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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 941 | 2026-06-09 |
Hypoxia-driven TCF21/CCL11 axis in GCMSCs orchestrates macrophage polarization and lymphatic remodeling to promote gastric cancer lymph node metastasis
2026-Aug, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2026.118056
PMID:42134670
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研究论文 | 本研究揭示了低氧驱动的GCMSCs中TCF21/CCL11轴通过调控巨噬细胞极化和淋巴管重塑促进胃癌淋巴结转移的机制 | 首次发现GCMSCs分泌的CCL11通过非直接作用于肿瘤细胞,而是通过调控巨噬细胞M2极化和淋巴内皮细胞重塑来促进胃癌淋巴结转移,并阐明了低氧-TCF21-CCL11轴的核心调控机制 | NA | 阐明胃癌相关间充质干细胞(GCMSCs)介导的旁分泌因子在淋巴结转移中的作用及分子机制 | 胃癌相关间充质干细胞(GCMSCs)、巨噬细胞、淋巴内皮细胞(LECs)、胃癌细胞系 | machine learning | 胃癌 | 单细胞RNA测序、转录组分析、细胞因子谱分析 | NA | 转录组数据、细胞因子数据、单细胞RNA测序数据 | 临床样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 942 | 2026-06-09 |
Signal regulatory protein γ is associated with an exhaustion-prone immune microenvironment in metastatic melanoma
2026-Jul-15, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2026.115069
PMID:42167713
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研究论文 | 通过数据库挖掘、单细胞转录组学和免疫组化验证,研究信号调节蛋白γ在转移性黑色素瘤中的表达及其与免疫微环境的关系 | 首次揭示SIRPG在转移性黑色素瘤中与耗竭倾向的免疫抑制微环境相关,并发现其与PD-1在蛋白水平上的共表达富集 | 基于公共数据库和有限样本的验证,需进一步大规模临床研究确认其作为生物标志物的潜力 | 探讨SIRPG在皮肤黑色素瘤中的表达、临床意义及其对免疫微环境重塑的潜在影响 | 皮肤黑色素瘤组织样本及正常皮肤组织 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光 | NA | 转录组数据, 图像数据 | 基于公共数据库和免疫组化验证样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 943 | 2026-06-09 |
Gut Microbiota-Induced CTLA4 Expression on CD8 + T Cells Impairs Antitumor Immunity and Promotes Colorectal Cancer Progression
2026-Jul, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.70128
PMID:41780914
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研究论文 | 本研究揭示了肠道菌群诱导CD8+ T细胞CTLA4表达以促进结直肠癌免疫逃逸的新机制 | 首次阐明肠道菌群通过诱导CD8+ T细胞CTLA4过表达直接驱动结直肠癌免疫抑制的新通路 | 未明确具体菌种或代谢物如何调控CTLA4表达,且缺乏大规模临床队列验证 | 探究肠道菌群失调如何通过CTLA4信号轴抑制抗肿瘤免疫并促进结直肠癌进展 | 结直肠癌患者粪便样本及肿瘤微环境中的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 16S rRNA测序, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 测序数据 | 结直肠癌患者粪便样本(具体数量未提及)及小鼠模型 | NA | 16S rRNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 944 | 2026-06-09 |
Integrated intraocular-plasma proteomics reveals conserved biomarkers for diabetic retinopathy progression: a multi-fluid biopsy study
2026-Jul, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-026-06708-3
PMID:41817688
|
研究论文 | 通过整合眼内液和血浆蛋白质组学,鉴定可用于糖尿病视网膜病变进展监测的保守生物标志物 | 首次通过多液体活检(房水与血浆)联合分析,发现神经丝轻链作为可经血浆检测的跨阶段生物标志物,并验证其预测视网膜病变进展及血管并发症风险的能力 | 未提及明显的局限性 | 鉴定可追踪糖尿病视网膜病变全过程的保守生物标志物 | 糖尿病视网膜病变患者队列(中国广东DR多组学研究)、氧诱导视网膜病变小鼠模型、UK Biobank糖尿病患者队列 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 蛋白质组学(SomaScan v4.1)、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质表达数据、单细胞转录组数据、临床随访数据 | 中国队列32例房水样本;UK Biobank糖尿病患者2495例 | NA | NA | SomaScan v4.1 | 高通量蛋白质组学SomaScan v4.1平台 |
| 945 | 2026-06-09 |
A NETs-centric multi-omics framework prioritizes PGLYRP1 and MMP9 as subtype-associated thromboinflammatory biomarker candidates and putative therapeutic hypotheses in ischemic stroke
2026-Jul, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2026.107422
PMID:42066918
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研究论文 | 本研究构建了一个以中性粒细胞胞外陷阱(NETs)为中心的多组学框架,在缺血性卒中中识别出与亚型相关的血栓炎症生物标志物候选物PGLYRP1和MMP9,并提出了潜在的治疗假说 | 首次整合多队列外周血转录组学、机器学习特征选择、孟德尔随机化、单细胞RNA测序以及计算扰动分析,建立了NETs导向的亚型特异性分层框架,并发现PGLYRP1在心源性栓塞性卒中中具有特异性富集信号和潜在的因果关联 | 未充分验证MMP9和PGLYRP1在更大独立队列中的临床转化价值,且孟德尔随机化分析中系统性细胞因子的中介作用不显著,提示局部血栓炎症环境的复杂性未完全解析 | 探索缺血性卒中中NETs相关的血栓炎症生物标志物,推动亚型特异性诊断和治疗假说的发展 | 缺血性卒中患者的外周血样本,涵盖多种亚型 | 机器学习 | 缺血性卒中 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 分子动力学模拟, 细胞热转移分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 多队列分布,具体样本量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 946 | 2026-06-09 |
Beyond Weight: Systems Biology and Precision Medicine Redefine Obesity as a Multidimensional Disease
2026-Jul, Diabetes, obesity & metabolism
DOI:10.1111/dom.70724
PMID:41944002
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综述 | 通过系统生物学视角将肥胖重新定义为一种异质性、多维度的疾病 | 整合单细胞转录组学、代谢组学、表观基因组学、微生物组分析和计算建模等多种系统生物学方法,突破传统仅基于BMI的肥胖分类模式 | 研究主要基于现有文献总结,缺乏原始实验数据验证 | 重新定义肥胖为异质性、多维度的疾病,推动机制导向的精准肥胖防治 | 肥胖相关的分子、细胞、临床和环境信息 | 系统生物学 | 肥胖症 | 单细胞转录组学、代谢组学、表观基因组学、微生物组分析、计算建模 | NA | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 947 | 2026-06-09 |
Inhibition of soluble epoxide hydrolase ameliorates renal injury in IgA nephropathy by restoring epoxyeicosatrienoic acids
2026-Jun-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.116200
PMID:42256278
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research paper | 本研究通过血浆氧化脂质谱分析和肾脏单细胞RNA测序,揭示了可溶性环氧化物水解酶抑制通过恢复环氧二十碳三烯酸改善IgA肾病肾损伤的机制 | 首次在IgA肾病中发现sEH-EET轴失调,并验证sEH抑制剂作为潜在治疗靶点 | 主要基于动物模型和体外细胞实验,缺乏大规模临床样本验证 | 探究脂质代谢异常在IgA肾病中的作用及sEH抑制剂的治疗效果 | IgA肾病患者血浆样本、小鼠模型及人肾小球系膜细胞 | machine learning | IgA肾病 | 单细胞RNA测序, 血浆氧化脂质谱分析 | NA | 基因表达数据, 脂质组学数据 | IgA肾病患者血浆样本及小鼠模型样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 948 | 2026-06-09 |
Single-cell transcriptomics profiling elucidates RBP-driven metastatic signaling pathways in ER+ breast cancer
2026-Jun-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.116155
PMID:42256294
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研究论文 | 通过单细胞转录组图谱揭示RNA结合蛋白驱动的ER+乳腺癌转移信号通路 | 首次构建了涵盖正常组织、原发肿瘤和转移灶的ER+乳腺癌单细胞转录组图谱,系统鉴定了RNA结合蛋白在恶性进展中的渐进性上调及其与细胞骨架重塑、胞外基质相互作用和应激适应的关联 | 未提及具体局限性 | 探究RNA结合蛋白在雌激素受体阳性乳腺癌进展和转移中的作用机制 | 39个样本(正常组织、原发肿瘤和转移灶)中的198,286个细胞 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 39个样本,198,286个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 949 | 2026-06-09 |
Identification of an immediate-early gene-activated fibroblast state in frozen shoulder capsular fibrosis
2026-Jun-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.116183
PMID:42256302
|
研究论文 | 整合空间转录组学、假时间推断和验证,全面解析人类肩关节囊中的成纤维细胞异质性,并鉴定出立即早期基因激活的成纤维细胞状态与肩周炎纤维化重塑相关 | 首次鉴定出FOSJUNEGR1立即早期基因激活的成纤维细胞亚群作为压力响应过渡状态,连接稳态和促纤维化状态,并揭示成纤维细胞状态可塑性在肩周炎发病机制中的关键作用 | 未在摘要中提及明显局限,可能包括样本量有限或缺乏功能性验证 | 研究肩周炎关节囊纤维化过程中成纤维细胞的细胞程序 | 人类肩关节囊组织 | 数字病理学 | 肩周炎 | 空间转录组学 | 假时间推断 | 空间转录组数据 | 人类肩关节囊样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 950 | 2026-06-09 |
[Expression of CREPT in vascular endothelial cells and its angiogenic mechanism in glioma]
2026-Jun-08, Zhonghua bing li xue za zhi = Chinese journal of pathology
|
研究论文 | 研究CREPT在胶质瘤血管内皮细胞中的表达及其促进血管生成的机制 | 首次发现CREPT在胶质瘤血管内皮细胞中特异性表达,并通过VEGFA-VEGFR2信号通路调控血管生成,为抗血管生成治疗提供新靶点 | 未提及CREPT在其他类型肿瘤或正常组织中的表达模式,以及体内实验验证的缺乏 | 探究CREPT在胶质瘤血管内皮细胞中的表达模式及其调控血管生成的机制 | 胶质瘤血管内皮细胞 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞测序, 免疫组织化学, 免疫荧光染色, 基因集富集分析, 管形成实验, Western blot | NA | 图像, 文本 | 人胶质瘤样本的单细胞测序数据,临床样本(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基于人胶质瘤样本的单细胞测序数据进行分析 |
| 951 | 2026-06-09 |
Quantitative RNA spatial profiling using single-molecule RNA FISH on plant tissue cryosections
2026-Jun-08, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101943
PMID:42252663
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研究论文 | 提出一种优化的单分子RNA荧光原位杂交方法(cryo-smFISH),用于植物组织冰冻切片中单个mRNA分子的可视化和定量 | 开发了适用于植物组织冰冻切片的稳健smFISH方案,结合深度学习算法实现细胞核和细胞质中RNA丰度的精确定位,并可与免疫荧光联合使用 | 标题和摘要未提及明显局限性 | 开发简单且稳健的smFISH方法,用于植物组织冰冻切片中RNA的空间定量分析 | 植物组织冰冻切片中的单个mRNA分子 | 数字病理学 | NA | 单分子RNA荧光原位杂交 (smFISH) | 深度学习算法 | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 952 | 2026-06-09 |
SpaVGMC: A Unified Representation Learning Framework via Structural and Semantic Alignment in Spatial Transcriptomics
2026-Jun-08, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.6c01121
PMID:42253102
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研究论文 | 提出SpaVGMC统一表示学习框架,通过结构对齐和语义对齐来改进空间转录组学中的空间域识别 | 首次将结构化变分推理、结构信息对齐和语义对齐三者结合,在无数据增强的情况下通过分布感知对比学习组织全局转录语义,有效解决局部过平滑和拓扑保真度受损问题 | 未明确提及局限性,但可能依赖空间转录组数据的质量,且在大规模数据集上的计算效率有待验证 | 提升空间域识别的准确性和可解释性,克服当前方法在拓扑保持和全局语义建模上的不足 | 多个空间转录组数据集中的空间域 | 数字病理学、机器学习 | 不适用 | 空间转录组学 | 结构化变分自动编码器 | 空间转录组数据 | 多个空间转录组数据集,具体样本数未说明 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 953 | 2026-06-09 |
Integrative single-cell and spatial transcriptomics analysis reveals a baicalein-responsive 10-gene signature for non-small cell lung cancer
2026-Jun-07, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102853
PMID:42251782
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研究论文 | 整合单细胞和空间转录组学分析,揭示黄芩素响应性非小细胞肺癌10基因特征 | 首次整合网络药理学、单细胞RNA测序、批量转录组学、空间转录组学和机器学习,鉴定了黄芩素在非小细胞肺癌中的10基因诊断特征,并利用空间转录组学确认了所有基因在肿瘤组织中的显著高表达 | 未提及明确的局限性 | 探究黄芩素在非小细胞肺癌肿瘤微环境中的分子靶点和细胞类型特异性效应 | 非小细胞肺癌患者 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,分子对接,分子动力学模拟 | 共识聚类,机器学习 | 基因表达数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 954 | 2026-06-09 |
Spatial Transcriptomics Open a New Era of Pan-Cancer Analysis
2026-Jun-07, Cancer investigation
IF:1.8Q3
DOI:10.1080/07357907.2026.2681845
PMID:42252208
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综述 | 综述空间转录组学在泛癌分析中的关键进展及其对临床转化的启示 | 首次系统总结空间转录组学在解码跨癌症空间生态系统保守性与差异性、绘制驱动基因异质性图谱、追踪转移演化及建立新型空间分子分类中的突破性应用 | 多癌症数据集整合困难及临床转化效率不足仍是当前挑战 | 探讨空间转录组学在推动泛癌精准诊断和治疗分层中的潜力 | 泛癌(多种癌症类型) | 数字病理学 | 泛癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 955 | 2026-06-09 |
Emerging applications of long-read sequencing in hematological malignancies: highlights from the 2025 ASH annual meeting
2026-Jun-07, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-026-00942-y
PMID:42252388
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综述 | 综述长读长测序在血液恶性肿瘤中的新兴应用,重点介绍2025年美国血液学会年会的进展 | 全面总结了长读长测序在血液恶性肿瘤中的最新应用,包括快速全基因组测序、自适应采样、全长RNA测序和单细胞RNA测序等新技术在亚型分类、结构变异检测和融合转录本解析方面的突破 | 长读长测序的成本和准确性仍然是其在常规临床诊断中广泛应用的障碍 | 评估长读长测序技术在血液恶性肿瘤诊断和精准治疗中的潜力 | 血液恶性肿瘤 | 机器学习 | 血液恶性肿瘤 | 长读长测序, 全基因组测序, 全长RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 长读长测序 | NA | NA |
| 956 | 2026-06-09 |
Multi-omic profiling identifies TREM2+ lipid-laden macrophages as inflammatory drivers and therapeutic targets of colorectal cancer liver metastasis
2026-Jun-06, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218657
PMID:42250756
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研究论文 | 通过多组学分析鉴定TREM2+脂质负载巨噬细胞作为结直肠癌肝转移的炎症驱动因子和潜在治疗靶点 | 首次整合CyTOF、单细胞和空间转录组学、脂质组学等多组学技术,发现并表征了促进结直肠癌肝转移免疫逃逸和微环境重塑的TREM2+脂质负载巨噬细胞亚群,并验证了其炎症信号通路及靶向治疗潜力 | 未提及具体限制,该研究仍需在更大队列和临床环境中进一步验证TREM2靶向治疗的有效性和安全性 | 阐明结直肠癌肝转移中肿瘤相关巨噬细胞的特定亚群及其在免疫抑制和肿瘤进展中的作用 | 结直肠癌肝转移的肿瘤相关巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 结直肠癌 | CyTOF, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 脂质组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量转录组数据, 脂质组数据, CyTOF数据 | 小鼠模型及离体器官型肿瘤模型,具体样本量未详述 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 957 | 2026-06-09 |
Charting the human-specific properties of gene expression networks in the infant prefrontal cortex
2026-Jun-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aea3316
