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当前共找到 37326 篇文献，本页显示第 941 - 960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 941 | 2026-03-03 |
All the single cells: Single-cell transcriptomics/epigenomics experimental design and analysis considerations for glial biologists
2025-Mar, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24633
PMID:39558887
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综述 | 本文为胶质细胞生物学家提供单细胞RNA-seq实验设计与分析的入门指南 | 针对胶质细胞研究领域，系统梳理单细胞组学实验设计与分析的关键决策点 | 作为入门指南，未涉及具体算法或工具的深入技术细节 | 提升胶质生物学家对单细胞组学数据的分析、解释与批判能力 | 胶质细胞及其在神经疾病中的亚型与功能 | 单细胞组学 | 神经疾病 | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 942 | 2026-03-03 |
Analysis of human neutrophils from nasal polyps by single-cell RNA sequencing reveals roles of neutrophils in chronic rhinosinusitis
2025-Mar, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.10.032
PMID:39522652
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析鼻息肉组织中的中性粒细胞，揭示了其在慢性鼻窦炎伴鼻息肉发病机制中的潜在作用及异质性 | 首次利用基于微孔的单细胞RNA测序技术，对鼻息肉组织中的中性粒细胞进行高分辨率分析，揭示了其基因表达谱的改变和亚群异质性 | 样本量较小（5例对照、5例鼻息肉组织），且仅分析了粒细胞富集样本，可能未完全捕获所有细胞类型 | 揭示中性粒细胞在慢性鼻窦炎伴鼻息肉发病机制中的作用和异质性 | 鼻息肉组织、对照鼻窦组织及患者匹配的外周血样本中的中性粒细胞 | 单细胞组学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序 | Benjamini-Hochberg算法、通路富集分析、基因本体富集分析 | 单细胞转录组数据 | 5例对照鼻窦组织、5例鼻息肉组织及匹配外周血样本 | 未明确 | 单细胞RNA-seq | 微孔基单细胞RNA测序检测方法 | 新型基于微孔的单细胞RNA测序检测方法，使用粒细胞富集样本 |
| 943 | 2026-03-03 |
Microglial Responses to Alzheimer's Disease Pathology: Insights From "Omics" Studies
2025-Mar, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24666
PMID:39760224
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综述 | 本文综述了利用多种组学技术研究阿尔茨海默病小鼠模型中小胶质细胞反应的文献，旨在阐明小胶质细胞在AD病理中的作用机制 | 整合了多种组学技术（如单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质组学等）来系统分析AD小鼠模型中小胶质细胞的异质性和分子模式变化 | 主要基于小鼠模型研究，可能无法完全反映人类AD的复杂性；且为综述性文章，未提供原始实验数据 | 阐明小胶质细胞在阿尔茨海默病病理中的驱动和贡献机制 | 阿尔茨海默病小鼠模型中的小胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 转录组学、表观基因组学、空间转录组学、蛋白质组学、脂质组学、代谢组学 | NA | 组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 944 | 2026-03-03 |
Techniques and analytic workflow for spatial transcriptomics and its application to allergy and inflammation
2025-Mar, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.01.009
PMID:39837466
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术及其在过敏和炎症研究中的应用，重点关注数据处理和分析方法 | 通过整合单细胞基因表达数据与细胞定位，在完整空间背景下提供前所未有的生物学见解，为数据解释增加新维度 | NA | 总结空间转录组学领域的最新进展及其在过敏和炎症研究中的应用 | 过敏和炎症疾病，如特应性皮炎和慢性阻塞性肺疾病 | 数字病理学 | 过敏和炎症疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 945 | 2026-03-03 |
Deciphering key roles of B cells in prognostication and tailored therapeutic strategies for lung adenocarcinoma: a multi-omics and machine learning approach towards predictive, preventive, and personalized treatment strategies
2025-Mar, The EPMA journal
DOI:10.1007/s13167-024-00390-4
PMID:39991096
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研究论文 | 本研究通过多组学和机器学习方法，揭示了B细胞在肺腺癌预后中的关键作用，并开发了SRBS评分以支持预测性、预防性和个性化治疗策略 | 整合了多组学数据（包括bulk RNA、ATAC-seq、单细胞RNA和空间转录组测序）和机器学习算法，首次构建了与B细胞相关的SRBS评分，用于肺腺癌的预后预测和个性化治疗指导 | 未明确说明样本量大小，且实验验证部分可能有限，需要进一步临床验证 | 探索B细胞在肺腺癌预后中的作用，并开发个性化治疗策略以改善患者结局 | 肺腺癌患者及其相关的多组学数据 | 机器学习 | 肺癌 | 多组学整合分析，包括bulk RNA-seq、ATAC-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组测序 | 多种机器学习算法整合 | 多组学数据（RNA、ATAC、单细胞、空间转录组） | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq, bulk ATAC-seq | NA | NA |
| 946 | 2026-03-03 |
Spatial Transcriptomics in Inflammatory Skin Diseases Using GeoMx Digital Spatial Profiling: A Practical Guide for Applications in Dermatology
2025-Jan, JID innovations : skin science from molecules to population health
DOI:10.1016/j.xjidi.2024.100317
PMID:39559817
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研究论文 | 本文提供了使用NanoString GeoMx数字空间分析仪在炎症性皮肤病中进行空间转录组学研究的实用指南 | 提供了制造商指南中未包含的RNA捕获优化方法和潜在问题解决方案，并通过具体疾病案例展示了空间分析策略 | 主要关注GeoMx平台在皮肤病学的应用，可能不直接适用于其他空间转录组技术或其他组织类型 | 为皮肤病研究者提供数字空间分析技术的实用操作指南和优化策略 | 炎症性皮肤病（银屑病、扁平苔藓、盘状红斑狼疮）的组织样本 | 数字病理学 | 皮肤病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx数字空间分析仪 |
| 947 | 2026-03-03 |
Network pharmacology, bioinformatics and in vitro/in vivo validation elucidate the anti-lung cancer activities and potential targets of Rhoifolin
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1727729
PMID:41614077
|
研究论文 | 本研究通过整合网络药理学、生物信息学及体外/体内实验，系统探讨了Rhoifolin的抗肺癌活性及其潜在分子靶点EPHB2 | 首次将网络药理学、转录组学与机器学习相结合，识别出EPHB2作为Rhoifolin的关键治疗靶点，并通过分子对接、动力学模拟及体内外实验验证了其直接作用机制 | 研究主要基于H358细胞系和小鼠异种移植模型，临床前数据需在更多肺癌模型和临床试验中进一步验证 | 系统研究Rhoifolin的抗肿瘤效应并识别其关键分子靶点，为肺癌治疗提供新策略 | 肺癌细胞系（如H358）及H358异种移植小鼠模型 | 生物信息学 | 肺癌 | 网络药理学、转录组分析、机器学习、RT-qPCR、Western blot、免疫荧光、分子对接、动力学模拟 | 机器学习 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、临床数据 | 体外细胞实验及H358异种移植小鼠模型，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 948 | 2026-03-03 |
Single-cell and spatial transcriptomics identify COL6A3 as a prognostic biomarker in undifferentiated pleomorphic sarcoma
2024-Nov-15, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02168-8
PMID:39548577
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研究论文 | 本研究利用单细胞和空间转录组学技术，鉴定COL6A3作为未分化多形性肉瘤的预后生物标志物 | 首次结合单细胞和空间转录组学分析未分化多形性肉瘤及其亚型，发现COL6A3和BGN基因能预测生存和转移，且COL6A3优于现有肉瘤预后基因组合 | 样本量较小（单细胞分析仅5个活检样本和1个切除样本），需在更大队列中验证 | 更好表征未分化多形性肉瘤及其亚型（如非典型纤维黄色瘤和多形性真皮肉瘤），并识别预后生物标志物 | 未分化多形性肉瘤、非典型纤维黄色瘤和多形性真皮肉瘤的肿瘤样本 | 数字病理学 | 软组织肉瘤 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 5个活检样本（AFX和PDS）和1个切除样本（PDS），另加独立队列46个和38个UPS肿瘤 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 949 | 2026-03-03 |
Recovering single-cell expression profiles from spatial transcriptomics with scResolve
2024-Oct-21, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100864
PMID:39326411
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研究论文 | 本文开发了一种名为scResolve的方法，用于从多细胞分辨率空间转录组学数据中恢复单细胞表达谱 | scResolve能够准确恢复单个细胞在其位置上的表达谱，这是细胞类型去卷积方法无法实现的，并支持细胞类型特异性差异基因表达分析和稀有细胞群体的准确识别 | NA | 开发一种从空间转录组学测量中恢复单细胞表达谱的方法，以克服现有技术缺乏单细胞分辨率的问题 | 人类乳腺癌数据和人类肺部疾病数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学测量数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 950 | 2026-03-03 |
A single-cell RNA-seq dataset describing macrophages in NSCLC tumor and peritumor tissues
2024-10-01, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03885-x
PMID:39353975
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序生成了非小细胞肺癌肿瘤及瘤周组织中巨噬细胞的转录组数据集，以探究其在肿瘤微环境中的特征差异和相关性 | 首次基于单细胞RNA测序技术，全面描述了NSCLC肿瘤与瘤周组织中巨噬细胞的转录组特征，填补了该领域在组织特异性差异方面的知识空白 | 研究仅提供了数据集，未进行深入的机制或功能验证分析，且样本来源和数量未在摘要中明确说明 | 探究非小细胞肺癌肿瘤微环境中肿瘤相关巨噬细胞的特性，以理解NSCLC的进展并识别临床治疗靶点 | 非小细胞肺癌肿瘤及瘤周组织中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 951 | 2026-03-03 |
A single-cell transcriptomic dataset of pluripotent stem cell-derived astrocytes via NFIB/SOX9 overexpression
2024-09-10, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03823-x
PMID:39256463
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序，构建了NFIB/SOX9过表达诱导人多能干细胞分化为星形胶质细胞的全面转录组图谱 | 首次利用单细胞RNA测序技术，系统描绘了NFIB/SOX9过表达诱导星形胶质细胞分化的详细路径和分子特征 | 诱导星形胶质细胞的精确分化路径和分子特征仍未完全阐明 | 解析NFIB/SOX9诱导星形胶质细胞分化的分子机制，为神经系统疾病研究提供模型 | 人多能干细胞（iPSCs）及其NFIB/SOX9过表达诱导分化的星形胶质细胞 | 单细胞转录组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 64,736个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 952 | 2026-03-03 |
Identification of four mitochondria-related genes in sepsis based on RNA sequencing technology
2024-05-16, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-024-00623-1
PMID:38755528
|
研究论文 | 本研究通过RNA测序技术识别并分析了与脓毒症相关的线粒体基因，以阐明脓毒症免疫的潜在机制 | 结合RNA测序、生物信息学分析和单细胞测序，识别出四个与脓毒症预后显著负相关的线粒体基因（FIS1、FKBP8、GLRX5、GUK1），并验证了其诊断价值 | 样本量较小（脓毒症组20例，SIRS组12例），且为单中心研究，可能限制结果的普遍性 | 识别与脓毒症患者相关的线粒体基因，以阐明脓毒症免疫的潜在机制并提供临床治疗新思路 | 脓毒症和全身炎症反应综合征（SIRS）患者的住院病例 | 生物信息学 | 脓毒症 | RNA测序（RNA-seq）、单细胞RNA测序 | NA | RNA（mRNA）序列数据 | 脓毒症组20例，SIRS组12例，总计32例 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x单细胞测序用于明确核心基因的定位 |
| 953 | 2026-03-03 |
Wnt pathway inhibition with the porcupine inhibitor LGK974 decreases trabecular bone but not fibrosis in a murine model with fibrotic bone
2024-May, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/jbmrpl/ziae011
PMID:38577521
|
研究论文 | 本研究通过使用porcupine抑制剂LGK974抑制Wnt通路，探究其在G-GPCR信号过度激活的小鼠模型中，对骨纤维化和骨小梁形成的影响 | 首次在G-GPCR信号过度激活的骨纤维化小鼠模型中，应用单细胞RNA测序技术分析Wnt配体表达变化，并评估LGK974对骨小梁和纤维化的特异性作用 | LGK974仅部分减少骨小梁，对骨纤维化无显著改善，且在对照小鼠中引起明显骨丢失，提示其治疗潜力有限且存在副作用 | 探索Wnt通路抑制作为骨纤维化疾病（如纤维性发育不良）潜在治疗策略的效果 | 9周龄雄性ColI(2.3)/Rs1小鼠及其同窝对照小鼠的长骨基质细胞 | 数字病理学 | 骨纤维化疾病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型（ColI(2.3)/Rs1转基因小鼠） | RNA测序数据 | ColI(2.3)/Rs1小鼠及同窝对照小鼠的长骨基质细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 954 | 2026-03-03 |
Modulator of TMB-associated immune infiltration (MOTIF) predicts immunotherapy response and guides combination therapy
2024-03-30, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2024.01.025
PMID:38320897
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研究论文 | 开发了一种名为MOTIF的新工具，用于预测肿瘤突变负荷相关的免疫浸润，并指导免疫检查点抑制剂的治疗反应和联合疗法 | 首次提出MOTIF工具，通过整合多癌种的大规模RNA-seq数据，识别能决定CD8 T细胞浸润程度的基因，并揭示其在癌症-免疫循环中的完整性缺陷 | 研究主要基于回顾性数据，需要前瞻性临床试验进一步验证MOTIF的预测准确性 | 预测免疫检查点抑制剂的治疗反应并指导联合疗法 | 肿瘤样本和免疫细胞浸润 | 生物信息学 | 多种实体瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 9311个肿瘤样本（来自30种癌症类型）和84个人类单细胞RNA-seq数据集（来自32种实体瘤） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 955 | 2026-03-03 |
A Comprehensive Survey of Statistical Approaches for Differential Expression Analysis in Single-Cell RNA Sequencing Studies
2021-12-02, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12121947
PMID:34946896
|
综述 | 本文全面综述了单细胞RNA测序研究中差异表达分析的统计方法，并对19种广泛使用的方法在11个真实数据集上进行了性能评估 | 首次系统分类和评估了从批量RNA-seq借鉴的方法及专为scRNA-seq设计的方法，通过多标准分析推荐了最佳工具 | 评估基于特定数据集和性能指标，可能无法完全覆盖所有实验条件或新兴方法 | 为单细胞RNA测序数据中的差异表达分析提供方法选择指南和性能评估 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达分析方法 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 11个真实scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 956 | 2026-03-03 |
Single-cell connectomic analysis of adult mammalian lungs
2019-12, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aaw3851
PMID:31840053
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了小鼠、大鼠、猪和人类肺组织，以揭示成年哺乳动物肺中保守的细胞间相互作用模式，并构建了肺泡细胞群间信号传导的系统级图谱 | 首次在跨物种（小鼠、大鼠、猪、人类）水平上，利用单细胞RNA测序系统描绘了成年哺乳动物肺中保守的细胞间通讯网络，并发现肺泡I型细胞在组织稳态调控中起主要作用 | 研究主要关注成年健康肺组织的稳态机制，对疾病状态下的细胞互作变化及具体分子通路的实验验证尚待深入 | 揭示哺乳动物肺组织稳态的细胞间相互作用机制，为慢性肺病研究和肺组织再生医学提供基础 | 成年哺乳动物（小鼠、大鼠、猪、人类）的肺组织 | 单细胞组学 | 慢性肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 跨四个物种（小鼠、大鼠、猪、人类）的肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 957 | 2026-03-02 |
Decoding schizophrenia through postmortem human brain transcriptomics
2026-Apr, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2026.102434
PMID:41637815
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综述 | 本文通过综述尸检人脑组织的转录组学研究，揭示了精神分裂症的分子结构特征 | 整合了批量组织和单核转录组学的研究发现，揭示了精神分裂症中基因表达变化的细胞类型特异性和个体异质性，并指出前额叶皮层兴奋性神经元，特别是上层兴奋性神经元的易损性 | 尸检组织分析存在固有的方法学挑战，如组织质量、死后延迟等因素可能影响结果 | 解码精神分裂症的病理生理学分子机制 | 尸检人脑组织 | 数字病理学 | 精神分裂症 | 转录组学分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单核RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 958 | 2026-03-02 |
Single-cell and spatial transcriptome profiling identifies cellular heterogeneity and immunosuppressive tumor microenvironment in inflammatory breast cancer
2026-Mar, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.05.061
PMID:40460936
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组分析揭示了炎性乳腺癌的细胞异质性和免疫抑制性肿瘤微环境，并识别了潜在的治疗靶点 | 首次在单细胞和空间水平上全面分析炎性乳腺癌的免疫细胞组成和信号通路，发现CXCL13表达降低与免疫抑制相关，并筛选出天然产物作为免疫调节剂 | 研究样本量有限，且主要基于转录组数据，功能验证和临床转化需要进一步研究 | 分析炎性乳腺癌的病理和分子基础，以开发精准医疗策略 | 炎性乳腺癌和非炎性乳腺癌样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，qRT-PCR，荧光染色，空间分析，肿瘤-免疫细胞共培养，体内研究 | NA | 单细胞RNA测序数据，空间转录组数据，基因表达数据 | 未明确指定样本数量，但涉及炎性乳腺癌和非炎性乳腺癌样本 | NanoString | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler | NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler用于空间分析 |
| 959 | 2026-03-02 |
Cytoskeletal-related genes function as checkpoints for the maintenance of VSMC contractile phenotype and prevent pathological remodeling in arterial diseases
2026-Mar, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.05.065
PMID:40516911
|
研究论文 | 本研究构建了动脉疾病中血管平滑肌细胞表型转换的跨物种整合模型，识别了细胞骨架相关基因作为维持收缩表型的关键检查点，并验证其在病理重塑中的作用 | 通过单细胞RNA-seq数据分析，首次识别Fblim1、Tns1和Synpo2等细胞骨架相关基因作为VSMC表型转换的检查点，揭示了它们在防止病理重塑中的关键作用 | 研究主要基于公共数据集和动物模型，人类样本验证有限，且机制细节需进一步探索 | 构建VSMC表型转换的整合模型，识别调控基因并验证其在动脉疾病病理重塑中的功能 | 血管平滑肌细胞（VSMC）、动脉疾病（包括动脉粥样硬化和主动脉瘤） | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 公共单细胞RNA-seq数据集、实验动物动脉瘤样本、PDGF-BB处理的VSMCs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 960 | 2026-03-02 |
ANKRD1 sustains a neurogenic BMSC niche and counters cognitive aging
2026-Mar-01, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-026-00428-5
PMID:41764190
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了颅颌面骨髓间充质基质细胞中ANKRD1作为维持神经源性生态位的关键调节因子，并证明其靶向递送可改善老年小鼠的空间记忆缺陷 | 首次发现ANKRD1通过直接结合神经标志基因的超增强子并维持开放染色质结构来维持神经源性潜能，并证明其可作为治疗靶点改善认知老化 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类样本中得到验证；ANKRD1在衰老过程中的表达下降机制仍需进一步探究 | 探究维持骨髓间充质基质细胞神经源性潜能的分子机制及其在认知老化中的作用 | 颅颌面骨髓间充质基质细胞（BMSCs）、老年小鼠 | 单细胞转录组学 | 认知老化 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |