单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27574 篇文献，本页显示第 9561 - 9580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9561 | 2024-08-27 |
Spatial CRISPR genomics identifies regulators of the tumor microenvironment
2022-03-31, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.02.015
PMID:35290801
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研究论文 | 本文开发了一种名为Perturb-map的空间功能基因组学方法，用于在肺肿瘤小鼠模型中并行敲除多个基因，并评估这些敲除对肿瘤生长、组织病理学和免疫组成的影响。 | Perturb-map方法能够在保持空间结构的同时，以单细胞分辨率进行组织内的功能基因组学研究。 | NA | 探索CRISPR筛选技术在识别组织环境中细胞外基因功能方面的应用。 | 肺肿瘤小鼠模型中的基因敲除及其对肿瘤微环境的影响。 | 数字病理学 | 肺癌 | CRISPR | NA | 基因组数据 | 数十个基因在小鼠模型中被敲除 |
| 9562 | 2024-08-27 |
Single-cell genomics revolutionizes plant development studies across scales
2022-03-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200179
PMID:35285482
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研究论文 | 本文探讨了单细胞基因组学在植物发育研究中的应用及其技术发展 | 介绍了单细胞和单核分离技术在植物物种中的广泛应用，以及这些技术如何促进了植物器官中单细胞基因组学的研究 | NA | 强调单细胞基因组学在揭示植物器官内不同细胞类型发育轨迹中的贡献，并展示单细胞水平上组织和器官比较分析的努力 | 植物的组织、器官和整个生物体的发育 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因组数据 | NA |
| 9563 | 2024-08-27 |
Precision medicine in rheumatoid arthritis
2022-03, Best practice & research. Clinical rheumatology
DOI:10.1016/j.berh.2022.101742
PMID:35248489
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综述 | 本文综述了类风湿性关节炎（RA）的病理新见解，并讨论了将这些发现转化为临床实践中的可操作变化的关键步骤 | 应用单细胞转录组学和空间转录组学等细胞分析技术，揭示了RA关节组织中新的致病细胞类型和患者间细胞组成的显著异质性 | NA | 旨在强调RA病理学的新见解，并讨论将这些发现转化为临床实践中的可操作变化的关键步骤 | 类风湿性关节炎的病理机制及临床应用 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 细胞数据 | NA |
| 9564 | 2024-08-27 |
Computational exploration of cellular communication in skin from emerging single-cell and spatial transcriptomic data
2022-02-28, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20210863
PMID:35191953
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综述 | 本文综述了利用单细胞转录组学和空间转录组学数据推断细胞间通信的计算工具，并强调了这些工具在探索皮肤发育、稳态、疾病和衰老中的细胞通信方面的生物学见解 | 利用空间转录组学数据结合细胞间通信分析，为理解组织结构和功能提供了新的方向 | 单细胞转录组学数据 inherently 丢失了细胞的空间信息 | 探索细胞间通信在组织发育和稳态中的作用 | 皮肤中的细胞间通信机制 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 9565 | 2024-08-27 |
Single-cell eQTL analysis of activated T cell subsets reveals activation and cell type-dependent effects of disease-risk variants
2022-02-25, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abm2508
PMID:35213211
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研究论文 | 本文通过激活来自89名健康供体的CD4 T细胞并进行单细胞RNA测序，研究了遗传变异在细胞类型特异性和激活依赖性效应中的作用。 | 首次在单细胞水平上探讨了遗传变异对激活T细胞亚群的影响，并发现了新的疾病风险变异基因关联。 | 研究样本仅限于健康供体，可能限制了对疾病相关遗传变异效应的全面理解。 | 探索遗传变异在生物学相关背景下对细胞的影响。 | CD4 T细胞及其亚群。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 89名健康供体的CD4 T细胞，超过100万个细胞 |
| 9566 | 2024-08-27 |
Single-Cell RNA Sequencing of Urinary Cells Reveals Distinct Cellular Diversity in COVID-19-Associated AKI
2022-01-27, Kidney360
IF:3.2Q1
DOI:10.34067/KID.0005522021
PMID:35368565
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了COVID-19相关急性肾损伤患者的尿液细胞，揭示了其细胞多样性和基因表达差异 | 首次使用单细胞RNA测序技术非侵入性地研究COVID-19相关急性肾损伤的细胞变化，并提供了尿液膀胱细胞直接被SARS-CoV-2感染的初步证据 | 样本量较小，且仅包括住院患者 | 探究COVID-19相关急性肾损伤在尿液细胞中的表现和机制 | COVID-19相关急性肾损伤患者的尿液细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 共分析了30,076个细胞，来自8名COVID-19患者和4名非COVID-19急性肾损伤患者 |
| 9567 | 2024-08-27 |
Loss of Function of the Neural Cell Adhesion Molecule NrCAM Regulates Differentiation, Proliferation and Neurogenesis in Early Postnatal Hypothalamic Tanycytes
2022, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2022.832961
PMID:35464310
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研究论文 | 本文研究了神经细胞粘附分子NrCAM在早期新生小鼠下丘脑tanycytes中的功能丧失对分化、增殖和神经发生的影响 | 首次提供了NrCAM在成年小鼠tanycytes中调控作用的证据，并使用单细胞RNA测序技术揭示了tanycyte特异性基因表达的变化 | NrCAM缺陷小鼠中观察到的tanycyte减少和标记物丢失仅与轻微的代谢表型相关，可能需要进一步研究以揭示更深层次的影响 | 探讨NrCAM在tanycytes中的功能及其对细胞稳态的调控作用 | 下丘脑tanycytes及NrCAM的功能 | 神经科学 | NA | 免疫组织化学分析、杂交分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 成年小鼠及E16胚胎小鼠 |
| 9568 | 2024-08-27 |
Next-Generation and Single-Cell Sequencing Approaches to Study Atherosclerosis and Vascular Inflammation Pathophysiology: A Systematic Review
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.849675
PMID:35419441
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综述 | 本文综述了利用单细胞和下一代测序技术研究动脉粥样硬化和血管炎症病理生理学的现有数据 | 单细胞和下一代测序方法提供了比以往方法更高分辨率的阐明动脉粥样硬化的新手段 | 研究主要集中在平滑肌细胞、巨噬细胞和干细胞/祖细胞对疾病的贡献上，而对其他细胞类型如淋巴细胞和内皮细胞的贡献关注较少 | 旨在全面评估利用单细胞和下一代测序技术发表的数据，以识别动脉粥样硬化和血管炎症的关键细胞和分子贡献 | 动脉粥样硬化和血管炎症的病理生理学 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序和下一代测序 | NA | 基因组数据 | 34项研究符合叙事综合分析，其中16篇文章仅使用单细胞测序，10篇使用下一代测序，8篇使用这两种方法的组合 |
| 9569 | 2024-08-27 |
Analysis of Half a Billion Datapoints Across Ten Machine-Learning Algorithms Identifies Key Elements Associated With Insulin Transcription in Human Pancreatic Islet Cells
2022, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2022.853863
PMID:35399953
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研究论文 | 本研究通过分析超过4.9亿个数据点，比较了10种不同的机器学习工作流程，以识别与人类胰腺单细胞转录组中胰岛素转录相关基因 | 本研究首次在大规模数据集上比较了多种机器学习算法，特别是随机森林算法显示出高预测能力和敏感性 | NA | 比较不同机器学习工作流程在大数据分析中的表现，并识别与胰岛素转录相关的关键元素 | 人类胰腺单细胞转录组数据 | 机器学习 | 糖尿病 | 机器学习 | 随机森林 | 转录组数据 | 训练数据集包含11,652个样本，验证数据集包含2,913个样本 |
| 9570 | 2024-08-27 |
Inference of high-resolution trajectories in single-cell RNA-seq data by using RNA velocity
2021-10-25, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2021.100095
PMID:35474895
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CellPath的方法，通过整合单细胞基因表达和RNA速度信息来推断细胞轨迹 | CellPath方法能够发现多条高分辨率的轨迹，不受轨迹结构的限制，并能自动检测每条轨迹路径的方向 | NA | 开发一种新的方法来提高单细胞RNA测序数据中细胞发育轨迹推断的准确性和细节 | 单细胞RNA测序数据中的细胞发育轨迹 | 生物信息学 | NA | RNA速度 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 9571 | 2024-08-27 |
Regulation of cancer stem cells in triple negative breast cancer
2021, Cancer drug resistance (Alhambra, Calif.)
DOI:10.20517/cdr.2020.106
PMID:35582030
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综述 | 本文综述了三阴性乳腺癌中癌症干细胞的调控机制 | 聚焦于三阴性乳腺癌特有的机制，这些机制促进了自我更新癌症干细胞的扩张和活性 | NA | 探讨三阴性乳腺癌中癌症干细胞的特定机制及其对临床结果的影响 | 三阴性乳腺癌中的癌症干细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 9572 | 2024-08-27 |
The need to reassess single-cell RNA sequencing datasets: the importance of biological sample processing
2021, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.54864.2
PMID:35399227
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研究论文 | 本文重新分析了迄今为止最大的单细胞RNA测序数据集，探讨了细胞数量增加对分析结果的影响 | 提出了对当前科学界普遍认为的“越多越好”方法的质疑，指出大规模数据集可能导致分析结果的偏差 | 文章指出大规模数据集可能由于长时间的计算处理时间而影响分析的深度 | 旨在通过分析大规模单细胞RNA测序数据集，识别健康成人皮肤中先前描述的成纤维细胞亚群 | 健康成人皮肤中的成纤维细胞亚群 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | 无监督群体匹配算法 | 转录组数据 | 528,253个测序细胞 |
| 9573 | 2024-08-26 |
Effects of tumor treating fields (TTFields) on human mesenchymal stromal cells
2024-Sep, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-024-04740-0
PMID:38900237
|
研究论文 | 研究肿瘤治疗场（TTFields）对人类间充质基质细胞（MSCs）的影响 | 首次探讨了TTFields对MSCs的影响，填补了该领域的知识空白 | 仅在体外进行了实验，尚未在临床环境中验证 | 研究TTFields对间充质基质细胞的生物学效应 | 人类间充质基质细胞（MSCs） | NA | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、流式细胞术、Boyden室实验 | NA | 细胞 | 患者样本中的间充质基质细胞 |
| 9574 | 2024-08-07 |