PMID:42234754
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研究论文 | 通过比较新生儿黑猩猩、人类和恒河猴的脑样本,利用单细胞转录组学和表观基因组学,揭示了人类婴儿前额叶皮层基因表达网络中的人类特异性特性 | 首次利用稀有新生儿黑猩猩样本进行跨物种比较,识别出人类婴儿特异性转录程序,并发现其与自闭症和帕金森病风险基因的关联 | NA | 探究人类婴儿期是否具有特异性转录程序,以及这些程序与神经疾病易感性的关系 | 人类、黑猩猩和恒河猴婴儿的前额叶皮层样本 | 数字病理学 | 自闭症, 帕金森病 | 单细胞转录组学, 单细胞表观基因组学 | NA | 单细胞转录组与表观基因组数据 | 稀有新生儿黑猩猩、年龄匹配的人类和恒河猴脑样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | NA |
| 958 | 2026-06-09 |
Single-cell transcriptomics reveals the hemocyte atlas and molecular mechanisms underlying the growth-immunity trade-off in Litopenaeus vannamei
2026-Jun-05, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2026.111494
PMID:42250742
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研究论文 | 使用单细胞转录组学揭示凡纳滨对虾血细胞图谱及生长-免疫权衡的分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序和加权基因共表达网络分析(WGCNA)系统比较快速生长组和缓慢生长组的血细胞图谱,揭示了生长-免疫权衡的细胞和分子基础,并识别了上游调控网络 | 未提及 | 阐明凡纳滨对虾个体生长异质性的细胞和分子调控机制,特别是生长-免疫权衡的机制 | 凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)的快速生长组和缓慢生长组 | 单细胞转录组学 | 无 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、加权基因共表达网络分析(WGCNA) | NA | 单细胞转录组数据 | 快速生长组和缓慢生长组样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 959 | 2026-06-09 |
MYC-Driven Glycolysis in TNFRSF4+ CD4+ T Cells Underlies Heightened Rejection Susceptibility of Cardiac vs. Renal Allografts
2026-Jun-05, Circulation journal : official journal of the Japanese Circulation Society
IF:3.1Q2
DOI:10.1253/circj.CJ-25-0880
PMID:42252199
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现,心脏移植物中TNFRSF4+ CD4+ T细胞的MYC驱动糖酵解导致其排斥易感性高于肾脏移植物 | 首次揭示MYC驱动糖酵解在心脏移植物特异性TNFRSF4+ CD4+ T细胞扩增中的关键作用,解释了心脏与肾脏移植物排斥易感性的差异机制 | 未明确说明,但可能包括动物模型与临床应用的转化限制以及样本量有限 | 探究心脏移植物比肾脏移植物更易发生排斥反应的分子机制 | 巴马小型猪的心脏和肾脏同种异体移植组织,临床人类心脏组织(正常与急性排斥),小鼠心脏移植模型 | 机器学习 | 移植物排斥反应 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 巴马小型猪模型(数量未明确),临床人类心脏组织(正常与急性排斥样本),小鼠心脏移植模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序技术 |
| 960 | 2026-06-09 |
Patient-derived lymphoma spheroids reveal predictive markers of glofitamab resistance in relapsed/refractory B-NHL
2026-Jun-04, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025031309
PMID:41746860
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研究论文 | 利用患者来源的淋巴瘤球体预测复发/难治性B细胞非霍奇金淋巴瘤对glofitamab的耐药性标志物 | 首次通过三维患者来源淋巴瘤球体模型,结合多参数流式细胞术、单细胞RNA测序和空间蛋白质组学,识别出CD8+ T细胞耗竭和功能活跃的Tfh细胞是glofitamab耐药的关键因素 | 未提及,但可能包括样本量有限(39个样本)、体外模型与临床反应的相关性需进一步验证等 | 识别glofitamab双特异性抗体在复发/难治性B-NHL中的耐药预测标志物 | 39例复发/难治性B-NHL患者样本,以及48例患者预处理RNA测序数据 | 数字病理学 | B细胞非霍奇金淋巴瘤 | 多参数流式细胞术,单细胞RNA测序,索引编码空间蛋白质组学,功能分析 | NA | 图像,文本,基因表达数据 | 39个患者来源淋巴瘤球体样本,48例患者预处理RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |