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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 941 | 2026-06-26 |
Distinct cuproptosis patterns in hepatocellular carcinoma patients correlate with unique immune microenvironment characteristics and cell-cell communication, contributing to varied overall survival outcomes
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1379690
PMID:38868777
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研究论文 | 探讨肝癌患者铜死亡模式与免疫微环境特征及细胞间通讯的关联,以及对总生存期的影响 | 首次揭示铜死亡相关基因在肝细胞癌中与免疫微环境和细胞间通讯的关联,并构建了基于铜死亡相关基因的预后风险模型 | 未提及具体局限性信息 | 探索肝细胞癌中细胞铜死亡与免疫微环境的相关性,为免疫治疗提供潜在见解 | 肝细胞癌患者的铜死亡相关基因表达、免疫微环境及细胞间通讯 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, LASSO Cox分析, WGCNA, 共识聚类 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | TCGA数据库和GEO数据库的肝癌患者样本(具体数量未提及) | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq(推测) | TCGA和GEO数据库来源的测序数据, 平台细节未明确提供 |
| 942 | 2026-06-25 |
Single-cell profiling identifies an AIM2-dependent macrophage program amplifying T cell-mediated acute cardiac allograft rejection
2026-Sep-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116951
PMID:42235315
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术解析心脏移植排斥反应中巨噬细胞亚群特征,发现AIM2炎症小体通路在促进T细胞介导的急性排斥中起关键作用 | 首次在单细胞水平上鉴定心脏移植排斥中M1样巨噬细胞的AIM2依赖性程序,证明其通过增强共刺激活化和初始T细胞启动放大排斥反应,提出AIM2抑制剂作为心脏移植辅助疗法的潜在策略 | NA | 表征心脏移植急性排斥过程中巨噬细胞亚群特征及AIM2炎症小体在促炎巨噬细胞中的作用机制 | 小鼠心脏移植模型及人类心内膜心肌活检样本中的巨噬细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠心脏移植模型及人类心内膜心肌活检样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium平台进行单细胞RNA测序 |
| 943 | 2026-06-25 |
Portulaca Oleracea polysaccharides attenuate zearalenone-induced macrophage activation and Leydig cell dysfunction in testis: A single-cell and multi-omics study
2026-Aug-31, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2026.119481
PMID:42215139
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研究论文 | 该研究整合单细胞转录组学、代谢组学和肠道微生物组分析,探讨马齿苋多糖对玉米赤霉烯酮诱导的小鼠睾丸巨噬细胞极化和间质细胞功能障碍的缓解作用 | 首次通过单细胞转录组学结合多组学方法,揭示了马齿苋多糖通过调节肠道-血液-睾丸轴缓解玉米赤霉烯酮生殖毒性的机制 | 研究仅基于小鼠模型,结果向人类的推广性有限;玉米赤霉烯酮给药剂量和时长可能不完全反映自然暴露情况 | 探究玉米赤霉烯酮对雄性生殖的毒性机制以及马齿苋多糖的解毒作用 | 雄性昆明小鼠及其睾丸组织、血清、肠道微生物 | 机器学习 | 生殖毒性 | 单细胞RNA测序,代谢组学,肠道微生物组分析 | 无 | 基因表达数据,代谢物数据 | 小鼠样本;具体数量未在标题和摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 944 | 2026-06-25 |
Early Developmental Neuronal Activity Impacts Oligodendrocyte Differentiation Through AMPA Receptors
2026-Aug, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70157
PMID:42334020
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研究论文 | 本研究探讨了早期发育过程中神经元活动如何通过AMPA受体调控少突胶质细胞分化 | 首次揭示在早期大脑发育中,神经元活动减少反而促进少突胶质细胞分化,而非传统认知中的促进效应,并明确AMPAR信号在少突胶质细胞成熟后期而非分化起始的关键作用 | 未明确早期与成熟阶段神经元活动对少突胶质细胞作用差异的分子机制;体外模型可能无法完全模拟体内复杂微环境 | 研究谷氨酸能神经元活动如何调节早期发育中少突胶质细胞的分化与成熟过程 | 小鼠嗅球、体感皮层和胼胝体中的少突胶质细胞前体细胞及少突胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序、体内化学遗传学、离体皮层切片培养 | NA | 基因表达数据 | 使用感觉剥夺模型和化学遗传学方法的小鼠群体,具体数量未说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 945 | 2026-06-25 |
Cellular Heterogeneity During Arterial Aging
2026-Jul, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70597
PMID:42333936
|
综述 | 本文综述了基于单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术解析血管衰老过程中细胞异质性的研究成果,重点关注细胞衰老、细胞外基质重构、炎症老化和细胞通讯变化等关键表型程序 | 首次系统整合单细胞研究,揭示血管衰老中内皮功能障碍、平滑肌表型调节、成纤维细胞相关基质重构和免疫激活的跨物种和跨血管床的差异,并强调细胞间通讯网络的改变 | 当前单细胞研究中存在细胞状态注释不一致、功能验证不完整、空间和表观遗传分辨率有限等局限性 | 系统梳理单细胞RNA测序在血管衰老研究中的应用,阐述细胞异质性与衰老相关动脉变化的关系 | 动脉壁中的内皮细胞、平滑肌细胞、成纤维细胞和免疫细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 946 | 2026-06-25 |
Potential targets of baicalein in macrophages revealed by bulk and single cell RNA sequencing analysis
2026-Jun-24, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05628-8
PMID:42337165
|
研究论文 | 通过批量RNA测序和单细胞RNA测序分析揭示黄芩素在巨噬细胞中的潜在靶点及其在炎症条件下的系统性免疫调节作用 | 首次整合网络药理学、分子对接、巨噬细胞批量RNA测序和脓毒症患者外周血单细胞RNA测序,鉴定黄芩素在巨噬细胞中的核心靶点并揭示其多细胞免疫调节机制 | 未见明确提及局限性 | 探究黄芩素在巨噬细胞中的分子靶点及其在过度炎症条件下对外周血免疫细胞的系统性免疫调节作用 | 巨噬细胞和脓毒症患者外周血免疫细胞 | 机器学习 | 脓毒症, 非酒精性脂肪肝 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 脓毒症患者外周血样本(单细胞RNA测序),RAW264.7巨噬细胞(批量RNA测序) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 947 | 2026-06-25 |
Identification and validation of SPP1 as a prognostic biomarker in interstitial lung disease subtypes by single-cell sequencing
2026-Jun-24, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-026-03788-y
PMID:42337746
|
研究论文 | 通过单细胞测序鉴定并验证SPP1作为间质性肺疾病亚型预后生物标志物 | 首次利用单细胞RNA测序在特发性肺纤维化(IPF)患者肺组织中鉴定出SPP1,并在多个ILD队列中验证其血清水平与预后的关联 | 样本量有限,仅纳入3例IPF患者和3例对照进行单细胞测序;验证队列样本量也相对较小 | 探索间质性肺疾病(ILD)亚型的预后生物标志物 | 特发性肺纤维化(IPF)患者、特发性炎症性肌病相关ILD(IIM-ILD)患者及健康对照 | 机器学习和数字病理 | 肺间质性疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | Cox比例风险模型 | 基因表达数据和血清水平数据 | 3例IPF患者和3例对照用于单细胞测序;验证队列包括74例IPF患者、92例IIM-ILD患者和56例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 对IPF患者的肺组织进行单细胞RNA测序 |
| 948 | 2026-06-25 |
Macrophage-fibroblast signaling networks identified by single-cell RNA sequencing in juvenile systemic sclerosis
2026-Jun-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.202801
PMID:42334871
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 949 | 2026-06-25 |
Pathogenic Rewiring of IL6 Signaling Fuels Macrophage Immunometabolic reprogramming in COPD
2026-Jun-23, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1093/ajrcmb/aanag113
PMID:42334931
|
研究论文 | 通过整合单细胞转录组学与机制研究,揭示IL6/STAT3/SREBP2轴驱动慢性阻塞性肺疾病中巨噬细胞免疫代谢重编程的致病机制 | 首次发现IL6信号通路在COPD中从促胆固醇流出功能转变为致病性重编程,并明确STAT3直接反式激活SREBP2驱动胆固醇合成促进炎症的线性通路 | NA | 阐明IL6信号通路在COPD肺巨噬细胞中的功能性角色及其免疫代谢重编程机制 | 人类COPD肺组织、小鼠COPD模型、巨噬细胞 | 机器学习教育 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类COPD肺样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 950 | 2026-06-25 |
CycleVI: Isolating cell cycle variation with an interpretable deep generative model
2026-Jun-23, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag372
PMID:42334940
|
研究论文 | CycleVI是一个可解释的深度生成模型,用于从单细胞RNA测序数据中分离细胞周期变异,以揭示其他生物信号 | 利用分区潜在表示和专用的圆形子空间,将细胞周期驱动的变异与其他信号分离,提供可解释的细胞周期相位推断 | 无相关信息 | 从单细胞RNA测序数据中准确推断细胞周期相位,并分离细胞周期相关的变异,以增强对增殖系统中细胞异质性的分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞周期相位推断和变异分离 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 深度生成模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 951 | 2026-06-25 |
A MYCN-GAL-SREBP1 Lipogenic Axis Drives Proliferation in Silent Corticotroph Adenomas
2026-Jun-23, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag141
PMID:42334961
|
研究论文 | 整合批量及单细胞RNA测序数据,揭示MYCN-GAL-SREBP1脂质合成轴驱动静默性促肾上腺皮质激素腺瘤增殖的机制 | 首次发现MYCN-GAL-SREBP1脂质合成轴在静默性促肾上腺皮质激素腺瘤中的驱动作用,并证明SREBP1是潜在可药靶向的治疗弱点 | 未提及具体局限性 | 阐明静默性促肾上腺皮质激素腺瘤增殖的分子机制,特别是脂质代谢及其调控通路的作用 | 静默性促肾上腺皮质激素腺瘤、功能性促肾上腺皮质激素腺瘤和正常垂体组织 | 数字病理学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | RNA-seq, 脂质组学, 荧光素酶报告基因实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 脂质组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 952 | 2026-06-25 |
PTPN1 synergistically promotes hepatocellular carcinoma progression by inhibiting the expression of STAT5 in CD8+ T cells and enhancing the activity of the PI3K-AKT pathway
2026-Jun-23, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117061
PMID:42335545
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研究论文 | 该文章探究了PTPN1在肝细胞癌中通过抑制CD8+ T细胞中STAT5的表达并增强PI3K-AKT通路活性从而协同促进肿瘤进展的机制 | 首次将PTPN1作为免疫检查点研究其在肝细胞癌中对CD8+ T细胞和肿瘤细胞的双重作用机制,揭示其通过JAK2-STAT5轴抑制T细胞增殖同时激活PI3K-AKT通路促进癌细胞进展 | 该研究的局限性未在摘要中明确说明 | 阐明PTPN1对肝细胞癌患者预后、肿瘤微环境以及肝癌细胞生物学行为的影响,评估其作为免疫治疗靶点的临床潜力 | 肝细胞癌患者肿瘤组织、CD8+ T细胞、肝癌细胞系 | 机器学习 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 953 | 2026-06-25 |
Decoding the complexity of intestinal immunity with spatial transcriptomics
2026-Jun-23, Current opinion in immunology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.coi.2026.102806
PMID:42335605
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综述 | 利用空间转录组学解码肠道免疫系统的复杂性 | 全面回顾了空间转录组学在解析肠道免疫系统空间异质性中的适用性及其关键发现 | 当前空间转录组学技术仍存在分辨率与覆盖度之间的平衡问题,且与互补技术的整合面临挑战 | 探讨空间转录组学在肠道免疫研究中的应用现状、挑战及未来方向 | 肠道免疫系统及其空间异质性 | 数字病理学 | 胃肠道疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 954 | 2026-06-25 |
Corrigendum to "Single-cell RNA sequencing reveals depot-specific characteristics of adipose progenitor cells in ducks" [Poultry Science, Volume 105/Issue 7, July 2026, 107004]
2026-Jun-23, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2026.107324
PMID:42335774
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 955 | 2026-06-25 |
An emergent disease-associated motor neuron state precedes cell death in ALS
2026-Jun-23, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2026.05.047
PMID:42335888
|
研究论文 | 通过SOD1-G93A小鼠模型的纵向单核转录组和染色质开放性图谱,结合空间转录组学,定义了肌萎缩侧索硬化症中运动神经元退化的分子决定因素,发现了一种与疾病相关的运动神经元状态 | 首次识别出易受损的α运动神经元在ALS中转变为一独特细胞状态(疾病相关运动神经元,DMs),并通过人类运动神经元中DM相关转录因子的上调实验验证了其活性调控成分 | 未提及 | 定义肌萎缩侧索硬化症中运动神经元退化的分子决定因素 | SOD1-G93A小鼠模型的脊髓运动神经元及人类ALS脊髓组织 | 数字病理学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单核RNA测序、单核ATAC测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、染色质开放性数据、空间转录组数据 | 小鼠模型(SOD1-G93A)和人类ALS脊髓样本 | NA | 单核RNA测序、单核ATAC测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 956 | 2026-06-25 |
Cancer Stem Cells and Immune Evasion: Mechanisms Driving Immunotherapy Resistance and Strategies for Therapeutic Intervention
2026-Jun-23, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2026.105450
PMID:42336068
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综述 | 综述癌症干细胞(CSC)通过重塑肿瘤微环境驱动免疫治疗耐药性的机制,并探讨靶向CSC相关生态位的治疗策略 | 系统整合空间转录组学、单细胞分析和患者衍生模型的证据,将CSC介导的免疫逃逸机制与其对应的治疗状态进行映射,并讨论了新兴的CSC靶向纳米技术和工程细胞疗法 | 许多机制在患者中缺乏直接因果证据,且需要严格的生物标志物驱动试验来验证靶向CSC生态位能否持续改善抗肿瘤免疫 | 阐明癌症干细胞介导免疫逃逸的机制及其对免疫治疗耐药性的影响,并提出潜在的治疗干预策略 | 癌症干细胞、肿瘤微环境、免疫逃逸机制、免疫治疗耐药性 | 机器学习 | 癌症 | 空间转录组学、单细胞分析、患者衍生模型、体内验证 | NA | 图像、文本 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | 10x Visium、10x Chromium | 空间转录组学(10x Visium)和单细胞RNA测序(10x Chromium)用于分析肿瘤微环境中的CSC相关特征 |
| 957 | 2026-06-25 |
Single-cell and spatial transcriptomic colocalization analysis reveals the roles of histone deacetylation in lung adenocarcinoma progression and microenvironment
2026-Jun-23, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2026.06.013
PMID:42336135
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research paper | 整合单细胞RNA测序、空间转录组学和分子生物学研究了组蛋白去乙酰化相关基因在肺腺癌进展和微环境中的作用 | 首次通过单细胞和空间转录组共定位分析揭示FOXA1-HDAC2轴在肺腺癌中的调控机制,并建立了7基因预后模型 | 文献摘要未明确提及局限性 | 阐明组蛋白去乙酰化在肺腺癌异质性和恶性进展中的空间分布和调控网络 | 肺腺癌患者样本和细胞系 | machine learning | lung cancer | scRNA-seq, 空间转录组学, 分子生物学 | 7-gene prognostic model | single-cell RNA-seq数据, 空间转录组数据, 基因表达数据 | 多个公开数据集(GSE131907, GSE189487, TCGA-LUAD),具体样本数量未提及 | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 958 | 2026-06-25 |
A Multicellular Coordinated Network Driving Lymphovascular Space Invasion in Endometrioid Endometrial Carcinoma
2026-Jun-23, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70246
PMID:42336618
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示子宫内膜样腺癌中淋巴血管间隙浸润的多细胞协调网络 | 首次通过单细胞测序解析LVSI阳性肿瘤的多细胞生态系统,发现WNT5A_mCAF和SPP1+MMP9+巨噬细胞协同重塑细胞外基质、促进淋巴血管生成并抑制T细胞活性 | 样本量较小(3个LVSI+、2个LVSI-及2个正常样本),需更大规模队列验证 | 阐明子宫内膜样腺癌中淋巴血管间隙浸润的多细胞分子机制 | 子宫内膜样腺癌LVSI阳性、LVSI阴性及正常子宫内膜组织样本 | 机器学习 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序、空间多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据、空间免疫荧光图像 | 7例组织样本(3例LVSI+、2例LVSI-、2例正常子宫内膜) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 959 | 2026-06-25 |
EFHD2 drives lactate-mediated DNA damage repair and immunosuppression via HMGB1 and HIF-1α to confer radioresistance in colorectal cancer
2026-Jun-23, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-09031-2
PMID:42336814
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了EFHD2在结直肠癌放射抵抗中通过HMGB1和HIF-1α介导乳酸驱动的DNA损伤修复和免疫抑制的机制 | 首次发现EFHD2的K9位点乳酸化修饰对其DNA修复功能至关重要,并揭示EFHD2通过乳酸代谢重塑肿瘤免疫微环境促进放射抵抗 | 未明确提及主要局限性,但可能包括多组学数据整合的复杂性及临床样本量有限 | 阐明EFHD2在结直肠癌放射抵抗中的作用机制,探索靶向EFHD2轴以恢复抗肿瘤免疫和改善治疗效果的潜力 | 放射抵抗结直肠癌细胞模型、免疫活性及免疫缺陷小鼠、患者源性直肠癌样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序,蛋白质组学,乳酸化蛋白质组学,空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据,蛋白质组学数据,空间转录组学数据,单细胞RNA测序数据 | 放射抵抗结直肠癌细胞模型及小鼠模型,患者源性直肠癌样本 | 10x Genomics | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 10x Visium,10x Chromium | 10x Visium用于空间转录组学,10x Chromium用于单细胞RNA测序 |
| 960 | 2026-06-25 |
Stromal and endothelial transcriptional changes during progression from MGUS to myeloma and after treatment response
2026-Jun-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74389-y
PMID:42336819
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序研究从意义未明的单克隆丙种球蛋白病(MGUS)进展为多发性骨髓瘤(MM)及治疗后反应过程中,骨髓微环境中基质细胞和内皮细胞的转录变化 | 首次在基因工程小鼠模型中利用单细胞RNA测序解析非免疫性骨髓微环境在多发性骨髓瘤进展和药物反应中的动态转录变化,并发现干扰素驱动的程序在疾病阶段和治疗响应中的关键作用 | 未提及 | 阐明非免疫性骨髓微环境(内皮细胞和间充质干细胞)在多发性骨髓瘤进展和治疗反应中的作用 | 基因工程小鼠模型(BIcγ1和MI模型)以及患者样本中的内皮细胞和间充质干细胞 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 基因工程小鼠模型及患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |