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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 941 - 960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 941 | 2025-10-05 |
Tryptophan metabolic dysregulation drives immune activation and cartilage degradation in osteoarthritis: Functional validation integrated with transcriptomic and single-cell RNA sequencing
2025-Sep-30, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152497
PMID:40907267
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组学和单细胞RNA测序分析，揭示了色氨酸代谢紊乱在骨关节炎中驱动免疫激活和软骨退化的机制 | 首次系统阐明色氨酸代谢异常通过犬尿氨酸途径驱动骨关节炎免疫激活和软骨退化的代谢机制，并鉴定出代谢基因富集的软骨细胞亚群 | 研究主要基于体外细胞模型，需要进一步在动物模型和临床样本中验证 | 探究色氨酸代谢异常在骨关节炎发病机制中的作用 | 骨关节炎软骨组织、IL-1β刺激的软骨细胞 | 单细胞测序 | 骨关节炎 | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 942 | 2025-10-05 |
UCP2 is identified as a therapeutic target for abdominal aortic aneurysm by comprehensive bioinformatic analysis and experimental validation
2025-Sep-30, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152589
PMID:40915059
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研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证，确定UCP2作为腹主动脉瘤的潜在治疗靶点 | 首次系统研究胞葬作用相关基因在腹主动脉瘤中的作用，并发现UCP2在巨噬细胞中高表达且其抑制剂能显著减缓疾病进展 | 研究主要基于生物信息学分析和动物模型验证，需要在更多临床样本中进一步验证 | 探究胞葬作用相关基因在腹主动脉瘤发病机制中的作用并寻找治疗靶点 | 腹主动脉瘤患者组织样本和弹性蛋白酶诱导的小鼠AAA模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，机器学习，免疫荧光染色 | LASSO，随机森林，XGBoost | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | 使用GSE47472、GSE57691和GSE7084等多个数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 943 | 2025-10-05 |
A practical guide to spatial transcriptomics: lessons from over 1000 samples
2025-Sep-19, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.08.020
PMID:40975650
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指南 | 基于1000多个空间样本处理经验的空间转录组学实用指南 | 整合了跨多个平台的1000多个空间样本的处理和分析经验，为领域提供首个大规模实践经验总结 | NA | 为研究人员提供空间转录组学实验的实用指导，支持稳健可重复的空间工作流程 | 空间转录组学实验的设计、执行和分析过程 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达空间数据 | 超过1000个空间样本 | NA | 空间转录组学 | NA | 多个空间转录组学平台 |
| 944 | 2025-10-05 |
Multi-modal characterization of metabolic and immune gene clusters in adrenocortical carcinoma treatment
2025-Sep-18, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01092-4
PMID:40968257
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研究论文 | 通过多模态分析开发肾上腺皮质癌的类固醇相关免疫评分系统，并验证其预测免疫治疗和激素抑制治疗反应的能力 | 开发了基于多模态分析的SIS评分系统，揭示了代谢和免疫基因簇的协同调控机制，发现ACC与精神分裂症的代谢特征相似性 | 样本量相对有限，需要进一步大样本验证 | 提高肾上腺皮质癌的精准医疗水平并改善患者预后 | 肾上腺皮质癌患者 | 数字病理学 | 肾上腺皮质癌 | 单细胞RNA测序, 多模态分析, 体外功能实验 | ResNet50, Vision Transformer-B16, CAMs | 基因组数据, 数字病理图像, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 945 | 2025-10-05 |
Spatially resolved transcriptomics of benign and malignant peripheral nerve sheath tumors
2025-Sep-17, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf016
PMID:39847441
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研究论文 | 本研究应用空间转录组学分析良性和恶性外周神经鞘瘤的空间异质性 | 首次构建MPNST的空间细胞分化图谱，定位施万细胞前体、神经嵴样细胞和间充质转化细胞的空间分布 | 样本量有限，属于初步研究 | 确定外周神经鞘瘤的空间和生物学异质性 | 福尔马林固定石蜡包埋的病变外周神经组织 | 空间转录组学 | 外周神经鞘瘤 | 空间转录组学，免疫组织化学 | 空间聚类，加权相关网络分析 | 空间转录组数据，单细胞测序数据，组织学特征 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 946 | 2025-10-05 |
Elucidating anti-triple-negative breast cancer mechanisms and mitigating toxicity of Fritillaria thunbergii Miq.: A multi-omics and network pharmacology approach
2025-Sep-13, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120600
PMID:40953776
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研究论文 | 本研究通过多组学和网络药理学方法评估浙贝母抗三阴性乳腺癌的潜在治疗机制和安全性 | 整合网络药理学、机器学习、单细胞RNA测序和分子对接模拟，首次系统阐明浙贝母抗TNBC的分子机制，并通过结构优化降低毒性 | 计算生物学研究，缺乏实验验证 | 评估传统中药浙贝母抗三阴性乳腺癌的潜在治疗机制和安全性 | 浙贝母生物活性成分及其与三阴性乳腺癌的相互作用 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 网络药理学、机器学习、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟、网络毒理学 | 机器学习算法 | 组学数据、化合物结构数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 947 | 2025-10-05 |
Elevated P4HB expression in hepatocellular carcinoma and its role in UCA1-mediated malignant progression
2025-Sep-12, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112131
PMID:40945634
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研究论文 | 本研究探讨P4HB在肝细胞癌中的表达及其通过UCA1促进恶性肿瘤进展的作用机制 | 首次发现P4HB与lncRNA UCA1之间的相互作用，并揭示其通过增强糖酵解促进HCC恶性行为的新机制 | 未明确说明样本量大小及研究人群的具体特征 | 研究P4HB在肝细胞癌进展中的作用及其作为诊断生物标志物的潜力 | 肝细胞癌细胞及患者血清样本 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序，ROC分析，体外和体内功能实验 | NA | 基因表达数据，血清蛋白水平数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 948 | 2025-10-05 |
DAESC+: High-performance, integrated software for single-cell allele-specific expression data
2025-Sep-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.03.674100
PMID:40964337
|
研究论文 | 开发了用于单细胞等位基因特异性表达数据处理和分析的高性能集成软件DAESC+ | 提供了首个端到端的单细胞ASE专用计算工具，预处理模块DAESC-P比现有SALSA流程更准确，分析模块DAESC-GPU比前代方法DAESC快数十倍且可扩展至百万级细胞 | NA | 开发高性能的单细胞等位基因特异性表达数据分析工具 | 单细胞等位基因特异性表达数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | GPU加速计算 | 单细胞RNA测序数据 | OneK1K队列子集（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 949 | 2025-10-05 |
Spatiotemporal analysis of Crohn's disease reveals PECAM2 signaling at the basis of the inflammation-to-fibrosis transition
2025-Sep-07, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjaf130
PMID:40680170
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研究论文 | 通过时空转录组学分析克罗恩病，揭示PECAM2信号在炎症向纤维化转变中的关键作用 | 首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序技术，系统解析克罗恩病中炎症向纤维化转变的细胞分子机制，并发现PECAM2-CD38信号轴的关键驱动作用 | 样本量相对有限（13个手术标本），研究结果需要在更大队列中进一步验证 | 阐明克罗恩病从慢性炎症向纤维化发展的分子机制 | 克罗恩病患者手术标本、TNBS诱导的慢性结肠炎小鼠模型 | 空间转录组学 | 克罗恩病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 免疫染色, 配体-受体相互作用分析, 伪时间分析 | 计算分析流程, TNBS诱导的小鼠结肠炎模型 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 免疫染色图像 | 13个手术标本（包括炎症组织、纤维化组织和健康对照） | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 950 | 2025-10-05 |
Differential Localization of β-Catenin Protein in CTNNB1 Mutant Endometrial Cancers Results in Distinct Transcriptional Profiles
2025-Sep, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2025.100791
PMID:40348058
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析CTNNB1突变子宫内膜癌中β-连环蛋白不同亚细胞定位导致的转录谱差异 | 首次发现β-连环蛋白在CTNNB1突变子宫内膜癌中的亚细胞定位差异导致瘤内转录异质性，并鉴定出TROP2作为Wnt/β-连环蛋白信号通路的新治疗靶点 | 研究样本量有限，未明确说明具体病例数量；空间转录组学分析仅针对选定区域 | 确定β-连环蛋白不同亚细胞定位对子宫内膜癌下游基因表达的影响 | CTNNB1外显子3突变的子宫内膜样子宫内膜癌组织 | 空间转录组学 | 子宫内膜癌 | 空间转录组学，差异表达分析，层次聚类分析 | NA | 空间转录组数据，蛋白质定位数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 951 | 2025-10-05 |
Nerve-associated macrophages control adipose homeostasis across lifespan and restrain age-related inflammation
2025-Sep, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-025-00952-9
PMID:40897908
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研究论文 | 本研究揭示了神经相关巨噬细胞在调控脂肪组织稳态和抑制年龄相关炎症中的关键作用 | 首次发现并定义了神经相关巨噬细胞这一特殊脂肪组织巨噬细胞亚群，揭示了其在控制脂肪组织稳态和抑制年龄相关炎症中的新机制 | 研究仅在鼠类模型中进行，尚未在人类中验证；具体分子机制仍需进一步研究 | 探究脂肪组织巨噬细胞在年龄相关炎症中的作用机制 | 小鼠脂肪组织中的巨噬细胞亚群 | 免疫学 | 老年疾病 | 单细胞测序，多参数流式细胞术，血管内标记 | NA | 单细胞测序数据，流式细胞数据 | 不同年龄段的小鼠脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 952 | 2025-10-05 |
MIG-21 interacts with Wnt and Netrin signaling in gonad migration in C. elegans
2025-Sep, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011866
PMID:40953068
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现mig-21基因在线虫生殖腺迁移中的新调控作用 | 首次在线虫生殖腺迁移研究中应用单细胞RNA测序技术，发现mig-21与Wnt和Netrin信号通路协同调控远端尖端细胞的迁移 | 研究主要基于已发表的单细胞RNA测序数据集，实验验证仍依赖传统遗传学方法 | 探究线虫生殖腺迁移过程中新的遗传调控机制 | 秀丽隐杆线虫的生殖腺远端尖端细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，RNAi敲低，活细胞成像，经典遗传学技术 | NA | 单细胞RNA测序数据，显微成像数据 | 已发表的成年秀丽隐杆线虫单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 953 | 2025-10-05 |
Spatial gene expression at single-cell resolution from histology using deep learning with GHIST
2025-Sep, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02795-z
PMID:40954301
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研究论文 | 开发了一种基于深度学习的框架GHIST，能够从组织学图像预测单细胞分辨率空间基因表达 | 利用亚细胞空间转录组学和多层生物信息协同关系，实现单细胞分辨率的空间基因表达预测 | 未明确说明具体的技术限制 | 开发从常规组织学图像预测空间基因表达的方法 | 公共数据集和癌症基因组图谱数据 | 数字病理学 | 癌症 | 深度学习 | 深度学习框架 | 组织学图像、空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 954 | 2025-10-05 |
Single-cell consequences of X-linked meiotic drive in stalk-eyed flies
2025-Sep, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011816
PMID:40966227
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序研究马来西亚突眼蝇X连锁减数分裂驱动对睾丸转录组景观和性染色体调控的影响 | 首次在非模式生物突眼蝇中构建睾丸单细胞图谱，揭示减数分裂驱动系统对性染色体调控的独特影响 | 研究局限于单一物种，缺乏与其他驱动系统的比较分析 | 探究性连锁减数分裂驱动的分子机制及其对配子发生和性染色体调控的影响 | 马来西亚突眼蝇(Teleopsis dalmanni)的睾丸组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 驱动型和标准型睾丸样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 955 | 2025-10-05 |
Mitoepigenetic Targeting of Age-Related Dysfunction: Mechanisms, Therapeutic Avenues, and Transgenerational Implications
2025-Sep, Aging advances
|
综述 | 探讨线粒体表观遗传学在衰老及相关疾病中的作用机制与治疗前景 | 系统整合线粒体表观遗传调控机制，提出跨代表观遗传记忆和精准医疗新策略 | 线粒体DNA甲基化检测技术存在标准化难题，临床转化面临挑战 | 阐明线粒体表观遗传在年龄相关功能障碍中的调控机制与治疗潜力 | 线粒体DNA、核小体动力学、非编码RNA、代谢产物修饰 | 表观遗传学 | 衰老相关疾病 | 单细胞测序、CRISPR技术、表观遗传分析 | NA | 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 956 | 2025-10-05 |
Graph-based deep learning for integrating single-cell and bulk transcriptomic data to identify clinical cancer subtypes
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf467
PMID:40966644
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研究论文 | 提出一种基于图深度学习的单细胞和批量转录组数据整合方法，用于识别临床癌症亚型 | 开发了scBGDL方法，通过构建样本特异性基因图来建模基因-基因相互作用和细胞关系，结合图注意力网络、MinCutPool层和Transformer模块 | 未明确说明方法在处理特定数据类型或技术变体时的局限性 | 整合单细胞和批量转录组数据以精确识别癌症亚型和预测临床结局 | 癌症患者转录组数据 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序，批量转录组测序 | 图注意力网络，Transformer，图深度学习 | 基因表达数据 | 16种TCGA癌症类型，肺癌1099例，卵巢癌762例，黑色素瘤305例 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 957 | 2025-10-05 |
ISENICS: a model for identifying senescent immune cells and samples and characterization of their roles in tumor microenvironment
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf469
PMID:40966646
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研究论文 | 开发ISENICS模型识别衰老免疫细胞并研究其在肿瘤微环境中的作用 | 首次开发了能够量化不同免疫细胞类型衰老水平的模型，并系统分析了23种癌症类型中衰老免疫细胞的特征 | NA | 探索衰老免疫细胞在肿瘤免疫微环境中的作用及其与免疫治疗反应的关系 | 23种癌症类型的肿瘤样本和正常样本中的免疫细胞 | 生物信息学 | 癌症 | RNA-seq | 去卷积算法 | 基因表达数据 | 23种癌症类型的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 958 | 2025-10-05 |
A STAT3/integrin axis accelerates pancreatic cancer initiation and progression
2025-Aug-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116010
PMID:40701148
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研究论文 | 本研究揭示了STAT3通过调控ITGB3表达加速胰腺癌发生发展的新机制 | 发现STAT3通过染色质可及性调控ITGB3表达的塑性调控机制，并建立了18基因特征用于生存分层 | NA | 探究STAT3信号通路在胰腺癌发生发展中的调控机制 | 胰腺导管腺癌细胞 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | ChIP-seq, 单细胞转录组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 959 | 2025-10-05 |
Aggrecan protects against plaque accumulation and is essential for proper microglial responses to plaques
2025-Aug-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116064
PMID:40748756
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研究论文 | 本研究探讨了聚集蛋白聚糖在阿尔茨海默病中对斑块积累的抑制作用及其对小胶质细胞反应的关键调控作用 | 首次通过基因敲除方法证明聚集蛋白聚糖缺失会增强疾病相关小胶质细胞表型并改变斑块形态 | 研究基于5xFAD小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究神经周围网络在阿尔茨海默病发病机制中的作用 | 5xFAD转基因小鼠模型和Acan条件性敲除小鼠 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞空间转录组学，基因敲除技术 | 条件性基因敲除模型 | 基因表达数据，组织成像数据 | 转基因小鼠模型 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 960 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptional landscape of liver transplant rejection reveals tissue persistence of clonally expanded, treatment-resistant T cells
2025-Aug-12, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2025.08.004
PMID:40812614
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示肝移植排斥中克隆扩增、治疗抵抗性T细胞的持续存在机制 | 首次在肝移植排斥中系统描绘CD8 T细胞的克隆扩增、表型特征和空间定位，发现其治疗后的持续存在现象 | 样本量相对有限（30例），主要针对儿科患者，结果在成人中的普适性需进一步验证 | 探究肝移植T细胞介导排斥中CD8 T细胞的克隆动态和分子特征 | 儿科肝移植患者的冷冻保存肝活检组织 | 单细胞生物学 | 肝移植排斥 | 单细胞RNA测序，免疫受体谱分析，MultiNicheNet分析 | NA | 单细胞转录组数据，免疫受体序列数据 | 30例冷冻保存肝活检组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |