role of macrophage signature gene FCER1G in hepatocellular carcinoma
2025-02-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-88071-8
PMID:39893200
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和基因组分析揭示巨噬细胞特征基因FCER1G在肝细胞癌中的肿瘤抑制作用 | 首次系统性地识别巨噬细胞相关特征基因并构建基于LASSO回归的预后预测模型，发现FCER1G在HCC中的肿瘤 suppressor 功能 | 样本量较小（仅7个HCC样本），未发现MSI和TMB评分的显著差异 | 探索肝细胞癌中巨噬细胞特征基因及其对患者预后的影响 | 肝细胞癌患者样本和巨噬细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，基因组分析，主成分分析，t-SNE降维，LASSO回归 | LASSO回归模型 | 单细胞测序数据，基因组数据 | 7个HCC样本（来自GEO数据库），TCGA-LIHC队列验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9659 | 2025-10-07 |
MSC-EVs and UCB-EVs promote skin wound healing and spatial transcriptome analysis
2025-02-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-87592-6
PMID:39893214
|
研究论文 | 本研究探讨间充质干细胞来源细胞外囊泡和脐带血来源细胞外囊泡通过调节关键信号通路促进皮肤伤口愈合和减少瘢痕形成的机制 | 首次结合空间转录组学技术系统分析两种来源细胞外囊泡对皮肤伤口愈合过程中细胞异质性和信号通路的调控作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体临床试验验证 | 探究细胞外囊泡促进皮肤伤口愈合和减少瘢痕形成的分子机制 | 人真皮成纤维细胞和小鼠皮肤伤口模型 | 空间转录组学 | 皮肤创伤 | 超速离心法、透射电镜、纳米颗粒追踪分析、Western blot、细胞划痕实验、细胞迁移实验、细胞增殖实验、空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、组织学图像、细胞实验数据 | 小鼠皮肤组织样本（分组对照） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9660 | 2025-10-07 |
Vascular smooth muscle cell-derived SO2 sulphenylated interferon regulatory factor 1 to inhibit VSMC senescence
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1516885
PMID:40223932
|
研究论文 | 本研究揭示了内源性二氧化硫通过亚磺酰化干扰素调节因子1抑制血管平滑肌细胞衰老的分子机制 | 首次发现SO2通过IRF1蛋白C83位点的亚磺酰化修饰抑制VSMC衰老的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系，人类临床相关性需要进一步验证 | 探索内源性SO2在血管平滑肌细胞衰老中的作用及其分子通路 | 老年小鼠、VSMC特异性AAT1敲除小鼠、D-半乳糖处理的主动脉环和大鼠VSMC系A7r5 | 心血管生物学 | 心血管疾病 | Western blot、单细胞RNA测序、实时定量PCR、SA-β-gal染色、生物素转换实验、定点突变 | NA | 蛋白质表达数据、基因表达数据、细胞染色数据 | 老年小鼠(24月龄)、基因修饰小鼠模型、细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |