单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27818 篇文献，本页显示第 9461 - 9480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9461 | 2024-09-07 |
Intracellular and Intercellular Gene Regulatory Network Inference From Time-Course Individual RNA-Seq
2021, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2021.777299
PMID:36303726
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研究论文 | 本文研究了从时间序列单个RNA-Seq数据中推断细胞内和细胞间基因调控网络的方法 | 本文提出了一种基于时间序列批量RNA-Seq数据推断基因调控网络的方法，能够揭示多细胞生物中的细胞间调控关系 | 本文仅使用了小鼠早期发育阶段的RNA-Seq数据，未来研究可以扩展到其他物种和发育阶段 | 研究多细胞生物中细胞内和细胞间基因调控网络的推断方法 | 小鼠早期发育阶段的基因调控网络 | 基因组学 | NA | RNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 多个小鼠胚胎 |
| 9462 | 2024-09-07 |
Fast, sensitive and accurate integration of single-cell data with Harmony
2019-12, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-019-0619-0
PMID:31740819
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Harmony的算法，用于快速、灵敏且准确地整合单细胞RNA测序数据 | Harmony算法能够将细胞投影到一个共享嵌入空间中，使得细胞按细胞类型分组而非数据集特定的条件，同时考虑了多个实验和生物因素 | NA | 开发一种高效的方法来整合不同技术测量的单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据，包括外周血单核细胞、胰腺胰岛细胞、小鼠胚胎发育数据以及空间转录组学数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | Harmony算法 | RNA测序数据 | 约10个细胞 |
| 9463 | 2024-09-06 |
Time-resolved scRNA-seq reveals transcription dynamics of polarized macrophages with influenza A virus infection and antigen presentation to T cells
2024-Dec, Emerging microbes & infections
IF:8.4Q1
DOI:10.1080/22221751.2024.2387450
PMID:39129565
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研究论文 | 本研究利用时间分辨单细胞测序技术结合代谢RNA标记，揭示了流感A病毒感染后骨髓来源巨噬细胞在不同极化状态下的转录动态变化 | 本研究首次采用时间分辨单细胞测序技术，捕捉了传统scRNA-seq方法所缺乏的转录活动的时间维度，并揭示了M2极化巨噬细胞是支持流感A病毒成功复制的唯一状态 | NA | 研究流感A病毒感染后骨髓来源巨噬细胞在不同极化状态下的转录动态变化及其对T细胞抗原呈递能力的影响 | 骨髓来源巨噬细胞在流感A病毒感染后的转录动态变化及其对CD4和CD8 T细胞的抗原呈递能力 | 数字病理学 | 流感 | 时间分辨单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 9464 | 2024-09-06 |
Comprehensive scRNA-seq analysis to identify new markers of M2 macrophages for predicting the prognosis of prostate cancer
2024-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2024.2398195
PMID:39221762
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析识别M2巨噬细胞的新标记物，用于预测前列腺癌的预后 | 首次通过单细胞RNA测序和加权基因共表达网络分析（WGCNA）整合M2巨噬细胞的标记基因和枢纽基因，筛选出前列腺癌的预后基因签名 | 研究主要基于公共数据库的数据，缺乏体内实验验证 | 探讨M2巨噬细胞在前列腺癌中的预后价值 | M2巨噬细胞及其相关基因在前列腺癌中的作用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | 基因表达数据 | 2431个M2巨噬细胞标记基因和650个枢纽基因 |
| 9465 | 2024-09-06 |
Enhanced desmosome assembly driven by acquired high-level desmoglein-2 promotes phenotypic plasticity and endocrine resistance in ER+ breast cancer
2024-Sep-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217179
PMID:39154704
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研究论文 | 本研究探讨了desmoglein-2在ER+乳腺癌内分泌治疗耐药性和细胞可塑性中的作用 | 首次揭示了DSG2在ER+乳腺癌内分泌耐药中的关键作用，并提出了DSG2标志物可能用于治疗干预 | 研究主要基于体外和异种移植模型，需要进一步的临床验证 | 探讨DSG2在ER+乳腺癌内分泌耐药中的作用机制 | ER+乳腺癌细胞和异种移植模型 | NA | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了fulvestrant耐药的ER+乳腺癌模型 |
| 9466 | 2024-09-06 |
A novel in vitro tubular model to recapitulate features of distal airways: The bronchioid
2024-Sep-04, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00562-2024
PMID:39231631
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研究论文 | 本文介绍了一种新型体外管状模型，用于再现远端气道的特征 | 开发了一种名为bronchioid的模型，通过封装人支气管成体干细胞在海藻酸盐凝胶管状支架中，成功模拟了小气道的结构和功能 | 需要精细控制收缩水平以建立具有生理相关形状和大小的bronchiole模型 | 旨在克服当前体外培养系统的局限性，建立一种能够再现小气道结构和功能的模型 | 人支气管成体干细胞和小气道的结构与功能 | 数字病理学 | NA | 3D成像、基因表达分析和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 从临床样本中提取的人支气管成体干细胞 |
| 9467 | 2024-09-06 |
Identification of Therapy-Induced Clonal Evolution and Resistance Pathways in Minimal Residual Clones in Multiple Myeloma through Single-Cell Sequencing
2024-Sep-03, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-0545
PMID:38900040
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究多发性骨髓瘤中治疗诱导的克隆进化和耐药途径 | 首次应用单细胞RNA测序技术分析多发性骨髓瘤患者治疗前后的骨髓样本，揭示了治疗后转录组进化的三种主要轨迹，并发现了遗传和非遗传因素在驱动克隆进化中的显著相关性 | 样本量相对较小，且仅限于骨髓样本，可能无法全面反映所有患者的治疗反应 | 深入理解多发性骨髓瘤中治疗诱导的克隆进化分子机制 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓样本 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 38个骨髓样本，包括1个意义未明的单克隆丙种球蛋白病、19个诊断时的多发性骨髓瘤患者、17个治疗后的多发性骨髓瘤患者和1个健康供体 |
| 9468 | 2024-09-06 |
RAB13 regulates macrophage polarization in sepsis
2024-09-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-71771-y
PMID:39223234
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研究论文 | 研究RAB13在脓毒症患者外周血中的核心靶点作用及其分子功能和可能的机制 | 首次揭示RAB13在脓毒症中的潜在核心靶点作用，并通过单细胞测序和细胞实验验证了其促进巨噬细胞向M2表型分化的功能 | 研究样本量较小，且仅限于脓毒症患者和健康对照组，未来需扩大样本量并纳入更多疾病状态以验证结果的普适性 | 探讨RAB13在脓毒症中的分子功能及其可能的机制 | 脓毒症患者的外周血和单核细胞 | NA | 脓毒症 | RNA-seq, 10×单细胞测序 | NA | RNA | 脓毒症患者21例，健康个体9例 |
| 9469 | 2024-09-06 |
Combined deletion of Mct8 and Dio2 impairs SVZ neurogliogenesis and olfactory function in adult mice
2024-Sep, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2024.106572
PMID:38901782
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研究论文 | 研究了Mct8和Dio2基因缺失对成年小鼠SVZ神经胶质发生和嗅觉功能的影响 | 首次探讨了MCT8和DIO2在成年小鼠SVZ神经胶质发生中的作用，并揭示了其在神经退行性和脱髓鞘疾病中的潜在治疗靶点 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨MCT8和DIO2在成年小鼠SVZ神经胶质发生中的作用 | 成年小鼠的SVZ神经干细胞和嗅觉功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Mct8/Dio2敲除小鼠和野生型小鼠 |
| 9470 | 2024-09-06 |
Hematopoiesis after anti-CD117 monoclonal antibody treatment in the settings of wild-type and Fanconi anemia mice
2024-Sep-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2023.284275
PMID:38572555
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研究论文 | 研究抗CD117单克隆抗体在野生型和范可尼贫血小鼠中的造血作用 | 发现抗CD117单克隆抗体ACK2在治疗后不会引起短期DNA损伤，并且在范可尼贫血小鼠中增加了集落形成，表明其对造血干细胞的潜在靶向作用 | 未完全探索这些治疗的短期和长期效应 | 评估抗CD117单克隆抗体ACK2在野生型和范可尼贫血小鼠中的造血效应 | 野生型和范可尼贫血小鼠 | NA | 范可尼贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 野生型和范可尼贫血小鼠 |
| 9471 | 2024-09-06 |
Robust identification of perturbed cell types in single-cell RNA-seq data
2024-Sep-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51649-3
PMID:39218971
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研究论文 | 本文提出了一种名为scDist的计算工具，基于混合效应模型，用于在单细胞RNA测序数据中识别受扰动的细胞类型 | scDist通过混合效应模型提供了一种统计上严谨且计算高效的检测转录组差异的方法，显著优于现有方法 | NA | 开发一种新的计算工具，以准确识别单细胞RNA测序数据中的受扰动细胞类型 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型变化 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 混合效应模型 | 转录组数据 | 有限样本量 |
| 9472 | 2024-09-06 |
The immune microenvironment of steatotic hepatocellular carcinoma: Current findings and future prospects
2024-Sep-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000516
PMID:39225682
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研究论文 | 本文综述了非酒精性脂肪性肝炎相关肝细胞癌（MASH-HCC）的免疫微环境，并探讨了利用单细胞RNA测序、空间转录组学和质谱成像等前沿技术解析其复杂性 | 本文介绍了利用代谢抑制剂、表观遗传抑制剂和免疫调节剂等新型治疗手段，以改善MASH-HCC对PD-1抑制剂的反应 | 本文主要基于临床前模型讨论治疗创新，尚未涉及临床试验数据 | 探讨MASH-HCC的免疫微环境及其对免疫检查点抑制剂的反应，并提出个性化治疗策略 | 非酒精性脂肪性肝炎相关肝细胞癌（MASH-HCC）及其免疫微环境 | 数字病理 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、质谱成像 | NA | RNA | NA |
| 9473 | 2024-09-06 |
NKG2C/KLRC2 tumor cell expression enhances immunotherapeutic efficacy against glioblastoma
2024-Aug-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009210
PMID:39214651
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研究论文 | 研究探讨了NKG2C/KLRC2在胶质母细胞瘤（GBM）中的表达及其对免疫治疗效果的影响 | 发现NKG2C/KLRC2在肿瘤细胞中的高表达与PD-1单克隆抗体治疗效果的增强相关，提示其可能作为免疫检查点抑制剂治疗的预测生物标志物 | 研究结果需要在未来的前瞻性试验中进一步验证 | 探讨NKG2C/KLRC2在GBM中的表达及其对免疫微环境的影响 | 胶质母细胞瘤（GBM）及其免疫微环境 | 免疫学 | 神经系统肿瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 包括大量和单细胞RNA测序的GBM数据集，以及来自两个临床试验的样本 |
| 9474 | 2024-09-06 |
scParser: sparse representation learning for scalable single-cell RNA sequencing data analysis
2024-Aug-16, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03345-0
PMID:39152499
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研究论文 | 提出了一种名为scParser的稀疏表示学习方法，用于可扩展的单细胞RNA测序数据分析 | scParser模型能够揭示基因表达如何影响表型的关键机制，并能识别出对疾病发病机制有贡献的细胞亚群中的生物过程 | NA | 开发一种可扩展的方法，用于整合分析单细胞RNA测序数据，并理解不同细胞群体中生物条件的异质性效应 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 稀疏表示学习 | scParser | RNA测序数据 | NA |
| 9475 | 2024-09-06 |
Periodontal Ligament Cell Apoptosis Activates Lepr+ Osteoprogenitors in Orthodontics
2024-08, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241262706
PMID:39104161
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研究论文 | 研究了正畸牙齿移动过程中牙槽骨重塑的潜在机制，特别是Lepr+成骨前体细胞和牙周韧带细胞的作用 | 首次报道了正畸牙齿移动过程中压缩侧的骨形成现象，并揭示了PDLC凋亡激活Lepr+成骨前体细胞的机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步在人类中验证 | 探讨正畸牙齿移动过程中新骨形成的潜在机制 | Lepr+成骨前体细胞和牙周韧带细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序分析、荧光标记技术 | NA | RNA序列数据 | 小鼠模型和体外细胞培养 |
| 9476 | 2024-09-06 |
Identification and Validation of Prognostic Model for Tumor Microenvironment-Associated Genes in Bladder Cancer Based on Single-Cell RNA Sequencing Data Sets
2024-Aug, JCO precision oncology
IF:5.3Q1
DOI:10.1200/PO.23.00661
PMID:39151107
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，识别并验证了与膀胱癌肿瘤微环境相关的预后模型 | 首次基于单细胞RNA测序数据构建了膀胱癌的预后模型，并验证了其预测性能 | 研究主要基于公共数据库的数据，未来需进行体外验证 | 阐明膀胱癌进展中肿瘤微环境与细胞多样性的关系，并构建预后模型 | 膀胱癌的肿瘤微环境相关基因及预后模型 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归和多变量Cox回归分析 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的正常和肿瘤膀胱细胞数据，以及TCGA的病人随访数据 |
| 9477 | 2024-09-06 |
Dystrophin deficiency impairs cell junction formation during embryonic myogenesis from pluripotent stem cells
2024-Jul-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110242
PMID:39040067
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研究论文 | 研究了肌营养不良蛋白缺乏对人类多能干细胞在胚胎肌生成过程中细胞连接形成的影响 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了肌营养不良蛋白缺乏导致细胞在体节阶段分化为替代分支，并影响了细胞状态转换相关的细胞连接蛋白 | 研究仅限于体外实验，未涉及体内模型 | 探讨肌营养不良蛋白缺乏对胚胎肌生成过程中细胞连接形成的影响 | 人类多能干细胞在胚胎肌生成过程中的细胞连接形成 | 数字病理学 | 肌肉疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 9478 | 2024-09-06 |
Single-cell decoding of drug induced transcriptomic reprogramming in triple negative breast cancers
2024-Jul-18, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03318-3
PMID:39026273
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研究论文 | 研究探讨了三阴性乳腺癌中单细胞转录组在药物诱导下的重编程机制 | 首次结合单细胞转录组和基因组拷贝数数据，揭示了药物诱导下三阴性乳腺癌细胞的克隆响应和转录重编程 | 研究仅限于三阴性乳腺癌，且样本量相对较小 | 探讨药物诱导下三阴性乳腺癌细胞的转录组重编程机制 | 三阴性乳腺癌细胞的单细胞转录组和基因组拷贝数数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 53,641个过滤后的细胞 |
| 9479 | 2024-09-06 |
Salivary Gland Tissue Recombination Can Modify Cell Fate
2024-07, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241247484
PMID:38715201
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研究论文 | 研究探讨了唾液腺组织重组对细胞命运的影响 | 首次全面无偏倚地利用单细胞RNA测序和成像分析，探索组织重组方法对细胞命运调控的影响 | 研究主要集中在胚胎小鼠唾液腺的组织重组，未涉及其他物种或成体组织 | 阐明组织间相互作用在细胞分化中的作用 | 胚胎小鼠唾液腺的间质和上皮组织 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 胚胎小鼠唾液腺的间质和上皮组织 |
| 9480 | 2024-09-06 |
A Novel Mechanism of MSCs Responding to Occlusal Force for Bone Homeostasis
2024-06, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241236120
PMID:38665065
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研究论文 | 研究了咬合力对骨稳态的影响机制，特别是MSC在失去咬合力后对牙槽骨的影响 | 首次揭示了咬合力通过Yap/Taz/Ptn轴调控MSC介导的血管生成，从而维持牙槽骨稳态的机制 | 研究仅在鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨失去咬合力后牙槽骨损失的机制 | 鼠牙槽骨中的非造血细胞（CD45细胞） | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 鼠牙槽骨中的非造血细胞 |