单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27504 篇文献，本页显示第 9421 - 9440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9421 | 2024-08-29 |
Deciphering Immune Landscape Remodeling Unravels the Underlying Mechanism for Synchronized Muscle and Bone Aging
2024-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202304084
PMID:38088531
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了人体肌肉和骨骼的衰老相关转录动力学，揭示了脂质相关巨噬细胞（TREM2 Macs）在肌肉和骨骼衰老中的作用及其分子机制。 | 首次揭示了TREM2 Macs在肌肉和骨骼同步衰老中的保守作用，并阐明了其通过CD6-ALCAM信号通路调节SPP1表达的机制。 | 研究仅限于人体肌肉和骨骼的单细胞RNA测序分析，未涉及其他组织或动物模型。 | 探究肌肉和骨骼同步衰老的潜在机制。 | 人体肌肉和骨骼的衰老过程及其相关细胞和分子机制。 | 数字病理学 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 人体肌肉和骨骼样本 |
| 9422 | 2024-08-29 |
Single-Cell Atlas of Human Ovaries Reveals The Role Of The Pyroptotic Macrophage in Ovarian Aging
2024-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202305175
PMID:38036420
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了不同生育年龄的人类卵巢，揭示了随着年龄增长，卵巢中巨噬细胞的焦亡途径激活增加，从而影响卵巢的免疫微环境，加速生殖功能衰退。 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了人类卵巢衰老过程中巨噬细胞焦亡途径的激活及其对免疫微环境的影响。 | 研究主要基于细胞和动物实验，未来需要更多临床数据验证这些发现。 | 探索人类卵巢衰老过程中细胞和分子层面的变化及其机制。 | 人类卵巢中的巨噬细胞及其焦亡途径。 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 不同生育年龄的人类卵巢样本 |
| 9423 | 2024-08-29 |
Single-Cell Transcriptome Atlas and Regulatory Dynamics in Developing Cotton Anthers
2024-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202304017
PMID:37974530
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研究论文 | 本研究建立了棉花花药的第一个单细胞转录组图谱和染色质可及性调查，揭示了花药中不同细胞类型的特异性表达和表观遗传景观，并探讨了高温应激对花药细胞的异质性响应。 | 首次在棉花花药中建立了单细胞转录组图谱和染色质可及性调查，重建了减数分裂细胞、绒毡层细胞和中层细胞的发育轨迹，并揭示了高温应激下花药细胞的异质性响应。 | NA | 研究花药发育过程中的空间表达图谱和调控动态，以及高温应激下的响应机制。 | 棉花花药中的不同细胞类型及其在高温应激下的响应。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 9424 | 2024-08-29 |
SPASCER: spatial transcriptomics annotation at single-cell resolution
2023-01-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac889
PMID:36243975
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研究论文 | 本文构建了一个名为SPASCER的新型空间转录组数据库，旨在帮助理解组织结构的异质性、区域特异性微环境及跨组织结构的多层次细胞间相互作用 | SPASCER数据库整合了来自43项研究的1082个子数据集，涵盖四种物种的16种器官类型，并结合scRNA-seq数据进行空间转录组的解卷积/映射，以及空间细胞间相互作用、基因模式和通路富集分析 | NA | 研究目的是通过构建SPASCER数据库，深入理解健康和疾病组织中的生物学过程机制 | 研究对象包括组织结构异质性、区域特异性微环境及细胞间相互作用 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 43项研究的1082个子数据集，涵盖16种器官类型，涉及四种物种 |
| 9425 | 2024-08-29 |
Single-cell RNA sequencing unravels heterogeneity of skeletal progenitors and cell-cell interactions underlying the bone repair process
2022-Dec, Regenerative therapy
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.reth.2022.05.001
PMID:35619947
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了骨骼前体细胞在骨修复过程中的异质性和细胞间相互作用 | 首次在单细胞分辨率下描述了多潜能骨骼前体细胞及其分化方向，并识别了Ccl9信号通路作为骨再生的潜在治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 深入理解骨骼前体细胞在骨修复过程中的行为及其分子机制 | 骨骼前体细胞及其在骨修复中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用Sox9-CreERT2;R26R tdTomato小鼠模型进行线粒体追踪和单细胞RNA测序分析 |
| 9426 | 2024-08-29 |
The power of single-cell transcriptomics in cardiovascular disease
2022-Jul, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-022-00109-6
PMID:39196239
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9427 | 2024-08-29 |
Intrahepatic inflammatory IgA+PD-L1high monocytes in hepatocellular carcinoma development and immunotherapy
2022-05, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003618
PMID:35577505
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研究论文 | 本研究探讨了炎症诱导的肝内炎症性IgA+单核细胞在肝细胞癌（HCC）发展中的作用 | 发现血清IgA水平与慢性肝病和HCC中的肝内及肿瘤内炎症性IgA+PD-L1高表达单核细胞浸润相关，为潜在的治疗靶点提供了依据 | NA | 阐明炎症诱导的肝内炎症性IgA+单核细胞在肝细胞癌发展中的作用 | 肝细胞癌患者及其肝内炎症性IgA+单核细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 免疫组织化学、多色流式细胞术、单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | 组织样本、血液样本 | 包括61例脂肪性肝炎患者和271例HCC患者 |
| 9428 | 2024-08-29 |
Single-Cell RNA-seq Reveals a Developmental Hierarchy Super-Imposed Over Subclonal Evolution in the Cellular Ecosystem of Prostate Cancer
2022-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202105530
PMID:35322584
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研究论文 | 研究者通过单细胞RNA测序技术分析了14名未经治疗的前列腺癌患者的细胞，构建了一个详细的前列腺癌细胞图谱，并揭示了肿瘤亚克隆进化与转录异质性之间的关系 | 首次将发育层次结构映射到肿瘤亚克隆进化上，并识别了四种转录亚型，这些亚型在干细胞样和分化状态中呈层次结构 | 研究仅限于14名未经治疗的前列腺癌患者，可能需要进一步扩大样本量以验证结果的普遍性 | 探讨前列腺癌中亚克隆进化与转录异质性之间的关系及其对患者预后的影响 | 前列腺癌患者的肿瘤细胞及其亚克隆和转录异质性 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 14名未经治疗的前列腺癌患者 |
| 9429 | 2024-08-29 |
CCPE: cell cycle pseudotime estimation for single cell RNA-seq data
2022-01-25, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab1236
PMID:34931240
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研究论文 | 本文开发了一种名为CCPE的新型细胞周期伪时间估计方法，用于从单细胞RNA测序数据中表征细胞周期时间和识别细胞周期阶段 | CCPE使用一种判别性螺旋来表征细胞周期的循环过程，并估计每个细胞沿细胞周期的伪时间 | NA | 开发一种有效的方法来预测细胞周期伪时间并识别细胞周期阶段 | 单细胞RNA测序数据中的细胞周期 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多种模拟和真实的单细胞RNA测序数据集 |
| 9430 | 2024-08-29 |
Transcriptomic signatures associated with autoimmune thyroiditis in papillary thyroid carcinoma and cancer immunotherapy-induced thyroid dysfunction
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.05.019
PMID:35664236
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研究论文 | 本研究探讨了甲状腺乳头状癌（PTC）与桥本甲状腺炎（HT）共存现象及其转录组基础，以及免疫治疗相关甲状腺功能障碍的分子标志物 | 首次揭示了PTC患者中HT与复发之间的负相关性，并发现了HT患者中PD-1相关基因的高表达与CD8 T细胞激活的潜在关联 | 研究主要基于回顾性数据分析，未来需通过前瞻性研究进一步验证 | 探索PTC与HT共存的转录组基础及免疫治疗相关甲状腺功能障碍的分子机制 | 甲状腺乳头状癌患者及接受免疫治疗的患者的甲状腺功能障碍 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 转录组分析，单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据，单细胞数据 | 468名PTC患者，22,155名PTC患者（元分析），17,438个细胞（单细胞转录组分析），39,123名患者（甲状腺不良事件分析） |
| 9431 | 2024-08-29 |
Comparative Toxicotranscriptomics of Single Cell RNA-Seq and Conventional RNA-Seq in TCDD-Exposed Testicular Tissue
2022, Frontiers in toxicology
IF:3.6Q2
DOI:10.3389/ftox.2022.821116
PMID:35615540
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研究论文 | 本报告比较了两种转录组学方法（常规RNA-seq和单细胞RNA测序）在暴露于TCDD的成年斑马鱼睾丸组织中的结果和局限性 | 单细胞RNA测序能够揭示异质组织中特定细胞类型的转录组动态 | 单细胞RNA测序中的细胞解离效应和转录组覆盖度降低可能影响毒理学研究 | 探讨单细胞RNA测序与常规RNA-seq在转录组学和毒理学上的差异 | 暴露于TCDD的成年斑马鱼睾丸组织 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 控制组和TCDD暴露组的配对样本 |
| 9432 | 2024-08-29 |
Cisplatin Neurotoxicity Targets Specific Subpopulations and K+ Channels in Tyrosine-Hydroxylase Positive Dorsal Root Ganglia Neurons
2022, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2022.853035
PMID:35586548
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研究论文 | 研究揭示了顺铂化疗引起的外周神经病变中，顺铂如何影响酪氨酸羟化酶阳性背根神经节神经元的特定亚群和K+通道 | 发现了顺铂通过靶向外向K电流（可能通过K2P18.1通道）影响神经元功能，并暗示维生素E可能具有神经保护作用 | NA | 探讨顺铂化疗引起的外周神经病变的细胞机制 | 酪氨酸羟化酶阳性背根神经节神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析和电生理分析 | NA | 转录组数据和电生理数据 | 小鼠的酪氨酸羟化酶阳性背根神经节神经元 |
| 9433 | 2024-08-29 |
Single-cell RNA sequencing of batch Chlamydomonas cultures reveals heterogeneity in their diurnal cycle phase
2021-05-31, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koab025
PMID:33585940
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）分析了Chlamydomonas reinhardtii在不同环境和基因型下的细胞异质性，特别是在昼夜周期中的表现。 | 首次使用scRNA-seq技术揭示了Chlamydomonas细胞在铁或氮缺乏条件下的异质性，并展示了昼夜节律对细胞响应的影响。 | 研究仅限于实验室培养的Chlamydomonas reinhardtii，未涉及自然环境中的藻类群体。 | 探讨Chlamydomonas reinhardtii在不同环境条件下的转录组异质性。 | Chlamydomonas reinhardtii的单细胞转录组。 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及两种基因型的Chlamydomonas细胞，在三种不同环境条件下进行测序。 |
| 9434 | 2024-08-29 |
Machine Intelligence in Single-Cell Data Analysis: Advances and New Challenges
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.655536
PMID:34135939
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综述 | 本文综述了机器学习方法在单细胞多组学数据分析中的应用 | 介绍了单细胞RNA测序数据的预处理方法和高级数据分析工具，以及多组学整合和单细胞RNA测序数据的综合分析 | NA | 探讨机器学习方法在单细胞多组学数据分析中的应用，以促进对复杂生物系统或过程的理解 | 单细胞多组学数据分析 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 多组学数据 | NA |
| 9435 | 2024-08-29 |
scIGANs: single-cell RNA-seq imputation using generative adversarial networks
2020-09-04, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa506
PMID:32588900
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研究论文 | 本文提出了一种使用生成对抗网络（GANs）进行单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据插补的方法，称为scIGANs | scIGANs利用生成的细胞而非观察到的细胞来避免过度平滑和去除细胞间基因表达的自然随机性，并平衡主要和稀有细胞群之间的性能 | NA | 旨在提高单细胞RNA测序数据的质量，通过插补技术减少技术噪声，如过多的假零值（dropouts） | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 生成对抗网络（GANs） | 基因表达数据 | 适用于包含超过100,000个细胞的数据集 |
| 9436 | 2024-08-29 |
CaSpER identifies and visualizes CNV events by integrative analysis of single-cell or bulk RNA-sequencing data
2020-01-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-13779-x
PMID:31900397
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CaSpER的信号处理方法，用于通过综合分析单细胞或批量RNA测序数据来识别、可视化和分析拷贝数变异（CNV）事件 | CaSpER通过整合多尺度表达信号和等位基因偏移信号进行CNV调用，并利用高效的B-allele频率（BAF）信号轮廓生成方法进行CNV调用的校正 | NA | 开发一种新的方法来识别和可视化RNA测序数据中的拷贝数变异事件 | 拷贝数变异（CNV）事件 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | 信号处理方法 | RNA测序数据 | NA |
| 9437 | 2024-08-28 |
ST2+ T-regulatory Cells in Renal Inflammation and Fibrosis following Ischemic Kidney Injury
2024-Aug-26, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000471
PMID:39186386
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研究论文 | 本研究探讨了IL-33/ST2信号通路在调节性T细胞（Tregs）中对肾脏损伤修复的作用 | 首次研究了内源性IL-33/ST2在Tregs中对肾脏损伤修复的贡献 | NA | 探讨IL-33/ST2信号通路在Tregs中对肾脏损伤修复的作用 | 肾脏炎症和纤维化 | NA | 肾脏疾病 | RNA测序 | NA | RNA | 使用了小鼠肾脏缺血-再灌注损伤模型和肾脏类器官 |
| 9438 | 2024-08-28 |
Single-cell analysis reveals the implication of vascular endothelial cell-intrinsic ANGPT2 in human intracranial aneurysm
2024-Aug-24, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae186
PMID:39187926
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，揭示了血管内皮细胞中ANGPT2在人颅内动脉瘤中的作用 | 发现了ANGPT2在颅内动脉瘤形成和进展中的作用，为治疗提供了新的潜在靶点 | NA | 探究颅内动脉瘤的主要分子机制及其细胞组成和分子变化 | 人颅内动脉瘤中的血管内皮细胞 | 数字病理学 | 颅内动脉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 43,462个细胞 |
| 9439 | 2024-08-28 |
Lamc1 promotes osteogenic differentiation and inhibits adipogenic differentiation of bone marrow-derived mesenchymal stem cells
2024-08-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-69629-4
PMID:39179716
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研究论文 | 本研究探讨了骨髓间充质干细胞（BMSCs）晚期分化的分子机制，并鉴定了四个关键基因Lamc1、Tln2、Hexb和St3gal5在BMSCs分化中的作用 | 首次揭示了Lamc1在BMSCs晚期分化中的重要作用，并验证了其在脂肪形成和骨形成中的调控作用 | 研究主要基于公共数据集和单细胞RNA测序数据，未进行体内实验验证 | 阐明骨髓间充质干细胞晚期分化的关键生物过程 | 骨髓间充质干细胞（BMSCs）的晚期分化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 分析了约14天的骨髓间充质干细胞在成骨、成脂和软骨分化后的公共转录组数据 |
| 9440 | 2024-08-28 |
Single-cell profiling reveals altered immune landscape and impaired NK cell function in gastric cancer liver metastasis
2024-Aug, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03114-0
PMID:39060439
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨胃癌肝转移的免疫景观，揭示了肿瘤免疫微环境中多种免疫抑制成分的变化，并发现NK细胞功能受损与TGFβ的诱导有关 | 首次揭示胃癌肝转移中免疫微环境的详细变化，并发现TGFβ在NK细胞功能障碍中的作用，提出联合TGFβ抑制和NK细胞免疫疗法的新策略 | NA | 探讨胃癌肝转移的免疫景观及其对患者预后的影响 | 胃癌肝转移中的免疫细胞及其功能 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个胃癌肝转移样本 |