单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 37491 篇文献,本页显示第 941 - 960 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
941 2026-03-07
NAFLD and Hypothyroidism: Deciphering Pivotal Genetic Variants, Cellular Expression Landscapes, and Spatial Architectures
2026-Feb-14, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过整合大规模全基因组关联研究、单细胞转录组学、空间转录组学和单细胞染色质可及性数据,揭示了非酒精性脂肪肝病(NAFLD)与甲状腺功能减退症之间的遗传关联、细胞表达景观和空间结构 结合单细胞转录组学、空间转录组学和单细胞染色质可及性,提出了动态时空双打击模型,并鉴定了MAGI3、RRNAD1和PRCC等候选基因及关键风险位点rs926103 未明确提及样本量或具体实验平台细节,可能依赖于公开数据集 解析NAFLD与甲状腺功能减退症之间的遗传基础和病理生理连续体 非酒精性脂肪肝病(NAFLD)和甲状腺功能减退症患者 计算生物学 非酒精性脂肪肝病 全基因组关联研究(GWAS)、单细胞转录组学、空间转录组学、单细胞染色质可及性 动态时空双打击模型 基因组、转录组、空间转录组、染色质可及性数据 NA NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学、单细胞ATAC-seq NA NA
942 2026-03-07
KIF18B Is Essential for Lung Adenocarcinoma Progression Through the E2F Transcriptional Network
2026-Feb-13, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究揭示了KIF18B通过E2F转录网络驱动肺腺癌进展的关键作用 首次系统阐明KIF18B在肺腺癌中的致癌机制,并发现其通过调控E2F转录网络发挥作用 研究主要基于细胞系和公共数据库分析,缺乏更多临床样本验证 探究KIF18B在肺腺癌中的致癌作用和治疗靶点潜力 肺腺癌细胞系、TCGA和GEO数据库中的肺腺癌组织数据 癌症生物学 肺癌 单细胞测序、转录组分析、荧光素酶报告基因检测 NA 基因表达数据、单细胞测序数据 TCGA和GEO数据库中的肺腺癌样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
943 2026-03-07
Organoids Gone Viral: A Comprehensive Review on Human Organoid Models to Study Viral Pathogenesis
2026-Feb-13, Viruses
综述 本文全面综述了利用人类类器官模型研究病毒发病机制的最新进展与应用 系统阐述了类器官技术如何通过提供生理相关的3D人类模型,填补了传统2D细胞培养与复杂体内系统之间的空白,并整合了单细胞转录组学、CRISPR编辑和抗病毒筛选等前沿技术 NA 总结和评估类器官模型在研究人类病毒发病机制、抗病毒药物发现和疫苗测试方面的应用与潜力 人类类器官模型,涵盖神经、肠道、肝脏、肺和肾组织 数字病理学 病毒感染 单细胞转录组学、CRISPR编辑、抗病毒筛选 NA NA NA NA NA NA NA
944 2026-03-07
Neonatal Hyperoxia Induces Metabolic Reprogramming in Senescent Alveolar Macrophages, Leading to Persistent Lung Injury
2026-Feb-10, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了新生儿高氧暴露诱导衰老肺泡巨噬细胞的代谢重编程,导致持续性肺损伤的分子机制 首次在新生儿高氧模型中,利用单细胞RNA测序技术系统性地鉴定了衰老肺泡巨噬细胞的异质性群体及其代谢重编程特征,并验证了靶向代谢通路(如丙酮酸脱氢酶激酶抑制)和衰老细胞清除对减轻肺损伤的作用 研究基于小鼠模型,结果向人类早产儿支气管肺发育不良的转化需进一步验证;单细胞测序数据为重新分析现有数据集,可能受原始实验设计限制 探究新生儿高氧暴露诱导的衰老肺泡巨噬细胞的分子和功能特性,及其在持续性肺损伤中的作用 新生小鼠的肺组织,特别是高氧暴露后分离的衰老肺细胞(以巨噬细胞为主) 数字病理学 肺疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 基于公共数据集GSE207866,包括高氧暴露和空气暴露对照组的小鼠肺细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
945 2026-03-07
Canonical human blood dendritic cells are distinguished by robust E-selectin binding
2026-Feb-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 本文研究了人类血液树突状细胞通过E-选择素结合进行组织募集的分子基础 揭示了所有人类血液树突状细胞亚群均具有稳健的E-选择素结合能力,这是其统一特征,并重新概念化了这类连接先天与适应性免疫系统的细胞 单细胞RNA测序未能提供树突状细胞sLeX表达的关键化学酶效应物的见解 探究人类血液树突状细胞与E-选择素结合的能力及其组织募集的分子机制 人类血液树突状细胞及其亚群 免疫学 NA 多参数流式细胞术、生化分析、转录本测量、RNA测序 NA 流式细胞数据、生化数据、转录组数据 NA NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
946 2026-03-07
A comprehensive single-cell analysis reveals the impact of laser interstitial thermal therapy on the tumor microenvironment in glioblastoma
2026-Feb-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光分析,探究了激光间质热疗(LITT)诱导的亚致死性高温对胶质母细胞瘤(GBM)肿瘤微环境的影响 首次在体内颅内大鼠GBM模型中,利用单细胞RNA测序结合空间转录组学和生存分析,系统揭示了LITT诱导的亚致死性高温对肿瘤微环境的复杂且对立的影响,包括促进免疫细胞浸润、降低肿瘤恶性程度,同时发现其促进肿瘤血管生成和增殖的双重作用 研究基于大鼠模型,其结果向人类临床转化的直接适用性尚需进一步验证;研究聚焦于亚致死性高温区域,对核心消融区的直接效应未深入探讨 探究激光间质热疗(LITT)诱导的亚致死性高温对胶质母细胞瘤(GBM)肿瘤细胞及其微环境的影响,以优化其临床应用 胶质母细胞瘤(GBM)大鼠模型中的肿瘤细胞及肿瘤微环境内的免疫细胞(如细胞毒性T细胞、树突状细胞、B细胞、巨噬细胞) 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序,免疫荧光测定,空间转录组学,细胞间通讯分析,生存分析 NA 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,免疫荧光图像数据 使用体内颅内大鼠GBM模型进行研究,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
947 2026-03-07
T cells co-expressing high levels of CD29 and CD99 show increased cytotoxic potential and are upregulated in Sjögren's disease
2026-Feb-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 本研究探讨了CD29和CD99在人类T淋巴细胞中的共表达及其在干燥综合征中的意义 首次揭示了CD29和CD99在T细胞中的强正相关性,并发现CD29hiCD99hi T细胞具有增强的细胞毒性和激活表型,在干燥综合征患者中显著上调 研究主要基于外周血样本,未深入探讨组织特异性;ROC分析显示仅CD4+ T细胞中的TIGIT表达具有高AUC值,提示其他标志物可能有限;需要进一步纵向研究验证临床价值 研究CD29和CD99在T淋巴细胞中的作用及其在干燥综合征中的临床意义 人类外周血单个核细胞(PBMCs)中的T淋巴细胞,包括干燥综合征患者和健康对照 免疫学 干燥综合征 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、流式细胞术、批量RNA测序(bulk RNA-Seq) NA 基因表达数据、流式细胞数据 干燥综合征患者和健康对照的外周血样本(具体数量未明确) NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
948 2026-03-07
Disruption of Cell-Adhesion Signaling Resolves Unwanted Progenitor Specification in Stem Cell-Derived α and β Cell Grafts
2026-Feb-07, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本研究探讨了干细胞衍生的α和β细胞移植物中由残留祖细胞引起的异常增生问题,并发现通过破坏细胞黏附信号可以降低其增生倾向 首次发现并比较了SC-α细胞与SC-β细胞移植物中异常增生的相似性,识别出共同的驱动细胞群,并提出通过单细胞分散和重聚集全面破坏细胞黏附信号的新策略来减少增生 研究未详细探讨Notch通路小分子抑制剂对不同驱动细胞群效果差异的具体机制,且体外干预策略在体内长期安全性和有效性仍需进一步验证 提高干细胞衍生的α和β细胞用于1型糖尿病细胞疗法的安全性 干细胞衍生的α细胞和β细胞及其移植物中的异常增生 细胞生物学与再生医学 1型糖尿病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
949 2026-03-07
TWEAK is increased in ulcerative colitis and contributes to fibroblast-mediated monocyte activation via heterologous non-canonical NF-kB/STAT3 signaling
2026-Feb-05, Journal of Crohn's & colitis
研究论文 本研究探讨了TWEAK在溃疡性结肠炎中的作用,通过异源非经典NF-kB/STAT3信号通路促进成纤维细胞介导的单核细胞活化 揭示了TWEAK通过NF-κB/STAT3轴调控成纤维细胞与单核细胞间通讯的新机制,并关联了抗TNF治疗耐药性和IBD易感基因 机制研究主要基于体外共培养模型,体内验证和临床转化潜力需进一步探索 阐明溃疡性结肠炎中成纤维细胞介导单核细胞活化的分子机制 溃疡性结肠炎患者组织样本、健康供体样本、成纤维细胞与单核细胞共培养体系 NA 溃疡性结肠炎 共培养模型、单细胞转录组学、免疫荧光染色 NA 转录组数据、组织样本 人类溃疡性结肠炎患者和健康供体的活检组织 NA 单细胞转录组学 NA NA
950 2026-03-07
Tensor-cell2cell v2 unravels coordinated dynamics of protein- and metabolite-mediated cell-cell communication
2026-Feb-03, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文介绍了Tensor-cell2cell v2,一种用于联合分析蛋白质和代谢物介导的细胞间通讯动态变化的计算工具 通过耦合张量成分分析,首次实现了对蛋白质和代谢物介导的细胞间通讯的联合分析,并保留了各模态的独立性和数据结构 NA 开发一种能够分析细胞间通讯动态变化,特别是蛋白质和代谢物协调作用的计算工具 大脑类器官发育过程中的细胞间通讯 计算生物学 NA 单细胞转录组学 耦合张量成分分析 单细胞转录组数据 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
951 2026-03-07
Single-Cell Sequencing Reveals the Immune Characteristics of Secondary Liver Injury Induced Indirectly by CHIKV Infection in Rhesus Macaques
2026-Feb-03, Viruses
研究论文 本研究通过建立恒河猴基孔肯雅病毒感染模型,利用单细胞RNA测序技术揭示了CHIKV感染间接引起的继发性肝损伤的免疫特征 首次在恒河猴模型中结合单细胞测序技术系统解析CHIKV感染导致的间接肝损伤免疫机制,发现T细胞与巨噬细胞间潜在的双向激活效应 研究仅基于第7天感染时间点的单细胞数据,缺乏动态时间序列分析;样本量较小且为动物模型,需人类样本验证 探究基孔肯雅病毒感染间接导致肝损伤的免疫学机制 感染CHIKV的恒河猴肝脏组织 单细胞组学 病毒感染相关肝损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 恒河猴感染模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
952 2026-03-07
CEBPB Expression in Tumor Cells Drives Immune Evasion in Colorectal Cancer via CTLA4 Up-regulation in T Cells
2026, Cancer communications (London, England)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了结直肠癌中CEBPB表达如何通过上调T细胞中的CTLA4驱动免疫逃逸 首次发现肿瘤细胞中CEBPB表达与T细胞CTLA4上调之间的直接关联,并阐明p53突变通过CEBPB介导的免疫抑制机制 研究主要基于小鼠模型和细胞共培养实验,人类样本验证相对有限,且机制细节需进一步探索 阐明结直肠癌免疫逃逸的分子机制 结直肠癌患者肿瘤组织、小鼠模型及细胞系 单细胞测序 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 30名结直肠癌患者肿瘤组织及小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
953 2026-03-07
Multi-omics profiling of sodium-overload (NECSO) programs identifies NEK8 as a central driver of colorectal cancer progression through single-cell and spatial transcriptomics
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组学分析,揭示了钠超载细胞死亡程序在结直肠癌进展中的核心作用,并识别NEK8为关键驱动因子 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组学来研究NECSO程序在结直肠癌中的作用,并开发了一个基于NECSO的五基因预后模型 研究主要基于TCGA和GEO数据集进行验证,可能缺乏前瞻性临床队列的独立验证 探究钠超载细胞死亡程序在结直肠癌进展中的作用及其与免疫调节的关联 结直肠癌患者样本和细胞系 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 LASSO-Cox回归模型 基因表达数据, 空间转录组数据 TCGA和GEO数据集中的结直肠癌样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
954 2026-03-07
Systematic Comparison of Droplet-Based and Microwell-Based Platforms for Comprehensive Single-Cell Transcriptomic Analysis in Clinical Samples
2026, IET nanobiotechnology IF:3.8Q3
研究论文 本研究系统比较了基于液滴和微孔板的单细胞RNA测序平台在临床样本分析中的性能,揭示了平台间在mRNA偏好、细胞类型恢复和基因表达模式等方面的差异 首次在临床样本中全面比较了基于液滴和微孔板的scRNA-seq平台,揭示了平台特异性技术偏差对数据解释的影响,为跨平台数据整合提供了新见解 研究可能未涵盖所有临床样本类型或平台变体,且批次效应校正后仍存在残留差异 比较不同单细胞RNA测序平台在临床样本分析中的性能差异,以优化平台选择和数据整合策略 临床样本(具体肿瘤类型未明确说明) 单细胞转录组学 肿瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA 基于液滴和基于微孔板的scRNA-seq平台
955 2026-03-07
Salidroside targets the Notch1/Hes5 axis to reconstruct the molecular innate immune-vascular network and correlates with repair after ischemic stroke
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了缺血性中风后神经分子先天免疫-血管网络的失调,并发现红景天主要活性成分红景天苷通过靶向Notch1/Hes5轴调节星形胶质细胞状态,从而促进神经修复 首次在单细胞分辨率下,将红景天苷的神经保护作用与Notch1+Hes5+星形胶质细胞亚群的调控联系起来,并系统描绘了缺血性中风后先天免疫微环境的细胞图谱和调控网络 研究主要基于小鼠模型,其在人类疾病中的转化意义尚需进一步验证;单细胞测序数据主要来自特定时间点,动态变化过程仍需更全面的时序分析 阐明缺血性中风后神经分子先天免疫-血管网络的失调机制,并探究中药红景天活性成分红景天苷的细胞类型特异性免疫调节作用 缺血性中风小鼠模型的脑组织细胞 数字病理学 缺血性中风 单细胞RNA测序,网络药理学,分子对接,生物信息学分析 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
956 2026-03-07
Metabolic reprogramming of glioma-associated macrophages identifies detoxification and energetic macrophages as drivers of immunosuppression and therapeutic vulnerability
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过代谢重编程对胶质瘤相关巨噬细胞进行分型,鉴定出解毒与能量型巨噬细胞是免疫抑制和潜在治疗靶点的关键驱动因素 首次基于代谢特征对胶质瘤相关巨噬细胞进行系统分型,并构建了结合代谢风险模型与EGFR/IDH状态的临床预后工具 研究主要基于生物信息学分析,实验验证部分相对有限,需要更多功能实验证实代谢亚型的具体机制 阐明胶质瘤相关巨噬细胞的代谢重编程特征及其临床预后价值 胶质瘤患者样本中的肿瘤相关巨噬细胞 数字病理学 胶质瘤 单细胞RNA测序,转录组测序,Western blot 逐步Cox回归 + 随机生存森林 单细胞RNA-seq数据,批量转录组数据,临床数据 未明确指定具体样本数量,但包含胶质瘤患者的单细胞和批量测序数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
957 2026-03-07
Characterizing tumor microenvironment heterogeneity in EBV+ nTNKL vs ENKTL using spatial transcriptomics and MIF
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学和多重免疫荧光技术,比较了EBV阳性淋巴结T/NK细胞淋巴瘤(EBV+ nTNKL)与结外NK/T细胞淋巴瘤(ENKTL)的肿瘤微环境异质性 首次通过空间转录组学揭示ENKTL与EBV+ nTNKL在免疫微环境、细胞间通讯和分子特征上的根本差异,为这一罕见淋巴瘤亚型提供了新的生物学见解 样本量有限(仅14例EBV+ nTNKL患者),可能影响结果的普遍性 阐明EBV+ nTNKL与ENKTL的免疫学和分子结构差异,探索其临床意义和治疗策略 EBV阳性淋巴结T/NK细胞淋巴瘤(EBV+ nTNKL)和结外NK/T细胞淋巴瘤(ENKTL)患者组织样本 数字病理学 淋巴瘤 空间转录组学,多重免疫荧光 NA 空间转录组数据,免疫荧光图像 14例EBV+ nTNKL患者(回顾性队列)及代表性ENKTL标本 NA 空间转录组学 NA NA
958 2026-03-07
Annotation-free prediction of immunotherapy response in melanoma using single-cell transcriptomic data
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究开发了一种基于人工智能的模型,利用单细胞RNA测序数据预测黑色素瘤患者对免疫检查点抑制剂的反应,无需细胞类型注释 提出了一种无需细胞类型注释的AI模型,直接从单细胞转录组数据预测免疫治疗反应,并识别出29个关键预测生物标志物,如CCR7和MTRNR2L2 研究基于公共数据集,样本量相对有限,且模型在独立验证中可能受批次效应或技术差异影响 预测黑色素瘤患者对免疫检查点抑制剂的治疗反应 黑色素瘤患者的肿瘤浸润细胞 机器学习 黑色素瘤 单细胞RNA测序 Extreme Gradient Boosting, Random Forest, Logistic Regression, Support Vector Machine, Feedforward Neural Network, Convolutional Neural Network 单细胞转录组数据 16,290个肿瘤浸润细胞 NA 单细胞RNA-seq Smart-seq2 Smart-seq2平台
959 2026-03-07
Fcer1g and St3gal1: Macrophage-associated angiogenesis biomarkers and therapeutic targets in sepsis-induced acute lung injury
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过生物信息学分析和机器学习算法,鉴定出Fcer1g和St3gal1作为脓毒症相关急性肺损伤中巨噬细胞相关的血管生成关键生物标志物和潜在治疗靶点 首次系统性地结合WGCNA、多种机器学习算法和单细胞RNA测序技术,在脓毒症相关急性肺损伤中鉴定出巨噬细胞相关的血管生成关键基因Fcer1g和St3gal1,并揭示了它们通过糖免疫信号通路介导巨噬细胞-内皮细胞相互作用的分子机制 研究主要基于小鼠模型和生物信息学分析,尚未在人类患者中进行充分验证;基因表达模式和机制在人类SALI中的适用性需要进一步实验证实 鉴定脓毒症相关急性肺损伤中巨噬细胞相关的血管生成相关基因,作为新型诊断生物标志物和治疗靶点 脓毒症相关急性肺损伤(SALI)中的巨噬细胞和血管生成过程 生物信息学 急性肺损伤 RNA-seq, 单细胞RNA测序, RT-PCR LASSO回归, 随机森林, SVM 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 未在摘要中明确说明具体样本数量,使用了GEO数据库的转录组数据集和独立验证集 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
960 2026-03-07
Dapagliflozin mitigates myocardial inflammation and metabolic stress in heart failure through STAT1 inhibition: Evidence from multi-omics analyses and experimental exploration
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过整合多组学分析和实验验证,揭示了达格列净通过抑制STAT1信号通路减轻心力衰竭中的心肌炎症和代谢应激的分子机制 首次将STAT1确定为连接心力衰竭中代谢应激与免疫失衡的关键枢纽基因,并通过单细胞转录组学分析在特定髓系细胞亚群中验证了其异常表达 研究主要基于动物模型和细胞实验,临床样本验证有限;单细胞测序数据来自公共数据库,样本量相对较小 探究达格列净在心力衰竭中的分子作用机制,特别是其对STAT1信号通路的调控作用 心力衰竭患者的心肌组织样本、心肌梗死诱导的心力衰竭大鼠模型以及H9C2心肌细胞系 生物信息学与计算生物学 心血管疾病 RNA测序、单细胞RNA测序、Western blot、ELISA、流式细胞术、qPCR 加权基因共表达网络分析(WGCNA)、Seurat、Harmony 转录组数据、单细胞转录组数据、蛋白质表达数据、细胞表型数据 公共数据集GSE57345(批量RNA-seq)、GSE145154(单细胞RNA-seq,包含4例正常对照、8例扩张型心肌病、6例缺血性心肌病梗死区、6例非梗死区样本),以及大鼠模型(对照组、HF组、HF+DAPA组各若干) NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
回到顶部