单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 9421 - 9440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9421 | 2024-08-24 |
ITGB6 modulates resistance to anti-CD276 therapy in head and neck cancer by promoting PF4+ macrophage infiltration
2024-Aug-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51096-0
PMID:39152118
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研究论文 | 本研究评估了抗CD276抗体在化学诱导的鼠头颈鳞状细胞癌模型中的活性，并发现ITGB6是介导对反CD276治疗不同反应的关键基因 | 通过单细胞RNA测序和基因敲除鼠模型，发现ITGB6通过调节肿瘤相关趋化因子CX3CL1的表达，招募并激活表达高水平的CX3CR1的PF4巨噬细胞，从而影响对反CD276治疗的敏感性 | NA | 揭示与免疫检查点抑制剂治疗相关的耐药机制，并识别克服癌症治疗耐药性的潜在目标 | 头颈癌中的ITGB6基因及其对反CD276治疗的反应 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
| 9422 | 2024-08-24 |
Applications of single-cell technologies in drug discovery for tumor treatment
2024-Aug-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110486
PMID:39171294
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综述 | 本文综述了单细胞技术在肿瘤治疗药物发现中的应用 | 介绍了新兴的单细胞分析技术，如多维单细胞分子特征整合、单细胞数据规模扩展、单细胞基因表型影响分析和全长度覆盖单细胞测序 | NA | 系统总结单细胞技术在肿瘤治疗药物发现各阶段的应用，并强调其在深入理解肿瘤生物学中的作用 | 单细胞技术在药物发现中的应用，包括靶点识别、高通量药物筛选和药代动力学评估 | 生物技术 | 肿瘤 | 单细胞技术 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 9423 | 2024-08-24 |
Single-cell transcriptomics reveals tumor landscape in ovarian carcinosarcoma
2024-Aug-15, Journal of Zhejiang University. Science. B
DOI:10.1631/jzus.B2300407
PMID:39155781
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）分析了卵巢癌肉瘤（OCS）的细胞组成和分子特征 | 首次提供了人类OCS的单细胞转录组特征，为阐明OCS的多样性提供了新的资源 | NA | 通过单细胞RNA测序技术揭示卵巢癌肉瘤的肿瘤景观 | 卵巢癌肉瘤的细胞组成和分子特征 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 9424 | 2024-08-24 |
A pan-cancer cuproptosis signature predicting immunotherapy response and prognosis
2024-Aug-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e35404
PMID:39170145
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research paper | 本文通过分析多个单细胞RNA测序数据集，开发了一种泛癌铜死亡特征（Cup.Sig），用于预测免疫治疗反应和预后 | 首次开发了一种泛癌铜死亡特征，用于预测免疫治疗反应和预后 | NA | 开发一种泛癌铜死亡特征，用于预测生存和免疫治疗反应 | 泛癌铜死亡特征及其在免疫治疗反应和预后预测中的应用 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习算法 | RNA测序数据 | 28个scRNA-seq数据集，TCGA泛癌队列和10个免疫治疗队列 |
| 9425 | 2024-08-24 |
Single-cell sequencing analysis revealed that WDR72 was a novel cancer stem cells related gene in gastric cancer
2024-Aug-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e35549
PMID:39170171
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析揭示了WDR72作为胃癌中与癌症干细胞相关的新基因 | 首次发现WDR72作为胃癌中与癌症干细胞相关的新基因 | NA | 探索胃癌上皮细胞中与癌症干细胞相关的基因 | 胃癌上皮细胞中的癌症干细胞相关基因 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | mRNA表达谱 | NA |
| 9426 | 2024-08-24 |
Screening chondrocyte necroptosis-related genes in the diagnosis and treatment of osteoarthritis
2024-Aug-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e35263
PMID:39170298
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序数据分析了骨关节炎中软骨细胞坏死调控的相关基因，并构建了机器学习模型进行药物分子对接验证。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了骨关节炎中调控软骨细胞坏死的机制，并验证了nimesulide作为潜在抑制剂的可能性。 | 研究主要集中在体外实验和数据分析，需要进一步的临床试验验证nimesulide的疗效。 | 探讨骨关节炎中软骨细胞坏死相关基因的诊断和治疗潜力。 | 骨关节炎中的软骨细胞坏死相关基因。 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 贝叶斯模型 | RNA序列 | 未具体说明样本数量 |
| 9427 | 2024-08-24 |
Single-cell RNA-Seq reveals the heterogeneity of fibroblasts within the tympanojugular paraganglioma microenvironment
2024-Aug-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e35478
PMID:39170307
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和全外显子测序分析了六例手术切除的鼓室颈静脉副神经节瘤样本，揭示了瘤内纤维母细胞的异质性及其在瘤微环境中的复杂作用 | 首次建立了针对鼓室颈静脉副神经节瘤的全面转录组图谱，并详细描述了纤维母细胞在瘤微环境中的多方面作用及其细胞间通讯网络 | NA | 研究鼓室颈静脉副神经节瘤的细胞组成和瘤内异质性，以及纤维母细胞在瘤微环境中的具体贡献 | 鼓室颈静脉副神经节瘤样本及其细胞组成 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，全外显子测序 | NA | 转录组数据 | 六例手术切除的鼓室颈静脉副神经节瘤样本 |
| 9428 | 2024-08-24 |
Dysregulated T-cell homeostasis and decreased CD30+ Treg proliferating in aplastic anemia
2024-Aug-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e35775
PMID:39170389
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了再生障碍性贫血（AA）患者中T细胞稳态的潜在破坏，并识别了CD4 T常规细胞和Treg细胞的变化 | 首次揭示了AA患者中CD30 Treg细胞亚群的减少及其高增殖和显著的免疫抑制表型，并提出异常的TNFSF8/TNFRSF8信号通路可能通过增加CD30 Treg细胞的破坏导致T细胞免疫功能障碍 | NA | 阐明再生障碍性贫血中自身反应性T细胞在疾病发展中的精确作用，以促进治疗和诊断策略的进步 | 再生障碍性贫血患者的CD8 T细胞、常规CD4 T细胞和Treg细胞 | 免疫学 | 再生障碍性贫血 | 单细胞转录组分析，流式细胞术，RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 9429 | 2024-08-24 |
Galectin-3 induces pathogenic immunosuppressive macrophages through interaction with TREM2 in lung cancer
2024-Aug-13, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03124-6
PMID:39135069
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研究论文 | 本研究探讨了半乳糖凝集素-3通过与TREM2相互作用诱导肺肿瘤相关巨噬细胞的免疫抑制作用 | 揭示了半乳糖凝集素-3与TREM2在肺肿瘤相关巨噬细胞中的未知关联，并提出同时抑制半乳糖凝集素3和TREM2作为肺肿瘤治疗的新策略 | NA | 研究TREM2表达的肿瘤相关巨噬细胞的招募机制及其介导免疫抑制的配体 | 肺肿瘤相关巨噬细胞及其免疫抑制作用 | 数字病理学 | 肺肿瘤 | 流式细胞术，单细胞RNA测序，质谱分析，免疫沉淀 | NA | 细胞 | 使用TREM2f/f-Lyz2-cre小鼠模型进行验证 |
| 9430 | 2024-08-24 |
A Cell Cycle-Aware Network for Data Integration and Label Transferring of Single-Cell RNA-Seq and ATAC-Seq
2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202401815
PMID:38887194
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研究论文 | 本文开发了一种细胞周期感知网络（CCAN），用于去除单细胞多组学数据集成中的细胞周期效应，同时保留细胞类型特异性变异 | 这是首个研究单细胞多组学数据集成中细胞周期效应的计算模型 | NA | 研究单细胞多组学数据集成中的细胞周期效应 | 单细胞RNA测序和ATAC测序数据的集成 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | 网络模型 | 多组学数据 | 多个基准数据集 |
| 9431 | 2024-08-24 |
Heterogeneity of Wnt1-Cre-marked and Pax2-Cre-marked first branchial arch cranial neural crest cells in mice
2024-Aug-01, Hua xi kou qiang yi xue za zhi = Huaxi kouqiang yixue zazhi = West China journal of stomatology
DOI:10.7518/hxkq.2024.2023374
PMID:39049630
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研究论文 | 本研究旨在探讨Wnt1-Cre标记和Pax2-Cre标记的小鼠第一鳃弓颅神经嵴细胞的异质性和基因本体 | 本研究通过单细胞RNA测序和实时荧光定量PCR技术，揭示了Wnt1-Cre和Pax2-Cre标记的神经嵴细胞在不同组织中的表达差异及其在细胞分化和骨化中的作用 | NA | 探索Wnt1-Cre和Pax2-Cre标记的小鼠第一鳃弓颅神经嵴细胞的异质性和基因本体 | Wnt1-Cre和Pax2-Cre标记的小鼠第一鳃弓颅神经嵴细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 实时荧光定量PCR | NA | RNA | Wnt1-Cre;R26RmTmG和Pax2-Cre;R26RmTmG小鼠的胚胎 |
| 9432 | 2024-08-24 |
Patient-Derived Tumor Organoids Combined with Function-Associated ScRNA-Seq for Dissecting the Local Immune Response of Lung Cancer
2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202400185
PMID:38896792
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研究论文 | 本研究通过生成患者来源的肺肿瘤类器官（pLCOs）并结合功能关联的单细胞RNA测序（FascRNA-seq）平台，分析了肺肿瘤局部免疫微环境（TIME）对免疫治疗的动态响应 | 开发了一种结合表型评估和单细胞RNA测序的FascRNA-seq平台，能够在单个类器官水平上解析TIME | NA | 研究肺肿瘤局部免疫微环境对免疫治疗的动态响应 | 患者来源的肺肿瘤类器官及其免疫微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 171个个体肺肿瘤类器官，来自7名患者 |
| 9433 | 2024-08-24 |
scRNMF: An imputation method for single-cell RNA-seq data by robust and non-negative matrix factorization
2024-Aug, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012339
PMID:39116191
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研究论文 | 本文提出了一种基于鲁棒和非负矩阵分解的单细胞RNA测序数据插补方法scRNMF | scRNMF方法结合了L2损失和C损失函数，C损失函数对大误差的惩罚较小，使得在处理异常值时更加鲁棒 | NA | 开发有效的插补方法以克服单细胞RNA测序数据中的高缺失率问题 | 单细胞RNA测序数据 | 基因组学 | NA | 非负矩阵分解 | NA | RNA测序数据 | 使用了不同大小和零率的各种数据集 |
| 9434 | 2024-08-24 |
Neutrophil extracellular trap related risk score exhibits crucial prognostic value in skin cutaneous melanoma, associating with distinct immune characteristics
2024-Aug, Skin research and technology : official journal of International Society for Bioengineering and the Skin (ISBS) [and] International Society for Digital Imaging of Skin (ISDIS) [and] International Society for Skin Imaging (ISSI)
IF:2.0Q3
DOI:10.1111/srt.70008
PMID:39167030
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研究论文 | 本文构建了与中性粒细胞外陷阱（NETs）相关的基因特征，并探讨了其在皮肤皮肤黑色素瘤（SKCM）中的预后价值及免疫特征 | 首次构建了基于五个NET基因的预后模型，并探讨了其在SKCM中的预后能力和免疫特征 | NA | 研究NETs在皮肤皮肤黑色素瘤中的预后价值及免疫特征 | 皮肤皮肤黑色素瘤患者 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | LASSO Cox回归分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用TCGA-SKCM队列和GSE115978数据集 |
| 9435 | 2024-08-24 |
Summary data-based Mendelian randomization and single-cell RNA sequencing analyses identify immune associations with low-level LGALS9 in sepsis
2024-Jul, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18559
PMID:39044269
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研究论文 | 本研究通过基于汇总数据的孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序，揭示了低水平LGALS9与脓毒症免疫关联的分子机制 | 首次结合基于汇总数据的孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序技术，深入探讨了脓毒症中免疫细胞的表型变化及其分子机制 | NA | 深入理解脓毒症的发病机制及其免疫细胞的表型变化 | 脓毒症患者的免疫细胞及其分子机制 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化分析 | 基因表达数据 | NA |
| 9436 | 2024-08-24 |
Integrated Analysis Construct a Tumor-Associated Macrophage Novel Signature with Promising Implications in Predicting the Prognosis and Immunotherapeutic Response of Gastric Cancer Patients
2024-Jun, Digestive diseases and sciences
IF:2.5Q2
DOI:10.1007/s10620-024-08365-1
PMID:38573378
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研究论文 | 本研究通过综合分析构建了一个与肿瘤相关巨噬细胞（TAM）相关的新型风险特征，用于预测胃癌患者的预后和免疫治疗反应 | 开发了一个基于TAM的九基因风险特征，能够准确预测胃癌的预后，并为临床诊断、预测和免疫治疗提供新的视角 | NA | 研究TAM在胃癌中的特征，并开发基于TAM的风险特征以预测胃癌患者的预后 | 胃癌患者的肿瘤相关巨噬细胞（TAM）及其相关基因 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA序列数据 | NA |
| 9437 | 2024-08-24 |
Angiogenesis-related immune response may be the prelude to the syndesmophyte formation in Ankylosing spondylitis
2024-May-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112040
PMID:38631220
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序方法，分析了强直性脊柱炎模型中疾病进展过程中的外周血单个核细胞比例变化，并探讨了局部炎症与骨形成之间的关系。 | 首次揭示了CD4+CXCR5+ T滤泡辅助细胞在强直性脊柱炎骨病变中的定位及其作为促血管生成级联反应上游启动者的作用。 | NA | 探讨强直性脊柱炎中局部炎症与骨形成之间的关系，并阐明其发病机制。 | 强直性脊柱炎模型中的外周血单个核细胞及骨病变。 | 免疫学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及强直性脊柱炎的猕猴模型 |
| 9438 | 2024-08-24 |
Integrative multiomics enhancer activity profiling identifies therapeutic vulnerabilities in cholangiocarcinoma of different etiologies
2024-05-10, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-330483
PMID:38050079
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研究论文 | 本研究通过综合多组学增强子活性分析，识别不同病因胆管癌的治疗脆弱性 | 首次在胆管癌中探讨增强子活性的失调及其对致癌过程的影响，并利用这些信息识别新的治疗靶点 | 研究主要基于细胞系和异种移植模型，可能与临床实际情况存在差异 | 旨在通过增强子活性分析，识别不同胆管癌亚型的潜在治疗靶点 | 胆管癌（CCA）的不同亚型 | NA | 胆管癌 | NanoString、多重免疫组织化学染色和单细胞空间转录组学 | NA | 细胞系、患者来源的异种移植模型 | 使用了多种胆管癌细胞系、患者来源和细胞系来源的异种移植模型 |
| 9439 | 2024-08-24 |
Integrated multi-omics analyses identify anti-viral host factors and pathways controlling SARS-CoV-2 infection
2024-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44175-1
PMID:38168026
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研究论文 | 本研究通过全基因组CRISPR剔除筛选和多组学数据的综合分析，揭示了控制SARS-CoV-2感染的宿主抗病毒因子及其途径 | 本研究发现了许多目前被低估的宿主因子，如V-ATP酶、ESCRT和N-糖基化途径的组成部分，以及作为抗病毒途径的凝聚素复合物 | NA | 揭示控制SARS-CoV-2感染的宿主抗病毒因子及其途径 | SARS-CoV-2感染的宿主抗病毒因子及其途径 | 基因组学 | COVID-19 | CRISPR, 全基因组关联研究, 单细胞RNA-Seq, 宿主-病毒蛋白质或蛋白质/RNA相互作用组 | NA | 多组学数据 | NA |
| 9440 | 2024-08-24 |
Comprehensive multi-omics analysis of pyroptosis for optimizing neoadjuvant immunotherapy in patients with gastric cancer
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.93124
PMID:38773976
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨了焦亡在胃癌中的免疫调节作用及其对新辅助免疫治疗的影响 | 构建了焦亡风险评分（PRS），并验证了其在胃癌新辅助免疫治疗中的预测价值 | NA | 探讨焦亡在胃癌肿瘤微环境重塑和免疫治疗中的作用 | 胃癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序和多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据 | 共涉及1903个样本，包括公共数据库和独立中国医学队列的胃癌样本，以及接受新辅助免疫治疗和化疗的胃癌患者 |