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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 941 - 960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 941 | 2025-10-05 |
Spatially resolved transcriptomic profiling for glomerular and tubulointerstitial gene expression in C3 glomerulopathy
2025-May, Clinical kidney journal
IF:3.9Q1
DOI:10.1093/ckj/sfaf139
PMID:40416397
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组技术分析C3肾小球病的肾小球和肾小管间质基因表达特征 | 首次应用空间转录组技术对C3肾小球病进行亚结构特异性基因表达谱分析 | 样本量较小（仅3例C3G病例），需要更大规模研究验证 | 探究C3肾小球病的转录组特征和病理机制 | 人类肾脏活检标本（C3G患者、供体肾脏和其他肾小球肾炎患者） | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 3例C3G病例、7例供体对照、41例其他肾小球肾炎疾病对照 | NA | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx Digital Spatial Profiler与福尔马林固定石蜡包埋肾脏活检标本 |
| 942 | 2025-10-05 |
CellSP: Module discovery and visualization for subcellular spatial transcriptomics data
2025-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.12.632553
PMID:39868198
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研究论文 | 开发用于亚细胞空间转录组数据分析的计算框架CellSP，能够识别、可视化和表征mRNA的一致亚细胞空间模式 | 提出“基因-细胞模块”概念，首次提供识别和解释亚细胞转录分布功能相关空间模式的工具 | NA | 解决亚细胞空间转录组数据中功能相关空间模式识别和解释工具缺乏的问题 | 小鼠脑组织、肾脏癌和健康样本、阿尔茨海默病小鼠模型 | 空间转录组学 | 肾脏癌,阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | 计算框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 943 | 2025-10-05 |
High-resolution reconstruction of cell-type specific transcriptional regulatory processes from bulk sequencing samples
2025-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.02.646189
PMID:40291712
|
研究论文 | 提出一种名为DeepDETAILS的新型深度学习框架，能够从批量测序样本中高分辨率重建细胞类型特异性转录调控过程 | 开发了基于深度学习的跨模态反卷积方法，可利用scATAC-seq参考库对其他批量组学数据集进行细胞类型特异性信号重建，达到碱基对精度 | 依赖于scATAC-seq参考数据的可用性和质量，未明确说明模型对数据稀缺情况的处理能力 | 实现从批量测序数据中高分辨率重建细胞类型特异性基因组信号 | 人类组织和细胞类型，包括39种不同人体组织和86种不同细胞类型 | 机器学习 | 原发性硬化性胆管炎 | 深度学习，单细胞ATAC测序，染色质免疫沉淀测序，新生转录测序 | 深度学习框架 | 基因组测序数据 | 39种人体组织和86种细胞类型 | NA | 单细胞ATAC-seq, ChIP-seq, PRO-cap, PRO-seq | NA | NA |
| 944 | 2025-10-05 |
Inhibition of bone morphogenetic protein 4 alleviates angiotensin II-induced abdominal aortic aneurysm by reducing inflammation and endothelial-mesenchymal transition
2025-04, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示BMP4在血管紧张素II诱导的腹主动脉瘤中通过调节内皮-间质转化和炎症促进疾病进展的机制 | 首次发现BMP4在腹主动脉瘤进展中的关键作用，并阐明其通过BGN结合和PI3K/AKT/mTOR通路诱导内皮细胞表型转换的机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究腹主动脉瘤的发病机制及BMP4在其中的作用 | 血管紧张素II诱导的腹主动脉瘤小鼠模型和鼠主动脉内皮细胞 | 单细胞测序分析 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序, 伪时间轨迹分析, 蛋白质-蛋白质相互作用分析, 共免疫沉淀 | 小鼠疾病模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x单细胞测序分析 |
| 945 | 2025-10-05 |
Integrative analysis of single-cell transcriptomics and genetic associations identify cell states associated with vascular disease
2025-04, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
|
研究论文 | 通过整合单细胞转录组学和遗传关联分析，识别与血管疾病相关的细胞状态 | 开发新的计算方法整合GWAS数据与单核RNA测序数据，识别血管疾病相关的特定细胞亚群和中间状态 | 样本量相对较小（正常n=7，动脉瘤n=9，动脉粥样硬化n=2），仅使用人类升主动脉组织 | 识别导致早期血管功能障碍的特定血管亚群和中间细胞状态 | 人类升主动脉组织（正常、动脉瘤和动脉粥样硬化） | 单细胞生物学 | 血管疾病 | 单核RNA测序（snRNA-seq），GWAS整合分析 | RNA轨迹分析，细胞类型特异性富集分析 | 单细胞转录组数据，遗传关联数据 | 18个样本（7正常，9动脉瘤，2动脉粥样硬化） | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 946 | 2025-10-05 |
Fate (or state) of CA2 neurons in a mineralocorticoid receptor knockout
2024-Nov-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.29.626110
PMID:39651204
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学方法探究盐皮质激素受体敲除后海马CA2区神经元的命运变化 | 首次发现MR敲除导致CA2神经元获得CA1样分子表型，揭示了MR在控制CA2神经元发育状态中的关键作用 | 研究主要关注分子表型变化，对行为功能影响的直接证据不足 | 探究盐皮质激素受体敲除对海马CA2区神经元命运的影响 | 小鼠海马CA2区神经元 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 条件性基因敲除模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 947 | 2025-10-05 |
Deciphering the landscape of transcriptional heterogeneity across cancer
2023-09-11, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.07.008
PMID:37595585
|
研究论文 | 通过整合77项研究和24种癌症类型的单细胞RNA测序数据，揭示癌症转录异质性的重复模式及其功能意义 | 首次大规模整合跨癌症类型的单细胞转录组数据，系统识别转录异质性的重复模式 | NA | 解析癌症转录异质性景观并探索其功能意义 | 24种癌症类型的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 77项研究整合数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 948 | 2025-10-05 |
Deterministic evolution and stringent selection during preneoplasia
2023-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06102-8
PMID:37258665
|
研究论文 | 通过人类胃类器官模型研究TP53双等位基因失活后的癌前病变演化过程 | 建立了人类胃类器官模型模拟早期肿瘤发生过程，揭示了TP53失活后染色体不稳定的演化规律和克隆选择机制 | 研究基于体外类器官模型，可能与体内真实肿瘤发生环境存在差异 | 探索人类肿瘤发生的最早期事件及其演化规律 | TP53双等位基因失活的人类胃类器官 | 癌症生物学 | 胃癌 | 单细胞测序, 高通量谱系追踪, 实验演化 | 类器官模型 | 基因组数据, 转录组数据 | 多个克隆来源的培养物，历时2年的纵向研究 | NA | 单细胞测序, 谱系追踪 | NA | NA |
| 949 | 2025-10-05 |
Hallmarks of transcriptional intratumour heterogeneity across a thousand tumours
2023-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06130-4
PMID:37258682
|
研究论文 | 通过整合77项研究的单细胞RNA测序数据，系统分析了24种肿瘤类型中1,163个肿瘤样本的转录组瘤内异质性模式 | 首次大规模整合跨研究单细胞数据，识别出41个保守元程序并归纳为11个瘤内异质性标志 | 基于已有研究的整合分析，可能受原始数据质量和批次效应影响 | 系统表征肿瘤转录组瘤内异质性模式 | 1,163个肿瘤样本涵盖24种肿瘤类型 | 生物信息学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序 | 整合分析 | 单细胞转录组数据 | 1,163个肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 950 | 2025-10-05 |
Systems vaccinology of the BNT162b2 mRNA vaccine in humans
2021-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03791-x
PMID:34252919
|
研究论文 | 本研究采用系统疫苗学方法分析BNT162b2 mRNA疫苗在人体内引发的免疫反应 | 首次通过系统疫苗学方法全面描绘mRNA疫苗的免疫应答机制，揭示加强免疫显著增强先天免疫反应的特征 | 样本量相对有限（56名健康志愿者），未涵盖不同年龄组或免疫功能低下人群 | 阐明mRNA疫苗如何刺激免疫系统产生保护性免疫应答 | 56名接种辉瑞-BioNTech mRNA疫苗（BNT162b2）的健康志愿者 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组学，系统疫苗学方法 | NA | 转录组数据，免疫细胞表型数据 | 56名健康志愿者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 951 | 2025-10-05 |
Repopulation of microglia and its implications for CNS disorders: Insights from the single-cell era
2025-Oct-15, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.107066
PMID:40865648
|
综述 | 本文综述了小胶质细胞的起源、发育、再殖和异质性研究进展，并强调单细胞时代下小胶质细胞再殖对中枢神经系统疾病的治疗意义 | 整合单细胞测序技术揭示小胶质细胞在发育、稳态和病理状态下的细胞命运决定和异质性，并探讨再殖小胶质细胞的新型治疗价值 | NA | 增强对小胶质细胞再殖的理解，为中枢神经系统疾病的新治疗策略提供见解 | 小胶质细胞 | 神经科学 | 中枢神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 952 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomics reveals hypoxia-driven iCAF_PLAU is associated with stemness and immunosuppression in anorectal malignant melanoma
2025-Oct, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-025-02273-5
PMID:40613916
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示缺氧驱动的iCAF_PLAU在肛门直肠恶性黑色素瘤中与干性和免疫抑制相关 | 首次在ARMM中发现独特的iCAF_PLAU成纤维细胞亚群，并阐明其通过WNT5A_FZD3_LRP6和NRG1_ERBB3信号通路增强癌细胞干性，以及通过CCL2-CCR1轴促进免疫抑制的机制 | 样本量较小（仅3例ARMM患者），需要更大规模研究验证发现 | 探究肛门直肠恶性黑色素瘤肿瘤微环境特征及其与治疗抵抗的关系 | 肛门直肠恶性黑色素瘤患者肿瘤组织和血液样本 | 数字病理学 | 肛门直肠恶性黑色素瘤 | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据，基因表达数据 | 3例ARMM患者肿瘤和血液组织，结合GEO数据库皮肤黑色素瘤数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 953 | 2025-10-05 |
Identification of a unique subpopulation of mucosal fibroblasts in colorectal cancer with tumor-restraining characteristics
2025-Oct, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mocell.2025.100263
PMID:40759242
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研究论文 | 本研究通过多组学分析在结直肠癌中发现了一类具有肿瘤抑制特性的独特黏膜成纤维细胞亚群 | 首次在结直肠癌中鉴定出表达ADAMDEC1、CXCL14、EDNRB和PROCR的肿瘤抑制性癌症相关成纤维细胞亚群 | NA | 探索结直肠癌中肿瘤抑制性癌症相关成纤维细胞的特征和临床意义 | 结直肠癌样本中的成纤维细胞亚群 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, RNA-seq, 免疫组织化学 | NA | 单细胞测序数据, RNA测序数据, 组织学样本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 954 | 2025-10-05 |
FAPI-engineered nanoprobe induces dual-cell ferroptosis therapy and enables light-up magnetic resonance imaging for gastric cancer peritoneal metastasis
2025-Oct, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.102261
PMID:40969390
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研究论文 | 本研究开发了一种多功能诊疗纳米探针，通过诱导双细胞铁死亡和增强磁共振成像来治疗胃癌腹膜转移 | 开发了FAPI修饰的多功能纳米探针，首次实现CAF靶向的铁死亡治疗和pH响应的磁共振成像信号增强 | 研究仅在小鼠模型中进行验证，尚未开展临床试验 | 开发针对胃癌腹膜转移的新型纳米诊疗策略 | 胃癌腹膜转移模型中的癌细胞和癌症相关成纤维细胞 | 纳米医学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，磁共振成像 | NA | 基因表达数据，影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 955 | 2025-10-05 |
Delineating unique MASH-endothelial cells in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease using single-cell lensing
2025-Oct, Digestive and liver disease : official journal of the Italian Society of Gastroenterology and the Italian Association for the Study of the Liver
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/j.dld.2025.07.035
PMID:40846560
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研究论文 | 通过单细胞分析揭示代谢功能障碍相关脂肪肝病中独特的MASH内皮细胞特征 | 首次在MASLD中鉴定出五个独特的MASH内皮细胞亚群，发现关键turquoise模块在糖脂代谢中的作用，并识别出两个新的致病基因ENTPD1和IFITM3 | NA | 阐明内皮细胞在代谢功能障碍相关脂肪肝病病理机制中的作用 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病患者的内皮细胞 | 生物信息学 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病 | 单细胞测序, 批量测序, 高维加权基因共表达网络分析, 机器学习, 孟德尔随机化 | 机器学习算法 | 单细胞测序数据, 批量测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 956 | 2025-10-05 |
Tryptophan metabolic dysregulation drives immune activation and cartilage degradation in osteoarthritis: Functional validation integrated with transcriptomic and single-cell RNA sequencing
2025-Sep-30, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152497
PMID:40907267
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学和单细胞RNA测序分析，揭示了色氨酸代谢紊乱在骨关节炎中驱动免疫激活和软骨退化的机制 | 首次系统阐明色氨酸代谢异常通过犬尿氨酸途径驱动骨关节炎免疫激活和软骨退化的代谢机制，并鉴定出代谢基因富集的软骨细胞亚群 | 研究主要基于体外细胞模型，需要进一步在动物模型和临床样本中验证 | 探究色氨酸代谢异常在骨关节炎发病机制中的作用 | 骨关节炎软骨组织、IL-1β刺激的软骨细胞 | 单细胞测序 | 骨关节炎 | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 957 | 2025-10-05 |
UCP2 is identified as a therapeutic target for abdominal aortic aneurysm by comprehensive bioinformatic analysis and experimental validation
2025-Sep-30, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152589
PMID:40915059
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研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证，确定UCP2作为腹主动脉瘤的潜在治疗靶点 | 首次系统研究胞葬作用相关基因在腹主动脉瘤中的作用，并发现UCP2在巨噬细胞中高表达且其抑制剂能显著减缓疾病进展 | 研究主要基于生物信息学分析和动物模型验证，需要在更多临床样本中进一步验证 | 探究胞葬作用相关基因在腹主动脉瘤发病机制中的作用并寻找治疗靶点 | 腹主动脉瘤患者组织样本和弹性蛋白酶诱导的小鼠AAA模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，机器学习，免疫荧光染色 | LASSO，随机森林，XGBoost | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | 使用GSE47472、GSE57691和GSE7084等多个数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 958 | 2025-10-05 |
A practical guide to spatial transcriptomics: lessons from over 1000 samples
2025-Sep-19, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.08.020
PMID:40975650
|
指南 | 基于1000多个空间样本处理经验的空间转录组学实用指南 | 整合了跨多个平台的1000多个空间样本的处理和分析经验，为领域提供首个大规模实践经验总结 | NA | 为研究人员提供空间转录组学实验的实用指导，支持稳健可重复的空间工作流程 | 空间转录组学实验的设计、执行和分析过程 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达空间数据 | 超过1000个空间样本 | NA | 空间转录组学 | NA | 多个空间转录组学平台 |
| 959 | 2025-10-05 |
Multi-modal characterization of metabolic and immune gene clusters in adrenocortical carcinoma treatment
2025-Sep-18, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01092-4
PMID:40968257
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研究论文 | 通过多模态分析开发肾上腺皮质癌的类固醇相关免疫评分系统，并验证其预测免疫治疗和激素抑制治疗反应的能力 | 开发了基于多模态分析的SIS评分系统，揭示了代谢和免疫基因簇的协同调控机制，发现ACC与精神分裂症的代谢特征相似性 | 样本量相对有限，需要进一步大样本验证 | 提高肾上腺皮质癌的精准医疗水平并改善患者预后 | 肾上腺皮质癌患者 | 数字病理学 | 肾上腺皮质癌 | 单细胞RNA测序, 多模态分析, 体外功能实验 | ResNet50, Vision Transformer-B16, CAMs | 基因组数据, 数字病理图像, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 960 | 2025-10-05 |
Spatially resolved transcriptomics of benign and malignant peripheral nerve sheath tumors
2025-Sep-17, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf016
PMID:39847441
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研究论文 | 本研究应用空间转录组学分析良性和恶性外周神经鞘瘤的空间异质性 | 首次构建MPNST的空间细胞分化图谱，定位施万细胞前体、神经嵴样细胞和间充质转化细胞的空间分布 | 样本量有限，属于初步研究 | 确定外周神经鞘瘤的空间和生物学异质性 | 福尔马林固定石蜡包埋的病变外周神经组织 | 空间转录组学 | 外周神经鞘瘤 | 空间转录组学，免疫组织化学 | 空间聚类，加权相关网络分析 | 空间转录组数据，单细胞测序数据，组织学特征 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |