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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 941 | 2026-07-02 |
PRMT1 regulates glioblastoma stemness and immunosuppression via nitric oxide metabolism: Multi-cohort analysis and experimental validation
2026-06, Nitric oxide : biology and chemistry
DOI:10.1016/j.niox.2026.02.003
PMID:41747856
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研究论文 | 通过多队列分析和实验验证,研究PRMT1通过一氧化氮代谢调控胶质母细胞瘤干性和免疫抑制的机制 | 首次揭示PRMT1作为一氧化氮代谢相关基因,通过NO依赖机制同时调控胶质瘤干性因子(OCT4、SOX2)和免疫检查点(PD-L1),连接代谢、干性和免疫抑制 | 未提及具体局限性,但可能包括样本来源主要为公开数据集、细胞系模型与临床实际差异以及NO代谢调控网络的复杂性 | 阐明一氧化氮代谢在协调胶质瘤干性和免疫逃逸中的关键分子机制 | 胶质母细胞瘤细胞系、患者来源的胶质瘤干细胞、原位小鼠模型以及多队列临床样本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, Cox回归, LASSO建模, 基因敲除实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 1500例(CGGA、TCGA、Rembrandt数据集)和65655个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 942 | 2026-07-02 |
Human Fibroblast-Myeloid Cell Tissue Atlas Across the Lungs, Synovium, Skin, and Heart
2026-Jun-01, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70238
PMID:42223224
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研究论文 | 通过分析公共单细胞RNA测序数据,构建了人类肺、滑膜、皮肤和心脏的成纤维细胞-髓系细胞组织图谱 | 首次跨组织比较了肺、滑膜、皮肤和心脏中成纤维细胞和髓系细胞的共享及组织特异性亚群,并鉴定了SPP1+巨噬细胞和POSTN+成纤维细胞作为致病组织中共有的致病亚群 | 尽管识别了共享和疾病特异的细胞变化,但样本来源于公共数据集,可能存在跨个体变异且部分疾病状态混杂 | 表征不同组织中共有和组织特异性的髓系及基质细胞表型,揭示参与致病组织激活的关键细胞亚型 | 人类肺、滑膜、皮肤和心脏组织中的髓系细胞(136,741个)和成纤维细胞(116,776个) | 数字病理学 | 心血管疾病,肺部疾病,皮肤疾病,关节疾病 | 单细胞RNA测序(scRNAseq),免疫荧光验证 | NA | 单细胞转录组数据 | 148个样本,包括心脏41例、肺25例、皮肤34例和滑膜48例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 943 | 2026-07-02 |
Generation and Single-Cell Transcriptomic Analysis of Hepatocellular Carcinoma Organoids following Drug Treatment
2026-May-26, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/70511
PMID:42296231
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研究论文 | 开发了一种标准化工作流程,用于生成肝细胞癌类器官、实施指定药物处理并进行单细胞RNA测序,以分析药物处理前后的转录变化 | 将类器官药物处理与下游单细胞转录组分析连接起来的标准化实验流程,并提供了关键的技术注意事项以提高可重复性和样本质量 | 未提及具体局限性,但可能包括类器官异质性、药物处理条件的优化需求等 | 建立一种实用工作流程,以研究肝细胞癌类器官在药物处理前后的转录水平变化 | 肝细胞癌类器官 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量,但涉及药物处理前后的类器官样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 基于10x Chromium平台构建单细胞文库 |
| 944 | 2026-07-02 |
Scientific highlights and perspectives from the International Inflammatory Breast Cancer Symposium 2025
2026-05-15, Cancer
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/cncr.70447
PMID:42133847
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综述 | 总结了2025年国际炎性乳腺癌研讨会的科学亮点与未来研究方向的战略规划 | 聚焦于肿瘤栓子形成和肿瘤微环境相互作用等炎性乳腺癌独特生物学特征,并整合空间转录组学、人工智能工具和液体活检等新兴技术以推动疾病诊疗进展 | 未提供具体研究数据或实验验证,主要基于专家讨论和观点综述 | 回顾炎性乳腺癌领域的最新研究进展,并确定研究和临床护理的战略优先事项 | 炎性乳腺癌的生物学机制、分子免疫分型、治疗策略以及新兴技术应用 | 癌症研究 | 炎性乳腺癌 | 空间转录组学、液体活检 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 945 | 2026-07-02 |
10 × Genomics Flex Gene Expression is a powerful tool for single-cell transcriptomics of xenografts models
2026-May-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04092-0
PMID:42098734
|
研究论文 | 10x Genomics Flex基因表达方案是一种基于探针的方法,用于分析固定或冷冻样本,简化单细胞RNA测序前的样本处理,并展示了在异种移植模型中通过混合探针同时分析人类和小鼠细胞的能力 | 首次证明10x Genomics Flex方案可以通过混合人类和小鼠探针组,在单一反应中对异种移植样本进行单细胞转录组分析,无需流式分选即可获得干净的物种特异性计数矩阵 | 探针仅适用于人类和小鼠,且需要去除交叉反应信号以获得清晰的物种特异性数据 | 评估10x Genomics Flex基因表达方案在异种移植模型单细胞转录组学中的应用潜力 | 含有混合人类和小鼠细胞的异种移植样本 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 异种移植样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Flex基因表达方案 | 10x Genomics Flex基因表达方案,使用人类和小鼠探针组进行混合反应 |
| 946 | 2026-07-02 |
Integrated bulk and single-cell transcriptomic analyses identify transcriptome-defined groups and EGFR-associated microenvironmental programs in glioma
2026-May-08, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05138-2
PMID:42101748
|
研究论文 | 综合批量与单细胞转录组分析,识别胶质瘤中转录组定义的分组及EGFR相关微环境程序 | 首次整合批量RNA测序与单细胞RNA测序数据,系统表征EGFR高/低表达恶性细胞状态及其与肿瘤微环境的交互模式 | 原始数据来源有限(仅两个公共数据集),验证仅依赖细胞系,缺乏临床样本和体内模型支持 | 阐明胶质瘤分子异质性与EGFR相关恶性细胞程序的机制 | 胶质瘤细胞系(LN229, U251)和正常星形胶质细胞(NHA) | 自然语言处理 | 胶质瘤 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、qRT-PCR | NA | 文本 | 包括GSE35169(批量RNA-seq)和GSE131928(单细胞RNA-seq)数据集,以及2种胶质瘤细胞系和1种正常星形胶质细胞 | NA | 批量RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 947 | 2026-07-02 |
Transcriptional heterogeneity of tumor-associated high endothelial venules defines inflammatory and stress-metabolic states with distinct prognostic associations
2026-May-08, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05162-2
PMID:42104153
|
研究论文 | 整合11种癌症类型的单细胞RNA测序数据,构建肿瘤相关高内皮微静脉(TA-HEV)图谱,发现其分为炎症和应激代谢两种功能状态,且具有不同的预后关联 | 首次在泛癌水平揭示TA-HEV的转录异质性,并定义两种功能状态(炎症性和应激代谢性),提出其临床意义的差异性框架 | 基于公开数据集整合,可能存在批次效应;未进行功能验证实验;炎症性TA-HEV的预后关联依赖于癌症环境 | 解析肿瘤相关高内皮微静脉的转录异质性及其功能状态对临床预后的影响 | 11种癌症类型中的肿瘤相关高内皮微静脉(TA-HEV) | 单细胞转录组学 | 多种癌症(泛癌分析) | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11种癌症类型的公开单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 948 | 2026-07-02 |
Single-cell and machine learning-integrated bulk RNA-seq analysis reveals TKT as an oxidative stress-associated diagnostic biomarker in acute myocardial infarction
2026-May-07, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-026-00978-z
PMID:42098867
|
研究论文 | 通过单细胞和机器学习整合批量RNA-seq分析,揭示TKT作为急性心肌梗死氧化应激相关诊断生物标志物 | 首次在单细胞水平系统评估氧化应激相关基因在急性心肌梗死中的动态表达谱和功能意义,并整合多队列批量RNA-seq数据构建综合评估;采用六种机器学习算法共同筛选并验证TKT作为稳健诊断标志物 | 未详细说明样本量和独立验证队列的具体规模;TKT的功能机制仍需进一步实验验证 | 识别急性心肌梗死中氧化应激相关的诊断生物标志物 | 急性心肌梗死患者心肌组织和外周免疫细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,Western Blot | LASSO,随机森林,Boruta,贝叶斯建模,LVQ,Treebag | 基因表达数据 | 未明确说明,提及训练队列和独立验证队列 | Illumina(推测,基于批量RNA-seq常见平台) | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | 未明确说明 | 未明确说明 |
| 949 | 2026-07-02 |
TENT5A Maintains MYC mRNA Stability to Enhance Osteosarcoma Stemness
2026-May-04, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-4635
PMID:41616089
|
研究论文 | 本研究揭示了TENT5A通过维持MYC mRNA稳定性增强骨肉瘤干细胞特性的机制 | 首次发现TENT5A作为非经典RNA结合多聚腺苷酸聚合酶,通过延长MYC mRNA的poly(A)尾并稳定其转录本,从而增强MYC驱动的干细胞特性和化疗抵抗性 | 主要基于临床前模型,尚需在更大样本的临床试验中验证TENT5A抑制剂的疗效 | 阐明骨肉瘤中MYC持续激活的转录后调控机制 | 骨肉瘤细胞系、原位异种移植模型、患者来源类器官 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 多组学分析, 单细胞转录组测序, RNA-seq, 多聚腺苷酸测序 | 无 | 图像, 文本 | 多个骨肉瘤细胞系, 原位异种移植模型, 患者来源类器官 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'基因表达分析 |
| 950 | 2026-07-02 |
MICALL2 promotes angiogenesis of colorectal cancer by regulating the EGFR/PI3K/AKT/KLF5/VEGFA axis
2026-May, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2026.117757
PMID:41617093
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和WGCNA分析发现MICALL2在结直肠癌上皮细胞中高表达并通过EGFR/PI3K/AKT/KLF5/VEGFA轴促进血管生成 | 首次揭示MICALL2通过抑制EGFR溶酶体降解稳定EGFR并激活PI3K/AKT通路进而上调KLF5和VEGFA表达促进结直肠癌血管生成的新机制 | 未提及具体局限性内容 | 探索结直肠癌血管生成的新机制和潜在治疗靶点 | 结直肠癌细胞及人脐静脉内皮细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 结直肠癌样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 951 | 2026-07-02 |
Kitasamycin overcomes ferroptosis and immunotherapy resistance by targeting the HUWE1-NCOA4-FTH1 axis
2026-May, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2026.2623986
PMID:41612599
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研究论文 | 研究发现大环内酯类抗生素北里霉素通过靶向HUWE1-NCOA4-FTH1轴增强铁死亡和免疫治疗疗效 | 首次揭示抗生素北里霉素通过竞争性结合HUWE1抑制其E3泛素连接酶活性,稳定NCOA4并激活铁蛋白自噬通路,从而增强铁死亡和免疫治疗敏感性 | 临床样本中仅通过相关性分析验证了NCOA4低表达HUWE1高表达特征与免疫治疗预后的关联,缺乏前瞻性干预试验验证 | 探索抗生素在免疫治疗中调节铁死亡作用的机制,为需要抗生素治疗的癌症患者寻找增强免疫治疗效果的联合策略 | 北里霉素对铁死亡和免疫治疗抵抗的影响及其分子机制 | 癌症免疫治疗 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组测序、流式细胞术、多重免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据、多重免疫组化图像 | 多种黑色素瘤模型:B16F10皮下肿瘤模型、BRAF-PTEN驱动自发肿瘤模型、人源外周血单个核细胞人源化小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'基因表达分析 |
| 952 | 2026-07-02 |
Multidimensional Characterization of Tumor-Immune Architecture Reveals Clinically Relevant Classic Hodgkin Lymphoma Subtypes
2026-May-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-25-0859
PMID:41615883
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研究论文 | 采用多模态方法对经典霍奇金淋巴瘤进行多维表征,揭示了四种与临床相关的分子亚型 | 首次通过整合恶性细胞测序、空间转录组学和成像质谱流式技术对cHL进行系统性多维度分析,并基于肿瘤免疫架构识别出具有不同临床特征和空间组织的四种分子亚型 | 未提及具体局限性 | 通过多维分子和空间分析揭示经典霍奇金淋巴瘤的疾病异质性和临床相关亚型 | 经典霍奇金淋巴瘤(cHL)肿瘤样本 | 数字病理学 | 经典霍奇金淋巴瘤 | 测序,空间转录组学,成像质谱流式 | NA | 图像,基因表达数据,空间转录组数据 | 未提及具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 953 | 2026-07-02 |
Retinoic acid drives cell fate specification, maturation and retinal regionality in human retinal organoids
2026-Apr-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72130-3
PMID:42031716
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研究论文 | 视黄酸通过时空剂量调控驱动人视网膜类器官中的细胞命运特化、成熟及区域化特征 | 首次揭示视黄酸剂量依赖性地调控人视网膜类器官中黄斑样与外周样区域身份的建立,并结合单细胞与空间转录组学解析其机制 | 视黄酸浓度梯度在体内动态调控的复杂性尚未完全模拟,且类器官模型可能无法完全再现人视网膜的完整区域性特征 | 阐明视黄酸在人类视网膜发育中调控细胞命运、成熟及区域特化的分子机制 | 人视网膜类器官 | 数字病理学 | 遗传性视网膜疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质分析 | NA | 转录组数据、空间表达数据 | 人视网膜类器官样本,具体数目未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞转录组,10x Visium 用于空间转录组分析 |
| 954 | 2026-07-02 |
A macrophage MHC-I axis links intratumoral heterogeneity to terminal CD8+ T cell exhaustion in lung adenocarcinoma
2026-Apr-25, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01446-6
PMID:42031958
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研究论文 | 通过整合批量、单细胞和空间转录组学数据,研究肺腺癌中肿瘤内异质性如何加剧CD8 T细胞耗竭 | 首次揭示巨噬细胞MHC-I轴连接肿瘤内异质性与终末期CD8+T细胞耗竭,并开发六基因决策树分类器预测表型 | 未提及具体的实验验证或临床干预结果,分类器的临床实用性需进一步验证 | 探索肺腺癌中肿瘤内异质性与CD8 T细胞耗竭之间的分子机制 | 肺腺癌患者的肿瘤样本(包括批量、单细胞和空间转录组数据) | 数字病理学 | 肺癌 | 批量转录组学、单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 未明确具体样本数量,但涉及多个队列的批量、单细胞和空间数据 | NA | 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 955 | 2026-07-02 |
Deep learning for predicting pituitary neuroendocrine tumour lineage and high-risk subtypes from histology
2026-Apr-24, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01444-8
PMID:42031964
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研究论文 | 利用深度学习模型从常规H&E染色全切片图像预测垂体神经内分泌肿瘤的谱系、高风险亚型和复发 | 首次使用深度学习模型直接从常规H&E染色全切片图像中预测垂体神经内分泌肿瘤的谱系、高风险亚型和复发,并通过空间转录组学验证了与复发相关的免疫和分子特征 | 复发预测的AUC仅为0.641,表明模型在预测复发方面性能有限 | 开发深度学习模型以预测垂体神经内分泌肿瘤的谱系、高风险亚型和复发 | 垂体神经内分泌肿瘤患者 | 数字病理学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | NA | 深度学习 | 图像 | 训练集925例(中国科学技术大学),外部验证集:太和医院226例、华山医院193例 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 956 | 2026-07-02 |
DAPK2 Regulates PKM2 Phosphorylation at Threonine 45 to Facilitate Disturbed Flow-Induced Atherosclerosis
2026-Apr-14, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 该研究发现DAPK2通过磷酸化PKM2的苏氨酸45位点,促进扰动血流诱导的动脉粥样硬化形成 | 首次揭示DAPK2通过磷酸化PKM2的T45位点调控内皮细胞炎症反应,并鉴定该通路为动脉粥样硬化的新机制和治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床验证尚需进一步开展 | 阐明DAPK2在振荡剪切应力诱导的内皮细胞活化和动脉粥样硬化中的作用 | 人及小鼠动脉内皮细胞、Apoe-/-小鼠模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 质谱, 免疫共沉淀, 邻近连接法 | NA | 基因表达数据, 测序数据 | 包括公开数据库数据及小鼠模型样本(具体数量未明确) | Illumina | 单细胞RNA-seq, RNA-seq | Illumina NovaSeq | 公开数据库包括基因芯片、RNA测序及单细胞RNA测序数据 |
| 957 | 2026-07-02 |
Tumor-derived ITIH2 activates PI3K\AKT pathway via THBS1 ubiquitination and promotes tumor angiogenesis in hepatocellular carcinoma
2026-Apr, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2026.168175
PMID:41616982
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研究论文 | 研究发现肿瘤来源的ITIH2通过泛素化调控THBS1激活PI3K/AKT通路,促进肝细胞癌血管生成 | 首次发现ITIH2作为肝细胞癌预后生物标志物,通过泛素化介导的THBS1稳定性调控激活PI3K/AKT通路,促进血管生成,且不直接影响肿瘤细胞增殖或凋亡 | 未具体说明局限性,但可能包括样本量有限和机制细节需进一步验证 | 阐明肝细胞癌中血管生成与肿瘤进展之间的分子机制 | 肝细胞癌肿瘤微环境中的血管内皮细胞 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归、多变量Cox回归 | 单细胞转录组数据 | 2例肝细胞癌患者单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 958 | 2026-07-02 |
Repeated proliferative events ameliorate age-associated accumulation of DNA damage in HSPCs
2026-Apr, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202503337
PMID:41611449
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研究论文 | 研究重复性增殖事件对造血干细胞和祖细胞年龄相关DNA损伤积累的改善作用 | 通过多次放血实验诱导小鼠HSPC持续增殖,发现重复增殖事件可清除年龄相关的DNA双链断裂积累,而不影响造血功能 | 未提供具体局限性信息 | 探究增殖速率增加对造血干细胞和祖细胞造血衰老的影响 | 小鼠和人的造血干细胞和祖细胞(HSPCs) | 机器学 | 老年疾病 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠和人类样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 959 | 2026-07-02 |
Maternal obesity induces activator protein 1-mediated inflammatory response to impair embryonic neurogenesis
2026-04, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP289326
PMID:41823327
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研究论文 | 该论文通过单细胞RNA测序和ATAC测序揭示母体肥胖通过激活蛋白1介导的炎症反应损害胚胎神经发生的机制 | 首次利用单细胞多组学技术(scRNA-seq和scATAC-seq)揭示母体肥胖通过激活蛋白1(AP-1)转录因子增强炎症基因(如Tnf和Cd68)的染色质可及性,从而抑制神经发生的关键转录因子(如Neurod1、Neurog2和Ascl1)表达 | NA | 探究母体肥胖对胚胎神经发育影响的分子机制 | 母体肥胖小鼠及其E11.5和E13.5胚胎 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组、单细胞染色质可及性 | 母体肥胖小鼠(高脂饮食喂养2个月)及其E11.5和E13.5胚胎 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 960 | 2026-07-02 |
Transcriptional regulation of the main olfactory epithelium by environmental olfactory exposures
2026-Mar-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.24.713727
PMID:41929152
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究环境嗅觉暴露对小鼠主嗅觉上皮细胞类型特异性转录调控的影响 | 首次在稳态条件下识别环境嗅觉暴露对主嗅觉上皮细胞类型特异性转录的影响 | 未深入探讨多细胞相互作用和通讯在嗅觉上皮调节中的具体机制 | 研究环境嗅觉暴露如何影响小鼠主嗅觉上皮中不同细胞类型的转录反应 | 小鼠主嗅觉上皮,包括嗅觉感觉神经元、支持细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 嗅觉功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠主嗅觉上皮样本(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |