单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
9421	2024-09-10	Protective heterologous T cell immunity in COVID-19 induced by the trivalent MMR and Tdap vaccine antigens 2021-09-10, Med (New York, N.Y.) DOI:10.1016/j.medj.2021.08.004 PMID:34414383	研究论文	研究MMR和Tdap疫苗抗原是否通过诱导交叉反应性T细胞来减轻COVID-19的严重程度	发现MMR和Tdap疫苗诱导的记忆T细胞可以被SARS-CoV-2重新激活，从而提供对严重COVID-19的保护	NA	研究MMR和Tdap疫苗是否通过诱导交叉反应性T细胞来减轻COVID-19的严重程度	COVID-19康复者、未感染者和COVID-19 mRNA疫苗接种者的T细胞	免疫学	COVID-19	酶联免疫吸附试验（ELISA）、酶联免疫斑点试验（ELISpot）、流式细胞术、TCR克隆型分析、单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	T细胞、细胞因子	COVID-19康复者、未感染者和COVID-19 mRNA疫苗接种者的T细胞样本
9422	2024-09-10	A modified vaccinia Ankara vector-based vaccine protects macaques from SARS-CoV-2 infection, immune pathology, and dysfunction in the lungs 2021-03-09, Immunity IF:25.5Q1 DOI:10.1016/j.immuni.2021.02.001 PMID:33631118	研究论文	研究了基于改良安卡拉痘苗（MVA）载体的疫苗对SARS-CoV-2感染的保护作用	首次展示了MVA/S疫苗在非人灵长类动物中诱导强效中和抗体和CD8 T细胞反应，并有效保护免受SARS-CoV-2感染和肺部病理损伤	研究仅限于非人灵长类动物模型，尚未在人类中进行验证	评估基于MVA载体的疫苗对SARS-CoV-2感染的保护效果	SARS-CoV-2感染的非人灵长类动物	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	研究涉及小鼠和非人灵长类动物
9423	2024-09-10	Embryonic lethality and defective mammary gland development of activator-function impaired conditional knock-in Erbb3 V943R mice 2021-Mar, Advanced genetics (Hoboken, N.J.) DOI:10.1002/ggn2.10036 PMID:36618440	研究论文	研究了ERBB3 V943R条件性敲入小鼠模型的胚胎致死性和乳腺发育缺陷	首次报道了ERBB3 V943R条件性敲入小鼠模型，并研究了其对胚胎发育和乳腺发育的影响	仅限于小鼠模型，未涉及人类或其他物种的研究	研究ERBB3 V943R突变对小鼠胚胎发育和乳腺发育的影响	ERBB3 V943R条件性敲入小鼠	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	涉及多个小鼠样本，具体数量未明确
9424	2024-09-09	DC-derived CXCL10 promotes CTL activation to suppress ovarian cancer 2024-Oct, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine IF:6.4Q1 DOI:10.1016/j.trsl.2024.05.013 PMID:38823437	研究论文	研究树突状细胞（DCs）及其CXCL10标记基因在卵巢癌微环境中激活细胞毒性T淋巴细胞（CTLs）的作用及其对疾病进展的影响	揭示了DCs衍生的CXCL10在抑制卵巢癌生长和转移中的关键作用，为卵巢癌治疗提供了潜在的治疗靶点	NA	探讨DCs及其CXCL10标记基因在卵巢癌微环境中激活CTLs的作用及其对疾病进展的影响	树突状细胞（DCs）、细胞毒性T淋巴细胞（CTLs）、卵巢癌	NA	卵巢癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫浸润分析	NA	基因数据	NA
9425	2024-09-09	Single-cell RNA sequencing reveals the MIF/ACKR3 receptor-ligand interaction between neutrophils and nucleus pulposus cells in intervertebral disc degeneration 2024-Oct, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine IF:6.4Q1 DOI:10.1016/j.trsl.2024.05.011 PMID:38823438	研究论文	研究揭示了在椎间盘退变过程中，中性粒细胞与髓核细胞之间的MIF/ACKR3受体-配体相互作用	首次通过单细胞RNA测序揭示了中性粒细胞与髓核细胞之间的MIF/ACKR3轴在椎间盘退变中的作用	研究主要集中在体外和体内实验，缺乏长期临床随访数据	揭示椎间盘退变过程中微环境中中性粒细胞的异质性和功能	中性粒细胞和髓核细胞	数字病理学	脊柱疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA	71520个单细胞，来自5个对照和9个退变椎间盘样本
9426	2024-09-09	Enhanced cytokine signaling and ferroptosis defense interplay initiates obesity-associated pancreatic ductal adenocarcinoma 2024-Oct-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.217162 PMID:39127339	研究论文	研究揭示了肥胖与胰腺导管腺癌之间的机制联系，发现肥胖患者的血清改变了胰腺导管上皮细胞的炎症细胞因子信号和铁死亡防御机制	首次发现肥胖患者的血清通过增强白细胞介素34表达和铁死亡防御之间的相互作用，促进了胰腺导管腺癌的发生	研究主要基于细胞培养和小鼠模型，需要进一步的人体临床验证	探讨肥胖与胰腺导管腺癌之间的分子机制	胰腺导管上皮细胞、肥胖患者血清、小鼠模型	NA	胰腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	涉及不同代谢状态的人类血清样本和肥胖小鼠模型
9427	2024-09-09	Survival benefit and spatial properties of tertiary lymphoid structures in esophageal squamous cell carcinoma with neoadjuvant therapies 2024-Oct-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.217178 PMID:39142497	研究论文	研究了三级淋巴结构在食管鳞状细胞癌患者接受新辅助治疗后的生存益处和空间分布	首次探讨了三级淋巴结构在食管鳞状细胞癌患者接受新辅助化疗、新辅助免疫治疗、新辅助放化疗或单独手术后的成熟度和空间分布，并发现成熟的三级淋巴结构是食管鳞状细胞癌的独立预后因素	研究样本仅限于359名食管鳞状细胞癌患者，可能存在样本量不足的问题	探讨三级淋巴结构在食管鳞状细胞癌患者接受新辅助治疗后的临床相关性和空间分布	食管鳞状细胞癌患者接受新辅助化疗、新辅助免疫治疗、新辅助放化疗或单独手术后的三级淋巴结构	数字病理学	食管癌	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	359名食管鳞状细胞癌患者
9428	2024-09-09	Single-cell RNA-seq reveals heterogeneity in metastatic renal cell carcinoma and effect of anti-angiogenesis therapy in the pancreas metastatic lesion 2024-Oct-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.217193 PMID:39159881	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了转移性肾细胞癌在胰腺转移灶中的异质性，并评估了抗血管生成治疗的效果	首次通过单细胞RNA测序详细解析了胰腺转移灶的肿瘤微环境，并探讨了抗血管生成治疗的影响	研究样本量有限，可能影响结果的普适性	揭示转移性肾细胞癌在胰腺转移灶中的异质性及其治疗效果	转移性肾细胞癌的胰腺转移灶及其肿瘤微环境	数字病理学	肾细胞癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	包括大量原发和转移性病灶样本
9429	2024-09-09	ALOX15+ M2 macrophages contribute to epithelial remodeling in eosinophilic chronic rhinosinusitis with nasal polyps 2024-Sep, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jaci.2024.04.019 PMID:38705258	研究论文	研究探讨了ALOX15+ M2巨噬细胞在嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉（eCRSwNP）上皮重塑中的作用	首次揭示了ALOX15+ M2巨噬细胞在eCRSwNP上皮重塑中的特定作用及其机制	研究主要基于体外实验和空间转录组分析，缺乏体内实验验证	探究ALOX15+ M2巨噬细胞在eCRSwNP上皮重塑中的作用及其机制	嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉（eCRSwNP）中的上皮细胞和巨噬细胞	数字病理学	鼻窦炎	空间转录组学和单细胞测序分析	NA	基因表达数据	涉及人类鼻上皮细胞（hNECs）和巨噬细胞系THP-1的共培养系统
9430	2024-09-09	The nasal basal cell population shifts toward a diseased phenotype with impaired barrier formation capacity in allergic rhinitis 2024-Sep, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jaci.2024.04.021 PMID:38705259	研究论文	研究过敏性鼻炎中鼻腔基底细胞群体向疾病表型的转变及其屏障形成能力受损的情况	首次详细研究了过敏性鼻炎中基底细胞的行为变化及其与慢性屏障破坏机制的关系	研究主要集中在鼻腔基底细胞的转录组和功能变化，未涉及其他可能影响屏障功能的细胞类型	研究过敏性鼻炎中基底细胞亚型及其在健康对照组中的差异	鼻腔基底细胞及其在过敏性鼻炎中的表型和功能变化	数字病理学	过敏性鼻炎	单细胞RNA测序 (scRNA-Seq)	NA	RNA	非过敏性和屋尘螨过敏的过敏性鼻炎患者
9431	2024-09-09	scRNA-seq reveals the landscape of immune repertoire of PBMNCs in iMCD 2024-Sep, Oncogene IF:6.9Q1 DOI:10.1038/s41388-024-03128-8 PMID:39147879	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了iMCD患者外周血单个核细胞的免疫谱系	首次通过单细胞RNA测序技术揭示了iMCD患者外周血单个核细胞的免疫谱系，并识别了潜在的治疗靶点	NA	阐明iMCD患者外周血单个核细胞的免疫谱系，并识别潜在的治疗靶点	iMCD患者的外周血单个核细胞	数字病理学	Castleman病	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
9432	2024-09-09	Tumor immune microenvironment of NSCLC with EGFR exon 20 insertions may predict efficacy of first-line ICI-combined regimen 2024-Sep, Lung cancer (Amsterdam, Netherlands) DOI:10.1016/j.lungcan.2024.107933 PMID:39191079	研究论文	研究EGFR外显子20插入突变的非小细胞肺癌（NSCLC）患者的肿瘤免疫微环境与一线ICI联合化疗方案疗效之间的关系	首次探讨了EGFR外显子20插入突变的NSCLC患者的肿瘤免疫微环境与ICI联合化疗方案疗效之间的关联	研究样本量较小，且仅限于特定的基因突变类型	探讨EGFR外显子20插入突变的NSCLC患者的肿瘤免疫微环境与ICI联合化疗方案疗效之间的关系	EGFR外显子20插入突变的NSCLC患者的肿瘤免疫微环境	数字病理学	肺癌	单细胞转录组测序和多重免疫荧光染色	NA	单细胞RNA测序数据和免疫荧光染色数据	15例未经治疗的NSCLC样本，30例EGFR L858R突变样本和4例野生型样本
9433	2024-09-08	Identification of feature genes and molecular mechanisms involved in cell communication in uveal melanoma through analysis of single‑cell sequencing data 2024-Nov, Oncology letters IF:2.5Q3 DOI:10.3892/ol.2024.14636 PMID:39233824	研究论文	本研究通过分析单细胞测序数据，识别了葡萄膜黑色素瘤中的特征基因及其在细胞通讯中的分子机制	本研究发现了葡萄膜黑色素瘤中新的关键基因，并揭示了这些基因在血管发育、粘附连接和细胞粘附分子结合等通路中的显著富集	本研究主要依赖于公共数据库的数据，未进行体内实验验证	识别葡萄膜黑色素瘤中的特征基因及其在细胞通讯中的分子机制	葡萄膜黑色素瘤中的特征基因及其在细胞通讯中的作用	数字病理学	葡萄膜黑色素瘤	单细胞测序	随机生存森林算法	RNA测序数据	13个单细胞样本亚型
9434	2024-09-08	Skin in the game: a review of single-cell and spatial transcriptomics in dermatological research 2024-Sep-25, Clinical chemistry and laboratory medicine IF:3.8Q1 DOI:10.1515/cclm-2023-1245 PMID:38656304	综述	本文综述了单细胞和空间转录组学在皮肤病学研究中的应用	介绍了单细胞RNA测序和空间转录组学在皮肤病学中的新兴应用，这些技术能够以高分辨率研究基因表达的微环境	NA	探讨单细胞和空间转录组学在皮肤病学研究中的潜力	健康皮肤和多种皮肤病理生理学，包括特应性皮炎、银屑病和皮肤恶性肿瘤	数字病理学	皮肤癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学（ST）	NA	基因表达数据	NA
9435	2024-09-08	Baseline Immune State and T-cell Clonal Kinetics are Associated with Durable Response to CAR-T Therapy in Large B-cell Lymphoma 2024-Sep-06, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2024024381 PMID:39241199	研究论文	研究分析了50名接受CAR-T疗法的LBCL患者的外周血样本，通过单细胞RNA和TCR测序等技术，探讨了基线免疫状态和T细胞克隆动力学与CAR-T疗法持久反应之间的关系	首次整合单细胞RNA和TCR测序、流式细胞术和质谱流式细胞术，分析CAR-T疗法前后的免疫特征，并开发了一个基于基线B细胞比例和淋巴细胞与单核细胞比率的预测模型	研究样本量有限，且仅限于接受axi-cel治疗的LBCL患者	探讨基线免疫状态和T细胞克隆动力学与CAR-T疗法持久反应之间的关系，并开发预测模型	接受CAR-T疗法的LBCL患者的外周血样本	免疫学	淋巴瘤	单细胞RNA测序、TCR测序、流式细胞术、质谱流式细胞术	NA	血液样本	50名LBCL患者，扩展到99名ZUMA-1队列患者
9436	2024-09-08	Natural killer (NK) cells-related gene signature reveals the immune environment heterogeneity in hepatocellular carcinoma based on single cell analysis 2024-Sep-04, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-024-01287-4 PMID:39231877	研究论文	本研究利用自然杀伤细胞（NK细胞）相关的基因预测模型，通过单细胞分析揭示了肝细胞癌（HCC）免疫环境的异质性	本研究首次建立了基于NK细胞相关基因的风险评分模型，并开发了用于精确预测HCC患者生存率的诺模图	本研究依赖于公开数据库的数据，可能存在数据质量和样本代表性的限制	本研究旨在通过单细胞分析揭示肝细胞癌的免疫环境异质性，并为精准治疗提供基因水平的依据	本研究主要研究对象为肝细胞癌患者，重点关注NK细胞及其相关基因在肿瘤免疫治疗中的作用	数字病理学	肝癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和RNA测序（RNA-seq）	NA	基因表达数据	本研究使用了来自肝细胞癌患者的单细胞RNA测序和RNA测序数据
9437	2024-09-06	Publisher Correction: scParser: sparse representation learning for scalable single-cell RNA sequencing data analysis 2024-Sep-04, Genome biology IF:10.1Q1 DOI:10.1186/s13059-024-03378-5 PMID:39232797	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
9438	2024-09-08	Integrated ultrasensitive metabolomics and single-cell transcriptomics identify crucial regulators of sheep oocyte maturation and early embryo development in vitro 2024-Sep-02, Journal of advanced research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jare.2024.08.040 PMID:39233000	研究论文	本研究通过超灵敏代谢组学和单细胞转录组学分析，识别了影响绵羊卵母细胞体外成熟和早期胚胎发育的关键代谢物	本研究首次整合超灵敏代谢组学和单细胞转录组学，识别了体外培养系统中缺失的关键代谢物，并通过补充这些代谢物显著提高了胚胎发育率	本研究主要集中在体外培养系统，未涉及体内环境的影响	提高绵羊卵母细胞的体外发育能力	绵羊卵母细胞和早期胚胎	代谢组学	NA	超灵敏代谢组学分析，单细胞RNA测序	NA	代谢物数据，转录组数据	微量样本
9439	2024-09-08	Lost in space: what single-cell RNA sequencing cannot tell you 2024-Sep, Trends in plant science IF:17.3Q1 DOI:10.1016/j.tplants.2024.03.010 PMID:38570278	综述	本文讨论了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在植物科学中的应用及其在空间信息方面的局限性	提出了利用空间信息来监督单细胞分析的可能性，以整合不同技术的优势	scRNA-seq在测序过程中会丢失细胞的位置信息，限制了其对复杂生物系统的全面描述	探讨如何通过整合空间信息来提升单细胞RNA测序的分析能力	单细胞RNA测序及其在空间信息恢复方面的局限性	基因组学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	NA
9440	2024-09-08	Cell Culture Differentiation and Proliferation Conditions Influence the In Vitro Regeneration of the Human Airway Epithelium 2024-Sep, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1 DOI:10.1165/rcmb.2023-0356MA PMID:38843491	研究论文	研究评估了不同培养基对体外人呼吸道上皮细胞再生和分化的影响	首次系统评估了不同培养基对单细胞RNA测序和成像技术下细胞组成、基因表达谱、细胞信号传导和上皮形态的影响	研究主要集中在体外培养条件下，未涉及体内实验	评估不同培养基对体外人呼吸道上皮细胞再生和分化的影响	人呼吸道上皮细胞	细胞生物学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	多种培养基（BEGM, PneumaCult, Half & Half, Clancy）下的细胞样本