单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
9501 2024-08-22
Development of a Novel CD8+ T Cell-Associated Signature for Prognostic Assessment in Hepatocellular Carcinoma
2024 Jan-Dec, Cancer control : journal of the Moffitt Cancer Center IF:2.5Q3
研究论文 本研究旨在分析CD8+ T细胞相关调控基因在肝细胞癌(HCC)中的临床意义和预后价值 构建了一个新的8基因CD8+ T细胞相关签名,用于肝细胞癌的预后评估 NA 分析CD8+ T细胞相关调控基因在肝细胞癌中的临床意义和预后价值 CD8+ T细胞相关调控基因在肝细胞癌中的作用 数字病理学 肝细胞癌 qRT-PCR, 免疫组织化学, 组织微阵列, CIBERSORT算法 Lasso-Cox回归分析 RNA测序数据 使用了TCGA-LIHC和单细胞RNA测序数据
9502 2024-08-22
G0 arrest gene patterns to predict the prognosis and drug sensitivity of patients with lung adenocarcinoma
2024, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究旨在开发基于G0停滞(G0A)相关基因的肺腺癌(LUAD)患者基因特征,并探讨其与预后、肿瘤免疫微环境和治疗反应的关系 成功建立了一个包含六个基因(CHCHD4, DUT, LARP1, PTTG1IP, RBM14, 和 WBP11)的特征,该特征对LUAD患者的总体生存具有显著的预测能力,并显示出独立的预后价值 NA 开发肺腺癌患者的基因特征,并研究其与预后、肿瘤免疫微环境和治疗反应的关系 肺腺癌患者 数字病理学 肺腺癌 qRT-PCR Cox和lasso回归模型 转录组数据 使用TCGA-LUAD数据库作为发现队列,验证模型使用了多个转录组数据集(GSE50081, GSE72094, GSE127465, GSE131907 和 EMTAB6149)
9503 2024-08-22
The single-cell atlas of the epididymis in mice reveals the changes in epididymis function before and after sexual maturity
2024, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序技术分析了5周龄和10周龄C57 BL/6J雄性小鼠的附睾头和尾部细胞,揭示了附睾功能在性成熟前后的变化 首次构建了小鼠附睾的单细胞图谱,并分析了主要细胞类型在性成熟前后的功能变化 NA 探究附睾在性成熟前后的功能变化及其对精子成熟和免疫反应的影响 5周龄和10周龄C57 BL/6J雄性小鼠的附睾头和尾部细胞 NA NA 单细胞测序 NA 细胞 5周龄和10周龄C57 BL/6J雄性小鼠的附睾头和尾部细胞
9504 2024-08-22
Combining Bulk and Single Cell RNA-Sequencing Data to Identify Hub Genes of Fibroblasts in Dilated Cardiomyopathy
2024, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究结合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,识别扩张型心肌病中成纤维细胞的关键基因 本研究首次结合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,通过细胞间通信网络和活性分析,筛选出与扩张型心肌病相关的重要细胞和基因 本研究主要基于公开数据集,未来需进一步在更大规模和多样性的样本中验证结果 揭示扩张型心肌病的病理生理机制 扩张型心肌病中的成纤维细胞和单核细胞 数字病理学 心血管疾病 RNA测序 NA 基因表达数据 使用了公开的批量RNA测序和单细胞RNA测序数据集
9505 2024-08-22
Integrated hepatic single-cell RNA sequencing and untargeted metabolomics reveals the immune and metabolic modulation of Qing-Fei-Pai-Du decoction in mice with coronavirus-induced pneumonia
2022-Mar, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 本研究通过整合肝单细胞RNA测序和非靶向代谢组学,探讨了清肺排毒汤对冠状病毒诱导的小鼠肺炎的免疫和代谢调节机制。 首次将肝单细胞RNA测序和非靶向代谢组学整合应用于中药配方中,揭示了清肺排毒汤对免疫功能和肝脏损伤的改善作用。 NA 研究清肺排毒汤在治疗冠状病毒诱导的小鼠肺炎中的作用机制。 清肺排毒汤对冠状病毒诱导的小鼠肺炎的免疫和代谢调节机制。 数字病理学 冠状病毒感染 单细胞RNA测序, 非靶向代谢组学 NA RNA序列, 代谢数据 BALB/c小鼠模型
9506 2024-08-22
A matter of space and time: Emerging roles of disease-associated proteins in neural development
2022-01-19, Neuron IF:14.7Q1
研究论文 本文探讨了神经发育障碍中与疾病相关的蛋白质在神经发育中的新兴角色 新证据表明,这些蛋白质在未成熟细胞中具有新颖的、不同的作用,特别是在神经系统在产前发育中的组装过程中 NA 探讨神经发育障碍中与疾病相关的蛋白质在神经发育中的作用 神经发育障碍中的突触蛋白和离子通道 NA 神经发育障碍 单细胞测序 NA NA NA
9507 2024-08-22
Challenges and Opportunities for the Translation of Single-Cell RNA Sequencing Technologies to Dermatology
2022-Jan-04, Life (Basel, Switzerland)
综述 本文综述了利用单细胞RNA测序技术在皮肤生物学领域的最新进展,特别关注皮肤病理学及其向临床的转化 本文总结了单细胞分析的优势和局限性,有助于将这些新技术的新见解转化为临床应用 目前这些新技术的临床转化尚不足 总结单细胞RNA测序技术在皮肤生物学中的应用现状,并探讨其向临床转化的挑战与机遇 人类皮肤细胞类型及其在稳态和多种皮肤病中的相互作用 数字病理学 皮肤病 单细胞RNA测序 NA 数据集 大量
9508 2024-08-22
A growth factor-expressing macrophage subpopulation orchestrates regenerative inflammation via GDF-15
2022-01-03, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1
研究论文 本文研究了肌肉再生过程中,一种表达生长因子的巨噬细胞亚群通过GDF-15调控再生性炎症的机制 首次揭示了GDF-15在肌肉再生中的作用及其调控机制,并识别出一种新的巨噬细胞亚群——生长因子表达巨噬细胞(GFEMs) NA 探讨肌肉再生过程中巨噬细胞亚群的特化及其在再生性炎症中的作用 肌肉再生过程中的巨噬细胞及其表达的GDF-15 NA NA 基因表达动力学聚类分析,免疫单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 受伤肌肉中分离的Ly6Chigh和Ly6Clow巨噬细胞
9509 2024-08-22
Monocytes and Macrophages in Kidney Transplantation and Insights from Single Cell RNA-Seq Studies
2021-10-28, Kidney360 IF:3.2Q1
综述 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在肾移植中对单核细胞和巨噬细胞的命名、起源和功能的研究,特别关注了肾移植领域的新发现。 scRNA-seq技术提供了无偏见的转录组学方法,揭示了巨噬细胞的起源和功能,这是传统方法无法实现的。 目前关于这一主题的发表研究较少。 探讨单细胞RNA测序在肾移植中对免疫细胞景观和同种异体免疫反应的研究。 单核细胞和巨噬细胞在肾移植中的作用。 NA 肾移植 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA NA
9510 2024-08-22
Loss of ESRP1 blocks mouse oocyte development and leads to female infertility
2021-01-18, Development (Cambridge, England)
研究论文 研究通过干扰ESRP1控制的pre-mRNA剪接事件,发现ESRP1的缺失导致小鼠卵母细胞发育受阻和雌性不育 首次阐明了ESRP1介导的母源mRNA转录本的AS程序,揭示了其在卵母细胞减数分裂和雌性生育中的作用 NA 探究ESRP1在卵母细胞发育和雌性生育中的作用 小鼠卵母细胞和雌性生育能力 NA 雌性不育 单细胞RNA测序 NA RNA 涉及六个月大的ESRP1敲除小鼠
9511 2024-08-22
Integrated single-cell and bulk gene expression and ATAC-seq reveals heterogeneity and early changes in pathways associated with resistance to cetuximab in HNSCC-sensitive cell lines
2020-07, British journal of cancer IF:6.4Q1
研究论文 本研究通过综合单细胞和批量基因表达以及ATAC-seq数据,揭示了HNSCC敏感细胞系中与西妥昔单抗耐药相关的异质性和早期通路变化 首次生成了敏感头颈鳞状细胞癌(HNSCC)细胞的综合多组学数据,以识别西妥昔单抗的即时反应 NA 识别肿瘤细胞在仍对治疗有反应时潜在的耐药机制,以延迟获得性耐药 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)敏感细胞系中西妥昔单抗耐药的早期反应和相关通路 数字病理学 头颈癌 单细胞RNA测序, ATAC-seq NA 基因表达数据 多个HNSCC敏感细胞系
9512 2024-08-22
Single-Cell RNA Sequencing for Precision Oncology: Current State-of-Art
2020, Journal of the Indian Institute of Science IF:1.8Q2
综述 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在精准肿瘤学中的应用现状,包括数据处理步骤和其在精准肿瘤学中的意义 scRNA-seq技术为肿瘤内异质性(ITH)及其在药物抗性和转移中的影响提供了前所未有的见解 NA 为进入scRNA-seq领域的新人提供框架和指南 scRNA-seq技术的分析步骤和其在精准肿瘤学中的应用 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA序列数据 NA
9513 2024-08-21
Integrative analysis of single-Cell RNA sequencing and experimental validation in the study of abdominal aortic aneurysm progression
2024-Dec-15, Gene IF:2.6Q2
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序数据和实验验证,探讨腹主动脉瘤进展中的细胞相互作用和分子机制 通过单细胞RNA测序和细胞间相互作用分析,揭示了腹主动脉瘤中特定的配体-受体对在疾病发生中的关键作用 NA 理解腹主动脉瘤发展的细胞相互作用和分子机制,以识别潜在的治疗靶点 腹主动脉瘤及其对照样本的单细胞和批量RNA测序数据 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 使用了来自GEO数据库的GSE197748、GSE164678和GSE183464数据集,包括腹主动脉瘤和对照样本的单细胞和批量RNA测序数据
9514 2024-08-21
Comparative assessment of the intragenomic variations of dinoflagellate Tripos species through single-cell sequencing
2024-Sep, Marine pollution bulletin IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序技术评估和比较了三角藻属(Tripos)物种的基因组内变异(IGVs) 首次使用高通量测序(HTS)对Tripos物种的18S rDNA V4区域进行单细胞测序,揭示了高水平的基因组内变异 研究仅限于Tripos物种的30个单细胞,可能无法代表所有Tripos物种的基因组内变异情况 评估和比较Tripos物种的基因组内变异,探讨其在分子多样性分析中的影响 Tripos物种的基因组内变异 生物信息学 NA 高通量测序(HTS) NA DNA序列 30个Tripos物种的单细胞
9515 2024-08-21
Targeting mitochondrial dysfunction in atopic dermatitis with trilinolein: A triacylglycerol from the medicinal plant Cannabis fructus
2024-Sep, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 本研究探讨了从药用植物大麻果实中提取的三亚油酸甘油酯(trilinolein)在治疗特应性皮炎(AD)中的作用及其机制 首次揭示了trilinolein通过AhR-Nrf2途径减轻NOX2依赖的线粒体功能障碍,修复皮肤屏障 研究主要集中在细胞和小鼠模型上,尚未进行人体临床试验 评估trilinolein在预防和治疗特应性皮炎中的潜力及其作用机制 特应性皮炎患者和健康对照者的皮肤样本,以及DNCB诱导的BALB/c小鼠和IL-4及TNF-α诱导的HaCaT细胞 NA 特应性皮炎 HPLC-ESI-MS/MS分析,单细胞转录组分析,蛋白质组学分析 NA 蛋白质表达数据 慢性AD患者和健康对照者的皮肤样本,DNCB诱导的BALB/c小鼠,IL-4及TNF-α诱导的HaCaT细胞
9516 2024-08-21
FAT1 as a tumor mutation burden specific gene affects the immunotherapy effect in head and neck squamous cell cancer
2024-Sep, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1
研究论文 本研究探讨了FAT1基因突变与头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)患者免疫治疗反应之间的关系 发现FAT1基因突变与HNSCC患者对免疫治疗的抵抗性相关,并涉及多个代谢相关通路 样本量较小,仅包括33名HNSCC患者 研究肿瘤突变负荷(TMB)特异性基因如何影响头颈部鳞状细胞癌的免疫治疗效果 头颈部鳞状细胞癌患者 数字病理学 头颈部鳞状细胞癌 下一代测序(NGS) NA 转录组数据 33名头颈部鳞状细胞癌患者
9517 2024-08-21
Expansion of effector regulatory T cells in steroid responders of severe alcohol-associated hepatitis
2024-Sep-01, Liver transplantation : official publication of the American Association for the Study of Liver Diseases and the International Liver Transplantation Society IF:4.7Q1
研究论文 研究探讨了严重酒精相关性肝炎患者中,糖皮质激素治疗与效应调节T细胞(eTreg)的关系及其对临床结果的影响 首次揭示了糖皮质激素治疗严重酒精相关性肝炎患者中eTreg细胞数量的增加及其与治疗效果的关联 研究样本量较小,且仅包括了酒精相关性肝炎患者,可能限制了结果的普遍性 探究糖皮质激素治疗严重酒精相关性肝炎的效果及其与eTreg细胞的关系 严重酒精相关性肝炎患者及其治疗反应 NA 酒精相关性肝炎 流式细胞术,单细胞RNA测序 NA 血液单个核细胞 47名酒精相关性肝炎患者,其中18名接受糖皮质激素治疗,29名未接受治疗
9518 2024-08-21
A distinct subset of urothelial cells with enhanced EMT features promotes chemotherapy resistance and cancer recurrence by increasing COL4A1-ITGB1 mediated angiogenesis
2024-Sep, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序,发现具有上皮-间质转化(EMT)特征的尿路上皮细胞亚群(EMT-UC)与化疗耐药和癌症复发显著相关,并验证了EMT-UC通过COL4A1-ITGB1相互作用促进肿瘤血管生成的作用。 首次揭示了EMT-UC通过COL4A1-ITGB1相互作用促进尿路上皮癌化疗耐药和复发的机制。 EMT-UC不仅在肿瘤组织中被识别,也在邻近的正常组织中被发现,这限制了对EMT-UC特异性的理解。 探究尿路上皮癌化疗耐药和复发的潜在机制。 尿路上皮细胞亚群(EMT-UC)及其在化疗耐药和癌症复发中的作用。 数字病理学 尿路上皮癌 单细胞RNA测序 NA RNA 来自不良预后患者的尿路上皮癌组织样本
9519 2024-08-21
Reversal of injury-associated retinal ganglion cell gene expression by a phosphodiesterase anchoring disruptor peptide
2024-Sep, Experimental eye research IF:3.0Q1
研究论文 本研究探讨了通过表达一种修饰的磷酸二酯酶4D3 N端肽4D3(E)来改变视网膜神经节细胞(RGCs)基因表达,以逆转损伤相关的基因表达变化 通过使用单细胞RNA测序技术,研究了4D3(E)肽表达对视网膜神经节细胞在受到视神经压迫损伤后基因表达的影响 NA 探索磷酸二酯酶4D3位移促进神经保护的机制 视网膜神经节细胞(RGCs)及其在视神经压迫损伤后的基因表达 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA
9520 2024-08-21
Recryopreservation impairs blastocyst implantation potential via activated endoplasmic reticulum stress pathway and induced apoptosis
2024-Sep, MedComm IF:10.7Q1
研究论文 本研究探讨了重复冷冻保存对胚泡植入潜能的影响及其机制 首次揭示了重复冷冻保存通过激活内质网应激途径和诱导细胞凋亡影响胚泡植入潜能的机制 研究样本仅来自一个学术生殖医学中心,可能限制了结果的普遍性 探究重复冷冻保存对胚泡植入潜能的影响及其分子机制 人类胚泡及其植入潜能 生殖医学 NA 单细胞RNA测序、免疫荧光、TUNEL检测 NA 细胞 捐赠的人类胚泡
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