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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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9541 | 2024-08-20 |
Aging of the Hematopoietic Stem Cell Niche: New Tools to Answer an Old Question
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.738204
PMID:34858399
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综述 | 本文综述了骨髓微环境老化对造血干细胞(HSC)功能的影响,并介绍了用于研究老化过程中骨髓微环境特定改变的新工具 | 文章介绍了跨学科方法开发的新技术工具,如特定的小鼠模型、共培养系统、新的三维成像工具、骨化小体和模拟骨髓系统,以及单细胞测序技术、空间转录组学和人工智能深度学习方法在数据分析和整合中的应用 | NA | 探讨骨髓微环境老化对造血干细胞功能的影响,并介绍用于研究老化过程中骨髓微环境特定改变的新工具 | 造血干细胞(HSC)及其微环境 | NA | NA | 单细胞测序技术、空间转录组学、人工智能和深度学习 | NA | NA | NA |
9542 | 2024-08-20 |
Single-Cell Sequencing Reveals Differential Cell Types in Skin Tissues of Liaoning Cashmere Goats and Key Genes Related Potentially to the Fineness of Cashmere Fiber
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.726670
PMID:34858469
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和计算模型,在辽宁绒山羊的皮肤组织中鉴定了13种皮肤细胞类型,并分析了与绒毛形成相关的细胞簇中的枢纽基因 | 首次在单细胞水平上揭示了辽宁绒山羊皮肤组织中与绒毛细度相关的细胞类型和关键基因 | NA | 探究绒毛细度在细胞水平的调控机制 | 辽宁绒山羊的皮肤组织 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | 计算模型 | 基因表达数据 | NA |
9543 | 2024-08-20 |
The Potential Prognostic Role of Oligosaccharide-Binding Fold-Containing Protein 2A (OBFC2A) in Triple-Negative Breast Cancer
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.751430
PMID:34868954
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研究论文 | 本研究旨在通过分析乳腺癌蛋白质组和转录组数据集,探讨三阴性乳腺癌(TNBC)的潜在预后标志物 | 发现OBFC2A蛋白在三阴性乳腺癌中具有独立的预后标志物作用,并与其免疫功能相关 | NA | 探讨三阴性乳腺癌的潜在预后标志物 | 三阴性乳腺癌患者的预后 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 蛋白质组和转录组数据 | 来自CPTAC的六种候选蛋白质,以及来自METABRIC的数据集 |
9544 | 2024-08-19 |
HAO2 protects from proximal tubular cells injured in rats with chronic kidney disease by promoting fatty acid metabolic processes
2024-Oct, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167342
PMID:39002705
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研究论文 | 本研究使用单细胞转录组测序技术,对正常对照组和慢性肾脏病(CKD)大鼠的血液和肾脏组织细胞进行测序和分析,重点关注关键细胞群和功能富集,以探索CKD的发病机制 | 成功建立了CKD大鼠的单细胞转录组图谱,并发现HAO2通过促进脂肪酸代谢过程保护近端小管细胞免受损伤 | NA | 探索慢性肾脏病的发病机制 | 慢性肾脏病大鼠的血液和肾脏组织细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞转录组测序技术 | NA | 细胞 | 正常对照组和慢性肾脏病大鼠的血液和肾脏组织细胞 |
9545 | 2024-08-19 |
Lysine lactylation-based insight to understanding the characterization of cervical cancer
2024-Oct, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167356
PMID:39025375
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研究论文 | 本文通过综合蛋白质组学分析,研究了赖氨酸乳酸化(Kla)在宫颈癌中的特征和功能 | 首次全面分析了Kla在宫颈癌细胞中的分布和功能,并构建了基于Kla的宫颈癌预后模型 | 研究主要集中在HeLa细胞系,可能需要进一步在更多样化的细胞系和临床样本中验证 | 探索赖氨酸乳酸化在宫颈癌中的特征和功能,为治疗提供潜在途径 | 宫颈癌细胞中的赖氨酸乳酸化位点和相关蛋白 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 蛋白质组学分析 | NA | 蛋白质组、转录组和单细胞转录组数据 | 3633个Kla位点,1637种蛋白质 |
9546 | 2024-08-19 |
Single-cell analysis identifies critical regulators of spermatogonial development and differentiation in cattle-yak bulls
2024-Sep, Journal of dairy science
IF:3.7Q2
DOI:10.3168/jds.2023-24442
PMID:38642661
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了牦牛和牛-牦牛杂交种在睾丸细胞组成和生精细胞发育轨迹上的差异 | 首次在单细胞水平上获得了不同生殖细胞和睾丸体细胞的转录组特征,并识别了牦牛和无生育能力牛-牦牛的生精细胞分化和减数分裂的关键调控因子 | NA | 探讨导致牛科物种杂交不育和物种形成的遗传机制 | 牦牛和牛-牦牛杂交种的生精细胞发育和分化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
9547 | 2024-08-19 |
Requirement of Pdgfrα+ cells for calvarial bone repair
2024-Aug-16, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szae041
PMID:38986535
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研究论文 | 本文研究了血小板衍生生长因子受体α(PDGFRα)阳性细胞在颅骨修复中的作用 | 首次详细探讨了PDGFRα阳性间充质细胞在颅骨愈合过程中的贡献 | NA | 探究PDGFRα阳性间充质细胞在颅骨修复中的作用 | PDGFRα阳性间充质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 细胞 | 使用Pdgfrα-CreERTM;mT/mG报告动物模型进行研究 |
9548 | 2024-08-19 |
Nanos2 marks precursors of somatic lineages and is required for germline formation in the sea anemone Nematostella vectensis
2024-Aug-16, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ado0424
PMID:39151009
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研究论文 | 本文研究了海葵Nematostella vectensis中Nanos2基因在体细胞系和生殖细胞形成中的作用 | 通过转基因报告基因和单细胞转录组学,识别了表达生殖细胞相关标记的细胞群,并发现Nanos2基因对生殖细胞形成至关重要 | NA | 旨在描述海葵中保守的干细胞标记基因 | 海葵Nematostella vectensis中的干细胞系统 | NA | NA | 转基因报告基因和单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
9549 | 2024-08-19 |
Exploring the molecular mechanisms and shared potential drugs between rheumatoid arthritis and arthrofibrosis based on large language model and synovial microenvironment analysis
2024-08-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-69080-5
PMID:39147768
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研究论文 | 本研究基于大型语言模型和滑膜微环境分析,探索类风湿性关节炎和关节纤维化的分子机制及潜在共享药物 | 本研究采用文本挖掘方法和药物再定位技术,发现并验证了针对类风湿性关节炎和关节纤维化的新型潜在药物 | NA | 旨在全面分析类风湿性关节炎和关节纤维化之间的关系,并识别新的临床用药 | 类风湿性关节炎和关节纤维化 | NA | 类风湿性关节炎,关节纤维化 | 文本挖掘,单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 5个批量测序数据集和4个单细胞测序数据集 |
9550 | 2024-08-19 |
Janus liposozyme for the modulation of redox and immune homeostasis in infected diabetic wounds
2024-Aug, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-024-01660-y
PMID:38740936
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研究论文 | 本文报道了一种名为Janus脂酶的新型治疗剂,用于治疗糖尿病伤口感染并促进伤口愈合 | 开发了一种包含脂质体样硒酶的Janus脂酶,用于清除活性氧(ROS)以恢复组织氧化还原和免疫稳态,并结合光动力疗法治疗感染 | NA | 研究Janus脂酶在治疗糖尿病伤口感染和促进伤口愈合中的应用 | 糖尿病伤口感染及伤口愈合过程 | NA | 糖尿病 | 光动力疗法 | NA | RNA序列 | 使用T细胞缺陷的Rag1小鼠和迷你猪进行实验 |
9551 | 2024-08-19 |
Complex immune microenvironment of chordoma: a road map for future treatment
