单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 9521 - 9540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9521 | 2025-02-23 |
Decoding cell-cell communication using spatial transcriptomics
2025-May, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-025-00824-3
PMID:39984677
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9522 | 2025-10-07 |
Identification of the crucial roles of BAXhigh NK cells in human derived mesenchymal stem cell therapy for chronic heart failure patients
2025-May, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2025.155924
PMID:40174277
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，揭示了BAX高表达NK细胞在间充质干细胞治疗慢性心力衰竭中的关键作用机制 | 首次发现BAX高表达NK细胞在心力衰竭发病机制中的作用，并阐明间充质干细胞通过抑制BAX表达改善NK细胞功能的治疗机制 | 样本量有限，机制研究仍需进一步实验验证 | 探究间充质干细胞治疗心力衰竭的分子机制 | 慢性心力衰竭患者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 心力衰竭患者治疗前后外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9523 | 2025-10-07 |
Identification of a cancer stem cell-like subpopulation that promotes HCC metastasis
2025-May, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101302
PMID:40242316
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，鉴定并表征了肝细胞癌中促进转移的癌症干细胞样亚群 | 首次在肝细胞癌中鉴定出促进转移的癌症干细胞样亚群，并揭示其通过ICAM1信号通路诱导免疫抑制微环境的新机制 | 样本量相对有限（19例单细胞RNA测序样本和12例空间转录组样本），需要更大规模研究验证 | 探索癌症干细胞在肝细胞癌转移中的作用机制 | 肝细胞癌患者肿瘤组织中的癌症干细胞样细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 生物信息学分析, 免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 临床队列数据 | 19例肝细胞癌样本（单细胞RNA测序）, 12例肝细胞癌样本（空间转录组）, 9个临床队列 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9524 | 2025-04-19 |
Single-Cell Transcriptomics Revealed E-Cigarettes-Induced Vascular Remodeling by Enhancing Tcf21 Expression
2025-May, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70183
PMID:40248042
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9525 | 2025-10-07 |
CRISPR/Cas9-mediated SHP-1-knockout T cells combined with simvastatin enhances anti-tumor activity in humanized-PDX HCC model
2025-Apr-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112266
PMID:40241752
|
研究论文 | 本研究通过CRISPR/Cas9敲除SHP-1的CD8 T细胞联合辛伐他汀治疗，增强了对肝细胞癌的抗肿瘤活性 | 首次将CRISPR编辑的SHP-1敲除T细胞与HMGCR抑制剂辛伐他汀联合使用，通过双重策略克服肝癌免疫治疗耐药性 | 研究基于人源化PDX模型，尚未进行临床试验验证 | 开发增强肝细胞癌免疫治疗疗效的新策略 | 肝细胞癌患者T细胞、人源化PDX肝癌模型 | 癌症免疫治疗 | 肝细胞癌 | CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、转录组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9526 | 2025-10-07 |
CXCR4+ PD-L1+ neutrophils are increased in non-survived septic mice
2025-Apr-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112083
PMID:40241761
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析脓毒症小鼠免疫细胞，揭示CXCR4+ PD-L1+中性粒细胞在非存活小鼠中增加的现象 | 首次发现非存活脓毒症小鼠血液中未成熟CXCR4+ PD-L1+中性粒细胞频率增加，并鉴定该细胞群作为治疗靶点的潜力 | 研究仅限于CLP脓毒症小鼠模型，未在人类患者中验证 | 探究中性粒细胞在脓毒症高炎症表型中的免疫学机制 | 存活和非存活的CLP脓毒症小鼠 | 免疫学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 脓毒症小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9527 | 2025-10-07 |
Circular RNA discovery with emerging sequencing and deep learning technologies
2025-Apr-17, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02157-7
PMID:40247051
|
综述 | 本文总结了环状RNA发现、表征和功能分析算法的最新突破 | 整合长读长和单细胞RNA测序技术与深度学习算法，以前所未有的分辨率和规模研究环状RNA | 整合大规模环状RNA测序数据仍面临挑战 | 探索环状RNA在基因调控和疾病发病机制中的作用 | 环状RNA分子 | 自然语言处理 | NA | 长读长测序, 单细胞RNA测序 | 深度学习 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9528 | 2025-10-07 |
Bulk RNA-seq conjoined with ScRNA-seq analysis reveals the molecular characteristics of nucleus pulposus cell ferroptosis in rat aging intervertebral discs
2025-Apr-17, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-025-03550-7
PMID:40247370
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq分析，揭示了大鼠衰老椎间盘中髓核细胞铁死亡的分子特征 | 首次结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq技术系统鉴定髓核细胞铁死亡的关键驱动因子和细胞亚群特征 | 研究仅在大鼠模型中进行，需要进一步在人类样本中验证 | 明确椎间盘退变过程中髓核细胞铁死亡的关键驱动因子和细胞亚群特征 | 大鼠尾椎间盘的髓核组织和细胞 | 单细胞组学 | 椎间盘退变 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 普鲁士蓝染色, 荧光探针检测 | NA | 基因表达数据, 组织染色图像 | 10月龄和20月龄大鼠椎间盘组织 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9529 | 2025-10-07 |
Progranulin deficiency in the brain: the interplay between neuronal and non-neuronal cells
2025-Apr-16, Translational neurodegeneration
IF:10.8Q1
DOI:10.1186/s40035-025-00475-8
PMID:40234992
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综述 | 本文综述了颗粒蛋白前体缺乏在脑部疾病中的作用机制，重点关注神经元与非神经元细胞之间的相互作用 | 系统阐述了颗粒蛋白前体缺乏导致神经退行性病变的非细胞自主机制，特别关注脂滴积累小胶质细胞和髓鞘脂质含量改变等新发现 | NA | 探讨颗粒蛋白前体缺乏如何通过不同脑细胞群体及其异常相互作用导致额颞叶痴呆的神经退行性变和神经炎症 | 神经元、小胶质细胞、星形胶质细胞、少突胶质细胞、内皮细胞和周细胞等脑部细胞群体 | 神经科学 | 额颞叶痴呆 | 单细胞转录组学、诱导多能干细胞技术、基因工程器官样体 | NA | 患者脑组织、生物体液、体外模型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9530 | 2025-10-07 |
Senescence-induced p21high macrophages contributed to CD8+ T cells-related immune hyporesponsiveness in kidney transplantation via Zfp36/IL-27 axis
2025-Apr-15, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-025-00784-2
PMID:40234384
|
研究论文 | 本研究揭示了衰老诱导的p21高表达巨噬细胞通过Zfp36/IL-27轴抑制CD8+ T细胞功能，从而减轻肾移植排斥反应的机制 | 首次发现衰老相关巨噬细胞通过Zfp36调控IL-27表达影响CD8+ T细胞功能的免疫抑制机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床验证仍需进一步开展 | 探究衰老免疫系统对肾移植排斥反应的影响机制 | 肾移植受者和小鼠移植模型 | 免疫学 | 肾移植排斥反应 | 单细胞转录组分析，基因敲除，siRNA沉默，中和抗体 | 小鼠肾移植模型，条件性基因敲除模型 | 临床数据，单细胞转录组数据，体外功能实验数据 | 来自中国和德国两个医疗中心的临床数据，小鼠移植模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9531 | 2025-10-07 |
Redefining the high variable genes by optimized LOESS regression with positive ratio
2025-Apr-15, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06112-5
PMID:40234751
|
研究论文 | 开发了一种基于优化LOESS回归的单细胞RNA测序特征选择算法 | 利用优化的局部加权散点平滑回归精确捕捉基因平均表达水平与阳性比率的关系，同时最小化过拟合 | NA | 提高单细胞RNA测序数据的特征选择效果 | 单细胞RNA测序数据中的高变基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | LOESS回归 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 9532 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic dynamics of scallop heart reveals the heterogeneous response to heat stress
2025-Apr-15, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02210-1
PMID:40234911
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了扇贝心脏在热应激下的异质性响应机制 | 首次在开放循环系统动物中揭示心室肌细胞和心房肌细胞对热应激的差异化响应模式，并鉴定出关键热响应基因PLRP2-like | 研究仅针对单一物种，未涉及其他开放循环系统动物的比较分析 | 探究开放循环系统动物心脏对高温应激的细胞异质性响应机制 | 软体动物模型Argopecten irradians（扇贝）的心脏组织 | 单细胞生物学 | 热应激反应 | 单细胞RNA测序，RNA干扰 | NA | 单细胞转录组数据，形态学数据，代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9533 | 2025-10-07 |
Patterns of hemolysis, erythropoiesis, and iron distribution define unique disease trajectories in three mouse models of genetic anemia
2025-Apr-15, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2025.104787
PMID:40245977
|
研究论文 | 本研究系统比较了三种遗传性贫血小鼠模型的溶血模式、红细胞生成和铁分布特征 | 首次通过综合比较三种常见遗传性贫血模型，揭示了它们在溶血模式、铁代谢和红细胞生成方面的独特疾病轨迹 | 研究仅限于小鼠模型，结果向人类疾病的转化需要进一步验证 | 阐明不同遗传性贫血模型的病理生理差异，为疾病研究和治疗开发提供模型选择依据 | 镰状细胞病、β-地中海贫血和遗传性球形红细胞增多症的小鼠模型 | 血液病研究 | 遗传性贫血 | 单细胞RNA测序, 铁同位素示踪 | NA | 基因表达数据, 代谢数据 | 三种遗传性贫血小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9534 | 2025-10-07 |
Unveiling hypoxia-related prognostic and immunotherapeutic biomarkers in lung adenocarcinoma through single-cell and bulk RNA sequencing: Including insights into PGF
2025-Apr-12, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143056
PMID:40228772
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和bulk RNA测序揭示肺腺癌中缺氧相关的预后和免疫治疗生物标志物 | 识别了与晚期肺腺癌相关的新细胞亚型，发现了高缺氧评分的细胞亚型模块，构建了基于缺氧相关分子簇的新型预后特征 | 样本量相对较小(15例患者)，机制研究仍需进一步验证 | 探索缺氧微环境与免疫抵抗相互作用的机制 | 肺腺癌患者肿瘤微环境中的细胞亚型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 空间转录组分析 | 预后特征模型 | RNA测序数据, 空间转录组数据 | 15例肺腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 9535 | 2025-10-07 |
scAMZI: attention-based deep autoencoder with zero-inflated layer for clustering scRNA-seq data
2025-Apr-07, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11511-2
PMID:40197174
|
研究论文 | 提出一种基于注意力自编码器和零膨胀层的深度学习模型scAMZI，用于单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 结合SimAM注意力模块、自编码器、ZINB模型和零膨胀层，能够充分挖掘细胞特征并处理数据中的零值问题 | NA | 开发更有效的单细胞RNA测序数据聚类方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 注意力自编码器, 深度学习 | 基因表达数据 | 14个基准数据集，包含数百至数万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9536 | 2025-10-07 |
Decoding B Cells in Autoimmune Diseases Through ScRNA + BCR-Seq: Current Knowledge and Future Directions
2025-04-03, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14070539
PMID:40214492
|
综述 | 系统总结单细胞RNA测序与B细胞受体测序技术在自身免疫疾病B细胞研究中的应用与前景 | 首次整合分析B细胞亚群转录组与BCR克隆的动态关联，并聚焦双BCR B细胞和B/T双表型细胞在自身免疫中的特殊作用 | NA | 推动自身免疫疾病多组学研究和精准治疗范式的创新 | 自身免疫疾病中的B细胞及其受体 | 自然语言处理 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞B细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据, BCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞BCR-seq | NA | NA |
| 9537 | 2025-10-07 |
Lipid metabolism-related genes are involved in the formation of macrophage extracellular traps in allergic airway inflammation
2025-Apr, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00319-5
PMID:39789299
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证揭示了脂质代谢基因ABCA1在巨噬细胞胞外诱捕网形成中的作用 | 首次发现脂质代谢基因ABCA1参与巨噬细胞胞外诱捕网的形成过程 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仍需进一步完善 | 探究脂质代谢在过敏性气道炎症中巨噬细胞胞外诱捕网形成的作用机制 | 巨噬细胞和哮喘患者样本 | 生物信息学 | 哮喘 | WGCNA, LASSO回归, 免疫浸润分析, 单细胞转录组分析, 免疫荧光, SYTOX Green染色, Western blot | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 多个GEO数据集(GSE40885, GSE42606, GSE27066, GSE137268, GSE256534)和Tabula Muris数据库 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 9538 | 2025-10-07 |
Comprehensive analysis of autophagy status and its relationship with immunity and inflammation in ischemic stroke through integrated transcriptomic and single-cell sequencing
2025-Apr, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00320-y
PMID:39827328
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研究论文 | 通过整合转录组和单细胞测序技术，全面分析缺血性脑卒中中自噬状态及其与免疫和炎症的关系 | 首次系统揭示缺血性脑卒中患者自噬状态受抑制，发现两种具有不同基因表达模式和免疫细胞浸润的IS亚型，并通过单细胞测序证实过氧化物酶体自噬下调 | 研究结果仍需在更大规模队列中进一步验证，自噬相关基因的具体调控机制有待深入探索 | 探究自噬和自噬相关基因在缺血性脑卒中中的作用机制 | 缺血性脑卒中患者和IS小鼠模型 | 生物信息学 | 缺血性脑卒中 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 机器学习, WGCNA | 机器学习预测模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | GEO数据库IS数据集、外部验证队列和IS小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 9539 | 2025-10-07 |
Integrative analysis of genetic variability and functional traits in lung adenocarcinoma epithelial cells via single-cell RNA sequencing, GWAS, bayesian deconvolution, and machine learning
2025-Apr, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01621-2
PMID:39992528
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、全基因组关联研究、贝叶斯反卷积和机器学习技术，研究肺腺癌上皮细胞的遗传变异和功能特征 | 首次将单细胞RNA测序与全基因组关联研究通过贝叶斯反卷积和机器学习方法相结合，系统分析肺腺癌上皮细胞的遗传和功能复杂性 | NA | 揭示肺腺癌的遗传和功能复杂性，探索肿瘤进展机制和免疫-上皮细胞相互作用 | 肺腺癌上皮细胞 | 机器学习 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究, 贝叶斯反卷积, 机器学习 | 机器学习模型 | 基因表达数据, 遗传变异数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9540 | 2025-10-07 |
HISSTA: a human in situ single-cell transcriptome atlas
2025-Mar-29, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf142
PMID:40163697
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研究论文 | 介绍HISSTA数据库，该数据库用于存储和分析人类组织原位单细胞分辨率转录组数据 | 首个专门用于管理原位单细胞分辨率转录组数据的综合性数据库，整合了多种空间转录组技术数据 | NA | 构建一个用户友好的空间转录组数据存储和分析平台 | 人类多种组织的空间转录组数据 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 112个样本，2800万个细胞，涵盖16种组织类型，来自63项研究 | 10x Genomics, NanoString, Vizgen | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | Xenium, CosMx SMI, MERFISH | MERFISH, CosMx SMI, Xenium空间转录组技术 |