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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 941 | 2026-05-25 |
Cardiomyocyte-derived GPX4 stabilizes BNIP3 to facilitate mitophagy and mitigate myocardial ischemia/reperfusion injury
2026-Mar-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71232-2
PMID:41904174
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研究论文 | 研究发现心肌细胞来源的GPX4通过稳定BNIP3促进线粒体自噬,减轻心肌缺血再灌注损伤 | 首次揭示GPX4通过其U46活性位点增强BNIP3与USP20相互作用,减少BNIP3的K131位泛素化,从而稳定BNIP3并促进线粒体自噬的新机制,将GPX4与铁死亡相关的线粒体损伤联系起来 | 未提及 | 阐明GPX4在心肌缺血再灌注损伤中的效应及分子机制 | 心肌细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单细胞测序 | NA | 空间转录组数据, 空间蛋白质组数据, 单细胞测序数据 | NA | 10x Genomics, Illumina | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Visium空间转录组学平台, Illumina NovaSeq测序平台 |
| 942 | 2026-05-25 |
Single-cell transcriptome-wide Mendelian randomization during CD4+ T cell activation reveals immune-mediated mechanisms and drug targets for neuropsychiatric disorders
2026-Mar-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09941-z
PMID:41904330
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研究论文 | 结合单细胞转录组学、表达数量性状位点鉴定、孟德尔随机化和共定位分析,识别神经精神疾病在CD4+ T细胞激活过程中的致病基因、通路和药物靶点 | 首次在动态T细胞激活状态下整合单细胞转录组学与孟德尔随机化,发现时间特异性因果模式,并优先考虑RAC1和PARP1等21个潜在药物重定位靶点 | 未提及具体局限性,但可能包括样本量有限或因果推断的潜在混杂因素 | 阐明CD4+ T细胞激活在阿尔茨海默病和重度抑郁症免疫介导机制中的作用并识别药物靶点 | 阿尔茨海默病和重度抑郁症 | 机器学习 | 阿尔茨海默病, 重度抑郁症 | 单细胞RNA-seq, 表达数量性状位点分析, 孟德尔随机化 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 943 | 2026-05-25 |
The CD4+ T cell population partners with Tpex CD8+ T cells to mediate antitumor immunity in the tumor microenvironment
2026-Mar-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71161-0
PMID:41904165
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和质谱流式分析,发现CD4+ T细胞亚群Th7R与Tpex CD8+ T细胞在肿瘤微环境中协同作用,维持抗肿瘤免疫 | 首次鉴定出IL-7R CCR6+ Th1样CD4+ T细胞亚群(Th7R)作为Tpex的伴侣细胞,阐明其在三级淋巴结构中与Tpex共定位并支持抗肿瘤免疫的新机制 | 部分数据来自肾细胞癌样本,且主要基于肺癌患者,可能限制结论的普适性;小鼠模型为过继转移实验,人类研究为关联性分析,因果验证不足 | 探究肿瘤微环境中CD4+ T细胞如何与Tpex CD8+ T细胞协作以维持抗肿瘤免疫 | 肺癌患者(主要)和肾细胞癌患者的外周血、肿瘤和淋巴结样本 | 机器学习 | 肺癌, 肾细胞癌 | NA | NA | NA | 肺癌和肾细胞癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序, 质谱流式 | NA | NA |
| 944 | 2026-05-25 |
Single-bacterial cell insights into mechanisms of ceftriaxone resistance in Neisseria subflava
2026-Mar-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68621-y
PMID:41896210
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研究论文 | 通过单细菌细胞视角揭示头孢曲松耐药在奈瑟氏球菌亚种中的机制 | 首次结合实验进化和单细胞转录组学来解析奈瑟氏球菌亚种在抗生素压力下从共生菌向病原菌转变的多因素策略 | 尚未在更多临床菌株或体内模型中验证该适应性过程 | 研究抗生素压力如何驱动奈瑟氏球菌亚种适应并增强致病性 | 奈瑟氏球菌亚种(Neisseria subflava) | 机器学习和数字病理学 | 慢性呼吸系统疾病 | 全基因组测序、单细胞转录组学 | NA | 基因数据 | 实验进化过程中多个时间点的细菌培养样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 945 | 2026-05-25 |
Conserved Ductular Reaction Mechanisms in Biliary Atresia and Primary Sclerosing Cholangitis Derived From Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2026-Mar-27, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101778
PMID:41903685
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学揭示胆道闭锁与原发性硬化性胆管炎中保守的导管反应机制 | 首次通过单细胞和空间转录组学技术比较两种胆道疾病(BA和PSC),发现保守的纤维炎症机制,包括上皮、间质和先天免疫过程的共享,而适应性免疫过程存在差异 | 未来研究需纳入更广泛的早期和晚期疾病样本(尤其是非肝硬化PSC),当前对配体-受体相互作用的预测置信度有限 | 阐明胆道闭锁和原发性硬化性胆管炎中导管反应的保守分子机制,识别跨纤维炎症性疾病的治疗靶点 | 胆道闭锁和原发性硬化性胆管炎患者的胆管组织及细胞类型 | 数字病理学 | 胆道闭锁, 原发性硬化性胆管炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA(提及需涵盖早晚期样本,但未提供具体数量) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 946 | 2026-05-25 |
Spatial Transcriptomics of Early Tooth Morphogenesis in Formalin-fixed Paraffin-embedded Mouse Embryonic Tissue
2026-03-13, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/70340
PMID:41911219
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研究论文 | 描述了用于小鼠胚胎甲醛固定石蜡包埋组织的空间转录组学分析方案,以研究早期牙齿形态发生 | 优化了从收集、固定到石蜡包埋的完整工作流程,确保RNA完整性和组织形态,兼容多种空间转录组学平台 | NA | 建立可重复的空间转录组学分析方法,用于研究胚胎牙齿发育的分子机制 | 小鼠胚胎颅面组织 | 数字病理学 | 牙齿发育异常 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 947 | 2026-05-25 |
Multi-omics analysis of NEDD1 in hepatocellular carcinoma: biological function, prognostic value, and clinical significance
2026-Mar-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-42505-z
PMID:41775913
|
研究论文 | 通过多组学分析研究NEDD1在肝细胞癌中的生物学功能、预后价值和临床意义 | 首次多组学揭示NEDD1在肝细胞癌中的致癌作用及NEDD1-MZT2B模块在肿瘤细胞和免疫抑制性巨噬细胞中的动态功能模型 | 可能受到公共数据集异质性的影响,且功能性验证仅涉及单一基因敲减和皮下异种移植模型 | 探索NEDD1在肝细胞癌中的致癌作用、调控机制及与肿瘤微环境的相互作用 | 肝细胞癌组织和细胞系 | 数字病理学 | 肝癌 | DNA甲基化测序, 磷酸化组学, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 表达数据, 甲基化数据, 磷酸化数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | TCGA和GEO公共数据集及临床样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 使用GSE140228和HRA000437公共数据集 |
| 948 | 2026-05-25 |
Microglial CR3-mediated synaptic pruning in the dmPFC promotes the generation and maintenance of chronic muscle pain via glutamatergic dysfunction
2026-Mar, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-026-01666-7
PMID:41765955
|
研究论文 | 揭示小胶质细胞CR3介导的突触修剪通过谷氨酸能功能障碍促进慢性肌肉痛的产生和维持 | 首次发现小胶质细胞CR3依赖的突触修剪抑制背内侧前额叶皮层谷氨酸能神经元兴奋性,阐明其机制在慢性肌肉痛及情绪共病中的关键作用 | 未明确说明 | 探究慢性肌肉痛产生和维持的复杂机制,为治疗提供新靶点 | 慢性肌肉痛大鼠模型 | 神经科学 | 慢性肌肉痛 | 单细胞RNA测序、纤维光度法、膜片钳、场电位记录、流式细胞术、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、电生理数据、成像数据 | 大鼠模型样本,具体数量未提供 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 949 | 2026-05-25 |
Germ line LCP1 mutations cause immunodeficiency with neutropenia, monocytopenia, lymphopenia, and defective cytokinesis
2026-Feb-10, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2025016507
PMID:41056520
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研究论文 | 本研究报告了LCP1基因种系突变导致的一种新型免疫缺陷疾病,其特征包括中性粒细胞减少、单核细胞减少、淋巴细胞减少及细胞分裂缺陷 | 首次发现LCP1基因的激活型突变是导致常染色体显性遗传性造血系统疾病的病因,并通过患者来源的诱导多能干细胞验证了遗传起源 | 主要基于四个独立家系的数据,样本量有限,且对突变导致的功能获得效应的分子机制阐述尚不完全 | 阐明LCP1基因突变在先天性中性粒细胞减少症及免疫缺陷中的致病作用 | 来自四个独立家系的LCP1基因突变患者及其骨髓来源的造血干细胞和祖细胞 | 数字病理学 | 先天性中性粒细胞减少症 | 单细胞转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 四个家系中多名患者,具体数量未说明;其中A247_E254del突变患者的骨髓来源造血干细胞和祖细胞进行了单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 950 | 2026-05-25 |
Claudin 18.2 as a Biomarker for Imaging and Radiopharmaceutical Therapy in Gastric and Pancreatic Tumors
2026-01-02, Journal of nuclear medicine : official publication, Society of Nuclear Medicine
IF:9.1Q1
DOI:10.2967/jnumed.125.270568
PMID:41266253
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研究论文 | 探究Claudin 18.2作为胃癌和胰腺癌中分子成像与靶向放射性药物治疗的生物标志物的潜力 | 首次在胃癌和胰腺癌模型中系统评估CLDN18.2用于PET成像和放射性核素治疗的可行性,展示了[Zr]Zr-DFO-zolbetuximab的高肿瘤摄取和[Lu]Lu-DOTA-zolbetuximab的抗肿瘤效果 | 研究基于小鼠异种移植模型,尚未在人体中进行验证;样本量较小(31例PDAC患者) | 评估CLDN18.2作为胃癌和胰腺癌分子成像和靶向放射性药物治疗的生物标志物的潜力 | 胃癌(GSU细胞系)和胰腺导管腺癌(HUPT-4和PATU8988S细胞系)的小鼠皮下异种移植模型 | 数字病理学 | 胃癌, 胰腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, PET成像, 放射性药物治疗 | NA | 测序数据, 影像数据 | 31名胰腺癌患者, 裸鼠异种移植模型(GSU、HUPT-4、PATU8988S细胞系) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 951 | 2026-05-25 |
Ubiquitous and Brain Cell-Type-Specific Promoters and Enhancers in Lentiviral Vectors
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4807-0_7
PMID:41273642
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综述 | 讨论了在慢病毒载体中构建和运用组成型及脑细胞类型特异性启动子和增强子以实现精准高效基因递送的方法 | 利用单细胞转录组学和ATAC测序新技术发现新型增强子区域,为开发更精准的靶向慢病毒载体铺平道路 | 未明确说明 | 开发用于慢病毒载体的脑细胞类型特异性启动子和增强子,提高转基因在脑细胞中的表达特异性和效率 | 脑细胞类型包括兴奋性和抑制性神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学, ATAC测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 952 | 2026-05-25 |
Engineered vasculature induces functional maturation of pluripotent stem cell-derived islet organoids
2025-Sep-22, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.04.024
PMID:40412386
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研究论文 | 通过构建三维血管化胰岛类器官,改善多能干细胞来源的胰岛细胞功能成熟度 | 首次将血管内皮细胞和成纤维细胞与干细胞来源胰岛细胞组装成三维血管化类器官,并在微流控装置中实现灌注;揭示血管通过形成胰岛样基底膜和BMP信号通路促进β细胞功能成熟 | 未提及具体局限性 | 研究血管化对干细胞来源胰岛类器官功能成熟的影响及其机制 | 人干细胞来源的胰岛细胞、人原代内皮细胞、成纤维细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 953 | 2026-05-25 |
Association of DNA damage response signals and oxidative stress status with nivolumab efficacy in patients with Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2025-Aug, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03032-2
PMID:40410274
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研究论文 | 评估头颈部鳞状细胞癌患者外周血单核细胞中DNA损伤反应信号与氧化应激状态对纳武利尤单抗疗效的关联 | 首次在HNSCC患者中研究基线PBMCs中DDR相关信号和氧化应激状态与免疫检查点抑制剂疗效的关联,并利用空间转录组学分析肿瘤、白细胞和巨噬细胞三个分子定义的组织区室 | 样本量较小(26例健康对照和50例患者),且未提及外部验证队列,结果需进一步验证才能作为非侵入性生物标志物 | 检验基线HNSCC患者PBMCs中DDR相关信号与免疫检查点抑制剂(纳武利尤单抗)反应相关的假说 | 26例健康对照和50例复发性/转移性头颈部鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、血液样本数据 | 26例健康对照和50例复发性/转移性HNSCC患者 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学分析肿瘤、白细胞和巨噬细胞三个组织区室 |
| 954 | 2026-05-25 |
Down-regulation of IGFBP2 mediates endometrial epithelial cells senescence in thin endometrium
2025-07-03, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf032
PMID:40700608
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析发现,薄型子宫内膜中IGFBP2表达下调导致子宫内膜上皮细胞衰老,并揭示了其通过PI3K/AKT信号通路调控PTEN活性的机制 | 首次阐明IGFBP2下调通过PTEN/PI3K/AKT通路介导子宫内膜上皮细胞衰老,并在体内外模型中验证重组IGFBP2蛋白抗衰老效果优于传统药物达沙替尼 | 未明确IGFBP2上游调控机制;小鼠模型与人类TE病理差异需进一步验证 | 阐明薄型子宫内膜中IGFBP2调控上皮细胞衰老的分子机制及治疗潜力 | 人类原代子宫内膜上皮细胞、Ishikawa细胞系、薄型子宫内膜小鼠模型 | 数字病理学 | 子宫内膜相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 薄型子宫内膜和正常对照组织的单细胞RNA测序数据;小鼠模型数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 955 | 2026-05-25 |
The Dual Molecular Identity of Vestibular Kinocilia: Bridging Structural and Functional Traits of Primary and Motile Cilia
2025-Jun-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.16.647417
PMID:40568142
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和活细胞成像,揭示了前庭动纤毛兼具初级纤毛和运动纤毛的分子特征及其主动运动功能 | 首次证明前庭动纤毛具有初级纤毛和运动纤毛的双重分子身份,并发现其能自发产生运动,挑战了传统认为动纤毛仅为感觉结构的观点 | 未详细说明成像技术的分辨率限制及跨物种比较中可能存在的差异 | 阐明前庭动纤毛的结构、分子组成和功能特征 | 成年小鼠、斑马鱼、牛蛙和人类的前庭毛细胞及动纤毛 | 分子生物学, 细胞生物学 | 前庭疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫染色, 活细胞成像 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 成年小鼠和人类的前庭毛细胞(未明确具体数量) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 956 | 2026-05-25 |
PANoptosis-related gene biomarkers in aortic dissection
2025-06, Archives of biochemistry and biophysics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.abb.2025.110385
PMID:40086567
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研究论文 | 本研究探讨了PANoptosis相关基因在主动脉夹层中的生物标志物作用 | 首次在单细胞水平上评估血管平滑肌细胞中PANoptosis(包括焦亡、凋亡和坏死性凋亡)评分,并鉴定出关键基因GADD45B、CDKN1A和SOD2 | 未在更大规模临床样本中验证,机制研究依赖于公共数据集 | 阐明PANoptosis相关基因在主动脉夹层发病机制中的作用 | 主动脉夹层患者和动物模型中的血管平滑肌细胞 | 机器学习和生物信息学 | 主动脉夹层 | 单细胞测序 | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | GSE213740(单细胞测序数据集)、GSE153434、GSE147026和GSE52093共4个公共数据集,以及患者和小鼠血管组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | GSE213740单细胞测序数据集 |
| 957 | 2026-05-25 |
SpaceBar enables clone tracing in spatial transcriptomic data
2025-Feb-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.10.637514
PMID:39990434
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研究论文 | 报道了一种名为SpaceBar的细胞条形码策略,可同时在空间转录组数据中进行克隆追踪和基因表达分析 | 首次将合成条形码库与成像空间转录组技术结合,实现单细胞水平的克隆追踪和空间基因表达同步分析 | 条形码库仅包含96个合成序列,可能限制大规模克隆追踪的分辨率 | 开发一种能够同时追踪克隆动态和空间基因表达的方法 | 黑色素瘤细胞在肿瘤异种移植模型中的克隆和基因表达 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组测序 | NA | 图像和基因表达数据 | 黑色素瘤异种移植模型中的肿瘤样本 | NA | 空间转录组学 | seqFISH | 使用seqFISH技术进行成像空间转录组检测 |
| 958 | 2026-05-25 |
Blockade of purine metabolism reverses macrophage immunosuppression and enhances anti-tumor immunity in non-small cell lung cancer
2025-01, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2024.101175
PMID:39608215
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研究论文 | 本研究揭示了嘌呤代谢阻断可逆转巨噬细胞免疫抑制并增强非小细胞肺癌的抗肿瘤免疫 | 首次发现非小细胞肺癌细胞分泌的CXCL8通过激活嘌呤代谢促进巨噬细胞PD-L1表达,并揭示NLRP3/caspase-1/IL-1β信号通路在嘌呤代谢介导的巨噬细胞免疫抑制中的作用 | NA | 评估巨噬细胞是否通过代谢串扰调节非小细胞肺癌进展并影响免疫治疗疗效 | 非小细胞肺癌组织中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞测序, 流式细胞术, 免疫荧光, 多重检测, ELISA, RNA-seq | NA | 图像, 文本 | 非小细胞肺癌组织样本及C57BL/6J小鼠肿瘤模型 | 10x Genomics, NA | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞测序系统 |
| 959 | 2026-05-25 |
Interleukin-1β Drives Disease Progression in Arrhythmogenic Cardiomyopathy
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.11.628020
PMID:39763850
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研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学分析,揭示IL-1β在致心律失常性心肌病疾病进展中的驱动作用 | 首次在人类ACM样本中采用单核RNA测序和空间转录组学联合分析,鉴定出疾病相关的炎症-纤维化空间微环境,并证明抗IL-1β中和抗体在ACM小鼠模型中可减轻纤维化、保护心脏功能 | 主要基于小鼠模型验证治疗策略,人类样本数量有限且未进行干预性临床试验验证 | 阐明IL-1β在ACM发病机制中的作用并评估其作为治疗靶点的潜力 | 人类ACM心肌样本和Dsg2突变小鼠模型 | 数字病理学 | 致心律失常性心肌病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 人类ACM患者与对照供体的心肌样本,以及Dsg2基因纯合突变小鼠 | 10x Genomics | 单核RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Genomics单核RNA测序和Visium空间转录组学平台 |
| 960 | 2026-05-25 |
Local Controlled Delivery of IL-4 Decreases Inflammatory Bone Loss in a Murine Model of Periodontal Disease
2024-Dec-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2400332
PMID:39465979
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研究论文 | 通过局部控制释放IL-4减少牙周炎小鼠模型中的炎症性骨丢失 | 首次证明使用可控药物递送策略局部释放IL-4可逆转炎症性骨丢失并促进骨再生,并利用单细胞RNA测序揭示其通过将巨噬细胞转向修复表型的作用机制 | 未提及具体局限性,但可能包括小鼠模型与人类的差异、递送系统的长期效果及安全性需进一步验证 | 评估使用可控药物递送策略靶向口腔巨噬细胞治疗慢性炎症的可行性 | 牙周炎小鼠模型中的巨噬细胞和牙周组织 | 数字化病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 牙周炎小鼠模型,具体数量未在摘要中提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |