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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 9541 - 9560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9541 | 2025-10-07 |
uHAF: a unified hierarchical annotation framework for cell type standardization and harmonization
2025-Mar-29, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf149
PMID:40172934
|
研究论文 | 开发了一个统一的层次注释框架uHAF，用于单细胞转录组学中的细胞类型标准化和协调 | 提出了包含器官特异性层次细胞类型树和基于大语言模型的映射工具的统一框架，首次系统解决了单细胞注释中的命名不一致和粒度差异问题 | NA | 解决单细胞转录组学中细胞类型注释不一致的问题，促进数据整合和机器学习应用 | 38个器官的细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学，大语言模型 | GPT-4 | 文本注释数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9542 | 2025-10-07 |
Molecular evidence for pre-chordate origins of ovarian cell types and neuroendocrine control of reproduction
2025-Mar-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.24.644836
PMID:40196654
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研究论文 | 本研究通过海星卵巢单细胞测序和3D成像揭示了卵巢细胞类型及其空间组织，为卵巢细胞类型和生殖神经内分泌控制的脊索动物前起源提供了分子证据 | 首次在非脊索动物后口动物中发现与哺乳动物相似的卵巢细胞类型和类下丘脑-垂体-性腺轴的神经内分泌信号系统 | 研究仅基于海星这一特定物种，需要在更多物种中验证这些发现的普适性 | 探究卵巢细胞类型及其信号相互作用的进化起源 | 海星卵巢细胞类型及其空间组织 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 高分辨率3D成像 | NA | 单细胞转录组数据, 3D图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9543 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing analysis reveals the essential role of the m 6A reader YTHDF1 in retinal visual function by regulating TULP1 and DHX38 translation
2025-Mar-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析揭示m6A阅读器YTHDF1通过调控TULP1和DHX38翻译在视网膜视觉功能中的关键作用 | 首次发现YTHDF1在成熟视网膜功能维持中的新作用，揭示其通过识别m6A修饰直接调控视网膜变性相关基因TULP1和DHX38翻译的新机制 | 研究主要基于基因敲除模型，在人类视网膜疾病中的直接应用仍需进一步验证 | 探究m6A阅读器YTHDF1在视网膜功能维持中的分子机制 | 小鼠视网膜组织及视网膜细胞 | 单细胞生物学 | 视网膜变性疾病 | 单细胞RNA测序, MeRIP测序, RIP测序 | 基因敲除模型 | 单细胞转录组数据, 表观转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 甲基化RNA免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 9544 | 2025-10-07 |
Integrated single-cell transcriptomic map of pig kidney cells across various periods and anatomical sites
2025-Mar-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建了猪肾脏在不同时期和不同解剖部位的单细胞转录组图谱 | 首次系统构建了猪肾脏跨胚胎期、育肥期和妊娠期的单细胞转录组图谱，发现了近端小管细胞代谢相关转录因子的表达特征，并揭示了厚壁升支细胞亚群和肾脏驻留巨噬细胞的功能异质性 | 研究样本数量有限（12个样本），且仅针对猪模型，人类肾脏验证数据相对较少 | 构建猪肾脏单细胞转录组图谱，研究肾脏细胞在不同生理时期和不同解剖部位的功能异质性 | 猪肾脏细胞 | 单细胞组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序，荧光同源双标记 | NA | 单细胞转录组数据，组织切片图像 | 138,469个细胞，来自12个猪肾脏样本（涵盖胚胎期、育肥期和妊娠期） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9545 | 2025-10-07 |
Pre-B-cell leukemia transcription factor 1 contributes to liver fibrosis by enabling IL-7 signaling in HSC
2025-Mar-13, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001302
PMID:40080840
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研究论文 | 本研究揭示了前B细胞白血病转录因子1通过激活IL-7信号通路促进肝星状细胞活化和肝纤维化的新机制 | 首次发现PBX1在肝星状细胞活化中的关键作用，并阐明其通过调控IL-7受体表达激活促纤维化信号级联的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床验证数据有限 | 探究PBX1在肝纤维化发生发展中的作用机制 | 肝星状细胞、小鼠模型、肝硬化患者样本 | 分子生物学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序、报告基因检测、染色质免疫沉淀、转录组分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 小鼠模型和肝硬化患者样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9546 | 2025-10-07 |
Mechanistic elucidation of human pancreatic acinar development using single-cell transcriptome analysis on a human iPSC differentiation model
2025-02-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-88690-1
PMID:39920294
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究人iPSC分化模型中胰腺腺泡细胞的发育机制 | 首次在hiPSC分化模型中鉴定REG4作为胰腺腺泡祖细胞标志物，并发现cAMP信号通路在腺泡细胞分化中的关键作用 | 研究依赖于小鼠体内分化模型，体外分化效率仍需优化 | 阐明胰腺外分泌腺泡谱系的发育机制，建立hiPSC定向分化为胰腺腺泡细胞的方法 | 人诱导多能干细胞分化的胰腺腺泡细胞 | 单细胞组学 | 胰腺外分泌疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9547 | 2025-10-07 |
Integration of scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq Identifies Circadian Rhythm Disruption-Related Genes Associated with Prognosis and Drug Resistance in Colorectal Cancer Patients
2025, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S499806
PMID:40241740
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量RNA测序数据，鉴定与结直肠癌预后和耐药相关的昼夜节律紊乱基因 | 首次系统揭示昼夜节律相关基因在结直肠癌中的表达特征及其与肿瘤进展和免疫治疗反应的关系 | NA | 探索昼夜节律相关基因在结直肠癌中的作用机制及其临床意义 | 结直肠癌患者样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, WGCNA, GSEA | 预后模型 | 基因表达数据 | GSE178318数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 9548 | 2025-10-07 |
An Integrative Analysis of Transcriptome Combined with Machine Learning and Single-Cell RNA-Seq for the Common Biomarkers in Crohn's Disease and Kidney Stone Disease
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S502513
PMID:40242727
|
研究论文 | 通过整合转录组分析结合机器学习和单细胞RNA测序技术，鉴定克罗恩病和肾结石病的共同生物标志物 | 首次整合机器学习算法和单细胞RNA测序技术识别克罗恩病与肾结石病的共同生物标志物 | 研究基于公共数据库数据，样本量有限，需要进一步实验验证 | 识别能够预测克罗恩病合并肾结石病的生物标志物 | 克罗恩病和肾结石病患者数据及人肠道细胞和近端肾小管上皮细胞模型 | 生物信息学 | 克罗恩病,肾结石病 | 转录组分析,机器学习,单细胞RNA测序 | Limma,WGCNA,机器学习算法 | 基因表达数据 | 三个克罗恩病数据集和一个肾结石病数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9549 | 2025-10-07 |
Cross one single body 49 tissues single-cell transcriptome reveals detailed macrophage heterogeneity during pig pregnancy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1574120
PMID:40242774
|
研究论文 | 通过单头健康怀孕猪49个组织的单细胞转录组测序，揭示妊娠期间巨噬细胞的详细异质性 | 首次在单一个体水平构建了涵盖49个组织的巨噬细胞单细胞转录组图谱，揭示了妊娠期巨噬细胞的跨组织异质性和物种间保守性 | 研究仅基于单一个体，样本量有限，需要在更多个体中验证结果 | 研究妊娠期间巨噬细胞的转录组异质性和组织特异性适应机制 | 健康怀孕猪的巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 妊娠相关生理变化 | 单细胞RNA测序，免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据 | 单头怀孕猪的49个组织，共114,881个巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9550 | 2025-04-19 |
Editorial: Spatial transcriptome and single-cell sequencing for exploring molecular mechanisms of neuroimmunity and discovering novel markers of neurological diseases
2025, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2025.1582019
PMID:40248015
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9551 | 2025-10-07 |
PPARγ-dependent remodeling of translational machinery in adipose progenitors is impaired in obesity
2024-Dec-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114945
PMID:39579770
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和核糖体分析揭示了PPARγ激动剂如何通过调控翻译机制促进肥胖状态下脂肪组织的可塑性 | 首次发现PPARγ直接调控核糖体因子表达并通过促进特定mRNA的翻译选择性来增强脂肪生成 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证 | 探究PPARγ激动剂在肥胖状态下对脂肪组织前体细胞翻译机制的重塑作用 | 肥胖小鼠的基质血管组分细胞 | 单细胞生物学 | 肥胖 | 单细胞RNA测序, 核糖体分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 肥胖小鼠的腹股沟和附睾脂肪组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9552 | 2025-10-07 |
PIEZO-dependent mechanosensing is essential for intestinal stem cell fate decision and maintenance
2024-11-29, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adj7615
PMID:39607940
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研究论文 | 本研究揭示了PIEZO机械敏感通道通过感知细胞外机械刺激调控肠道干细胞命运决定和维持的机制 | 首次在体内证实PIEZO通道在肠道干细胞机械感知中的关键作用，并建立了从机械信号感知到干细胞功能调控的完整机制通路 | 研究主要基于小鼠模型，在人类肠道干细胞中的适用性需要进一步验证 | 探究肠道干细胞如何感知机械信号并维持稳态 | 小鼠肠道干细胞及其微环境 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，小鼠遗传学，生物工程基质，拉伸装置 | NA | 基因表达数据，机械性能测量数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9553 | 2025-10-07 |
Epigenetic dysregulation in Alzheimer's disease peripheral immunity
2024-Apr-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.01.013
PMID:38340719
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了阿尔茨海默病外周免疫系统的表观遗传调控异常 | 首次系统研究AD外周免疫系统的表观遗传变化，发现CD8 T细胞中CXCR3基因启动子的顺式调控元件和单核细胞中AD特异的RELA转录因子结合位点 | 外周免疫系统研究相对有限，样本规模未明确说明 | 探究阿尔茨海默病外周免疫系统的表观遗传和转录调控改变 | 阿尔茨海默病患者的外周免疫细胞（CD8 T细胞和单核细胞） | 表观遗传学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序，转座酶可及染色质测定，RNA测序 | NA | 表观遗传数据，转录组数据 | NA | NA | single-cell ATAC-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 9554 | 2025-10-07 |
Mechanisms of sex differences in Alzheimer's disease
2024-Apr-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.01.024
PMID:38402606
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综述 | 探讨阿尔茨海默病性别差异的潜在生物学机制 | 整合单细胞RNA测序、代谢组学和多组学分析等先进技术，系统研究性别差异在阿尔茨海默病中的作用机制 | NA | 理解阿尔茨海默病性别差异的生物学基础 | 阿尔茨海默病发病机制中的性别相关因素 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 代谢组学, 多组学分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 多组学 | NA | NA |
| 9555 | 2025-10-07 |
Mutation S139N on Zika virus prM protein shifts immune response from Asian to contemporary strain
2025-May, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2025.02.012
PMID:39986659
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研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示寨卡病毒prM蛋白S139N突变如何改变免疫反应模式 | 首次发现S139N单点突变可使亚洲株免疫反应特征转变为当代流行株模式 | 研究仅使用1日龄小鼠模型，未在更成熟动物模型或人体中验证 | 探究寨卡病毒prM蛋白S139N突变对免疫反应的影响 | 寨卡病毒感染的小鼠脑组织免疫细胞 | 单细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1日龄小鼠感染三种寨卡病毒株 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9556 | 2025-10-07 |
CD44+ cells enhance pro-tumor stroma in the spatial landscape of colorectal cancer leading edge
2025-May, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-02968-9
PMID:40069574
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研究论文 | 本研究通过空间转录组和单细胞RNA测序揭示了结直肠癌前缘CD44+肿瘤细胞通过PTN信号重塑肿瘤微环境的机制 | 首次发现CD44+肿瘤细胞在肿瘤前缘通过PTN信号诱导CAFs表型转换，揭示了肿瘤异质性在空间结构上的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床样本验证相对有限 | 探索结直肠癌异质性如何影响肿瘤空间结构并促进疾病进展 | AOM/DSS诱导的结直肠癌小鼠模型和临床患者样本 | 空间转录组学 | 结直肠癌 | 空间转录组分析, 单细胞RNA测序, 伪时间轨迹分析, 细胞间通讯分析, 免疫荧光染色 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | AOM/DSS诱导的结直肠癌模型和临床样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9557 | 2025-10-07 |
Single-cell profiling reveals monocyte heterogeneity and association with liver fibrosis in patients with chronic HBV
2025-May-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000672
PMID:40227083
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示慢性乙型肝炎患者循环单核细胞的异质性及其与肝纤维化的关联 | 首次在慢性乙型肝炎患者中发现单核细胞-血小板聚集体（MPA）亚群，并揭示其通过CCL5信号通路促进肝纤维化的新机制 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证发现；机制研究主要基于体外实验 | 探究慢性乙型肝炎患者循环单核细胞的异质性及其在肝纤维化进展中的作用机制 | 慢性乙型肝炎伴肝纤维化患者和健康对照者的循环单核细胞 | 单细胞组学 | 慢性乙型肝炎、肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 慢性乙型肝炎患者组和健康对照组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9558 | 2025-04-18 |
Identification of Novel Protein Biomarkers for Intrahepatic Cholangiocarcinoma by Integrating Human Plasma Proteome with Genome
2025-Apr-17, Journal of gastrointestinal cancer
IF:1.6Q4
DOI:10.1007/s12029-025-01226-8
PMID:40240670
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研究论文 | 本研究通过整合人类血浆蛋白质组与基因组数据，识别出与肝内胆管癌(ICC)潜在相关的蛋白质生物标志物 | 首次对ICC进行蛋白质组-MR分析，揭示了其复杂的遗传结构，并鉴定出5种与疾病有潜在因果关联的新型血液蛋白 | 研究主要基于欧洲人群数据，可能在其他人群中的普适性有待验证 | 发现ICC的潜在治疗和诊断靶点 | 肝内胆管癌(ICC)相关蛋白质生物标志物 | 生物信息学 | 肝内胆管癌 | 蛋白质组范围孟德尔随机化(MR)、ELISA、scRNA-seq | 孟德尔随机化模型 | 基因组数据、蛋白质组数据、RNA-seq数据 | 来自deCODE血浆蛋白质组GWAS和欧洲meta分析的遗传数据，TCGA和GTEx数据库样本 | NA | NA | NA | NA |
| 9559 | 2025-04-18 |
Single-cell hdWGCNA reveals a novel diagnostic model and signature genes of macrophages associated with chronic obstructive pulmonary disease
2025-Apr-17, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-025-02025-4
PMID:40244418
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和高维加权基因共表达网络分析，揭示了慢性阻塞性肺病（COPD）中巨噬细胞亚群的诊断模型和特征基因 | 首次使用hdWGCNA方法识别与COPD相关的巨噬细胞亚群及其特征基因，并构建了基于机器学习的临床诊断模型 | 研究样本量未明确说明，且仅基于RNA测序数据，缺乏实验验证 | 探索COPD的免疫机制并开发临床诊断模型 | 慢性阻塞性肺病（COPD）患者和正常个体的巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），高维加权基因共表达网络分析（hdWGCNA） | 随机森林（RF），卷积神经网络（CNN） | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9560 | 2025-10-07 |
Human long noncoding RNA VILMIR is induced by major respiratory viral infections and modulates the host interferon response
2025-Apr-15, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00141-25
PMID:40130878
|
研究论文 | 本研究鉴定了一种新型长链非编码RNA VILMIR，发现其在主要呼吸道病毒感染中被诱导表达并调控宿主干扰素反应 | 首次发现并表征了VILMIR这一新型干扰素刺激基因，证明其在多种呼吸道病毒感染中均被上调表达并参与调控宿主抗病毒反应 | 需要进一步的机制研究来阐明VILMIR调控干扰素反应的具体分子机制 | 鉴定在人类主要呼吸道病毒感染中起关键作用的新型lncRNA靶标 | 人类上皮细胞系(A549)、免疫细胞系(SUP-T1、THP-1)、COVID-19患者支气管肺泡灌洗液样本 | 功能基因组学 | 呼吸道病毒感染 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 多种人类细胞系和COVID-19患者样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |