单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 9481 - 9500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9481 | 2024-08-23 |
Abnormal respiratory progenitors in fibrotic lung injury
2022-02-07, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-022-02737-y
PMID:35130980
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和上皮细胞系标记技术在识别纤维化肺损伤后肺泡再生过程中异常上皮祖细胞群体方面的最新进展 | 识别了多种在肺泡II型细胞向I型细胞分化过程中出现的异常上皮祖细胞群体，包括基底样细胞、II型细胞过渡细胞和持续性上皮祖细胞 | NA | 深入理解这些新发现的、由损伤诱导的异常行为上皮祖细胞的特征和功能，以及调控其表型的信号通路，以期为纤维化肺疾病提供独特的治疗靶点 | 异常上皮祖细胞及其在肺泡再生中的作用 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 9482 | 2024-08-23 |
SARS-CoV-2 infects the human kidney and drives fibrosis in kidney organoids
2022-02-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.12.010
PMID:35032430
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研究论文 | 本文报道了SARS-CoV-2直接感染人类肾脏细胞，并在患者尸检样本中观察到与肾小管间质纤维化增加相关。通过感染人诱导多能干细胞衍生的肾脏类器官，研究了病毒对肾脏的直接影响，发现感染细胞出现损伤和去分化，激活了促纤维化信号通路，并增加了胶原蛋白1的表达。 | 首次揭示了SARS-CoV-2直接感染肾脏细胞并诱导细胞损伤和纤维化的机制，并发现SARS-CoV-2蛋白酶抑制剂能减轻肾脏细胞的感染。 | 研究主要集中在体外肾脏类器官模型，尚未在临床试验中验证这些发现。 | 探究SARS-CoV-2对人类肾脏的直接影响及其与肾脏纤维化的关系。 | 人诱导多能干细胞衍生的肾脏类器官和患者尸检样本。 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 9483 | 2024-08-23 |
Single-cell transcriptomics identifies Gadd45b as a regulator of herpesvirus-reactivating neurons
2022-02-03, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202153543
PMID:34842321
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单分子灵敏度荧光原位杂交（smFISH）技术，探讨了人类神经亲和性病毒——单纯疱疹病毒1型（HSV-1）再激活时宿主单细胞转录组的变化 | 首次识别出应激传感器Gadd45b作为调节HSV-1再激活事件的关键抗病毒宿主因子，并揭示了Gadd45b在亚群潜伏感染初级神经元中的独特亚细胞定位特征 | NA | 探究宿主细胞与潜伏感染细胞中病毒病原体之间的相互作用 | 单纯疱疹病毒1型（HSV-1）再激活时宿主单细胞转录组的变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单分子灵敏度荧光原位杂交（smFISH） | NA | 转录组 | 潜伏感染的初级神经元亚群 |
| 9484 | 2024-08-23 |
New horizons in the stormy sea of multimodal single-cell data integration
2022-01-20, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2021.12.012
PMID:35063095
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综述 | 本文综述了多模态单细胞数据整合的生物信息学挑战和实验设计挑战 | 探讨了整合多模态单细胞数据以识别高度特异的细胞亚群和推断因果生物机制的新方法 | NA | 设计、执行和分析多模态单细胞实验，以学习新的因果和机制生物学 | 多模态单细胞数据整合 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 多模态数据 | NA |
| 9485 | 2024-08-23 |
Single-cell sequencing reveals lineage-specific dynamic genetic regulation of gene expression during human cardiomyocyte differentiation
2022-01, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1009666
PMID:35061661
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了从诱导多能干细胞到心肌细胞分化过程中基因表达的动态遗传调控 | 本研究采用灵活的方法来映射动态eQTL，这些eQTL的效果在分叉分化轨迹的过程中显著变化，并且特定于某一谱系 | NA | 揭示人类心肌细胞分化过程中基因表达的谱系特异性动态遗传调控 | 从诱导多能干细胞到心肌细胞的分化过程中的基因调控变化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 19个人类细胞系，在7个独特的时间点采样 |
| 9486 | 2024-08-23 |
Single-Cell RNA Sequencing of Peripheral Blood Mononuclear Cells From Acute Myocardial Infarction
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.908815
PMID:35844519
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了急性心肌梗死患者外周血单个核细胞的转录组特征 | 首次揭示了在斑块破裂和非破裂情况下，不同免疫细胞亚群在急性心肌梗死中的具体作用 | 样本量较小，仅包括10名患者 | 探讨急性心肌梗死患者中斑块破裂与非破裂情况下循环免疫细胞的差异 | 急性心肌梗死患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 10名急性心肌梗死患者 |
| 9487 | 2024-08-23 |
RNA-Seq of Single Fish Cells - Seeking Out the Leukocytes Mediating Immunity in Teleost Fishes
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.798712
PMID:35140719
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在硬骨鱼类免疫系统研究中的应用，特别是揭示白细胞亚群及其相互作用对整体免疫反应的贡献 | 单细胞RNA测序技术揭示了白细胞群体的意外可塑性和异质性，改变了免疫学的几个长期范式 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在硬骨鱼类免疫系统中的应用，揭示白细胞亚群的个体贡献及其相互作用 | 硬骨鱼类的白细胞及其在免疫反应中的作用 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 单个鱼细胞 |
| 9488 | 2024-08-23 |
Joint Clustering of Single-Cell Sequencing and Fluorescence In Situ Hybridization Data for Reconstructing Clonal Heterogeneity in Cancers
2021-11, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2021.0255
PMID:34612714
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研究论文 | 本文开发了一种联合聚类方法，结合单细胞测序和荧光原位杂交数据，以更好地解析肿瘤进化中的染色体倍性变化 | 提出了一种概率框架，通过马尔可夫链蒙特卡洛采样和线性回归优化，以最大化给定预聚类数据集的潜在变量的概率 | 现有的方法在通过倍性变化解析肿瘤进化方面能力有限 | 旨在通过结合单细胞测序和荧光原位杂交数据，更好地解析肿瘤进化中的染色体倍性变化 | 单细胞测序和荧光原位杂交数据 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞DNA测序（scSeq）和多重间期荧光原位杂交（miFISH） | 马尔可夫链蒙特卡洛采样和线性回归 | 单细胞测序和荧光原位杂交数据 | 使用模拟数据和一个胶质母细胞瘤（GBM）病例进行验证，并在两个GBM病例中应用该方法 |
| 9489 | 2024-08-23 |
Scaling up reproducible research for single-cell transcriptomics using MetaNeighbor
2021-08, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-021-00575-5
PMID:34234317
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研究论文 | 本文介绍了使用MetaNeighbor方法进行单细胞转录组数据的可重复性研究 | 提出了一种高效且稳健的细胞类型可重复性量化方法MetaNeighbor，该方法保持数据集独立性并具有高度可扩展性 | NA | 研究单细胞RNA测序数据中细胞类型的可重复性和通用性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 数百万个细胞 |
| 9490 | 2024-08-23 |
Opposing immune and genetic mechanisms shape oncogenic programs in synovial sarcoma
2021-02, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-020-01212-6
PMID:33495604
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研究论文 | 本研究通过综合运用单细胞RNA测序、空间分析以及遗传和药理学扰动，探讨了滑膜肉瘤中的癌症-免疫相互作用 | 揭示了滑膜肉瘤中由SS18-SSX融合驱动的恶性细胞状态，并发现这种状态可被HDAC和CDK4/CDK6抑制剂联合治疗增强其免疫原性 | NA | 研究滑膜肉瘤中的癌症-免疫相互作用及其治疗策略 | 滑膜肉瘤中的恶性细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 滑膜肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 16,872个细胞来自12个人类滑膜肉瘤肿瘤 |
| 9491 | 2024-08-23 |
Long-Term Storage Does Not Affect the Expression Profiles of mRNA and Long Non-Coding RNA in Vitrified-Warmed Human Embryos
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.751467
PMID:35178066
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研究论文 | 本研究探讨了长期存储对人类胚胎中mRNA和长非编码RNA表达谱的影响 | 首次揭示了长期存储后的人类胚胎中mRNA和长非编码RNA表达谱的稳定性 | 研究样本量较小，且仅限于特定年龄段的女性 | 探究长期存储对人类胚胎中mRNA和长非编码RNA表达的影响 | 人类胚胎中的mRNA和长非编码RNA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 11名女性，包括3个新鲜八细胞胚胎和8个存活下来的冷冻解冻八细胞胚胎 |
| 9492 | 2024-08-23 |
Building vs. Rebuilding Epidermis: Comparison Embryonic Development and Adult Wound Repair
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.796080
PMID:35145968
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综述 | 本文比较了胚胎发育与成人伤口修复过程中表皮重建的相似性与差异性 | 利用单细胞转录组学、谱系追踪和活体成像技术揭示了以往无法检测到的亚群、长期细胞命运和动态细胞行为 | NA | 探讨成人伤口修复与胚胎组织发育在表皮方面的异同 | 表皮组织 | NA | NA | 单细胞转录组学、谱系追踪、活体成像 | NA | NA | NA |
| 9493 | 2024-08-23 |
Analysis and Visualization of Spatial Transcriptomic Data
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.785290
PMID:35154244
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综述 | 本文综述了空间转录组技术的核心概念及其分析和可视化方法 | 空间转录组技术能够在保留空间信息的同时测量转录组信息，扩展了分析和可视化的可能性 | NA | 总结空间基因组技术的核心概念并全面回顾当前的空间转录组分析和可视化方法 | 人类和动物组织的异质细胞类型及其空间结构 | 基因组学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 9494 | 2024-08-22 |
Blood Lipoproteins Shape the Phenotype and Lipid Content of Early Atherosclerotic Lesion Macrophages: A Dual-Structured Mathematical Model
2024-Aug-02, Bulletin of mathematical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s11538-024-01342-9
PMID:39093509
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研究论文 | 本文开发了一种双结构数学模型，用于研究早期动脉粥样硬化病变中巨噬细胞的表型和脂质含量 | 提出了一个数学模型，通过分析低密度脂蛋白（LDL）和高密度脂蛋白（HDL）的血液密度，来理解巨噬细胞表型和脂质含量的关系 | 需要通过单细胞RNA测序数据来验证模型 | 探讨早期动脉粥样硬化病变中巨噬细胞的表型分布及其与脂质含量的关系 | 早期动脉粥样硬化病变中的巨噬细胞 | NA | 心血管疾病 | NA | 数学模型 | NA | NA |
| 9495 | 2024-08-22 |
SLC44A2 regulates vascular smooth muscle cell phenotypic switching and aortic aneurysm
2024-Jun-25, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI173690
PMID:38916960
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研究论文 | 本文研究了SLC44A2在血管平滑肌细胞表型转换和主动脉瘤中的作用 | 首次揭示了SLC44A2通过与NRP1和ITGB3相互作用激活TGF-β/SMAD信号通路，从而调控血管平滑肌细胞的表型转换 | NA | 探讨SLC44A2在主动脉瘤中的作用及其机制 | SLC44A2在血管平滑肌细胞中的表达及其对主动脉瘤的影响 | 心血管疾病 | 主动脉瘤 | 微阵列和单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括腹主动脉瘤患者和Ang II诱导的Apoe-/-小鼠的主动脉组织 |
| 9496 | 2024-08-22 |
Inhibition of the eukaryotic initiation factor-2α kinase PERK decreases risk of autoimmune diabetes in mice
2024-Jun-18, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI176136
PMID:38889047
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研究论文 | 本研究通过抑制eIF2α激酶PERK，减少小鼠自身免疫性糖尿病的风险 | 发现抑制PERK可以逆转应激人胰岛中的mRNA翻译阻断，延缓糖尿病发作，减少胰岛炎症，并保护β细胞数量 | NA | 预防自身免疫性1型糖尿病（T1D）的发作 | 小鼠的胰岛和β细胞 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序，空间蛋白质组学 | NA | RNA，蛋白质 | T1D易感小鼠的胰岛 |
| 9497 | 2024-08-22 |
Examining the Effects of Nutrient Supplementation on Metabolic Pathways via Mitochondrial Ferredoxin in Aging Ovaries
2024-05-13, Nutrients
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/nu16101470
PMID:38794708
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研究论文 | 研究通过营养补充剂对衰老卵巢中线粒体铁氧还原蛋白在代谢途径中的作用进行探讨 | 采用多组学分析方法，结合空间转录组学、单细胞RNA测序、人类卵巢病理学和临床活检数据，探讨FDX1作为卵巢衰老标志物的潜力 | 研究仅涉及70名患者，且仅进行了两个月的临床试验，可能需要更大规模和更长时间的研究来验证结果 | 探讨营养补充剂对衰老卵巢中代谢途径的影响，特别是通过线粒体铁氧还原蛋白FDX1的作用 | 衰老卵巢中的卵母细胞 | NA | NA | 多组学分析 | NA | 转录组数据 | 70名患有衰老卵巢的患者 |
| 9498 | 2024-08-22 |
ScRNA-seq of gastric cancer tissues reveals differences in the immune microenvironment of primary tumors and metastases
2024-May, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03012-5
PMID:38555278
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了胃癌原发肿瘤和转移瘤组织的转录组，揭示了两者在免疫微环境上的差异 | 首次详细比较了胃癌原发肿瘤和转移瘤在免疫微环境中的差异，特别是CD8 T细胞和表达ApoE的巨噬细胞的差异 | 研究样本量相对较小，可能影响结果的普遍性 | 探究胃癌原发肿瘤和转移瘤在免疫微环境中的差异及其潜在机制 | 胃癌的原发肿瘤和转移瘤组织 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序(ScRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 46份胃癌原发肿瘤、邻近非肿瘤组织和转移瘤组织 |
| 9499 | 2024-08-22 |
Fibroblasts under pressure: cardiac fibroblast responses to hypertension and antihypertensive therapies
2024-01-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00401.2023
PMID:37999643
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综述 | 本文综述了高血压和抗高血压治疗对心脏成纤维细胞的影响，以及单细胞RNA测序技术在高血压和压力超负荷模型中对成纤维细胞异质性的发现 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了高血压和压力超负荷模型中左心室成纤维细胞的异质性 | NA | 探讨高血压和压力超负荷对心脏成纤维细胞的特定变化，以及抗高血压治疗的效果 | 心脏成纤维细胞在高血压和压力超负荷下的反应及其在抗高血压治疗中的作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 9500 | 2024-08-22 |
Identification and validation of tryptophan-related gene signatures to predict prognosis and immunotherapy response in lung adenocarcinoma reveals a critical role for PTTG1
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1386427
PMID:39144144
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研究论文 | 本研究通过分析色氨酸代谢相关基因，构建了预测肺腺癌预后和免疫治疗反应的模型，并探讨了PTTG1在其中的关键作用 | 首次揭示了色氨酸代谢在肺腺癌中的模式和分子特征，并建立了色氨酸代谢相关的肺腺癌预后模型 | NA | 研究色氨酸代谢在肺腺癌中的作用及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 肺腺癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA和GEO数据库的多个数据集，具体样本数量未详细说明 |