单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27474 篇文献，本页显示第 9521 - 9540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9521 | 2024-08-25 |
Myeloid Heterogeneity in Kidney Disease as Revealed through Single-Cell RNA Sequencing
2021-11-25, Kidney360
IF:3.2Q1
DOI:10.34067/KID.0003682021
PMID:35372996
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在揭示肾脏疾病中髓系细胞异质性方面的应用 | 利用scRNA-seq技术，能够以前所未有的分辨率和通量分析单个细胞的转录组，并生成细胞图谱 | NA | 探讨髓系细胞在肾脏健康和疾病中的作用，以及scRNA-seq技术在髓系细胞和肾脏研究中的应用 | 髓系细胞在肾脏疾病中的异质性 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 9522 | 2024-08-25 |
Integrated single-cell transcriptomics and epigenomics reveals strong germinal center-associated etiology of autoimmune risk loci
2021-Oct-15, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abh3768
PMID:34623901
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学和表观基因组学揭示了与生发中心相关的自身免疫风险位点的强烈病因 | 生成了人类扁桃体的单细胞转录组学和表观基因组学图谱，并利用这些数据解释了与自身免疫相关的遗传变异的潜在调控影响 | NA | 理解生发中心反应背后的基因调控原则，并解释与自身免疫相关的遗传变异的潜在调控影响 | 人类扁桃体的生发中心反应及其与自身免疫疾病的关系 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞转录组学, 表观基因组学 | NA | 转录组, 表观基因组 | 人类扁桃体样本 |
| 9523 | 2024-08-25 |
Single cell analyses to understand the immune continuum in atherosclerosis
2021-08, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
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综述 | 本文综述了单细胞分析技术在理解动脉粥样硬化中免疫连续性的应用 | 介绍了单细胞技术如CyTOF、scRNA-seq和CITE-seq在解析动脉粥样硬化病变中细胞可塑性的价值 | 讨论了单细胞技术在应用于人类血管组织时面临的挑战，以及分离式单细胞方法的局限性 | 探讨单细胞技术在动脉粥样硬化研究中的应用，以实现针对心血管疾病的个性化治疗 | 动脉粥样硬化中的免疫细胞及其在疾病进展中的结构和功能变化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞质谱流式细胞术(CyTOF)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、细胞转录组和表位索引测序(CITE-seq) | NA | 组织 | NA |
| 9524 | 2024-08-25 |
Role of Tim4 in the regulation of ABCA1+ adipose tissue macrophages and post-prandial cholesterol levels
2021-07-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24684-7
PMID:34290249
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研究论文 | 研究探讨了Tim4在调节ABCA1+脂肪组织巨噬细胞和餐后胆固醇水平中的作用 | 首次揭示了Tim4作为餐后胆固醇运输和脂肪组织巨噬细胞功能的关键调节因子 | NA | 理解巨噬细胞脂质代谢的机制，以开发新的治疗方法 | 脂肪组织巨噬细胞和餐后胆固醇水平 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 特定表达Lyve1、Tim4和ABCA1的脂肪组织巨噬细胞群体 |
| 9525 | 2024-08-25 |
Polar Gini Curve: A Technique to Discover Gene Expression Spatial Patterns from Single-cell RNA-seq Data
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2020.09.006
PMID:34958962
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研究论文 | 本文介绍了一种名为极性基尼曲线的方法，用于通过分析单细胞RNA测序数据来表征簇标记 | 极性基尼曲线结合基因表达和二维坐标信息，用于检测单细胞RNA测序数据中任何簇细胞的均匀性模式 | NA | 开发一种方法来表征单细胞RNA测序数据中的簇标记和空间基因表达模式 | 单细胞RNA测序数据中的簇细胞和基因表达模式 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 极性基尼曲线 | 基因表达数据 | 涉及多个模拟案例研究和实际的新生小鼠心脏细胞数据集 |
| 9526 | 2024-08-25 |
Single-cell RNA Sequencing Reveals Thoracolumbar Vertebra Heterogeneity and Rib-genesis in Pigs
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2021.09.008
PMID:34775075
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了猪胚胎27天龄的胸腰椎和肋骨原基细胞的转录组图谱 | 首次在全生物体层面分析了胸腰椎和肋骨原基相关基因的表达动态，并揭示了骨形成和血管生成在胸腰椎和肋骨发育中的耦合过程 | NA | 探究脊椎动物胸腰椎和肋骨原基发育中的胚胎骨形成和血管生成 | 猪胚胎的胸椎、腰椎和肋骨原基细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 一个27天龄的猪胚胎的胸椎、腰椎和肋骨原基细胞 |
| 9527 | 2024-08-24 |
Identification and experimental validation of immune-related gene PPARG is involved in ulcerative colitis
2024-Oct, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167300
PMID:38880160
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研究论文 | 本研究旨在深入理解溃疡性结肠炎（UC）的免疫学特征，并识别有价值的诊断和治疗生物标志物 | 通过生物信息学技术，本研究首次确定了PPARG作为UC的关键生物标志物，并验证了其在UC中的作用及其与巨噬细胞浸润的相关性 | NA | 深入理解溃疡性结肠炎的免疫学特征并识别生物标志物 | 溃疡性结肠炎及其相关免疫基因PPARG | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞测序技术 | DNN | 基因表达数据 | UC数据集来自GEO数据库，具体样本数量未详细说明 |
| 9528 | 2024-08-24 |
Exploring the role of DNMT1 in dental papilla cell fate specification during mouse tooth germ development through integrated single-cell transcriptomics and bulk RNA sequencing
2024-Sep, Journal of oral biosciences
IF:2.6Q1
DOI:10.1016/j.job.2024.06.010
PMID:38942194
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研究论文 | 本研究通过综合单细胞转录组学和批量RNA测序技术，探索了DNMT1在小鼠牙胚发育中牙乳头细胞命运决定的作用 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和批量RNA测序相结合的方法，揭示了DNMT1在早期成牙本质细胞发育中的关键调控作用 | 研究主要集中在胚胎第14.5天的小鼠牙胚细胞，未来研究可以扩展到不同发育阶段和不同物种 | 探究牙齿发育过程中牙间充质细胞的调控机制，特别是成牙本质细胞分化和表观遗传调控的作用 | 小鼠牙胚中的牙间充质细胞和成牙本质细胞分化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序 | 单细胞调控网络推理和聚类（SCENIC） | RNA | 胚胎第14.5天的小鼠牙胚细胞和分离的牙间充质细胞 |
| 9529 | 2024-08-24 |
Single-cell transcriptome sequencing partially revealed the changes of T cells in the early stage of aging kidney
2024-Sep, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2024.06.005
PMID:39059207
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，揭示了衰老肾脏早期阶段T细胞的分子表型和组成变化 | 首次详细描述了衰老肾脏中T细胞的分子状态变化和极化现象，并识别出特定亚群的T细胞 | 研究仅限于小鼠模型，且未探讨人类肾脏衰老的具体情况 | 探究肾脏衰老早期阶段免疫细胞的变化及其分子机制 | 衰老小鼠肾脏中的T细胞和其他免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 9530 | 2024-08-24 |
Resolution of Acinar Dedifferentiation Regulates Tissue Remodeling in Pancreatic Injury and Cancer Initiation
2024-Sep, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.04.031
PMID:38729450
|
研究论文 | 本文通过比较转录组分析研究了胰腺损伤和癌症起始过程中腺泡细胞去分化调控的机制。 | 发现Sox4基因在胰腺腺泡细胞去分化过程中起到抑制作用，并揭示了其在维持组织稳态和肿瘤退化中的新功能。 | NA | 探讨胰腺腺泡细胞去分化在胰腺损伤和癌症起始中的作用及机制。 | 胰腺腺泡细胞去分化过程中的Sox4基因及其调控机制。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA原位杂交、免疫组织化学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 |
| 9531 | 2024-08-24 |
Inhibition of Renin Expression Is Regulated by an Epigenetic Switch From an Active to a Poised State
2024-Sep, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
|
研究论文 | 本文研究了抑制肾素表达的调控机制，通过使用不同抑制剂处理As4.1细胞，并利用ATAC-seq、单细胞RNA测序等技术分析了肾素表达的表观遗传调控。 | 首次揭示了肾素表达在细胞中从活跃状态转变为准备状态的表观遗传调控机制，并识别了与肾素调控相关的转录因子基序和基因。 | 研究主要集中在As4.1细胞模型上，可能需要进一步在其他细胞类型或体内模型中验证这些发现。 | 探究肾素表达的表观遗传调控机制及其在细胞功能转换中的作用。 | As4.1细胞（源自小鼠近球小体的肿瘤细胞，持续表达肾素）。 | NA | NA | ATAC-seq, 单细胞RNA测序, CUT&Tag, 染色质免疫沉淀测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 处理和对照的As4.1细胞的生物学重复样本 |
| 9532 | 2024-08-07 |
Corrigendum to "Single-cell transcriptomics reveals CD8+ T cell structure and developmental trajectories in idiopathic pulmonary fibrosis" [Mol. Immunol. 172 (2024) 85-95]
2024-Sep, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2024.07.013
PMID:39088936
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9533 | 2024-08-24 |
Single-cell Transcriptomics, Web-based Systems Pharmacology and Integrated Transcriptomics Network Analysis Identified Diagnostic Targets and Drug Candidates for Type 2 Diabetes
2024-Aug-22, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学、基于网络的系统药理学和综合转录组网络分析，为2型糖尿病（T2D）识别新的治疗靶点和开发新的诊断模型 | 通过单细胞聚类分析，识别了正常胰岛β细胞样本与T2D胰岛β细胞样本之间的七个亚群，并筛选出27个关键基因作为T2D的诊断靶点，同时发现MME与DB05490之间具有强结合力，为T2D的治疗提供了有效的候选药物 | NA | 发现2型糖尿病（T2D）的新治疗靶点并开发新的诊断模型 | 2型糖尿病（T2D）的治疗靶点和诊断模型 | 生物信息学 | 糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 正常胰岛β细胞样本与T2D胰岛β细胞样本 |
| 9534 | 2024-08-24 |
Explore key genes of Crohn's disease based on glycerophospholipid metabolism: A comprehensive analysis Utilizing Mendelian Randomization, Multi-Omics integration, Machine Learning, and SHAP methodology
2024-Aug-21, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112905
PMID:39173401
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化、多组学整合、机器学习和SHAP方法，探索了与克罗恩病相关的关键基因和代谢物 | 首次综合运用孟德尔随机化、多组学整合、机器学习和SHAP方法，识别与克罗恩病相关的关键基因和代谢物 | 研究样本量较小，且仅限于特定的代谢物和炎症因子，可能存在未涵盖的其他重要因素 | 旨在识别克罗恩病的潜在致病基因和代谢物，为疾病的诊断和治疗提供新靶点 | 克罗恩病相关的代谢物、炎症因子和关键基因 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 孟德尔随机化、多组学整合、机器学习、SHAP | Catboost、XGboost、NGboost | 血清代谢物、炎症因子、单细胞RNA测序数据 | 1400个血清代谢物样本、91个炎症因子样本、克罗恩病患者和健康对照者的外周血单个核细胞 |
| 9535 | 2024-08-24 |
Subtyping of gastric cancer based on basement membrane genes that stratifies the prognosis, immune infiltration and therapeutic response
2024-Aug-20, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01238-z
PMID:39164593
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研究论文 | 本研究基于基底膜基因表达对胃癌进行分子分类，并探讨其与患者预后、免疫浸润及治疗反应的关系 | 首次基于基底膜基因表达定义了胃癌的新型分子分类，并开发了预测预后、免疫治疗效果和化疗抵抗的风险模型 | NA | 探讨基底膜状态、转移与患者预后的关系，并开发相关的风险预测模型 | 胃癌及其基底膜基因表达 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 多个大型队列 |
| 9536 | 2024-08-24 |
Spatial transcriptomics profiling of gallbladder adenocarcinoma: a detailed two-case study of progression from precursor lesions to cancer
2024-Aug-20, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12770-0
PMID:39164619
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析了两个胆囊腺癌病例，从癌前病变到癌症的进展过程 | 首次提供了支持胆囊癌起源于胆管上皮内瘤变（BilIN）或独立于BilIN的结论的空间转录组数据 | 研究仅限于两个病例，可能无法完全代表所有胆囊腺癌的进展过程 | 研究个体患者中胆囊癌肿瘤发生的空间转录组学特征 | 两个具有不同癌症病因的患者的胆囊样本，包括正常上皮、BilINs和腺癌区域 | 数字病理学 | 胆囊癌 | GeoMx数字空间分析 | NA | 转录组数据 | 两个患者，每个患者分别有24和32个感兴趣区域（ROIs） |
| 9537 | 2024-08-24 |
Implications of PD-L1 expression on the immune microenvironment in HER2-positive gastric cancer
2024-Aug-20, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02085-w
PMID:39164705
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研究论文 | 研究PD-L1表达在HER2阳性胃癌免疫微环境中的影响 | 发现CPS≥1的HER2阳性胃癌患者中免疫细胞的空间有效评分较高，且CPS<1患者中存在一种与不良预后相关的CXCR4M2巨噬细胞亚型 | 研究样本量有限，且仅限于HER2阳性胃癌患者 | 探讨PD-L1表达在HER2阳性胃癌免疫微环境中的作用及其对治疗反应的影响 | HER2阳性胃癌患者及其免疫微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 160名HER2阳性胃癌患者 |
| 9538 | 2024-08-24 |
Single-cell RNA sequencing reveals the effects of high-fat diet on oocyte and early embryo development in female mice
2024-Aug-20, Reproductive biology and endocrinology : RB&E
IF:4.2Q1
DOI:10.1186/s12958-024-01279-7
PMID:39164729
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研究论文 | 本研究通过建立高脂饮食诱导的肥胖雌性小鼠模型，利用单细胞RNA测序技术探讨了高脂饮食对小鼠卵母细胞和早期胚胎发育的影响 | 首次采用单细胞RNA测序技术探索高脂饮食诱导的肥胖小鼠在不同阶段胚胎的转录组变化 | NA | 研究高脂饮食对雌性小鼠卵巢功能和早期胚胎发育的具体发病机制 | 高脂饮食诱导的肥胖雌性小鼠的系统代谢、卵巢形态和卵母细胞功能 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 9539 | 2024-08-24 |
Host-pathogen interactions in the Plasmodium-infected mouse liver at spatial and single-cell resolution
2024-Aug-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51418-2
PMID:39160174
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学与单核RNA测序技术，在多个时间点分析了感染疟原虫的肝脏组织中的宿主-病原体相互作用 | 首次详细描绘了疟疾感染肝脏组织中的空间基因表达变化，包括脂质代谢变化、炎症程序差异及炎症热点区域 | NA | 探索疟疾感染期间肝脏组织中宿主反应的协调机制 | 感染疟原虫的肝脏组织 | 数字病理学 | 疟疾 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个时间点的感染疟原虫的肝脏组织样本 |
| 9540 | 2024-08-24 |
ITGB6 modulates resistance to anti-CD276 therapy in head and neck cancer by promoting PF4+ macrophage infiltration
2024-Aug-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51096-0
PMID:39152118
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研究论文 | 本研究评估了抗CD276抗体在化学诱导的鼠头颈鳞状细胞癌模型中的活性，并发现ITGB6是介导对反CD276治疗不同反应的关键基因 | 通过单细胞RNA测序和基因敲除鼠模型，发现ITGB6通过调节肿瘤相关趋化因子CX3CL1的表达，招募并激活表达高水平的CX3CR1的PF4巨噬细胞，从而影响对反CD276治疗的敏感性 | NA | 揭示与免疫检查点抑制剂治疗相关的耐药机制，并识别克服癌症治疗耐药性的潜在目标 | 头颈癌中的ITGB6基因及其对反CD276治疗的反应 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除鼠模型 | 基因表达数据 | NA |