2024-Jun-21, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009313
PMID:38908855
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和批量RNA测序等技术,深入分析了脊索瘤的复杂免疫微环境,并探讨了免疫治疗在该疾病中的应用前景 | 首次采用单细胞RNA测序和批量RNA测序技术,结合CellChat和基因集变异分析,全面解析了脊索瘤的免疫微环境 | 研究样本量较小,仅包括126名脊索瘤患者和6名患者的单细胞RNA测序数据 | 探讨脊索瘤的免疫微环境特征及其对免疫治疗效果的影响 | 脊索瘤的免疫微环境及其对患者预后的影响 | 数字病理学 | 脊索瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序(RNA-seq) | NA | RNA | 126名脊索瘤患者和6名患者的单细胞RNA测序数据 |
9552 | 2024-08-19 |
Diminished function of cytotoxic T- and NK- cells in severe alcohol-associated hepatitis
2022-Dec, Metabolism and target organ damage
DOI:10.20517/mtod.2022.13
PMID:39148503
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研究论文 | 本研究探讨了严重酒精相关肝炎(sAH)患者中细胞毒性T细胞和NK细胞的功能减退及其机制 | 首次使用单细胞RNA测序和多面板细胞内流式细胞术分析sAH患者和健康对照者的外周血单个核细胞(PBMCs),揭示了NK细胞和CD8 T细胞中关键受体的下调 | 样本量较小,仅为4例sAH患者和7-8例健康对照者 | 理解代谢性肝病患者免疫反应的机制,特别是sAH患者中细胞毒性细胞的功能减退 | 严重酒精相关肝炎患者的细胞毒性NK细胞和CD8 T细胞 | 免疫学 | 酒精相关肝炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),多面板细胞内流式细胞术 | NA | RNA | 4例sAH患者和7-8例健康对照者 |
9553 | 2024-08-19 |
Single-cell RNA sequencing to characterize the response of pancreatic cancer to anti-PD-1 immunotherapy
2022-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2021.101262
PMID:34768100
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研究论文 | 本研究通过建立四种不同胰腺癌细胞系的原位胰腺癌小鼠模型,利用单细胞RNA测序技术分析了αPD-1抗体治疗对胰腺癌的响应,揭示了肿瘤微环境中免疫细胞的差异及其与免疫治疗响应的关系 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了胰腺癌对αPD-1免疫治疗的响应机制,特别是肿瘤相关巨噬细胞与效应CD8 T细胞的失衡对治疗响应的影响 | 研究仅限于小鼠模型,需要进一步在临床样本中验证这些发现 | 探究胰腺癌对αPD-1免疫治疗的响应机制 | 胰腺癌及其对αPD-1免疫治疗的响应 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四种不同胰腺癌细胞系的原位胰腺癌小鼠模型 |
9554 | 2024-08-19 |
Thymus-Derived CD4+CD8+ Cells Reside in Mediastinal Adipose Tissue and the Aortic Arch
2021-12-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100208
PMID:34740961
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、流式细胞术和三维全装图像技术,发现并证实了在胸腺、纵隔脂肪组织和主动脉外膜中存在双阳性CD4CD8αβ细胞(DP细胞),并探讨了这些细胞的转录特征及其在血管稳态中的潜在作用 | 发现了在健康和动脉粥样硬化小鼠模型中,除了胸腺外,纵隔脂肪组织和主动脉外膜中也存在双阳性CD4CD8αβ细胞,这些细胞具有独特的转录特征 | 研究主要集中在小鼠模型上,未来需要进一步的人体研究来验证这些发现 | 探讨双阳性CD4CD8αβ细胞在不同组织中的分布及其在血管稳态中的作用 | 双阳性CD4CD8αβ细胞在胸腺、纵隔脂肪组织和主动脉外膜中的分布及转录特征 | 免疫学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、三维全装图像技术 | NA | 细胞 | 健康和动脉粥样硬化小鼠模型 |
9555 | 2024-08-19 |
Stem/progenitor cells in normal physiology and disease of the pancreas
2021-12-01, Molecular and cellular endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1016/j.mce.2021.111459
PMID:34543699
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综述 | 本文综述了胚胎期和成年期胰腺干细胞/祖细胞在稳态和疾病中的研究进展 | 结合最新的测序技术、谱系追踪和类器官技术,探讨了成年胰腺中干细胞/祖细胞的存在及其在稳态和应激反应中的作用 | 由于实验结果的矛盾性,成年胰腺中干细胞/祖细胞的存在仍存在争议 | 探讨胰腺干细胞/祖细胞在正常生理和疾病中的作用 | 胚胎期和成年期的胰腺干细胞/祖细胞 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
9556 | 2024-08-19 |
A transposon expression burst accompanies the activation of Y-chromosome fertility genes during Drosophila spermatogenesis
2021-11-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27136-4
PMID:34824217
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研究论文 | 本研究通过重新分析公开的单细胞RNA测序数据,量化了果蝇睾丸中不同细胞类型的转座子表达,并开发了一种方法来识别转座子和宿主基因表达模块 | 发现了在果蝇精子发生过程中,转座子表达爆发与Y染色体生育基因激活的关联,并揭示了特定细胞群中转座子表达的特异性 | NA | 研究果蝇睾丸中转座子活动和宿主沉默机制 | 果蝇睾丸中不同细胞类型的转座子表达 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 公开数据集中的多个样本 |
9557 | 2024-08-19 |
Cell type identification from single-cell transcriptomes in melanoma
2021-11-17, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-021-01118-3
PMID:34784909
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研究论文 | 本文提出了一种基于单细胞基因和长非编码RNA表达水平的计算框架,用于从单细胞转录组中识别黑色素瘤中的细胞类型 | 该方法充分考虑了细胞脱落特性,通过定义细胞的脱落特征和脱落簇,构建差异共表达网络并识别差异模块,最终基于这些差异模块识别细胞类型 | NA | 探索黑色素瘤相关的关键细胞类型的分子机制,为黑色素瘤研究提供见解 | 单细胞转录组数据中的细胞类型 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 应用该方法于单细胞黑色素瘤数据,识别出八种细胞类型 |
9558 | 2024-08-19 |
Single-cell RNA sequencing reveals differential cell cycle activity in key cell populations during nephrogenesis
2021-11-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-01790-6
PMID:34789782
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了胚胎期14.5天小鼠肾脏发育过程中的基因表达,揭示了关键细胞群体中细胞周期活动的差异 | 本研究首次在单细胞水平上揭示了肾脏发育过程中“准备”和“自我更新”的肾单位前体细胞亚群之间的细胞周期活动差异,并发现了不成熟远端小管中细胞周期相关基因的增强表达 | NA | 深入理解驱动肾脏发育的分子机制,为设计增强肾脏修复和再生的策略提供依据 | 小鼠胚胎期14.5天的肾脏发育过程 | 数字病理学 | 儿童慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 胚胎期14.5天的小鼠肾脏样本 |
9559 | 2024-08-19 |
Single-cell sequencing of rotavirus-infected intestinal epithelium reveals cell-type specific epithelial repair and tuft cell infection
2021-11-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2112814118
PMID:34732579
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研究论文 | 本研究利用已知的肠道病毒(轮状病毒),该病毒损害绒毛顶端的上皮细胞但不直接损害肠道干细胞,探索了肠道上皮在单细胞水平上的再生转录反应 | 发现特定的细胞亚群表现出增加的细胞周期频率,与上皮隐窝的显著扩张相关,并伴随着未成熟肠细胞数量的增加。意外地发现轮状病毒感染了簇状细胞,并通过干扰素相关途径响应病毒感染 | NA | 理解上皮修复和再生在损伤后的机制,以开发促进快速愈合和恢复正常肠道功能的疗法 | 轮状病毒感染的肠道上皮细胞 | 数字病理学 | 消化疾病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
9560 | 2024-08-19 |
Mechanisms of vascular smooth muscle cell investment and phenotypic diversification in vascular diseases
2021-11-01, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20210138
PMID:34495326
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综述 | 本文综述了血管平滑肌细胞在血管疾病中的投入机制及其表型多样化的研究进展 | 结合克隆系谱追踪和单细胞转录组学技术,揭示了血管病变中血管平滑肌细胞来源细胞的显著多样性 | NA | 探讨血管平滑肌细胞在病理血管重塑中的调控机制,并讨论开发治疗策略的可能性 | 血管平滑肌细胞及其在血管疾病中的作用 | NA | 心血管疾病 | 克隆系谱追踪、单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |