单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
9621 2024-08-16
[The application of the diagnosis and therapy of single cell sequencing technology in central nervous system tumors]
2024-Aug-06, Zhonghua yu fang yi xue za zhi [Chinese journal of preventive medicine]
综述 本文综述了单细胞测序技术在中枢神经系统肿瘤的异质性、诊断、治疗及预后方面的应用 单细胞测序技术为揭示中枢神经系统肿瘤的复杂生态系统提供了机会 大多数研究成果尚未达到临床应用水平 探讨单细胞测序在中枢神经系统肿瘤中的应用及其对肿瘤预后和复发预防的潜在影响 中枢神经系统肿瘤的异质性、诊断、治疗及预后 数字病理学 神经系统肿瘤 单细胞测序技术 NA 细胞 NA
9622 2024-08-16
Integrated Single-Cell RNA-seq and ATAC-seq Reveals Heterogeneous Differentiation of CD4+ Naive T Cell Subsets is Associated with Response to Antidepressant Treatment in Major Depressive Disorder
2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过综合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和ATAC-seq技术,分析了8名健康个体和8名重度抑郁症(MDD)患者在接受抗抑郁治疗前后的外周血单个核细胞,揭示了CD4+幼稚T细胞亚群的异质性分化与抗抑郁治疗反应的关联。 本研究首次结合scRNA-seq和ATAC-seq技术,揭示了MDD患者中CD4+幼稚T细胞的异质性分化与抗抑郁治疗反应的关联,并识别出响应者中特定激活的CD4+幼稚T细胞群及其上游调控因子ETS。 研究样本量较小,且仅包括8名MDD患者和8名健康个体,可能影响结果的普遍性。 探讨重度抑郁症患者抗抑郁治疗反应的分子机制。 重度抑郁症(MDD)患者和健康个体的外周血单个核细胞。 数字病理学 抑郁症 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和ATAC-seq NA RNA和染色质可及性数据 8名MDD患者和8名健康个体
9623 2024-08-16
Unraveling the connection between Hashimoto's Thyroiditis and non-alcoholic fatty liver disease: exploring the role of CD4+central memory T cells through integrated genetic approaches
2024-Aug, Endocrine IF:3.0Q2
研究论文 本研究通过综合遗传方法探讨桥本甲状腺炎与非酒精性脂肪肝病之间的联系,特别是CD4+中央记忆T细胞的作用。 本研究首次通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化等方法,揭示了CD4+中央记忆T细胞在桥本甲状腺炎和非酒精性脂肪肝病中的关键作用,并鉴定了MAGI3基因作为这两种疾病的标志基因。 NA 探索桥本甲状腺炎与非酒精性脂肪肝病之间的潜在联系。 桥本甲状腺炎和非酒精性脂肪肝病患者及健康对照的CD4+中央记忆T细胞。 遗传学 桥本甲状腺炎,非酒精性脂肪肝病 单细胞RNA测序,孟德尔随机化 NA 基因表达数据 桥本甲状腺炎、非酒精性脂肪肝病及健康对照的单细胞RNA测序数据
9624 2024-08-16
B cells expressing mutated IGHV1-69-encoded antigen receptors related to virus neutralization show lymphoma-like transcriptomes in patients with chronic HCV infection
2024-Aug-01, Hepatology communications IF:5.6Q1
研究论文 本文研究了慢性HCV感染患者中表达突变IGHV1-69编码抗原受体的B细胞,这些细胞与病毒中和相关,并显示出类似淋巴瘤的转录组特征 首次揭示了淋巴瘤样细胞可能源自抗HCV免疫反应,并提供了这些细胞在病毒清除后仍持续存在并可能导致B细胞功能障碍和淋巴瘤风险的机制基础 NA 探讨慢性HCV感染患者中B细胞的免疫反应及其与淋巴瘤样细胞的关系 慢性HCV感染患者及接受直接抗病毒治疗的患者的B细胞受体(BCR) 数字病理学 肝病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 慢性HCV感染患者及HCV治疗后持续病毒学应答(SVR)患者的样本
9625 2024-08-16
In vivo single-cell CRISPR uncovers distinct TNF programmes in tumour evolution
2024-Aug, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本文开发了一种体内单细胞CRISPR策略,用于系统研究150个最常突变的鳞状细胞癌基因的组织范围克隆动态,揭示了肿瘤坏死因子(TNF)信号模块在肿瘤进化中的作用。 首次采用体内单细胞CRISPR筛选技术,结合超声引导的子宫内慢病毒微注射、单细胞RNA测序和引导捕获,实时监测克隆扩展并记录其背后的基因程序。 NA 研究肿瘤进化模型中,恶性转化前随机分布的驱动突变如何导致少数克隆转化为恶性肿瘤的机制。 150个最常突变的鳞状细胞癌基因的组织范围克隆动态。 数字病理学 鳞状细胞癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA
9626 2024-08-16
Integrated multi-omic analyses uncover the effects of aging on cell-type regulation in glucose-responsive tissues
2024-Aug, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本研究通过整合转录组学、甲基组学、单细胞RNA测序和代谢组学数据,探讨了衰老对葡萄糖应答组织中细胞类型调控的影响 首次全面评估了衰老及其相关细胞类型响应的影响,并识别了潜在的血液生物标志物 NA 研究衰老对葡萄糖应答组织中细胞类型调控的影响 脂肪组织和肌肉组织 组学 NA 转录组学、甲基组学、单细胞RNA测序、代谢组学 共表达网络分析 转录组、甲基组、单细胞RNA、代谢组 NA
9627 2024-08-16
Tracing Immunological Interaction in Trimethylamine N-Oxide Hydrogel-Derived Zwitterionic Microenvironment During Promoted Diabetic Wound Regeneration
2024-Aug, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
研究论文 本研究开发了一种新型三甲胺N-氧化物(TMAO)衍生的两性离子水凝胶,用于促进糖尿病伤口愈合,并探索了两性离子水凝胶周围的多细胞生态系统 首次使用两性离子水凝胶促进糖尿病伤口愈合,并通过单细胞RNA测序揭示了不同细胞在两性离子微环境中的作用 NA 解析糖尿病伤口愈合过程中的多细胞特征并寻求治疗策略 糖尿病伤口愈合过程中的免疫调节机制 生物材料 糖尿病 单细胞RNA测序 NA RNA NA
9628 2024-08-16
Astaxanthin Alleviates Autoimmune Hepatitis by Modulating CD8+ T Cells: Insights From Mass Cytometry and Single-Cell RNA Sequencing Analyses
2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过使用质谱流式细胞术和单细胞RNA测序分析,探讨了虾青素(ASX)通过调节CD8+ T细胞减轻自身免疫性肝炎(AIH)的作用。 本研究首次通过质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术,揭示了虾青素对CD8+ T细胞数量和功能的调节作用,并预测了关键的转录因子及构建了细胞间通信网络。 研究仅在AIH的小鼠模型中进行,未来需要进一步在人体中验证虾青素的效果和机制。 探讨虾青素在自身免疫性肝炎中的作用及其对CD8+ T细胞的调节机制。 自身免疫性肝炎(AIH)的小鼠模型及CD8+ T细胞。 NA 自身免疫性疾病 质谱流式细胞术,单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 细胞数据 小鼠模型中的多个样本
9629 2024-08-16
Sexually Dimorphic Response to Hepatic Injury in Newborn Suffering from Intrauterine Growth Restriction
2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了宫内生长受限(IUGR)新生猪肝脏细胞的景观,揭示了性别依赖的IUGR诱导的肝脏损伤模式 首次探索了利用早期发育可塑性逆转不良胎儿编程结果的可能性,并发现了Apolipoprotein A4(APOA4)作为IUGR男性中对抗缺氧的保护性反应的新型生物标志物 研究仅限于猪模型,可能需要进一步的人体研究来验证结果 研究宫内生长受限对新生儿肝脏功能的影响及性别差异 宫内生长受限的新生猪 NA 肝脏疾病 scRNA-seq NA 细胞 来自同一胎儿的猪仔
9630 2024-08-16
Identification and Characterization of Metastasis-Initiating Cells in ESCC in a Multi-Timepoint Pulmonary Metastasis Mouse Model
2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,在多时间点肺转移小鼠模型中鉴定并表征了食管鳞状细胞癌(ESCC)中的转移起始细胞(MICs)。 本研究首次鉴定出ESCC中的转移起始细胞,并识别出一组7个转移起始标志基因(MIS),这些基因在功能研究和生物信息学分析中显示出对早期转移微环境的潜在重塑作用。 本研究主要基于小鼠模型和临床样本,未来需要进一步的人体临床试验来验证这些发现。 旨在鉴定和表征食管鳞状细胞癌中的转移起始细胞,并探索其在早期转移中的作用。 食管鳞状细胞癌(ESCC)中的转移起始细胞(MICs)及其相关标志基因。 数字病理学 食管癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 多个时间点的肺转移小鼠模型中的ESCC细胞
9631 2024-08-16
Mapping the unicellular transcriptome of the ascending thoracic aorta to changes in mechanosensing and mechanoadaptation during aging
2024-Aug, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 研究揭示了随着年龄增长,升主动脉的单细胞转录组变化及其在机械感应和机械适应性中的作用 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了升主动脉在衰老过程中的细胞衰老、重塑和炎症反应的变化 研究主要集中在升主动脉,对其他部位的主动脉变化未进行详细探讨 探索年龄增长对升主动脉机械感应和适应性的分子机制 升主动脉的单细胞转录组及其在衰老过程中的变化 数字病理学 老年疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 老年和年轻升主动脉组织的单细胞样本
9632 2024-08-16
CD58 Alterations Govern Antitumor Immune Responses by Inducing PDL1 and IDO in Diffuse Large B-Cell Lymphoma
2024-Jul-02, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过多种测序技术分析CD58在弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)中的基因特征,发现CD58的遗传改变与治疗反应和生存率降低相关,并揭示了CD58通过调控PDL1和IDO表达影响肿瘤免疫逃逸的机制。 首次全面分析了CD58在DLBCL中的基因特征及其对免疫反应的影响,揭示了CD58通过激活LYN/CD22/SHP1轴抑制JAK2/STAT1通路,从而调控PDL1和IDO表达的新机制。 研究主要集中在基因和分子层面,未涉及临床试验验证CD58相关治疗策略的有效性。 探究CD58在弥漫大B细胞淋巴瘤中的作用及其对免疫反应的影响,为改善患者治疗提供潜在靶点和策略。 弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者中的CD58基因及其表达。 免疫学 淋巴瘤 下一代测序(NGS)、RNA测序(RNA-seq)、全外显子测序、单细胞RNA测序 NA 基因组数据、转录组数据 所有入组的DLBCL患者
9633 2024-08-16
Single-cell transcriptomics across 2,534 microbial species reveals functional heterogeneity in the rumen microbiome
2024-Jul, Nature microbiology IF:20.5Q1
研究论文 本文通过滴液单细胞RNA测序和基于泛基因组的计算分析,开发了微生物组单细胞转录组学,以揭示瘤胃微生物组的功能异质性 本文开发了一种新的微生物组单细胞转录组学方法,并构建了瘤胃微生物组的单细胞转录组图谱 NA 揭示复杂群落和环境中单个微生物的活性 瘤胃微生物组的功能异质性 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因组数据 包括174,531个微生物细胞和2,534个物种
9634 2024-08-16
Molecular cascade reveals sequential milestones underlying hippocampal neural stem cell development into an adult state
2024-Jun-25, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过靶向单细胞RNA测序分析,揭示了小鼠海马齿状回早期新生期神经干细胞发育为成年状态的分子级联反应 首次详细描述了神经干细胞从发育状态过渡到成年状态的多步骤过程及其关键里程碑,包括静息前自噬爆发和细胞活性氧水平升高 NA 揭示神经干细胞从发育状态过渡到成年状态的过程、里程碑和机制 小鼠海马齿状回中的神经干细胞 神经科学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA
9635 2024-08-16
DNMT1-targeting remodeling global DNA hypomethylation for enhanced tumor suppression and circumvented toxicity in oral squamous cell carcinoma
2024-May-16, Molecular cancer IF:27.7Q1
研究论文 本研究通过靶向DNMT1调控口腔鳞状细胞癌(OSCC)中的全局DNA低甲基化,以增强肿瘤抑制并减少毒性 本研究首次揭示了DNMT1调控的全新全局DNA低甲基化模式,通过平衡信号协同作用来增强抗癌效果并减少潜在毒性 NA 探讨DNMT1在口腔鳞状细胞癌中的作用及其对全局DNA甲基化的影响 口腔鳞状细胞癌(OSCC) 数字病理学 口腔鳞状细胞癌 shRNA敲低技术,DNA甲基化微阵列,单细胞RNA测序 NA DNA甲基化数据,RNA序列数据 包括体外口腔癌细胞和异种移植OSCC小鼠模型
9636 2024-08-16
A Mettl16/m6A/mybl2b/Igf2bp1 axis ensures cell cycle progression of embryonic hematopoietic stem and progenitor cells
2024-May, The EMBO journal
研究论文 本文通过跨物种单细胞RNA测序分析,揭示了METTL16在胚胎造血干细胞和祖细胞(HSPCs)中的高表达及其在细胞周期进展中的关键作用。 首次发现METTL16通过m6A修饰调控细胞周期转录因子mybl2b,并通过METTL16-mA-MYBL2-IGF2BP1轴在人类中保守控制G1/S进展。 NA 阐明METTL16介导的m6A修饰在早期胚胎发育中对HSPC细胞周期进展的关键功能。 胚胎造血干细胞和祖细胞(HSPCs)及其细胞周期进展。 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 涉及斑马鱼和人类样本
9637 2024-08-16
Primary nasal viral infection rewires the tissue-scale memory response
2024-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析了小鼠鼻黏膜在初次和再次流感感染前后的细胞变化,揭示了组织层面记忆反应的重塑 首次详细描述了初次感染后鼻黏膜中细胞类型、亚型和状态的逐步变化,以及再次感染时加速和协调的髓样和淋巴样细胞反应 NA 探讨初次病毒感染如何塑造组织层面的记忆反应,为鼻靶向治疗和疫苗的合理设计提供依据 小鼠鼻黏膜在初次和再次流感感染前后的细胞变化 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 三个不同区域的鼻黏膜样本,包括初次和再次流感感染前后的样本
9638 2024-08-16
Single-cell profiling reveals immune aberrations in progressive idiopathic pulmonary fibrosis
2023-Apr-29, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术,详细描述了特发性肺纤维化患者外周血免疫系统的变化 首次在单细胞分辨率下详细描述了特发性肺纤维化患者外周血细胞群体的变化,并揭示了与疾病进展和生存率相关的免疫细胞亚群 NA 提供特发性肺纤维化稳定期和进展期外周免疫系统的变化图谱 特发性肺纤维化患者的外周血单个核细胞 数字病理学 肺纤维化 10x Chromium 5' 单细胞RNA测序 NA 细胞 38份外周血单个核细胞样本,来自25名特发性肺纤维化患者和13名匹配的对照
9639 2024-08-16
Cell-to-cell interaction analysis of prognostic ligand-receptor pairs in human pancreatic ductal adenocarcinoma
2021-Dec, Biochemistry and biophysics reports IF:2.3Q3
研究论文 本文通过整合生存分析和单细胞细胞间相互作用预测,研究了人胰腺导管腺癌中与预后相关的配体-受体对 首次系统地分析了细胞间相互作用通过配体-受体对与胰腺导管腺癌预后的关联,并识别了潜在的治疗靶点 需要进一步确定这些配体-受体对的临床意义 识别与胰腺导管腺癌患者预后相关的配体-受体对,为治疗提供潜在靶点 胰腺导管腺癌中的细胞间相互作用及其与预后的关联 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 涉及多个癌症队列的基因表达数据
9640 2024-08-16
High-throughput RNA sequencing of paraformaldehyde-fixed single cells
2021-09-24, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文介绍了一种名为FD-seq的高通量方法,用于固定、通透和分选的单细胞的液滴RNA测序,适用于甲醛固定的细胞。 FD-seq方法在固定和通透处理后能保持RNA完整性和相对基因表达水平,且能检测到比甲醇固定更多的基因和转录本。 NA 开发一种新的高通量单细胞RNA测序方法,以克服现有方法在处理甲醛固定细胞时的限制。 甲醛固定的单细胞,特别是支持人类肿瘤病毒KSHV裂解再激活的稀有细胞亚群和感染人类冠状病毒OC43的细胞。 基因组学 肿瘤病毒感染 RNA测序 NA RNA 文中未具体说明样本数量
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