单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
941	2025-05-23	Novel marker genes and small molecule drugs for radiotherapy resistance in cervical cancer identified based on single-cell multi-omics analysis 2025-May-19, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02532-0 PMID:40389794	研究论文	通过单细胞多组学分析和机器学习方法，识别宫颈癌放疗抗性的新标记基因和小分子药物	结合多组学数据和机器学习构建稳健的预后模型，识别与放疗抗性相关的分子标记和潜在治疗药物	研究依赖于公共数据库数据，未进行实验验证	探究宫颈癌放疗抗性的分子和细胞机制	宫颈癌患者	数字病理学	宫颈癌	单细胞测序、转录组测序、甲基化分析	Cox回归	测序数据	43,475个细胞和13种细胞类型
942	2025-05-23	Integrating single-cell and bulk RNA profiles to uncover glutamine metabolism's role in prognosis and immune dynamics in multiple myeloma 2025-May-19, BMC cancer IF:3.4Q2 DOI:10.1186/s12885-025-14239-0 PMID:40389878	研究论文	本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，揭示了谷氨酰胺代谢相关基因在多发性骨髓瘤预后和免疫动态中的作用	首次系统性地鉴定了谷氨酰胺代谢相关基因在多发性骨髓瘤中的预后和免疫调控作用，并验证了其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力	研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证	探索谷氨酰胺代谢相关基因在多发性骨髓瘤中的预后价值和治疗意义	多发性骨髓瘤患者样本和谷氨酰胺代谢相关基因	生物信息学	多发性骨髓瘤	单细胞测序，批量转录组测序，加权共表达网络分析，Cox比例风险模型	NA	RNA测序数据	多个公共多组学队列数据集
943	2025-05-23	The gene regulatory mechanisms shaping the heterogeneity of venom production in the Cape coral snake 2025-May-19, Genome biology IF:10.1Q1 DOI:10.1186/s13059-025-03602-w PMID:40390047	research paper	该研究通过生成高质量的开普珊瑚蛇基因组草图，并结合毒腺单细胞RNA-seq数据和空间毒腺毒素分布分析，揭示了毒素调控的变异性和毒腺中异质性毒素产生的分子机制	揭示了不同毒素家族由不同的细胞群体产生，且毒素表达通过调控模块进一步精细调节，以及调控元件的进化与其相关毒素基因的进化密切相关	研究未明确探讨这些非适应性特征状态如何具体促进进化创新和新颖性	研究蛇毒腺中异质性毒素产生的分子机制及其进化意义	开普珊瑚蛇（Aspidelaps lubricus）及其毒腺	分子生物学	NA	单细胞RNA-seq, 空间毒腺毒素分布分析	NA	基因组数据, RNA-seq数据, 空间分布数据	NA
944	2025-05-23	FK506 prolongs corneal allograft survival and prevents dendritic cell infiltration in an MDSC-dependent manner 2025-May-19, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons IF:8.9Q1 DOI:10.1016/j.ajt.2025.05.018 PMID:40398562	研究论文	本文研究了FK506通过诱导MDSC介导的早期DC激活抑制来延长角膜同种异体移植物存活的细胞机制	揭示了FK506通过MDSC依赖性和时间性方式减少免疫细胞浸润的新机制	研究仅在小鼠模型中进行，未涉及人类临床试验	探究FK506抑制免疫激活和延长同种异体移植物存活的细胞机制	小鼠角膜穿透性角膜移植模型	免疫学	角膜移植排斥	单细胞RNA测序分析、免疫荧光染色	小鼠模型	基因表达数据、图像数据	未明确说明具体样本数量，使用小鼠模型
945	2025-05-23	Crosstalk between kidney and bones: New perspective for modulating osteoporosis 2025-May-17, Ageing research reviews IF:12.5Q1 DOI:10.1016/j.arr.2025.102776 PMID:40389172	review	本文综述了肾脏与骨骼之间的相互作用及其在骨质疏松症中的调控作用	提出了肾脏与骨骼之间相互作用的新视角，并强调了创新方法在研究器官间相互作用中的重要性	NA	探讨肾脏与骨骼之间的相互作用及其在骨质疏松症中的调控机制	肾脏与骨骼的相互作用及其相关疾病（如慢性肾病伴骨密度异常、肾性骨营养不良和骨质疏松症）	NA	骨质疏松症	细胞共培养、器官芯片、单细胞测序、空间转录组学	NA	NA	NA
946	2025-05-23	Astrocytic AEG-1 drives neuroinflammation and enhances seizure susceptibility 2025-May-16, Neurobiology of disease IF:5.1Q1 DOI:10.1016/j.nbd.2025.106957 PMID:40383165	研究论文	本研究探讨了星形胶质细胞中AEG-1基因在神经炎症和癫痫易感性中的作用	首次揭示了AEG-1通过NF-κB信号通路介导神经炎症和癫痫易感性的机制	研究主要基于小鼠模型和体外培养的星形胶质细胞，人类临床相关性尚需进一步验证	探究AEG-1在神经炎症和癫痫易感性中的分子机制	小鼠模型和体外培养的星形胶质细胞	神经科学	癫痫	单细胞RNA测序	小鼠炎症模型	基因表达数据	NA
947	2025-05-23	The battle within: Discovering new insights into phytopathogen interactions and effector dynamics 2025-May-15, Microbiological research IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.micres.2025.128220 PMID:40398012	综述	本文全面回顾了植物病原体相互作用中的效应子动态及其在宿主免疫防御和病原体毒力策略中的作用	强调了元种群动态和快速适应在效应子与植物抗性蛋白互作中的作用，以及环境变化对宿主-病原体互作的影响	NA	探讨植物病原体相互作用机制及效应子动态，为疾病管理策略提供理论基础	植物病原体效应子与宿主免疫系统的相互作用	植物病理学	植物病害	生物信息学、单细胞转录组学	NA	NA	NA
948	2025-05-23	NanoCRISPR-assisted biomimetic tissue-equivalent patch regenerates the intervertebral disc by inhibiting endothelial-to-mesenchymal transition 2025-May-14, Biomaterials IF:12.8Q1 DOI:10.1016/j.biomaterials.2025.123404 PMID:40398216	研究论文	该研究提出了一种纳米CRISPR辅助的生物仿生组织等效补片，通过抑制内皮-间质转化来再生椎间盘	使用纳米CRISPR系统靶向消除VEGF介导的血管生成因子，并结合仿生纳米纤维支架促进椎间盘修复	NA	解决椎间盘纤维环损伤后的生物修复和血管生成问题	椎间盘纤维环(AF)和血管内皮生长因子(VEGF)	生物医学工程	椎间盘退行性疾病	单细胞RNA测序、纳米CRISPR系统	NA	NA	NA
949	2025-05-23	Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) and its insights into cellular heterogeneity in atherosclerosis 2025-May-07, Vascular pharmacology IF:3.5Q2 DOI:10.1016/j.vph.2025.107499 PMID:40345606	综述	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在动脉粥样硬化（AS）中揭示细胞异质性的应用及其对疾病机制的深入理解	通过scRNA-seq技术重新定义了动脉粥样硬化斑块病理学，识别了多种细胞类型及其在斑块稳定性和炎症中的特定作用	综述性文章，未涉及具体实验数据或新发现	探讨scRNA-seq在心血管疾病（CVD）特别是动脉粥样硬化（AS）研究中的应用及其对疾病机制的贡献	小鼠和人类组织中的非病变和动脉粥样硬化主动脉的细胞群体	生物医学研究	心血管疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	NA
950	2025-05-23	A STT3A-dependent PD-L1 glycosylation modification mediated by GMPS drives tumor immune evasion in hepatocellular carcinoma 2025-May, Cell death and differentiation IF:13.7Q1 DOI:10.1038/s41418-024-01432-0 PMID:39690246	研究论文	本文探讨了GMPS通过调控PD-L1的糖基化修饰促进肝细胞癌免疫逃逸的机制	首次揭示了GMPS通过STT3A依赖的PD-L1糖基化修饰驱动肿瘤免疫逃逸的新机制，并验证了GMPS抑制剂angustmycin A的治疗潜力	研究主要基于体外实验和动物模型，临床转化效果仍需进一步验证	探究肝细胞癌免疫逃逸的分子机制并寻找潜在治疗靶点	肝细胞癌组织和CD8+T细胞	肿瘤免疫学	肝细胞癌	蛋白质组学分析、scRNA-Seq	NA	蛋白质组数据、单细胞转录组数据	晚期肝细胞癌组织样本（具体数量未说明）
951	2025-05-23	Optimized inner ear organoids for efficient hair cell generation and ototoxicity response modeling 2025-May, Science China. Life sciences DOI:10.1007/s11427-024-2803-1 PMID:39862345	研究论文	本文介绍了一种新型的一步自组织内耳类器官系统，用于高效生成毛细胞并模拟耳毒性反应	开发了一种优化的小分子一步自组织内耳类器官系统，绕过多步扩增和强制分化协议的需求	未提及样本量大小或实验重复次数	开发高效的内耳毛细胞生成模型用于药物发现和毛细胞保护机制研究	哺乳动物耳蜗毛细胞	生物医学工程	听力损失	单细胞RNA测序	内耳类器官系统	基因表达数据	NA
952	2025-05-23	Spatial transcriptomics of Glomerulo-centric antibody mediated rejection in renal transplants 2025-May, Clinical immunology (Orlando, Fla.) DOI:10.1016/j.clim.2025.110460 PMID:39993695	研究论文	使用数字空间分析技术对肾移植中抗体介导的排斥反应进行空间转录组学研究	通过数字空间分析技术定位了急性抗体介导排斥反应期间肾小球中的分子特征，揭示了天然免疫细胞和HLA II类抗原的转录上调以及足细胞特征基因的下调	研究仅基于单一患者的4次活检样本，样本量较小	研究肾移植中抗体介导排斥反应的分子机制	肾移植患者的活检样本	数字病理学	肾脏疾病	Digital Spatial Profiling	NA	空间转录组数据	4份来自同一患者的活检样本
953	2025-05-23	Clinical efficacy and chemoresistance analysis of precision neoadjuvant chemotherapy for borderline resectable pancreatic cancer: a prospective, single-arm pilot study 2025-May-01, International journal of surgery (London, England) DOI:10.1097/JS9.0000000000002342 PMID:40146255	研究论文	本研究评估了基于患者来源类器官（PDOs）的新辅助化疗（NAC）在临界可切除胰腺癌（BRPC）中的临床疗效和安全性	利用PDOs进行药物敏感性测试以调整治疗方案，并探索了吉西他滨耐药的潜在机制	单臂试点研究，样本量较小（19例患者）	评估基于PDOs的NAC在BRPC患者中的临床疗效和安全性，并探索吉西他滨耐药的分子机制	临界可切除胰腺癌（BRPC）患者	数字病理学	胰腺癌	scRNA-seq分析	NA	临床数据和转录组数据	19例符合条件的BRPC患者
954	2025-05-23	Quasi-spatial single-cell transcriptome based on physical tissue properties defines early aging associated niche in liver 2025-May, Nature aging IF:17.0Q1 DOI:10.1038/s43587-025-00857-7 PMID:40325195	research paper	该研究开发了一种名为FiNi-seq的方法，通过利用组织的物理特性富集与衰老相关的纤维化微环境，并进行单细胞RNA测序和单核ATAC测序分析，以探索衰老初期微环境	开发了FiNi-seq方法，利用组织对酶消化的抵抗性选择性富集纤维化微环境，实现了准空间分析，并发现了具有衰老表型的Wif1和Smoc1产生的间充质细胞群	由于衰老细胞稀少和当前组学工具的技术偏差，衰老细胞群在一般分析流程中常被忽略	探索衰老初期微环境中的细胞特性和多样性及其对组织微环境的影响	年轻和年老雄性小鼠的肝脏	digital pathology	geriatric disease	single-cell RNA sequencing, single-nuclei ATAC sequencing (ATAC-seq), fibrotic niche enrichment sequencing (FiNi-seq)	NA	RNA-seq, ATAC-seq	年轻和年老雄性小鼠的肝脏样本
955	2025-05-23	Inactivation of GSK3β by Ser389 phosphorylation prevents thymocyte necroptosis and impacts Tcr repertoire diversity 2025-May, Cell death and differentiation IF:13.7Q1 DOI:10.1038/s41418-024-01441-z PMID:39779909	研究论文	本研究通过高分辨率单细胞RNA测序分析，揭示了DN3和DN4胸腺细胞在Tcrb和Tcra基因重组过程中的G2M细胞周期检查点，并发现GSK3β通过Ser389磷酸化失活对胸腺细胞存活及TCRα/β库多样性的影响	发现了GSK3β通过Ser389磷酸化失活对胸腺细胞在V(D)J重组过程中存活的关键作用，以及这一过程对TCRα/β库多样性的影响	研究仅基于小鼠模型，尚未在人类细胞中验证	探究胸腺细胞在Tcrb和Tcra基因重组过程中的细胞周期检查点和存活机制	小鼠DN3和DN4胸腺细胞	分子生物学	NA	scRNA-seq	NA	RNA测序数据	个体分选的小鼠DN3和DN4胸腺细胞
956	2025-05-23	Comprehensive Multi-Omics Analysis of Copper Metabolism Related Molecular Subtypes and Prognostic Risk Stratification in Colon Adenocarcinoma 2025-May, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2 DOI:10.1111/jcmm.70591 PMID:40391581	研究论文	通过多组学分析铜代谢相关分子亚型，构建结肠腺癌预后风险分层模型	首次结合铜代谢相关基因（CMRG）构建结肠腺癌预后风险模型，并通过单细胞测序揭示CMRG在肿瘤微环境中的空间和细胞分布	研究主要基于TCGA和GEO数据库，需要进一步临床样本验证	探究铜代谢在结肠腺癌进展中的作用并寻找潜在治疗靶点	结肠腺癌（COAD）	生物信息学	结肠癌	多组学分析、单细胞测序、western blot、PCR、siRNA、集落形成实验、Transwell实验	CMRG-based风险模型	基因组数据、转录组数据	TCGA和GEO数据库样本
957	2025-05-23	Lipoxin A4/FPR2 Signaling Mitigates Ferroptosis of Alveolar Epithelial Cells via NRF2-Dependent Pathway During Lung Ischemia-Reperfusion Injury 2025-Apr-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.202401475R PMID:40270323	研究论文	本研究探讨了Lipoxin A4 (LxA)通过FPR2/NRF2信号通路减轻肺泡上皮细胞铁死亡在肺缺血再灌注损伤(IRI)中的作用	首次揭示了LxA/FPR2信号通过NRF2依赖的途径减轻肺泡上皮细胞铁死亡的新机制	研究主要基于小鼠模型，在人体中的效果需要进一步验证	探究LxA是否能够通过FPR2/NRF2通路保护肺组织免受IRI引起的铁死亡	肺泡II型上皮细胞(ATII cells)	呼吸系统疾病	肺缺血再灌注损伤	单细胞RNA测序	小鼠肺缺血再灌注模型和原位肺移植模型	基因表达数据、氧化脂质水平数据	C57BL/6野生型小鼠、Fpr2和Nrf2敲除小鼠、人肺移植患者组织样本
958	2025-05-23	Vagal Sensory Gut-Brain Pathways That Control Eating-Satiety and Beyond 2025-Apr, Comprehensive Physiology IF:4.2Q1 DOI:10.1002/cph4.70010 PMID:40229922	review	本文综述了迷走神经在肠道与大脑之间传递信息的多重作用，挑战了其仅作为饱腹感信号被动传递者的传统观点	揭示了迷走神经传入神经元（VANs）的多样化亚群、多种感觉模式及其在摄食行为、代谢和认知中的复杂作用	综述性文章，未涉及具体实验数据或样本量的限制	探讨迷走神经感觉通路在肠道-大脑通信中的多重作用，超越饱腹感信号传递	迷走神经传入神经元（VANs）及其下游大脑回路	神经科学	NA	单细胞转录组学、神经回路映射、功能成像	NA	NA	NA
959	2025-05-23	Single-cell omics technologies - Fundamentals on how to create single-cell looking glasses for reproductive health 2025-Apr, American journal of obstetrics and gynecology IF:8.7Q1 DOI:10.1016/j.ajog.2024.08.041 PMID:40253074	综述	本文回顾了单细胞组学技术在妇科疾病和女性生命周期中的系统性生物适应研究中的应用	探讨了单细胞技术在生殖医学中的最新应用，包括测序和蛋白质组学方法，以及空间转录组学和高维蛋白质组成像	讨论了单细胞技术在数据分析和临床转化中的统计限制和计算挑战	研究单细胞技术在妇科疾病和女性生殖健康中的应用，以开发新的诊断方法和靶向治疗	女性生殖道组织、妊娠及妊娠相关疾病、妇科恶性肿瘤、子宫和卵巢生理及衰老	生物医学	妇科疾病	单细胞测序、蛋白质组学、空间转录组学、高维蛋白质组成像	NA	基因表达数据、蛋白质表达数据	NA
960	2025-05-23	Contribution of germline and somatic mutations to risk of neuromyelitis optica spectrum disorder 2025-Mar-12, Cell genomics IF:11.1Q1 DOI:10.1016/j.xgen.2025.100776 PMID:39986280	research paper	该研究通过基因组范围的荟萃分析和单细胞RNA测序，探讨了神经脊髓炎视神经谱系障碍（NMOSD）的遗传和体细胞突变背景	发现了与NMOSD风险相关的CCR6常见变异和体细胞嵌合染色体改变（mCAs），并揭示了这些突变在CD4T细胞亚群中的疾病特异性表达数量性状位点效应	样本量相对较小，特别是单细胞RNA测序分析部分仅包括25名患者和101名对照	探索神经脊髓炎视神经谱系障碍（NMOSD）的遗传和体细胞突变背景	日本人群中的NMOSD患者（240名患者和50,578名对照）及单细胞RNA测序样本（25名患者和101名对照）	genetics	neuromyelitis optica spectrum disorder	genome-wide meta-analysis, single-cell RNA sequencing (scRNA-seq)	NA	genomic data, RNA-seq data	240 patients and 50,578 controls for genome-wide meta-analysis, 25 patients and 101 controls for scRNA-seq