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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 9481 - 9500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9481 | 2025-10-07 |
Development and validation of a transcription factor regulatory network-based signature for individualized prognostic risk in lung adenocarcinoma
2025-Jun-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.35375
PMID:39960662
|
研究论文 | 开发并验证基于转录因子调控网络的肺腺癌个体化预后风险特征 | 利用单细胞RNA测序数据构建上皮细胞特异性转录因子调控网络，开发了包含3521个基因对的单细胞基因对特征（scGPS）用于预后预测 | NA | 开发可靠的肺腺癌预后特征用于风险分层 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，微阵列 | 基因对特征模型 | 基因表达数据 | 来自23个队列的2740名患者，包括1个单细胞RNA测序数据集、5个bulk RNA测序数据集和17个微阵列数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 9482 | 2025-10-07 |
Fast analysis of Spatial Transcriptomics (FaST): an ultra lightweight and fast pipeline for the analysis of high resolution spatial transcriptomics
2025-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf044
PMID:40248491
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研究论文 | 开发了一个名为FaST的超轻量快速分析流程，用于处理高分辨率空间转录组数据 | 首个能够在标准多核工作站上快速分析大规模空间转录组数据的流程，无需高性能计算集群 | 依赖spateo-release包进行RNA分割，未集成成像引导的细胞分割功能 | 开发高效的空间转录组数据分析工具 | 空间转录组测序数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组测序数据 | >5亿条测序reads | Illumina | 空间转录组学 | Illumina flow cells | 兼容OpenST、seq-scope、Stereo-seq等协议 |
| 9483 | 2025-10-07 |
SciGeneX: enhancing transcriptional analysis through gene module detection in single-cell and spatial transcriptomics data
2025-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf043
PMID:40248490
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研究论文 | 介绍用于单细胞和空间转录组数据分析的R包SciGeneX，通过基因模块检测增强转录分析能力 | 采用邻域分析和图分割方法生成共表达基因模块，能够发现传统方法忽略的稀有细胞群体 | NA | 开发新的计算方法来更好地解析单细胞和空间转录组数据中的细胞异质性 | 单细胞RNA测序和空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 邻域分析，图分割方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 9484 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing highlights the role of proinflammatory fibroblasts, vascular endothelial cells, and immune cells in the keloid immune microenvironment
2025-May, International journal of dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/ijd.17516
PMID:39450923
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示促炎性成纤维细胞、血管内皮细胞和免疫细胞在瘢痕疙瘩免疫微环境中的作用 | 首次系统阐明促炎性成纤维细胞和血管内皮细胞在瘢痕疙瘩免疫微环境中的关键作用 | 样本量较小（3例瘢痕疙瘩和2例正常皮肤），需进一步验证 | 探究瘢痕疙瘩免疫微环境中细胞的功能状态 | 瘢痕疙瘩组织和正常皮肤组织 | 单细胞测序分析 | 瘢痕疙瘩 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例瘢痕疙瘩病变组织，2例正常皮肤标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9485 | 2025-10-07 |
Heterogeneity of the tumor immune cell microenvironment revealed by single-cell sequencing in head and neck cancer
2025-May, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.104677
PMID:40023465
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综述 | 本文综述单细胞测序技术在头颈癌肿瘤免疫微环境异质性研究中的应用与价值 | 系统阐述单细胞测序技术在解析头颈癌免疫微环境细胞异质性方面的独特优势 | NA | 探讨单细胞测序技术在头颈癌研究中的应用潜力 | 头颈癌肿瘤免疫微环境细胞 | 数字病理 | 头颈癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9486 | 2025-10-07 |
Comprehensive characterization of T cell subtypes in lung adenocarcinoma: Prognostic, predictive, and therapeutic implications
2025-May, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102332
PMID:40184717
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习算法开发了肺腺癌T细胞相关预后标志物，并验证了CPA3基因在CD4+ T细胞中的免疫功能 | 整合多种机器学习算法开发了基于T细胞特征的肺腺癌预后标志物，首次发现CPA3在CD4+ T细胞特别是Th1细胞中的表达及其促进肿瘤细胞凋亡的机制 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步临床验证；体外实验的生理相关性需要更多体内研究支持 | 开发肺腺癌预后预测模型并探索T细胞在肿瘤免疫中的作用机制 | 肺腺癌患者和CD4+ T细胞 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，机器学习算法，体外实验，分子生物学技术 | Lasso + PLSRcox，10种机器学习算法 | 基因表达数据，临床数据 | TCGA、GSE31210、GSE50081和GSE68465数据集中的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9487 | 2025-10-07 |
Polarity-guided uneven mitotic divisions control brassinosteroid activity in proliferating plant root cells
2025-Apr-17, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.02.011
PMID:40068682
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序与长期活细胞成像技术，揭示了拟南芥根细胞中油菜素甾醇活性在细胞周期中的波动规律及其受极性引导的不均等有丝分裂调控机制 | 首次发现母细胞固有极性驱动有丝分裂后油菜素甾醇活性恢复，导致两个子细胞分别增强信号传导和促进生物合成，从而规避负反馈环路 | 研究仅针对拟南芥根尖分生组织，在其他植物组织或物种中的普适性有待验证 | 探究油菜素甾醇在植物增殖组织中的功能及其调控机制 | 拟南芥根尖分生组织细胞 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，长期活细胞成像 | NA | 基因表达数据，细胞影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9488 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing of human double-negative T cells reveals a favorable cellular signature for cancer therapy
2025-Apr-17, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010684
PMID:40246580
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人类双阴性T细胞在癌症治疗中的有利细胞特征 | 首次在单细胞水平比较双阴性T细胞与传统Vδ2 T细胞的转录组差异，发现DNTs独特的细胞组成和持久性特征 | 研究主要基于健康供体样本，在癌症患者中的验证仍需进一步研究 | 阐明双阴性T细胞的生物学特性及其在癌症治疗中的优势 | 人类双阴性T细胞和Vδ2 T细胞 | 单细胞生物学 | 白血病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，异种移植模型 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康供体来源的T细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9489 | 2025-10-07 |
Hypoxia-induced Wnt5a-secreting fibroblasts promote colon cancer progression
2025-Apr-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58748-9
PMID:40246836
|
研究论文 | 本研究揭示了缺氧诱导的成纤维细胞通过分泌Wnt5a促进结肠癌进展的机制 | 首次发现Wnt5a在肿瘤腔面附近的成纤维细胞中表达，并阐明其通过抑制血管生成维持缺氧诱导炎症性成纤维细胞（InfFib）的恶性循环机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床样本验证尚需进一步加强 | 探究Wnt5a在结肠癌进展中的来源和作用机制 | 结肠癌、成纤维细胞、内皮细胞 | 癌症生物学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序、meta分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 人和小鼠结肠成纤维细胞单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9490 | 2025-10-07 |
MIRO1 mutation leads to metabolic maladaptation resulting in Parkinson's disease-associated dopaminergic neuron loss
2025-Apr-17, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-025-00509-x
PMID:40246848
|
研究论文 | 本研究利用携带MIRO1 p.R272Q突变的患者特异性iPSC来源中脑类器官，探索帕金森病多巴胺能神经元退化的细胞和分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序分析和代谢建模揭示MIRO1突变导致多巴胺能神经元发育路径异常和代谢缺陷，破坏神经元-星形胶质细胞代谢互作 | 研究基于单一患者来源的iPSC模型，样本规模有限 | 探索MIRO1突变导致帕金森病多巴胺能神经元丢失的分子机制 | 携带MIRO1 p.R272Q突变的人iPSC来源中脑类器官 | 神经科学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序, 代谢建模 | NA | 单细胞转录组数据 | 患者特异性iPSC来源中脑类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9491 | 2025-10-07 |
PRC1 as an independent adverse prognostic factor in Wilms tumor via integrated bioinformatics and experimental validation
2025-Apr-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-98030-y
PMID:40247060
|
研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析和实验验证，揭示了PRC1作为Wilms肿瘤独立不良预后因子及其作用机制 | 首次系统性地将PRC1鉴定为Wilms肿瘤的独立预后因子，并通过单细胞RNA-seq和功能实验验证了其在EMT和肿瘤转移中的作用 | 研究主要基于公共数据库和体外细胞实验，需要更多临床样本和体内实验验证 | 探究PRC1在Wilms肿瘤中的预后价值和分子机制 | Wilms肿瘤患者样本和WIT-49细胞系 | 生物信息学 | Wilms肿瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 功能富集分析, 免疫分析, 基因组分析, 体外功能实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 基因组变异数据 | 来自TARGET数据库的批量RNA-seq数据和GSE200256单细胞RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 9492 | 2025-10-07 |
Dynamic evolution and antitumor mechanisms of CXCR6+CD8+ T cells in small cell lung cancer treated with low-dose radiotherapy and immunotherapy
2025-Apr-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06450-1
PMID:40247265
|
研究论文 | 本研究揭示了低剂量放疗联合免疫治疗中小细胞肺癌内CXCR6+CD8+ T细胞的动态演变及其抗肿瘤机制 | 首次描绘了CD8+ T细胞从肿瘤引流淋巴结向肿瘤部位迁移并分化为效应表型的动态轨迹，并发现树突状细胞在此过程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，临床验证仍需进一步扩大样本量 | 阐明低剂量放疗联合免疫治疗中小细胞肺癌T细胞动态变化及抗肿瘤机制 | 小细胞肺癌小鼠模型及临床患者队列 | 肿瘤免疫学 | 小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞数据，免疫荧光图像，临床队列数据 | Kaede荷瘤小鼠及临床患者队列（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9493 | 2025-10-07 |
High-fat diet alters retinal lipid composition and gene expression networks in mice
2025-Apr-17, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02212-z
PMID:40247316
|
研究论文 | 通过多组学研究揭示高脂饮食通过替代性胆汁酸合成途径影响视网膜脂质代谢和基因表达网络 | 首次在单细胞分辨率下系统分析高脂饮食对不同视网膜细胞类型的影响，发现穆勒胶质细胞在视网膜脂质代谢中的关键作用 | 研究仅使用小鼠模型，结果向人类临床应用的转化需要进一步验证 | 探究高脂饮食对视网膜脂质代谢和基因表达的影响机制 | 高脂饮食喂养6个月的小鼠视网膜组织 | 生物医学 | 视网膜疾病 | 脂质组学,蛋白质组学,单细胞转录组测序 | NA | 脂质组数据,蛋白质组数据,单细胞转录组数据 | 高脂饮食和正常饮食小鼠的视网膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq,脂质组学,蛋白质组学 | NA | NA |
| 9494 | 2025-10-07 |
Molecular features and diagnostic modeling of synovium- and IPFP-derived OA macrophages in the inflammatory microenvironment via scRNA-seq and machine learning
2025-Apr-17, Journal of orthopaedic surgery and research
IF:2.8Q1
DOI:10.1186/s13018-025-05793-1
PMID:40247403
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和机器学习研究骨关节炎滑膜和髌下脂肪垫来源巨噬细胞的分子特征及诊断模型 | 首次通过单细胞RNA测序揭示OA巨噬细胞在炎症微环境中的核心作用，并开发了基于四个基因的OAMGS诊断评分系统 | 研究样本量有限，需要更大规模验证；动物模型与人类疾病存在差异 | 探究骨关节炎中巨噬细胞的功能及其临床意义 | 正常和骨关节炎患者的滑膜和髌下脂肪垫组织 | 机器学习 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序，机器学习，免疫荧光染色，RT-qPCR | 机器学习算法 | 单细胞RNA测序数据 | 正常和OA患者样本，大鼠OA模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9495 | 2025-10-07 |
Explainable modeling of single-cell perturbation data using attention and sparse dictionary learning
2025-Apr-16, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101245
PMID:40187352
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研究论文 | 提出了一种名为CellCap的可解释深度学习模型，用于分析单细胞扰动数据 | 结合注意力机制和稀疏字典学习，在潜在空间中解构细胞状态特异性扰动响应，提高了模型的可解释性 | 未明确说明模型在更广泛数据集上的泛化能力 | 开发可解释的计算方法分析单细胞扰动实验数据 | 单细胞转录组数据及其对遗传和化合物扰动的响应 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | 深度生成模型, 注意力机制, 稀疏字典学习 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9496 | 2025-10-07 |
Clinical significance and immune infiltration analyses of the coagulation factor V gene in brain lower grade glioma
2025-Apr-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02124-y
PMID:40237931
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析探讨凝血因子V在低级别脑胶质瘤中的临床意义和免疫浸润特征 | 首次在泛癌分析中发现FV在LGG中高表达，鉴定hsa-miR-665为其最有效上游miRNA，并揭示FV表达与肿瘤免疫浸润的负相关关系 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证 | 探究凝血因子V在低级别脑胶质瘤中的生物学功能和临床意义 | 低级别脑胶质瘤组织和相关基因表达数据 | 生物信息学 | 脑胶质瘤 | 单细胞RNA测序, DNA甲基化分析, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 临床预后数据, 甲基化数据 | TCGA和GTEx数据库中的泛癌样本和LGG样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9497 | 2025-10-07 |
Inflammatory conditions shape phenotypic and functional characteristics of lung-resident memory T cells in mice
2025-Apr-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58931-y
PMID:40240341
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研究论文 | 本研究比较了腺病毒载体疫苗和H1N1感染诱导的小鼠肺组织驻留记忆T细胞的特征差异 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了疫苗诱导与感染诱导的肺组织驻留记忆T细胞在表型和功能特征上的差异 | 研究仅限于BALB/c小鼠模型，未在人类或其他动物模型中验证 | 探究炎症条件如何影响肺组织驻留记忆T细胞的表型和功能特征 | BALB/c小鼠的肺组织驻留记忆T细胞 | 免疫学 | 呼吸道感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | BALB/c小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9498 | 2025-10-07 |
PDT-regulated immune gene prognostic model reveals tumor microenvironment in colorectal cancer liver metastases
2025-Apr-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-97667-z
PMID:40240471
|
研究论文 | 构建了PDT调控的免疫基因预后模型用于评估结直肠癌肝转移患者的预后和临床治疗反应 | 首次建立基于光动力疗法调控的免疫相关基因预后模型，并揭示了该模型与肿瘤免疫微环境的关系 | 模型验证仍需更大样本量的临床研究确认 | 构建结直肠癌肝转移的预后预测模型并探索其临床应用价值 | 结直肠癌肝转移患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | WGCNA, GO分析, GSEA, 单细胞测序, 甲基化分析, 突变分析 | 基因预后模型 | 基因表达数据, 甲基化数据, 突变数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 9499 | 2025-10-07 |
Multiple machine learning algorithms identified SLC6A8 as a diagnostic biomarker of the late stage of Hepatocellular carcinoma
2025-Apr-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02351-3
PMID:40240560
|
研究论文 | 本研究通过机器学习算法鉴定SLC6A8作为肝细胞癌晚期诊断的生物标志物 | 首次通过多种机器学习算法(LASSO-LR/SVM-RFE/RF-Boruta)联合鉴定SLC6A8作为HCC晚期诊断标志物，并结合单细胞转录组数据验证 | 基于已发表数据集进行整合分析，缺乏独立验证队列 | 识别肝细胞癌早期诊断关键基因并研究早期与晚期HCC免疫细胞浸润差异 | 肝细胞癌患者基因表达数据和免疫细胞浸润特征 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 基因集富集分析(GSEA), 单细胞转录组测序 | LASSO-LR, SVM-RFE, RF-Boruta | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 基于两个已发表数据集，包含575个差异表达基因 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9500 | 2025-10-07 |
Integrating bulk, single-cell, and spatial transcriptomics to identify and functionally validate novel targets to enhance immunotherapy in NSCLC
2025-Apr-16, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00893-x
PMID:40240582
|
研究论文 | 本研究通过整合多种转录组数据识别并验证了非小细胞肺癌中程序性细胞死亡相关基因作为免疫治疗新靶点 | 首次构建结合坏死性凋亡和自噬基因的联合细胞死亡指数(CCDI)，并通过多组学数据验证其在免疫治疗预测中的价值 | 样本量有限，仅验证了12对临床样本，需要更大规模研究确认 | 识别和验证增强非小细胞肺癌免疫治疗疗效的新靶点 | 非小细胞肺癌患者样本、癌细胞系、小鼠模型 | 生物信息学 | 肺癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 多基因特征模型 | 基因表达数据 | 5个单细胞RNA测序数据集, 2个空间转录组数据集, 12对NSCLC肿瘤和正常组织 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |