单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 38549 篇文献,本页显示第 941 - 960 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
941 2026-04-09
ADAMTS7 promotes smooth muscle foam cell expansion in atherosclerosis
2026-Mar-16, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究揭示了ADAMTS7通过AP-1/PU.1/CD36调控轴促进平滑肌细胞向泡沫细胞转化,从而驱动动脉粥样硬化发展的细胞特异性机制 首次在平滑肌细胞和内皮细胞特异性敲除/转基因小鼠模型中阐明ADAMTS7促进动脉粥样硬化的细胞特异性机制,并发现其通过AP-1/PU.1/CD36轴调控脂质摄取的新通路 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限;未涉及其他血管细胞类型(如巨噬细胞)中ADAMTS7的作用 探究ADAMTS7在动脉粥样硬化发展中的细胞特异性作用机制 人类颈动脉粥样硬化组织、平滑肌细胞特异性/内皮细胞特异性Adamts7条件性敲除及转基因小鼠 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序、ATAC-seq、RNA-seq 条件性基因敲除小鼠模型、转基因小鼠模型 单细胞转录组数据、染色质可及性数据、基因表达数据 人类颈动脉粥样硬化组织单细胞数据(未明确样本数)、多组基因工程小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq, ATAC-seq NA NA
942 2026-04-09
Equine endometrial organoids preserve tissue structure and cycle-stage transcriptional identity†
2026-Mar-16, Biology of reproduction IF:3.1Q2
研究论文 本研究评估了马子宫内膜类器官在生殖周期阶段和长期培养中的结构和分子保真度 首次详细表征了马子宫内膜类器官在生殖周期阶段的转录身份和组织结构保留情况 类器官中某些细胞类型(如纤毛细胞、内皮细胞)代表性不足,且周期特异性特征随培养时间延长而减弱 研究马子宫内膜类器官作为研究平台的适用性 马子宫内膜组织和类器官 数字病理学 NA 组织学、免疫组织化学、电子显微镜、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 NA 图像、文本(基因表达数据) 从发情期和黄体期收集的活检样本生成的类器官 NA 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 NA NA
943 2026-04-09
CXCR6+ T Cells Drive Immune Checkpoint Inhibitor Myocarditis
2026-Mar-10, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本研究探讨了免疫检查点抑制剂(ICI)引发心肌炎的机制,特别是抗LAG-3/PD-1联合治疗下的风险,并识别了CXCR6+ T细胞在疾病发病中的关键作用 首次通过小鼠模型和临床数据验证了抗LAG-3/PD-1联合治疗增加心肌炎风险,并发现CXCR6作为心脏T细胞活化的关键标记物,其抗体治疗能预防疾病致死和心律失常 研究主要基于小鼠模型和有限的患者数据,临床转化需进一步验证;未详细探讨其他免疫细胞或信号通路在心肌炎中的作用 阐明ICI心肌炎的发病机制,特别是抗LAG-3/PD-1治疗下的风险因素,并探索潜在治疗靶点 小鼠模型(Lag3-/-, Pdcd1-/-小鼠)和临床患者数据,聚焦于心脏炎症和T细胞浸润 免疫学 心肌炎 单细胞RNA测序、流式细胞术、组织学分析、心电图、抗体诱导细胞耗竭 NA 基因表达数据、临床数据、图像数据 小鼠模型和VigiBase国际药物警戒数据库中的临床数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
944 2026-04-09
Gene expression dynamics of human and mouse craniofacial development at the single-cell level
2026-Mar-09, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单核RNA测序技术,分析了人类和小鼠颅面发育过程中的基因表达动态,揭示了细胞类型的多样性和功能保守性 首次在单细胞水平上系统比较人类和小鼠颅面发育的基因表达,识别了多种功能独特的细胞亚型,并关联了颅面裂风险因素 研究仅覆盖4至8周的人类胚胎发育阶段,可能未完全捕捉整个发育过程的动态变化 理解人类颅面发育的细胞类型和基因表达动态,并比较与小鼠的保守性 人类和小鼠的颅面发育组织 单细胞组学 颅面裂 单核RNA测序,空间转录组学 NA 单细胞基因表达数据,空间转录组数据 人类胚胎4至8周发育阶段的样本,以及可比小鼠发育阶段的样本 NA 单核RNA-seq,空间转录组学 NA NA
945 2026-04-09
Exploring the human brain: spatial transcriptomics challenges and approaches in post-mortem analysis
2026-Mar-05, Brain : a journal of neurology IF:10.6Q1
综述 本文综述了空间转录组学技术在人类大脑研究中的应用、挑战与机遇 系统比较了空间转录组学工具,并总结了其在人类大脑研究中的具体应用与挑战 主要关注人类大脑研究,未深入探讨其他器官或物种的应用 探索空间转录组学技术在人类大脑分析中的挑战与解决方案 人类大脑 空间转录组学 神经系统疾病 空间转录组学 NA mRNA表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
946 2026-04-09
Somatic gene mutations in the motor cortex of patients with sporadic amyotrophic lateral sclerosis
2026-Mar-05, Brain : a journal of neurology IF:10.6Q1
研究论文 本研究利用尸检组织DNA和单细胞RNA测序数据,探索了散发性肌萎缩侧索硬化症(sALS)患者运动皮层中体细胞嵌合变异的存在及其在疾病发展中的作用 首次在sALS患者运动皮层中发现低等位基因频率体细胞变异的富集,并鉴定出导致FUS蛋白核质错误定位和聚集的体细胞突变p.E516X,同时通过单细胞RNA测序揭示了体细胞变异在兴奋性神经元中的特异性积累 研究基于尸检组织,可能无法完全反映疾病早期阶段的体细胞突变情况;样本量相对有限,需要更大规模研究验证 探究体细胞突变在散发性肌萎缩侧索硬化症(sALS)发病机制中的作用 散发性肌萎缩侧索硬化症(sALS)患者的尸检运动皮层组织 神经科学 肌萎缩侧索硬化症 深度靶向panel测序, 单细胞RNA测序 NA DNA测序数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
947 2026-04-09
Class A scavenger receptors promote tumor progression and induce a unique macrophage phenotype in a mouse model of spontaneous breast cancer
2026-Mar-03, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2
研究论文 本研究探讨了A类清道夫受体(SR-A)在自发性乳腺癌小鼠模型中促进肿瘤进展并诱导独特巨噬细胞表型的作用 首次在自发性乳腺癌模型中证实SR-A(而非FAP)缺失可显著延迟肿瘤发生并减少肺转移,并发现SR-A与乳腺癌细胞表面聚糖结合,通过单细胞RNA测序鉴定出具有高精氨酸酶1基因表达的SR-A依赖性肿瘤相关巨噬细胞亚群 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;SR-A特异性配体在肿瘤微环境中的完整作用机制尚未完全阐明 评估成纤维细胞激活蛋白酶(FAP)和SR-A在乳腺癌进展中的作用机制 自发性乳腺癌小鼠模型中的肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)和乳腺癌细胞 肿瘤免疫学 乳腺癌 单细胞RNA测序,流式细胞术,通路分析 NA 基因表达数据,细胞表型数据 自发性乳腺癌小鼠模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
948 2026-04-09
Atlas-guided discovery of transcription factors for T cell programming
2026-03, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究通过整合转录组和表观遗传数据构建了CD8 T细胞状态的综合图谱,并利用CRISPR筛选与单细胞RNA测序技术,发现了调控T细胞分化的关键转录因子 构建了首个整合多组学数据的CD8 T细胞状态图谱,并利用体内Perturb-seq技术系统鉴定出调控T细胞分化的新转录因子,如ZSCAN20和JDP2 研究主要基于小鼠模型,人类T细胞验证数据有限;未全面评估所有潜在转录因子的功能 系统定义调控CD8 T细胞不同分化状态的转录因子,以优化细胞免疫疗法设计 CD8 T细胞,特别是终末耗竭T细胞(TEX)和组织驻留记忆T细胞(TRM) 免疫学与计算生物学 癌症与慢性病毒感染 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、表观遗传分析、体内CRISPR筛选(Perturb-seq) 转录因子活性推断模型、TF社区分析网络 转录组数据、表观遗传数据、单细胞测序数据 涵盖九种CD8 T细胞状态,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
949 2026-04-09
Scavenging of Isolevuglandins Attenuates Neutrophil Migration and Neutrophil Extracellular Trap Formation in Systemic Lupus Erythematosus
2026-Mar, ACR open rheumatology IF:2.9Q2
研究论文 本研究探讨了异戊二烯类脂质过氧化物(isoLGs)在系统性红斑狼疮(SLE)中驱动中性粒细胞迁移和中性粒细胞胞外诱捕网(NET)形成的作用,并通过清除isoLGs来减轻疾病活动 首次证明isoLGs在SLE中直接驱动NETosis,并通过清除剂干预在患者和动物模型中验证其减轻炎症和自身免疫反应的效果 样本量较小(患者n=6,小鼠n=11-15),且未涉及长期疗效或临床转化研究 探究isoLGs在SLE中促进中性粒细胞迁移和NET形成的作用机制 SLE患者的中性粒细胞和SLE易感小鼠的淋巴组织及主动脉 免疫学 系统性红斑狼疮 免疫荧光、单细胞测序、流式细胞术 NA 细胞图像、基因表达数据、流式细胞数据 6名SLE患者的中性粒细胞,11-15只B6.SLE123小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
950 2026-04-09
CoMBCR: Co-Learning Multi-Modalities of BCRs and gene expressions
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文提出了一种名为CoMBCR的B细胞嵌入工具,能够共同学习B细胞受体(BCR)和基因表达谱这两种互补的数据模态,并将其表示在统一的潜在空间中以支持下游分析 首次开发了一种能够共同学习B细胞受体序列和基因表达谱多模态数据的嵌入方法,通过统一的潜在空间表示实现了对B细胞更全面的表征 未明确说明模型在不同数据集间的泛化能力,以及计算复杂度方面的限制 开发一种能够整合B细胞多模态数据的计算方法,以更好地理解B细胞的生物学特征和功能 B细胞(特别是SARS-CoV-2特异性记忆B细胞和淋巴瘤患者的恶性B细胞) 生物信息学 淋巴瘤、COVID-19 多模态学习、嵌入表示学习 多模态深度学习模型 序列数据(BCR)、基因表达数据、空间转录组数据 126,791个B细胞(来自多个数据集) NA 空间转录组学 NA NA
951 2026-04-09
ETV2-ECSCR-mTOR pathways regulate reprogramming to the endothelial lineage
2026-Feb-23, Stem cells (Dayton, Ohio)
研究论文 本研究揭示了ETV2通过调控ECSCR-mTORC1通路来调节内皮细胞谱系重编程的新机制 首次将Ecscr定义为ETV2的直接转录靶点,并发现其通过mTORC1通路负反馈调节ETV2介导的细胞命运转换 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类细胞中的验证和临床应用潜力尚未充分探索 探究ETV2介导的内皮细胞重编程的分子机制 小鼠胚胎体分化、胚胎成纤维细胞重编程及发育中胚胎 细胞生物学 NA 单细胞RNA测序, ATAC-seq, ChIP-seq, 凝胶迁移实验, 转录分析 NA 基因表达数据, 表观遗传数据 使用转基因小鼠和Etv2敲除小鼠模型,结合发育中小鼠胚胎的单细胞RNA-seq分析 NA 单细胞RNA-seq NA NA
952 2026-04-09
Cerebral Venous Thrombosis in Previously Healthy Patients with Cryptococcal Meningitis
2026-Feb-18, The Journal of infectious diseases IF:5.0Q1
研究论文 本研究回顾性分析了免疫功能正常的隐球菌性脑膜炎患者中脑静脉窦血栓形成的临床特征和发生率 首次在免疫功能正常的隐球菌性脑膜炎患者中系统研究脑静脉窦血栓形成的临床特征,并利用单细胞RNA测序探索血栓相关基因表达 回顾性研究设计,样本量较小(89例患者),需要未来病例对照研究验证发现 调查隐球菌性脑膜炎患者中脑静脉窦血栓形成的临床特征和潜在机制 免疫功能正常的隐球菌性脑膜炎患者 数字病理学 隐球菌性脑膜炎 单细胞RNA测序,基因分析 NA 医疗记录,神经影像数据,实验室数据,基因表达数据 89例免疫功能正常的隐球菌性脑膜炎患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
953 2026-04-09
An Extracellular Matrix-Producing Subset of Cancer-Associated Fibroblasts Drives Chemoresistance in Breast Cancer via SRC Activation and G0S2 Upregulation
2026-Feb-16, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过结合患者数据分析与肿瘤芯片技术,识别出一种特定的细胞外基质生成型肌成纤维细胞亚群,该亚群通过激活SRC激酶和上调G0S2基因,驱动三阴性乳腺癌的化疗耐药性 首次结合单细胞RNA测序、肿瘤芯片模型和功能实验,揭示ECM-myCAF亚群在化疗耐药中的独特作用,并鉴定G0S2为关键调控因子 研究主要基于体外模型和患者数据分析,体内验证和临床转化潜力需进一步探索 探究三阴性乳腺癌化疗耐药机制,识别驱动耐药的具体癌症相关成纤维细胞亚群 三阴性乳腺癌患者样本、肿瘤芯片模型中的癌细胞和癌症相关成纤维细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序,肿瘤芯片技术,高级细胞成像,功能实验 NA RNA测序数据,图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
954 2026-04-09
CanSig Benchmarks Methods for Reproducible Cancer Cell State Discovery from Single-Cell Transcriptomic Data
2026-Feb-16, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 开发了CanSig基准测试工具,用于评估从单细胞转录组数据中识别癌症细胞状态的方法 CanSig整合了批次校正、生物信号保留和转录特征相关性指标,为方法评估提供标准化框架 仅评估了13种方法在5种癌症类型的数据上,可能未覆盖所有现有方法或癌症类型 提高单细胞RNA测序数据分析中癌症细胞状态发现的再现性和临床相关性 人类癌症单细胞转录组数据,包括胶质母细胞瘤、乳腺癌、肺腺癌、横纹肌肉瘤和皮肤鳞状细胞癌 生物信息学 癌症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 185名患者和174,000个恶性细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
955 2026-04-09
STING-induced blood-brain barrier opening combined with radiotherapy potentiates antitumor response in a high-grade glioma model
2026-Feb-16, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究探讨了STING激动剂8803联合放疗在高级别胶质瘤模型中的抗肿瘤效果及其机制 首次揭示了STING激动剂8803能够通过改变内皮细胞中的Pecam和Cd147通路来重编程血脑屏障,并诱导长达24小时的双半球BBB开放,同时使用[18F]-FLT PET成像纵向可视化STING激活过程 在辐射抵抗的QPP8v模型中未观察到长期生存获益,且研究仅限于小鼠模型,尚未在人体中进行验证 评估STING激动剂8803联合放疗在高级别胶质瘤治疗中的潜力并阐明其作用机制 携带颅内CT-2A或QPP8v胶质瘤的C57BL/6J小鼠 肿瘤免疫治疗 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序,PET成像 动物模型 基因表达数据,影像数据 C57BL/6J小鼠(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
956 2026-04-09
Inactivation of Hes1 in Skeletal Undifferentiated Cells Increases Bone Volume
2026-Feb-04, Endocrinology IF:3.8Q2
研究论文 本研究探讨了在瘦素受体阳性细胞中失活Hes1基因对骨骼体积的影响 首次在LepR+细胞中特异性失活Hes1基因,揭示了其通过抑制RANKL表达减少骨吸收从而增加骨量的新机制 研究仅在小鼠模型中进行,未涉及人类样本;骨量增加仅限于股骨小梁骨,未影响椎骨和皮质骨;性别差异仅在成骨细胞数量方面观察到 探究Notch信号通路靶基因Hes1在LepR+细胞中对骨骼稳态的调控作用 LepR-Cre;Hes1Δ/Δ基因工程小鼠及其对照小鼠 骨骼生物学 骨骼疾病 单细胞RNA测序,骨组织形态计量学,细胞培养 基因敲除小鼠模型 基因表达数据,组织形态学数据 5月龄雄性和雌性LepR-Cre;Hes1Δ/Δ小鼠及对照小鼠 NA 单细胞RNA测序 NA NA
957 2026-04-09
Tumour-brain crosstalk restrains cancer immunity via a sensory-sympathetic axis
2026-02, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究揭示了一种涉及迷走感觉输入和交感输出的双向肿瘤-大脑通信轴,该轴通过建立免疫抑制性肿瘤微环境促进肺癌发生 首次发现肺癌通过迷走感觉神经元与大脑通信,驱动交感神经活动增强,从而抑制肺泡巨噬细胞的抗肿瘤免疫 研究主要基于小鼠模型,人类肿瘤-大脑通信机制仍需进一步验证 探究大脑如何感知和响应外周器官肿瘤,以及肿瘤-大脑通信如何影响癌症免疫 肺癌小鼠模型、迷走感觉神经元、交感神经、肺泡巨噬细胞 神经免疫学 肺癌 单细胞转录组学、神经示踪、组织成像 NA 转录组数据、成像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
958 2026-04-09
Transcriptional signature of induced neurons differentiates virologically suppressed people with HIV from people without HIV
2026-Jan-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究利用诱导神经元模型,揭示了HIV感染者与未感染者之间的转录组差异,并识别出与神经认知损伤相关的基因特征 首次使用诱导神经元模型来模拟HIV感染者的神经元生物学和损伤,并发现IFI27上调及FOXL2NB-FOXL2-LINC01391表达降低与神经认知损伤相关 样本量较小(仅6名HIV感染者和7名未感染者),且研究基于体外诱导神经元模型,可能无法完全反映体内复杂环境 探索HIV感染者神经认知损伤的潜在机制 HIV感染者和未感染者的诱导神经元 数字病理学 HIV感染 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 诱导神经元模型 转录组数据 6名HIV感染者和7名未感染者的皮肤成纤维细胞衍生的诱导神经元 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
959 2026-04-09
Repeated Dextran Sulfate Sodium Exposure Elicits Distinct Immune Responses Reflecting Human Ulcerative Colitis
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过比较单次与重复DSS暴露诱导的小鼠结肠炎模型,评估其与人类溃疡性结肠炎的免疫反应相似性 首次系统比较了急性与重复DSS暴露模型在免疫细胞转录程序、微生物组变化及与人类疾病对齐程度方面的差异 研究基于小鼠模型,其免疫反应与人类疾病存在物种差异;未涉及长期重复暴露(超过两个周期)的影响 评估重复DSS暴露模型是否更好地模拟人类溃疡性结肠炎的免疫特征 DSS诱导的小鼠结肠炎模型(单次vs重复暴露) 单细胞组学 溃疡性结肠炎 单细胞RNA测序, 16S rRNA分析, 流式细胞术, 组织病理学 NA 单细胞转录组数据, 微生物组数据, 流式细胞数据, 组织学图像 未明确样本数量的小鼠模型 NA 单细胞RNA测序, 16S rRNA测序 NA NA
960 2026-04-09
Innovative approaches targeting innate immune cells to promote organ transplant tolerance
2026, Frontiers in transplantation
综述 本文综述了通过靶向先天免疫细胞以促进器官移植耐受的创新策略 提出利用单细胞RNA测序和空间转录组学揭示的先天免疫细胞异质性,开发选择性调节先天免疫反应而不损害整体免疫力的精准疗法,包括靶向髓系抑制检查点、调节代谢重编程、使用CRISPR/Cas9基因编辑以及过继转移调节性细胞 NA 探讨在最小化全身免疫抑制的同时实现长期同种异体移植物存活的策略 先天免疫细胞(包括中性粒细胞、单核细胞、巨噬细胞、树突状细胞、髓源性抑制细胞、先天淋巴样细胞、自然杀伤细胞和γδ T细胞) 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学,CRISPR/Cas9基因编辑 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
回到顶部