单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
9521	2024-08-21	An integrated multi-omics analysis reveals osteokines involved in global regulation 2024-May-07, Cell metabolism IF:27.7Q1 DOI:10.1016/j.cmet.2024.03.006 PMID:38574738	研究论文	本研究通过综合多组学分析方法，探讨了骨分泌蛋白（osteokines）在骨代谢和全身稳态中的作用及其调控机制	本研究首次识别了375种候选osteokines及其在衰老和机械加载/卸载条件下的变化，并揭示了它们在骨和其他器官间的通信机制	NA	揭示osteokines的真实身份、细胞来源及其调控机制	骨和非骨骼组织、成骨细胞条件培养基、骨髓上清液和血清中的osteokines	数字病理学	NA	RNA测序、单细胞RNA测序、蛋白质组学	NA	RNA、蛋白质	NA
9522	2024-08-21	Enhancing radiotherapy response via intratumoral injection of the TLR9 agonist CpG to stimulate CD8 T cells in an autochthonous mouse model of sarcoma 2024-Jan-04, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.01.03.573968 PMID:38260522	研究论文	本研究通过使用CRISPR/Cas9和化学致癌物3-甲基胆蒽（MCA）生成具有高肿瘤突变负荷的自体软组织肉瘤模型，探讨了TLR9激动剂CpG与放射治疗（RT）联合使用对肿瘤反应的增强作用及其机制。	首次在自体软组织肉瘤模型中验证了TLR9激动剂CpG与放射治疗联合使用对肿瘤反应的增强作用，并揭示了CD8 T细胞在其中的关键作用。	研究主要在动物模型中进行，需要进一步的临床试验来验证这些发现。	探讨TLR9激动剂CpG与放射治疗联合使用对软组织肉瘤的治疗效果及其机制。	自体软组织肉瘤模型中的肿瘤反应及免疫细胞变化。	数字病理学	软组织肉瘤	CRISPR/Cas9, RNA测序, 质谱细胞术	NA	RNA	多个自体软组织肉瘤模型样本
9523	2024-08-21	The Downregulation of ITGAX Exacerbates Amyloid-β Plaque Deposition in Alzheimer's Disease by Increasing Polarization of M1 Microglia 2024, Journal of Alzheimer's disease : JAD DOI:10.3233/JAD-240118 PMID:38905043	研究论文	本研究探讨了ITGAX下调通过增加M1型小胶质细胞极化加剧阿尔茨海默病中淀粉样β斑块沉积的分子机制	通过单细胞RNA测序和APP/PS1小鼠模型，揭示了ITGAX表达上调与阿尔茨海默病病理过程中的关系	NA	识别阿尔茨海默病中小胶质细胞参与的更精确分子靶点，并探索其潜在机制	ITGAX在阿尔茨海默病中的作用及其对小胶质细胞极化和淀粉样β斑块沉积的影响	神经科学	阿尔茨海默病	单细胞RNA测序	APP/PS1小鼠模型	RNA	使用了来自Gene Expression Omnibus (GEO)数据库的单细胞RNA测序数据
9524	2024-08-21	Role of glycosylation-related gene MGAT1 in pancreatic ductal adenocarcinoma 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1438935 PMID:39156890	研究论文	本文探讨了糖基化相关基因MGAT1在胰腺导管腺癌（PDAC）中的作用	首次揭示了MGAT1通过调节巨噬细胞中的糖基化水平，影响PDAC的进展和预后	需要进一步的研究来开发针对MGAT1的靶向治疗策略	研究MGAT1在PDAC中的作用及其作为治疗靶点的潜力	胰腺导管腺癌（PDAC）细胞和肿瘤微环境	数字病理学	胰腺癌	单细胞RNA测序, 空间转录组学	NA	转录组数据	来自GSE197177和GSE224411的数据, 以及UCSC Xena和TCGA的RNA-seq数据和生存信息
9525	2024-08-21	Advancing precision medicine in gliomas through single-cell sequencing: unveiling the complex tumor microenvironment 2024, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1 DOI:10.3389/fcell.2024.1396836 PMID:39156969	研究论文	本文通过单细胞测序技术深入研究胶质母细胞瘤（GBM）的肿瘤微环境，揭示了肿瘤细胞与周围正常细胞的复杂相互作用	利用单细胞转录组学和空间转录组学技术，精确分类肿瘤微环境中的细胞类型，并探讨了多组学条件下细胞间的相互作用及其对GBM生长的影响	NA	通过深入理解肿瘤微环境中的细胞相互作用，开发新的治疗策略以提高GBM患者的治疗效果	胶质母细胞瘤（GBM）及其肿瘤微环境中的细胞类型和相互作用	数字病理学	脑癌	单细胞转录组学	NA	转录组数据	NA
9526	2024-08-21	Single-Cell RNA Sequencing Reveals a Unique Fibroblastic Subset and Immune Disorder in Lichen Sclerosus Urethral Stricture 2024, Journal of inflammation research IF:4.2Q2 DOI:10.2147/JIR.S466317 PMID:39157587	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了硬化性苔藓尿道狭窄中独特的成纤维细胞亚群及免疫紊乱	发现了一种独特的成纤维细胞亚群Fib7，该亚群仅存在于硬化性苔藓尿道狭窄中，并表现出SAA1和SAA2的高表达水平	NA	旨在深入理解硬化性苔藓尿道狭窄的组织微环境，以助于阐明其发病机制	硬化性苔藓尿道狭窄疾病中的细胞亚群及其转录组特征	数字病理学	尿道疾病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	三名硬化性苔藓尿道狭窄患者和三名非硬化性苔藓尿道狭窄患者
9527	2024-08-21	Human Pancreatic α-Cell Heterogeneity and Trajectory Inference Analysis Using Integrated Single Cell- and Single Nucleus-RNA Sequencing Platforms 2023-Nov-19, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.11.19.567715 PMID:38014078	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq）技术，分析了来自非糖尿病捐赠者的人体胰岛和胰岛移植物中的α细胞和β细胞的异质性和命运转换	首次揭示了人体胰岛中α细胞和β细胞的亚型及其在α-β细胞转换中的具体作用，并发现了多个新的α细胞亚群及其转录组特征	研究主要集中在非糖尿病捐赠者的胰岛和胰岛移植物，未涵盖更多样化的样本，如其他疾病状态下的胰岛	探究人体胰岛中α细胞和β细胞的异质性及其在α-β细胞转换中的具体作用	人体胰岛中的α细胞和β细胞	数字病理学	糖尿病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq）	NA	转录组数据	来自非糖尿病捐赠者的人体胰岛和胰岛移植物
9528	2024-08-21	Gene Expression Nebulas (GEN): a comprehensive data portal integrating transcriptomic profiles across multiple species at both bulk and single-cell levels 2022-01-07, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkab878 PMID:34591957	research paper	本文介绍了一个名为Gene Expression Nebulas（GEN）的综合数据门户，该门户整合了多个物种在批量和单细胞层面的转录组数据	GEN通过使用标准化的数据处理流程和结构化的管理模型，收集了高质量的批量和单细胞RNA测序数据集	NA	旨在提供一个全面的转录组数据集，以更好地理解从组织到细胞的遗传调控结构和功能机制	多个物种的转录组数据	NA	NA	RNA sequencing	NA	transcriptomic profiles	50,500个样本和15,540,169个细胞，涵盖30个物种
9529	2024-08-21	MAB21L1 modulates gene expression and DNA metabolic processes in the lens placode 2021-12-01, Disease models & mechanisms IF:4.0Q1 DOI:10.1242/dmm.049251 PMID:34779479	研究论文	本研究通过电子显微镜和单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了Mab21l1基因敲除小鼠的晶状体外胚层早期单细胞水平表型	首次揭示了MAB21L1在晶状体基板形成过程中调节晶状体特异性基因表达和DNA/核苷酸代谢过程的作用	NA	探究MAB21L1在晶状体基板形成中的作用及其对基因表达和DNA代谢过程的调控	Mab21l1基因敲除小鼠的晶状体外胚层	NA	先天性小脑、眼部、颅面和生殖系统（COFG）综合征	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	131个基因下调，148个基因上调
9530	2024-08-21	Leukotriene B4 Is a Major Determinant of Leukocyte Recruitment During Otitis Media 2021, Frontiers in cellular and infection microbiology IF:4.6Q1 DOI:10.3389/fcimb.2021.768815 PMID:35004347	研究论文	本研究探讨了白三烯B4（LTB4）在急性中耳炎（OM）中的作用，通过基因表达分析和LTB4受体抑制剂的使用，观察了LTB4在炎症细胞招募中的关键作用。	首次详细研究了LTB4在急性中耳炎中的作用，并证明了LTB4受体拮抗剂在治疗OM中的潜在价值。	研究主要集中在LTB4的作用上，未全面探讨其他趋化因子在中耳炎中的作用。	研究LTB4在急性中耳炎中的作用及其对炎症反应的影响。	中耳感染非类型化流感嗜血杆菌（NTHi）的LTB4相关基因表达和中耳炎症反应。	NA	中耳炎	基因阵列分析，单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	中耳感染NTHi的样本
9531	2024-08-21	Transcriptomic and Single-Cell Analysis of the Murine Parotid Gland 2019-12, Journal of dental research IF:5.7Q1 DOI:10.1177/0022034519882355 PMID:31623513	研究论文	本研究通过RNA测序和单细胞RNA测序分析了小鼠腮腺在不同成熟阶段的转录组特征	首次全面揭示了腮腺在不同成熟阶段的全球基因表达谱，并发现了腮腺特异性的基因特征和细胞异质性	NA	阐明腮腺的分子特性	小鼠腮腺的转录组和单细胞转录组	数字病理学	NA	RNA测序，单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	不同成熟阶段的小鼠腮腺样本
9532	2024-08-20	Integrated metabolomics and proteomics analyses to reveal anticancer mechanism of hemp oil extract in colorectal cancer 2024-Oct-15, Journal of pharmaceutical and biomedical analysis IF:3.1Q2 DOI:10.1016/j.jpba.2024.116379 PMID:39059180	研究论文	本研究通过代谢组学和蛋白质组学分析，探讨了大麻油提取物（HOE）在结直肠癌（CRC）治疗中的抗癌机制	首次详细揭示了大麻油提取物通过影响嘌呤代谢途径和下调c-MYC等细胞周期相关蛋白的表达，导致细胞周期在G1期停滞，从而抑制结直肠癌细胞增殖的机制	NA	阐明大麻油提取物在结直肠癌治疗中的具体抗癌机制	大麻油提取物对结直肠癌细胞的影响	数字病理学	结直肠癌	质谱法	NA	代谢组学数据和蛋白质组学数据	NA
9533	2024-08-20	IL-17A/F double producing T cells, unstable Tregs and quiescent TRMs in clinically healed lesions are potential cellular candidates for recurrence of psoriasis 2024-Sep, Clinical immunology (Orlando, Fla.) DOI:10.1016/j.clim.2024.110328 PMID:39067676	研究论文	本研究通过单细胞测序和多重免疫组化染色技术，分析了自体愈合性病变、现场复发性银屑病变和相邻正常皮肤中的T细胞亚群，以揭示银屑病复发的细胞机制	首次在临床愈合的银屑病变中识别出IL-17A/F双产T细胞、不稳定Tregs和静息TRMs作为复发的潜在细胞候选者	研究结果需要进一步的深入工作以加深理解	阐明银屑病复发的免疫学机制	银屑病愈合病变中的T细胞亚群	NA	银屑病	单细胞测序，多重免疫组化染色	NA	细胞	自体愈合性病变、现场复发性银屑病变和相邻正常皮肤样本
9534	2024-08-20	RBMS1 reflects a distinct microenvironment and promotes tumor progression in ocular melanoma 2024-Sep, Experimental eye research IF:3.0Q1 DOI:10.1016/j.exer.2024.109990 PMID:38969283	研究论文	本研究通过多种机器学习算法分析了UM患者的DNA甲基化、转录组数据及临床信息，发现甲基化驱动的基因RBMS1与UM患者的临床预后不良相关，并揭示了RBMS1在肿瘤微环境中的作用及其对肿瘤进展的影响。	首次揭示RBMS1基因在眼部黑色素瘤中的作用，及其与肿瘤微环境和预后的关联。	研究主要基于UM患者的数据，未来研究需验证RBMS1在其他类型眼部黑色素瘤中的作用。	探讨RBMS1基因在眼部黑色素瘤中的作用及其对肿瘤微环境和预后的影响。	眼部黑色素瘤，包括葡萄膜黑色素瘤（UM）和结膜黑色素瘤（CM）。	数字病理学	眼部黑色素瘤	DNA甲基化分析、RNA测序、单细胞RNA测序	机器学习算法	DNA甲基化数据、转录组数据、临床信息	具体样本数量未在摘要中明确提及
9535	2024-08-20	Adenosine A2A receptor activation regulates the M1 macrophages activation to initiate innate and adaptive immunity in psoriasis 2024-Sep, Clinical immunology (Orlando, Fla.) DOI:10.1016/j.clim.2024.110309 PMID:39002795	研究论文	本研究探讨了腺苷A2A受体激活对M1巨噬细胞的调节作用及其在银屑病中的免疫机制	首次发现KRT16在M1巨噬细胞中的表达，并确定CXCL10/11主要来源于巨噬细胞和树突状细胞而非角质形成细胞	NA	探究M1巨噬细胞在银屑病发病机制中的作用	M1巨噬细胞在银屑病中的作用及腺苷A2A受体的调节机制	免疫学	银屑病	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
9536	2024-08-20	Integrated analysis reveals an aspartate metabolism-related gene signature for predicting the overall survival in patients with hepatocellular carcinoma 2024-Sep, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12094-024-03431-6 PMID:38472558	研究论文	本研究通过多组学数据分析，建立了一个与天冬氨酸代谢相关的基因签名（AMGS），用于预测肝细胞癌患者的总体生存率	首次揭示了天冬氨酸代谢重编程在肝细胞癌中的作用，并建立了一个新的基因签名用于预测患者的生存率	NA	探索天冬氨酸代谢在肝细胞癌中的作用，并开发新的预测工具	肝细胞癌患者及其天冬氨酸代谢相关基因	数字病理学	肝细胞癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	Cox回归模型	多组学数据	来自公共数据库的肝细胞癌患者数据
9537	2024-08-20	TDP-43 was Involved in Radiation-induced Neuronal Damage and May Not Through the BDNF/TrkB Pathway 2024-03-01, Radiation research IF:2.5Q2 DOI:10.1667/RADE-23-00168.1 PMID:38235539	研究论文	本研究探讨了TDP-43在辐射诱导的海马损伤中的作用，并评估了BDNF/TrkB通路是否参与此过程。	首次揭示了TDP-43在辐射诱导的神经元损伤中的作用，并发现BDNF/TrkB信号通路可能不参与此过程。	研究主要基于动物模型和体外细胞实验，需要进一步的人体研究来验证结果。	探究TDP-43在辐射诱导的认知功能障碍中的作用及其与BDNF/TrkB通路的关系。	辐射诱导认知功能障碍的大鼠模型及体外神经元细胞。	神经科学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	大鼠海马组织及体外神经元细胞
9538	2024-08-20	Single-Cell RNA Sequencing Reveals a Role for Reactive Oxygen Species and Peroxiredoxins in Fatty Acid-Induced Rat β-Cell Proliferation 2023-01-01, Diabetes IF:6.2Q1 DOI:10.2337/db22-0121 PMID:36191509	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序探讨了脂肪酸诱导的大鼠β细胞增殖的转录机制	首次揭示了活性氧物种和过氧化物酶在脂肪酸诱导的β细胞增殖中的关键作用	研究仅限于大鼠模型，且未探讨其他脂肪酸类型对β细胞增殖的影响	探究脂肪酸诱导β细胞增殖的分子机制	大鼠胰岛β细胞	数字病理学	糖尿病	单细胞RNA测序	NA	RNA	使用了大鼠胰岛样本，具体数量未详述
9539	2024-08-20	Cellular heterogeneity of circulating CD4+CD8+ double-positive T cells characterized by single-cell RNA sequencing 2021-12-08, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-021-03013-4 PMID:34880348	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术分析了食蟹猴外周血中循环CD4+CD8+双阳性T细胞的组成和特性	研究发现循环中的CD4+CD8+双阳性T细胞不仅包含大量幼稚细胞，还包含多种具有潜在功能的异质性细胞群	尽管研究揭示了循环CD4+CD8+双阳性T细胞的更多亚型，但这一群体本身非常小	研究循环CD4+CD8+双阳性T细胞的组成和特性	食蟹猴外周血中的循环CD4+CD8+双阳性T细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	食蟹猴的外周血样本
9540	2024-08-20	Roles of Macrophages in Atherogenesis 2021, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1 DOI:10.3389/fphar.2021.785220 PMID:34899348	综述	本文综述了巨噬细胞在动脉粥样硬化不同阶段中的作用，并描述了基于巨噬细胞的治疗方法	利用单细胞测序技术探讨了病变中巨噬细胞的异质性	NA	探讨巨噬细胞在动脉粥样硬化中的作用及潜在治疗策略	巨噬细胞在动脉粥样硬化中的作用及其治疗潜力	NA	心血管疾病	单细胞测序	NA	NA	NA