单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 9461 - 9480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9461 | 2024-08-23 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals a decrease in the frequency of macrophage-RGS1high subsets in patients with osteoarticular tuberculosis
2024-Aug-10, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00886-9
PMID:39123125
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了骨关节结核患者中免疫细胞亚群的表型和功能 | 首次揭示了骨关节结核患者中巨噬细胞-RGS1高表达亚群频率的降低，并探讨了其在结核感染中的作用 | 研究仅限于病理组织和健康邻近组织的单细胞RNA测序分析，未涉及更广泛的样本类型 | 探究骨关节结核患者中免疫细胞亚群的表型和功能 | 骨关节结核患者的病理组织和健康邻近组织 | 数字病理学 | 骨关节疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 骨关节结核患者和健康对照组的组织样本 |
| 9462 | 2024-08-23 |
The influence of CLEC5A on early macrophage-mediated inflammation in COPD progression
2024-Aug-04, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05375-0
PMID:39097839
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研究论文 | 本研究分析了早期慢性阻塞性肺病（COPD）患者的肺组织测序数据和烟雾暴露小鼠模型，通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）和机器学习识别潜在致病基因，并使用单细胞测序和细胞间通讯分析来验证CLEC5A在早期COPD中的作用。 | 本研究首次将CLEC5A确定为早期COPD的关键基因，并通过体外实验验证了其在促进炎症反应中的作用。 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，需要进一步的体内实验来全面验证CLEC5A在COPD中的作用。 | 阐明影响早期COPD进展的遗传因素，特别是与气道炎症和重塑相关的基因。 | 早期COPD患者的肺组织和烟雾暴露小鼠。 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺病 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）、单细胞测序、机器学习 | NA | 基因表达数据 | 包括早期COPD患者的肺组织和烟雾暴露小鼠的样本。 |
| 9463 | 2024-08-23 |
Somatic BrafV600E mutation in the cerebral endothelium induces brain arteriovenous malformations
2024-Aug, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-024-09918-8
PMID:38700584
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研究论文 | 本文开发了一种新的脑动静脉畸形（BAVM）小鼠模型，该模型与人类临床表现一致 | 成功诱导了与人类病变相似的BAVM小鼠模型，并进行了单细胞测序以揭示差异表达基因 | Dabrafenib在治疗已建立的BAVM病变中的疗效尚不确定 | 开发一种临床一致的BAVM动物模型，以研究其生物学机制并开发创新治疗策略 | 脑动静脉畸形（BAVM）及其治疗策略 | NA | 脑血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 不同年龄组和脑区域的小鼠 |
| 9464 | 2024-08-23 |
Bariatric surgery induces pancreatic cell transdifferentiation as indicated by single-cell transcriptomics in Zucker diabetic rats
2024-Aug, Journal of diabetes
IF:3.0Q2
DOI:10.1111/1753-0407.13521
PMID:38149757
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术，探讨了减肥手术如何影响Zucker糖尿病肥胖大鼠胰腺细胞亚群的分化和转变 | 首次通过单细胞转录组图谱，全面描述了减肥手术后胰腺内分泌细胞的异质性和分化情况 | 需要进一步研究以阐明这些结果 | 旨在阐明减肥手术如何修改胰腺细胞亚群的分化和转变 | 8周龄的Zucker糖尿病肥胖大鼠 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 25只大鼠（袖状胃切除术9只，Roux-en-Y胃旁路手术9只，假手术7只） |
| 9465 | 2024-08-23 |
Single-cell RNA sequencing technology in human spermatogenesis: Progresses and perspectives
2024-Aug, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-023-04840-x
PMID:37659974
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在人类精子发生中的应用及其进展和展望 | 介绍了单细胞RNA测序技术在男性生殖领域的独特洞察力和深度挖掘分析能力 | 讨论了该技术在男性生殖应用中的挑战 | 总结单细胞RNA测序技术在不同发育阶段和病理状态下精子发生中的研究成果和应用方向 | 研究对象包括原始生殖细胞、精原干细胞、Sertoli细胞等关键细胞以及不同类型的男性不育疾病 | NA | 男性不育 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 涵盖新生儿、青春期前、青春期和成年阶段的不同时期数据 |
| 9466 | 2024-08-23 |
Human post-implantation blastocyst-like characteristics of Muse cells isolated from human umbilical cord
2024-Jul-11, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05339-4
PMID:38992309
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研究论文 | 本文研究了从人脐带中分离出的Muse细胞，这些细胞表现出类似人类植入后囊胚的特征 | 首次发现人脐带中的SSEA-3阳性细胞具有类似植入后囊胚的特性，并且表达与成人组织Muse细胞不同的基因和DNA甲基化模式 | NA | 探讨人脐带中Muse细胞的特性及其在人类早期发育和生殖医学中的潜在应用 | 人脐带中的SSEA-3阳性Muse细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约20%的人脐带SSEA-3阳性细胞 |
| 9467 | 2024-08-23 |
Differential expression and prognostic value of TLR4 in kidney renal clear cell carcinoma
2024-Jun, Molecular and cellular probes
IF:2.3Q4
DOI:10.1016/j.mcp.2024.101959
PMID:38579915
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序和批量RNA测序数据结合体外研究，评估了TLR4在肾透明细胞癌中的表达及其预后价值 | 首次详细探讨了TLR4在肾透明细胞癌中的表达及其与免疫细胞浸润的关系，并发现TLR4在女性患者中具有保护作用 | 研究仅在特定细胞系和性别中进行了分析，可能需要更多的样本和性别来验证结果 | 评估TLR4在肾透明细胞癌中的表达及其预后价值 | TLR4在肾透明细胞癌中的表达及其与免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | 肾癌 | RNA测序 | NA | RNA | 未具体说明样本数量 |
| 9468 | 2024-08-23 |
Bone marrow CD8+ Trm cells induced by IL-15 and CD16+ monocytes contribute to HSPC destruction in human severe aplastic anemia
2024-Jun, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110223
PMID:38636890
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了严重再生障碍性贫血（SAA）患者和健康捐赠者的外周血单个核细胞（PBMCs）和骨髓单个核细胞（BMMCs），发现骨髓中的CD8 Trm细胞通过高表达IFN-γ和FasL，增强了对造血干细胞和祖细胞（HSPCs）的诱导凋亡能力。 | 首次揭示了IL-15诱导的CD8 Trm细胞在SAA患者中作为病理性细胞，介导HSPC破坏的机制。 | NA | 探究严重再生障碍性贫血（SAA）中T细胞诱导的造血干细胞和祖细胞（HSPCs）破坏的机制。 | 严重再生障碍性贫血（SAA）患者和健康捐赠者的外周血单个核细胞（PBMCs）和骨髓单个核细胞（BMMCs）。 | NA | 再生障碍性贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 严重再生障碍性贫血（SAA）患者和健康捐赠者的外周血单个核细胞（PBMCs）和骨髓单个核细胞（BMMCs） |
| 9469 | 2024-08-07 |
A New Immunological Index for the Elderly: High Proportion of Multiple TCR T Cells Based on scRNA-Seq
2024-May-07, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2023.0509-1
PMID:38722790
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9470 | 2024-08-23 |
Role of macrophages in regression of myocardial fibrosis following alleviation of left ventricular pressure overload
2024-05-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00240.2023
PMID:38363214
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研究论文 | 本研究探讨了巨噬细胞在减轻左心室压力超负荷后心肌纤维化消退中的作用 | 首次展示了巨噬细胞在心肌纤维化发展和消退过程中的动态变化及其对胶原降解和部分纤维化消退的潜在益处 | NA | 确定心肌巨噬细胞表型在横断主动脉缩窄（TAC）和解除TAC（unTAC）后的时间变化，并研究巨噬细胞耗竭是否影响unTAC后的胶原降解 | 心肌巨噬细胞的数量和表型 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 免疫组织化学、流式细胞术、RT-PCR、免疫测定和免疫印迹 | NA | 图像 | 包括非TAC、2周、4周TAC，以及2周、4周和6周unTAC的样本 |
| 9471 | 2024-08-23 |
Mechanosensitive protein polycystin-1 promotes periosteal stem/progenitor cells osteochondral differentiation in fracture healing
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.93269
PMID:38646641
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研究论文 | 本研究使用多种小鼠模型和单细胞RNA测序技术，分析了机械敏感蛋白polycystin-1在骨折愈合中促进骨膜干细胞/祖细胞骨软骨分化的关键作用 | 首次揭示了polycystin-1通过PC1-TAZ轴感知机械力，促进骨折愈合的新机制 | NA | 探究机械力在骨折愈合中的调控机制 | 机械敏感蛋白polycystin-1及其在骨折愈合中的作用 | NA | 骨折 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用多种小鼠模型进行研究 |
| 9472 | 2024-08-23 |
Targeting the Cascade Amplification of Macrophage Colony-stimulating Factor to Alleviate the Immunosuppressive Effects Following Radiotherapy
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0450
PMID:39165639
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研究论文 | 本文研究了放射治疗（RT）后免疫抑制效应的缓解方法，通过靶向巨噬细胞集落刺激因子（MCSF）的级联放大作用来增强RT的免疫激活效应。 | 本文首次发现并验证了放射治疗后肿瘤细胞来源的MCSF上调，并通过抑制MCSF来增强RT的免疫激活效应。 | NA | 研究如何通过调节放射治疗后的免疫抑制环境来增强其治疗效果。 | 放射治疗后的免疫抑制效应及巨噬细胞集落刺激因子（MCSF）的作用机制。 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 9473 | 2024-08-23 |
Insights into preeclampsia: a bioinformatics approach to deciphering genetic and immune contributions
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1372164
PMID:39165753
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研究论文 | 本研究利用孟德尔随机化（MR）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，探讨了子痫前期的遗传和分子机制，为诊断和治疗提供了新视角 | 通过scRNA-seq技术发现了子痫前期患者与对照组在T辅助细胞（Th细胞）中的显著细胞类型分布差异，并揭示了与子痫前期直接相关的6个基因 | 由于数据限制，pQTL分析结果不明确 | 阐明子痫前期的遗传和分子基础，探索新的诊断和治疗途径 | 子痫前期的遗传和免疫贡献 | 生物信息学 | 妊娠相关疾病 | 孟德尔随机化（MR）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据、表达数据、蛋白质定量性状位点（eQTL和pQTL）数据、单细胞数据 | 外周血单个核细胞（PBMCs） |
| 9474 | 2024-08-23 |
Corrigendum: Single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells from acute myocardial infarction
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1462970
PMID:39170610
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9475 | 2024-08-23 |
Single-cell RNA sequencing identifies eggplant as a regulator of germ cell development in Drosophila
2023-Oct-09, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202256475
PMID:37603128
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RNAi筛选和生物信息学分析，鉴定了影响果蝇卵巢生殖干细胞（GSCs）发育的基因，特别是名为eggplant（eggpl）的基因 | 首次鉴定并命名了eggplant基因，并揭示了其在调节生殖细胞增殖和分化中的作用 | NA | 探索调节果蝇早期生殖细胞发育的信号网络 | 果蝇卵巢生殖干细胞（GSCs）及其发育过程中的基因调控 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 包括34个在早期生殖细胞发育中表达上调的基因和19个可能调节生殖细胞分化的基因 |
| 9476 | 2024-08-23 |
Tertiary lymphoid structures correlate with enhancement of antitumor immunity in esophageal squamous cell carcinoma
2023-10, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-023-02396-7
PMID:37604932
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研究论文 | 本文研究了三级淋巴结构（TLSs）与食管鳞状细胞癌（ESCC）预后及肿瘤免疫微环境（TIME）的关系 | 首次探讨了TLSs在ESCC中的预后意义及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 研究样本量有限，且仅限于ESCC组织 | 探讨TLSs在ESCC中的预后意义及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 180例ESCC组织样本及14例ESCC组织的单细胞RNA测序 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 组织样本 | 180例ESCC组织样本及14例ESCC组织 |
| 9477 | 2024-08-23 |
Thrombospondin-1 promotes fibro-adipogenic stromal expansion and contractile dysfunction of the diaphragm in obesity
2023-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.17.553733
PMID:37645822
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研究论文 | 研究探讨了肥胖状态下膈肌功能障碍与血栓调节蛋白-1（THBS1）的关系 | 首次揭示THBS1在肥胖诱导的膈肌纤维脂肪性基质扩张和收缩功能障碍中的作用 | 研究仅在动物模型中进行，需要进一步的人体研究验证 | 探究肥胖状态下膈肌功能障碍的病理生理机制 | 肥胖小鼠的膈肌功能 | NA | 肥胖 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 野生型和敲除小鼠的膈肌样本 |
| 9478 | 2024-08-23 |
Toward modeling metabolic state from single-cell transcriptomics
2022-03, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2021.101396
PMID:34785394
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研究论文 | 本文总结了单细胞代谢测量和建模方法的当前状态，并探讨了计算技术在预测单细胞代谢中的应用 | 提出利用先验代谢网络知识结合可测量组学层数据进行代谢状态预测，并探讨了潜在的模型扩展和计算方法 | 单细胞水平的代谢测量存在可扩展性和敏感性不足的问题，且目前无法与测量转录状态同时进行 | 探索单细胞代谢建模的新方法，以更好地理解细胞功能 | 单细胞代谢状态的测量和建模 | 生物信息学 | NA | 计算建模 | 路径级分析、基于约束的建模和动力学建模 | 转录组数据 | NA |
| 9479 | 2024-08-23 |
Multiomic characterization of pancreatic cancer-associated macrophage polarization reveals deregulated metabolic programs driven by the GM-CSF-PI3K pathway
2022-02-14, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.73796
PMID:35156921
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研究论文 | 本文通过体外培养肿瘤教育巨噬细胞（TEMs）并进行多组学分析，揭示了胰腺癌相关巨噬细胞极化的独特遗传和代谢特征 | 本文首次揭示了胰腺癌相关巨噬细胞（TAMs）的独特遗传和代谢特征，并确定了新的代谢标记物，如ARG1、ACLY和TXNIP | 本文主要依赖于体外模型系统，未来研究需要进一步验证这些发现是否适用于体内环境 | 研究胰腺癌相关巨噬细胞的极化特征及其在疾病进展中的作用 | 胰腺癌相关巨噬细胞（TAMs）及其极化特征 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 多组学分析（转录组学、蛋白质组学、代谢组学） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 |
| 9480 | 2024-08-23 |
Benchmarking clustering algorithms on estimating the number of cell types from single-cell RNA-sequencing data
2022-02-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02622-0
PMID:35135612
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研究论文 | 本文系统地评估了多种流行的聚类算法在估计单细胞RNA测序数据中细胞类型数量的性能 | 首次系统地比较了多种聚类算法在不同设置下单细胞RNA测序数据中细胞类型数量估计的性能 | 研究主要基于Tabula Muris和Tabula Sapiens数据集，可能需要进一步验证在其他数据集上的适用性 | 评估和比较不同聚类算法在单细胞RNA测序数据中估计细胞类型数量的性能 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型数量估计 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类算法 | 基因表达数据 | 使用Tabula Muris和Tabula Sapiens数据集，包含不同数量和比例的细胞类型 |