单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 38610 篇文献,本页显示第 941 - 960 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
941 2026-04-11
Accurate Identification of Spatial Domain by Incorporating Global Spatial Proximity and Local Expression Proximity
2024-06-09, Biomolecules IF:4.8Q1
研究论文 本文提出了一种名为SECE的深度学习方法,用于准确识别空间转录组学数据中的空间域,通过整合全局空间邻近性和局部表达邻近性来优化组织微环境和生物功能分析 SECE方法首次同时捕捉局部和全局空间关系,并利用表达相似性和空间相似性聚合信息,克服了现有方法仅基于局部或全局关系进行分割的局限性 NA 提高空间转录组学数据中空间域识别的准确性,以更好地阐明组织微环境和生物功能 空间转录组学数据中的空间点(spots) 空间转录组学 NA 空间转录组学 深度学习 空间转录组学数据 六个真实空间转录组学数据集,涵盖四个不同平台 NA 空间转录组学 NA NA
942 2026-04-11
MYCT1 controls environmental sensing in human haematopoietic stem cells
2024-06, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究揭示了MYCT1在调控人类造血干细胞内吞和环境感知中的关键作用,以维持干细胞特性 首次将MYCT1识别为人类造血干细胞的关键调节因子,通过控制内吞作用和环境感知来维持干细胞特性,并发现其在细胞培养中下调是HSC扩增的脆弱点 研究主要基于胎儿肝脏和脐带血来源的HSPCs,未涉及成人或其他来源的造血干细胞,且机制细节如MYCT1与信号通路的相互作用需进一步探索 探究人类造血干细胞自我更新和移植能力的调控机制,以改善体外培养扩增功能 人类造血干细胞和祖细胞(HSPCs),包括胎儿肝脏和脐带血来源 单细胞组学 血液系统疾病 单细胞RNA测序,慢病毒介导的基因敲低和过表达 NA 单细胞RNA测序数据 人类胎儿肝脏和脐带血HSPCs样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
943 2026-04-11
Multiplex, single-cell CRISPRa screening for cell type specific regulatory elements
2024-Apr-30, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种结合多重CRISPRa扰动与单细胞RNA测序的实验框架,用于识别细胞类型特异性调控元件及其调控基因 开发了一种新方法,通过随机组合多个gRNA并利用单细胞RNA测序分析,系统性地测试CRISPRa对增强子和启动子的扰动效果,实现了细胞类型特异性调控元件的大规模筛选 方法可能依赖于细胞特定的染色质景观或额外作用因子,限制了在某些细胞类型中的普适性,且样本规模相对较小 旨在识别细胞类型特异性、CRISPRa响应的调控元件,以促进基因治疗中靶向基因激活的gRNA筛选 K562细胞和iPSC衍生的兴奋性神经元 基因编辑与单细胞组学 自闭症谱系障碍和神经发育障碍 CRISPRa、单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 使用493个gRNA靶向候选调控元件,在K562细胞和iPSC衍生神经元中进行测试 NA 单细胞RNA-seq NA NA
944 2026-04-11
Universal recording of immune cell interactions in vivo
2024-03, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本文报道了一种名为uLIPSTIC的通用技术,用于在体内记录免疫细胞之间以及免疫与非免疫细胞之间的瞬时物理相互作用 开发了通用版本的LIPSTIC技术,不再依赖特定受体-配体通路,能够记录任意细胞间的物理相互作用 未明确提及技术本身的局限性,但暗示了先前版本仅能测量特定细胞间相互作用的限制 开发一种通用技术以在体内记录细胞间的物理相互作用 免疫细胞(如CD8 T细胞、树突状细胞、调节性T细胞、滤泡辅助T细胞)与非免疫细胞(如肠道上皮细胞) 免疫学 NA LIPSTIC/uLIPSTIC技术,单细胞转录组学 NA 分子标记数据,单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
945 2026-04-11
Transcription factor NFYa controls cardiomyocyte metabolism and proliferation during mouse fetal heart development
2023-12-18, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 本研究探讨了转录因子NFYa在小鼠胎儿心脏发育过程中调控心肌细胞代谢和增殖的作用 揭示了NFYa通过与辅因子SP2相互作用,在转录水平激活连接代谢和增殖的基因,这是先前未被识别的心脏代谢转录调控机制 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类,且未深入探讨NFYa在成年心脏再生中的具体作用 探究NFYa在协调心肌细胞代谢和增殖中的机制,以理解胎儿心脏发育和再生的调控 小鼠胎儿心脏中的心肌细胞 数字病理学 心血管疾病 空间转录组分析,单细胞转录组分析 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
946 2026-04-11
Universal recording of cell-cell contacts in vivo for interaction-based transcriptomics
2023-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种通用版本的LIPSTIC技术(uLIPSTIC),用于在体内记录细胞间物理相互作用,并结合单细胞转录组学分析免疫细胞与非免疫细胞间的互作网络 开发了不依赖于特定受体-配体对的通用细胞间接触记录技术,扩展了原LIPSTIC技术的应用范围 未明确说明技术灵敏度或可能存在的假阳性/假阴性问题 开发通用技术以研究免疫细胞与非免疫细胞间的瞬时物理相互作用 免疫细胞(CD8 T细胞、调节性T细胞、滤泡辅助T细胞)与肠道上皮细胞等非免疫细胞 单细胞组学 NA 单细胞转录组学 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
947 2026-04-11
Targeting Immune-Fibroblast Crosstalk in Myocardial Infarction and Cardiac Fibrosis
2023-Jan-26, Research square
研究论文 本研究通过多组学单细胞分析揭示了人类心肌梗死和心脏纤维化中免疫-成纤维细胞交互作用的分子机制 首次在人类心脏疾病中系统探索免疫-成纤维细胞交互的分子机制,并识别出由IL-1β信号驱动的促纤维化成纤维细胞亚群 样本量相对有限(38名捐赠者),且动物模型与人类疾病表型的完全重现性仍有待验证 探究心肌梗死和心脏纤维化中免疫细胞与成纤维细胞之间的交互作用机制 人类心脏组织(急性梗死和慢性衰竭心脏)以及小鼠心脏损伤模型 单细胞多组学 心血管疾病 单细胞基因表达分析、表位映射、染色质可及性分析、空间转录组学 NA 单细胞多组学数据、空间转录组数据 38名捐赠者的人类心脏样本 NA 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、空间转录组学 NA NA
948 2026-04-11
Developmental regulation of epithelial cell cuboidal-to-squamous transition in Drosophila follicle cells
2022-11, Developmental biology IF:2.5Q2
研究论文 本研究揭示了果蝇卵泡细胞从立方体到鳞状形态转变的发育调控机制 发现蜕皮激素和JAK/STAT信号通路协同抑制转录因子Broad,从而调控上皮细胞形态重塑,并首次结合单细胞RNA测序数据揭示基因表达变化 研究局限于果蝇模型系统,在哺乳动物中的保守性尚未验证 探究上皮细胞形态转变的分子调控机制 果蝇卵泡上皮细胞 发育生物学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
949 2026-04-11
APOΕ4 lowers energy expenditure in females and impairs glucose oxidation by increasing flux through aerobic glycolysis
2021-09-06, Molecular neurodegeneration IF:14.9Q1
研究论文 本研究通过多组学方法揭示了APOE4等位基因在年轻女性中降低能量消耗并损害葡萄糖氧化的机制,与阿尔茨海默病相关的脑葡萄糖代谢减退有关 首次结合单细胞RNA测序和稳定同位素解析代谢组学,在星形胶质细胞、脑组织、小鼠和人类中系统定义了APOE4相关的代谢重编程,并发现年轻女性携带者中明显的能量消耗降低 研究主要关注年轻女性亚组,样本量可能有限,且机制在男性或其他年龄组中的普适性需进一步验证 探究APOE4等位基因如何影响脑葡萄糖代谢及全身能量代谢,以阐明阿尔茨海默病早期代谢变化的机制 表达人类APOE的转基因小鼠、年轻及中年人类参与者(包括APOE4携带者和非携带者) 代谢组学与神经科学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序(scRNAseq)、稳定同位素解析代谢组学(SIRM)、间接热量测定 NA 基因表达数据、代谢物数据、生理测量数据 小鼠脑组织及星形胶质细胞、人类参与者(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
950 2026-04-11
Ref-1 redox activity alters cancer cell metabolism in pancreatic cancer: exploiting this novel finding as a potential target
2021-Aug-10, Journal of experimental & clinical cancer research : CR IF:11.4Q1
研究论文 本研究探讨了Ref-1蛋白在胰腺癌代谢中的作用,通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析,揭示了Ref-1通过调节TCA循环影响癌细胞代谢和肿瘤生长 首次在缺氧条件下利用单细胞RNA测序和蛋白质组学结合,系统分析了Ref-1对胰腺癌细胞代谢通路的影响,并验证了其通过TCA循环功能障碍改变代谢的机制 研究主要基于体外细胞培养和动物模型,未涉及人类临床试验,且样本量相对有限 探究Ref-1蛋白在胰腺癌代谢调控中的作用,并评估其作为治疗靶点的潜力 胰腺癌细胞系(包括Ref-1敲低和对照细胞)以及小鼠异种移植模型 癌症代谢研究 胰腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、蛋白质组学、qRT-PCR、线粒体功能测定、Western blotting、NADP测定、3D共培养体外实验、异种移植体内研究 NA 单细胞RNA测序数据、蛋白质组学数据、基因表达数据 未明确指定具体样本数量,但涉及胰腺癌细胞系和小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
951 2026-04-11
Proteolysis targeting chimeras (PROTACs) are emerging therapeutics for hematologic malignancies
2020-07-27, Journal of hematology & oncology IF:29.5Q1
综述 本文综述了蛋白水解靶向嵌合体(PROTACs)作为新兴疗法在血液恶性肿瘤治疗中的应用潜力 提出利用最新的人类全组织单细胞RNA测序数据识别造血细胞类型特异性/选择性E3连接酶,以开发肿瘤特异性/选择性PROTACs,从而提高治疗安全性 NA 系统总结可用于治疗各种血液恶性肿瘤的已知PROTACs,并讨论提高其临床应用安全性的策略 蛋白水解靶向嵌合体(PROTACs)及其在血液恶性肿瘤治疗中的应用 NA 血液恶性肿瘤 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
952 2026-04-10
Loss of PINK1 impairs mitophagy and accelerates ovarian aging independent of Parkin
2026-May, Free radical biology & medicine
研究论文 本文探讨了PINK1和Parkin在卵巢衰老中的作用,发现PINK1缺失会损害线粒体自噬并加速卵巢衰老,而Parkin缺失则影响较小 首次明确PINK1而非Parkin是卵巢衰老的关键调节因子,通过单细胞RNA测序揭示了其在线粒体自噬和卵巢衰老转录特征中的作用 研究主要基于小鼠模型,人类卵巢中的具体机制尚需进一步验证 探究PINK1和Parkin在卵巢生理和衰老过程中的具体作用 小鼠卵巢组织、卵母细胞、颗粒细胞和早期胚胎 生物医学研究 卵巢衰老 bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
953 2026-04-10
Clonal hematopoiesis and lymphoma-associated mutations in hematopoietic progenitors in B-cell non-Hodgkin lymphoma
2026-Apr-09, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究通过全外显子组、靶向和单细胞测序方法,系统分析了B细胞非霍奇金淋巴瘤患者中的克隆造血和疾病起始前体,揭示了克隆造血在淋巴瘤发生发展中的作用 首次系统性地在B细胞非霍奇金淋巴瘤中描述了克隆造血突变,并发现了B细胞偏向的克隆扩增模式,以及淋巴瘤相关突变在造血祖细胞中的存在,为疾病起源提供了新见解 样本量相对较小(43例患者),且主要关注特定B细胞非霍奇金淋巴瘤亚型,可能限制了结果的普遍适用性 探究克隆造血和疾病起始前体在B细胞非霍奇金淋巴瘤中的贡献,以理解疾病进展和复发的机制 43例B细胞非霍奇金淋巴瘤患者,包括惰性和侵袭性亚型 基因组学 B细胞非霍奇金淋巴瘤 全外显子组测序、靶向测序、单细胞测序 NA 基因组数据、单细胞数据 43例患者 NA 单细胞测序 NA NA
954 2026-04-10
TBXAS1 deficiency causes autoinflammation responsive to IL-6 inhibitor
2026-Apr, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1
研究论文 本研究揭示了TBXAS1缺陷通过花生四烯酸代谢通路异常导致系统性自身炎症的分子机制,并证实IL-6抑制剂托珠单抗对该病症的有效治疗作用 首次将TBXAS1缺陷与系统性自身炎症联系起来,阐明了前列腺素E2通过EP2/cAMP/CREB通路诱导IL-6表达的新机制,并成功将IL-6抑制剂应用于Ghosal血骨发育不良综合征的治疗 研究仅纳入2例患者,样本量较小;机制研究主要基于体外实验,需进一步体内验证 探索TBXAS1缺陷导致自身炎症的分子机制并寻找靶向治疗方案 2例TBXAS1缺陷患者及其外周血单个核细胞 NA Ghosal血骨发育不良综合征 全外显子组测序、Sanger测序、定量逆转录PCR、Western blotting、细胞因子微球阵列、酶联免疫吸附试验、质谱分析、飞行时间质谱流式细胞术、单细胞RNA测序 NA 基因组数据、蛋白质数据、代谢物数据、单细胞转录组数据 2例患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
955 2026-04-10
Clonal differentiation of plasmablasts undergoing oral immunotherapy in patients with milk allergy
2026-Apr, Allergology international : official journal of the Japanese Society of Allergology IF:6.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞分析,描述了牛奶过敏患者在接受口服免疫治疗期间浆母细胞的克隆分化特征 首次在牛奶过敏患者口服免疫治疗中,通过单细胞转录组学和B细胞免疫受体分析,揭示了浆母细胞的克隆扩增、IgD克隆识别过敏原以及克隆树中超过80%的CDR克隆匹配,并发现IgA1抗体也能识别过敏原 研究仅基于2名患者的小样本,可能限制结果的普遍性和统计效力 旨在表征接受口服免疫治疗的牛奶过敏患者中浆母细胞的克隆分化特征 牛奶过敏患者在接受口服免疫治疗期间的浆母细胞 免疫学 食物过敏 单细胞转录组学分析、B细胞免疫受体分析、重组抗体谱分析 NA 单细胞转录组数据、B细胞受体序列数据 2名牛奶过敏患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
956 2026-04-10
Spatial Transcriptomics Analysis of Macrophage-to-Myofibroblast Transition in Bronchiolitis Obliterans Following Hematopoietic Stem Cell Transplantation
2026-Apr, Transplantation and cellular therapy IF:3.6Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,分析了造血干细胞移植后闭塞性细支气管炎中巨噬细胞向肌成纤维细胞转化的作用 首次在BO中应用空间转录组学揭示巨噬细胞向肌成纤维细胞转化的时空特异性基因表达模式,并明确了疾病进展中从炎症到纤维化的转录组转变 样本量较小(3例BO患者,2例对照),且为回顾性研究,需要更大规模的前瞻性研究验证 探究巨噬细胞向肌成纤维细胞转化是否参与造血干细胞移植后闭塞性细支气管炎的纤维化进程 造血干细胞移植后发生闭塞性细支气管炎患者的肺组织样本,以及肺癌患者的肺组织作为对照 数字病理学 肺移植相关并发症/纤维化肺病 免疫荧光染色,空间转录组学 无监督聚类分析 空间基因表达数据,免疫荧光图像 3例BO患者的肺移植样本,2例肺癌患者的肺组织作为对照 NA 空间转录组学 NA NA
957 2026-04-10
Identification of novel fibroblast subsets in diffuse cutaneous systemic sclerosis
2026-Apr, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,在弥漫性皮肤系统性硬化症中识别出新型成纤维细胞亚群,并探讨了CD9和FHL1蛋白在纤维化环境中的功能作用 首次在系统性硬化症中利用单细胞RNA测序揭示成纤维细胞的高度异质性,并鉴定出CD9和FHL1上调的新型成纤维细胞亚群,建立了FHL1与VGLL3调控之间的新机制联系 研究基于体外培养的皮肤成纤维细胞,可能无法完全反映体内微环境;样本量未在摘要中明确说明,可能限制统计效力 识别系统性硬化症中的新型成纤维细胞亚群并确定其功能角色 健康供体和弥漫性皮肤系统性硬化症患者的皮肤成纤维细胞 数字病理学 系统性硬化症 单细胞RNA测序,siRNA敲低实验,蛋白质水平验证 NA RNA测序数据,蛋白质表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
958 2026-04-10
Treatment nonresponders in lupus nephritis characteristically exhibit persistent type I interferon signalling in monocytes: a longitudinal single-cell transcriptomic analysis
2026-Apr, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1
研究论文 本研究通过纵向单细胞转录组分析,揭示了狼疮性肾炎治疗无应答者单核细胞中持续存在的I型干扰素信号特征 首次在狼疮性肾炎治疗过程中进行纵向单细胞转录组分析,并识别出单核细胞中持续的I型干扰素信号是治疗抵抗的关键特征 样本量较小(n=10),需要在更大规模的独立队列中进行验证 表征狼疮性肾炎治疗应答过程中的动态转录变化,识别治疗抵抗的生物标志物 活检证实活动性增殖性狼疮性肾炎患者的外周血单个核细胞和单核细胞 单细胞转录组学 狼疮性肾炎 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 加权基因共表达网络分析 转录组数据 单细胞RNA测序队列10名患者,bulk RNA测序验证队列13名患者 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
959 2026-04-10
A brain-driven neural circuit contributes to tissue regeneration in joint cartilage
2026-Apr, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1
研究论文 本研究揭示了一个大脑驱动的神经回路,通过调控去甲肾上腺素信号通路促进关节软骨的再生 首次实验证实大脑通过特定神经回路(PVNCRH神经元至滑膜交感神经)直接调控组织再生,并识别了ADRB2受体在Proteoglycan 4+细胞中的关键作用 研究主要基于小鼠模型和人类软骨外植体,临床转化需进一步验证;神经回路的具体调控机制仍需深入探索 探究大脑是否及如何调控组织再生,以关节软骨为例 人类骨关节炎患者和小鼠模型的关节软骨组织 神经科学 骨关节炎 磁共振成像、多突触逆行追踪、化学遗传学/光遗传学操作、单细胞RNA测序 NA 影像数据、基因表达数据、生理指标数据 人类骨关节炎患者和小鼠模型(具体数量未明确) NA 单细胞RNA测序 NA NA
960 2026-04-10
Fibroblast-like cells accumulate late in human coronary atherosclerosis contributing to necrotic core formation
2026-Mar-26, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究通过免疫染色和机器学习辅助细胞分类,分析了人类冠状动脉粥样硬化中不同间充质细胞亚型的时空分布及其与坏死核心形成的关系 首次在人类冠状动脉粥样硬化中详细绘制了间充质细胞亚型的时空分布图,并揭示了成纤维样细胞在坏死核心形成中的关键作用 研究基于尸检样本,可能无法完全反映活体动态过程;样本量相对有限(44个动脉段) 探究人类冠状动脉粥样硬化进展中间充质细胞亚型的积累模式及其在疾病进程中的作用 人类冠状动脉(左前降支)和颈动脉斑块样本 数字病理学 心血管疾病 多重免疫染色、单细胞RNA测序验证、机器学习辅助细胞分类 机器学习辅助分类模型 组织切片图像 44个动脉段(来自38个个体),涵盖正常内膜、适应性内膜增厚、病理性内膜增厚和纤维粥样斑块 NA NA NA NA
回到顶部