Unlocking Skin's Symphony: Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveal the Harmonious Interplay among Diverse Cell Populations
2024-Sep, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.01.039
PMID:38678464
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9575 | 2024-08-26 |
Mitochondrial DNA Leakage Promotes Persistent Pancreatic Acinar Cell Injury in Acute Pancreatitis via the cGAS-STING-NF-κB Pathway
2024-Aug-24, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02132-0
PMID:39180578
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研究论文 | 研究探讨了线粒体DNA泄漏通过cGAS-STING-NF-κB途径在急性胰腺炎中促进胰腺腺泡细胞损伤的作用 | 首次研究了cGAS-STING途径在胰腺腺泡细胞中的作用及其在急性胰腺炎中的潜在炎症机制 | NA | 探讨cGAS-STING途径在胰腺腺泡细胞中的作用及其在急性胰腺炎中的机制 | 急性胰腺炎患者的血浆和胰腺腺泡细胞 | NA | 急性胰腺炎 | 数字PCR, 单细胞测序 | NA | 血浆, 细胞 | 50名急性胰腺炎患者和10名健康捐赠者的血浆, 以及小鼠和细胞模型 |
| 9576 | 2024-08-26 |
Pan-cancer single-cell dissection reveals phenotypically distinct B cell subtypes
2024-Aug-22, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.06.038
PMID:39047727
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研究论文 | 本文通过整合来自19种主要癌症类型的649名患者的单细胞RNA测序数据，建立了一个全面的人类B细胞资源，并揭示了肿瘤浸润B细胞（TIBs）的组成和表型特征的显著异质性 | 本文首次识别出应激反应记忆B细胞和肿瘤相关非典型B细胞（TAABs），这两种肿瘤富集亚群具有预后潜力，并在泛癌种中共享 | NA | 深入理解B细胞在癌症发展中的作用 | 肿瘤浸润B细胞（TIBs）的组成和表型特征 | 数字病理学 | 泛癌种 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 649名患者 |
| 9577 | 2024-08-26 |
Prognositic value of anoikis and tumor immune microenvironment-related gene in the treatment of osteosarcoma
2024-May-28, Zhong nan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Central South University. Medical sciences
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研究论文 | 本研究探讨了与肿瘤免疫微环境相关的细胞凋亡（anoikis）基因在骨肉瘤治疗中的预后价值 | 首次在骨肉瘤中研究了anoikis及其与肿瘤免疫微环境的关系，并构建了基于这些基因的预后模型 | NA | 阐明anoikis及肿瘤免疫微环境相关基因在骨肉瘤治疗中的预后价值 | 骨肉瘤患者及其肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）算法 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 51个与肿瘤微环境密切相关的关键anoikis相关基因（ANRGs） |
| 9578 | 2024-08-26 |
Identification and validation of a seven-gene prognostic marker in colon cancer based on single-cell transcriptome analysis
2022-04, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.12041
PMID:35352485
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，在结肠癌中识别并验证了一个包含七个基因的预后标志物。 | 通过单细胞RNA测序技术，本研究首次识别并验证了一个包含七个基因的预后标志物，为结肠癌的预后预测提供了新的潜在标志物。 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术识别并验证结肠癌的预后标志物。 | 结肠癌患者的单细胞RNA测序数据、体细胞变异数据和临床报告。 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Cox回归分析和最小绝对收缩与选择算子方法 | 转录组数据 | 结肠癌患者的数据，包括治疗前后的样本 |
| 9579 | 2024-08-26 |
Prime-seq, efficient and powerful bulk RNA sequencing
2022-03-31, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02660-8
PMID:35361256
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研究论文 | 本文优化并验证了一种早期条形码批量RNA测序方法——prime-seq，展示了其与标准批量RNA测序方法TruSeq性能相当，但成本效率高出四倍 | prime-seq方法通过早期条形码技术，实现了成本效率的显著提升，且库成本降低了近50倍 | NA | 优化和验证一种成本效率高的早期条形码批量RNA测序方法 | prime-seq方法的性能和成本效率 | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 9580 | 2024-08-26 |
Decoding the multicellular ecosystem of vena caval tumor thrombus in clear cell renal cell carcinoma by single-cell RNA sequencing
2022-03-31, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02651-9
PMID:35361264
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了8名透明细胞肾细胞癌（ccRCC）患者的19个手术组织样本，揭示了肿瘤血栓形成的多细胞生态系统及其机制。 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了肿瘤血栓中的细胞类型和它们之间的相互作用，特别是肿瘤血栓中CD8+ T细胞和巨噬细胞的特征。 | 研究样本量较小，仅包括8名患者，可能影响结果的普遍性。 | 深入了解肿瘤血栓形成的机制，为设计有效的辅助治疗提供依据。 | 透明细胞肾细胞癌患者的肿瘤血栓组织。 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 19个手术组织样本来自8名患者 |